Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	827249	14	13	-0.1694	NA	NA	NA	0.00655489473427821	756927	876933
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	832336	1681443	204	197	0.4496	0.00655489473427821	756927	876933	6.22437756865211e-72	1640562	1698789
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1683684	16698906	5562	5404	-0.2513	6.22437756865211e-72	1640562	1698789	1.97989702159377e-07	16660353	16713074
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	16921319	11	11	-1.2195	1.97989702159377e-07	16660353	16713074	0	16917759	16923767
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16923767	72533804	22099	21481	0.2684	0	16917759	16923767	0	72533804	72533804
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72533856	72536231	3	3	-3.2777	0	72533804	72533804	4.53690346583126e-23	72536231	72536231
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72579311	15	15	1.7545	4.53690346583126e-23	72536231	72536231	9.58809818758452e-58	72571158	72589682
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	143697723	15620	15201	0.2648	9.58809818758452e-58	72571158	72589682	1.15120957936456e-91	143656552	143706582
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	143700072	1	0	NA	1.15120957936456e-91	143656552	143706582	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	144093719	78	77	-0.6509	NA	NA	NA	3.60520680880186e-39	143975987	144105332
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	146294654	561	551	0.1857	3.60520680880186e-39	143975987	144105332	2.38073836223386e-11	146268572	147329819
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	148081741	41	39	-0.4464	2.38073836223386e-11	146268572	147329819	1.10729566602586e-32	147510532	148088285
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150823073	1256	1227	0.5786	1.10729566602586e-32	147510532	148088285	1.33148542389500e-13	150819879	150836481
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150846148	7	7	-0.9732	1.331485423895e-13	150819879	150836481	9.59030161533639e-11	150844444	150851439
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	9.59030161533639e-11	150844444	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2662	0.4377	NA	NA	NA	2.8039196345095e-07	157128689	157133150
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.6295	2.8039196345095e-07	157128689	157133150	1.59607454746563e-47	157136342	157136342
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3990	0.1546	1.59607454746563e-47	157136342	157136342	6.0817014015981e-80	167483267	167483267
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.3757	6.0817014015981e-80	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	247186514	28794	28011	-0.202	0	167507898	167507898	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	89047614	30283	29445	0.1243	NA	NA	NA	0	89038425	89054185
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89050026	94892170	89	87	-0.8012	0	89038425	89054185	9.20846875519478e-83	91179406	94920265
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94892766	127212623	8830	8594	0.3007	9.20846875519478e-83	91179406	94920265	0	127191283	127261070
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	127220197	150177788	6837	6629	-0.4202	0	127191283	127261070	0	150170303	150183023
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	150179568	214092669	21543	20975	0.4511	0	150170303	150183023	0	214086994	214101493
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	214093761	241291089	9763	9495	-0.471	0	214086994	214101493	0	241240238	241308677
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241297674	241419497	53	50	-1.5315	0	241240238	241308677	1.93325218443458e-20	241391993	241437658
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241421625	242689978	429	415	-0.6927	1.93325218443458e-20	241391993	241437658	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	75479859	26876	26131	-0.0066	NA	NA	NA	3.45538798991168e-303	75428991	75798154
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76000715	19	19	-0.8265	3.45538798991168e-303	75428991	75798154	3.76356314705774e-13	75868882	76032165
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76006248	89475107	3746	3637	-0.0442	3.76356314705774e-13	75868882	76032165	1.31103653998216e-09	89462579	89488409
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89499433	12	12	-0.8102	1.31103653998216e-09	89462579	89488409	1.71159254561952e-30	89493682	89509246
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89500935	133189686	13056	12687	-0.0056	1.71159254561952e-30	89493682	89509246	4.54941935931228e-34	133189686	133189686
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	2.468	4.54941935931228e-34	133189686	133189686	2.38221143157282e-38	133194685	133198618
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	2.38221143157282e-38	133194685	133198618	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	153056445	6340	6168	0.5748	NA	NA	NA	0	153044706	153064108
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	153059012	165609671	3859	3759	-0.3694	0	153044706	153064108	0	165584691	165633624
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	165617693	194354505	9735	9445	0.4536	0	165584691	165633624	1.04968393459759e-71	194354505	194354505
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.2779	1.04968393459759e-71	194354505	194354505	1.62429506365532e-58	194366950	194366950
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1933	0.219	1.62429506365532e-58	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	69099817	18439	17954	0.0772	NA	NA	NA	0	69097336	69099817
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69109815	69165814	8	8	-1.4752	0	69097336	69099817	9.20014998445636e-26	69165814	69656183
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	82334492	4327	4185	-0.0434	9.20014998445636e-26	69165814	69656183	1.11978408812615e-30	82318437	82343052
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	82336762	82393171	19	19	0.8294	1.11978408812615e-30	82318437	82343052	3.01667003994457e-177	82370048	82423455
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	82402048	187330240	31125	30283	-0.0639	3.01667003994457e-177	82370048	82423455	2.14709627878099e-177	187330240	187330240
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.2941	2.14709627878099e-177	187330240	187330240	3.86462437516826e-17	187333619	187333619
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1207	-0.1338	3.86462437516826e-17	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	20524896	6185	6015	0.5446	NA	NA	NA	0	20510505	20538898
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20528784	76068823	14694	14243	-0.3646	0	20510505	20538898	0	76049264	76075769
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76071274	76084165	7	7	-1.2652	0	76049264	76075769	1.93809963696566e-06	76074455	76137967
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76085900	88602951	3978	3878	-0.6307	1.93809963696566e-06	76074455	76137967	0	88548443	88634661
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	88606286	127482823	10476	10195	-0.0233	0	88548443	88634661	4.97228753152874e-10	127482823	127482823
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127485798	127485798	1	0	NA	4.97228753152874e-10	127482823	127482823	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127486937	127488642	2	2	-2.5149	NA	NA	NA	2.28523599869518e-73	127488642	127488642
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127491893	150181399	8511	8277	-0.0501	2.28523599869518e-73	127488642	127488642	2.79031538140134e-79	150171154	150181399
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-2.2746	2.79031538140134e-79	150171154	150181399	1.64026892015386e-20	150202601	150204134
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9612	-0.2734	1.64026892015386e-20	150202601	150204134	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	36	-0.257	NA	NA	NA	1.01049882250501e-13	183349	211079
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	322557	60	58	-1.0408	1.01049882250501e-13	183349	211079	3.29157850691179e-42	314877	329100
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	323898	32558677	11578	11263	-0.1092	3.29157850691179e-42	314877	329100	6.20502053671251e-32	32548736	32564884
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32590568	5	5	-1.6959	6.20502053671251e-32	32548736	32564884	2.55510591282915e-10	32567462	32593151
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	54035000	8307	8062	-0.0643	2.55510591282915e-10	32567462	32593151	1.16137380782882e-07	54033505	54035000
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-1.8977	1.16137380782882e-07	54033505	54035000	1.21490567918722e-100	54042734	54047193
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	88481767	9048	8787	-0.2805	1.21490567918722e-100	54042734	54047193	9.9236456066711e-103	88481767	88481767
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	88484518	88485951	2	2	-2.9148	9.9236456066711e-103	88481767	88481767	4.15342485008361e-09	88485951	88485951
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	88487679	89975814	472	462	-0.3945	4.15342485008361e-09	88485951	88485951	5.22071994379507e-06	89964396	89975814
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	89977141	90005230	10	10	0.5268	5.22071994379507e-06	89964396	89975814	9.7841556661099e-07	90005230	90011580
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	90006387	102039635	3185	3090	-0.3851	9.7841556661099e-07	90005230	90011580	2.88891110024085e-08	102036719	102039635
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-2.2157	2.88891110024085e-08	102036719	102039635	7.92976958317982e-08	102044331	102046884
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	470	-0.3453	7.92976958317982e-08	102044331	102046884	2.96567807107912e-24	103841482	103841482
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.1654	2.96567807107912e-24	103841482	103841482	7.9319011116069e-315	103868154	103868154
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22239	-0.2705	7.9319011116069e-315	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	40	-0.305	NA	NA	NA	2.20874022583513e-12	240576	244720
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-2.4332	2.20874022583513e-12	240576	244720	7.45407853643139e-18	254342	254342
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	3838978	1327	1295	-0.3205	7.45407853643139e-18	254342	254342	1.40113669484507e-07	3830337	3844997
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3841423	3868675	14	14	0.513	1.40113669484507e-07	3830337	3844997	3.41809362998257e-164	3862193	3891950
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3871971	68516721	18997	18474	-0.1948	3.41809362998257e-164	3862193	3891950	0	68490559	68538797
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	68518558	72410458	1451	1408	0.4034	0	68490559	68538797	1.91992600354798e-23	72394374	72448311
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	72412206	72620603	86	84	1.0111	1.91992600354798e-23	72394374	72448311	0	72610389	72625855
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	72622095	141409512	27882	27075	0.0386	0	72610389	72625855	0	141385063	141419692
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141440184	15	15	0.7131	0	141385063	141419692	4.94141221178353e-05	141432778	141463339
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	109	-0.0344	4.94141221178353e-05	141432778	141463339	1.76081672892737e-54	141690753	141698634
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.121	1.76081672892737e-54	141690753	141698634	8.11873417455268e-77	141712786	141714168
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	144399712	976	954	0.019	8.11873417455268e-77	141712786	141714168	6.8754618527671e-23	144399712	144399712
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144403133	144404463	2	2	-3.7949	6.8754618527671e-23	144399712	144399712	2.45461048335811e-26	144404463	144404463
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144411778	158620919	5752	5599	0.0214	2.45461048335811e-26	144404463	144404463	1.11991866660105e-30	158618496	158739897
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158733294	158821263	22	22	-1.3372	1.11991866660105e-30	158618496	158739897	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	28819191	9749	9474	-0.7034	NA	NA	NA	0	28812663	28827798
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	28820976	39341524	3323	3226	0.2398	0	28812663	28827798	2.05193951138028e-58	39333915	39356595
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39345557	39505256	61	59	1.1576	2.05193951138028e-58	39333915	39356595	1.11080394614958e-39	39497514	39514180
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	82962193	11701	11379	0.2642	1.11080394614958e-39	39497514	39514180	0	82932528	82997625
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	82968740	146264846	19732	19160	0.9081	0	82932528	82997625	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	197437	5	5	-0.5229	NA	NA	NA	1.11504338013740e-42	194193	270058
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	201086	26951929	8700	8438	0.1103	1.1150433801374e-42	194193	270058	4.90601845261422e-40	26948930	26955486
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	26955486	27025300	34	33	-1.0953	4.90601845261422e-40	26948930	26955486	2.20863334861511e-42	27024130	27031502
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27026690	27026690	1	0	NA	2.20863334861511e-42	27024130	27031502	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27029125	39062211	3987	3868	0.1681	NA	NA	NA	6.6664271416577e-29	38721373	43530076
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39088753	70221479	34	32	-0.5169	6.6664271416577e-29	38721373	43530076	6.63055668243283e-09	68483889	70238439
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70223138	70926188	311	302	0.0864	6.63055668243283e-09	68483889	70238439	8.45378646121834e-11	70926188	70926188
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.4405	8.45378646121834e-11	70926188	70926188	9.17328297788065e-42	70930528	70930528
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100310274	9901	9648	0.0887	9.17328297788065e-42	70930528	70930528	2.4438611962694e-43	100304331	100310274
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100316999	100323040	5	4	-1.4049	2.4438611962694e-43	100304331	100310274	8.4555607140587e-208	100323040	100329010
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100324222	118220450	6327	6134	0.0153	8.4555607140587e-208	100323040	100329010	9.60556544724546e-203	118188321	118234531
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118222956	118293228	36	35	0.5709	9.60556544724546e-203	118188321	118234531	1.16254235420909e-58	118273003	118346742
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118294760	140145683	8601	8357	0.0832	1.16254235420909e-58	118273003	118346742	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9461	0.0704	NA	NA	NA	7.93039259825344e-100	27038538	27038538
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.8793	7.93039259825344e-100	27038538	27038538	1.50669742257794e-14	27041812	27041812
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1505	0.1489	1.50669742257794e-14	27041812	27041812	4.78487049618042e-42	31284926	31284926
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-4.0269	4.78487049618042e-42	31284926	31284926	7.07260737244947e-82	31291525	31291525
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	76568253	12663	12319	0.0276	7.07260737244947e-82	31291525	31291525	1.00090626316896e-85	76555965	76568253
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76570177	76594010	9	9	-0.9871	1.00090626316896e-85	76555965	76568253	6.25788622606484e-11	76594010	76598571
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76596575	77917870	624	606	0.263	6.25788622606484e-11	76594010	76598571	1.86071308624071e-09	77916218	77917870
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77928738	4	4	-1.4888	1.86071308624071e-09	77916218	77917870	7.31721348841834e-10	77928738	77936034
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	87645994	2767	2691	0.2706	7.31721348841834e-10	77928738	77936034	3.81190047389418e-07	87634801	87651599
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87647286	87681883	15	15	-0.5107	3.81190047389418e-07	87634801	87651599	0.000189468836177854	87677341	87681883
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87683587	87692200	4	4	-1.5673	0.000189468836177854	87677341	87681883	4.78312235347084e-178	87692200	87701320
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87694413	135285645	17427	16918	-0.3608	4.78312235347084e-178	87692200	87701320	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18896166	7372	7189	0.0046	NA	NA	NA	4.75739302634432e-27	18888184	18896166
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18929375	7	7	-1.1873	4.75739302634432e-27	18888184	18896166	1.78178712134302e-30	18929375	18933855
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18932031	54909735	9473	9201	0.1013	1.78178712134302e-30	18929375	18933855	8.34879713764088e-27	54877880	54969741
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	54913583	55118214	53	53	-0.4697	8.34879713764088e-27	54877880	54969741	2.22453467423038e-82	55118214	55123719
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-3.3096	2.22453467423038e-82	55118214	55123719	6.12526130404035e-283	55209626	55217189
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	63672654	3356	3269	-0.2158	6.12526130404035e-283	55209626	55217189	0	63649772	63691875
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63673946	94570408	10992	10678	0.3023	0	63649772	63691875	1.58865748326248e-47	94569150	94570408
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	94573019	94574280	2	2	2.4103	1.58865748326248e-47	94569150	94570408	7.09469238445242e-21	94574280	94575563
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	94575563	106733851	3687	3586	0.4296	7.09469238445242e-21	94574280	94575563	4.28915410729655e-71	106733851	106733851
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-4.2422	4.28915410729655e-71	106733851	106733851	1.08312141344097e-69	106747920	106747920
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	10020	0.389	1.08312141344097e-69	106747920	106747920	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3642	-0.1338	NA	NA	NA	8.95447078635473e-64	9516067	9531133
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-1.9242	8.95447078635473e-64	9516067	9531133	5.10789730236483e-45	9543817	9555181
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	29954008	7140	6959	-0.3162	5.10789730236483e-45	9543817	9555181	0	29919645	29980370
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29962908	34148629	1266	1234	0.544	0	29919645	29980370	0	34082511	34193896
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34151681	40386684	1199	1169	-0.262	0	34082511	34193896	0	40379232	40394917
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	40389102	46974773	2127	2066	0.7707	0	40379232	40394917	0	46946965	46992235
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46981780	100624427	17956	17491	-0.185	0	46946965	46992235	0	100624427	100624427
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100628460	2	2	-2.8796	0	100624427	100624427	1.76755626277852e-100	100628460	100628460
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100629832	130943064	11172	10837	-0.3041	1.76755626277852e-100	100628460	100628460	1.20666272509444e-102	130943064	130943064
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.6607	1.20666272509444e-102	130943064	130943064	1.71761291673265e-12	130946248	130946248
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	538	-0.2604	1.71761291673265e-12	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7139	0.0413	NA	NA	NA	3.28387580632981e-41	37953582	37953582
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	4.4326	3.28387580632981e-41	37953582	37953582	3.84976564438931e-34	37957844	37957844
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	43022980	2095	2059	-0.246	3.84976564438931e-34	37957844	37957844	1.00934339116052e-116	43008620	43041372
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	43024283	44511372	590	576	-0.8166	1.00934339116052e-116	43008620	43041372	4.97486287016227e-67	44486018	44541451
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	44513557	46068511	717	689	-0.3101	4.97486287016227e-67	44486018	44541451	1.06479249868054e-139	46052350	46086803
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	46070372	61681703	4526	4388	-0.8487	1.06479249868054e-139	46052350	46086803	0	61646602	61712794
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	61687792	114123340	16376	15901	-0.1	0	61646602	61712794	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	58	-0.8113	NA	NA	NA	2.83745995248365e-31	19483933	19540294
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5546	0.0013	2.83745995248365e-31	19483933	19540294	9.00092341711074e-08	34666996	34674458
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.8218	9.00092341711074e-08	34666996	34674458	1.70278519082422e-162	34683810	34685308
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	66669694	10650	10336	-0.1818	1.70278519082422e-162	34683810	34685308	5.92705513639739e-164	66658817	66675243
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	66671841	66706985	22	21	-0.9509	5.92705513639739e-164	66658817	66675243	3.98252169067668e-07	66701686	66727713
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	66707997	79174722	5916	5725	-0.3018	3.98252169067668e-07	66701686	66727713	1.22843085354466e-19	79174722	79174722
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-2.7523	1.22843085354466e-19	79174722	79174722	1.78099560728601e-231	79183154	79183154
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	9015	-0.1755	1.78099560728601e-231	79183154	79183154	3.32855629159976e-217	105597555	105602602
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.9997	3.32855629159976e-217	105597555	105602602	3.24697820031643e-41	105630089	105632168
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	48	-0.0054	3.24697820031643e-41	105630089	105632168	7.094640853382e-05	105839439	105850033
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-1.4025	7.094640853382e-05	105839439	105850033	8.3435861157359e-06	105875924	105897061
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	173	-0.0536	8.3435861157359e-06	105875924	105897061	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.8634	NA	NA	NA	7.34976457621045e-18	18452491	18452491
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	147	-1.1966	7.34976457621045e-18	18452491	18452491	4.71675014476416e-164	20079935	20308014
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	20627802	130	127	0.4276	4.71675014476416e-164	20079935	20308014	3.12287359559725e-135	20611586	20683484
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20629300	69217290	18985	18424	-0.1369	3.12287359559725e-135	20611586	20683484	2.51085169426987e-168	69197591	69230656
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69219358	69716684	251	240	0.4557	2.51085169426987e-168	69197591	69230656	3.18258684344235e-39	69696527	69740369
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69717843	74669752	2189	2120	-0.0295	3.18258684344235e-39	69696527	69740369	1.15560168734641e-15	74669752	74671626
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.3194	1.15560168734641e-15	74669752	74671626	4.24261734786144e-16	74680338	74680439
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9340	-0.0339	4.24261734786144e-16	74680338	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	8569330	3236	3158	-0.3004	NA	NA	NA	0	8529682	8603936
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8576815	14592228	2186	2130	0.4418	0	8529682	8603936	3.76324873778739e-07	14559921	14609683
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14594700	14594700	1	0	NA	3.76324873778739e-07	14559921	14609683	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14596137	14687636	44	42	-0.045	NA	NA	NA	3.77296535814995e-10	14678535	14956177
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15029941	15	12	-1.0307	3.77296535814995e-10	14678535	14956177	1.53601157845180e-08	15009449	15042407
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	15034210	1	0	NA	1.5360115784518e-08	15009449	15042407	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15037844	17614054	686	663	-0.0732	NA	NA	NA	2.14795999549764e-123	17544570	17688304
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	17624524	24417548	2124	2070	0.4941	2.14795999549764e-123	17544570	17688304	6.83959316416466e-203	24354181	24462049
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	24421812	31854794	2278	2209	-0.0062	6.83959316416466e-203	24354181	24462049	3.09670804820101e-32	31838577	32513457
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	34056516	55	52	-0.9224	3.09670804820101e-32	31838577	32513457	0	33841331	34067256
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34058222	75093957	9897	9636	-0.1332	0	33841331	34067256	0	75093957	75093957
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.3566	0	75093957	75093957	1.95885212784558e-09	75100865	75102639
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	594	-0.3836	1.95885212784558e-09	75100865	75102639	4.24833272202594e-29	76925748	76933534
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.5529	4.24833272202594e-29	76925748	76933534	6.10956890807974e-30	76935880	76940218
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4392	-0.3066	6.10956890807974e-30	76935880	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15727076	6302	6121	-0.3308	NA	NA	NA	1.27342203216680e-22	15727076	15727076
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-4.1074	1.2734220321668e-22	15727076	15727076	9.26295598362827e-22	15733964	15733964
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	36673853	7567	7365	-0.3257	9.26295598362827e-22	15733964	15733964	7.19977907217658e-15	36672710	36675987
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.3169	7.19977907217658e-15	36672710	36675987	4.23166476809617e-16	36682031	36684619
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41552048	2026	1961	-0.2072	4.23166476809617e-16	36682031	36684619	2.23825557261228e-14	41527705	41558893
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41553226	42147225	56	54	-0.8183	2.23825557261228e-14	41527705	41558893	1.48325514751457e-19	41710400	42165272
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	78653545	13676	13275	-0.2029	1.48325514751457e-19	41710400	42165272	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	74043977	22220	21617	-0.0133	NA	NA	NA	0	74032670	74063563
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	74051462	76116026	744	723	-0.8553	0	74032670	74063563	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	12179966	5460	5285	-0.0944	NA	NA	NA	1.27650617321925e-67	12167651	12195784
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12180988	12534733	140	135	-0.851	1.27650617321925e-67	12167651	12195784	2.81546307234359e-79	12523812	12549051
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12536642	56823430	14273	13876	0.0594	2.81546307234359e-79	12523812	12549051	3.48065657169984e-95	56823430	56823430
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	7	-2.5918	3.48065657169984e-95	56823430	56823430	5.21150589154472e-36	56840346	56840346
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63787171	3177	3096	-0.023	5.21150589154472e-36	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	567	-0.37	NA	NA	NA	6.17002220519739e-11	1493655	1511632
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1532433	11	11	0.7336	6.17002220519739e-11	1493655	1511632	7.08758056864984e-11	1528899	1548251
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	25030240	8160	7944	-0.3725	7.08758056864984e-11	1528899	1548251	0	25003011	25066655
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	25032355	62419534	12823	12485	0.194	0	25003011	25066655	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13097	0.0289	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	9275	0.0327	NA	NA	NA	2.64180395427075e-08	35469770	35472378
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	2.4681	2.64180395427075e-08	35469770	35472378	7.817842336953e-09	35476942	35478503
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6804	0.0097	7.817842336953e-09	35476942	35478503	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.1485	NA	NA	NA	6.06084557639145e-110	94062	94062
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-2.1687	6.06084557639145e-110	94062	94062	7.19640393845122e-14	104732	106242
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2708291	1780	1732	-0.5011	7.19640393845122e-14	104732	106242	0	2706218	2712641
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43869	0.774	0	2706218	2712641	3.02481050394757e-187	154570196	154601146
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.3427	3.02481050394757e-187	154570196	154601146	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-2.8864	NA	NA	NA	1.358050524573e-09	3780462	4174561
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	4425391	4	4	0.3657	1.358050524573e-09	3780462	4174561	1.93152935629103e-08	4425391	4846477
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4431527	4431527	1	0	NA	1.93152935629103e-08	4425391	4846477	NA	NA	NA
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7051884	179	177	-2.738	NA	NA	NA	3.61867906347952e-05	7009137	7219774
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7394617	114	109	-2.0916	3.61867906347952e-05	7009137	7219774	3.46840803890579e-06	7284775	7632577
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7401540	10515697	539	521	-2.7058	3.46840803890579e-06	7284775	7632577	9.99166733087892e-13	10386626	12541506
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	13129843	220	215	-2.0341	9.99166733087892e-13	10386626	12541506	3.85181247454617e-14	13050965	13169265
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14508894	505	493	-2.7019	3.85181247454617e-14	13050965	13169265	5.47414857629305e-17	14503185	14530134
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-0.9378	5.47414857629305e-17	14503185	14530134	8.20218804266637e-18	14561228	14587291
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	26870361	1622	1571	-2.7709	8.20218804266637e-18	14561228	14587291	3.071480730104e-37	22924754	26887743
MSK_252152912683_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26871442	57440809	83	80	-1.3082	3.071480730104e-37	22924754	26887743	NA	NA	NA
