Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26821	-0.0063	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	10	-4.1389	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	143697723	15620	15044	-0.003	0	72579311	72579311	3.69821495915092e-28	143653780	143702972
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	143800457	50	47	-0.3613	3.69821495915092e-28	143653780	143702972	3.59445263181891e-29	143793256	143808283
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143802400	161099582	6282	6055	-0.007	3.59445263181891e-29	143793256	143808283	2.88629781275817e-16	161099582	161099582
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.3255	2.88629781275817e-16	161099582	161099582	9.80121523733117e-16	161104791	161104791
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2392	-0.0122	9.80121523733117e-16	161104791	161104791	0	167483267	167483267
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.1965	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	196570662	9761	9387	-5e-04	0	167507898	167507898	1.16672273208123e-11	196569486	196570662
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	3	-0.9189	1.16672273208123e-11	196569486	196570662	3.44973362669584e-12	196576204	196576204
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	200598243	1583	1519	-0.001	3.44973362669584e-12	196576204	196576204	1.64507646545644e-11	200580745	200625002
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200787319	38	38	-0.2574	1.64507646545644e-11	200580745	200625002	3.63669110044961e-11	200670407	200808717
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	227875096	9925	9522	-0.0058	3.63669110044961e-11	200670407	200808717	1.96063910686368e-14	227875096	227875096
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8783	1.96063910686368e-14	227875096	227875096	3.87182352204967e-11	227882805	227889619
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	228259793	70	68	-0.0336	3.87182352204967e-11	227882805	227889619	1.25494937314144e-08	228257476	228259793
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228261810	228268844	3	2	1.0366	1.25494937314144e-08	228257476	228259793	2.17004846905134e-09	228268844	228268844
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228271750	246820980	7289	7049	-0.0011	2.17004846905134e-09	228268844	228268844	1.45673648441345e-14	246806669	246825991
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246822838	246860551	19	18	0.4108	1.45673648441345e-14	246806669	246825991	3.27280634786050e-12	246857496	246864725
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246862029	247186514	99	97	0.0139	3.2728063478605e-12	246857496	246864725	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11059	-0.003	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	14	-4.817	0	34543992	34543992	0.0255357341262103	34566082	34579933
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34589997	4	4	-3.6362	0.0255357341262103	34566082	34579933	3.44019754755528e-254	34589997	34589997
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	179767214	44742	43088	-0.0023	3.44019754755528e-254	34589997	34589997	2.51578422011690e-12	179764819	179767214
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.9596	2.5157842201169e-12	179764819	179767214	1.14081729903504e-12	179778919	179778919
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242484747	21467	20683	0.0026	1.14081729903504e-12	179778919	179778919	3.90158550089517e-20	242469806	242495169
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242487220	242634956	58	56	0.2787	3.90158550089517e-20	242469806	242495169	0.000338691240132365	242591308	242649724
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242643111	242689978	17	17	0.0273	0.000338691240132365	242591308	242649724	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	17275014	6377	6154	0.0032	NA	NA	NA	7.72159053845952e-10	17272012	17275014
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17276413	17280019	3	3	-0.8379	7.72159053845952e-10	17272012	17275014	3.00448643698455e-09	17280019	17281860
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17281860	53001678	12282	11847	-0.003	3.00448643698455e-09	17280019	17281860	1.26940594066179e-12	52999601	53001678
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.7506	1.26940594066179e-12	52999601	53001678	3.02512596934702e-13	53011885	53014254
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	65160634	4843	4661	-0.0029	3.02512596934702e-13	53011885	53014254	1.50883044221404e-10	65160634	65160634
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-1.0636	1.50883044221404e-10	65160634	65160634	3.496883273787e-10	65184180	65184180
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	99891210	8671	8353	0.0038	3.496883273787e-10	65184180	65184180	1.36730947416863e-180	99891210	99891210
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.3495	1.36730947416863e-180	99891210	99891210	4.1852362026029e-177	99897201	99897201
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11077	-0.0042	4.1852362026029e-177	99897201	99897201	6.80680622347341e-25	133189686	133189686
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6466	6.80680622347341e-25	133189686	133189686	2.36455082747195e-25	133194685	133194685
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9428	0.0039	2.36455082747195e-25	133194685	133194685	1.58210213049738e-49	163992903	164019640
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	6	-1.3371	1.58210213049738e-49	163992903	164019640	4.42357582804065e-09	164019640	164027724
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-4.6716	4.42357582804065e-09	164019640	164027724	0	164107951	164107951
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196822133	11132	10699	0.0035	0	164107951	164107951	1.14246675112681e-25	196810503	196835413
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	19	-0.5325	1.14246675112681e-25	196810503	196835413	4.34148112699021e-22	196929805	196942158
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199300066	952	917	-0.0072	4.34148112699021e-22	196929805	196942158	1.29260119955114e-20	199291327	199301859
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199300213	199324677	10	10	0.6958	1.29260119955114e-20	199291327	199301859	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199329592	199329592	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3278	-0.0075	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.9587	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5941	0.0015	0	9842644	9842644	6.02688044467933e-11	34439897	34445002
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.631	6.02688044467933e-11	34439897	34445002	2.26447567106579e-11	34491115	34506297
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8531	0.0058	2.26447567106579e-11	34491115	34506297	3.3289495159134e-30	68901210	69075140
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	12	-0.7155	3.3289495159134e-30	68901210	69075140	3.48461171084947e-24	69144974	69643272
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	114	-0.0067	3.48461171084947e-24	69144974	69643272	2.02347489398272e-16	70150576	70150576
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.9492	2.02347489398272e-16	70150576	70150576	6.54966079205544e-17	70216707	70216707
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	173660684	31267	30208	0.0101	6.54966079205544e-17	70216707	70216707	3.84635957333058e-93	173660684	173660684
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.102	3.84635957333058e-93	173660684	173660684	1.46288736575084e-98	173666072	173666072
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	713	0.0105	1.46288736575084e-98	173666072	173666072	3.47940103381463e-09	175860235	175860235
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.9834	3.47940103381463e-09	175860235	175860235	1.64701415626642e-08	175863396	175866055
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187329037	3335	3213	0.0163	1.64701415626642e-08	175863396	175866055	1.07393609710269e-258	187329037	187329037
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187330240	187330240	1	0	NA	1.07393609710269e-258	187329037	187329037	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-5.143	NA	NA	NA	3.94062382323588e-268	187333619	187333619
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190710812	1131	1090	-1e-04	3.94062382323588e-268	187333619	187333619	2.67989287543558e-18	190676708	190749363
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190910126	61	58	-0.2583	2.67989287543558e-18	190676708	190749363	8.39534560818274e-08	190888913	190942866
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190913517	190913517	1	0	NA	8.39534560818274e-08	190888913	190942866	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190915643	191153613	48	47	-0.0101	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	7463502	2217	2125	-0.006	NA	NA	NA	1.28387237961423e-109	7463502	7463502
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7465335	7523331	29	27	0.9097	1.28387237961423e-109	7463502	7463502	2.84064809416913e-108	7523331	7527647
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7527647	179429409	51096	49177	0.0018	2.84064809416913e-108	7523331	7527647	3.32361679563746e-09	179429409	179429409
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	1.0281	3.32361679563746e-09	179429409	179429409	1.31938088936025e-10	179431937	179433578
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180344964	303	290	-0.0279	1.31938088936025e-10	179431937	179433578	6.83416003421545e-11	180194323	180344964
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180346557	180358977	7	7	0.5485	6.83416003421545e-11	180194323	180344964	3.37222543226508e-10	180358977	180362342
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	-0.0103	3.37222543226508e-10	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	37	0.0291	NA	NA	NA	1.97262719473991e-18	198124	204881
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	241674	17	17	-0.5734	1.97262719473991e-18	198124	204881	2.18572285383842e-09	237952	251128
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	326323	44	37	-1.0684	2.18572285383842e-09	237952	251128	4.59225341212193e-208	323898	326323
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10098	-6e-04	4.59225341212193e-208	323898	326323	8.45433750359105e-34	29939288	29972382
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	14	-0.7066	8.45433750359105e-34	29939288	29972382	2.82186498191895e-29	29998009	30010234
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	32558677	1076	1036	-0.0107	2.82186498191895e-29	29998009	30010234	1.99401944058080e-139	32558677	32563252
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-2.1951	1.9940194405808e-139	32558677	32563252	1.73287860155879e-09	32590568	32595402
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	-0.0854	1.73287860155879e-09	32590568	32595402	4.57374745047598e-17	32628420	32628420
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-1.632	4.57374745047598e-17	32628420	32628420	3.21924847365110e-37	32633691	32633691
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	7969	6e-04	3.2192484736511e-37	32633691	32633691	8.5752131307945e-28	54035000	54035000
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.4157	8.5752131307945e-28	54035000	54035000	1.93034236019532e-29	54042734	54042734
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4365	0.0051	1.93034236019532e-29	54042734	54042734	8.42229838461193e-132	72919733	72919733
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-2.9832	8.42229838461193e-132	72919733	72919733	1.13316823814505e-128	72924440	72924440
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	132748175	18412	17731	0.0054	1.13316823814505e-128	72924440	72924440	1.47036333204878e-13	132748175	132748175
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132749309	132752481	3	3	-0.9892	1.47036333204878e-13	132748175	132748175	1.13572239276421e-13	132752481	132752481
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132754426	165643653	11364	10936	0.0056	1.13572239276421e-13	132752481	132752481	0	165643653	165643653
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.539	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1734	-0.0069	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5184	0.0014	NA	NA	NA	2.20288481219801e-225	16135701	16135701
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.8757	2.20288481219801e-225	16135701	16135701	3.38467703159516e-227	16140018	16140018
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	133433384	40705	39121	7e-04	3.38467703159516e-227	16140018	16140018	1.39121728737100e-20	133432281	133433384
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	0.8028	1.391217287371e-20	133432281	133433384	1.93952729976170e-21	133448277	133453811
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141425306	3706	3544	-0.0038	1.9395272997617e-21	133448277	133453811	2.13678309784475e-11	141419692	141429405
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141426846	141440184	8	8	-0.5605	2.13678309784475e-11	141419692	141429405	1.888377720353e-08	141435643	141443577
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	114	0.0262	1.888377720353e-08	141435643	141443577	6.70530537055583e-20	141689547	141690753
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8189	6.70530537055583e-20	141689547	141690753	7.5796870808446e-17	141714168	141720324
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	7.5796870808446e-17	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142156165	167	165	0.1044	NA	NA	NA	2.0315281752929e-29	142156165	142161005
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142167908	5	4	-1.7095	2.0315281752929e-29	142156165	142161005	2.55825627256756e-50	142161005	142167908
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	142176074	1	0	NA	2.55825627256756e-50	142161005	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187073	156483966	5521	5338	-0.0025	NA	NA	NA	3.03782788246271e-11	156483966	156483966
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	1.1515	3.03782788246271e-11	156483966	156483966	1.29952999934667e-10	156490484	156490484
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1012	-0.0239	1.29952999934667e-10	156490484	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.0226	NA	NA	NA	4.82321884684541e-11	581533	581533
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.1997	4.82321884684541e-11	581533	581533	8.97607428897279e-13	588865	588865
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2187	-0.0017	8.9760742889728e-13	588865	588865	5.45561795406558e-20	7156900	7322035
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	8137794	9	9	-0.704	5.45561795406558e-20	7156900	7322035	7.04691887813708e-21	7790934	8139999
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8139999	25022606	5727	5518	-0.0011	7.04691887813708e-21	7790934	8139999	2.26355662294617e-205	25022606	25030003
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-3.8402	2.26355662294617e-205	25022606	25030003	2.15662147379614e-192	25034970	25039370
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	32797545	3061	2945	-0.0058	2.15662147379614e-192	25034970	25039370	6.8368006695327e-28	32797545	32797545
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	2	-1.7413	6.8368006695327e-28	32797545	32797545	1.33565269938976e-30	32808049	32808049
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	40892587	2378	2289	0.0095	1.33565269938976e-30	32808049	32808049	2.76624693868146e-16	40892587	40892587
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.2966	2.76624693868146e-16	40892587	40892587	5.28014662490905e-15	40897469	40897469
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29809	0.0016	5.28014662490905e-15	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	4364001	1591	1541	-0.0041	NA	NA	NA	4.07108870608057e-07	4362055	4364001
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4366552	4368040	2	2	0.8875	4.07108870608057e-07	4362055	4364001	1.20546960674280e-07	4368040	4370217
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4370217	5623484	496	466	-0.005	1.2054696067428e-07	4368040	4370217	1.01241689572477e-09	5621129	5623484
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5632749	5634019	2	2	-1.0115	1.01241689572477e-09	5621129	5623484	2.23279952377658e-09	5634019	5634019
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5646414	24491341	6167	5941	-0.0051	2.23279952377658e-09	5634019	5634019	3.23043484339237e-08	24478198	24491341
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24495765	24506914	3	3	-0.7775	3.23043484339237e-08	24478198	24491341	2.20028641159806e-08	24506914	24509107
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24509107	37746137	4147	4011	-0.0024	2.20028641159806e-08	24506914	24509107	3.9942970586865e-65	37741154	37753942
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	37748503	37859783	47	46	0.5383	3.9942970586865e-65	37741154	37753942	6.98967995670914e-53	37853796	37864210
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	37862936	39048058	271	263	0.0252	6.98967995670914e-53	37853796	37864210	1.79404984345445e-10	38721373	39146895
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39062211	67927172	26	26	-0.2511	1.79404984345445e-10	38721373	39146895	3.49903636351822e-07	67913672	70225166
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	301	0.0015	3.49903636351822e-07	67913672	70225166	5.97101828307026e-138	70926188	70926188
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.8243	5.97101828307026e-138	70926188	70926188	1.37329016297347e-146	70930528	70930528
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	86960197	5360	5166	-8e-04	1.37329016297347e-146	70930528	70930528	7.0741085902599e-08	86956605	86960197
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.9181	7.0741085902599e-08	86956605	86960197	1.34681056529424e-07	86965458	86965458
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	116124007	10106	9747	-0.0119	1.34681056529424e-07	86965458	86965458	3.4393596631276e-10	116124007	116124007
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0769	3.4393596631276e-10	116124007	116124007	2.04995754774395e-09	116130333	116130333
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	9033	-0.012	2.04995754774395e-09	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9408	-0.0039	NA	NA	NA	7.47143311693094e-27	27038538	27038538
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.6955	7.47143311693094e-27	27038538	27038538	6.38628287767648e-26	27041812	27041812
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1493	-0.0077	6.38628287767648e-26	27041812	27041812	0	31284926	31284926
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-6.0709	0	31284926	31284926	0	31291525	31291525
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917870	13296	12804	-0.0051	0	31291525	31291525	4.103623512792e-25	77917870	77917870
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77928738	4	3	-1.3401	4.103623512792e-25	77917870	77917870	3.73706039414102e-25	77928738	77928738
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100468861	7680	7408	-0.006	3.73706039414102e-25	77928738	77928738	4.20940589159852e-12	100468861	100468861
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100471550	100472291	2	2	-1.1545	4.20940589159852e-12	100468861	100468861	1.64138355893038e-12	100472291	100472291
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100482798	129694802	10617	10217	-0.0089	1.64138355893038e-12	100472291	100472291	1.07493863666335e-14	129694802	129694802
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	129697462	129699880	2	0	NA	1.07493863666335e-14	129694802	129694802	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	129701393	129702903	2	2	-1.2452	NA	NA	NA	6.3114648912549e-14	129702903	129702903
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	129704501	134739406	1699	1637	-0.0174	6.3114648912549e-14	129702903	129702903	4.10533963538072e-07	134736198	134739406
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	0.873	4.10533963538072e-07	134736198	134739406	6.95690369883343e-06	134743423	134746574
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	204	-0.0284	6.95690369883343e-06	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	7758275	3015	2906	-0.008	NA	NA	NA	6.96643175884952e-28	7758275	7758275
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7762277	1	0	NA	6.96643175884952e-28	7758275	7758275	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7771593	7783492	8	7	-0.9956	NA	NA	NA	4.1427716160274e-32	7783492	7783492
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	7797993	1	0	NA	4.1427716160274e-32	7783492	7783492	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	55118214	13880	13327	2e-04	NA	NA	NA	8.70512041585008e-37	55112618	55124730
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55207305	38	35	0.4763	8.70512041585008e-37	55112618	55124730	1.12203194685255e-36	55205278	55217189
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	66463477	4639	4448	0.0013	1.12203194685255e-36	55205278	55217189	1.3502729209783e-08	66463477	66463477
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9851	1.3502729209783e-08	66463477	66463477	1.28694621775444e-08	66469412	66469412
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22910	-0.0031	1.28694621775444e-08	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7884886	3246	3142	-0.004	NA	NA	NA	6.2983129345946e-98	7879321	7884886
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	8015452	50	50	0.6439	6.2983129345946e-98	7879321	7884886	7.46235245232665e-87	8013470	8018443
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8018443	9523923	446	429	0.0013	7.46235245232665e-87	8013470	8018443	9.30994860526339e-82	9523923	9528590
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	14	1.2821	9.30994860526339e-82	9523923	9528590	2.24653552844144e-91	9604633	9610054
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	561	-0.0151	2.24653552844144e-91	9604633	9610054	3.20603601469222e-19	11112600	11121204
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	0.7575	3.20603601469222e-19	11112600	11121204	2.75626413950729e-18	11130871	11143592
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6573	0.0025	2.75626413950729e-18	11130871	11143592	2.74606318082899e-27	31132716	31173065
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	0.5919	2.74606318082899e-27	31132716	31173065	3.00484021471285e-27	31230579	31242528
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	78665408	15379	14808	0.0045	3.00484021471285e-27	31230579	31242528	6.8290136463646e-12	78663063	78675711
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78668041	78686371	7	7	-0.6112	6.8290136463646e-12	78663063	78675711	5.52640107457299e-15	78681634	78688893
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	80662066	783	758	0.0134	5.52640107457299e-15	78681634	78688893	1.55996634693636e-13	80662066	80662066
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.0859	1.55996634693636e-13	80662066	80662066	1.29620848844264e-10	80666751	80666751
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130943064	17266	16618	9e-04	1.29620848844264e-10	80666751	80666751	2.34909941128176e-10	130943064	130943064
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.0755	2.34909941128176e-10	130943064	130943064	1.80237701554565e-08	130946248	130947790
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	534	0.0036	1.80237701554565e-08	130946248	130947790	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	19313579	306	295	-0.0176	NA	NA	NA	1.24509317524221e-21	19310619	19313579
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19317333	19362016	16	16	0.5867	1.24509317524221e-21	19310619	19313579	1.88123852693274e-26	19362016	19376087
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19376087	31428172	4562	4410	8e-04	1.88123852693274e-26	19362016	19376087	2.71651310401716e-12	31428172	31428172
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-1.1414	2.71651310401716e-12	31428172	31428172	6.57697812262472e-12	31436314	31436314
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	42635995	4353	4193	-0.0021	6.57697812262472e-12	31436314	31436314	7.20709049417766e-30	42629858	42635995
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42639217	42687363	21	19	0.5758	7.20709049417766e-30	42629858	42635995	7.5827906880948e-29	42687363	42691461
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	42689750	63209551	6257	6049	0.0029	7.5827906880948e-29	42687363	42691461	3.35154117498457e-09	63208221	63209551
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63230997	63280389	5	5	0.6474	3.35154117498457e-09	63208221	63209551	2.12431665340086e-09	63280389	63322571
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63322571	89659397	6771	6499	0.0104	2.12431665340086e-09	63280389	63322571	1.24629624191298e-13	89659397	89659397
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.2111	1.24629624191298e-13	89659397	89659397	2.55812291134523e-13	89662326	89662326
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4612	0.0052	2.55812291134523e-13	89662326	89662326	4.03237240833952e-73	100690991	100690991
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.8346	4.03237240833952e-73	100690991	100690991	2.47533546898194e-70	100693892	100693892
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4366	2e-04	2.47533546898194e-70	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19478367	54	52	-0.2552	NA	NA	NA	2.67831871237208e-17	19456276	19494416
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19483933	21662700	1059	1028	0.0169	2.67831871237208e-17	19456276	19494416	3.18976356671283e-58	21648371	21681204
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21664897	21664897	1	0	NA	3.18976356671283e-58	21648371	21681204	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21667866	22061243	205	197	0.2715	NA	NA	NA	1.46381229053499e-68	22049850	22074706
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	40676611	6329	6091	-0.0011	1.46381229053499e-68	22049850	22074706	1.04336996747846e-07	40659171	40687108
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40741934	9	9	0.4357	1.04336996747846e-07	40659171	40687108	5.9159670121088e-08	40722360	40765979
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40746865	73075500	11765	11346	-0.0058	5.9159670121088e-08	40722360	40765979	1.29040311357867e-08	73061942	73075500
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	0.6085	1.29040311357867e-08	73061942	73075500	4.07938577307293e-08	73092112	73106558
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73101327	1	0	NA	4.07938577307293e-08	73092112	73106558	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	105597555	12214	11747	-0.0047	NA	NA	NA	0	105597555	105597555
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.7184	0	105597555	105597555	1.10625966568230e-78	105632168	105632168
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105848335	47	45	-0.0351	1.1062596656823e-78	105632168	105632168	3.95213182214742e-06	105838104	105856591
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105850033	105850033	1	0	NA	3.95213182214742e-06	105838104	105856591	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.5265	NA	NA	NA	4.83876348680365e-05	105881677	105902383
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	171	0.0358	4.83876348680365e-05	105881677	105902383	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3133	NA	NA	NA	2.03368397177218e-25	18452491	18452491
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18824622	6	6	-0.9103	2.03368397177218e-25	18452491	18452491	1.10312985607101e-07	18824622	18826924
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18826924	18848213	8	8	-0.4085	1.10312985607101e-07	18824622	18826924	0.00668369208270953	18842565	19347444
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	20088256	137	133	-0.6193	0.00668369208270953	18842565	19347444	1.90127222971138e-229	20079935	20308014
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	59468560	14825	14300	-0.0073	1.90127222971138e-229	20079935	20308014	1.15859853242844e-22	59468560	59468560
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-1.3028	1.15859853242844e-22	59468560	59468560	1.05882522170743e-23	59483715	59483715
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	99632987	16064	15427	-0.0074	1.05882522170743e-23	59483715	59483715	3.27307246550960e-31	99632987	99632987
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.8058	3.2730724655096e-31	99632987	99632987	4.67233112101761e-39	99635701	99635701
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	256	-0.0161	4.67233112101761e-39	99635701	99635701	0.0208169831662171	100200937	100282819
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.3271	0.0208169831662171	100200937	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5278	-0.0149	NA	NA	NA	4.32115119611848e-09	14674185	14876356
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15023848	12	12	-0.4263	4.32115119611848e-09	14674185	14876356	1.53920929762493e-09	15023848	15037844
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15028108	32379126	5093	4912	1e-04	1.53920929762493e-09	15023848	15037844	2.66978899148655e-62	31854794	32513457
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	43	-0.5631	2.66978899148655e-62	31854794	32513457	1.30160764766841e-31	33538171	33841331
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	34317157	88	87	-0.0553	1.30160764766841e-31	33538171	33841331	7.78037466431267e-26	34306513	34339543
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	50	0.3987	7.78037466431267e-26	34306513	34339543	2.63668645962959e-39	34578641	34621068
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	74962410	9704	9351	-0.0073	2.63668645962959e-39	34578641	34621068	8.7841885362289e-06	74928601	74985302
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74964182	75025318	29	29	0.2071	8.7841885362289e-06	74928601	74985302	6.24520961392807e-05	75006572	75039434
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75029709	75093957	31	31	-0.0365	6.24520961392807e-05	75006572	75039434	3.78087337225993e-96	75093957	75093957
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.4764	3.78087337225993e-96	75093957	75093957	1.41660536911322e-86	75100865	75100865
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	585	-0.0032	1.41660536911322e-86	75100865	75100865	0	76925748	76929598
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.6838	0	76925748	76929598	0	76938723	76940218
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4343	-0.0147	0	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	401	0.0192	NA	NA	NA	8.24700506572746e-37	1028979	1028979
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.0188	8.24700506572746e-37	1028979	1028979	4.9840997616338e-38	1030766	1030766
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31457889	11618	11195	-0.002	4.9840997616338e-38	1030766	1030766	6.8899631021963e-22	31447686	31461588
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	17	0.5278	6.8899631021963e-22	31447686	31461588	3.47504517947985e-22	31493990	31889566
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1738	-0.0069	3.47504517947985e-22	31493990	31889566	4.92591280422328e-307	36673853	36673853
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-3.3843	4.92591280422328e-307	36673853	36673853	1.90709339294721e-321	36684619	36684619
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1951	-2e-04	1.90709339294721e-321	36684619	36684619	5.83527158656334e-32	41515622	41521544
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	20	0.576	5.83527158656334e-32	41515622	41521544	0.000109155496397850	41546807	41574775
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41708551	46	44	0.3638	0.00010915549639785	41546807	41574775	1.77727979935216e-27	41704093	42148637
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	62868652	7750	7453	-0.0047	1.77727979935216e-27	41704093	42148637	1.92177215575582e-12	62867799	62868652
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	62869966	62873107	4	4	-0.8379	1.92177215575582e-12	62867799	62868652	2.35565690355619e-12	62873107	62874348
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	62874348	78653545	5926	5695	-0.0023	2.35565690355619e-12	62873107	62874348	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10570	2e-04	NA	NA	NA	1.22633226770165e-67	36509250	36509250
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.6366	1.22633226770165e-67	36509250	36509250	1.37888447724659e-60	36519728	36519728
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	40226609	810	773	-0.0124	1.37888447724659e-60	36519728	36519728	1.54661826230981e-10	40223036	40226609
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-0.8336	1.54661826230981e-10	40223036	40226609	1.79011483501733e-09	40235901	40244566
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	53092949	4402	4231	-0.0123	1.79011483501733e-09	40235901	40244566	2.05277691308826e-17	53092949	53092949
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.3653	2.05277691308826e-17	53092949	53092949	5.71621236468255e-17	53099601	53099601
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6515	-0.0042	5.71621236468255e-17	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	468	0.0094	NA	NA	NA	6.99064315285427e-21	1398325	1398325
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.6483	6.99064315285427e-21	1398325	1398325	2.19964804215886e-24	1400840	1400840
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4501	-0.0013	2.19964804215886e-24	1400840	1400840	3.14262092830326e-18	11448975	11448975
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.4312	3.14262092830326e-18	11448975	11448975	3.62863132949176e-18	11452390	11452390
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	35401924	5688	5480	-0.0025	3.62863132949176e-18	11452390	11452390	1.46777675708927e-12	35401924	35401924
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35405902	35412031	2	2	1.1989	1.46777675708927e-12	35401924	35401924	1.98343051297258e-13	35412031	35412031
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35416838	48211296	5091	4917	-0.0126	1.98343051297258e-13	35412031	35412031	2.39433573621121e-28	48205963	48321523
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48276273	48536890	13	13	-0.697	2.39433573621121e-28	48205963	48321523	2.73727359459456e-28	48527052	48548254
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48548254	56021341	3501	3366	0.0036	2.73727359459456e-28	48527052	48548254	1.37438694801973e-57	56021341	56021341
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56022536	56024515	2	2	-2.5149	1.37438694801973e-57	56021341	56021341	4.18985193693487e-53	56024515	56024515
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56026655	59414898	1584	1536	-0.0171	4.18985193693487e-53	56024515	56024515	2.11772284227023e-19	59414645	59421197
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.6993	2.11772284227023e-19	59414645	59421197	2.86853929280631e-21	59434159	59440262
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1924	-0.0157	2.86853929280631e-21	59434159	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1506379	585	558	-0.0252	NA	NA	NA	6.76056045752817e-38	1499034	1511632
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8787	6.76056045752817e-38	1499034	1511632	8.24913053323383e-37	1531162	1544485
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20249	-0.0076	8.24913053323383e-37	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	13879604	56	52	-0.0649	NA	NA	NA	7.98227310865516e-08	13874295	13882260
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13882260	13992109	7	7	-0.603	7.98227310865516e-08	13874295	13882260	1.91265690914122e-11	13956118	14088878
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	14047236	1	0	NA	1.91265690914122e-11	13956118	14088878	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14088878	36789648	8481	8187	-0.0016	NA	NA	NA	6.53899836358142e-21	36789648	36789648
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.4992	6.53899836358142e-21	36789648	36789648	5.69827100527764e-20	36791668	36791668
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4716	-0.0083	5.69827100527764e-20	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22644243	2982	2866	-0.0105	NA	NA	NA	7.32682597542283e-12	22603134	22686690
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22736990	25	23	-0.3541	7.32682597542283e-12	22603134	22686690	9.1229310796079e-13	22718614	22747085
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22738466	35472378	6545	6313	-0.006	9.1229310796079e-13	22718614	22747085	6.13151270756416e-159	35472378	35472378
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.0628	6.13151270756416e-159	35472378	35472378	1.69099488982852e-148	35476942	35476942
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	1.69099488982852e-148	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	48448446	6500	6284	-0.0124	NA	NA	NA	7.58308589398996e-09	48446915	48448446
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	1.0109	7.58308589398996e-09	48446915	48448446	8.42059035697101e-09	48452959	48455492
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49567768	499	487	-0.0152	8.420590356971e-09	48452959	48455492	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	714353	479	455	0.0229	NA	NA	NA	0.000665880832072689	694501	727210
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	715717	742385	17	16	-0.2237	0.000665880832072689	694501	727210	4.60962053957738e-07	742385	742385
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	744659	2	2	-1.2036	4.60962053957738e-07	742385	742385	2.34585440549899e-14	744659	744659
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747220	849437	71	70	-0.0443	2.34585440549899e-14	744659	744659	4.31621179071662e-08	848806	853836
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851066	859452	7	6	-0.5923	4.31621179071662e-08	848806	853836	4.68322878257162e-09	853836	859493
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1431411	213	210	0.0041	4.68322878257162e-09	853836	859493	7.73443668297425e-08	1431411	1431411
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-0.9262	7.73443668297425e-08	1431411	1431411	2.41893899479168e-08	1432953	1432953
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	2.41893899479168e-08	1432953	1432953	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2303192	609	592	0.0083	NA	NA	NA	3.29610878341248e-21	2303192	2303192
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	1.2106	3.29610878341248e-21	2303192	2303192	2.24909850299086e-19	2304398	2304398
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	376	-0.0164	2.24909850299086e-19	2304398	2304398	0	2708291	2711273
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76992219	22938	22109	0.9664	0	2708291	2711273	2.18357948197550e-21	76992219	76992219
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76998610	76998610	1	0	NA	2.1835794819755e-21	76992219	76992219	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.7204	NA	NA	NA	9.6441681973831e-22	77010018	77010018
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21369	0.9702	9.6441681973831e-22	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0267	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2817193	50	48	-4.0477	NA	NA	NA	0.00184682584978695	2791440	2825051
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2819272	2819272	1	0	NA	0.00184682584978695	2791440	2825051	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2824225	2856959	12	12	-2.6177	NA	NA	NA	7.01190245386504e-12	2855924	2859887
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2858235	3733715	61	56	-4.3135	7.01190245386504e-12	2855924	2859887	1.71620274240400e-33	3223585	3773948
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	3772482	1	0	NA	1.716202742404e-33	3223585	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3773948	5593746	15	13	-1.3345	NA	NA	NA	2.11111372272188e-09	5422507	6692482
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	167	-3.7112	2.11111372272188e-09	5422507	6692482	4.83100734805314e-11	7027599	7169915
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	122	-2.5933	4.83100734805314e-11	7027599	7169915	3.97424586151097e-05	7446842	7568006
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	12	-4.5372	3.97424586151097e-05	7446842	7568006	0.000228627631494593	7606496	7630477
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	17	-2.6908	0.000228627631494593	7606496	7630477	0.000121820221558474	7631265	7663037
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7719658	42	38	-4.2389	0.000121820221558474	7631265	7663037	1.63207807912156e-09	7711759	7723783
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7722458	7782532	20	18	-2.3022	1.63207807912156e-09	7711759	7723783	0.000143343878823711	7749796	7798534
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7859390	29	29	-3.4945	0.000143343878823711	7749796	7798534	8.58311527665037e-05	7848999	7870400
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	11	-2.1686	8.58311527665037e-05	7848999	7870400	3.60361063375923e-05	7911990	7930528
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7985612	15	15	-4.0911	3.60361063375923e-05	7911990	7930528	0.000315700126393784	7970340	7985612
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992095	7996758	3	3	-1.305	0.000315700126393784	7970340	7985612	5.02954071566183e-09	7996758	7997485
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	8174858	38	35	-4.3346	5.02954071566183e-09	7996758	7997485	2.18686996365029e-05	8149413	8174858
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8176058	8176058	1	0	NA	2.18686996365029e-05	8149413	8174858	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8178487	8201959	9	7	-2.7964	NA	NA	NA	1.22094678997321e-20	8201959	8204414
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8204414	8293425	21	18	-4.6093	1.22094678997321e-20	8201959	8204414	0.00717951278695877	8280065	8446542
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8294345	8956787	191	178	-3.6523	0.00717951278695877	8280065	8446542	1.81099572875899e-06	8893817	8961669
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	33	-4.7378	1.81099572875899e-06	8893817	8961669	9.69940130160013e-11	9155283	9171109
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10014777	12	12	-2.9791	9.69940130160013e-11	9155283	9171109	6.03983462242497e-07	10001056	10049346
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10025706	10513747	63	61	-4.3278	6.03983462242497e-07	10001056	10049346	4.28964474963364e-32	10513747	10535786
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-1.2897	4.28964474963364e-32	10513747	10535786	2.64520406458101e-09	11249952	12452734
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.1812	2.64520406458101e-09	11249952	12452734	2.23544398451389e-07	12541506	12554612
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.9897	2.23544398451389e-07	12541506	12554612	6.43449171753749e-08	12649357	12715696
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-3.887	6.43449171753749e-08	12649357	12715696	3.15629160603049e-09	12796639	12852769
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	112	-2.2265	3.15629160603049e-09	12796639	12852769	1.59322563544364e-07	13104920	13149825
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	44	-3.3614	1.59322563544364e-07	13104920	13149825	0.000388563722066031	13162723	13348970
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14340202	362	339	-4.0722	0.000388563722066031	13162723	13348970	7.54984779512544e-09	14225706	14409145
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14342834	14342834	1	0	NA	7.54984779512544e-09	14225706	14409145	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	94	-3.302	NA	NA	NA	7.54401031054584e-14	14503185	14526446
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.1899	7.54401031054584e-14	14503185	14526446	5.61182348160323e-19	14569287	14596156
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	16387273	579	551	-3.526	5.61182348160323e-19	14569287	14596156	1.27565130752266e-06	16260833	16453776
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16679419	49	45	-4.565	1.27565130752266e-06	16260833	16453776	0.000116617569284712	16614663	16757245
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	20084862	426	406	-3.8008	0.000116617569284712	16614663	16757245	0.00115696172369277	19627111	20295362
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20086711	21041164	197	182	-4.1589	0.00115696172369277	19627111	20295362	2.52435926022558e-06	21035621	21043581
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21042490	21054519	5	5	-1.5259	2.52435926022558e-06	21035621	21043581	4.71398405050762e-06	21047798	21059229
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	251	-3.9127	4.71398405050762e-06	21047798	21059229	6.27587052756902e-08	22052726	22157319
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.7761	6.27587052756902e-08	22052726	22157319	5.95592250196819e-19	22177335	22179794
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22178964	1	0	NA	5.95592250196819e-19	22177335	22179794	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	25737663	94	86	-4.2356	NA	NA	NA	2.57675216008092e-52	25737663	25737663
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26904563	14	12	-0.9593	2.57675216008092e-52	25737663	25737663	5.15237013718682e-06	26904563	26913408
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26905954	26905954	1	0	NA	5.15237013718682e-06	26904563	26913408	NA	NA	NA
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26907147	26920247	6	6	-2.1816	NA	NA	NA	1.27380031854334e-08	26915670	26924187
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	10	-0.7799	1.27380031854334e-08	26915670	26924187	9.38501450931455e-05	26945893	26984336
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27003308	12	11	-3.3078	9.38501450931455e-05	26945893	26984336	8.96472962318024e-05	26980386	27011035
MSK_252152912705_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	57440809	41	39	-1.101	8.96472962318024e-05	26980386	27011035	NA	NA	NA
