Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	45400021	17156	16502	0.0221	NA	NA	NA	2.83468036239925e-10	45399781	45407239
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	45407239	45415070	4	4	-1.0936	2.83468036239925e-10	45399781	45407239	1.34030820624339e-10	45411460	45415070
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	45416135	72537426	10734	10319	0.0057	1.34030820624339e-10	45411460	45415070	4.67828892478935e-316	72537426	72537426
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.1116	4.67828892478935e-316	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	16926	0.0049	0	72579311	72579311	4.87603297123428e-71	150819879	150823073
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	1.7368	4.87603297123428e-71	150819879	150823073	1.58331782579180e-68	150848509	150851439
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	247186514	35673	34369	0.0045	1.5833178257918e-68	150848509	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	7019	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20341	35821494	12023	11592	0.0038	NA	NA	NA	1.06649215156017e-09	35821494	35821494
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.4948	1.06649215156017e-09	35821494	35821494	8.7992391656661e-10	35844884	35844884
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6497	-0.0046	8.7992391656661e-10	35844884	35844884	2.23300591572114e-136	52600588	52600588
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-3.421	2.23300591572114e-136	52600588	52600588	2.64722145562229e-136	52635695	52635695
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	242689978	59090	56967	0.0016	2.64722145562229e-136	52635695	52635695	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	4143898	1549	1487	-0.0047	NA	NA	NA	2.2153220038525e-78	4141380	4159901
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	4156423	4287755	48	47	-0.8546	2.2153220038525e-78	4141380	4159901	7.18756291642664e-81	4278981	4290695
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	4290695	32074432	9199	8834	-3e-04	7.18756291642664e-81	4278981	4290695	3.44070023408303e-09	32064724	32074432
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.4368	3.44070023408303e-09	32064724	32074432	2.86166786603708e-09	32080848	32094956
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37316910	1591	1528	0.0196	2.86166786603708e-09	32080848	32094956	5.28676151514701e-09	37315380	37316910
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37318650	37322779	3	2	1.4184	5.28676151514701e-09	37315380	37316910	1.69481690458274e-08	37322779	37324884
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37324884	53006923	6272	6061	0.0222	1.69481690458274e-08	37322779	37324884	1.77592321071070e-07	53003136	53006923
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53009361	53011885	3	3	-1.0521	1.7759232107107e-07	53003136	53006923	8.03871443037204e-07	53011885	53014254
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	133189686	25042	24112	-0.0027	8.03871443037204e-07	53011885	53014254	1.47107049699215e-12	133189686	133189686
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6897	1.47107049699215e-12	133189686	133189686	9.6053421844894e-13	133194685	133194685
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	9.6053421844894e-13	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9417	-0.001	NA	NA	NA	1.70166125534852e-63	164005577	164009321
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.3392	1.70166125534852e-63	164005577	164009321	7.3622294950056e-63	164019640	164027724
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	187890040	7856	7560	0.0084	7.3622294950056e-63	164019640	164027724	3.34328491259857e-16	187887798	187891716
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187891716	187901855	6	6	-1.0863	3.34328491259857e-16	187887798	187891716	1.02071008987792e-15	187899237	187901855
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187903422	194354505	2288	2220	-0.0118	1.02071008987792e-15	187899237	187901855	2.27632308721095e-197	194354505	194354505
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.7644	2.27632308721095e-197	194354505	194354505	4.52595135480507e-190	194366950	194366950
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	963	-0.005	4.52595135480507e-190	194366950	194366950	8.94376674540029e-09	196805434	196911055
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196943380	24	23	-0.4294	8.94376674540029e-09	196805434	196911055	5.95526084679963e-10	196927528	196957322
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	199329592	960	922	0.0109	5.95526084679963e-10	196927528	196957322	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3262	0.0162	NA	NA	NA	7.18923191445288e-74	9815760	9815760
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-2.7666	7.18923191445288e-74	9815760	9815760	9.4161700692639e-72	9842644	9842644
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	38144274	7147	6893	-0.0053	9.4161700692639e-72	9842644	9842644	5.12275551792845e-67	38142240	38147030
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	38147030	38216532	28	28	-1.0166	5.12275551792845e-67	38142240	38147030	3.74226680159091e-70	38213530	38221880
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	38221880	69085386	7864	7581	0.0029	3.74226680159091e-70	38213530	38221880	1.49657821976555e-11	68905670	69097336
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69088563	69165814	11	10	-0.7053	1.49657821976555e-11	68905670	69097336	8.1863504802656e-11	69144974	69656183
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	191153613	36714	35368	0.001	8.1863504802656e-11	69144974	69656183	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	17653599	5509	5312	-0.0166	NA	NA	NA	3.02044719985524e-23	17647063	17671944
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17671944	17739874	11	11	-0.9548	3.02044719985524e-23	17647063	17671944	3.27031702895826e-23	17735652	17743589
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17743589	45890934	7595	7318	0.0039	3.27031702895826e-23	17735652	17743589	1.76763567073706e-13	45878978	45890934
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45894590	45912443	5	5	-1.0893	1.76763567073706e-13	45878978	45890934	1.35039856169366e-13	45912443	45916407
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45916407	97060205	14351	13820	1e-04	1.35039856169366e-13	45912443	45916407	8.38104071264337e-12	97055188	97060205
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-0.8614	8.38104071264337e-12	97055188	97060205	1.78692500468447e-11	97119376	97126918
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	180346557	26170	25249	0.0051	1.78692500468447e-11	97119376	97126918	6.22910063320138e-122	180346557	180346557
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180352261	3	3	-4.1584	6.22910063320138e-122	180346557	180346557	8.92970031820606e-15	180352261	180352261
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180355807	180358977	3	3	-2.2796	8.92970031820606e-15	180352261	180352261	2.08666749367914e-24	180358977	180358977
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	-0.0362	2.08666749367914e-24	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	237952	55	52	-0.0312	NA	NA	NA	1.41743011344380e-15	228968	246974
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	240119	1	0	NA	1.4174301134438e-15	228968	246974	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	323898	44	42	-0.5021	NA	NA	NA	3.24743354552488e-24	320854	331014
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	326323	32558677	11577	11176	0.0015	3.24743354552488e-24	320854	331014	9.4167727377058e-61	32558677	32564884
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-1.7094	9.4167727377058e-61	32558677	32564884	0.0118257526411374	32588005	32613538
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	8	-0.5052	0.0118257526411374	32588005	32613538	8.59700794297764e-05	32609525	32654861
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	35862502	1382	1340	0.019	8.59700794297764e-05	32609525	32654861	3.80252411481621e-08	35856922	35862502
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	0.8171	3.80252411481621e-08	35856922	35862502	1.08046565104465e-08	35873335	35878656
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6650	0.0046	1.08046565104465e-08	35873335	35878656	2.60419444262142e-57	54035000	54035000
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-2.8577	2.60419444262142e-57	54035000	54035000	8.64541955523518e-57	54042734	54042734
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12723	-0.001	8.64541955523518e-57	54042734	54042734	1.03662302844905e-75	103841482	103841482
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.8563	1.03662302844905e-75	103841482	103841482	6.64451520803158e-77	103868154	103868154
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20346	-0.0016	6.64451520803158e-77	103868154	103868154	2.3552395885505e-100	165643653	165643653
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-3.2551	2.3552395885505e-100	165643653	165643653	6.29321791676095e-98	165650610	165650610
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1742	-0.0136	6.29321791676095e-98	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	40	0.0335	NA	NA	NA	2.0501565044638e-08	240576	244720
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-0.956	2.0501565044638e-08	240576	244720	8.94173943642823e-10	254342	256802
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	125831554	42393	40823	0.0047	8.94173943642823e-10	254342	256802	7.40465023343048e-10	125829681	125831554
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.2494	7.40465023343048e-10	125829681	125831554	3.40293789705924e-10	125837524	125839386
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3506	0.0059	3.40293789705924e-10	125837524	125839386	3.60336273860267e-11	133426938	133433384
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133453811	9	9	0.756	3.60336273860267e-11	133426938	133433384	9.317576760675e-12	133453811	133456873
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133455682	141410894	3699	3574	9e-04	9.317576760675e-12	133453811	133456873	1.70937709435487e-09	141405145	141417702
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.5484	1.70937709435487e-09	141405145	141417702	8.62119276765146e-08	141434131	141453012
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	115	-0.0084	8.62119276765146e-08	141434131	141453012	1.75844629185289e-87	141690753	141700432
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-2.9967	1.75844629185289e-87	141690753	141700432	8.92506424224431e-91	141709835	141714168
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	8.92506424224431e-91	141709835	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142161005	169	160	0.0956	NA	NA	NA	1.37386840527143e-24	142161005	142161005
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142167908	3	3	-2.2819	1.37386840527143e-24	142161005	142161005	3.51516536891198e-35	142167908	142167908
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	150183705	3287	3168	-0.0051	3.51516536891198e-35	142167908	142167908	5.20156739160869e-12	150179390	150190397
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150185843	150204599	10	10	-0.7458	5.20156739160869e-12	150179390	150190397	8.67653964739707e-12	150198615	150219388
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	150207208	158821263	3282	3174	-0.0023	8.67653964739707e-12	150198615	150219388	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.0024	NA	NA	NA	8.26426169086723e-17	581533	581533
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.0479	8.26426169086723e-17	581533	581533	4.30501033659615e-18	588865	588865
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7764	-0.0036	4.30501033659615e-18	588865	588865	7.29754066459024e-14	25120552	25120552
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	7.29754066459024e-14	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.796	NA	NA	NA	3.22527569530381e-14	25125700	25125700
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35002	0.0046	3.22527569530381e-14	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5255	0.004	NA	NA	NA	9.81687322629693e-16	15802255	15802255
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.8709	9.81687322629693e-16	15802255	15802255	7.01007465096645e-16	15807123	15807123
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2302	-0.0142	7.01007465096645e-16	15807123	15807123	1.27560231239357e-15	22477358	22477358
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.8637	1.27560231239357e-15	22477358	22477358	2.36009115625772e-15	22492603	22492603
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5022	0.0051	2.36009115625772e-15	22492603	22492603	5.46806253561206e-12	70926188	70926188
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.6622	5.46806253561206e-12	70926188	70926188	8.33395754132964e-12	70930528	70930528
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23930	-7e-04	8.33395754132964e-12	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	524029	177	167	0.0115	NA	NA	NA	8.20893295537315e-42	521445	526704
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	526704	591042	34	33	-0.859	8.20893295537315e-42	521445	526704	1.36842694123331e-55	588102	596329
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	592670	594684	2	0	NA	1.36842694123331e-55	588102	596329	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	596329	45489823	14244	13745	-0.0048	NA	NA	NA	2.55697140421733e-39	45468679	46399272
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47943524	122	115	0.3819	2.55697140421733e-39	45468679	46399272	4.45879533360695e-38	47162381	47980174
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47946216	135285645	30229	29100	0.0012	4.45879533360695e-38	47162381	47980174	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5744034	2140	2064	-0.0021	NA	NA	NA	3.83577053905652e-12	5738494	5747806
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5745329	5766615	14	13	-0.6604	3.83577053905652e-12	5738494	5747806	1.32530585670073e-12	5762182	5774108
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	7758275	861	827	0.0036	1.32530585670073e-12	5762182	5774108	5.5273262446514e-19	7757329	7758275
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7783492	9	9	-0.969	5.5273262446514e-19	7757329	7758275	1.76997516890407e-19	7783492	7803570
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	7800021	2	0	NA	1.76997516890407e-19	7783492	7803570	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7803570	55118214	13879	13357	0.0064	NA	NA	NA	6.69593641902962e-14	55092628	55136234
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	-0.4037	6.69593641902962e-14	55092628	55136234	1.12505570960633e-13	55194990	55230765
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27328	0.0069	1.12505570960633e-13	55194990	55230765	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	609689	251	244	0.0369	NA	NA	NA	2.43739511239337e-13	603552	619095
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	611272	651760	17	16	0.6424	2.43739511239337e-13	603552	619095	2.25592913642415e-14	643807	663212
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	653563	9523923	3474	3348	0.0148	2.25592913642415e-14	643807	663212	6.74364651451349e-50	9523923	9531133
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-2.054	6.74364651451349e-50	9523923	9531133	0.0359791594307207	9531133	9573313
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9599999	8	7	-0.6867	0.0359791594307207	9531133	9573313	2.55481700175698e-06	9563866	9607363
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11090914	564	546	-0.0176	2.55481700175698e-06	9563866	9607363	3.42874588940762e-07	11074107	11099711
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11093358	11121204	11	11	-0.5701	3.42874588940762e-07	11074107	11099711	5.47175791132659e-20	11121204	11123452
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11130871	5	5	-3.2815	5.47175791132659e-20	11121204	11123452	1.07429222802041e-74	11130871	11130871
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	67	-0.0235	1.07429222802041e-74	11130871	11130871	6.54721967950729e-16	11393473	11395862
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11440927	7	7	-1.1128	6.54721967950729e-16	11393473	11395862	2.50783937879382e-19	11440927	11452868
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	31890222	7033	6813	-0.0011	2.50783937879382e-19	11440927	11452868	1.97153245468688e-20	31879835	31890222
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31899792	31949481	8	8	1.0672	1.97153245468688e-20	31879835	31890222	1.04058615759256e-17	31949481	31954769
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31954769	33178741	467	447	0.0423	1.04058615759256e-17	31949481	31954769	2.14242890509206e-15	33178741	33178741
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	2.14242890509206e-15	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-1.9119	NA	NA	NA	2.21014072033170e-16	33198331	33198331
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	33201796	1	0	NA	2.2101407203317e-16	33198331	33198331	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33210537	132289090	33236	32018	0.0079	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7047	-0.0041	NA	NA	NA	6.853072126774e-32	37953582	37953582
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.6214	6.853072126774e-32	37953582	37953582	2.78599026496576e-31	37957844	37957844
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4700	-0.0049	2.78599026496576e-31	37957844	37957844	2.37749841099744e-26	49964838	49964838
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.4209	2.37749841099744e-26	49964838	49964838	2.75133401284178e-25	49971732	49971732
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	52253047	937	901	-0.0045	2.75133401284178e-25	49971732	49971732	1.28078046738519e-09	52250102	52253047
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	52254399	52261110	8	8	-0.76	1.28078046738519e-09	52250102	52253047	2.17900246722818e-10	52261110	52262714
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	52261881	71375082	4497	4353	0.0093	2.17900246722818e-10	52261110	52262714	2.40489671750918e-44	71375082	71375082
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-3.0993	2.40489671750918e-44	71375082	71375082	1.14100374078284e-44	71377671	71377671
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4469	-0.0026	1.14100374078284e-44	71377671	71377671	7.79155089099449e-12	89659397	89659397
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.6285	7.79155089099449e-12	89659397	89659397	4.63704355513031e-12	89662326	89662326
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9011	-0.0059	4.63704355513031e-12	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.6033	NA	NA	NA	3.4212912194625e-48	19483933	19535787
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	105856591	31643	30492	0.0068	3.4212912194625e-48	19483933	19535787	4.70797973932828e-11	105848335	105856591
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105875924	4	4	-1.1322	4.70797973932828e-11	105848335	105856591	3.13537676977395e-07	105875924	105881893
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	169	-0.059	3.13537676977395e-07	105875924	105881893	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3137	NA	NA	NA	1.91007537034334e-23	18452491	18452491
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18886649	25	24	-0.7722	1.91007537034334e-23	18452491	18452491	0.00031456187776636	18876677	19186696
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	20321772	130	125	-0.4395	0.00031456187776636	18876677	19186696	5.65399193721839e-56	20053008	20364680
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20330200	100298352	31162	30082	0.0016	5.65399193721839e-56	20053008	20364680	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14379	0.0145	NA	NA	NA	1.21748161865398e-17	57203733	57203733
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.9992	1.21748161865398e-17	57203733	57203733	8.57723168515174e-18	57206772	57206772
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5399	0.0113	8.57723168515174e-18	57206772	57206772	2.29177355651628e-43	75093957	75097331
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.5306	2.29177355651628e-43	75093957	75097331	2.24017579252395e-43	75099083	75100865
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4959	0.0035	2.24017579252395e-43	75099083	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	406	0.0396	NA	NA	NA	7.10290298002898e-09	1026339	1027736
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.0568	7.10290298002898e-09	1026339	1027736	4.27784493409464e-09	1030715	1031233
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	12936	0.0175	4.27784493409464e-09	1030715	1031233	2.64037074607389e-94	36673853	36673853
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.8657	2.64037074607389e-94	36673853	36673853	3.14481228706093e-94	36683509	36683509
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1941	0.0289	3.14481228706093e-94	36683509	36683509	3.38197817155957e-08	41501967	41522429
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	20	0.4683	3.38197817155957e-08	41501967	41522429	1.35841275582941e-08	41564408	41577520
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	78653545	13724	13166	0.016	1.35841275582941e-08	41564408	41577520	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	76116026	22963	22118	-0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	40543992	12694	12218	0.0307	NA	NA	NA	4.02383881978089e-55	40543992	40543992
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40548081	40553315	2	2	-3.5267	4.02383881978089e-55	40543992	40543992	4.88736027406015e-58	40553315	40553315
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	56825794	7178	6918	0.0371	4.88736027406015e-58	40553315	40553315	3.23180951379582e-08	56822197	56829614
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.7045	3.23180951379582e-08	56822197	56829614	9.60372155625013e-08	56837593	56844304
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3076	0.0223	9.60372155625013e-08	56837593	56844304	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	568	0.0046	NA	NA	NA	1.38338686706702e-105	1506379	1511632
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1525300	7	7	-2.6079	1.38338686706702e-105	1506379	1511632	3.72079411020827e-110	1523000	1525300
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	62419534	20986	20257	0.0073	3.72079411020827e-110	1523000	1525300	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12941	0.0022	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	9193	0.0175	NA	NA	NA	1.74912752082143e-33	35472378	35472378
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.7356	1.74912752082143e-33	35472378	35472378	3.29306290660918e-33	35476942	35476942
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6730	0.0215	3.29306290660918e-33	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1529	2	2	-0.528	NA	NA	NA	4.03153164598593e-06	1529	134946
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3237	2708291	1791	1716	0.063	4.03153164598593e-06	1529	134946	0	2706218	2712641
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1738	0.8938	0	2706218	2712641	3.47753462091759e-09	8447855	8458058
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8473482	8	8	0.0967	3.47753462091759e-09	8447855	8458058	1.97217855490127e-10	8466917	8477126
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	76998610	21140	20410	0.9243	1.97217855490127e-10	8466917	8477126	3.66111270046410e-25	76998610	76998610
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.4332	3.6611127004641e-25	76998610	76998610	3.71628602617146e-25	77010018	77010018
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21394	0.9202	3.71628602617146e-25	77010018	77010018	1.04698050431065e-311	154578922	154586690
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	0.0234	1.04698050431065e-311	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	117	-3.0073	NA	NA	NA	1.32172025069747e-17	2973379	3223585
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.32172025069747e-17	2973379	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8438	NA	NA	NA	1.52669767222108e-10	5531459	6696721
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	5672441	1	0	NA	1.52669767222108e-10	5531459	6696721	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	6942585	110	101	-2.7663	NA	NA	NA	7.49784032205817e-05	6899085	7016814
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6944497	7653082	223	220	-2.1021	7.49784032205817e-05	6899085	7016814	1.51731117642580e-05	7605311	7665429
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	44	-3.0697	1.5173111764258e-05	7605311	7665429	3.2403683671377e-11	7717556	7723783
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7756907	13	12	-1.0761	3.2403683671377e-11	7717556	7723783	1.04139008789406e-05	7755522	7785973
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7758635	10475426	423	410	-2.6539	1.04139008789406e-05	7755522	7785973	6.81335249574769e-13	10451527	10506718
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10480759	11698871	30	30	-1.2414	6.81335249574769e-13	10451527	10506718	2.35010871467071e-07	10646662	12502304
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-3.3976	2.35010871467071e-07	10646662	12502304	1.51969806529264e-17	12536761	12542979
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12590969	24	22	-0.8624	1.51969806529264e-17	12536761	12542979	8.55994880921926e-12	12588578	12593244
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12611624	11	11	-3.02	8.55994880921926e-12	12588578	12593244	1.12983980330304e-05	12605673	12615455
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	19	-1.3254	1.12983980330304e-05	12605673	12615455	6.28550657170075e-11	12668435	12682301
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	8	-3.6991	6.28550657170075e-11	12668435	12682301	2.29470442984934e-05	12725675	12776542
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12926941	47	43	-2.239	2.29470442984934e-05	12725675	12776542	0.000842658318683594	12901857	12997864
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	77	-1.4077	0.000842658318683594	12901857	12997864	1.28335240772069e-17	13104920	13147329
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13868296	257	249	-2.6268	1.28335240772069e-17	13104920	13147329	0.000127999528802522	13568997	13956735
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14353244	156	147	-3.1049	0.000127999528802522	13568997	13956735	1.40904979913479e-05	14244120	14409975
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14508021	92	89	-2.431	1.40904979913479e-05	14244120	14409975	5.00865285280709e-05	14492454	14539230
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.00865285280709e-05	14492454	14539230	NA	NA	NA
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.2937	NA	NA	NA	9.4992899420299e-08	14561228	14601309
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15206674	151	146	-2.6838	9.4992899420299e-08	14561228	14601309	0.000109258978662565	15199550	15206674
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15221212	5	5	-0.4036	0.000109258978662565	15199550	15206674	0.000169392041024821	15221212	15240367
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15222741	15523178	172	166	-2.7729	0.000169392041024821	15221212	15240367	6.44423104580109e-05	15497443	15527805
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15541293	10	10	-0.9835	6.44423104580109e-05	15497443	15527805	1.24377476317766e-07	15537260	15547576
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15542314	15911389	78	75	-2.8481	1.24377476317766e-07	15537260	15547576	6.01440288913348e-05	15801779	15967120
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15915466	16042966	50	48	-1.9869	6.01440288913348e-05	15801779	15967120	3.92752156082826e-05	16007396	16124286
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	22139807	1051	1008	-2.7716	3.92752156082826e-05	16007396	16124286	8.81931600376433e-06	22043133	22165808
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22181855	12	11	-1.0697	8.81931600376433e-06	22043133	22165808	1.35022795313990e-17	22179794	22182080
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22268552	26	26	-3.6016	1.3502279531399e-17	22179794	22182080	2.196079641983e-06	22248936	22387293
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22877495	46	44	-2.5599	2.196079641983e-06	22248936	22387293	0.104110289110636	22789287	22921089
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	25737663	20	20	-3.1781	0.104110289110636	22789287	22921089	2.09194367594366e-24	23283689	26871442
MSK_252152912312_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	83	-0.9564	2.09194367594366e-24	23283689	26871442	NA	NA	NA
