Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16698906	5780	5704	0.0242	NA	NA	NA	5.09622710621684e-07	16652095	16836160
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	17104345	21	21	-0.4119	5.09622710621684e-07	16652095	16836160	8.87689290547563e-08	16963812	17127039
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17107476	22785963	2356	2321	0.017	8.87689290547563e-08	16963812	17127039	8.72832519498069e-08	22785963	22785963
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	22787161	22788440	2	2	-1.3648	8.72832519498069e-08	22785963	22785963	4.01265922411283e-07	22788440	22788440
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	22791693	34869589	4735	4681	0.015	4.01265922411283e-07	22788440	22788440	3.98131574672923e-165	34869589	34869589
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34881595	3	3	-5.1973	3.98131574672923e-165	34869589	34869589	8.2259019307231e-182	34881595	34881595
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34883375	72537426	14997	14818	0.0024	8.2259019307231e-182	34881595	34881595	2.66734010422232e-10	72533804	72539143
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	13	0.6191	2.66734010422232e-10	72533804	72539143	2.59587693620688e-11	72571158	72610316
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	2.59587693620688e-11	72571158	72610316	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110014625	11701	11563	-0.0012	NA	NA	NA	2.97243388305058e-14	110011494	110014625
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-1.0189	2.97243388305058e-14	110011494	110014625	1.24295676640340e-13	110041712	110058441
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147313991	4559	4502	-0.0168	1.2429567664034e-13	110041712	110058441	6.43318305807939e-19	146297175	147346399
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	147510532	32	32	0.4936	6.43318305807939e-19	146297175	147346399	4.47852124144237e-16	147475854	148084402
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150839754	1262	1248	0.0032	4.47852124144237e-16	147475854	148084402	2.91282793653779e-12	150839754	150839754
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	2	-1.6956	2.91282793653779e-12	150839754	150839754	7.15331814023227e-12	150846148	150846148
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	7.15331814023227e-12	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	79	-0.0357	NA	NA	NA	2.09737507654434e-110	151026228	151026228
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.2367	2.09737507654434e-110	151026228	151026228	4.14459083095064e-162	151036435	151036435
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2644	0.0083	4.14459083095064e-162	151036435	151036435	1.0053818516366e-30	157133150	157133150
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.6252	1.0053818516366e-30	157133150	157133150	9.96866410477776e-31	157136342	157136342
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	246755298	32784	32377	-0.0035	9.96866410477776e-31	157136342	157136342	1.96686370398504e-15	246738832	246794552
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246769018	246878405	32	32	-0.4768	1.96686370398504e-15	246738832	246794552	2.71375116691568e-14	246863179	246906110
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246882156	247186514	94	94	0.0317	2.71375116691568e-14	246863179	246906110	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	24452394	7082	6998	-0.0061	NA	NA	NA	1.23951976310820e-10	24448885	24452394
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24471101	6	6	-0.9083	1.2395197631082e-10	24448885	24452394	3.88864868543303e-10	24471101	24488467
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24475416	30469072	2705	2668	0.005	3.88864868543303e-10	24471101	24488467	6.21368966997178e-07	30459148	30469072
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	30473673	30479402	2	2	1.326	6.21368966997178e-07	30459148	30469072	1.54091376020237e-07	30479402	30483157
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	30483157	35821494	2229	2204	0.0057	1.54091376020237e-07	30479402	30483157	1.54900383263342e-12	35821494	35821494
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.6886	1.54900383263342e-12	35821494	35821494	5.07500174944905e-13	35844884	35844884
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	874	-0.0242	5.07500174944905e-13	35844884	35844884	2.15496575482530e-25	37800512	37815049
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37858379	23	22	-0.7525	2.1549657548253e-25	37800512	37815049	1.45611012222696e-28	37854350	37859985
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	52600588	5800	5716	-0.004	1.45611012222696e-28	37854350	37859985	1.77400803548301e-210	52600588	52600588
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-4.2183	1.77400803548301e-210	52600588	52600588	1.16875403885639e-216	52635695	52635695
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4490	-0.0064	1.16875403885639e-216	52635695	52635695	1.53332687590413e-99	66357387	66357387
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-4.5149	1.53332687590413e-99	66357387	66357387	4.86027701773776e-92	66360747	66360747
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	242689978	54531	53783	-0.0028	4.86027701773776e-92	66360747	66360747	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	21210959	7469	7360	-0.0043	NA	NA	NA	6.84006242572337e-16	21203157	21224805
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	21224805	21326830	10	10	-0.858	6.84006242572337e-16	21203157	21224805	1.12105649897248e-16	21310801	21339836
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	21332584	32074432	3317	3265	-0.0187	1.12105649897248e-16	21310801	21339836	2.58619103927872e-30	32074432	32074432
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.4907	2.58619103927872e-30	32074432	32074432	9.4245213550678e-27	32080848	32080848
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5343	0.004	9.4245213550678e-27	32080848	32080848	4.23109193715939e-84	47460892	47460892
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.3671	4.23109193715939e-84	47460892	47460892	1.39046629225336e-87	47466921	47466921
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75479859	10656	10520	0.0027	1.39046629225336e-87	47466921	47466921	1.17134231622005e-12	75464737	75784655
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75874255	17	16	-0.5997	1.17134231622005e-12	75464737	75784655	2.6349340726694e-12	75868882	76019295
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75875904	75875904	1	0	NA	2.6349340726694e-12	75868882	76019295	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	133189686	16815	16594	-0.0065	NA	NA	NA	3.24299113762265e-10	133189686	133189686
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-1.5452	3.24299113762265e-10	133189686	133189686	7.73711767951213e-11	133194685	133194685
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	143333168	3511	3466	-0.005	7.73711767951213e-11	133194685	133194685	6.3349714916389e-08	143330849	143333168
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143336453	143336879	2	2	-1.3309	6.3349714916389e-08	143330849	143333168	1.22673025566146e-07	143336879	143336879
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143343375	164038917	6274	6201	-0.0067	1.22673025566146e-07	143336879	143336879	1.17688178308811e-15	164019640	164048489
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164042397	164107951	18	18	0.6136	1.17688178308811e-15	164019640	164048489	1.75082802618231e-15	164101776	164121847
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8991	-0.0077	1.75082802618231e-15	164101776	164121847	4.0162750842427e-142	191219222	191219222
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-5.534	4.0162750842427e-142	191219222	191219222	4.1649451549071e-158	191222891	191222891
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	192546280	424	419	-0.0079	4.1649451549071e-158	191222891	191222891	7.54045006516837e-174	192546280	192546280
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-4.3048	7.54045006516837e-174	192546280	192546280	2.00111401487245e-166	192552734	192552734
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	199329592	2564	2527	-4e-04	2.00111401487245e-166	192552734	192552734	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3352	0.0171	NA	NA	NA	5.66600637839491e-175	9815760	9815760
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.7702	5.66600637839491e-175	9815760	9815760	8.59911149963426e-218	9842644	9842644
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	173224400	46243	45609	-0.0028	8.59911149963426e-218	9842644	9842644	7.91507490291452e-42	173224400	173224400
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.9862	7.91507490291452e-42	173224400	173224400	1.76997445773486e-46	173228860	173228860
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	193	0.0273	1.76997445773486e-46	173228860	173228860	1.31724564427802e-12	173660684	173660684
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.6045	1.31724564427802e-12	173660684	173660684	1.26176973574903e-11	173666072	173666072
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	4029	6e-04	1.26176973574903e-11	173666072	173666072	4.03304801143309e-77	187330240	187330240
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.043	4.03304801143309e-77	187330240	187330240	1.32625080704931e-73	187333619	187333619
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190710812	1131	1121	-0.0097	1.32625080704931e-73	187333619	187333619	2.75091071282278e-18	190664041	190749363
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190924564	66	65	-0.3728	2.75091071282278e-18	190664041	190749363	4.57352067457659e-12	190907865	190940021
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191037553	36	36	0.0371	4.57352067457659e-12	190907865	190940021	0.000102103761816540	191024476	191116001
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191041481	191153613	8	8	-0.4518	0.00010210376181654	191024476	191116001	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	53040	-0.0051	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10459	-0.001	NA	NA	NA	1.03718594384973e-08	29930018	29966336
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-0.5253	1.03718594384973e-08	29930018	29966336	1.57617899114850e-08	30004636	30031367
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32558677	1075	1057	0.0092	1.5761789911485e-08	30004636	30031367	3.08227292535415e-99	32558677	32564884
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.425	3.08227292535415e-99	32558677	32564884	0.0439163199670729	32588005	32613538
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	8	-0.7884	0.0439163199670729	32588005	32613538	2.52858028119942e-10	32609525	32634977
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	49022360	6534	6434	0.0045	2.52858028119942e-10	32609525	32634977	7.02869976295959e-32	49022360	49022360
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49027493	49027493	1	0	NA	7.02869976295959e-32	49022360	49022360	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49039318	49045025	2	2	-2.7194	NA	NA	NA	3.37705202220787e-31	49045025	49045025
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49049568	54035000	1758	1733	-0.0117	3.37705202220787e-31	49045025	49045025	1.62689440554703e-12	54033505	54035000
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.3794	1.62689440554703e-12	54033505	54035000	1.05448356217033e-12	54042734	54042734
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	170753106	36125	35583	-0.0065	1.05448356217033e-12	54042734	54042734	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	109217320	34961	34514	0	NA	NA	NA	4.58652699571983e-115	109217320	109217320
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109231462	2	2	-5.0512	4.58652699571983e-115	109217320	109217320	1.44817098438542e-118	109231462	109231462
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109233214	118611324	4302	4241	-0.0042	1.44817098438542e-118	109231462	109231462	3.63379300285146e-10	118609124	118611324
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.2357	3.63379300285146e-10	118609124	118611324	1.38535774907249e-10	118620875	118622742
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3126	4e-04	1.38535774907249e-10	118620875	118622742	2.40341832355121e-13	125829681	125831554
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3816	2.40341832355121e-13	125829681	125831554	2.76104791436771e-12	125837524	125839386
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141409512	7361	7261	-4e-04	2.76104791436771e-12	125837524	125839386	3.86935304075896e-08	141405145	141413352
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141429405	9	9	0.6576	3.86935304075896e-08	141405145	141413352	1.60523669673884e-06	141425306	141435643
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141431668	141690753	122	121	0.0048	1.60523669673884e-06	141425306	141435643	2.39209202928275e-129	141690753	141690753
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-3.6141	2.39209202928275e-129	141690753	141690753	6.70274233338418e-239	141714168	141714168
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2484	0.012	6.70274233338418e-239	141714168	141714168	3.05266919185717e-13	147702365	147702365
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.8082	3.05266919185717e-13	147702365	147702365	2.55930925925099e-13	147707161	147707161
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	149182041	641	632	0.0058	2.55930925925099e-13	147707161	147707161	4.0062965682569e-10	149176475	149191205
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149183338	149215630	19	18	0.541	4.0062965682569e-10	149176475	149191205	1.27439504276059e-10	149205869	149243561
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149234006	153144321	1252	1241	0.0034	1.27439504276059e-10	149205869	149243561	8.24028036216012e-31	153078212	153203532
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	153158956	153384849	77	77	0.4572	8.24028036216012e-31	153078212	153203532	1.03472839078995e-30	153352424	153453380
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	153392480	158821263	2249	2218	-0.0054	1.03472839078995e-30	153352424	153453380	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	119	-0.0529	NA	NA	NA	2.31811506005626e-48	581533	581533
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.7767	2.31811506005626e-48	581533	581533	2.90711260576558e-63	588865	588865
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	40892587	13453	13261	-0.0023	2.90711260576558e-63	588865	588865	2.24343820988478e-88	40892587	40892587
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.4553	2.24343820988478e-88	40892587	40892587	5.87085295367006e-92	40897469	40897469
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30593	-0.0019	5.87085295367006e-92	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7902	-6e-04	NA	NA	NA	8.53778910938357e-103	23343915	23343915
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.7719	8.53778910938357e-103	23343915	23343915	3.17420702797873e-101	23365926	23365926
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	43445839	4729	4667	0.0055	3.17420702797873e-101	23365926	23365926	7.07008626329846e-17	39091349	43530076
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43530076	68483889	22	22	-0.5732	7.07008626329846e-17	39091349	43530076	5.82457169500165e-17	67927172	70207320
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70174301	70926188	318	316	-0.0151	5.82457169500165e-17	67927172	70207320	7.13584375390473e-56	70926188	70926188
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.2457	7.13584375390473e-56	70926188	70926188	5.52806797316614e-46	70930528	70930528
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	5.52806797316614e-46	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	137352394	23764	23449	-0.0022	NA	NA	NA	2.31385752686579e-08	137352394	137352394
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.4424	2.31385752686579e-08	137352394	137352394	1.25857293720805e-06	137356880	137359947
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1085	0.0117	1.25857293720805e-06	137356880	137359947	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4620	-0.0042	NA	NA	NA	2.79906800338467e-07	13553503	13553503
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.3129	2.79906800338467e-07	13553503	13553503	4.75264730521998e-07	13556315	13557998
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	46389734	9776	9646	-0.0109	4.75264730521998e-07	13556315	13557998	2.33559198971794e-19	45468679	46406159
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46391653	47060942	75	75	-0.3539	2.33559198971794e-19	45468679	46406159	5.70059915857487e-21	46558272	47080155
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47063200	77917893	10057	9919	-0.0024	5.70059915857487e-21	46558272	47080155	9.61793018107084e-44	77917893	77917893
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.5103	9.61793018107084e-44	77917893	77917893	1.23401828942891e-41	77928738	77928738
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19938	-0.0019	1.23401828942891e-41	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1752	0.0213	NA	NA	NA	1.55138817995607e-160	4923300	4923300
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.1406	1.55138817995607e-160	4923300	4923300	1.95249325137299e-193	4932214	4932214
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	134450318	43527	42900	0.0022	1.95249325137299e-193	4932214	4932214	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	292	0.054	NA	NA	NA	2.39896691341192e-06	734832	736988
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	741193	3	3	-0.9935	2.39896691341192e-06	734832	736988	1.76093285417999e-06	741193	743223
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	743223	2106791	620	609	0.0266	1.76093285417999e-06	741193	743223	2.24902549891578e-07	2099450	2109441
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2109441	2127537	8	8	-0.6407	2.24902549891578e-07	2099450	2109441	3.27546663550714e-06	2123764	2135894
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	2128807	1	0	NA	3.27546663550714e-06	2123764	2135894	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2130138	9523923	2814	2771	-0.0068	NA	NA	NA	9.8091239258521e-33	9516067	9528590
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.1026	9.8091239258521e-33	9516067	9528590	5.74475405914485e-35	9590351	9604633
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	69138621	19918	19649	0.0012	5.74475405914485e-35	9590351	9604633	3.51126926611422e-130	69138621	69138621
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-5.3654	3.51126926611422e-130	69138621	69138621	2.19771560609755e-134	69164231	69164231
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	100624427	9760	9635	-0.005	2.19771560609755e-134	69164231	69164231	1.11190483197978e-76	100624427	100624427
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-3.3207	1.11190483197978e-76	100624427	100624427	2.99524601937425e-73	100629832	100629832
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	132289090	11723	11558	0.0126	2.99524601937425e-73	100629832	100629832	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7264	-0.0076	NA	NA	NA	1.53203508508111e-37	37953582	37953582
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9026	1.53203508508111e-37	37953582	37953582	1.25575534245071e-39	37957844	37957844
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6586	-0.004	1.25575534245071e-39	37957844	37957844	6.04294611209777e-16	56610886	56657371
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	12	-0.7667	6.04294611209777e-16	56610886	56657371	4.93039941181187e-16	56680346	56686863
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	71375082	3624	3579	-0.0019	4.93039941181187e-16	56680346	56686863	3.41559007176541e-84	71375082	71375082
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2252	3.41559007176541e-84	71375082	71375082	2.97336797479023e-83	71377671	71377671
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	100690991	9415	9261	-0.0064	2.97336797479023e-83	71377671	71377671	6.93913157657892e-24	100690991	100690991
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.2964	6.93913157657892e-24	100690991	100690991	2.19079055196101e-22	100693892	100693892
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4491	-0.0078	2.19079055196101e-22	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19442895	38	35	-0.4416	NA	NA	NA	1.88471775006691e-15	19417432	19457688
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19446048	19446048	1	0	NA	1.88471775006691e-15	19417432	19457688	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19448755	34674458	5711	5620	0.011	NA	NA	NA	8.90708933144625e-10	34666996	34674458
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1869	8.90708933144625e-10	34666996	34674458	3.80077578531457e-09	34683810	34685308
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	73075500	13669	13471	-0.0044	3.80077578531457e-09	34683810	34685308	1.10176118564919e-82	73075500	73082262
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	-2.6832	1.10176118564919e-82	73075500	73082262	2.92333094891224e-76	73092018	73092112
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	106358491	12458	12295	-7e-04	2.92333094891224e-76	73092018	73092112	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18848213	19	18	-0.1693	NA	NA	NA	2.34046538073078e-10	18824622	18857376
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	20088256	137	136	-0.7612	2.34046538073078e-10	18824622	18857376	1.24821713427925e-160	20065525	20310916
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32517839	3673	3625	-0.007	1.24821713427925e-160	20065525	20310916	5.70088182258327e-19	32454294	32525865
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32520164	32594200	23	23	-0.6377	5.70088182258327e-19	32454294	32525865	6.01202603548687e-20	32580871	32667508
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	74669752	17859	17647	-7e-04	6.01202603548687e-20	32580871	32667508	3.23152766887271e-13	74665386	74669752
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.255	3.23152766887271e-13	74665386	74669752	2.50268529901789e-13	74680439	74696127
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9469	-0.0038	2.50268529901789e-13	74680439	74696127	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	20214	0.0037	NA	NA	NA	1.27220061381525e-08	75092501	75093957
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.2237	1.27220061381525e-08	75092501	75093957	1.66797888262687e-10	75100865	75102639
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	604	-0.0155	1.66797888262687e-10	75100865	75102639	1.05465343392712e-23	76923844	76929598
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.1228	1.05465343392712e-23	76923844	76929598	3.58575054118773e-20	76938723	76942679
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4448	0.0084	3.58575054118773e-20	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13700	0.0122	NA	NA	NA	4.02679241983249e-15	36672710	36675987
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.1455	4.02679241983249e-15	36672710	36675987	4.84645814588078e-15	36683509	36686013
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1980	0.0361	4.84645814588078e-15	36683509	36686013	7.88039713900059e-32	41515622	41521544
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	20	0.9137	7.88039713900059e-32	41515622	41521544	1.01074021581932e-10	41558893	41568539
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41647135	38	38	0.3929	1.01074021581932e-10	41558893	41568539	5.3127505165336e-11	41635536	42142363
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	78653545	13688	13498	0.0106	5.3127505165336e-11	41635536	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22674	-0.0085	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	59414898	21055	20758	0.0195	NA	NA	NA	3.57591008631888e-58	59414898	59414898
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-1.74	3.57591008631888e-58	59414898	59414898	2.29324024370998e-59	59434202	59434202
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1963	0.0081	2.29324024370998e-59	59434202	59434202	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	583	-0.027	NA	NA	NA	5.44851746412108e-86	1516966	1518825
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.7414	5.44851746412108e-86	1516966	1518825	4.20984627068918e-97	1528899	1531162
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20670	0.0024	4.20984627068918e-97	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13268	-0.005	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22679305	2985	2949	0.0193	NA	NA	NA	8.50915415620169e-08	22618049	22701123
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22682428	22720195	18	18	0.512	8.50915415620169e-08	22618049	22701123	3.34655159406612e-08	22710302	22739574
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	49571068	13554	13382	0.0112	3.34655159406612e-08	22710302	22739574	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127779	31	31	-0.0721	NA	NA	NA	0.00258564602431392	117763	129104
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	132721	5	5	-0.9767	0.00258564602431392	117763	129104	7.80325734262308e-07	132689	134946
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	133501	771824	479	476	-0.0733	7.80325734262308e-07	132689	134946	1.14225904125423e-06	752447	775073
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	772351	797536	19	19	-0.5361	1.14225904125423e-06	752447	775073	3.48636814686001e-07	788996	811913
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800669	1431411	255	251	-0.0508	3.48636814686001e-07	788996	811913	1.58624895606623e-12	1431411	1431411
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.9613	1.58624895606623e-12	1431411	1431411	4.72257917094729e-13	1432953	1432953
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2303192	610	603	-0.0528	4.72257917094729e-13	1432953	1432953	1.38903619421635e-42	2303192	2303192
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.8398	1.38903619421635e-42	2303192	2303192	5.10208584305385e-46	2304398	2304398
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	380	-0.0879	5.10208584305385e-46	2304398	2304398	0	2708113	2711273
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22610	1.0425	0	2708113	2711273	8.23653105819392e-19	76998610	76998610
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.2627	8.23653105819392e-19	76998610	76998610	7.66257998169196e-19	77010018	77010018
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	153332114	21778	21480	1.0512	7.66257998169196e-19	77010018	77010018	1.06149469425636e-09	153329988	153340901
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153333629	153344718	6	6	0.1147	1.06149469425636e-09	153329988	153340901	2.31177187687378e-09	153340901	153348763
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153348763	154582414	409	397	1.0503	2.31177187687378e-09	153340901	153348763	3.37560330097038e-311	154578922	154586690
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	-0.0799	3.37560330097038e-311	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2834262	56	54	-3.3462	NA	NA	NA	7.36480623603914e-05	2782280	2864334
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2836573	3733715	68	67	-4.1302	7.36480623603914e-05	2782280	2864334	4.66806175277683e-38	3733715	3772482
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0322	4.66806175277683e-38	3733715	3772482	3.00442322248883e-14	5422507	6688691
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	175	-3.5475	3.00442322248883e-14	5422507	6688691	2.79010742108452e-06	7016814	7224954
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	126	-2.7064	2.79010742108452e-06	7016814	7224954	0.00029786278902738	7313003	7614571
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	74	-3.5773	0.00029786278902738	7313003	7614571	1.16361111488842e-05	7712882	7731490
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	18	-2.274	1.16361111488842e-05	7712882	7731490	0.000540468107958737	7758635	7821580
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-3.4329	0.000540468107958737	7758635	7821580	5.62598553486321e-05	7895945	7905286
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.5805	5.62598553486321e-05	7895945	7905286	1.57237318999419e-06	7914104	7919636
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	382	-3.6297	1.57237318999419e-06	7914104	7919636	3.83968189832625e-23	10513747	10515697
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.7972	3.83968189832625e-23	10513747	10515697	0.000443063192708045	10631941	12530596
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13128515	207	203	-2.579	0.000443063192708045	10631941	12530596	2.64791882598718e-28	13080405	13148290
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14508894	506	498	-3.6499	2.64791882598718e-28	13080405	13148290	1.00765877426239e-18	14503185	14536962
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.6904	1.00765877426239e-18	14503185	14536962	8.01031568229148e-11	14557473	14596156
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15139441	113	113	-3.5344	8.01031568229148e-11	14557473	14596156	0.00500687439710265	14941202	15191780
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15274383	72	72	-2.9043	0.00500687439710265	14941202	15191780	2.43798087167705e-11	15252823	15278175
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15275313	15408015	88	88	-3.9561	2.43798087167705e-11	15252823	15278175	0.000114452269089884	15396500	15473709
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15687088	107	107	-3.2642	0.000114452269089884	15396500	15473709	0.000546585335593311	15558235	15713288
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15937162	41	40	-4.1389	0.000546585335593311	15558235	15713288	5.82051335428469e-17	15932535	15945921
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15943877	15953710	6	6	-1.4609	5.82051335428469e-17	15932535	15945921	0.00188234100955041	15947948	15970911
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15955821	16040789	37	36	-3.1741	0.00188234100955041	15947948	15970911	0.00129709912221584	16036892	16040789
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16042014	16042966	2	2	-0.3641	0.00129709912221584	16036892	16040789	0.000103885451546275	16042966	16059723
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	22930737	1153	1126	-3.7399	0.000103885451546275	16042966	16059723	1.02805962287169e-50	22924754	23283689
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0533	1.02805962287169e-50	22924754	23283689	2.95869881524998e-07	26943701	26980386
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27000085	11	11	-2.9408	2.95869881524998e-07	26943701	26980386	3.61281587667499e-06	26984336	27007874
MSK_252152912715_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27003308	57440809	42	40	-1.0734	3.61281587667499e-06	26984336	27007874	NA	NA	NA
