Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	11910598	4117	3993	0.0238	NA	NA	NA	4.55499137837126e-13	11910598	11910598
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	11912493	11915125	3	3	-0.9095	4.55499137837126e-13	11910598	11910598	1.46494127534443e-12	11915125	11915125
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	11918032	16668773	1659	1622	0.0196	1.46494127534443e-12	11915125	11915125	7.16349984374773e-10	16652095	16888048
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16698906	17127039	28	28	0.2946	7.16349984374773e-10	16652095	16888048	5.55707360168528e-10	17086698	17167719
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	24391166	3027	2933	0.0201	5.55707360168528e-10	17086698	17167719	1.81333477085282e-71	24391166	24391166
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-2.7628	1.81333477085282e-71	24391166	24391166	5.08688382499275e-80	24395691	24395691
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	34869589	4058	3941	0.0369	5.08688382499275e-80	24395691	24395691	0	34869589	34869589
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-5.8523	0	34869589	34869589	0	34883375	34883375
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	48591378	5449	5308	0.0174	0	34883375	34883375	9.14284160294064e-11	48563379	48614435
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	48593929	48656563	26	26	0.2991	9.14284160294064e-11	48563379	48614435	5.15683471349514e-16	48637796	48665847
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	48658088	72537426	9521	9288	-0.0084	5.15683471349514e-16	48637796	48665847	2.56060555507702e-129	72537426	72537426
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.2452	2.56060555507702e-129	72537426	72537426	5.2125358283343e-130	72579311	72579311
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	99174985	8732	8500	-0.0033	5.2125358283343e-130	72579311	72579311	5.1007090295256e-18	99174985	99174985
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	99178134	99179775	2	2	-1.2517	5.1007090295256e-18	99174985	99174985	5.31033405002299e-19	99179775	99179775
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	99181907	103904723	1371	1327	0.0027	5.31033405002299e-19	99179775	99179775	1.75197735224664e-19	103901454	103907903
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103956767	14	13	0.5043	1.75197735224664e-19	103901454	103907903	2.13464791077869e-21	103927825	104012520
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103962495	103962495	1	0	NA	2.13464791077869e-21	103927825	104012520	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	108533257	1008	993	-0.0179	NA	NA	NA	6.03313446825076e-11	108531247	108533257
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-0.7956	6.03313446825076e-11	108531247	108533257	1.21960335526140e-09	108538662	108541074
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109373255	275	270	0.015	1.2196033552614e-09	108538662	108541074	3.97179865618672e-10	109369942	109373255
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.0002	3.97179865618672e-10	109369942	109373255	6.5453393029048e-10	109376249	109376249
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110015739	294	287	0.0049	6.5453393029048e-10	109376249	109376249	7.99504277795384e-08	110011494	110015739
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110023268	110041712	5	5	0.5757	7.99504277795384e-08	110011494	110015739	2.17760829571621e-09	110041712	110058441
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	143659690	3912	3808	-0.0121	2.17760829571621e-09	110041712	110058441	1.89329293011882e-13	143641813	143706582
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143791143	47	44	-0.248	1.89329293011882e-13	143641813	143706582	3.64632669903434e-17	143783358	143802400
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143793179	146294654	594	573	0.0154	3.64632669903434e-17	143783358	143802400	2.86617876920643e-18	146279228	147313991
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147510532	38	37	0.3071	2.86617876920643e-18	146279228	147313991	7.30226905494008e-15	147460661	148084402
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1221	0.0407	7.30226905494008e-15	147460661	148084402	1.58989334574473e-255	150819879	150819879
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.1254	1.58989334574473e-255	150819879	150819879	1.03916820060171e-245	150851439	150851439
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2698	0.0148	1.03916820060171e-245	150851439	150851439	1.30450686983199e-152	157133150	157133150
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.6855	1.30450686983199e-152	157133150	157133150	4.49764657479371e-158	157136342	157136342
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4002	-0.0087	4.49764657479371e-158	157136342	157136342	1.17252870980868e-10	167479184	167493768
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-0.4989	1.17252870980868e-10	167479184	167493768	2.10475306388227e-11	167507882	167523140
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	177595302	3988	3887	-0.0103	2.10475306388227e-11	167507882	167523140	3.17981677708746e-08	177593746	177595302
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	3	-0.6932	3.17981677708746e-08	177593746	177595302	1.93812757650722e-08	177599597	177601540
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	185979586	3218	3125	-0.0037	1.93812757650722e-08	177599597	177601540	3.78985702044835e-45	185979586	185979586
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.9417	3.78985702044835e-45	185979586	185979586	8.53963120621118e-44	185988138	185988138
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200594055	4134	4048	0.0069	8.53963120621118e-44	185988138	185988138	7.70545784493669e-13	200572541	200623556
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200596027	200787319	40	40	-0.2316	7.70545784493669e-13	200572541	200623556	1.90110948891351e-11	200673525	200810641
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	246753652	17281	16781	-0.001	1.90110948891351e-11	200673525	200810641	3.29945826879904e-13	246696599	246794552
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246755225	246882156	35	35	0.2624	3.29945826879904e-13	246696599	246794552	1.00453127331920e-09	246862029	246912838
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902260	247186514	93	91	0.0038	1.0045312733192e-09	246862029	246912838	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1343	-0.0402	NA	NA	NA	4.01878036552551e-15	3708749	3708749
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-1.0034	4.01878036552551e-15	3708749	3708749	1.96231277600595e-16	3714236	3714236
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	34554208	10134	9852	-0.0059	1.96231277600595e-16	3714236	3714236	4.71599597300431e-10	34542224	34561038
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34556434	34589997	15	15	0.348	4.71599597300431e-10	34542224	34561038	4.85531014958242e-11	34580533	34599239
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35553983	381	373	-0.0172	4.85531014958242e-11	34580533	34599239	4.35214929922655e-06	35552710	35553983
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-0.7483	4.35214929922655e-06	35552710	35553983	5.01400873750003e-06	35562007	35564203
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	64936033	10833	10480	0.0046	5.01400873750003e-06	35562007	35564203	2.15192081751449e-05	64930509	64936033
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	64938167	64949736	4	4	-0.5024	2.15192081751449e-05	64930509	64936033	7.465281122866e-07	64949736	64954732
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	64952509	66038336	461	446	0.0401	7.465281122866e-07	64949736	64954732	9.93371494966908e-18	66038336	66038336
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.9508	9.93371494966908e-18	66038336	66038336	8.24551883189843e-15	66049853	66049853
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	146571330	21850	21278	-0.0059	8.24551883189843e-15	66049853	66049853	1.43255991049414e-19	146571330	146571330
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.9401	1.43255991049414e-19	146571330	146571330	3.18797651658921e-20	146592775	146592775
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	10917	-0.0032	3.18797651658921e-20	146592775	146592775	3.40425782589429e-10	179764819	179767214
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.778	3.40425782589429e-10	179764819	179767214	5.62431913193524e-11	179778919	179791128
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	180117780	104	99	-0.0032	5.62431913193524e-11	179778919	179791128	2.55831934259092e-29	180117780	180117780
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.916	2.55831934259092e-29	180117780	180117780	5.72664467979868e-29	180129680	180129680
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	242689978	21432	20875	0.0011	5.72664467979868e-29	180129680	180129680	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460805	16217	15770	-0.0083	NA	NA	NA	7.02675206807571e-10	47460805	47460805
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47460892	47460892	1	0	NA	7.02675206807571e-10	47460805	47460805	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	0.9485	NA	NA	NA	2.31002811851892e-29	47466921	47466921
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75845446	10664	10371	-0.0047	2.31002811851892e-29	47466921	47466921	7.84078115605678e-28	75799026	75853052
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75850223	75875904	10	10	0.4532	7.84078115605678e-28	75799026	75853052	1.57863409832243e-12	75871755	76000715
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	129861428	15507	15078	-0.0091	1.57863409832243e-12	75871755	76000715	6.25842804701751e-38	129861428	129861428
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129867158	129885779	7	7	-0.9505	6.25842804701751e-38	129861428	129861428	2.33392990278818e-37	129885779	129885779
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129887890	164005577	11083	10780	-0.0019	2.33392990278818e-37	129885779	129885779	2.85253910149901e-117	164005577	164005577
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.9737	2.85253910149901e-117	164005577	164005577	5.8545756007596e-32	164027724	164027724
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.4992	5.8545756007596e-32	164027724	164027724	7.53478945616566e-29	164101776	164115417
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9849	0.0011	7.53478945616566e-29	164101776	164115417	0	194354505	194354505
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.0654	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	959	0.0037	0	194366950	194366950	6.40346661898746e-12	196804569	196911010
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	31	0.2777	6.40346661898746e-12	196804569	196911010	8.88613517959042e-09	196943380	196978235
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	921	0.0411	8.88613517959042e-09	196943380	196978235	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	65688	11	11	0.4221	NA	NA	NA	2.15560181854707e-10	61552	78043
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	71148	710308	214	210	-0.008	2.15560181854707e-10	61552	78043	2.57477438202726e-05	701479	723794
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	713519	734006	9	9	0.3399	2.57477438202726e-05	701479	723794	2.63159400878927e-05	723794	745208
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	735115	1622405	288	280	-0.0158	2.63159400878927e-05	723794	745208	4.58535687524425e-10	1620129	1622405
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1625148	1626483	2	2	0.9995	4.58535687524425e-10	1620129	1622405	7.301813867793e-10	1626483	1626483
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1628228	8018659	2416	2358	-0.0071	7.301813867793e-10	1626483	1626483	6.80795319193515e-12	8018659	8018659
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	8022556	8025505	2	2	-1.1064	6.80795319193515e-12	8018659	8018659	3.26913186883844e-12	8025505	8025505
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	8028221	9815760	451	442	-0.019	3.26913186883844e-12	8025505	8025505	0	9815760	9815760
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.7904	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	6038	-0.0146	0	9842644	9842644	1.46478660700997e-24	34439897	34445002
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.8289	1.46478660700997e-24	34439897	34445002	7.78555668112325e-24	34491115	34491115
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	173660684	40265	39178	-0.0048	7.78555668112325e-24	34491115	34491115	9.13400046003595e-188	173660684	173660684
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.9392	9.13400046003595e-188	173660684	173660684	9.19489374251673e-186	173666072	173666072
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	722	-0.0033	9.19489374251673e-186	173666072	173666072	1.50930995525163e-08	175860235	175860235
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.858	1.50930995525163e-08	175860235	175860235	4.0491608978783e-08	175863396	175863396
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	186676034	3028	2950	0.0029	4.0491608978783e-08	175863396	175863396	3.09112169275541e-95	186676034	186676034
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.8424	3.09112169275541e-95	186676034	186676034	9.02640895093754e-95	186680176	186680176
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1506	-0.0158	9.02640895093754e-95	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	56578607	15202	14776	-0.0102	NA	NA	NA	1.73573776675508e-12	56576741	56578607
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56579735	56582581	3	3	0.8368	1.73573776675508e-12	56576741	56578607	3.90947072583381e-12	56582581	56582581
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56584732	98113816	12420	12054	-0.0018	3.90947072583381e-12	56582581	56582581	2.13580195940180e-22	98113816	98113816
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98116606	98116606	1	0	NA	2.1358019594018e-22	98113816	98113816	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98118881	98126117	4	4	-0.9746	NA	NA	NA	1.89048903533804e-23	98126117	98126117
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98127741	117408114	4964	4815	-0.0089	1.89048903533804e-23	98126117	98126117	3.37773585231265e-08	117403380	117408114
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	117417457	117420898	2	2	-0.8348	3.37773585231265e-08	117403380	117408114	2.66505625054037e-17	117420898	117423638
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	117423638	140203440	7484	7284	0.0011	2.66505625054037e-17	117420898	117423638	1.37976674354322e-39	140203440	140203440
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	7	-0.9901	1.37976674354322e-39	140203440	140203440	2.09403737152725e-35	140216524	140216524
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140533456	137	133	0.0353	2.09403737152725e-35	140216524	140216524	7.19772669158193e-126	140533456	140533456
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	3.6073	7.19772669158193e-126	140533456	140533456	3.29057506417395e-162	140538666	140538666
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	155405839	5257	5124	-0.0066	3.29057506417395e-162	140538666	140538666	1.74442382351265e-11	155404062	155405839
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-0.6307	1.74442382351265e-11	155404062	155405839	4.08796855631753e-11	155421443	155427589
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180644810	8278	8049	0.0036	4.08796855631753e-11	155421443	155427589	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	0.0138	NA	NA	NA	1.23536587907503e-14	198124	210326
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	202063	1	0	NA	1.23536587907503e-14	198124	210326	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	204881	240119	15	14	-0.5322	NA	NA	NA	1.11522055717847e-22	236535	241674
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	29950805	10531	10238	-8e-04	1.11522055717847e-22	236535	241674	3.68843726023127e-52	29941766	29966336
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	14	-0.8005	3.68843726023127e-52	29941766	29966336	1.92032431085652e-44	30004636	30005338
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	32558677	1076	1042	0.0021	1.92032431085652e-44	30004636	30005338	1.20912919836218e-284	32558677	32588005
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	15	-2.5174	1.20912919836218e-284	32558677	32588005	1.52771115946240e-307	32626619	32633691
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	35862502	1382	1341	0.019	1.5277111594624e-307	32626619	32633691	1.27690315613764e-10	35856922	35862502
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35875112	7	7	0.5886	1.27690315613764e-10	35856922	35862502	2.03561283175034e-15	35875112	35878656
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35878656	42055658	2553	2475	0.0034	2.03561283175034e-15	35875112	35878656	3.09481616708499e-16	42055658	42055658
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	42062564	42064212	3	3	-0.9653	3.09481616708499e-16	42055658	42055658	7.3435300146244e-16	42064212	42064212
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	42071356	54035000	4350	4244	-0.0034	7.3435300146244e-16	42064212	42064212	2.41946032277621e-25	54035000	54035000
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.204	2.41946032277621e-25	54035000	54035000	5.44328634352994e-26	54042734	54042734
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6261	-0.001	5.44328634352994e-26	54042734	54042734	1.97648509056013e-13	79011979	79032059
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.4204	1.97648509056013e-13	79011979	79032059	1.89304541227024e-13	79074911	79101978
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	6099	-0.0043	1.89304541227024e-13	79074911	79101978	5.43043310735991e-21	102039635	102039635
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-1.0982	5.43043310735991e-21	102039635	102039635	1.76309078704634e-21	102044331	102044331
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	472	0.0037	1.76309078704634e-21	102044331	102044331	8.01312470085448e-20	103841482	103841482
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9299	8.01312470085448e-20	103841482	103841482	5.88871442778548e-20	103868154	103868154
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	119302112	5105	4969	0.0042	5.88871442778548e-20	103868154	103868154	0	119299185	119315325
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	119315325	120417287	336	331	0.5953	0	119299185	119315325	0	120408706	120430209
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	120430209	162502077	14702	14330	-0.0022	0	120408706	120430209	7.74445122083135e-19	162502077	162502077
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-1.282	7.74445122083135e-19	162502077	162502077	2.49789001025908e-17	162505819	162505819
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	932	-0.0356	2.49789001025908e-17	162505819	162505819	1.43144887788065e-12	165642393	165643653
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.7185	1.43144887788065e-12	165642393	165643653	1.47057339107504e-12	165650610	165653315
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1758	-0.0403	1.47057339107504e-12	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5230	0.0118	NA	NA	NA	2.05482145297740e-77	16135701	16135701
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-2.6717	2.0548214529774e-77	16135701	16135701	2.43937149173523e-81	16140018	16140018
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	89938417	21804	21215	-8e-04	2.43937149173523e-81	16140018	16140018	5.09968509391726e-20	89938417	89938417
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89940776	89940776	1	0	NA	5.09968509391726e-20	89938417	89938417	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89944511	89946862	2	2	-0.9776	NA	NA	NA	1.77567603640192e-11	89946862	89946862
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89950160	100164752	3865	3755	0.0039	1.77567603640192e-11	89946862	89946862	1.84050882812355e-13	100162851	100164752
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.7814	1.84050882812355e-13	100162851	100164752	1.13380914844988e-16	100174991	100174991
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109216032	3894	3783	0.0107	1.13380914844988e-16	100174991	100174991	3.10835193075670e-19	109212149	109216032
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109236813	5	5	-0.5185	3.1083519307567e-19	109212149	109216032	4.8196518487824e-07	109236813	109244233
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109240210	118611324	4300	4180	-0.014	4.8196518487824e-07	109236813	109244233	1.05078858893560e-34	118611324	118611324
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.3865	1.0507885889356e-34	118611324	118611324	6.14102784230368e-34	118620875	118620875
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3078	-0.0229	6.14102784230368e-34	118620875	118620875	8.36700171232151e-320	125831554	125831554
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.308	8.36700171232151e-320	125831554	125831554	4.00687238777251e-321	125837524	125837524
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7152	0.0017	4.00687238777251e-321	125837524	125837524	3.57352438289975e-31	141409512	141413352
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.6277	3.57352438289975e-31	141409512	141413352	1.92589793662079e-26	141438504	141442231
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	115	0	1.92589793662079e-26	141438504	141442231	2.44108810656412e-24	141689547	141690753
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.6761	2.44108810656412e-24	141689547	141690753	8.949325620317e-23	141714168	141720324
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	8.949325620317e-23	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142152205	166	162	0.051	NA	NA	NA	3.28648200562228e-09	142140540	142159173
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142188727	10	10	0.4511	3.28648200562228e-09	142140540	142159173	3.15471169359581e-12	142187097	142194531
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142192030	147702365	2335	2275	-0.0189	3.15471169359581e-12	142187097	142194531	9.09381542514968e-38	147702365	147702365
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.8702	9.09381542514968e-38	147702365	147702365	6.17739633962433e-34	147707161	147707161
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4124	-0.0086	6.17739633962433e-34	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	-0.015	NA	NA	NA	2.19404833055954e-15	581533	581533
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.5651	2.19404833055954e-15	581533	581533	2.16673004078962e-27	588865	588865
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12587	-0.0075	2.16673004078962e-27	588865	588865	1.12443113723687e-219	39350798	39350798
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.7944	1.12443113723687e-219	39350798	39350798	1.50706613922114e-226	39504332	39505256
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30566	-0.0072	1.50706613922114e-226	39504332	39505256	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11833914	4154	4048	-0.0162	NA	NA	NA	9.32427116996849e-107	11833914	11833914
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11841585	11924560	15	15	-1.0965	9.32427116996849e-107	11833914	11833914	1.32322732110358e-105	11924560	11924560
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11930111	70926188	8903	8642	-0.0069	1.32322732110358e-105	11924560	11924560	2.10292002658893e-214	70926188	70926188
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.2485	2.10292002658893e-214	70926188	70926188	1.8645215261087e-222	70930528	70930528
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	89556154	6185	6035	-0.0016	1.8645215261087e-222	70930528	70930528	1.60243562782944e-08	89550122	89559722
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89558460	89572875	7	7	0.4593	1.60243562782944e-08	89550122	89559722	7.23719821457652e-08	89567792	89578197
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89574395	116124007	9276	9032	-2e-04	7.23719821457652e-08	89567792	89578197	1.94796199771059e-14	116124007	116124007
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.1416	1.94796199771059e-14	116124007	116124007	1.15018382284038e-16	116130333	116130333
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	123449399	2434	2365	-0.0306	1.15018382284038e-16	116130333	116130333	7.75979362299141e-11	123448269	123449399
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123451454	123455396	3	3	0.7485	7.75979362299141e-11	123448269	123449399	1.16511278111700e-08	123455396	123458013
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123458013	128663966	2255	2191	0.0076	1.165112781117e-08	123455396	123458013	3.56598853499854e-06	128637337	128668707
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128667210	128709553	19	19	0.2587	3.56598853499854e-06	128637337	128668707	8.99354795721135e-10	128699327	128728203
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128710906	137352394	3584	3467	0.0202	8.99354795721135e-10	128699327	128728203	3.1089994693329e-24	137352394	137352394
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-1.5357	3.1089994693329e-24	137352394	137352394	1.48506206588418e-21	137356880	137356880
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1082	0.0068	1.48506206588418e-21	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	4696485	1647	1601	-0.0355	NA	NA	NA	1.03321039893369e-09	4693561	4696485
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4696626	4704399	2	2	-0.9706	1.03321039893369e-09	4693561	4696485	2.09847268348753e-10	4704399	4705584
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4705584	21843243	6085	5920	0.0082	2.09847268348753e-10	4704399	4705584	6.60620200246539e-09	21841638	21843243
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	21844270	21844270	1	0	NA	6.60620200246539e-09	21841638	21843243	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	21845077	21851013	6	6	0.5334	NA	NA	NA	6.98583565692143e-09	21851013	21852870
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	21851864	114100979	29246	28487	0.0019	6.98583565692143e-09	21851013	21852870	4.4488254579959e-221	114100979	114100979
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-4.364	4.4488254579959e-221	114100979	114100979	2.37199637349598e-211	114106460	114106460
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7578	-0.0153	2.37199637349598e-211	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18890351	7370	7172	-0.0051	NA	NA	NA	5.77021712695294e-07	18865243	18896166
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18892456	18932031	10	10	-0.3794	5.77021712695294e-07	18865243	18896166	3.04389604830119e-07	18917191	18946873
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18933855	25875088	2100	2028	-0.0183	3.04389604830119e-07	18917191	18946873	3.4576209228885e-10	25875088	25880718
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25880718	25892171	3	3	-0.7952	3.4576209228885e-10	25875088	25880718	1.95635177315235e-10	25888389	25896241
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25896241	48959014	7083	6891	0.0023	1.95635177315235e-10	25888389	25896241	3.37018166703728e-08	48953023	48959014
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48986600	49001848	4	4	0.5286	3.37018166703728e-08	48953023	48959014	3.72070635617009e-07	49001848	49075237
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49032039	55118214	335	331	-0.0363	3.72070635617009e-07	49001848	49075237	3.0510731771626e-67	55114405	55124730
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.6188	3.0510731771626e-67	55114405	55124730	1.18964584424273e-83	55205278	55217189
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4512	0.0184	1.18964584424273e-83	55205278	55217189	1.81048238934090e-33	66463477	66463477
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0362	1.8104823893409e-33	66463477	66463477	1.19801420868632e-10	66469412	66469412
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	70132648	1266	1234	0.0103	1.19801420868632e-10	66469412	66469412	1.07641392216364e-11	70132648	70132648
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	70134644	70136255	2	2	-1.0637	1.07641392216364e-11	70132648	70132648	4.22367695692186e-12	70136255	70136255
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	70138721	134105421	22352	21681	-0.0097	4.22367695692186e-12	70136255	70136255	7.57947662755018e-11	134105421	134105421
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134109095	134111832	2	2	-0.9392	7.57947662755018e-11	134105421	134105421	1.37914457492654e-14	134111832	134111832
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134113671	134450318	98	97	-0.0278	1.37914457492654e-14	134111832	134111832	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3634	4e-04	NA	NA	NA	1.20379911264716e-44	9516067	9531133
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	16	0.7138	1.20379911264716e-44	9516067	9531133	3.18474259853938e-45	9607363	9626623
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11104973	567	550	-0.0212	3.18474259853938e-45	9607363	9626623	2.01809625234279e-11	11104085	11104973
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	-0.7561	2.01809625234279e-11	11104085	11104973	1.06980446766054e-23	11116883	11116883
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	-4.4694	1.06980446766054e-23	11116883	11116883	0	11140421	11140421
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6633	-0.0037	0	11140421	11140421	2.80941963344825e-89	31132716	31169263
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31298659	43	43	0.5857	2.80941963344825e-89	31132716	31169263	1.41734590042155e-82	31296973	31299898
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	33178741	723	703	0.0394	1.41734590042155e-82	31296973	31299898	7.90924416993964e-77	33178741	33178741
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33184017	33184017	1	0	NA	7.90924416993964e-77	33178741	33178741	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-2.8322	NA	NA	NA	1.07323406258778e-83	33198331	33198331
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	33201796	1	0	NA	1.07323406258778e-83	33198331	33198331	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33210537	41303729	1738	1692	-0.0042	NA	NA	NA	1.27229318780669e-18	41303729	41303729
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-1.0216	1.27229318780669e-18	41303729	41303729	2.97420738923615e-18	41312478	41312478
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	46992235	1817	1768	-0.002	2.97420738923615e-18	41312478	41312478	4.05794351430941e-07	46988969	46992235
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-0.796	4.05794351430941e-07	46988969	46992235	2.06157446535083e-11	46996769	46998876
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	69138621	8188	7944	0.0175	2.06157446535083e-11	46996769	46998876	2.82974407585695e-12	69138621	69138621
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-0.9599	2.82974407585695e-12	69138621	69138621	1.08806684626724e-33	69164231	69164231
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	123367713	18441	17939	0.0082	1.08806684626724e-33	69164231	69164231	8.29217967779006e-33	123365200	123367713
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123370406	123378252	4	4	-0.4809	8.29217967779006e-33	123365200	123367713	0.000226680195955558	123378252	123383462
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123379617	132289090	3041	2951	-0.0195	0.000226680195955558	123378252	123383462	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7130	-0.0045	NA	NA	NA	9.8779336053325e-72	37953582	37953582
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.4513	9.8779336053325e-72	37953582	37953582	8.878981864966e-70	37957844	37957844
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4743	-0.0023	8.878981864966e-70	37957844	37957844	2.01819862181466e-174	49964838	49964838
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.8684	2.01819862181466e-174	49964838	49964838	1.14817688634767e-184	49971732	49971732
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	68136198	4511	4390	-0.0034	1.14817688634767e-184	49971732	49971732	9.36141225376187e-11	68130387	68142120
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68138912	68167758	13	12	0.3884	9.36141225376187e-11	68130387	68142120	2.96398339770354e-11	68161714	68169957
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68168882	114123340	14899	14520	-0.0131	2.96398339770354e-11	68161714	68169957	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	6	0.7186	NA	NA	NA	1.80879525552085e-05	18798641	19287128
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	51	0.342	1.80879525552085e-05	18798641	19287128	1.77047598451447e-30	19490630	19540294
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5535	0.0126	1.77047598451447e-30	19490630	19540294	4.81884495901249e-15	34674458	34674458
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.0127	4.81884495901249e-15	34674458	34674458	4.81074465622803e-11	34679959	34679959
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	34683810	1	0	NA	4.81074465622803e-11	34679959	34679959	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1856	0.0078	NA	NA	NA	7.60394468532362e-13	40663660	40680589
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.5488	7.60394468532362e-13	40663660	40680589	9.87385932673424e-14	40722360	40741934
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69086125	9972	9713	0.006	9.87385932673424e-14	40722360	40741934	1.09874411891518e-14	69086125	69086125
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-0.909	1.09874411891518e-14	69086125	69086125	1.13007377199605e-13	69092211	69093444
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	79174722	4710	4573	0.007	1.13007377199605e-13	69092211	69093444	0	79174722	79174722
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-4.2173	0	79174722	79174722	0	79183154	79183154
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	82594434	1059	1023	-0.0176	0	79183154	79183154	4.51696539533949e-08	82594434	82594434
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	82596960	82598594	2	2	-0.8391	4.51696539533949e-08	82594434	82594434	2.59677275711738e-07	82598594	82600752
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	82600752	105597555	8236	8022	-0.0013	2.59677275711738e-07	82598594	82600752	2.08744654726692e-14	105594189	105606424
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.4689	2.08744654726692e-14	105594189	105606424	6.13385986079854e-10	105630089	105703388
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	223	-0.0138	6.13385986079854e-10	105630089	105703388	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19109124	31	31	-0.0232	NA	NA	NA	4.61487219592547e-07	18867285	19146596
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	19465359	67	65	0.1875	4.61487219592547e-07	18867285	19146596	1.40767851903778e-16	19415360	19835471
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	22683241	480	463	-0.0465	1.40767851903778e-16	19415360	19835471	2.11838527242153e-56	22683241	22683241
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22684804	22714096	11	11	-1.0457	2.11838527242153e-56	22683241	22683241	1.39956086148985e-68	22714096	22714096
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22716442	74669752	21122	20562	0.0029	1.39956086148985e-68	22714096	22714096	1.84822429609779e-19	74669752	74669752
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.9437	1.84822429609779e-19	74669752	74669752	4.53165974466929e-21	74680439	74680439
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	78855195	1660	1620	-0.001	4.53165974466929e-21	74680439	74680439	1.97928257725534e-09	78855195	78855195
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	0.9048	1.97928257725534e-09	78855195	78855195	5.68036694254529e-09	78858227	78858227
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	99632987	7671	7453	-0.0054	5.68036694254529e-09	78858227	78858227	6.08146831415107e-17	99632987	99632987
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.2245	6.08146831415107e-17	99632987	99632987	5.42980064164223e-18	99635701	99635701
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217283	268	257	-0.0228	5.42980064164223e-18	99635701	99635701	1.78721556935853e-26	100217283	100217283
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	1.0545	1.78721556935853e-26	100217283	100217283	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	23841444	8042	7796	0.0183	NA	NA	NA	8.30175108042761e-26	23841444	23841444
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23842653	23848772	4	4	-1.0923	8.30175108042761e-26	23841444	23841444	3.13763688511487e-27	23848772	23848772
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23850580	32379126	2527	2471	0.0273	3.13763688511487e-27	23848772	23848772	1.63436075616405e-56	31854794	32515876
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	45	-0.4566	1.63436075616405e-56	31854794	32515876	1.27400996404938e-50	33536526	33842125
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	33830585	1	0	NA	1.27400996404938e-50	33536526	33842125	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	57203733	4289	4172	0.0021	NA	NA	NA	3.12358964628697e-16	57203733	57203733
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.2401	3.12358964628697e-16	57203733	57203733	3.77841239433765e-17	57206772	57206772
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5440	0.0205	3.77841239433765e-17	57206772	57206772	5.2308474754997e-152	75093957	75093957
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.5504	5.2308474754997e-152	75093957	75093957	1.20636445753387e-135	75100865	75100865
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4989	-0.0061	1.20636445753387e-135	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	831	0.052	NA	NA	NA	1.75544772013505e-32	1904451	1904451
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.5255	1.75544772013505e-32	1904451	1904451	6.77438388783382e-38	1906391	1906391
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	24195451	8112	7861	0.0237	6.77438388783382e-38	1906391	1906391	3.82307895153175e-27	24195451	24195451
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24198397	24201924	5	5	-0.9645	3.82307895153175e-27	24195451	24195451	1.57624559486337e-26	24201924	24201924
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24204545	31457889	3063	2969	0.0209	1.57624559486337e-26	24201924	24201924	1.57565446460621e-20	31443186	31467971
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.3514	1.57565446460621e-20	31443186	31467971	3.51221775892141e-14	31492553	31893451
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	34442393	847	823	0.0333	3.51221775892141e-14	31492553	31893451	3.17142583653971e-11	34442393	34442393
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34445816	34446608	2	2	-0.9853	3.17142583653971e-11	34442393	34442393	1.00895547653214e-10	34446608	34446608
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34451067	36673853	966	939	0.0434	1.00895547653214e-10	34446608	34446608	0	36673853	36673853
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	-3.8905	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1981	0.0562	0	36684619	36684619	2.30965064681107e-35	41564408	41568539
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41624013	26	26	-0.4622	2.30965064681107e-35	41564408	41568539	0.00540165932558211	41611916	41697532
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	41710400	19	19	-0.2653	0.00540165932558211	41611916	41697532	1.71456300978224e-12	41697532	42155643
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52435609	3478	3384	0.0182	1.71456300978224e-12	41697532	42155643	4.30952372644839e-13	52429338	52435609
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52438207	52454171	6	6	0.4313	4.30952372644839e-13	52429338	52435609	7.76451041057263e-07	52454171	52469156
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52455229	58772402	2571	2491	0.0332	7.76451041057263e-07	52454171	52469156	2.78625275957835e-09	58772402	58772402
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58774596	58779216	2	2	-0.8851	2.78625275957835e-09	58772402	58772402	3.27448904533477e-08	58779216	58779216
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58779398	78653545	7622	7448	0.0256	3.27448904533477e-08	58779216	58779216	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15766	-0.0062	NA	NA	NA	1.88656637370927e-21	53092949	53092949
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.3737	1.88656637370927e-21	53092949	53092949	7.75540812851942e-21	53099601	53099601
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6569	-0.0109	7.75540812851942e-21	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	483	0.0566	NA	NA	NA	1.07077144010997e-33	1398325	1398325
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9529	1.07077144010997e-33	1398325	1398325	2.18508977419623e-34	1400840	1400840
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	14316563	5893	5729	0.0495	2.18508977419623e-34	1400840	1400840	1.86419694723764e-08	14312841	14316563
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14319043	14332781	3	3	0.8414	1.86419694723764e-08	14312841	14316563	2.65327009771864e-11	14332781	14335230
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14335230	36530816	4798	4654	0.033	2.65327009771864e-11	14332781	14335230	2.78834661557812e-10	36526750	36533954
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36533954	36540947	5	4	0.529	2.78834661557812e-10	36526750	36533954	0.000113341733336020	36537505	36543744
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36542243	63788698	11866	11556	0.028	0.00011334173333602	36537505	36543744	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	570	-0.0026	NA	NA	NA	4.97599564987894e-10	1506379	1506379
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	2	-1.0443	4.97599564987894e-10	1506379	1506379	0.0272969887435348	1516966	1523000
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-3.2015	0.0272969887435348	1516966	1523000	0	1531162	1531162
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20417	-0.002	0	1531162	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13066	-0.0062	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1103	0.0204	NA	NA	NA	4.36976861749813e-15	18125356	18125356
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	1.2229	4.36976861749813e-15	18125356	18125356	7.94891847422338e-14	18129194	18129194
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	21570227	1386	1351	0.001	7.94891847422338e-14	18129194	18129194	2.41988965100159e-13	21570227	21570227
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21571489	21576859	4	4	0.8503	2.41988965100159e-13	21570227	21570227	8.47913275855527e-12	21576859	21579649
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22603439	454	441	0.0124	8.47913275855527e-12	21576859	21579649	1.06388588700261e-21	22599899	22643742
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22618049	22725305	27	26	-0.4443	1.06388588700261e-21	22599899	22643742	8.19768266611613e-30	22718614	22736990
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6365	0.0125	8.19768266611613e-30	22718614	22736990	4.06194512031321e-38	35472378	35472378
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.8518	4.06194512031321e-38	35472378	35472378	1.12175286133030e-34	35476942	35476942
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49491186	6977	6767	0.0187	1.1217528613303e-34	35476942	35476942	1.41337117086597e-24	49406014	49515840
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49492106	49571068	26	25	-0.1388	1.41337117086597e-24	49406014	49515840	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0516	NA	NA	NA	5.80229846918616e-12	4926	94062
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	106242	8	8	0.9111	5.80229846918616e-12	4926	94062	7.40533966787353e-20	106242	108902
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	266212	113	109	0.0171	7.40533966787353e-20	106242	108902	2.43130332612005e-11	266212	266212
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.3538	2.43130332612005e-11	266212	266212	8.30580195970271e-18	267079	267079
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	742385	367	353	0.0565	8.30580195970271e-18	267079	267079	1.32190993649377e-16	742385	742385
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	744659	2	2	-1.1968	1.32190993649377e-16	742385	742385	1.49592513087090e-13	744659	744659
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747220	2302065	902	876	0.0372	1.4959251308709e-13	744659	744659	3.16027907780517e-121	2302065	2302065
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	-2.5939	3.16027907780517e-121	2302065	2302065	3.55988680051215e-101	2304008	2304398
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2426938	136	132	0.023	3.55988680051215e-101	2304008	2304398	2.33963815154340e-41	2426938	2426938
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	2.0731	2.3396381515434e-41	2426938	2426938	1.79344018635249e-41	2428307	2428307
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2673365	226	221	0.0452	1.79344018635249e-41	2428307	2428307	6.07593881521712e-13	2670510	2687501
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	24	-0.3177	6.07593881521712e-13	2670510	2687501	6.63758949118462e-144	2708291	2708291
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	13679455	4075	3982	0.876	6.63758949118462e-144	2708291	2708291	1.09799326738995e-20	13677276	13681110
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	3	0.1548	1.09799326738995e-20	13677276	13681110	1.07585183069893e-15	13683888	13688061
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	154582414	41056	39959	0.905	1.07585183069893e-15	13683888	13688061	0	154578922	154582414
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0138	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	117	-4.7423	NA	NA	NA	6.49036304336073e-29	3219200	3772482
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	6.49036304336073e-29	3219200	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4846477	12	11	-1.1847	NA	NA	NA	6.53076367186779e-14	4597974	5531459
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4948824	7054924	179	171	-4.2361	6.53076367186779e-14	4597974	5531459	3.07668528404356e-06	7022973	7231063
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-3.3552	3.07668528404356e-06	7022973	7231063	1.27727356737703e-07	7372772	7598374
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7709619	66	64	-4.6594	1.27727356737703e-07	7372772	7598374	1.93558287377214e-07	7694197	7714929
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	25	-3.1559	1.93558287377214e-07	7694197	7714929	0.000266616880942376	7749796	7807668
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-4.323	0.000266616880942376	7749796	7807668	0.000288920268208566	7893056	7905286
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.6274	0.000288920268208566	7893056	7905286	1.25755033339283e-06	7914104	7919636
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	373	-4.4952	1.25755033339283e-06	7914104	7919636	3.67308007803271e-49	10515697	10515697
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.4809	3.67308007803271e-49	10515697	10515697	4.12704976105433e-07	10645500	11673476
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13119344	205	198	-3.2317	4.12704976105433e-07	10645500	11673476	0.0403207907895551	12924438	13119344
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.3959	0.0403207907895551	12924438	13119344	4.00888565117655e-06	13128515	13129843
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13254711	42	41	-3.8841	4.00888565117655e-06	13128515	13129843	0.000149709450651275	13164641	13313420
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13537520	133	124	-4.5721	0.000149709450651275	13164641	13313420	3.18945236338873e-05	13510282	13558000
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13539170	13701755	43	40	-3.8673	3.18945236338873e-05	13510282	13558000	8.2345005887717e-07	13606316	13777254
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13705594	14342834	191	183	-4.6476	8.2345005887717e-07	13606316	13777254	1.42579541493263e-12	14322984	14375855
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	91	-3.7747	1.42579541493263e-12	14322984	14375855	1.80411452513528e-12	14503185	14508021
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.80411452513528e-12	14503185	14508021	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14549297	13	11	-1.2921	NA	NA	NA	3.34128110385892e-05	14539230	14549297
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14550971	14563486	8	7	-2.6799	3.34128110385892e-05	14539230	14549297	4.6572519085701e-21	14563486	14563486
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14566592	14579298	4	4	-0.5385	4.6572519085701e-21	14563486	14563486	3.59949416616188e-07	14579298	14585542
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	400	-4.1404	3.59949416616188e-07	14579298	14585542	4.03954708413005e-05	15801779	15937162
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15980898	22	21	-2.8203	4.03954708413005e-05	15801779	15937162	9.79290904055123e-07	15975479	15980898
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15982684	15998663	8	8	-4.5959	9.79290904055123e-07	15975479	15980898	0.00502549806177701	15998663	16017681
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16002819	16002819	1	0	NA	0.00502549806177701	15998663	16017681	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16004746	16035717	12	12	-3.6445	NA	NA	NA	1.63310477930585e-07	16035717	16035717
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.6304	1.63310477930585e-07	16035717	16035717	1.59234147663717e-05	16042966	16042966
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16071977	11	10	-3.5094	1.59234147663717e-05	16042966	16042966	0.0895491825830027	16062961	16371504
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16072965	16387273	102	98	-4.1324	0.0895491825830027	16062961	16371504	0.0405977711583795	16100397	16774581
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	19610243	377	365	-4.4952	0.0405977711583795	16100397	16774581	1.47643031202579e-07	19608039	19610243
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.4172	1.47643031202579e-07	19608039	19610243	4.26020190183279e-20	19613864	19613864
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	19693919	40	38	-4.5354	4.26020190183279e-20	19613864	19613864	0.00105353999498558	19673058	19771150
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19695980	19948843	41	41	-3.963	0.00105353999498558	19673058	19771150	0.000246846796693458	19883469	20104851
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19949944	20384639	134	127	-4.6147	0.000246846796693458	19883469	20104851	1.66755995301530e-06	20367138	20384639
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20387629	20393111	3	3	-1.912	1.6675599530153e-06	20367138	20384639	1.12791383676052e-11	20393111	20393111
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20400879	21036411	73	70	-4.5757	1.12791383676052e-11	20393111	20393111	8.05988109289615e-10	21034708	21036411
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-2.9449	8.05988109289615e-10	21034708	21036411	0.000109617308679792	21054519	21066129
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	0.000109617308679792	21054519	21066129	NA	NA	NA
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	243	-4.5303	NA	NA	NA	5.48033185301913e-10	22056953	22139807
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.5102	5.48033185301913e-10	22056953	22139807	2.05989139363351e-20	22177335	22178964
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	86	-4.8531	2.05989139363351e-20	22177335	22178964	4.83950104498505e-138	22930737	23283689
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.1717	4.83950104498505e-138	22930737	23283689	0.000281921626713362	26943701	27007874
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.6203	0.000281921626713362	26943701	27007874	4.60581918294209e-05	27006628	27039222
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.37	4.60581918294209e-05	27006628	27039222	1.48318864313815e-11	27137064	27163598
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-2.8921	1.48318864313815e-11	27137064	27163598	2.05962211040427e-10	27172283	27176933
MSK_252152912741_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.223	2.05962211040427e-10	27172283	27176933	NA	NA	NA
