Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26814	0.0086	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.3762	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	16867	-0.0042	0	72579311	72579311	1.47545089985262e-124	150819879	150819879
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	9	2.5584	1.47545089985262e-124	150819879	150819879	5.1435543740231e-120	150851439	150851439
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2671	0.0073	5.1435543740231e-120	150851439	150851439	5.11738370116959e-09	157133150	157133150
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.5202	5.11738370116959e-09	157133150	157133150	8.55934531116697e-10	157136342	157138568
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1566	-0.0109	8.55934531116697e-10	157136342	157138568	1.40976864805896e-07	161099582	161099582
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.3659	1.40976864805896e-07	161099582	161099582	3.96214275257136e-07	161104791	161104791
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2395	-0.0185	3.96214275257136e-07	161104791	161104791	4.14777381427555e-274	167483267	167483267
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.0919	4.14777381427555e-274	167483267	167483267	3.08988234470123e-275	167507898	167507898
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200598243	11347	10911	-0.0043	3.08988234470123e-275	167507898	167507898	6.03488493261688e-08	200567550	200633348
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200787319	38	38	-0.3375	6.03488493261688e-08	200567550	200633348	2.4159226209749e-09	200668993	200816497
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16781	-0.0021	2.4159226209749e-09	200668993	200816497	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34113644	11336	10894	0.002	NA	NA	NA	2.49895012045764e-10	34103771	34122572
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34115283	34138666	11	11	-0.6869	2.49895012045764e-10	34103771	34122572	9.4801956375482e-10	34128646	34144302
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34140288	242689978	66480	63893	-0.0041	9.4801956375482e-10	34128646	34144302	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10380	-0.0029	NA	NA	NA	7.69436356945014e-25	32074432	32074432
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.4275	7.69436356945014e-25	32074432	32074432	1.46003841265810e-24	32080848	32080848
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	75798154	16083	15447	-4e-04	1.4600384126581e-24	32080848	32080848	7.15957317377111e-17	75787094	75799026
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75799026	75875904	13	13	-0.7957	7.15957317377111e-17	75787094	75799026	1.49275460147405e-14	75874255	76006248
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	77558754	653	634	-0.033	1.49275460147405e-14	75874255	76006248	1.78252442886705e-09	77554912	77561208
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77559871	77571080	8	8	-0.8223	1.78252442886705e-09	77554912	77561208	3.37710238040202e-11	77567497	77574650
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77573039	89475107	3086	2971	-8e-04	3.37710238040202e-11	77567497	77574650	1.78594043044459e-16	89471984	89475107
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89502757	14	13	-0.7773	1.78594043044459e-16	89471984	89475107	7.27951300497145e-16	89502757	89505257
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89504141	99891210	1528	1477	0.0022	7.27951300497145e-16	89502757	89505257	6.22148874512509e-101	99891210	99891210
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.9162	6.22148874512509e-101	99891210	99891210	1.68541439850277e-100	99897201	99897201
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11085	-0.0071	1.68541439850277e-100	99897201	99897201	1.23105393326453e-11	133189686	133189686
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.7105	1.23105393326453e-11	133189686	133189686	7.07926912036766e-12	133194685	133194685
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	7.07926912036766e-12	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9428	-0.0034	NA	NA	NA	7.92821832922784e-64	164005577	164005577
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.7407	7.92821832922784e-64	164005577	164005577	6.925048286262e-63	164027724	164027724
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11673	-0.0061	6.925048286262e-63	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3270	0.0197	NA	NA	NA	4.6826638664503e-120	9815760	9815760
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.8624	4.6826638664503e-120	9815760	9815760	2.47679732367876e-129	9842644	9842644
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14453	-0.0084	2.47679732367876e-129	9842644	9842644	2.15790826790491e-165	68905670	68905670
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69120776	8	8	-3.09	2.15790826790491e-165	68905670	68905670	2.28606166250566e-12	69099817	69120776
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69139037	69165814	6	6	-5.1278	2.28606166250566e-12	69099817	69120776	0	69165814	69165814
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173224400	31193	30055	-0.0036	0	69165814	69165814	1.05814534133274e-28	173224400	173224400
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.6307	1.05814534133274e-28	173224400	173224400	7.04229482229391e-36	173228860	173228860
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	185	0.0162	7.04229482229391e-36	173228860	173228860	2.7441672693091e-29	173660684	173660684
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.3619	2.7441672693091e-29	173660684	173660684	6.40452435534728e-24	173666072	173666072
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	173672958	1	0	NA	6.40452435534728e-24	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173674198	186676034	3772	3621	-4e-04	NA	NA	NA	1.40436890055243e-10	186676034	186676034
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-1.594	1.40436890055243e-10	186676034	186676034	2.4119072204233e-09	186680176	186680176
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	297	-0.0263	2.4119072204233e-09	186680176	186680176	2.63895940854762e-57	187330240	187330240
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.883	2.63895940854762e-57	187330240	187330240	3.30121998504232e-59	187333619	187333619
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1182	-0.0242	3.30121998504232e-59	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3816	0.004	NA	NA	NA	2.08881749323187e-07	12853151	12857302
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.3377	2.08881749323187e-07	12853151	12857302	2.38368273480322e-07	12873052	13263185
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	21480789	2375	2279	-0.0165	2.38368273480322e-07	12873052	13263185	1.73928658728316e-09	21480789	21480789
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.5467	1.73928658728316e-09	21480789	21480789	3.45190246326751e-09	21487474	21487474
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	140200229	33724	32508	-0.008	3.45190246326751e-09	21487474	21487474	5.2690572329628e-17	140198797	140200229
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.9707	5.2690572329628e-17	140198797	140200229	4.72811833697854e-17	140216524	140219465
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150181399	3767	3635	-0.0036	4.72811833697854e-17	140216524	140219465	4.09796940882732e-08	150166447	150181399
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150185190	1	0	NA	4.09796940882732e-08	150166447	150181399	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150191322	150204134	7	7	-0.7728	NA	NA	NA	1.48135898432829e-08	150204134	150209789
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	176484289	8350	8046	0.0032	1.48135898432829e-08	150204134	150209789	7.82627488825422e-09	176479979	176484289
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176484401	176487950	3	3	-1.1996	7.82627488825422e-09	176479979	176484289	1.88824741669739e-08	176487950	176489495
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176489495	180644810	1551	1483	0.0024	1.88824741669739e-08	176487950	176489495	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	31887126	11386	10986	-0.0035	NA	NA	NA	4.05780574943112e-09	31882913	31893557
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31889575	31901389	6	6	-0.8828	4.05780574943112e-09	31882913	31893557	1.60238528428322e-10	31901389	31905636
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31902818	31902818	1	0	NA	1.60238528428322e-10	31901389	31905636	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31905636	32558677	284	271	0.0707	NA	NA	NA	1.16800051144724e-63	32558677	32564884
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-2.2499	1.16800051144724e-63	32558677	32564884	0.00705359946615753	32588005	32609525
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32633691	10	10	-0.6627	0.00705359946615753	32588005	32609525	0.0354938743037660	32600962	32653710
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.0043	0.035493874303766	32600962	32653710	1.54042028452179e-05	32703109	32721872
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	14	-0.6722	1.54042028452179e-05	32703109	32721872	2.26364788128819e-12	32732764	32745036
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	65767409	10654	10244	-0.0046	2.26364788128819e-12	32732764	32745036	1.64904748512504e-07	65765501	65767409
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.4038	1.64904748512504e-07	65765501	65767409	8.27117226759724e-08	65771532	65778663
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	103841482	10807	10428	-0.0064	8.27117226759724e-08	65771532	65778663	5.16478217008826e-108	103841482	103841482
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.5322	5.16478217008826e-108	103841482	103841482	2.44648944185522e-105	103868154	103868154
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22044	-0.0043	2.44648944185522e-105	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	125831554	42438	40867	-6e-04	NA	NA	NA	1.46344482934930e-102	125831554	125831554
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.0348	1.4634448293493e-102	125831554	125831554	1.64915780938654e-100	125837524	125837524
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3500	0.002	1.64915780938654e-100	125837524	125837524	8.28130587675531e-267	133433384	133433384
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	-4.325	8.28130587675531e-267	133433384	133433384	8.91570196295082e-265	133448277	133448277
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	154525027	8799	8477	3e-04	8.91570196295082e-265	133448277	133448277	4.70321505279387e-09	154523855	154525027
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154526573	154530165	2	2	1.5484	4.70321505279387e-09	154523855	154525027	1.78529328869228e-09	154530165	154531887
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154531887	158821263	1791	1731	-0.0036	1.78529328869228e-09	154530165	154531887	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	-0.0317	NA	NA	NA	8.0638058352566e-40	581533	581533
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.1653	8.0638058352566e-40	581533	581533	1.96254837703995e-43	588865	588865
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	6926661	2270	2191	0.0027	1.96254837703995e-43	588865	588865	8.64968859647319e-23	6909487	7226901
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	8137794	11	11	-0.9847	8.64968859647319e-23	6909487	7226901	4.19653668035484e-21	7790934	8139999
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8139999	32797545	8791	8446	-0.004	4.19653668035484e-21	7790934	8139999	3.4092957575868e-11	32797545	32797545
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	3.4092957575868e-11	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-1.7007	NA	NA	NA	1.91332325599292e-11	32808049	32808049
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	137757481	30520	29402	-1e-04	1.91332325599292e-11	32808049	32808049	3.15146418069848e-54	137751905	137766366
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137762418	137922591	30	30	-0.9261	3.15146418069848e-54	137751905	137766366	5.06822447485354e-48	137908789	137931707
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	146264846	2820	2706	0.0087	5.06822447485354e-48	137908789	137931707	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11903206	4165	3990	0.0018	NA	NA	NA	2.74335389573211e-71	11894249	11910616
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11910616	12170870	43	42	-0.8926	2.74335389573211e-71	11894249	11910616	3.87078818586415e-71	12166394	12175607
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	12175607	70926188	8864	8510	-0.004	3.87078818586415e-71	12166394	12175607	1.03266553039252e-17	70926188	70926188
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.0617	1.03266553039252e-17	70926188	70926188	4.08468712736046e-17	70930528	70930528
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22912	-0.003	4.08468712736046e-17	70930528	70930528	6.93683064955453e-34	137352394	137352394
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.8572	6.93683064955453e-34	137352394	137352394	9.03309508590088e-27	137356880	137356880
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1071	0.003	9.03309508590088e-27	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9352	-0.0065	NA	NA	NA	1.86385644540303e-58	27038538	27038538
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.7042	1.86385644540303e-58	27038538	27038538	8.8070426859189e-56	27041812	27041812
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	27641594	237	221	-0.0238	8.8070426859189e-56	27041812	27041812	1.95827981856104e-29	27635976	27651731
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27646617	27646617	1	0	NA	1.95827981856104e-29	27635976	27651731	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27648567	27743708	37	35	-0.7152	NA	NA	NA	3.37181096997377e-35	27740929	27761657
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27745873	46396163	4458	4295	-0.0143	3.37181096997377e-35	27740929	27761657	7.8840299603865e-12	45478162	46414875
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46399272	46523510	50	46	-0.375	7.8840299603865e-12	45478162	46414875	1.90704515840421e-12	46506743	46547543
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46524798	135285645	30294	29154	-0.0028	1.90704515840421e-12	46506743	46547543	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	46095353	15550	14923	-0.0013	NA	NA	NA	3.5915413011228e-09	46090344	46095353
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46096588	46103800	5	5	0.9745	3.5915413011228e-09	46090344	46095353	1.92676144726256e-09	46103800	46105220
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46105220	55114405	1349	1291	-0.001	1.92676144726256e-09	46103800	46105220	2.48020261093598e-10	55073386	55142193
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55217189	41	40	-0.3675	2.48020261093598e-10	55073386	55142193	2.18691370379773e-10	55196550	55241068
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	107284914	18284	17550	0.0039	2.18691370379773e-10	55196550	55241068	1.85808511682056e-94	107284914	107284914
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-4.8251	1.85808511682056e-94	107284914	107284914	3.27989160933919e-101	107292148	107292148
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9664	-0.0059	3.27989160933919e-101	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3604	0.0053	NA	NA	NA	2.48895977059563e-73	9523923	9531133
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.6968	2.48895977059563e-73	9523923	9531133	2.13594870385911e-74	9589725	9599999
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11112600	573	550	-0.0226	2.13594870385911e-74	9589725	9599999	6.79214908758914e-16	11110735	11112600
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	7	1.0148	6.79214908758914e-16	11110735	11112600	4.53564676290347e-15	11140421	11143592
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6557	-0.0041	4.53564676290347e-15	11140421	11143592	2.97157552904083e-12	31084265	31180019
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	16	0.6072	2.97157552904083e-12	31084265	31180019	2.40962038134881e-11	31225941	31249495
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	132289090	33989	32738	0.0013	2.40962038134881e-11	31225941	31249495	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	24117473	2003	1920	0.0017	NA	NA	NA	4.64517241603007e-18	24092085	24130534
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24120335	24215542	48	47	0.4357	4.64517241603007e-18	24092085	24130534	1.95359447366087e-18	24208074	24228670
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24216915	36969571	4988	4797	-0.0082	1.95359447366087e-18	24208074	24228670	2.87316622828705e-64	36969571	36969571
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-3.9624	2.87316622828705e-64	36969571	36969571	6.26027921024962e-74	36982877	36982877
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	286	-0.0076	6.26027921024962e-74	36982877	36982877	7.66560183667051e-40	37953582	37953582
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9022	7.66560183667051e-40	37953582	37953582	4.28081944630672e-36	37957844	37957844
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4683	-0.0059	4.28081944630672e-36	37957844	37957844	2.19392081518502e-66	49964838	49964838
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.933	2.19392081518502e-66	49964838	49964838	1.07459479461020e-64	49971732	49971732
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	114123340	19423	18703	-0.006	1.0745947946102e-64	49971732	49971732	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	35	-0.3422	NA	NA	NA	1.56531067635026e-07	19415745	19469681
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	79174722	22304	21453	-0.0025	1.56531067635026e-07	19415745	19469681	6.13334243164705e-68	79174722	79174722
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-2.8692	6.13334243164705e-68	79174722	79174722	2.62794070631367e-67	79183154	79183154
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	106214372	9486	9107	-0.0024	2.62794070631367e-67	79183154	79183154	6.8189485473676e-07	106205637	106219784
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106240343	13	13	-0.5345	6.8189485473676e-07	106205637	106219784	2.40301624603326e-06	106236795	106252126
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106242757	106358491	41	40	0.116	2.40301624603326e-06	106236795	106252126	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0896	NA	NA	NA	0.00505607850450402	18432558	18835660
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20308014	152	147	-0.4571	0.00505607850450402	18432558	18835660	6.51327272649981e-60	20053008	20335887
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	75115806	21728	20900	-0.0055	6.51327272649981e-60	20053008	20335887	1.03854149279469e-17	75115806	75115806
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.1397	1.03854149279469e-17	75115806	75115806	5.76973981358413e-19	75119713	75119713
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9063	-0.0045	5.76973981358413e-19	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5268	0.0048	NA	NA	NA	7.43010401855366e-08	14672496	14956177
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15037844	16	14	-0.539	7.43010401855366e-08	14672496	14956177	1.34644890361391e-07	15028108	15045430
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	34329518	5225	5025	0.0056	1.34644890361391e-07	15028108	15045430	1.97992514374806e-14	34280904	34357366
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34602318	50	48	0.4052	1.97992514374806e-14	34280904	34357366	9.89876643576054e-17	34574587	34634686
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	54352394	2937	2832	-0.006	9.89876643576054e-17	34574587	34634686	5.40395542543177e-10	54340649	54362111
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.7063	5.40395542543177e-10	54340649	54362111	1.36865588439668e-09	54368717	54399890
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	68693086	4593	4410	-0.0033	1.36865588439668e-09	54368717	54399890	2.09472040936173e-25	68693014	68710277
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-1.1254	2.09472040936173e-25	68693014	68710277	4.85505490570131e-25	68751390	68838384
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1408	-0.0284	4.85505490570131e-25	68751390	68838384	7.22978978715365e-08	72914152	72941901
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.7773	7.22978978715365e-08	72914152	72941901	1.54603337288526e-08	72963578	73025340
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	728	0.0143	1.54603337288526e-08	72963578	73025340	8.72805148390917e-11	75092501	75093957
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.3624	8.72805148390917e-11	75092501	75093957	3.61983636757422e-12	75100865	75102639
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	586	-0.0343	3.61983636757422e-12	75100865	75102639	1.12116976694333e-18	76923844	76925748
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.0219	1.12116976694333e-18	76923844	76925748	6.944882511792e-16	76940218	76942679
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4361	9e-04	6.944882511792e-16	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	8147124	3542	3393	0.0172	NA	NA	NA	1.16301277825499e-08	8144634	8147124
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.5403	1.16301277825499e-08	8144634	8147124	5.52132634937507e-09	8149084	8154339
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	19438939	4077	3924	0.0088	5.52132634937507e-09	8149084	8154339	5.891784940522e-11	19433346	19438939
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19442291	19476901	10	9	-0.7846	5.891784940522e-11	19433346	19438939	4.64728499011922e-11	19476901	19486276
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19478144	30543860	4040	3872	-0.0034	4.64728499011922e-11	19476901	19486276	7.03145047178463e-08	30540455	30543860
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30562246	30564576	2	2	1.4084	7.03145047178463e-08	30540455	30543860	4.69770924371625e-07	30564576	30566574
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30566574	32828797	748	716	0.003	4.69770924371625e-07	30564576	30566574	4.13821395941968e-54	32828797	32828797
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-3.794	4.13821395941968e-54	32828797	32828797	1.44615206424723e-56	32832642	32832642
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36675987	1449	1394	-0.0029	1.44615206424723e-56	32832642	32832642	1.54054123191611e-16	36673853	36678537
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36684619	5	5	1.3122	1.54054123191611e-16	36673853	36678537	4.55596005938387e-17	36683509	36686013
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1945	0.0193	4.55596005938387e-17	36683509	36686013	9.77006515097984e-11	41506317	41522429
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	20	0.5365	9.77006515097984e-11	41506317	41522429	1.35158542251563e-10	41561017	41574775
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	78653545	13726	13158	0.0063	1.35158542251563e-10	41561017	41574775	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15600	-0.0054	NA	NA	NA	2.20415091101207e-56	53092949	53092949
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-3.6305	2.20415091101207e-56	53092949	53092949	6.43669397049743e-55	53099601	53099601
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6518	-0.0124	6.43669397049743e-55	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	44047089	14262	13671	0.0186	NA	NA	NA	1.08183858146076e-08	44039364	44053712
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44047502	44065486	9	9	0.7619	1.08183858146076e-08	44039364	44053712	3.03868167836868e-09	44058456	44071170
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44066677	59414898	6784	6538	0.016	3.03868167836868e-09	44058456	44071170	1.05452490648823e-10	59411618	59414898
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7414	1.05452490648823e-10	59411618	59414898	3.05000709596339e-10	59434202	59440274
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1899	0.0027	3.05000709596339e-10	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	565	-0.0205	NA	NA	NA	8.28093028331183e-88	1506379	1515948
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-2.2857	8.28093028331183e-88	1506379	1515948	5.33838599477205e-109	1528899	1532433
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3543	2e-04	5.33838599477205e-109	1528899	1532433	2.26141869897902e-08	12089020	12095485
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4412	2.26141869897902e-08	12089020	12095485	1.01143650861532e-07	12113855	12127349
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16643	0.0017	1.01143650861532e-07	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12918	-0.0043	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	17274339	732	707	0.0219	NA	NA	NA	5.98881417677522e-11	17006871	17295409
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17274835	17433410	51	49	0.3761	5.98881417677522e-11	17006871	17295409	1.51639223318089e-10	17415323	17463248
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17434827	22667608	2199	2116	0.0263	1.51639223318089e-10	17415323	17463248	3.03079301017311e-87	22667608	22682428
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22702398	10	9	-2.326	3.03079301017311e-87	22667608	22682428	0.0428700134197088	22682428	22706166
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22704683	22721042	11	10	-3.8055	0.0428700134197088	22682428	22706166	1.99243375532044e-261	22721042	22721042
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	23959291	597	582	-0.0016	1.99243375532044e-261	22721042	22721042	2.34947528259079e-50	23951922	23974713
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23962239	24323062	130	123	0.4964	2.34947528259079e-50	23951922	23974713	1.40173567035642e-59	24309232	24348020
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24335637	35472378	5821	5608	0.0057	1.40173567035642e-59	24309232	24348020	3.59126779725509e-37	35472378	35472378
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.0131	3.59126779725509e-37	35472378	35472378	8.3370916085659e-35	35476942	35476942
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6721	0.0138	8.3370916085659e-35	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	106242	14	13	0.6271	NA	NA	NA	4.63976174364584e-11	99430	110101
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	1431411	775	750	-0.0321	4.63976174364584e-11	99430	110101	9.6729470271275e-07	1431240	1431411
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.3318	9.6729470271275e-07	1431240	1431411	1.23765485833975e-07	1432953	1434970
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1691644	214	202	-0.0283	1.23765485833975e-07	1432953	1434970	2.57452060696719e-08	1685003	1694016
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1691671	1712236	19	18	0.447	2.57452060696719e-08	1685003	1694016	2.33234502376093e-07	1706777	1724193
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1715594	2302065	376	363	-0.0361	2.33234502376093e-07	1706777	1724193	2.23293210730456e-12	2301365	2302065
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.2625	2.23293210730456e-12	2301365	2302065	2.92340909438452e-14	2304398	2306110
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	377	-0.0494	2.92340909438452e-14	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	153332114	44719	43002	1.0698	0	2708113	2711273	5.95966265027461e-07	153328351	153335752
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153333629	153344718	6	6	0.217	5.95966265027461e-07	153328351	153335752	2.36958752783437e-07	153342841	153351248
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153348763	154582414	409	387	1.0771	2.36958752783437e-07	153342841	153351248	1.41311874389195e-277	154578922	154586690
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0431	1.41311874389195e-277	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-3.5745	NA	NA	NA	4.42037894670962e-12	3773948	4425391
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5672441	12	12	-1.2816	4.42037894670962e-12	3773948	4425391	8.74642974453873e-05	4597974	6735310
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7996758	453	434	-3.0273	8.74642974453873e-05	4597974	6735310	2.30763715265455e-07	7717556	8168499
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	7997485	1	0	NA	2.30763715265455e-07	7717556	8168499	NA	NA	NA
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	10515697	371	357	-3.4955	NA	NA	NA	4.38187395046092e-25	10512616	10515697
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.5102	4.38187395046092e-25	10512616	10515697	1.49453131670847e-05	10645500	12511461
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12994193	151	146	-2.5883	1.49453131670847e-05	10645500	12511461	0.00576042318167084	12845704	13040293
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12996552	13128515	56	54	-1.8111	0.00576042318167084	12845704	13040293	3.12233026451406e-09	13101234	13138841
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13279098	50	50	-3.1327	3.12233026451406e-09	13101234	13138841	0.12533906489846	13138841	13427571
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13281871	13649497	159	153	-3.501	0.12533906489846	13138841	13427571	0.000149651321742519	13596448	13663517
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13699223	7	7	-2.1426	0.000149651321742519	13596448	13663517	1.20185220462116e-06	13692518	13705594
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14342834	193	187	-3.6377	1.20185220462116e-06	13692518	13705594	1.75342691500703e-05	14318786	14439890
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	92	-3.0573	1.75342691500703e-05	14318786	14439890	2.11333779708558e-08	14503185	14526446
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-0.8031	2.11333779708558e-08	14503185	14526446	1.81734439604642e-05	14545228	14547168
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14555872	5	5	-3.4	1.81734439604642e-05	14545228	14547168	7.19944392450322e-13	14555872	14555872
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14557473	14579298	8	8	-0.8293	7.19944392450322e-13	14555872	14555872	5.39392660013339e-09	14579298	14587291
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15920478	418	401	-3.2923	5.39392660013339e-09	14579298	14587291	0.00200960225581435	15573579	16037646
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16182565	107	102	-2.8124	0.00200960225581435	15573579	16037646	4.09708266266733e-10	16143653	16256821
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	22139807	992	957	-3.4869	4.09708266266733e-10	16143653	16256821	6.3595195170578e-07	22051284	22157319
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.6945	6.3595195170578e-07	22051284	22157319	3.3845519399706e-10	22177335	22179794
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	93	-3.7224	3.3845519399706e-10	22177335	22179794	1.07268170475421e-35	23283689	25737663
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26913408	18	17	-1.0172	1.07268170475421e-35	23283689	25737663	5.27944773116709e-07	26909069	26913408
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26915670	26920247	3	3	-2.3494	5.27944773116709e-07	26909069	26913408	1.31863305629695e-09	26920247	26920247
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	10	-0.588	1.31863305629695e-09	26920247	26920247	0.00419288261881615	26945893	27003308
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.2854	0.00419288261881615	26945893	27003308	0.000539460922369028	26995399	27068911
MSK_252152912740_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	32	-0.8885	0.000539460922369028	26995399	27068911	NA	NA	NA
