Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	31197658	11384	11118	0.018	NA	NA	NA	1.86667510220395e-11	31158662	31218832
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31200059	31314615	60	60	-0.1793	1.86667510220395e-11	31158662	31218832	1.95039809180002e-14	31300071	31339953
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31315832	32315157	412	398	0.0302	1.95039809180002e-14	31300071	31339953	9.34925640626944e-11	32315157	32315157
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32318893	32320470	2	2	-0.9089	9.34925640626944e-11	32315157	32315157	2.65278260050179e-09	32320470	32320470
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32322207	35492878	1280	1251	0.0288	2.65278260050179e-09	32320470	32320470	9.88795744075381e-06	35449455	35499701
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35494817	35534592	15	15	-0.244	9.88795744075381e-06	35449455	35499701	3.50021952397194e-20	35528530	35561612
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35536713	72537426	14741	14382	-0.0028	3.50021952397194e-20	35528530	35561612	0	72537426	72539143
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-3.5684	0	72537426	72539143	0	72574479	72579311
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	120333077	15522	15113	-0.0097	0	72574479	72579311	3.19119984353559e-08	120323428	120338395
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120386887	9	9	-0.4028	3.19119984353559e-08	120323428	120338395	3.51567785777198e-15	120383098	120854952
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120404156	147315217	736	718	-0.039	3.51567785777198e-15	120383098	120854952	2.81226303944214e-17	147308557	147352661
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147326097	147460661	23	22	0.3363	2.81226303944214e-17	147308557	147352661	2.80337433298478e-13	147441409	147490553
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147467273	150839754	1270	1241	0.0118	2.80337433298478e-13	147441409	147490553	1.16083536155394e-26	150839754	150841957
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	4	-1.0581	1.16083536155394e-26	150839754	150841957	1.82924840596618e-25	150848509	150851439
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	0.058	1.82924840596618e-25	150848509	150851439	1.41438482366631e-162	151026228	151026228
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151032967	2	2	-3.2121	1.41438482366631e-162	151026228	151026228	0	151032967	151032967
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151033188	151036435	2	2	-5.5274	0	151032967	151032967	0	151036435	151036435
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2611	0.0147	0	151036435	151036435	2.3243590298004e-20	157133150	157133150
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.3823	2.3243590298004e-20	157133150	157133150	1.99342444274527e-21	157136342	157136342
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4015	-0.0033	1.99342444274527e-21	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.7141	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	169318893	657	641	-0.0219	0	167507898	167507898	1.35345075002336e-06	169306497	169321682
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	169319655	169344186	23	23	0.2085	1.35345075002336e-06	169306497	169321682	1.63136315677667e-07	169339803	169353191
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	169344639	173060997	1497	1462	-0.0182	1.63136315677667e-07	169339803	169353191	0	173060997	173060997
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-4.132	0	173060997	173060997	4.65759915627969e-301	173067337	173067337
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	185979586	5029	4898	-0.0117	4.65759915627969e-301	173067337	173067337	8.15403244624577e-17	185979586	185979586
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.2039	8.15403244624577e-17	185979586	185979586	1.18115892703079e-15	185988138	185988138
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200600795	4137	4053	0.0066	1.18115892703079e-15	185988138	185988138	6.67551999281225e-16	200592050	200613454
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200602881	200667381	23	23	-0.3504	6.67551999281225e-16	200592050	200613454	2.86180197731917e-05	200652799	200667381
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	200693672	10	10	0.0417	2.86180197731917e-05	200652799	200667381	1.12419462855442e-16	200693672	200693672
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200696309	200787319	4	4	-0.5404	1.12419462855442e-16	200693672	200693672	3.4279116799045e-07	200787319	200797743
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	204724293	1634	1591	0.0202	3.4279116799045e-07	200787319	200797743	6.6848934248901e-09	204700007	204741536
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204725496	204785016	30	30	0.2492	6.6848934248901e-09	204700007	204741536	3.82751928170641e-10	204772495	204799880
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204790759	233186275	10293	10063	-9e-04	3.82751928170641e-10	204772495	204799880	5.53491604846586e-05	233144590	233218351
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	233190695	233255450	19	19	0.2262	5.53491604846586e-05	233144590	233218351	1.14697027593296e-06	233222436	233329839
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	233309013	236719235	1461	1440	-0.0217	1.14697027593296e-06	233222436	233329839	3.89990385087337e-07	236699060	236732120
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	236722662	236802487	22	21	0.2214	3.89990385087337e-07	236699060	236732120	4.73959813996482e-27	236751850	236926339
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	236811976	247186514	3950	3861	-0.0012	4.73959813996482e-27	236751850	236926339	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	17082016	5089	4962	0.0172	NA	NA	NA	1.45169420451267e-17	17082016	17082016
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17087488	17102047	4	4	-0.8862	1.45169420451267e-17	17082016	17082016	1.23743757287046e-17	17102047	17102047
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17105804	34543992	6429	6276	0.0031	1.23743757287046e-17	17102047	17102047	9.83891260735551e-14	34539603	34556434
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.3756	9.8389126073555e-14	34539603	34556434	7.78484676594366e-14	34580533	34597294
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37800512	1367	1334	-0.0092	7.78484676594366e-14	34580533	34597294	1.31193723607995e-14	37785655	37815049
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	24	-0.353	1.31193723607995e-14	37785655	37815049	3.74513709617317e-16	37846240	37866455
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	50366515	4990	4887	-0.0108	3.74513709617317e-16	37846240	37866455	6.05158211741489e-13	50366515	50366515
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50368207	50370054	2	2	-1.0729	6.05158211741489e-13	50366515	50366515	4.94794124072462e-13	50370054	50370054
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50371671	52600588	809	790	-0.0184	4.94794124072462e-13	50370054	50370054	1.8862936443112e-291	52600588	52600588
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-3.1833	1.8862936443112e-291	52600588	52600588	1.28712909421911e-290	52635695	52635695
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25782	-0.0017	1.28712909421911e-290	52635695	52635695	6.40683685613492e-15	146562545	146582195
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.6357	6.40683685613492e-15	146562545	146582195	2.82472786261507e-09	146589486	146597405
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2161	-0.0135	2.82472786261507e-09	146589486	146597405	9.27154681599853e-10	154601442	154601442
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.8868	9.27154681599853e-10	154601442	154601442	4.06076081673514e-09	154606943	154606943
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	156269427	463	456	0.0113	4.06076081673514e-09	154606943	154606943	4.86260150460664e-13	156269427	156269427
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	156275402	156282480	2	2	-1.0305	4.86260150460664e-13	156269427	156269427	1.74825468369292e-11	156282480	156282480
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	156291152	169872912	4686	4565	-0.0234	1.74825468369292e-11	156282480	156282480	1.15676954620009e-08	169872912	169872912
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	169878766	169880455	2	2	-0.9051	1.15676954620009e-08	169872912	169872912	6.25984823087331e-19	169880455	169880455
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	169883497	242501239	25324	24733	-0.0014	6.25984823087331e-19	169880455	169880455	1.02004802148088e-31	242492286	242521765
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242677011	62	62	0.2995	1.02004802148088e-31	242492286	242521765	0.00699422070554593	242632434	242677011
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677069	242689978	5	5	-0.0822	0.00699422070554593	242632434	242677011	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10539	-0.0085	NA	NA	NA	6.25956151872445e-23	32074432	32074432
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.3985	6.25956151872445e-23	32074432	32074432	2.30330322767261e-17	32080848	32080848
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32403022	139	135	0.0062	2.30330322767261e-17	32080848	32080848	0.000180174065494974	32375372	32413436
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32404752	32450303	23	22	-0.22	0.000180174065494974	32375372	32413436	1.29862711428367e-06	32441014	32474323
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32453395	47460892	5258	5133	0.0182	1.29862711428367e-06	32441014	32474323	1.07510931194459e-11	47460892	47460892
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.0484	1.07510931194459e-11	47460892	47460892	4.77898997502919e-30	47466921	47466921
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	65160634	7290	7113	5e-04	4.77898997502919e-30	47466921	47466921	1.45115707628114e-29	65160634	65160634
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-0.9742	1.45115707628114e-29	65160634	65160634	6.79397655367371e-10	65184180	65184180
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	75803353	3371	3284	-0.0395	6.79397655367371e-10	65184180	65184180	8.52333424797522e-12	75798154	75853052
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75845446	75875904	11	11	-0.4739	8.52333424797522e-12	75798154	75853052	5.24415199026934e-14	75870144	76006248
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	133189686	16815	16390	-0.001	5.24415199026934e-14	75870144	76006248	3.21044217833643e-21	133189686	133189686
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.3502	3.21044217833643e-21	133189686	133189686	3.83642871136394e-21	133194685	133194685
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	152993150	6315	6154	-3e-04	3.83642871136394e-21	133194685	133194685	1.16146327969687e-67	152991040	152993150
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	152996121	153032375	17	16	-0.8458	1.16146327969687e-67	152991040	152993150	5.26514076542652e-69	153032375	153032375
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	153035523	164005577	3448	3372	-0.0033	5.26514076542652e-69	153032375	153032375	9.77198075110926e-223	164005577	164005577
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.693	9.77198075110926e-223	164005577	164005577	5.6183581392771e-106	164027724	164027724
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	18	0.5744	5.6183581392771e-106	164027724	164027724	1.35768502925219e-27	164105613	164115417
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	167996046	872	853	0.0349	1.35768502925219e-27	164105613	164115417	2.73036937334644e-10	167990961	167998267
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	167998267	168016895	9	9	0.5044	2.73036937334644e-10	167990961	167998267	1.04544769636649e-13	168014740	168021667
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	168019533	194354505	9249	9037	-0.0146	1.04544769636649e-13	168014740	168021667	0	194354505	194354505
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.1166	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1933	-0.0021	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9337	0.0013	NA	NA	NA	5.41877553085138e-27	34439897	34457648
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6544	5.41877553085138e-27	34439897	34457648	2.89721541882875e-14	34485596	34506297
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	57362805	6464	6311	-0.0086	2.89721541882875e-14	34485596	34506297	8.75492639920864e-08	57335514	57385540
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57365818	57474252	31	29	-0.2299	8.75492639920864e-08	57335514	57385540	3.2366866396268e-09	57441662	57488864
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57476561	66614891	1799	1756	0.0044	3.2366866396268e-09	57441662	57488864	1.35437476687903e-10	66612156	66614891
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	66616989	66617052	2	2	-0.939	1.35437476687903e-10	66612156	66614891	1.57016315650719e-09	66617052	66617052
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	66623878	88752705	7166	7012	-0.0102	1.57016315650719e-09	66617052	66617052	7.44673911372296e-12	88752705	88752705
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.0394	7.44673911372296e-12	88752705	88752705	1.99026594815752e-12	88756721	88756721
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	93785591	1730	1708	0.0012	1.99026594815752e-12	88756721	88756721	3.31008274947567e-07	93784190	93785591
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	93787564	93788953	2	2	-0.8006	3.31008274947567e-07	93784190	93785591	5.8386276063202e-07	93788953	93793550
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	93793550	132185870	11268	10995	-0.0057	5.8386276063202e-07	93788953	93793550	6.72907193992348e-14	132185870	132185870
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	132191159	132196377	2	2	-1.1013	6.72907193992348e-14	132185870	132185870	1.62186736424906e-14	132196377	132196377
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	132203606	138307863	926	900	0.0139	1.62186736424906e-14	132196377	132196377	2.69620972218190e-12	138307863	138307863
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-1.0142	2.6962097221819e-12	138307863	138307863	9.73476372855197e-12	138319409	138319409
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	173224400	10676	10412	-0.0105	9.73476372855197e-12	138319409	138319409	1.41612709057611e-13	173224400	173224400
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.0644	1.41612709057611e-13	173224400	173224400	3.80245167306976e-13	173228860	173228860
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5384	2e-04	3.80245167306976e-13	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	217	0.0137	NA	NA	NA	1.13950203341743e-59	737829	737829
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	873365	8	8	1.2529	1.13950203341743e-59	737829	737829	3.62648705377035e-75	873365	873365
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	116853795	32265	31512	-0.0072	3.62648705377035e-75	873365	873365	1.53291137810908e-38	116853795	116853795
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116857709	116870196	5	5	-0.988	1.53291137810908e-38	116853795	116853795	1.13815220524095e-28	116870196	116870196
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116875705	135178583	5513	5398	9e-04	1.13815220524095e-28	116870196	116870196	8.66358449895326e-11	135075215	135205794
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	135179920	135266245	45	41	0.2061	8.66358449895326e-11	135075215	135205794	1.23292726578813e-09	135236908	135288165
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	135268433	140533456	2166	2109	0.0168	1.23292726578813e-09	135236908	135288165	1.75720056942874e-09	140532277	140533456
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-0.8371	1.75720056942874e-09	140532277	140533456	1.02316552115280e-10	140538666	140538666
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	140949800	189	182	0.0572	1.0231655211528e-10	140538666	140538666	2.77171710110559e-07	140948645	140949800
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140951370	140952556	2	2	-0.6831	2.77171710110559e-07	140948645	140949800	2.9171004572316e-05	140952556	140957438
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140957438	172248975	10512	10250	-0.0133	2.9171004572316e-05	140952556	140957438	1.46858587040370e-09	172244593	172252270
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172250860	172250860	1	0	NA	1.4685858704037e-09	172244593	172252270	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172252270	172262253	7	6	0.5256	NA	NA	NA	1.55385051537475e-07	172261055	172271626
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172264180	172264180	1	0	NA	1.55385051537475e-07	172261055	172271626	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172266276	180194323	2707	2644	0.0172	NA	NA	NA	1.90791061620358e-07	180184269	180194323
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180364670	11	11	-0.3561	1.90791061620358e-07	180184269	180194323	4.08832838527322e-09	180364670	180379352
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180365950	180644810	110	107	0.0734	4.08832838527322e-09	180364670	180379352	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	937596	339	330	-0.0128	NA	NA	NA	2.20705696142915e-14	933311	937596
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	939749	962809	8	8	0.5625	2.20705696142915e-14	933311	937596	3.60051568534416e-15	962809	965004
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	965004	17638603	5857	5718	-0.0077	3.60051568534416e-15	962809	965004	3.95053101484065e-08	17627782	17644753
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17639856	17668228	12	11	0.3405	3.95053101484065e-08	17627782	17644753	2.38775315866359e-07	17657895	17690415
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17678572	29941766	4370	4257	-0.0194	2.38775315866359e-07	17657895	17690415	1.6360625910014e-13	29935438	29981912
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	29950805	1	0	NA	1.6360625910014e-13	29935438	29981912	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-0.4321	NA	NA	NA	1.86913354606514e-17	29995247	30025480
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32558677	1075	1045	0.062	1.86913354606514e-17	29995247	30025480	2.47868679271378e-145	32558677	32564884
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32593151	6	5	-2.5289	2.47868679271378e-145	32558677	32564884	2.05482415479032e-14	32564884	32593151
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32713363	39	39	-0.1842	2.05482415479032e-14	32564884	32593151	0.000275459167647658	32698659	32721872
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-0.9926	0.000275459167647658	32698659	32721872	0.027490851900316	32718991	32736223
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32739800	6	5	-0.3445	0.027490851900316	32718991	32736223	6.65704675201934e-13	32732764	32760574
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	65767409	10654	10415	8e-04	6.65704675201934e-13	32732764	32760574	1.31629066700071e-13	65765501	65767409
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65778663	3	3	-0.6829	1.31629066700071e-13	65765501	65767409	8.12553627131815e-18	65778663	65778663
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65780036	65823778	16	15	-0.0474	8.12553627131815e-18	65778663	65778663	2.42387040790117e-13	65823778	65823778
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65825343	65826936	2	2	-0.743	2.42387040790117e-13	65823778	65823778	8.46090174654306e-07	65826936	65828418
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65828418	67060622	352	342	0.0289	8.46090174654306e-07	65826936	65828418	4.81698134381825e-20	67055837	67068673
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.7365	4.81698134381825e-20	67055837	67068673	3.86691982359279e-19	67101355	67111812
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	67109079	1	0	NA	3.86691982359279e-19	67101355	67111812	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67111812	79018959	3654	3563	0.0037	NA	NA	NA	7.79479081699577e-11	79008946	79028813
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.3789	7.79479081699577e-11	79008946	79028813	2.67617557799949e-09	79079988	79119694
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	79095415	1	0	NA	2.67617557799949e-09	79079988	79119694	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	81334248	727	710	-0.0148	NA	NA	NA	1.52243020331999e-11	81332468	81334248
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-0.8509	1.52243020331999e-11	81332468	81334248	9.42800403197144e-13	81348170	81350502
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	102039635	5541	5405	-0.0069	9.42800403197144e-13	81348170	81350502	9.71583222536806e-19	102039635	102039635
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-1.0224	9.71583222536806e-19	102039635	102039635	1.23392806139993e-17	102044331	102044331
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	470	0.0226	1.23392806139993e-17	102044331	102044331	5.03166586257444e-33	103841482	103841482
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.253	5.03166586257444e-33	103841482	103841482	3.76999240254687e-37	103868154	103868154
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	124478061	6632	6476	-0.0107	3.76999240254687e-37	103868154	103868154	4.20070999665423e-21	124467598	124478216
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124478216	124513895	14	14	0.502	4.20070999665423e-21	124467598	124478216	1.12902700892137e-20	124509956	124518529
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124517144	165643653	14460	14136	-0.008	1.12902700892137e-20	124509956	124518529	1.42460924216193e-16	165643653	165643653
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.8503	1.42460924216193e-16	165643653	165643653	4.21774480542074e-14	165650610	165653315
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	168075043	898	878	0.0044	4.21774480542074e-14	165650610	165653315	4.40459304139484e-56	168073309	168076928
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168076928	168169857	42	40	0.5374	4.40459304139484e-56	168073309	168076928	0.000489073233506584	168150422	168169857
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168172077	168182100	7	7	0.8145	0.000489073233506584	168150422	168169857	1.17528605475172e-05	168182100	168189740
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168183389	168340275	56	56	0.4779	1.17528605475172e-05	168182100	168189740	1.84406735066387e-56	168331501	168349663
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168342734	170753106	801	780	0.0403	1.84406735066387e-56	168331501	168349663	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	57545013	19123	18645	4e-04	NA	NA	NA	3.88581116847811e-32	57540358	57545013
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57548601	57562083	2	2	-0.7248	3.88581116847811e-32	57540358	57545013	1.12331579801009e-06	57562083	57566117
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57566117	64523575	437	428	0.091	1.12331579801009e-06	57562083	57566117	4.64615225282352e-19	64523575	64523575
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.2666	4.64615225282352e-19	64523575	64523575	2.64952100534383e-17	64532949	64532949
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	75699886	3101	3019	-4e-04	2.64952100534383e-17	64532949	64532949	2.62928406970986e-10	75685849	75707893
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75701355	75741690	22	21	0.3054	2.62928406970986e-10	75685849	75707893	1.58604145683696e-12	75735897	75751310
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75743352	93162991	5761	5623	-0.0161	1.58604145683696e-12	75735897	75751310	8.10416690446342e-12	93162991	93162991
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.995	8.10416690446342e-12	93162991	93162991	5.63092989805777e-11	93168978	93168978
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2549	0.004	5.63092989805777e-11	93168978	93168978	6.37982867176132e-16	100164752	100164752
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.8347	6.37982867176132e-16	100164752	100164752	6.99337147737244e-14	100174991	100178968
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	105384065	2199	2141	-0.0127	6.99337147737244e-14	100174991	100178968	3.22332913979132e-06	105382418	105384065
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	105386067	105388056	2	2	0.7801	3.22332913979132e-06	105382418	105384065	8.11114622062668e-07	105388056	105389436
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	105389436	109216032	1693	1653	-0.0012	8.11114622062668e-07	105388056	105389436	5.99197030083255e-13	109214735	109216032
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109244233	7	7	0.5671	5.99197030083255e-13	109214735	109216032	1.98960041853993e-13	109244233	109245944
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	118611324	4298	4201	-0.0091	1.98960041853993e-13	109244233	109245944	6.81120674390172e-258	118611324	118611324
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.7789	6.81120674390172e-258	118611324	118611324	5.41035357284608e-267	118620875	118620875
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3105	0.0057	5.41035357284608e-267	118620875	118620875	2.51647704541782e-133	125831554	125831554
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-2.6752	2.51647704541782e-133	125831554	125831554	1.73373963543929e-117	125837524	125837524
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3563	-0.0102	1.73373963543929e-117	125837524	125837524	1.61429841580252e-32	133433384	133433384
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8553	1.61429841580252e-32	133433384	133433384	2.41595412086480e-32	133448277	133448277
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3597	9e-04	2.4159541208648e-32	133448277	133448277	7.80618498217196e-24	141409512	141413352
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.557	7.80618498217196e-24	141409512	141413352	2.12945539468049e-18	141440184	141443577
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	114	-0.0176	2.12945539468049e-18	141440184	141443577	5.70580718772342e-195	141690753	141690753
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-3.6802	5.70580718772342e-195	141690753	141690753	0.0185376887996501	141705163	141711513
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141714168	2	2	-1.3682	0.0185376887996501	141705163	141711513	8.80870489270885e-19	141714168	141714168
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	144788636	1134	1115	0.0253	8.80870489270885e-19	141714168	141714168	1.38246211783329e-10	144787523	144788636
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144789849	144800233	5	5	0.6354	1.38246211783329e-10	144787523	144788636	3.14210185762765e-10	144800233	144804749
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144802294	158821263	5613	5500	0.0112	3.14210185762765e-10	144800233	144804749	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.017	NA	NA	NA	3.47911554828209e-13	581533	581533
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.3419	3.47911554828209e-13	581533	581533	1.78334712124761e-19	588865	588865
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	6926661	2270	2225	0.0094	1.78334712124761e-19	588865	588865	1.27567654975694e-36	6909487	7156900
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	-0.8095	1.27567654975694e-36	6909487	7156900	1.07337863297889e-32	7790934	8137794
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5606	-0.0096	1.07337863297889e-32	7790934	8137794	1.23662272832210e-79	25120552	25120552
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.2366227283221e-79	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.7586	NA	NA	NA	1.20713075768399e-88	25125700	25125700
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4799	0.0041	1.20713075768399e-88	25125700	25125700	0	39350798	39352361
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-4.0154	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	433	0.0059	0	39504332	39505256	1.21765165734487e-40	40892587	40892587
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.1263	1.21765165734487e-40	40892587	40892587	7.85583193379128e-47	40897469	40897469
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1689	0.002	7.85583193379128e-47	40897469	40897469	2.65708308435406e-303	51191560	51191560
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-3.6938	2.65708308435406e-303	51191560	51191560	9.88625357328334e-321	51200291	51200291
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	9.88625357328334e-321	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	85422157	9921	9664	-0.007	NA	NA	NA	1.28641474346178e-23	85422157	85422157
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	5	-0.9152	1.28641474346178e-23	85422157	85422157	7.52243981747553e-25	85431319	85431319
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	85434122	1	0	NA	7.52243981747553e-25	85431319	85431319	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85436597	87255865	576	563	-0.0117	NA	NA	NA	1.64102409247046e-20	87255865	87255865
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-1.0704	1.64102409247046e-20	87255865	87255865	1.17475618127213e-19	87262662	87262662
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	115701209	9048	8807	-0.0086	1.17475618127213e-19	87262662	87262662	8.38704084394305e-10	115701209	115701209
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.9427	8.38704084394305e-10	115701209	115701209	1.57740713674226e-31	115711730	115711730
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9497	-0.0076	1.57740713674226e-31	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2419	-0.0173	NA	NA	NA	2.48022876348878e-09	6679968	6685358
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6701392	4	4	-0.6843	2.48022876348878e-09	6679968	6685358	1.10810324073991e-10	6701392	6704941
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6704941	15802255	2983	2906	-0.0147	1.10810324073991e-10	6701392	6704941	2.07071403994318e-232	15802255	15802255
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-4.3175	2.07071403994318e-232	15802255	15802255	1.33651403811071e-216	15807123	15807123
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7436	-0.0012	1.33651403811071e-216	15807123	15807123	1.50465386330140e-35	70926188	70926188
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7629	1.5046538633014e-35	70926188	70926188	1.00728916020758e-37	70930528	70930528
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	86960197	5360	5231	-0.0231	1.00728916020758e-37	70930528	70930528	4.85054364271921e-15	86960197	86960197
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	1.1189	4.85054364271921e-15	86960197	86960197	1.03975059599734e-13	86965458	86965458
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	100348045	4557	4441	0.0088	1.03975059599734e-13	86965458	86965458	2.11419274632307e-31	100348045	100348045
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.6648	2.11419274632307e-31	100348045	100348045	2.36755430586404e-29	100350814	100350814
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	140145683	14949	14594	0.0052	2.36755430586404e-29	100350814	100350814	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4584	-0.0076	NA	NA	NA	4.06685376693679e-10	13553503	13553503
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.9001	4.06685376693679e-10	13553503	13553503	6.84478557656689e-10	13556315	13556315
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	19803498	2231	2181	-0.0026	6.84478557656689e-10	13556315	13556315	1.44662656997494e-09	19801924	19805240
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	19805240	19813308	5	5	-0.562	1.44662656997494e-09	19801924	19805240	2.20535414486253e-08	19811167	19816617
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	19815147	31284926	4372	4249	-0.0135	2.20535414486253e-08	19811167	19816617	2.37097693054177e-09	31284756	31284926
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.7586	2.37097693054177e-09	31284756	31284926	1.24557814240286e-09	31291525	31293140
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	46389734	3165	3092	5e-04	1.24557814240286e-09	31291525	31293140	2.53396776096222e-22	45474003	46407311
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46391653	47103846	90	86	0.2155	2.53396776096222e-22	45474003	46407311	5.93255270095603e-18	47072924	47148030
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47106750	56115736	2481	2425	0.0121	5.93255270095603e-18	47072924	47148030	8.64872414870529e-14	56112067	56118633
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	10	0.5354	8.64872414870529e-14	56112067	56118633	5.16830514050434e-17	56137463	56142414
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	70949263	4634	4528	-0.0088	5.16830514050434e-17	56137463	56142414	1.40468814857353e-19	70949263	70949263
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.9287	1.40468814857353e-19	70949263	70949263	1.27216439224593e-19	70960187	70960187
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2847	0.0095	1.27216439224593e-19	70960187	70960187	7.48802144218978e-08	77917870	77917893
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.7084	7.48802144218978e-08	77917870	77917893	1.56408416335552e-11	77928738	77936034
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19720	0.0054	1.56408416335552e-11	77928738	77936034	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1730	0.0103	NA	NA	NA	7.42948520693036e-16	4923300	4926583
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.8378	7.42948520693036e-16	4923300	4926583	5.40740236970359e-19	4931000	4932214
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14752	1e-04	5.40740236970359e-19	4931000	4932214	7.55989127807982e-44	55112618	55123719
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	0.4567	7.55989127807982e-44	55112618	55123719	1.35702263539685e-38	55207305	55219985
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	81519837	9953	9724	0.0169	1.35702263539685e-38	55207305	55219985	5.76498956914331e-11	81396497	81538067
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81524127	81544262	6	6	0.2756	5.76498956914331e-11	81396497	81538067	8.82906623018437e-20	81544262	81544262
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81551675	81557345	3	3	1.6225	8.82906623018437e-20	81544262	81544262	7.68668832657476e-46	81557345	81557345
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81561626	98525455	5301	5167	-0.0164	7.68668832657476e-46	81557345	81557345	2.04087674671165e-10	98525455	98525455
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	98526764	98528073	2	2	0.9625	2.04087674671165e-10	98525455	98525455	7.66259531777698e-10	98528073	98528073
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	98532002	134450318	13095	12768	-0.0014	7.66259531777698e-10	98528073	98528073	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3649	0.0046	NA	NA	NA	3.07792365623647e-46	9523923	9523923
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	1.2968	3.07792365623647e-46	9523923	9523923	5.30793568686783e-21	9554149	9554149
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	10	0.438	5.30793568686783e-21	9554149	9554149	4.4575663233995e-11	9607363	9626736
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	46992235	11725	11483	-0.0141	4.4575663233995e-11	9607363	9626736	1.23950722149402e-75	46992235	46992235
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-2.5809	1.23950722149402e-75	46992235	46992235	3.49655897686787e-75	46996769	46996769
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	130943064	29124	28433	-0.0022	3.49655897686787e-75	46996769	46996769	5.45788511084896e-16	130943064	130943064
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.2144	5.45788511084896e-16	130943064	130943064	9.76132030206316e-14	130946248	130946248
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	536	0.0109	9.76132030206316e-14	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7184	0.0014	NA	NA	NA	1.11379827710188e-163	37953582	37953582
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.7226	1.11379827710188e-163	37953582	37953582	2.20723682456522e-172	37957844	37957844
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	42368413	1773	1730	-0.0233	2.20723682456522e-172	37957844	37957844	2.83285801251514e-49	42366568	42369769
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42369769	42423317	27	25	0.5476	2.83285801251514e-49	42366568	42369769	2.51681100252467e-43	42422094	42424586
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42424586	44889680	1083	1062	-0.0239	2.51681100252467e-43	42422094	42424586	4.5155378932444e-08	44884803	44892219
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	44890846	44908144	13	13	0.3256	4.5155378932444e-08	44884803	44892219	2.90311869686737e-08	44905343	44917189
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	44909513	49964838	1983	1934	-0.0142	2.90311869686737e-08	44905343	44917189	2.97633861516575e-148	49964838	49964838
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.5696	2.97633861516575e-148	49964838	49964838	6.3734744770247e-162	49971732	49971732
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	68142120	4513	4407	0.0026	6.3734744770247e-162	49971732	49971732	1.08400048312967e-07	68132217	68146755
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	10	0.364	1.08400048312967e-07	68132217	68146755	4.17048953261438e-18	68160625	68169957
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	89659397	5549	5418	-0.0089	4.17048953261438e-18	68160625	68169957	1.00542648918745e-19	89659397	89659397
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.0199	1.00542648918745e-19	89659397	89659397	4.17116371220897e-11	89662326	89662326
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9130	0.002	4.17116371220897e-11	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	58	-0.6548	NA	NA	NA	2.21077535998113e-139	19490630	19535787
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	19497023	1	0	NA	2.21077535998113e-139	19490630	19535787	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19535787	34498340	5600	5498	0.0039	NA	NA	NA	2.58433988761042e-25	34498340	34498340
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34499884	34501839	2	2	-1.0753	2.58433988761042e-25	34498340	34498340	2.38351158343276e-10	34501839	34501839
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34505234	34674458	87	85	0.0723	2.38351158343276e-10	34501839	34501839	3.28448213339373e-13	34666996	34674458
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.084	3.28448213339373e-13	34666996	34674458	1.91933713484641e-21	34683810	34683810
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1853	0.0049	1.91933713484641e-21	34683810	34683810	5.02554242179166e-14	40670538	40676611
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.5434	5.02554242179166e-14	40670538	40676611	5.68128588619924e-13	40726930	40746865
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	92070208	18756	18327	-0.0055	5.68128588619924e-13	40726930	40746865	2.86518428193127e-07	92066492	92074484
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	92073279	92084160	7	7	0.4449	2.86518428193127e-07	92066492	92074484	3.77482968181085e-06	92081093	92092435
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	92087057	105597555	5223	5101	0.0199	3.77482968181085e-06	92081093	92092435	1.49281777343054e-10	105592583	105606424
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.4373	1.49281777343054e-10	105592583	105606424	1.46853562301129e-11	105625010	105673157
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105754664	11	11	-0.0255	1.46853562301129e-11	105625010	105673157	0.00513824672759295	105741049	105788623
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105758200	105798116	16	16	-0.3135	0.00513824672759295	105741049	105788623	3.30626966286374e-05	105787390	105800545
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105850033	21	21	0.063	3.30626966286374e-05	105787390	105800545	1.37117743581968e-10	105850033	105850033
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105856972	2	2	-1.0734	1.37117743581968e-10	105850033	105850033	0.000170956598124363	105856972	105872360
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-4.6343	0.000170956598124363	105856972	105872360	0.000276094834132707	105874293	105875924
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105881893	2	2	-1.6156	0.000276094834132707	105874293	105875924	9.97061834030763e-19	105881893	105881893
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105951399	18	18	-0.0332	9.97061834030763e-19	105881893	105881893	1.39095291995579e-18	105951399	105951399
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105961558	105994646	13	13	-0.8049	1.39095291995579e-18	105951399	105951399	2.8161727851433e-41	105994646	105994646
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105996176	106223507	97	93	0.0759	2.8161727851433e-41	105994646	105994646	1.25863220239819e-08	106219784	106231012
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106231012	106253648	12	12	-0.335	1.25863220239819e-08	106219784	106231012	2.14971328128088e-07	106252126	106260962
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.0621	2.14971328128088e-07	106252126	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.1172	NA	NA	NA	4.50883809592495e-06	18450562	18818949
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19537035	93	92	-0.2672	4.50883809592495e-06	18450562	18818949	1.09416867857406e-23	19427350	19819961
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19800789	1	0	NA	1.09416867857406e-23	19427350	19819961	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	20088256	56	56	-0.649	NA	NA	NA	7.81198902825416e-133	20079935	20308014
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	28370699	2252	2205	0.0188	7.81198902825416e-133	20079935	20308014	1.96069803653670e-09	28154955	28370699
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28439781	28731195	3	3	-0.7539	1.9606980365367e-09	28154955	28370699	2.86861177456636e-09	28731195	28736608
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28736608	44081349	6126	5980	0.0044	2.86861177456636e-09	28731195	28736608	7.57424440289767e-09	44004077	44096565
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	44084830	44106360	4	4	0.3168	7.57424440289767e-09	44004077	44096565	4.42643911363065e-19	44096565	44232375
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	44112943	74669752	13170	12864	-0.0049	4.42643911363065e-19	44096565	44232375	3.58119109118169e-25	74669752	74669752
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.084	3.58119109118169e-25	74669752	74669752	3.22766490590353e-25	74680439	74680439
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	168	0.0189	3.22766490590353e-25	74680439	74680439	5.86863046022315e-11	75115806	75115806
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.0224	5.86863046022315e-11	75115806	75115806	2.58246881949477e-11	75119713	75121466
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	85308725	3794	3690	0.0075	2.58246881949477e-11	75119713	75121466	4.24241796274931e-06	85293668	85319047
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85310340	85335390	16	15	0.2855	4.24241796274931e-06	85293668	85319047	3.07078901401133e-06	85322757	85351066
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85336660	99632987	5351	5204	0.0025	3.07078901401133e-06	85322757	85351066	3.25671714010088e-12	99632987	99632987
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.0633	3.25671714010088e-12	99632987	99632987	2.60406570140550e-11	99635701	99635701
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	264	0.0145	2.6040657014055e-11	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34285301	10701	10445	0.0024	NA	NA	NA	6.94266848170437e-65	34273991	34297461
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34292521	34602318	58	57	0.4744	6.94266848170437e-65	34273991	34297461	3.00737406238759e-69	34584793	34619028
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	54379839	2947	2877	0.0136	3.00737406238759e-69	34584793	34619028	7.53637656502043e-12	54379834	54399890
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.6084	7.53637656502043e-12	54379834	54399890	1.30863819750381e-11	54402057	54410800
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	68693086	4587	4480	0.0137	1.30863819750381e-11	54402057	54410800	1.51148589637134e-12	68687301	68732367
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.4899	1.51148589637134e-12	68687301	68732367	2.95715348680977e-10	68747578	68842364
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2154	-0.0148	2.95715348680977e-10	68747578	68842364	9.47193030036843e-94	75093957	75097331
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.4728	9.47193030036843e-94	75093957	75097331	6.39218342258602e-95	75099083	75100865
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	6.39218342258602e-95	75099083	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	88690571	5130	4990	-0.01	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	-0.0294	NA	NA	NA	6.76980762581899e-28	1028979	1028979
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7011	6.76980762581899e-28	1028979	1028979	9.57430141942643e-28	1030766	1030766
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1903358	434	421	-0.0254	9.57430141942643e-28	1030766	1030766	5.5453830697612e-32	1903358	1903358
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	1.2915	5.5453830697612e-32	1903358	1903358	2.53936424520150e-33	1906391	1906391
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	6844679	2043	2001	0	2.5393642452015e-33	1906391	1906391	1.16860420757951e-09	6838522	6848856
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6845520	6861502	18	16	0.3553	1.16860420757951e-09	6838522	6848856	4.20916004714012e-14	6858275	6864564
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6862130	16328035	3652	3567	0.0115	4.20916004714012e-14	6858275	6864564	8.02547709329586e-11	16318625	16332480
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	16330565	16335221	4	4	0.4056	8.02547709329586e-11	16318625	16332480	2.25265968824851e-09	16332480	16368245
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	16339261	31457889	5463	5329	0.0154	2.25265968824851e-09	16332480	16368245	5.45420580981569e-10	31439551	31470227
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	17	-0.3182	5.45420580981569e-10	31439551	31470227	8.31266645149897e-09	31489333	31895551
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1774	0.006	8.31266645149897e-09	31489333	31895551	1.19024652037859e-12	36672710	36673853
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.6517	1.19024652037859e-12	36672710	36673853	2.84441604904418e-21	36684619	36686013
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36785286	47	46	-0.011	2.84441604904418e-21	36684619	36686013	1.25169549993722e-11	36782082	36785286
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36787465	36792511	4	4	0.5787	1.25169549993722e-11	36782082	36785286	0.000168250200446151	36792511	36800661
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36793796	36973182	121	118	0.0975	0.000168250200446151	36792511	36800661	0.00143640405971625	36962647	36973182
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36975566	36978161	3	3	-0.3962	0.00143640405971625	36962647	36973182	0.00492329840119126	36978161	36999478
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36979909	74083926	13748	13406	0.0064	0.00492329840119126	36978161	36999478	2.53325806016637e-14	74081649	74092224
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74088319	74103984	8	8	0.59	2.53325806016637e-14	74081649	74092224	1.18115167065409e-12	74096260	74110308
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74108256	78653545	1826	1770	0.0095	1.18115167065409e-12	74096260	74110308	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	32228924	9917	9699	-0.0055	NA	NA	NA	4.05251561378335e-10	32212574	32243840
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32230851	32301247	36	35	0.2214	4.05251561378335e-10	32212574	32243840	9.40204215936045e-10	32283573	32322494
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32303200	54078204	6625	6486	-0.0015	9.40204215936045e-10	32283573	32322494	9.76185133769075e-24	54078204	54078204
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54082209	54087468	4	4	-1.0082	9.76185133769075e-24	54078204	54078204	1.46971370063335e-23	54087468	54087468
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54089357	76116026	6381	6232	-7e-04	1.46971370063335e-23	54087468	54087468	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	479	-0.0401	NA	NA	NA	3.31154419924265e-16	1398325	1398325
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3957	3.31154419924265e-16	1398325	1398325	1.95133665803856e-17	1400840	1400840
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4574	-0.0021	1.95133665803856e-17	1400840	1400840	7.04234526056977e-22	11448975	11448975
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.5543	7.04234526056977e-22	11448975	11448975	2.51015389849205e-23	11452390	11452390
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	13978275	1112	1087	0.0154	2.51015389849205e-23	11452390	11452390	2.82152359235394e-14	13975436	13993304
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13980416	13983527	2	0	NA	2.82152359235394e-14	13975436	13993304	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13991167	14014612	10	10	0.5597	NA	NA	NA	9.14454452908982e-14	14007528	14017904
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14016365	56823430	13575	13242	0.0246	9.14454452908982e-14	14007528	14017904	3.35831789797972e-24	56822197	56823430
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.7592	3.35831789797972e-24	56822197	56823430	7.08661897629983e-27	56840346	56840346
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58212113	587	566	0.01	7.08661897629983e-27	56840346	56840346	6.98328876731664e-10	58204170	58212113
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58213220	58244012	14	14	0.3664	6.98328876731664e-10	58204170	58212113	6.59984356758603e-08	58241773	58259101
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59414898	573	558	0.0198	6.59984356758603e-08	58241773	58259101	2.71932206793439e-28	59414645	59421197
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59443697	15	15	-0.6079	2.71932206793439e-28	59414645	59421197	2.60412203922805e-26	59441741	59445015
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59445015	59660738	103	101	-0.0129	2.60412203922805e-26	59441741	59445015	0.000218210502093192	59651021	59666884
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59662927	59671289	7	7	-0.3585	0.000218210502093192	59651021	59666884	7.14928818548453e-05	59667973	59684784
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59673873	63788698	1879	1835	0.0184	7.14928818548453e-05	59667973	59684784	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	571	0.0232	NA	NA	NA	1.32362281419366e-11	1499034	1499421
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1516966	4	4	-0.6999	1.32362281419366e-11	1499034	1499421	0.0224900656069260	1516966	1523000
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.3601	0.022490065606926	1516966	1523000	5.33179356799492e-183	1525300	1531162
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	7700269	2139	2076	0.0125	5.33179356799492e-183	1525300	1531162	2.4854168512935e-127	7700269	7700269
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	7709313	7787421	21	21	-1.0054	2.4854168512935e-127	7700269	7700269	5.66586066700504e-122	7787421	7787421
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	7790461	40611992	10685	10440	0.01	5.66586066700504e-122	7787421	7787421	5.55699205228789e-118	40609213	40611992
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	40613964	40667597	28	28	-0.8549	5.55699205228789e-118	40609213	40611992	2.00924458707369e-110	40667597	40667597
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	40669591	62419534	8111	7910	0.0094	2.00924458707369e-110	40667597	40667597	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	16003969	690	669	-0.0433	NA	NA	NA	3.53343916905742e-26	16001359	16003969
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16005800	16038164	20	18	0.4727	3.53343916905742e-26	16001359	16003969	2.71484886377206e-19	16038164	16038164
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16039094	16041496	2	2	1.2216	2.71484886377206e-19	16038164	16038164	0	16041496	16041496
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16043143	16044739	2	2	0.6395	0	16041496	16041496	0.000299741669509538	16044739	16046704
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16046704	36789648	7831	7655	0.0014	0.000299741669509538	16044739	16046704	3.22236400342293e-13	36789648	36789648
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.0738	3.22236400342293e-13	36789648	36789648	2.35430895285354e-10	36791668	36791668
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4767	0.0223	2.35430895285354e-10	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18604412	1420	1388	0.0156	NA	NA	NA	6.10412127857305e-06	18600372	18605152
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18605152	18608958	6	6	-0.3989	6.10412127857305e-06	18600372	18605152	1.42575446976777e-05	18608243	18612927
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18609924	20490822	570	560	0.0367	1.42575446976777e-05	18608243	18612927	1.21792058352499e-09	20464285	20502320
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20491983	20565919	44	43	-0.1795	1.21792058352499e-09	20464285	20502320	3.61748231174285e-10	20558685	20613292
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20566601	22696162	949	926	0.0503	3.61748231174285e-10	20558685	20613292	1.24433713783340e-07	22667608	22701123
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22720195	13	12	-0.3247	1.2443371378334e-07	22667608	22701123	2.85588701674828e-06	22718614	22738466
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6383	0.0022	2.85588701674828e-06	22718614	22738466	5.30621714915921e-14	35472378	35472378
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.1644	5.30621714915921e-14	35472378	35472378	5.16075253774809e-13	35476942	35476942
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	41237731	3054	2987	0.0117	5.16075253774809e-13	35476942	35476942	9.81740879920166e-12	41213175	41248301
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41246992	41279485	8	8	0.3938	9.81740879920166e-12	41213175	41248301	1.10730735999297e-05	41254820	41291691
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	47502495	3038	2953	0.0175	1.10730735999297e-05	41254820	41291691	6.72789704086384e-09	47487625	47510942
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47503378	47554331	31	31	0.2462	6.72789704086384e-09	47487625	47510942	1.19976803796309e-06	47535183	47588905
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47558289	49571068	872	845	0.0295	1.19976803796309e-06	47535183	47588905	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	28	0.0894	NA	NA	NA	4.15515781347959e-07	122211	127113
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.5842	4.15515781347959e-07	122211	127113	0.000157011830531129	129544	138278
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	266212	93	90	-0.0104	0.000157011830531129	129544	138278	1.92697110664929e-17	266212	266212
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.7473	1.92697110664929e-17	266212	266212	3.9812149627564e-33	267079	267079
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	340549	53	52	-0.0567	3.9812149627564e-33	267079	267079	5.20904927925594e-13	329876	346633
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	341509	425680	63	62	0.2064	5.20904927925594e-13	329876	346633	1.33893616473612e-11	424365	426332
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	426332	431846	5	5	-0.3414	1.33893616473612e-11	424365	426332	3.61348255084212e-06	431821	435020
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	433472	732505	240	232	0.16	3.61348255084212e-06	431821	435020	3.23835697102939e-09	727210	742385
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	735270	747220	9	9	-0.193	3.23835697102939e-09	727210	742385	0.0188026726991406	736490	772351
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747837	1431411	290	286	0.0566	0.0188026726991406	736490	772351	1.77320898835927e-16	1431411	1431411
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.2941	1.77320898835927e-16	1431411	1431411	1.77571225086195e-16	1432953	1432953
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	596	0.0411	1.77571225086195e-16	1432953	1432953	5.91338476659511e-14	2301365	2302065
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	-0.8347	5.91338476659511e-14	2301365	2302065	9.75034282047913e-14	2304398	2304398
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2306110	1	0	NA	9.75034282047913e-14	2304398	2304398	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2307282	2510846	207	199	0.0362	NA	NA	NA	1.51009197234724e-16	2510846	2510846
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	1.3659	1.51009197234724e-16	2510846	2510846	3.15851175326318e-17	2512881	2512881
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2672401	152	150	0.0341	3.15851175326318e-17	2512881	2512881	0.00029980460572225	2663031	2698769
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.1809	0.00029980460572225	2663031	2698769	7.15398742612354e-103	2708291	2711273
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6146726	1107	1090	0.9527	7.15398742612354e-103	2708291	2711273	3.91507209707976e-08	6145632	6146726
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6148661	6150055	2	2	-0.2103	3.91507209707976e-08	6145632	6146726	4.46868687084583e-12	6150055	6150055
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6152223	6753179	147	144	0.9669	4.46868687084583e-12	6150055	6150055	1.78983059654460e-32	6747678	6753179
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6765142	6834025	10	10	0.1045	1.7898305965446e-32	6747678	6753179	2.31794186262699e-32	6834025	6843577
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6843577	154582414	43868	42807	0.9546	2.31794186262699e-32	6834025	6843577	0	154582414	154582414
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0035	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2775895	28	28	-3.5041	NA	NA	NA	9.01334378457474e-07	2771455	2775895
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2777308	2784560	7	7	-1.7181	9.01334378457474e-07	2771455	2775895	1.17476205130779e-06	2784560	2792940
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	2911810	66	63	-3.4431	1.17476205130779e-06	2784560	2792940	0.000271944953898933	2896945	2925330
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2921156	2965000	17	17	-4.3659	0.000271944953898933	2896945	2925330	0.00976982896542315	2948341	3034907
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2969891	3733715	6	6	-3.5545	0.00976982896542315	2948341	3034907	5.58143983563003e-13	3733715	3773948
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.484	5.58143983563003e-13	3733715	3773948	1.00829271758340e-20	5422507	6652845
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	111	-3.2147	1.0082927175834e-20	5422507	6652845	1.55200801619751e-06	6918114	7016002
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7652302	215	210	-2.4492	1.55200801619751e-06	6918114	7016002	6.8678425978189e-07	7614571	7659535
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7653082	7709619	36	36	-3.6492	6.8678425978189e-07	7614571	7659535	0.610668572718644	7663037	7719658
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7723783	9	9	-2.9611	0.610668572718644	7663037	7719658	0.0966965413548105	7712882	7723783
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7751430	11	10	-1.6135	0.0966965413548105	7712882	7723783	0.00470618871889129	7751430	7806605
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7755522	7893056	41	41	-2.7604	0.00470618871889129	7751430	7806605	0.00353859023612931	7852359	7893056
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7895945	7914104	6	5	-1.1329	0.00353859023612931	7852359	7893056	5.90271513805778e-06	7914104	7926989
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8536761	142	137	-3.293	5.90271513805778e-06	7914104	7926989	1.45792985587977e-06	8486504	8552999
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8538835	8689019	55	54	-2.4922	1.45792985587977e-06	8486504	8552999	4.5685118193553e-06	8659109	8744081
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8690572	10513747	192	185	-3.3206	4.5685118193553e-06	8659109	8744081	6.4438677417823e-25	10511255	10535786
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-0.7461	6.4438677417823e-25	10511255	10535786	5.19131354826221e-27	11698871	12452734
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.9823	5.19131354826221e-27	11698871	12452734	2.60719388785437e-14	12541506	12545716
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	50	-1.6233	2.60719388785437e-14	12541506	12545716	1.09882052816149e-09	12661168	12710000
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12786515	16	16	-3.5479	1.09882052816149e-09	12661168	12710000	5.79030302810224e-06	12745259	12833424
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12792780	13128515	119	117	-1.9018	5.79030302810224e-06	12745259	12833424	0.000190729613569222	13061201	13149825
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13254711	42	40	-2.8293	0.000190729613569222	13061201	13149825	0.00243410861703679	13167862	13363320
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13823928	205	199	-3.5034	0.00243410861703679	13167862	13363320	0.00138100426164106	13777254	13851627
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13868296	10	10	-2.1856	0.00138100426164106	13777254	13851627	3.90427717881253e-10	13863616	13870622
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14118164	119	114	-3.9157	3.90427717881253e-10	13863616	13870622	4.38819297542981e-05	14094171	14320016
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14122036	14358464	40	39	-3.1055	4.38819297542981e-05	14094171	14320016	0.410716623899455	14169526	14489801
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508894	90	88	-2.6584	0.410716623899455	14169526	14489801	3.24193948573983e-08	14500820	14530134
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	22	-1.2505	3.24193948573983e-08	14500820	14530134	4.82827301381331e-15	14572190	14579298
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.1515	4.82827301381331e-15	14572190	14579298	2.31450468382696e-26	14598838	14598838
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.799	2.31450468382696e-26	14598838	14598838	2.64217615675699e-10	14644293	14681738
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14697315	11	11	-2.6787	2.64217615675699e-10	14644293	14681738	1.0437382897206e-05	14696387	14707011
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	14883615	45	45	-3.8481	1.0437382897206e-05	14696387	14707011	1.91754269766518e-11	14883615	14883615
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14909937	4	4	-0.8698	1.91754269766518e-11	14883615	14883615	0.000296594205884984	14903285	14937488
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14913412	15189646	72	70	-3.212	0.000296594205884984	14903285	14937488	0.000312432264705748	15152354	15220050
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15191780	15277060	46	42	-2.3657	0.000312432264705748	15152354	15220050	2.70625235610774e-10	15270384	15286805
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15278175	15407219	84	83	-3.5042	2.70625235610774e-10	15270384	15286805	3.24695209008011e-05	15380259	15455932
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15408015	15682936	107	103	-2.7789	3.24695209008011e-05	15380259	15455932	0.14196474442094	15410566	15690301
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15716500	7	7	-3.4261	0.14196474442094	15410566	15690301	0.000344791795975189	15713288	15750379
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15719904	15807366	15	15	-4.5301	0.000344791795975189	15713288	15750379	0.000730007110814264	15788556	15843146
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15810752	15920478	17	16	-3.5464	0.000730007110814264	15788556	15843146	0.159392914823604	15867364	16162358
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16177411	103	101	-2.7737	0.159392914823604	15867364	16162358	1.08376135250845e-06	16098683	16221882
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	17496151	234	225	-3.4887	1.08376135250845e-06	16098683	16221882	5.59002974092871e-06	17451391	17496151
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17503455	17557953	10	10	-1.7566	5.59002974092871e-06	17451391	17496151	0.000220168434652874	17548302	17628298
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	22157319	753	719	-3.3086	0.000220168434652874	17548302	17628298	6.76097215499681e-06	22043133	22165808
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22182080	12	12	-1.675	6.76097215499681e-06	22043133	22165808	3.56582421841383e-34	22182080	22182080
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22192409	22252795	22	22	-4.66	3.56582421841383e-34	22182080	22182080	0.000119512406593192	22243796	22393417
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22261337	25737663	69	65	-3.642	0.000119512406593192	22243796	22393417	8.48060460128728e-36	22930737	26873861
MSK_252152912316_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	81	-1.2548	8.48060460128728e-36	22930737	26873861	NA	NA	NA
