Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	54860193	21023	20434	-0.005	NA	NA	NA	1.88517100287792e-08	54857788	54860193
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54866506	3	3	-1.086	1.88517100287792e-08	54857788	54860193	1.55964771303516e-09	54866506	54876067
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72537426	6868	6666	-0.0044	1.55964771303516e-09	54866506	54876067	0	72537426	72537426
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.9511	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	89033045	5090	4941	0.0022	0	72579311	72579311	7.39198279017588e-16	89024147	89037322
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	89035969	89079670	22	22	0.5264	7.39198279017588e-16	89024147	89037322	3.65915414997855e-15	89071570	89085701
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	89081334	110023268	6591	6397	0.0035	3.65915414997855e-15	89071570	89085701	7.34937199465784e-21	110023268	110023268
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	1.654	7.34937199465784e-21	110023268	110023268	7.23344812470453e-23	110039388	110039388
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2148	-0.0036	7.23344812470453e-23	110039388	110039388	4.13372460030143e-20	116029725	116029725
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.9193	4.13372460030143e-20	116029725	116029725	3.86819759569559e-19	116033402	116033402
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	150818222	3625	3514	-0.0132	3.86819759569559e-19	116033402	116033402	1.19568795476377e-144	150818222	150823073
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150819879	1	0	NA	1.19568795476377e-144	150818222	150823073	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	2.1987	NA	NA	NA	1.75074655839393e-106	150848509	150851439
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	150852858	1	0	NA	1.75074655839393e-106	150848509	150851439	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151026228	77	74	-0.0791	NA	NA	NA	5.35446532097786e-13	151024118	151026228
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8398	5.35446532097786e-13	151024118	151026228	5.98459121902704e-07	151036435	151042365
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	151038091	1	0	NA	5.98459121902704e-07	151036435	151042365	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151040463	157133150	2678	2597	0.0019	NA	NA	NA	3.34964605941136e-65	157133150	157133150
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.5082	3.34964605941136e-65	157133150	157133150	1.98484318129353e-67	157136342	157136342
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11014	-0.0046	1.98484318129353e-67	157136342	157136342	5.35748430469158e-08	185973975	185979586
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.2509	5.35748430469158e-08	185973975	185979586	1.25770077211584e-07	185988138	186000612
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	246820980	21465	20916	0.001	1.25770077211584e-07	185988138	186000612	1.02766461564328e-10	246805521	246828744
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246822838	246860551	19	19	0.4742	1.02766461564328e-10	246805521	246828744	2.21161539169363e-09	246853406	246878405
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246862029	247186514	99	98	0.0293	2.21161539169363e-09	246853406	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	32737867	10731	10426	-0.0084	NA	NA	NA	1.77965145181512e-30	32737022	32742557
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	32742557	32769005	14	14	-0.9051	1.77965145181512e-30	32737022	32742557	3.33234761124014e-36	32766759	32772603
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	32772603	33076512	131	126	0.0282	3.33234761124014e-36	32766759	32772603	2.34143166308449e-123	33076512	33076512
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-4.1686	2.34143166308449e-123	33076512	33076512	4.8008702958181e-98	33080437	33080437
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34542224	643	630	0.0352	4.8008702958181e-98	33080437	33080437	3.25639022403096e-05	34506496	34558824
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34543992	34579933	15	15	0.405	3.25639022403096e-05	34506496	34558824	3.20993787890558e-07	34568392	34597294
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34580533	1	0	NA	3.20993787890558e-07	34568392	34597294	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	37810001	1372	1330	-0.0212	NA	NA	NA	7.65044071247711e-36	37803744	37815049
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	-0.8084	7.65044071247711e-36	37803744	37815049	1.56529147082758e-39	37852371	37858379
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	66357387	10363	10049	0.0061	1.56529147082758e-39	37852371	37858379	1.64715119651719e-172	66357387	66357387
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-5.4572	1.64715119651719e-172	66357387	66357387	3.01580913364129e-163	66360747	66360747
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	89319930	7012	6808	0.0039	3.01580913364129e-163	66360747	66360747	5.29323057267381e-77	89315203	89379689
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89377705	91151411	56	55	-0.7165	5.29323057267381e-77	89315203	89379689	5.7953427432271e-74	91143626	91158269
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91155301	146571330	14710	14259	-0.0084	5.7953427432271e-74	91143626	91158269	0	146571330	146571330
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.8913	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	10880	0.0059	0	146592775	146592775	3.87180689969231e-10	179764819	179767214
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.1686	3.87180689969231e-10	179764819	179767214	6.13066961253677e-12	179778919	179791128
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242689978	21542	20934	0.0029	6.13066961253677e-12	179778919	179791128	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10459	-0.0047	NA	NA	NA	7.74030368830645e-22	32074432	32074432
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.9947	7.74030368830645e-22	32074432	32074432	1.27049383258801e-20	32080848	32080848
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32094956	1	0	NA	1.27049383258801e-20	32080848	32080848	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32098215	47460892	5419	5270	9e-04	NA	NA	NA	6.95091541486191e-148	47460892	47460892
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-5.2648	6.95091541486191e-148	47460892	47460892	2.12668338722661e-150	47466921	47466921
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	133189686	27489	26665	2e-04	2.12668338722661e-150	47466921	47466921	3.95365017359322e-16	133189686	133189686
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.7682	3.95365017359322e-16	133189686	133189686	1.36908924073297e-16	133194685	133194685
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9530	0.0052	1.36908924073297e-16	133194685	133194685	1.32825180215953e-167	163992903	163992903
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-4.4818	1.32825180215953e-167	163992903	163992903	1.18887219458617e-28	164005577	164005577
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	3	-0.2997	1.18887219458617e-28	164005577	164005577	5.73581985756789e-17	164027724	164027724
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	18	-4.6881	5.73581985756789e-17	164027724	164027724	0	164107951	164107951
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	167212301	731	701	0.02	0	164107951	164107951	6.50940646996742e-08	167204968	167212301
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	167216102	167237294	4	4	-0.8832	6.50940646996742e-08	167204968	167212301	5.14026749610218e-08	167237294	167241432
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	167241432	194354505	9395	9125	0.0038	5.14026749610218e-08	167237294	167241432	0	194354505	194354505
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.6789	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1927	-6e-04	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	63346612	17223	16731	-0.0046	NA	NA	NA	3.58759242011695e-173	63346612	63346612
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-5.6056	3.58759242011695e-173	63346612	63346612	1.55467971549100e-174	63358506	63358506
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	68905670	1208	1171	0.0099	1.554679715491e-174	63358506	63358506	0	68905670	68905670
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-4.5429	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	98391083	9847	9555	0.0103	0	69165814	69165814	6.03720160726233e-12	98388524	98391083
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	98394061	98404447	4	4	-1.0874	6.03720160726233e-12	98388524	98391083	2.32502904735406e-12	98404447	98409393
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	98409393	156810598	16684	16169	0.0093	2.32502904735406e-12	98404447	98409393	3.70432289863198e-27	156808887	156810598
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	156811828	156831039	10	10	-1.001	3.70432289863198e-27	156808887	156810598	3.18530784703877e-27	156831039	156832170
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	156832170	173660684	4843	4717	0.0127	3.18530784703877e-27	156831039	156832170	1.37289061507192e-62	173660684	173660684
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.3998	1.37289061507192e-62	173660684	173660684	6.69322253993428e-64	173666072	173666072
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5177	0.008	6.69322253993428e-64	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	219	-0.0137	NA	NA	NA	6.42464607715921e-17	737829	776194
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	905462	8	8	0.9815	6.42464607715921e-17	737829	776194	2.26677073327279e-20	905462	910211
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	910211	150181399	43623	42419	-1e-04	2.26677073327279e-20	905462	910211	3.52832471361287e-12	150171154	150185190
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8257	3.52832471361287e-12	150171154	150185190	6.4110448908466e-13	150201145	150204134
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	178656438	9129	8886	0.0033	6.4110448908466e-13	150201145	150204134	7.80653869351596e-46	178648183	178668197
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178658712	178866013	75	74	0.4765	7.80653869351596e-46	178648183	178668197	1.82239552430294e-44	178855549	178881469
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178869385	180644810	701	680	-0.0229	1.82239552430294e-44	178855549	178881469	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	54	-0.0619	NA	NA	NA	1.22344553121618e-22	234115	244363
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	45	-0.6118	1.22344553121618e-22	234115	244363	9.22431678312721e-48	322557	329100
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32558677	11576	11219	0.0074	9.22431678312721e-48	322557	329100	2.67848852821585e-233	32558677	32567462
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32631315	16	16	-2.2998	2.67848852821585e-233	32558677	32567462	2.28248130391738e-18	32613538	32631315
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32633691	32633691	1	0	NA	2.28248130391738e-18	32613538	32631315	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32709263	26	26	0.0429	NA	NA	NA	0.0826761064752633	32680035	32785011
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32711957	32799261	38	38	0.308	0.0826761064752633	32680035	32785011	3.1826584320594e-09	32766023	32821094
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32800724	54035000	8231	7989	-5e-04	3.1826584320594e-09	32766023	32821094	6.85700357569089e-24	54035000	54035000
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.721	6.85700357569089e-24	54035000	54035000	2.76427494136674e-23	54042734	54042734
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79011979	6430	6252	0.01	2.76427494136674e-23	54042734	54042734	8.41307867867498e-08	78983276	79024557
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	15	0.465	8.41307867867498e-08	78983276	79024557	2.03288719351289e-08	79074911	79127731
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	90980820	3543	3459	-0.0016	2.03288719351289e-08	79074911	79127731	5.77708612012688e-09	90980820	90980820
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	90982083	90983810	2	2	-1.3166	5.77708612012688e-09	90980820	90980820	1.71768514443325e-09	90983810	90983810
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	90984974	103841482	3217	3129	0.013	1.71768514443325e-09	90983810	90983810	6.8486809812254e-182	103841482	103841482
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.0136	6.8486809812254e-182	103841482	103841482	3.30923587720715e-175	103868154	103868154
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22230	0.008	3.30923587720715e-175	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	71200243	21547	20922	0	NA	NA	NA	2.37386459999446e-08	71191256	71206540
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71203792	71217526	10	10	0.579	2.37386459999446e-08	71191256	71206540	1.29515279385576e-07	71211899	71223629
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71219030	133433384	24538	23834	0.0147	1.29515279385576e-07	71211899	71223629	3.04273787158368e-11	133426996	133433384
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133447868	7	7	0.8186	3.04273787158368e-11	133426996	133433384	3.93056186635136e-12	133447868	133453811
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133448277	141410894	3701	3602	0.0043	3.93056186635136e-12	133447868	133453811	8.63073700813403e-08	141405145	141419692
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141435643	12	12	0.5097	8.63073700813403e-08	141405145	141419692	1.46950674613227e-05	141426846	141449014
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141690753	118	114	0.0133	1.46950674613227e-05	141426846	141449014	1.52652150455408e-219	141690753	141690753
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-4.118	1.52652150455408e-219	141690753	141690753	1.10904012834668e-262	141714168	141714168
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142156165	168	163	0.0852	1.10904012834668e-262	141714168	141714168	6.08336428205139e-13	142156165	142156165
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142166710	3	2	-1.6215	6.08336428205139e-13	142156165	142156165	9.91716020415367e-09	142166710	142166710
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-3.9359	9.91716020415367e-09	142166710	142166710	2.88513324067319e-77	142167908	142167908
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	158821263	6579	6401	-0.0096	2.88513324067319e-77	142167908	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7697025	2397	2323	-0.0253	NA	NA	NA	1.67700655222875e-10	7327293	7697025
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7709141	7824059	4	4	-1.0462	1.67700655222875e-10	7327293	7697025	5.28812945184654e-11	7824059	8137794
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5586	-0.0057	5.28812945184654e-11	7824059	8137794	3.97264090411802e-19	25120552	25120552
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	3.97264090411802e-19	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.9113	NA	NA	NA	2.69621280807468e-17	25125700	25125700
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25462525	162	157	0.0305	2.69621280807468e-17	25125700	25125700	2.61380067632656e-09	25462525	25462525
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25463846	25463846	1	0	NA	2.61380067632656e-09	25462525	25462525	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25469017	2	2	-1.3619	NA	NA	NA	2.24966574299331e-09	25469017	25469017
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25470598	39350798	4747	4626	0.0017	2.24966574299331e-09	25469017	25469017	7.11400197489742e-122	39345557	39350798
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.8925	7.11400197489742e-122	39345557	39350798	1.44848684609932e-99	39504332	39509423
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	431	0.0276	1.44848684609932e-99	39504332	39509423	4.10035867531606e-08	40888127	40892587
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.3107	4.10035867531606e-08	40888127	40892587	7.17817625786566e-14	40897469	40904488
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30105	-2e-04	7.17817625786566e-14	40897469	40904488	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12705	-5e-04	NA	NA	NA	1.11126136194045e-19	70926188	70926188
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.9163	1.11126136194045e-19	70926188	70926188	1.05908684796437e-19	70930528	70930528
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	129221786	20432	19868	-0.012	1.05908684796437e-19	70930528	70930528	4.86047633284707e-124	129221786	129221786
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129223189	129224728	2	2	-4.7641	4.86047633284707e-124	129221786	129221786	7.76258106944225e-113	129224728	129224728
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	137352394	3331	3237	-0.0028	7.76258106944225e-113	129224728	129224728	2.75012232633643e-30	137352394	137352394
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.482	2.75012232633643e-30	137352394	137352394	1.88916663141809e-30	137356880	137356880
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1065	-0.0246	1.88916663141809e-30	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4553	-0.0082	NA	NA	NA	3.01923431709239e-11	13553503	13553503
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.477	3.01923431709239e-11	13553503	13553503	1.72023152677971e-11	13556315	13556315
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4875	0.0025	1.72023152677971e-11	13556315	13556315	3.85997480928237e-16	27038538	27038538
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.7401	3.85997480928237e-16	27038538	27038538	1.01521787926628e-15	27041812	27041812
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45478103	4722	4571	-0.0038	1.01521787926628e-15	27041812	27041812	4.55046514366940e-23	45452446	46402308
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45478162	47157002	117	117	-0.2805	4.5504651436694e-23	45452446	46402308	1.54540225465543e-23	47130487	47954413
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47159404	70949263	7105	6887	-0.0075	1.54540225465543e-23	47130487	47954413	2.82990866213676e-13	70947915	70949263
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-1.118	2.82990866213676e-13	70947915	70949263	1.46869325653100e-12	70960187	70964344
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2837	0.0017	1.468693256531e-12	70960187	70964344	1.09231547437682e-20	77917893	77917893
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.6477	1.09231547437682e-20	77917893	77917893	3.23886316977698e-22	77928738	77928738
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	124328915	16334	15849	-0.0059	3.23886316977698e-22	77928738	77928738	8.96892609954472e-11	124328915	124328915
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-1.1795	8.96892609954472e-11	124328915	124328915	9.1347730591078e-10	124340356	124370487
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	124368725	1	0	NA	9.1347730591078e-10	124340356	124370487	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124370487	135285645	3875	3748	-0.0336	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	2113999	783	764	-0.0415	NA	NA	NA	1.30862983652963e-07	2110773	2114514
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2114514	2122855	9	8	0.6098	1.30862983652963e-07	2110773	2114514	9.03887607011652e-08	2121540	2126644
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2123410	4923300	980	950	-0.0229	9.03887607011652e-08	2121540	2126644	4.63205726920235e-282	4923300	4923300
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.7659	4.63205726920235e-282	4923300	4923300	1.76595336433718e-302	4932214	4932214
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55124730	15130	14676	-0.0057	1.76595336433718e-302	4932214	4932214	1.76469513836265e-26	55114405	55129329
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55202450	33	32	0.5588	1.76469513836265e-26	55114405	55129329	5.509981196861e-27	55200744	55209626
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55203706	55203706	1	0	NA	5.509981196861e-27	55200744	55209626	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55205278	134450318	28363	27541	-0.0049	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3646	-3e-04	NA	NA	NA	9.19822466605353e-62	9523923	9531133
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	14	1.2913	9.19822466605353e-62	9523923	9531133	9.23050581750418e-49	9604633	9610054
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10459455	325	310	-0.0092	9.23050581750418e-49	9604633	9610054	8.70075612077499e-07	10447658	10465787
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10462211	10491341	12	11	-0.502	8.70075612077499e-07	10447658	10465787	9.9881697913524e-07	10482217	10540088
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10493984	11116883	234	230	-0.0272	9.9881697913524e-07	10482217	10540088	8.06733962078383e-22	11112600	11116883
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	1.1101	8.06733962078383e-22	11112600	11116883	4.33922344226995e-19	11140421	11143592
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6633	0.0063	4.33922344226995e-19	11140421	11143592	1.48775068149866e-15	31084265	31171313
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	0.6007	1.48775068149866e-15	31084265	31171313	1.87979881028313e-15	31231952	31246624
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	33270966	764	741	0.0302	1.87979881028313e-15	31231952	31246624	5.2669426008335e-47	33270966	33270966
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-3.0553	5.2669426008335e-47	33270966	33270966	1.80939325249013e-49	33283825	33283825
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	98798412	20724	20150	0.0106	1.80939325249013e-49	33283825	33283825	1.98903771402064e-09	98798412	98798412
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98798801	98804343	2	2	-1.3737	1.98903771402064e-09	98798412	98798412	3.93629663582422e-10	98804343	98804343
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98807495	125570308	10142	9865	0.0104	3.93629663582422e-10	98804343	98804343	1.12591304574866e-38	125565039	125570308
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125576897	125633613	16	16	-0.9217	1.12591304574866e-38	125565039	125570308	4.07469877077195e-34	125633613	125634951
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125634951	130694393	1693	1644	-0.0419	4.07469877077195e-34	125633613	125634951	1.65237736268259e-07	130690343	130694393
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.1509	1.65237736268259e-07	130690343	130694393	8.03296340079663e-07	130701040	130718440
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	621	0.0029	8.03296340079663e-07	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5454	0.0027	NA	NA	NA	9.9442115131477e-09	33028007	33030946
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-1.0639	9.9442115131477e-09	33028007	33030946	9.8408566811015e-09	33042557	33046417
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	49964838	6621	6397	0.0056	9.8408566811015e-09	33042557	33046417	1.14240641084948e-20	49964838	49964838
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.9741	1.14240641084948e-20	49964838	49964838	4.76550208746389e-20	49971732	49971732
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	114123340	19423	18827	0.0035	4.76550208746389e-20	49971732	49971732	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.7108	NA	NA	NA	1.40991985367940e-82	19490630	19535787
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5516	0.0156	1.4099198536794e-82	19490630	19535787	1.16466242265290e-11	34674458	34674458
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.5225	1.1646624226529e-11	34674458	34674458	7.4267236134162e-12	34679959	34679959
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	73061942	13667	13272	0.003	7.4267236134162e-12	34679959	34679959	6.72357476078154e-75	73061942	73082262
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73072457	2	0	NA	6.72357476078154e-75	73061942	73082262	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-2.1491	NA	NA	NA	4.00627746924816e-74	73091980	73092112
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11864	-0.0106	4.00627746924816e-74	73091980	73092112	0	105597555	105597555
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.4561	0	105597555	105597555	2.05396592987125e-113	105632168	105632168
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	48	-0.0243	2.05396592987125e-113	105632168	105632168	3.42638503378326e-30	105856972	105856972
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-2.2707	3.42638503378326e-30	105856972	105856972	1.47486746809824e-29	105875924	105875924
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106218059	126	122	-0.0633	1.47486746809824e-29	105875924	105875924	6.2942469323422e-05	106193881	106221696
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	-0.4658	6.2942469323422e-05	106193881	106221696	3.38232493699996e-06	106253648	106269748
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.0963	3.38232493699996e-06	106253648	106269748	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2982	NA	NA	NA	2.38516496098786e-08	18452491	18741716
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20060061	148	141	-0.5441	2.38516496098786e-08	18452491	18741716	3.17697681015685e-94	20042683	20088256
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20065525	28370699	2255	2182	-0.0241	3.17697681015685e-94	20042683	20088256	4.2410116266442e-31	28153357	28731195
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28439781	28439781	1	0	NA	4.2410116266442e-31	28153357	28731195	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28728864	28877226	26	24	-0.7334	NA	NA	NA	8.32293487931343e-33	28860936	28910478
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28902339	74669752	19276	18749	-0.005	8.32293487931343e-33	28860936	28910478	9.95725917649054e-10	74664249	74669752
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.9957	9.95725917649054e-10	74664249	74669752	5.01620912386185e-13	74680439	74696127
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	164	-0.0141	5.01620912386185e-13	74680439	74696127	1.21520113135372e-19	75115806	75115806
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.7364	1.21520113135372e-19	75115806	75115806	4.08218111460096e-16	75119713	75119713
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100217181	9430	9174	-0.0126	4.08218111460096e-16	75119713	75119713	9.50942960577371e-06	100212174	100278665
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.6985	9.50942960577371e-06	100212174	100278665	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5292	-0.0109	NA	NA	NA	3.09103432546666e-30	14683004	14876356
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	13	-0.9476	3.09103432546666e-30	14683004	14876356	4.20190774158361e-32	15029941	15034210
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	32558526	5107	4969	0.013	4.20190774158361e-32	15029941	15034210	6.2688358628949e-35	32545350	33278944
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32809658	34054713	36	33	-0.6175	6.2688358628949e-35	32545350	33278944	8.54339672282274e-23	33841331	34059589
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	34843320	160	159	-0.0543	8.54339672282274e-23	33841331	34059589	1.77145306686434e-10	34829552	34881950
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34847326	34926382	13	13	0.5126	1.77145306686434e-10	34829552	34881950	2.05489772071199e-09	34902941	34953633
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34930597	54352394	2898	2822	-0.0122	2.05489772071199e-09	34902941	34953633	1.93967969432799e-12	54343465	54363713
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.6971	1.93967969432799e-12	54343465	54363713	1.01113192884974e-06	54376805	54379839
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.9733	1.01113192884974e-06	54376805	54379839	5.17906092007732e-11	54399890	54405667
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	57201427	1198	1167	-0.0197	5.17906092007732e-11	54399890	54405667	4.67733791429317e-08	57198691	57201427
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57203733	57203733	1	0	NA	4.67733791429317e-08	57198691	57201427	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1807	NA	NA	NA	2.72420113332708e-09	57206772	57208375
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3266	0.0157	2.72420113332708e-09	57206772	57208375	6.15020530003878e-25	68693014	68693086
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68710277	1	0	NA	6.15020530003878e-25	68693014	68693086	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-1.0028	NA	NA	NA	1.20173896891578e-23	68753209	68838384
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1401	-0.0211	1.20173896891578e-23	68753209	68838384	1.25137591484315e-08	72914152	72918129
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72963578	6	6	-0.7584	1.25137591484315e-08	72914152	72918129	1.35407243312073e-09	72963578	73025340
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72964783	72964783	1	0	NA	1.35407243312073e-09	72963578	73025340	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	731	0.0299	NA	NA	NA	5.02657811543757e-69	75093957	75093957
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.9118	5.02657811543757e-69	75093957	75093957	5.26613012308992e-70	75100865	75100865
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	594	-0.023	5.26613012308992e-70	75100865	75100865	1.50251332520842e-17	76923844	76925748
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8764	1.50251332520842e-17	76923844	76925748	2.21893212006533e-15	76940218	76942679
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	77321274	188	183	-0.0304	2.21893212006533e-15	76940218	76942679	6.05497790761524e-09	77315662	77321274
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77323143	77329504	4	4	-0.9832	6.05497790761524e-09	77315662	77321274	7.74610739621331e-09	77329504	77332220
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77332220	88690571	4321	4189	-0.0256	7.74610739621331e-09	77329504	77332220	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	403	-0.0065	NA	NA	NA	9.09785463838837e-17	1028979	1028979
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.8731	9.09785463838837e-17	1028979	1028979	3.63985028226628e-18	1030766	1030766
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	8147124	3123	3036	0.0161	3.63985028226628e-18	1030766	1030766	7.08069624226541e-10	8144634	8147124
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.4019	7.08069624226541e-10	8144634	8147124	5.52387313726282e-10	8149084	8149084
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	31471890	8499	8260	0.0041	5.52387313726282e-10	8149084	8149084	1.53245670845049e-07	31457889	31474518
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31473186	31891535	15	15	-0.4445	1.53245670845049e-07	31457889	31474518	1.81477533484057e-08	31499568	31905266
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31893451	32828797	363	353	-0.002	1.81477533484057e-08	31499568	31905266	3.83623318935528e-07	32826928	32828797
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.0916	3.83623318935528e-07	32826928	32828797	2.7460529550095e-06	32832642	32833765
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1409	0.0026	2.7460529550095e-06	32832642	32833765	1.15167331685302e-13	36672710	36678537
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.9169	1.15167331685302e-13	36672710	36678537	1.18026189038245e-13	36682031	36686013
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41564408	2031	1969	0.0132	1.18026189038245e-13	36682031	36686013	3.43601802887346e-30	41555295	41570512
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41710400	47	47	-0.4661	3.43601802887346e-30	41555295	41570512	7.51039578408124e-28	41704093	42148637
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13285	0.0107	7.51039578408124e-28	41704093	42148637	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10678	-0.0048	NA	NA	NA	1.13119540849820e-25	36509250	36509250
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.1682	1.1311954084982e-25	36509250	36509250	8.04175918088587e-25	36519728	36519728
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	76116026	11980	11663	-0.0175	8.04175918088587e-25	36519728	36519728	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	1395246	490	477	0.0139	NA	NA	NA	1.60526646341833e-08	1390151	1395246
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1405308	4	4	0.9792	1.60526646341833e-08	1390151	1395246	8.21310090644729e-09	1405308	1409386
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1409386	3591120	1041	1008	0.0155	8.21310090644729e-09	1405308	1409386	2.75042723151403e-09	3591120	3591120
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.3805	2.75042723151403e-09	3591120	3591120	6.32988279373162e-10	3593646	3593646
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	18023406	6630	6441	0.0329	6.32988279373162e-10	3593646	3593646	5.75475919112382e-08	18020062	18023406
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	18026860	18028565	2	2	1.3084	5.75475919112382e-08	18020062	18023406	3.39943343290337e-08	18028565	18030239
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	18030239	19694025	857	843	0.0202	3.39943343290337e-08	18028565	18030239	3.16838897179744e-06	19692626	19699024
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-0.9048	3.16838897179744e-06	19692626	19699024	5.28734928232674e-07	19699485	19702214
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	20399700	186	181	0.0104	5.28734928232674e-07	19699485	19702214	4.55474438515349e-26	20386500	20420327
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20493401	15	15	-0.8175	4.55474438515349e-26	20386500	20420327	1.61749931588659e-26	20474417	20507235
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	40540618	3462	3364	0.0053	1.61749931588659e-26	20474417	20507235	3.77672638077434e-196	40540618	40540618
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-4.9271	3.77672638077434e-196	40540618	40540618	4.15584952657246e-194	40553315	40553315
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	51313257	4604	4472	0.0241	4.15584952657246e-194	40553315	40553315	1.17305299892458e-08	51311413	51313257
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51316654	51319006	3	3	-1.057	1.17305299892458e-08	51311413	51313257	5.72996721952103e-09	51319006	51320617
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51320617	56823430	2570	2492	0.0359	5.72996721952103e-09	51319006	51320617	0	56823430	56823430
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-4.2868	0	56823430	56823430	0	56840346	56840346
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1138	0.0218	0	56840346	56840346	2.44472731175915e-14	59412581	59414898
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7385	2.44472731175915e-14	59412581	59414898	4.42885995592378e-14	59434202	59440274
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1946	0.0107	4.42885995592378e-14	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	567	-0.046	NA	NA	NA	4.53872943819457e-181	1506379	1511632
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	-2.9726	4.53872943819457e-181	1506379	1511632	2.41677117935799e-214	1531162	1532433
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	26145205	8437	8194	-0.0092	2.41677117935799e-214	1531162	1532433	2.79780157451762e-12	26142400	26147112
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26147112	26161111	11	10	-0.6948	2.79780157451762e-12	26142400	26147112	7.9168228294362e-12	26158310	26170594
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	62419534	12535	12171	-0.0111	7.9168228294362e-12	26158310	26170594	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10101956	14	13	0.0565	NA	NA	NA	0.00194704708799247	10004854	10136303
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10115958	10152384	5	5	-0.5685	0.00194704708799247	10004854	10136303	0.00951538785068175	10136303	13676572
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	13876293	35	30	-0.1416	0.00951538785068175	10136303	13676572	0.000454374480478025	13817761	13893162
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13877546	14092232	12	11	-0.545	0.000454374480478025	13817761	13893162	3.13867470223627e-09	13956118	14294338
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14125179	22573420	2997	2928	0.0136	3.13867470223627e-09	13956118	14294338	8.38621721221962e-271	22573420	22573420
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-5.7429	8.38621721221962e-271	22573420	22573420	1.92713875234662e-272	22585040	22585040
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	35947800	5035	4902	0.0031	1.92713875234662e-272	22585040	22585040	2.38953079213115e-09	35947800	35947800
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	35951125	35954025	2	2	-1.3429	2.38953079213115e-09	35947800	35947800	1.22747889586920e-08	35954025	35954025
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	35956712	46922972	5338	5187	-0.0132	1.2274788958692e-08	35954025	35954025	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16997040	718	700	0.0087	NA	NA	NA	7.00879291226646e-07	16995963	16997040
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16998110	17001076	3	3	0.9745	7.00879291226646e-07	16995963	16997040	2.99597709123074e-07	17001076	17006871
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17006871	35472378	8831	8553	-0.015	2.99597709123074e-07	17001076	17006871	9.17186797136036e-67	35472378	35472378
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.5443	9.17186797136036e-67	35472378	35472378	8.66957502340918e-70	35476942	35476942
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1175	0.0066	8.66957502340918e-70	35476942	35476942	0	37685496	37685496
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-4.5601	0	37685496	37685496	0	37715385	37715385
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5606	-0.0178	0	37715385	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127779	31	30	-0.231	NA	NA	NA	8.80860102578583e-05	122273	127779
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	-1.6323	8.80860102578583e-05	122273	127779	2.27033516456232e-20	130528	130528
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	767373	477	463	-0.0235	2.27033516456232e-20	130528	130528	2.08270799603416e-07	747837	771824
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	767408	800669	24	23	-0.3836	2.08270799603416e-07	747837	771824	1.43511888241917e-07	793712	814363
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800956	1431411	254	247	-0.0119	1.43511888241917e-07	793712	814363	2.18455794784744e-22	1431411	1431411
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-2.1048	2.18455794784744e-22	1431411	1431411	5.56480625430285e-28	1432953	1432953
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	63	-0.0449	5.56480625430285e-28	1432953	1432953	7.94308481532552e-10	1528179	1528282
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.9137	7.94308481532552e-10	1528179	1528282	5.32328484894621e-08	1530474	1533361
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2708291	935	913	-0.0255	5.32328484894621e-08	1530474	1533361	0	2708113	2711273
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43816	1.0106	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0462	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-4.1287	NA	NA	NA	5.0813508535521e-20	3034907	3223585
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	4846477	13	12	-0.9917	5.0813508535521e-20	3034907	3223585	3.01685525204701e-12	4597974	5593746
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4948824	7057026	180	174	-3.7973	3.01685525204701e-12	4597974	5593746	4.87383369267129e-09	7022973	7197846
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	125	-2.7295	4.87383369267129e-09	7022973	7197846	4.65783800171869e-07	7386947	7598374
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	74	-3.9119	4.65783800171869e-07	7386947	7598374	8.4150843253964e-05	7703962	7731490
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-2.5911	8.4150843253964e-05	7703962	7731490	1.47523034031481e-05	7774773	7821580
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	414	-3.9366	1.47523034031481e-05	7774773	7821580	3.15146933709388e-29	10503821	10620136
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12682301	85	81	-2.3079	3.15146933709388e-29	10503821	10620136	3.06835791714567e-06	12627412	12696242
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12809152	20	19	-4.269	3.06835791714567e-06	12627412	12696242	9.94327558889235e-07	12796639	12852769
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12820920	13128515	115	113	-2.5376	9.94327558889235e-07	12796639	12852769	0.0101921515425794	13014163	13159901
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	46	-3.3193	0.0101921515425794	13014163	13159901	2.22254097219876e-06	13169265	13311009
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13580493	152	148	-4.1057	2.22254097219876e-06	13169265	13311009	9.86109125719785e-07	13563756	13597813
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13584982	13716000	22	21	-3.086	9.86109125719785e-07	13563756	13597813	3.58153859866625e-07	13692518	13760710
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14358464	196	194	-4.2207	3.58153859866625e-07	13692518	13760710	3.24307354578673e-12	14340202	14388689
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14506319	88	81	-3.2172	3.24307354578673e-12	14340202	14388689	1.54539348681889e-07	14496442	14530328
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508021	14508894	2	0	NA	1.54539348681889e-07	14496442	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.434	NA	NA	NA	3.83005075244672e-17	14566592	14587291
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15139441	113	109	-3.8776	3.83005075244672e-17	14566592	14587291	0.000581347221914769	15112995	15139441
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15149506	7	7	-1.9035	0.000581347221914769	15112995	15139441	0.00203092352060105	15148367	15165820
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15152354	15497443	200	190	-3.6769	0.00203092352060105	15148367	15165820	2.84697210542401e-05	15465845	15521958
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15499052	15546378	21	21	-2.3455	2.84697210542401e-05	15465845	15521958	2.78248685182664e-05	15532597	15560912
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15956978	88	85	-3.7768	2.78248685182664e-05	15532597	15560912	0.000122873586991182	15928904	15956978
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15958396	15977755	8	8	-1.8117	0.000122873586991182	15928904	15956978	4.02141835449882e-05	15977755	15986595
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15979526	16377188	140	136	-3.639	4.02141835449882e-05	15977755	15986595	0.0025913510815184	16357759	16377188
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16380639	16387273	2	2	-0.7241	0.0025913510815184	16357759	16377188	0.000383571228794125	16387273	16404836
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	21036503	671	647	-3.9836	0.000383571228794125	16387273	16404836	3.02035474953174e-08	21035621	21042490
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.358	3.02035474953174e-08	21035621	21042490	1.10963111112652e-07	21047798	21059229
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22178964	271	264	-3.9692	1.10963111112652e-07	21047798	21059229	1.59637953513839e-05	22028255	22210081
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22836305	57	56	-4.7355	1.59637953513839e-05	22028255	22210081	0.000382502156578522	22770920	22866553
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22843728	22930737	35	32	-3.9537	0.000382502156578522	22770920	22866553	1.45788897873660e-40	22930737	23283689
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.2266	1.4578889787366e-40	22930737	23283689	8.28585906486688e-05	26933862	26998633
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.6197	8.28585906486688e-05	26933862	26998633	2.72899429292327e-07	27009433	27039222
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.619	2.72899429292327e-07	27009433	27039222	3.53659994894776e-07	27137064	27163598
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-2.9082	3.53659994894776e-07	27137064	27163598	2.71883807383781e-09	27172283	27176933
MSK_252152912707_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.4096	2.71883807383781e-09	27172283	27176933	NA	NA	NA
