Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16698906	5780	5446	-0.0015	NA	NA	NA	1.53320060954527e-11	16663329	16698906
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	16963812	15	12	-0.5943	1.53320060954527e-11	16663329	16698906	1.33503896578476e-11	16963812	17094326
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	94060783	29103	27480	0.0045	1.33503896578476e-11	16963812	17094326	1.24332983133318e-07	94059721	94060783
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-1.2101	1.24332983133318e-07	94059721	94060783	4.98964178595646e-08	94062928	94062928
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	110023268	4711	4457	0.0067	4.98964178595646e-08	94062928	94062928	1.42485082477805e-16	110023268	110023268
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	1.4094	1.42485082477805e-16	110023268	110023268	2.44488434193731e-18	110039388	110039388
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	143697723	3914	3702	-0.0134	2.44488434193731e-18	110039388	110039388	5.33011431136867e-29	143645940	143710875
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	144093719	79	72	-0.3804	5.33011431136867e-29	143645940	143710875	7.15968387500175e-32	143928815	144108338
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150819879	1857	1744	0.0191	7.15968387500175e-32	143928815	144108338	2.76061753210565e-94	150819879	150819879
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	9	1.9417	2.76061753210565e-94	150819879	150819879	5.7730050361991e-62	150851439	150851439
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	73	-0.0544	5.7730050361991e-62	150851439	150851439	9.49726737209932e-10	151024118	151026228
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.806	9.49726737209932e-10	151024118	151026228	5.2418952324679e-07	151036435	151040463
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2531	0.0065	5.2418952324679e-07	151036435	151040463	9.46187131910736e-85	157133150	157133150
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.7929	9.46187131910736e-85	157133150	157133150	2.10965255435046e-85	157136342	157136342
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	31094	-0.0026	2.10965255435046e-85	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13113316	4162	3920	-0.0327	NA	NA	NA	1.08378762286456e-12	13088175	13113316
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.5106	1.08378762286456e-12	13088175	13113316	4.43766158691067e-11	13199426	13206492
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	33617141	6956	6567	-0.025	4.43766158691067e-11	13199426	13206492	1.48088880889403e-105	33617141	33617141
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-4.284	1.48088880889403e-105	33617141	33617141	8.07086553937363e-113	33621111	33621111
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	34543992	388	377	0.0224	8.07086553937363e-113	33621111	33621111	0	34543992	34551222
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-4.2595	0	34543992	34551222	0	34583814	34589997
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35553983	381	366	-0.0113	0	34583814	34589997	2.26042251663204e-10	35553983	35553983
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.2949	2.26042251663204e-10	35553983	35553983	2.03127625158733e-10	35562007	35564203
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	35821494	101	96	0.0187	2.03127625158733e-10	35562007	35564203	2.32319650970325e-13	35821494	35821494
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.4711	2.32319650970325e-13	35821494	35821494	9.26849109080578e-13	35844884	35844884
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6331	0.0015	9.26849109080578e-13	35844884	35844884	1.80455356447127e-09	52588009	52600588
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	4	0.904	1.80455356447127e-09	52588009	52600588	5.42742011293319e-09	52635695	52639605
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	115249749	17393	16423	-0.0029	5.42742011293319e-09	52635695	52639605	5.31576654567642e-14	115247758	115249749
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115251898	115258615	5	5	-0.9991	5.31576654567642e-14	115247758	115249749	5.02452424690963e-18	115258615	115260545
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115260545	242689978	41692	39358	-0.0012	5.02452424690963e-18	115258615	115260545	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10229	-0.0142	NA	NA	NA	5.92779495595046e-10	32074432	32074432
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.3394	5.92779495595046e-10	32074432	32074432	1.19754276058929e-09	32080848	32080848
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460805	5419	5138	-0.0121	1.19754276058929e-09	32080848	32080848	2.90204801861408e-22	47460805	47460805
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47460892	47460892	1	0	NA	2.90204801861408e-22	47460805	47460805	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.0028	NA	NA	NA	5.66004180619827e-23	47466921	47466921
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75798154	10661	10076	-0.0109	5.66004180619827e-23	47466921	47466921	8.15934356278573e-10	75783255	75845446
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75799026	75875904	13	12	-0.5172	8.15934356278573e-10	75783255	75845446	4.06453551210539e-10	75870144	76013273
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	148178032	21639	20481	-0.0026	4.06453551210539e-10	75870144	76013273	6.04521071593276e-11	148172889	148178032
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	148179829	148181707	2	2	-1.2269	6.04521071593276e-11	148172889	148178032	7.30784647227396e-09	148181707	148181707
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	148184747	163992903	4953	4678	0.0095	7.30784647227396e-09	148181707	148181707	1.18017809110949e-43	163992903	164005577
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	1.3151	1.18017809110949e-43	163992903	164005577	0.00637363138382904	164001657	164038917
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.581	0.00637363138382904	164001657	164038917	2.36699227793874e-20	164101776	164123806
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	199329592	12115	11448	0.0027	2.36699227793874e-20	164101776	164123806	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	173660684	49835	47167	0.0024	NA	NA	NA	6.15593854301954e-17	173660684	173660684
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.3861	6.15593854301954e-17	173660684	173660684	3.64893153018757e-11	173666072	173666072
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	190772330	5226	4939	0.0025	3.64893153018757e-11	173666072	173666072	9.39554399224444e-19	190749363	190792612
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190913517	50	44	-0.3759	9.39554399224444e-19	190749363	190792612	4.13096209398478e-06	190896423	190950585
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190915643	191153613	48	47	-0.0495	4.13096209398478e-06	190896423	190950585	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	219	-0.0594	NA	NA	NA	2.00572812110842e-07	819038	829954
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-1.1598	2.00572812110842e-07	819038	829954	2.33496575798402e-07	873365	873365
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12853151	3744	3538	-0.0354	2.33496575798402e-07	873365	873365	2.42140528013367e-83	12853151	12853151
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12857302	12857302	1	0	NA	2.42140528013367e-83	12853151	12853151	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-3.691	NA	NA	NA	4.99754355046555e-82	12873052	12873052
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180644810	49789	47064	-2e-04	4.99754355046555e-82	12873052	12873052	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32548736	11676	11007	0.0035	NA	NA	NA	2.46007820091349e-34	32536956	32633691
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32762061	67	63	0.4354	2.46007820091349e-34	32536956	32633691	1.76984948590655e-35	32723722	32772859
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	7794	-0.0034	1.76984948590655e-35	32723722	32772859	4.12922147049720e-169	54035000	54035000
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.2904	4.1292214704972e-169	54035000	54035000	7.59746640186295e-168	54042734	54042734
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12516	0.008	7.59746640186295e-168	54042734	54042734	2.51124095361584e-13	103841482	103841482
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103860573	3	3	1.251	2.51124095361584e-13	103841482	103841482	4.23746874431056e-13	103860573	103873584
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103868154	103868154	1	0	NA	4.23746874431056e-13	103860573	103873584	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	19938	0.0049	NA	NA	NA	6.98026695297819e-227	165643653	165643653
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.3576	6.98026695297819e-227	165643653	165643653	1.30913566554194e-214	165650610	165650610
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1686	-0.0383	1.30913566554194e-214	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	37059	0.003	NA	NA	NA	5.94152591846562e-08	118609124	118611324
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.0124	5.94152591846562e-08	118609124	118611324	2.89264434186602e-08	118620875	118622742
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2996	0.0093	2.89264434186602e-08	118620875	118622742	1.15944402297661e-10	125829681	125831554
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.1418	1.15944402297661e-10	125829681	125831554	7.90645446769477e-11	125837524	125837524
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3449	-0.0031	7.90645446769477e-11	125837524	125837524	2.54174485825906e-294	133433384	133433384
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133444486	6	6	-4.1946	2.54174485825906e-294	133433384	133433384	2.39475716547178e-288	133444486	133444486
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133447868	147702365	6354	6019	-3e-04	2.39475716547178e-288	133444486	133444486	1.9503652057699e-20	147702365	147702365
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.9481	1.9503652057699e-20	147702365	147702365	3.67916365302266e-20	147707161	147707161
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4007	-0.036	3.67916365302266e-20	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	15103911	4984	4710	-0.0092	NA	NA	NA	1.37275766019865e-08	15103911	15103911
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15105185	15106489	2	2	-1.2656	1.37275766019865e-08	15103911	15103911	1.07409569227171e-08	15106489	15106489
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15109198	26346515	3742	3541	-0.0097	1.07409569227171e-08	15106489	15106489	2.43066071940018e-08	26341902	26346515
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26350665	26355932	3	3	0.995	2.43066071940018e-08	26341902	26346515	1.17034081371601e-08	26355932	26358483
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26358483	32797545	2462	2328	-0.0027	1.17034081371601e-08	26355932	26358483	1.55906761685580e-16	32797545	32797545
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	2	-1.6694	1.5590676168558e-16	32797545	32797545	9.37669511823508e-17	32808049	32808049
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	40892587	2378	2229	0.0078	9.37669511823508e-17	32808049	32808049	4.32689911837940e-09	40888127	40892587
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.2579	4.3268991183794e-09	40888127	40892587	1.46254815623463e-08	40897469	40911342
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	40904488	1	0	NA	1.46254815623463e-08	40897469	40911342	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40911342	85422157	11661	11040	0.0077	NA	NA	NA	1.07015177033913e-09	85420037	85422157
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	5	-0.8299	1.07015177033913e-09	85420037	85422157	3.77441392114765e-21	85431319	85434122
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	146264846	19323	18245	-0.0038	3.77441392114765e-21	85431319	85434122	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5144	-0.0017	NA	NA	NA	1.13909148996632e-98	15802255	15802255
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-4.0045	1.13909148996632e-98	15802255	15802255	2.11855594643048e-100	15807123	15807123
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7160	-0.0012	2.11855594643048e-100	15807123	15807123	6.99810913887153e-49	70926188	70926188
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.8027	6.99810913887153e-49	70926188	70926188	6.14891618001001e-47	70930528	70930528
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22505	-0.0101	6.14891618001001e-47	70930528	70930528	3.65263733421113e-31	137352394	137352394
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.2925	3.65263733421113e-31	137352394	137352394	6.82569075803212e-29	137356880	137356880
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1035	-0.0434	6.82569075803212e-29	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9224	-0.0023	NA	NA	NA	1.95928578872461e-13	27038538	27038538
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.5367	1.95928578872461e-13	27038538	27038538	2.94213727943415e-13	27041812	27041812
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14062	0.0021	2.94213727943415e-13	27041812	27041812	2.90614437333182e-86	77917893	77917893
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.1239	2.90614437333182e-86	77917893	77917893	2.81273597199212e-88	77928738	77928738
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	11714	-0.0057	2.81273597199212e-88	77928738	77928738	9.45260366678491e-78	114100979	114100979
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.5881	9.45260366678491e-78	114100979	114100979	6.82293484514946e-75	114106460	114106460
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7371	-0.0299	6.82293484514946e-75	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55114405	16904	16011	-0.0093	NA	NA	NA	1.30137349075014e-10	55073386	55136234
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55217189	41	40	-0.3238	1.30137349075014e-10	55073386	55136234	3.80142111696686e-11	55200744	55238200
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	93000699	13687	12948	-0.0043	3.80142111696686e-11	55200744	55238200	1.95701528420944e-10	93000699	93000699
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93003167	93005517	2	2	-1.3884	1.95701528420944e-10	93000699	93000699	3.82083571443222e-11	93005517	93005517
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93008346	107144605	4530	4288	0.0049	3.82083571443222e-11	93005517	93005517	3.13030960039582e-09	107114225	107151582
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107146857	107177546	16	15	0.4709	3.13030960039582e-09	107114225	107151582	1.66238414951954e-11	107173481	107184680
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107178916	134450318	10124	9558	-0.0195	1.66238414951954e-11	107173481	107184680	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3562	0.0028	NA	NA	NA	8.28727231648424e-25	9516067	9531133
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9582696	10	8	1.0587	8.28727231648424e-25	9516067	9531133	2.47124918750926e-25	9573313	9589725
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9589725	132289090	41409	39117	0.0088	2.47124918750926e-25	9573313	9589725	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6939	0.0022	NA	NA	NA	7.65977135742021e-52	37953582	37953582
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.9735	7.65977135742021e-52	37953582	37953582	3.84242692166997e-55	37957844	37957844
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4620	0.0129	3.84242692166997e-55	37957844	37957844	1.36059569072120e-73	49964838	49964838
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.4336	1.3605956907212e-73	49964838	49964838	5.82213727353288e-67	49971732	49971732
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71373779	5441	5154	0.0136	5.82213727353288e-67	49971732	49971732	3.46181095998915e-25	71373779	71373779
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71375082	71375082	1	0	NA	3.46181095998915e-25	71373779	71373779	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.1258	NA	NA	NA	3.05585094563708e-25	71377671	71377671
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13242	-0.0054	3.05585094563708e-25	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	32	-0.3261	NA	NA	NA	7.13806185595754e-10	19418899	19461755
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	78227579	21794	20533	0.011	7.13806185595754e-10	19418899	19461755	2.73483129012104e-09	78226039	78227579
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78229428	78232665	3	3	-1.0588	2.73483129012104e-09	78226039	78227579	4.18244250480548e-09	78232665	78233664
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78233664	102900955	8826	8379	-0.0133	4.18244250480548e-09	78232665	78233664	1.67935238593405e-07	102896292	102900955
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	102908428	102908660	2	2	-1.1845	1.67935238593405e-07	102896292	102900955	3.85385904731184e-07	102908660	102912677
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	102912677	105595302	979	936	-0.0328	3.85385904731184e-07	102908660	102912677	1.11665364150103e-06	105585666	105597555
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105632168	13	13	-0.4715	1.11665364150103e-06	105585666	105597555	2.8254112982099e-05	105630089	105739770
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105673157	1	0	NA	2.8254112982099e-05	105630089	105739770	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105681007	105850033	47	42	0.055	NA	NA	NA	5.11141416177364e-05	105833372	105850033
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.7279	5.11141416177364e-05	105833372	105850033	2.33427147694524e-11	105881893	105897061
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105945006	15	13	-0.0193	2.33427147694524e-11	105881893	105897061	1.14927135373359e-08	105923686	105948347
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106013552	20	20	-0.6912	1.14927135373359e-08	105923686	105948347	3.21883061033957e-21	106002179	106017453
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106015449	106358491	141	132	0.01	3.21883061033957e-21	106002179	106017453	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1764	NA	NA	NA	0.000225956361010912	18450562	18818949
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	142	-0.4017	0.000225956361010912	18450562	18818949	5.17215069027737e-67	20045859	20330200
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	75115806	21729	20571	0.0045	5.17215069027737e-67	20045859	20330200	6.74370099538262e-12	75115806	75115806
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.366	6.74370099538262e-12	75115806	75115806	1.18814283509668e-10	75119713	75119713
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	8971	-0.0086	1.18814283509668e-10	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14687636	5467	5173	-0.0128	NA	NA	NA	5.48759425216093e-08	14669740	14956177
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15037844	17	17	-0.4335	5.48759425216093e-08	14669740	14956177	6.04030915672458e-09	15029941	15043869
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	34329518	5225	4921	0.0098	6.04030915672458e-09	15029941	15043869	1.79868380393548e-18	34280904	34359308
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34602318	50	49	0.3807	1.79868380393548e-18	34280904	34359308	4.0447281603847e-23	34571523	34623136
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	57203733	4150	3929	-0.0194	4.0447281603847e-23	34571523	34623136	2.03859696917225e-08	57203733	57203733
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1913	2.03859696917225e-08	57203733	57203733	1.24595106424416e-07	57206772	57208375
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5314	0.009	1.24595106424416e-07	57206772	57208375	2.07222062322645e-54	75093957	75093957
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.4829	2.07222062322645e-54	75093957	75093957	2.01309175718579e-56	75100865	75100865
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	2.01309175718579e-56	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	76925748	609	583	-0.0329	NA	NA	NA	4.48205233045003e-21	76923844	76925748
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8995	4.48205233045003e-21	76923844	76925748	1.03976296783832e-18	76940218	76942679
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4248	-0.0326	1.03976296783832e-18	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	397	-0.0111	NA	NA	NA	3.23556051793029e-15	1027248	1027736
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.1717	3.23556051793029e-15	1027248	1027736	8.3709055486604e-15	1030715	1030766
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31457889	11618	10962	0.0139	8.3709055486604e-15	1030715	1030766	3.44726935638105e-28	31447686	31461588
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	17	0.7803	3.44726935638105e-28	31447686	31461588	2.43031537393789e-31	31493990	31503774
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32828797	366	345	0.0077	2.43031537393789e-31	31493990	31503774	5.48023585058847e-08	32826928	32828797
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.12	5.48023585058847e-08	32826928	32828797	1.01860370863552e-06	32832642	32836527
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	32833765	1	0	NA	1.01860370863552e-06	32832642	32836527	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32836527	36673853	1447	1373	0.0194	NA	NA	NA	2.96522915811437e-08	36668730	36675987
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	0.7881	2.96522915811437e-08	36668730	36675987	7.29772520607428e-09	36683509	36687917
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36686013	1	0	NA	7.29772520607428e-09	36683509	36687917	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36687917	41519702	2010	1884	0.0186	NA	NA	NA	1.53864633457847e-40	41512318	41521544
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41704093	64	62	0.48	1.53864633457847e-40	41512318	41521544	1.65422741246549e-39	41702238	42142363
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	58433564	5913	5586	0.0207	1.65422741246549e-39	41702238	42142363	3.31877967736293e-07	58423755	58439971
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58435991	58435991	1	0	NA	3.31877967736293e-07	58423755	58439971	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58452260	7	7	0.6227	NA	NA	NA	4.80074042490916e-07	58452260	58459873
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	78653545	7761	7365	0.0058	4.80074042490916e-07	58452260	58459873	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21696	-0.0045	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63787171	23058	21774	0.0122	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	558	-0.0388	NA	NA	NA	1.19240486487993e-111	1506379	1516966
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-2.2598	1.19240486487993e-111	1506379	1516966	1.70527765001584e-150	1525300	1532433
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	19842	-0.008	1.70527765001584e-150	1525300	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	46922972	13440	12681	0.0016	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2824	-0.0052	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-3.2086	0	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	28293343	3046	2891	-0.0129	0	22720195	22725305	1.80047441754586e-07	28276371	28298321
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28294835	28344172	24	23	0.3177	1.80047441754586e-07	28276371	28298321	3.53366541611978e-06	28334902	28366281
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28347050	32110063	1972	1861	0.0035	3.53366541611978e-06	28334902	28366281	6.00040300599994e-216	32110063	32110063
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-6.0392	6.00040300599994e-216	32110063	32110063	3.36009630642434e-206	32112051	32112051
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	49571068	8508	8059	-0.0116	3.36009630642434e-206	32112051	32112051	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	767373	511	482	-0.0525	NA	NA	NA	4.32464053179675e-05	739660	771824
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	767408	800669	24	24	-0.3561	4.32464053179675e-05	739660	771824	2.35027870197485e-06	793677	815896
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800956	1431411	254	243	-0.0327	2.35027870197485e-06	793677	815896	4.52830875363465e-16	1431411	1431411
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.7446	4.52830875363465e-16	1431411	1431411	8.79312821665332e-17	1432953	1432953
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	8.79312821665332e-17	1432953	1432953	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2303192	609	569	-0.0379	NA	NA	NA	4.43482393144661e-12	2303192	2303192
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	1.15	4.43482393144661e-12	2303192	2303192	9.22498943239258e-13	2304398	2306110
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	365	-0.0542	9.22498943239258e-13	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8450789	1790	1699	0.9332	0	2708113	2711273	2.49902939892231e-07	8445177	8456422
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8452395	8473482	9	8	0.2617	2.49902939892231e-07	8445177	8456422	1.76745488303562e-19	8465433	8477126
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	154582414	43335	40863	0.9642	1.76745488303562e-19	8465433	8477126	0	154578922	154586690
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	-0.0431	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	112	-3.8579	NA	NA	NA	0.351833883721631	2728328	3034907
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	3733715	3	3	-2.6284	0.351833883721631	2728328	3034907	0.0251102231543969	3733715	4421500
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	3772482	1	0	NA	0.0251102231543969	3733715	4421500	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3773948	5593746	15	15	-1.0258	NA	NA	NA	2.56255443558101e-06	5422507	6728131
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	8010446	458	433	-3.1367	2.56255443558101e-06	5422507	6728131	0.00630760744436185	7776265	8088838
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	58	-3.8932	0.00630760744436185	7776265	8088838	0.154117507080180	8144929	8564257
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8835526	165	156	-3.411	0.15411750708018	8144929	8564257	0.293181472345196	8566630	8901974
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8836109	8949553	25	25	-4.0335	0.293181472345196	8566630	8901974	2.14972890349410e-05	8938284	8949553
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.3151	2.1497289034941e-05	8938284	8949553	1.71026973718811e-05	8956787	8959151
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	105	-4.0498	1.71026973718811e-05	8956787	8959151	1.75967637065026e-20	10512616	10537808
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	17	-1.4814	1.75967637065026e-20	10512616	10537808	2.26738871909169e-08	10655750	12452734
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.2204	2.26738871909169e-08	10655750	12452734	1.09727378314984e-05	12541506	12557151
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.0053	1.09727378314984e-05	12541506	12557151	2.30354679948158e-06	12634446	12696242
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-3.7695	2.30354679948158e-06	12634446	12696242	2.74613418428109e-10	12809152	12855363
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13133803	114	109	-2.0066	2.74613418428109e-10	12809152	12855363	3.00836228128855e-07	13114969	13138841
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13155705	13	12	-3.9219	3.00836228128855e-07	13114969	13138841	0.00294301614803855	13146483	13215006
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13158272	13254711	27	27	-2.8322	0.00294301614803855	13146483	13215006	1.35145741098303e-05	13230706	13296819
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14342834	367	345	-3.9053	1.35145741098303e-05	13230706	13296819	9.69053432005773e-09	14260254	14385580
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	86	-3.0566	9.69053432005773e-09	14260254	14385580	4.40561019782169e-06	14492454	14538156
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	23	-1.4283	4.40561019782169e-06	14492454	14538156	2.04027300540640e-10	14559651	14597771
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15523178	328	307	-3.4202	2.0402730054064e-10	14559651	14597771	2.05885593812335e-05	15475310	15527805
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	13	-1.5319	2.05885593812335e-05	15475310	15527805	0.00142940039413909	15540379	15558235
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15687088	39	38	-3.2572	0.00142940039413909	15540379	15558235	0.000580758263261119	15573648	15707307
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15915466	37	37	-4.3795	0.000580758263261119	15573648	15707307	9.62239931094727e-06	15898644	15967120
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	42	-3.0282	9.62239931094727e-06	15898644	15967120	0.00251501315505656	16002819	16036892
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16062175	10	8	-1.0438	0.00251501315505656	16002819	16036892	1.46192989832829e-06	16043782	16066990
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16062961	16218742	75	73	-3.1948	1.46192989832829e-06	16043782	16066990	0.00242089616314535	16163786	16552565
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16219596	21036503	705	671	-3.7904	0.00242089616314535	16163786	16552565	2.96659370790724e-06	21026715	21036503
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.114	2.96659370790724e-06	21026715	21036503	2.9862390711576e-08	21054519	21057446
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22058759	260	246	-3.8777	2.9862390711576e-08	21054519	21057446	5.65652988588522e-07	22049641	22157319
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22139807	22139807	1	0	NA	5.65652988588522e-07	22049641	22157319	NA	NA	NA
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.6752	NA	NA	NA	7.70219640266197e-06	22176501	22178964
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.5748	7.70219640266197e-06	22176501	22178964	0.000155367053354027	22181855	22203194
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	23	-4.8238	0.000155367053354027	22181855	22203194	0.000115070666246303	22252795	22768795
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	63	-3.8201	0.000115070666246303	22252795	22768795	7.0408286310519e-47	22926726	22930737
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-1.0385	7.0408286310519e-47	22926726	22930737	1.77220538159262e-29	26945893	26945893
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	4	-4.2409	1.77220538159262e-29	26945893	26945893	8.41173912644037e-05	26980386	26998633
MSK_252152912706_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	46	-1.1936	8.41173912644037e-05	26980386	26998633	NA	NA	NA
