Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	15157302	5073	4982	0.0197	NA	NA	NA	1.43093288897316e-08	15155742	15157302
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15158665	15162189	3	3	-0.72	1.43093288897316e-08	15155742	15157302	1.80073139496349e-07	15162189	15163929
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15163929	16838573	712	701	0.0117	1.80073139496349e-07	15162189	15163929	1.37385147436449e-08	16713074	16963812
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17127039	19	19	-0.306	1.37385147436449e-08	16713074	16963812	4.10246950349749e-09	17102601	17158730
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	34869589	7087	6980	0.0048	4.10246950349749e-09	17102601	17158730	1.38153011605105e-10	34859068	34869589
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.72	1.38153011605105e-10	34859068	34869589	2.5823335402724e-11	34883375	34884849
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14752	-0.0014	2.5823335402724e-11	34883375	34884849	0	72537426	72537426
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.1485	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6885	7e-04	0	72579311	72579311	1.35652009285013e-15	94060783	94060783
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-1.1465	1.35652009285013e-15	94060783	94060783	1.01088415553954e-15	94062928	94062928
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	109373255	4414	4358	9e-04	1.01088415553954e-15	94062928	94062928	5.31825275443234e-09	109373255	109373255
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.8787	5.31825275443234e-09	109373255	109373255	2.22103630890168e-08	109376249	109383196
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109379566	1	0	NA	2.22103630890168e-08	109376249	109383196	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109383196	109987341	279	275	6e-04	NA	NA	NA	7.25612118722412e-72	109987341	109987341
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-2.554	7.25612118722412e-72	109987341	109987341	7.03950045527013e-34	109989998	109989998
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110033018	14	14	-0.0528	7.03950045527013e-34	109989998	109989998	4.67556916714600e-08	110033018	110033018
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.0516	4.675569167146e-08	110033018	110033018	8.75978131783978e-13	110039388	110039388
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147329819	4563	4492	-0.0087	8.75978131783978e-13	110039388	110039388	4.33204301473420e-16	147311437	147352661
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346371	147497268	27	26	0.3206	4.3320430147342e-16	147311437	147352661	8.57165012647957e-16	147475854	148081741
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150839754	1264	1244	6e-04	8.57165012647957e-16	147475854	148081741	2.57548053718192e-107	150839754	150839754
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	-1.9237	2.57548053718192e-107	150839754	150839754	4.13722471366588e-56	150851439	150851439
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	0.0027	4.13722471366588e-56	150851439	150851439	3.4048363139583e-207	151026228	151026228
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.5399	3.4048363139583e-207	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2648	0.0024	0	151036435	151036435	5.94805788120779e-150	157133150	157133150
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.5892	5.94805788120779e-150	157133150	157133150	2.68781427554862e-154	157136342	157136342
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4042	-0.0096	2.68781427554862e-154	157136342	157136342	2.07177685051216e-16	167481271	167493768
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167520743	9	9	-0.5702	2.07177685051216e-16	167481271	167493768	4.23659340595613e-17	167507898	167523140
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	185979586	7208	7094	-0.0038	4.23659340595613e-17	167507898	167523140	4.27538139746214e-19	185979586	185979586
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.2719	4.27538139746214e-19	185979586	185979586	1.43578751992387e-19	185988138	185988138
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1465	-0.0034	1.43578751992387e-19	185988138	185988138	1.60159768813611e-16	192715640	192715640
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.1593	1.60159768813611e-16	192715640	192715640	1.56491353018968e-15	192719540	192719540
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	200596027	2642	2606	0.0054	1.56491353018968e-15	192719540	192719540	1.5501360861437e-13	200584100	200616638
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200598243	1	0	NA	1.5501360861437e-13	200584100	200616638	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200672373	27	27	-0.2903	NA	NA	NA	2.50391609435836e-12	200659076	200689399
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	227875096	9936	9772	-0.0042	2.50391609435836e-12	200659076	200689399	6.82939897743171e-15	227872808	227875096
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8157	6.82939897743171e-15	227872808	227875096	5.15227678137797e-15	227882805	227889619
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246769018	7355	7237	-0.0055	5.15227678137797e-15	227882805	227889619	1.36672944917486e-24	246753652	246794552
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	26	0.3659	1.36672944917486e-24	246753652	246794552	1.67391337612866e-14	246858820	246878405
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	97	0.0416	1.67391337612866e-14	246858820	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13113316	4162	4085	-0.0032	NA	NA	NA	5.74177844009408e-30	13108673	13113316
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.5814	5.74177844009408e-30	13108673	13113316	4.31950542100991e-28	13199426	13200787
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	33076512	6700	6596	-0.0056	4.31950542100991e-28	13199426	13200787	1.21394034594652e-12	33076512	33076512
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.0506	1.21394034594652e-12	33076512	33076512	5.96179852229899e-14	33080437	33080437
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	628	0.0072	5.96179852229899e-14	33080437	33080437	6.13714357454778e-10	34527334	34552935
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	6.13714357454778e-10	34527334	34552935	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34579933	13	13	0.3564	NA	NA	NA	7.98033063264549e-10	34575366	34591681
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	52600588	7196	7070	-0.004	7.98033063264549e-10	34575366	34591681	5.68461312224627e-18	52588009	52600588
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.7703	5.68461312224627e-18	52588009	52600588	2.93732086065061e-17	52635695	52639605
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	242493814	59020	58046	-0.0014	2.93732086065061e-17	52635695	52639605	4.00120552445619e-14	242471854	242542268
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242495169	242689978	70	68	0.1895	4.00120552445619e-14	242471854	242542268	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	5526424	2049	2011	-1e-04	NA	NA	NA	1.87038824834921e-89	5517937	5526424
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	5536496	5946483	49	48	0.5448	1.87038824834921e-89	5517937	5526424	5.07001690900156e-86	5946483	5965081
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	5965081	89475107	28543	28067	-0.0014	5.07001690900156e-86	5946483	5965081	1.25710525613075e-71	89475107	89475107
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89502757	14	14	-0.9249	1.25710525613075e-71	89475107	89475107	1.49099449851772e-72	89502757	89502757
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89504141	99891210	1528	1500	0.002	1.49099449851772e-72	89502757	89502757	3.83405750524808e-09	99891210	99891210
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	0.8899	3.83405750524808e-09	99891210	99891210	5.17298582021544e-09	99897201	99897201
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20958	-0.0019	5.17298582021544e-09	99897201	99897201	3.99194420451964e-170	164005577	164005577
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.3407	3.99194420451964e-170	164005577	164005577	1.44586306837689e-51	164027724	164027724
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5552	1.44586306837689e-51	164027724	164027724	4.66322525331959e-38	164105613	164112873
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9969	4e-04	4.66322525331959e-38	164105613	164112873	0	194354505	194354505
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.9662	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196924077	1011	997	-0.0157	0	194366950	194366950	1.26113581599118e-13	196917657	196928503
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196924340	196961238	16	16	-0.3925	1.26113581599118e-13	196917657	196928503	7.57931035413018e-13	196950095	196969782
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	939	-0.0033	7.57931035413018e-13	196950095	196969782	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	63808626	17284	17027	-0.0013	NA	NA	NA	5.80339610927107e-11	63803025	63808626
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63817412	63830459	3	3	-0.8055	5.80339610927107e-11	63803025	63808626	9.35257599685723e-12	63830459	63842706
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63842706	68905670	1146	1126	0.0078	9.35257599685723e-12	63830459	63842706	0	68905670	68905670
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-4.3695	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	92288271	7918	7796	-2e-04	0	69165814	69165814	5.43810170010743e-12	92288271	92288271
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92295210	92299709	3	3	-0.8169	5.43810170010743e-12	92288271	92288271	7.03957883883019e-12	92299709	92299709
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92306592	173660684	23467	23098	-6e-04	7.03957883883019e-12	92299709	92299709	3.48605003428931e-14	173660684	173660684
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.0852	3.48605003428931e-14	173660684	173660684	1.66156046717222e-14	173666072	173666072
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	4008	-0.001	1.66156046717222e-14	173666072	173666072	2.03334980787765e-283	187330240	187330240
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.7056	2.03334980787765e-283	187330240	187330240	1.32117262735487e-274	187333619	187333619
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1225	-0.0081	1.32117262735487e-274	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	4010810	1234	1218	0.0111	NA	NA	NA	3.05087998242518e-13	4008791	4010810
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	4015026	4021286	4	4	-0.8164	3.05087998242518e-13	4008791	4010810	9.27342391436086e-17	4021286	4029362
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	4029362	12857302	2737	2693	-0.0058	9.27342391436086e-17	4021286	4029362	0	12857302	12857302
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-5.0872	0	12857302	12857302	0	12873052	12873052
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	68885350	15073	14837	-0.0021	0	12873052	12873052	4.5488725567189e-12	68885350	68885350
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70343857	70345552	2	2	1.0125	4.5488725567189e-12	68885350	68885350	6.71364428770801e-12	70345552	70345552
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70405656	155405839	26431	26020	-0.0013	6.71364428770801e-12	70345552	70345552	0	155405839	155405839
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-4.7449	0	155405839	155405839	0	155421443	155421443
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	172345157	5486	5404	-0.0032	0	155421443	155421443	3.81848981740605e-10	172345157	172345157
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172348216	172349917	2	2	-0.9454	3.81848981740605e-10	172345157	172345157	8.23692091003261e-10	172349917	172349917
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172351264	180342860	2670	2623	0.0112	8.2369209100326e-10	172349917	172349917	2.13177172940051e-24	180342860	180342860
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180346557	2	2	-1.4745	2.13177172940051e-24	180342860	180342860	7.12798202714054e-19	180346557	180346557
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-4.8096	7.12798202714054e-19	180346557	180346557	0	180358977	180358977
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	110	-0.0357	0	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	200350	39	39	0.0295	NA	NA	NA	2.76787606401874e-09	183349	204881
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	236535	14	14	0.306	2.76787606401874e-09	183349	204881	9.2449238954556e-08	234115	246974
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	7867006	3039	2997	-0.0032	9.2449238954556e-08	234115	246974	5.532686739792e-14	7867006	7867006
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	7877115	7879495	3	3	-0.8867	5.532686739792e-14	7867006	7867006	1.50568213659309e-13	7879495	7879495
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	7882198	31382291	8084	7957	-2e-04	1.50568213659309e-13	7879495	7879495	5.0908138597255e-22	31382291	31383925
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31390982	5	5	-0.8681	5.0908138597255e-22	31382291	31383925	2.52873453663866e-22	31389372	31390982
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32548736	491	482	0.0216	2.52873453663866e-22	31389372	31390982	4.01338411953687e-36	32548736	32558677
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	0.9213	4.01338411953687e-36	32548736	32558677	3.28597989240782e-38	32593151	32595402
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	54035000	8305	8162	5e-04	3.28597989240782e-38	32593151	32595402	0	54035000	54035000
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.535	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2363	-0.0044	0	54042734	54042734	1.30082055126350e-13	65767409	65767409
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.0532	1.3008205512635e-13	65767409	65767409	9.7949085127599e-13	65771532	65771532
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	79018959	4032	3981	0.0045	9.7949085127599e-13	65771532	65771532	3.13624652150976e-14	79011979	79018959
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.4424	3.13624652150976e-14	79011979	79018959	1.82505051040268e-15	79091850	79101978
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	134629897	17246	16968	-0.001	1.82505051040268e-15	79091850	79101978	3.6524363341042e-17	134627341	134629897
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134639397	5	5	-0.7521	3.6524363341042e-17	134627341	134629897	2.79316695416345e-16	134639397	134641054
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134641054	170753106	12429	12222	-0.007	2.79316695416345e-16	134639397	134641054	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	258	0.0209	NA	NA	NA	5.48626032379751e-09	1038517	1038517
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.094	5.48626032379751e-09	1038517	1038517	1.41879639464041e-13	1047707	1047707
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	38258332	13338	13134	2e-04	1.41879639464041e-13	1047707	1047707	4.45743992643435e-56	38252620	38274436
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38347160	44	43	-0.4708	4.45743992643435e-56	38252620	38274436	1.37441403794548e-48	38340009	38360187
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38349033	39966287	683	676	-0.0108	1.37441403794548e-48	38340009	38360187	2.93214907100431e-18	39966287	39966287
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	39974922	39978230	4	4	-0.8835	2.93214907100431e-18	39966287	39966287	1.65948035985405e-17	39978230	39978230
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	39981616	69953732	6717	6605	-3e-04	1.65948035985405e-17	39978230	39978230	7.76330072692679e-22	69953732	69953732
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69960167	69993947	5	5	0.8787	7.76330072692679e-22	69953732	69953732	2.56013036290831e-18	69993947	70008248
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	70008248	73463437	1208	1188	0.0047	2.56013036290831e-18	69993947	70008248	4.36614889915840e-08	73458606	73465372
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	73465372	73470313	3	3	0.7672	4.3661488991584e-08	73458606	73465372	1.25995862745542e-10	73470313	73471982
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	73471982	81792312	2473	2428	-0.0015	1.25995862745542e-10	73470313	73471982	2.38752626703851e-09	81791206	81792312
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	81794051	81796004	2	2	-0.8859	2.38752626703851e-09	81791206	81792312	2.96264007432742e-09	81796004	81797260
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	81797260	93162991	3709	3671	4e-04	2.96264007432742e-09	81796004	81797260	9.26165443200068e-12	93162991	93162991
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.9934	9.26165443200068e-12	93162991	93162991	4.72607917298637e-11	93168978	93168978
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	109217320	6511	6395	0.0069	4.72607917298637e-11	93168978	93168978	0	109217320	109217320
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.2155	0	109217320	109217320	7.10845933795676e-06	109233214	109233214
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.3142	7.10845933795676e-06	109233214	109233214	9.80955570027222e-21	109240210	109240210
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	118611324	4299	4226	-0.0026	9.80955570027222e-21	109240210	109240210	7.38108232705793e-47	118611324	118611324
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	-1.9873	7.38108232705793e-47	118611324	118611324	2.01179459367464e-45	118619693	118619693
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118620875	1	0	NA	2.01179459367464e-45	118619693	118619693	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3124	0.0028	NA	NA	NA	9.51546638959023e-32	125831554	125831554
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3359	9.51546638959023e-32	125831554	125831554	2.71111826288532e-29	125837524	125837524
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3577	-0.0078	2.71111826288532e-29	125837524	125837524	1.91879210720132e-26	133432281	133433384
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7748	1.91879210720132e-26	133432281	133433384	4.03430623266573e-29	133448277	133453811
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3645	-0.0027	4.03430623266573e-29	133448277	133453811	1.71804056566737e-20	141409512	141417702
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5125	1.71804056566737e-20	141409512	141417702	2.63448966888393e-18	141434131	141442231
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141765117	149	146	-0.0139	2.63448966888393e-18	141434131	141442231	3.4945399544888e-09	141741655	141818470
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141766588	142202274	160	158	-0.1807	3.4945399544888e-09	141741655	141818470	1.87522023789794e-19	142118024	142235705
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142205830	144632522	889	875	-0.0081	1.87522023789794e-19	142118024	142235705	4.62154772990538e-23	144632522	144634655
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144634655	144648838	6	6	-0.8618	4.62154772990538e-23	144632522	144634655	3.69152022328206e-25	144645634	144651451
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144651451	147702365	1435	1407	-0.005	3.69152022328206e-25	144645634	144651451	2.91181844162914e-35	147702365	147702365
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7845	2.91181844162914e-35	147702365	147702365	1.45067885727692e-33	147707161	147707161
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4182	-0.0055	1.45067885727692e-33	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	0.0159	NA	NA	NA	3.24903249274375e-264	581533	581533
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.6409	3.24903249274375e-264	581533	581533	1.08293371393787e-250	588865	588865
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	40892587	13453	13251	-0.0035	1.08293371393787e-250	588865	588865	4.40704687141165e-21	40892587	40892587
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.3645	4.40704687141165e-21	40892587	40892587	1.72482552172651e-22	40897469	40897469
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	115701209	21295	20933	-0.0014	1.72482552172651e-22	40897469	40897469	3.72346136903278e-11	115701209	115701209
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.9824	3.72346136903278e-11	115701209	115701209	3.08667168158615e-12	115711730	115711730
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9552	7e-04	3.08667168158615e-12	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7883	-0.0031	NA	NA	NA	1.82421232991772e-12	23338535	23343915
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.8287	1.82421232991772e-12	23338535	23343915	5.98021787835829e-12	23365926	23365926
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4975	-0.0011	5.98021787835829e-12	23365926	23365926	4.03786730822617e-39	70926188	70926188
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8051	4.03786730822617e-39	70926188	70926188	4.76535451297147e-38	70930528	70930528
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	75177268	1792	1761	-0.0069	4.76535451297147e-38	70930528	70930528	1.68267457880356e-16	75177268	75177268
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75208977	75213550	2	2	-1.2112	1.68267457880356e-16	75177268	75177268	1.26692090578483e-16	75213550	75213550
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75221525	100348045	8125	7981	-0.0056	1.26692090578483e-16	75213550	75213550	5.94690429841429e-73	100348045	100348045
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.5274	5.94690429841429e-73	100348045	100348045	2.69055377998637e-76	100350814	100350814
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116122595	5546	5456	-0.0061	2.69055377998637e-76	100350814	100350814	8.94594707449976e-17	116122595	116122595
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116124007	116124007	1	0	NA	8.94594707449976e-17	116122595	116122595	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1795	NA	NA	NA	3.39390636465711e-14	116130333	116130333
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8154	0	3.39390636465711e-14	116130333	116130333	7.70646484560311e-17	137352394	137352394
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.28	7.70646484560311e-17	137352394	137352394	5.69283393877014e-13	137356880	137356880
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1079	0.0207	5.69283393877014e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27641594	9968	9784	-0.0049	NA	NA	NA	3.41745232958094e-15	27638430	27641594
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27646617	27665830	8	8	-0.574	3.41745232958094e-15	27638430	27641594	0.00050585274222014	27660321	27690433
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27669846	27745873	31	30	-0.9752	0.00050585274222014	27660321	27690433	2.95736742520036e-162	27745873	27745873
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27761657	31284926	1285	1269	-0.0066	2.95736742520036e-162	27745873	27745873	1.05496055399887e-16	31284926	31284926
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.9838	1.05496055399887e-16	31284926	31284926	2.09638609986840e-16	31291525	31291525
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917893	13297	13074	-0.0033	2.0963860998684e-16	31291525	31291525	2.58393345144419e-150	77917893	77917893
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.9151	2.58393345144419e-150	77917893	77917893	1.94995300085015e-148	77928738	77928738
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100676022	7762	7639	-0.0023	1.94995300085015e-148	77928738	77928738	5.77231409270909e-15	100676022	100676022
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-0.9436	5.77231409270909e-15	100676022	100676022	1.22236779446654e-15	100686753	100686753
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	123955023	8396	8250	-0.001	1.22236779446654e-15	100686753	100686753	8.20808197744705e-07	123947043	123957735
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123956449	123974228	9	9	-0.3701	8.20808197744705e-07	123947043	123957735	4.3702661072926e-06	123969584	123981980
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123976281	127169193	1166	1153	-0.0132	4.3702661072926e-06	123969584	123981980	1.71666358712449e-20	127165941	127169193
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127171902	127232555	13	13	0.5185	1.71666358712449e-20	127165941	127169193	3.48785082773021e-19	127232555	127236733
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127234886	135285645	2864	2820	-0.0079	3.48785082773021e-19	127232555	127236733	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18896166	7372	7260	0.0025	NA	NA	NA	1.17231570393834e-13	18890351	18896166
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.5609	1.17231570393834e-13	18890351	18896166	8.72540709645934e-11	18917191	18932031
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55124730	9529	9361	-0.0014	8.72540709645934e-11	18917191	18932031	1.36310397867663e-41	55118214	55129329
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55209626	37	37	0.4313	1.36310397867663e-41	55118214	55129329	2.41257873609678e-36	55205278	55221692
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4551	0.0102	2.41257873609678e-36	55205278	55221692	2.95260239537016e-11	66463477	66463477
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0328	2.95260239537016e-11	66463477	66463477	5.57320643282439e-12	66469412	66469412
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	106733851	13398	13188	-0.0021	5.57320643282439e-12	66469412	66469412	0	106733851	106733851
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-4.725	0	106733851	106733851	0	106747920	106747920
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	10157	-0.0054	0	106747920	106747920	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3689	-2e-04	NA	NA	NA	1.16004507656513e-188	9523923	9523923
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9531133	2	2	-4.1296	1.16004507656513e-188	9523923	9523923	0.00692738027204687	9531133	9531133
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9543817	9550789	2	2	-1.6364	0.00692738027204687	9531133	9531133	0.0092342929228162	9550789	9550789
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	9554149	1	0	NA	0.0092342929228162	9550789	9550789	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9626623	12	10	-0.3791	NA	NA	NA	1.95249431737614e-07	9604633	9630105
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11116883	570	561	-0.0228	1.95249431737614e-07	9604633	9630105	1.98160892773418e-45	11116883	11116883
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.0097	1.98160892773418e-45	11116883	11116883	2.08089091960487e-30	11140421	11140421
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11393473	69	69	-0.001	2.08089091960487e-30	11140421	11140421	1.29060456741737e-06	11376829	11419189
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11395862	11440927	8	8	-0.4371	1.29060456741737e-06	11376829	11419189	5.73256470295951e-09	11433210	11468938
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	28486517	6043	5956	0.0018	5.73256470295951e-09	11433210	11468938	2.45616994670464e-14	28486517	28489394
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28489394	28492064	3	3	-0.8937	2.45616994670464e-14	28486517	28489394	6.61953675557929e-14	28490565	28492064
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28493347	73782425	14591	14375	0.0047	6.61953675557929e-14	28490565	28492064	2.40730289566491e-18	73782425	73788595
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73784583	73784583	1	0	NA	2.40730289566491e-18	73782425	73788595	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73788595	73793215	3	3	-1.0217	NA	NA	NA	1.78307026532198e-17	73789955	73793215
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73795671	132289090	20107	19770	-0.0013	1.78307026532198e-17	73789955	73793215	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	12001	-0.0034	NA	NA	NA	5.72321852500304e-46	49964838	49964838
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.9675	5.72321852500304e-46	49964838	49964838	5.13694477270731e-42	49971732	49971732
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	63118944	3279	3225	-0.0025	5.13694477270731e-42	49971732	49971732	3.07339110241316e-14	63118944	63118944
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-1.1438	3.07339110241316e-14	63118944	63118944	3.57786718796179e-17	63130828	63130828
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	68132217	1228	1205	-1e-04	3.57786718796179e-17	63130828	63130828	2.8766044762369e-08	68124722	68136198
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68134536	68163523	14	13	0.3166	2.8766044762369e-08	68124722	68136198	1.08783007678777e-07	68158986	68172973
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	901	0.0039	1.08783007678777e-07	68158986	68172973	0	71375082	71375082
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-5.1408	0	71375082	71375082	0	71377671	71377671
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13761	-0.0016	0	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	58	-0.6882	NA	NA	NA	4.30697641196620e-138	19492531	19497023
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21504232	980	958	-0.0118	4.3069764119662e-138	19492531	19497023	2.59024304643912e-185	21501507	21511829
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21505880	22032374	261	257	-0.4277	2.59024304643912e-185	21501507	21511829	1.58309020073826e-257	22025617	22035729
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22034704	34674458	4449	4371	-0.0034	1.58309020073826e-257	22025617	22035729	4.62352861905581e-29	34674458	34674458
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.279	4.62352861905581e-29	34674458	34674458	4.25771466525708e-31	34683810	34683810
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1870	0.0048	4.25771466525708e-31	34683810	34683810	4.91641503667228e-13	40670538	40676611
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.5415	4.91641503667228e-13	40670538	40676611	4.31356976771197e-12	40722360	40741934
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73306411	11865	11668	-0.0023	4.31356976771197e-12	40722360	40741934	8.61839050164745e-24	73304106	73306411
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73307681	73315317	5	5	-0.8841	8.61839050164745e-24	73304106	73306411	6.53846696008075e-21	73315317	73315317
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	79174722	2816	2766	-0.0025	6.53846696008075e-21	73315317	73315317	0	79174722	79174722
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-4.5032	0	79174722	79174722	0	79183154	79183154
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	104674495	9057	8913	-1e-04	0	79183154	79183154	3.15801869466627e-07	104664322	104679956
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	104678746	104694951	7	7	0.4457	3.15801869466627e-07	104664322	104679956	1.05580220987322e-05	104688435	104703676
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	104696534	105602602	234	229	-0.0089	1.05580220987322e-05	104688435	104703676	1.65481829561196e-09	105594189	105602602
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105632168	11	10	-0.4975	1.65481829561196e-09	105594189	105602602	5.75759115831471e-07	105632168	105724133
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	47	-0.0052	5.75759115831471e-07	105632168	105724133	2.94355108849969e-06	105839439	105856972
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.5556	2.94355108849969e-06	105839439	105856972	1.64372360488151e-08	105875924	105898108
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	171	0.0227	1.64372360488151e-08	105875924	105898108	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0913	NA	NA	NA	2.80480271229389e-08	18432558	18749895
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19800789	94	93	-0.475	2.80480271229389e-08	18432558	18749895	4.30571594148994e-07	19394203	19874677
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	20088256	56	54	-0.6804	4.30571594148994e-07	19394203	19874677	5.58478460892855e-146	20079935	20308014
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	30664	-0.0045	5.58478460892855e-146	20079935	20308014	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5369	0.0032	NA	NA	NA	3.6180395110053e-08	14674185	14956252
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15023848	12	12	-0.3666	3.6180395110053e-08	14674185	14956252	2.65660275286245e-08	15009449	15039224
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15028108	32379126	5093	5014	0.0029	2.65660275286245e-08	15009449	15039224	2.66735834619170e-16	31841022	32527388
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	46	0.264	2.6673583461917e-16	31841022	32527388	2.49166278946238e-12	33527454	33868686
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	34325501	89	88	-0.0198	2.49166278946238e-12	33527454	33868686	4.82500857096176e-43	34317157	34329518
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34329518	34602318	51	50	0.4466	4.82500857096176e-43	34317157	34329518	6.14510074122866e-59	34596655	34619028
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	54352394	2937	2887	-0.0058	6.14510074122866e-59	34596655	34619028	5.01307275432319e-29	54352394	54365385
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54368717	7	7	-0.8829	5.01307275432319e-29	54352394	54365385	0.0295006044108344	54365385	54376805
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54376805	54379839	3	3	-2.8666	0.0295006044108344	54365385	54376805	5.09736335129266e-13	54379839	54379839
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.8014	5.09736335129266e-13	54379839	54379839	4.60236675376515e-21	54400475	54408446
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	68693086	4587	4520	0.002	4.60236675376515e-21	54400475	54408446	8.29250897758507e-10	68681874	68712507
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.4259	8.29250897758507e-10	68681874	68712507	1.36244121278199e-09	68747578	68844016
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2187	-0.0048	1.36244121278199e-09	68747578	68844016	2.60390474475451e-41	75093957	75093957
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.9666	2.60390474475451e-41	75093957	75093957	5.12047314490868e-38	75100865	75100865
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	5.12047314490868e-38	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	88690571	5130	5056	-0.0058	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	412	0.0382	NA	NA	NA	1.14941117049675e-06	1027248	1028979
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.8952	1.14941117049675e-06	1027248	1028979	5.83414195558048e-08	1030766	1030766
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	15727076	5883	5786	0.0075	5.83414195558048e-08	1030766	1030766	3.53701354285941e-54	15727076	15727076
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-2.2665	3.53701354285941e-54	15727076	15727076	2.33323186303979e-56	15733964	15733964
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31457889	5733	5634	6e-04	2.33323186303979e-56	15733964	15733964	1.25892396505136e-10	31441419	31471890
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.3225	1.25892396505136e-10	31441419	31471890	1.72751567876911e-09	31483188	31897238
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	31889566	1	0	NA	1.72751567876911e-09	31483188	31897238	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	32828797	364	355	-0.0128	NA	NA	NA	3.33358401447500e-45	32828797	32828797
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.2525	3.333584014475e-45	32828797	32828797	1.63698417762319e-56	32832642	32832642
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1421	0.0036	1.63698417762319e-56	32832642	32832642	1.7639837015413e-26	36673853	36673853
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.8677	1.7639837015413e-26	36673853	36673853	3.960412742422e-24	36684619	36684619
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1988	0.0184	3.960412742422e-24	36684619	36684619	9.36297407611368e-59	41564408	41573295
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41710400	45	43	-0.4805	9.36297407611368e-59	41564408	41573295	1.56755919308982e-56	41706870	42143048
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3418	0.004	1.56755919308982e-56	41706870	42143048	3.05310167620956e-12	52438207	52440878
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.8572	3.05310167620956e-12	52438207	52440878	2.22593354222915e-11	52447064	52454171
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	10025	0.0062	2.22593354222915e-11	52447064	52454171	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	173	0.0222	NA	NA	NA	1.15315188936725e-15	500897	500897
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	-1.0488	1.15315188936725e-15	500897	500897	1.96870583449405e-13	505456	505456
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	31093690	9340	9180	-0.0021	1.96870583449405e-13	505456	505456	3.00546444752694e-09	31087146	31093690
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	31096305	31112154	8	8	0.4372	3.00546444752694e-09	31087146	31093690	6.30821298092553e-09	31112154	31116007
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	31114438	76116026	13439	13232	-0.0039	6.30821298092553e-09	31112154	31116007	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56823430	19873	19538	0.0158	NA	NA	NA	2.03016973140214e-20	56822197	56823430
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	0.7344	2.03016973140214e-20	56822197	56823430	2.15264137854691e-23	56840346	56842447
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59246409	1085	1068	-0.01	2.15264137854691e-23	56840346	56842447	6.05548689200965e-243	59246409	59246409
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-3.8746	6.05548689200965e-243	59246409	59246409	1.07776450557213e-228	59251831	59251831
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	63788698	2090	2058	0.0044	1.07776450557213e-228	59251831	59251831	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	575	-0.0048	NA	NA	NA	0	1506379	1511632
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-3.375	0	1506379	1511632	0	1525300	1531162
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20632	-0.0031	0	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13233	-0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22644243	2982	2933	0.0115	NA	NA	NA	1.45886462160427e-21	22618049	22677959
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22725305	23	23	-0.4294	1.45886462160427e-21	22618049	22677959	8.75536236951976e-23	22720195	22738466
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6428	0.001	8.75536236951976e-23	22720195	22738466	8.33254563214611e-147	35472378	35472378
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.6474	8.33254563214611e-147	35472378	35472378	6.21345392358192e-136	35476942	35476942
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	48445579	6499	6396	0.0129	6.21345392358192e-136	35476942	35476942	1.55084544872307e-08	48443348	48448446
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48446915	48455492	5	5	0.6144	1.55084544872307e-08	48443348	48448446	1.19380814790010e-06	48451678	48459461
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48458933	49571068	499	493	0.034	1.1938081479001e-06	48451678	48459461	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1431411	789	779	-6e-04	NA	NA	NA	5.68290746909264e-07	1431240	1431411
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-0.8347	5.68290746909264e-07	1431240	1431411	2.22186078639444e-07	1432953	1435082
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	2.22186078639444e-07	1432953	1435082	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2302065	608	604	-0.0023	NA	NA	NA	1.61706993582865e-25	2302065	2302065
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0812	1.61706993582865e-25	2302065	2302065	9.61708883866188e-26	2304398	2304398
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2673365	364	359	-0.0169	9.61708883866188e-26	2304398	2304398	2.76093554160427e-05	2666344	2698769
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	25	-0.2275	2.76093554160427e-05	2666344	2698769	2.48020958894057e-170	2708291	2708291
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	58499056	19198	18879	0.9505	2.48020958894057e-170	2708291	2708291	3.73670094228138e-38	58314675	61848414
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	61848414	62078907	26	25	1.5124	3.73670094228138e-38	58314675	61848414	1.11390095341475e-36	62073044	62132368
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	62132368	76998610	3715	3651	0.9435	1.11390095341475e-36	62073044	62132368	6.91164676478363e-67	76998610	76998610
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.641	6.91164676478363e-67	76998610	76998610	6.65563103062789e-72	77010018	77010018
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	153329988	21777	21388	0.9538	6.65563103062789e-72	77010018	77010018	7.04784555140338e-18	153329988	153329988
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153333629	2	2	-0.4107	7.04784555140338e-18	153329988	153329988	4.34200046930909e-17	153333629	153333629
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153335752	154582414	414	407	0.9561	4.34200046930909e-17	153333629	153333629	0	154578922	154582414
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0286	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-4.5046	NA	NA	NA	9.24138115663459e-20	3777766	4413507
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5672441	12	12	-1.628	9.2413811566346e-20	3777766	4413507	1.86516319404874e-10	4948824	6692482
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7051884	172	168	-3.9809	1.86516319404874e-10	4948824	6692482	5.62429180116932e-10	7025866	7196517
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7653082	161	161	-3.0429	5.62429180116932e-10	7025866	7196517	3.92016242557951e-05	7584183	7664085
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	44	-4.1205	3.92016242557951e-05	7584183	7664085	5.0812089158877e-09	7717556	7723783
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7745143	9	8	-1.9651	5.0812089158877e-09	7717556	7723783	5.65759142601571e-16	7745143	7745143
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7776265	7	6	-3.5254	5.65759142601571e-16	7745143	7745143	3.69854685041826e-21	7776265	7776265
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7781968	7782532	2	2	-1.1484	3.69854685041826e-21	7776265	7776265	0.00076349623541906	7782532	7788596
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-3.9658	0.00076349623541906	7782532	7788596	1.39501632094667e-06	7895945	7905286
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.9236	1.39501632094667e-06	7895945	7905286	1.74648404698989e-07	7914104	7919636
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	379	-4.0708	1.74648404698989e-07	7914104	7919636	4.67820187461802e-39	10512616	10515697
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.6518	4.67820187461802e-39	10512616	10515697	0.00386400376453602	10631941	11673476
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-2.6739	0.00386400376453602	10631941	11673476	0.00930001524741057	10655750	12502304
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.7364	0.00930001524741057	10655750	12502304	1.00410663971329e-06	12537944	12554612
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.4248	1.00410663971329e-06	12537944	12554612	7.03212606131239e-05	12608293	12772155
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12696242	2	0	NA	7.03212606131239e-05	12608293	12772155	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12700767	12924438	52	49	-3.4795	NA	NA	NA	0.000321436112151902	12872417	12997864
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13128515	81	77	-2.5347	0.000321436112151902	12872417	12997864	1.65262265142334e-07	13080405	13138841
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13264329	47	46	-3.753	1.65262265142334e-07	13080405	13138841	0.000205751723093419	13169265	13381379
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13271228	14343139	363	354	-4.3066	0.000205751723093419	13169265	13381379	1.20495678935614e-09	14240985	14384653
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14508021	95	90	-3.5953	1.20495678935614e-09	14240985	14384653	5.48474011157002e-12	14503185	14530134
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.48474011157002e-12	14503185	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14561228	20	19	-1.7373	NA	NA	NA	4.52959258725856e-15	14555872	14569287
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14563486	15318374	223	214	-3.8391	4.52959258725856e-15	14555872	14569287	1.12749111516647e-06	15291532	15322196
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15319560	15388044	42	41	-4.7927	1.12749111516647e-06	15291532	15322196	0.000420762202177606	15380259	15388044
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15389388	15398652	6	5	-3.7293	0.000420762202177606	15380259	15388044	8.24898271331485e-20	15398652	15398652
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15399621	15408015	7	7	-5.1767	8.24898271331485e-20	15398652	15398652	0.00432171484440603	15408015	15426319
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15642822	100	100	-3.6372	0.00432171484440603	15408015	15426319	3.60360661364652e-07	15573579	15675166
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15650200	15915466	44	43	-4.6621	3.60360661364652e-07	15573579	15675166	2.3523682921869e-09	15892492	15953710
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	160	-3.6593	2.3523682921869e-09	15892492	15953710	2.33787529551936e-09	16224597	16622508
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22139807	938	911	-4.2111	2.33787529551936e-09	16224597	16622508	3.16429444372289e-06	22044579	22157319
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22179794	11	11	-2.5877	3.16429444372289e-06	22044579	22157319	7.72186089563791e-09	22178964	22200078
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	22930737	91	89	-4.359	7.72186089563791e-09	22178964	22200078	5.90106382497928e-74	22926726	23283689
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.2001	5.90106382497928e-74	22926726	23283689	2.21393972085394e-05	26945084	27003308
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.9314	2.21393972085394e-05	26945084	27003308	6.55459205318161e-05	27003308	27067889
MSK_252152912764_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.8826	6.55459205318161e-05	27003308	27067889	NA	NA	NA
