Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2238560	445	432	0.0253	NA	NA	NA	2.72458195453582e-12	2229298	2238560
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2240503	2265120	11	11	0.524	2.72458195453582e-12	2229298	2238560	8.46558216371574e-18	2265120	2269096
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2269096	5942982	1163	1147	-0.0124	8.46558216371574e-18	2265120	2269096	3.65066421287787e-10	5938735	5946119
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	5944655	5969894	12	12	0.3797	3.65066421287787e-10	5938735	5946119	9.18197950870453e-08	5960596	5980469
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	5971608	12762774	2883	2849	0.0309	9.18197950870453e-08	5960596	5980469	1.05811575789128e-22	12761998	12769521
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12839991	7	7	-0.7331	1.05811575789128e-22	12761998	12769521	2.52791289479181e-21	12835156	13101056
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13101056	16923767	1271	1258	0.0101	2.52791289479181e-21	12835156	13101056	5.98050644662168e-11	16838573	16963812
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16926444	17127039	15	15	-0.3579	5.98050644662168e-11	16838573	16963812	1.87767593863355e-15	17114337	17155989
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	39897959	8986	8889	0.0259	1.87767593863355e-15	17114337	17155989	2.45035685967029e-13	39889874	39901373
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	39899835	39917181	10	10	0.3827	2.45035685967029e-13	39889874	39901373	4.48957716995096e-08	39915462	39923484
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	39919639	72537426	13091	12920	-0.0043	4.48957716995096e-08	39915462	39923484	2.09668426890782e-161	72537426	72537426
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.3946	2.09668426890782e-161	72537426	72537426	2.71667150883682e-178	72579311	72579311
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	2.71667150883682e-178	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	103904723	10104	9961	-0.0071	NA	NA	NA	5.76974920486893e-21	103901454	103909053
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	15	0.4649	5.76974920486893e-21	103901454	103909053	4.29345802271444e-21	103929627	104108153
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110014625	1581	1566	-0.0127	4.29345802271444e-21	103929627	104108153	6.71783866936686e-10	110010176	110014625
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.5333	6.71783866936686e-10	110010176	110014625	2.08991702476837e-09	110041712	110060587
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147346371	4563	4520	-0.014	2.08991702476837e-09	110041712	110060587	1.96321249973552e-13	147313991	147357754
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346399	147475854	23	23	0.3005	1.96321249973552e-13	147313991	147357754	1.5574299706904e-16	147446584	147847659
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147490553	150839754	1267	1247	0.0465	1.5574299706904e-16	147446584	147847659	5.88384526898686e-38	150839754	150841957
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	4	-1.2245	5.88384526898686e-38	150839754	150841957	1.46910256868437e-35	150848509	150851439
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2741	0.0212	1.46910256868437e-35	150848509	150851439	2.94334791707251e-23	157133150	157133150
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.445	2.94334791707251e-23	157133150	157133150	1.42124319895533e-25	157136342	157136342
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	176052614	7485	7403	-0.0116	1.42124319895533e-25	157136342	157136342	8.64969436047243e-06	176045062	176052614
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	176059581	176066981	3	3	-0.5618	8.64969436047243e-06	176045062	176052614	1.25157909890331e-05	176066981	176074013
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	176070852	192715640	5330	5260	-0.0021	1.25157909890331e-05	176066981	176074013	2.03843693438595e-12	192715640	192715640
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192723635	3	3	0.8081	2.03843693438595e-12	192715640	192715640	1.29059566145848e-11	192723635	192723635
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192727583	200596027	2641	2605	0.0063	1.29059566145848e-11	192723635	192723635	2.1236711645476e-15	200582647	200620756
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200804838	44	43	-0.2391	2.1236711645476e-15	200582647	200620756	3.11703485285695e-16	200693672	200812072
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	204975255	1759	1736	0.0177	3.11703485285695e-16	200693672	200812072	1.11320970836975e-06	204972712	204975255
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204977817	204982218	4	4	0.5584	1.11320970836975e-06	204972712	204975255	2.03815421766510e-07	204982218	204986266
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204984480	225524594	7337	7258	-0.0049	2.0381542176651e-07	204982218	204986266	9.71377930634358e-19	225524594	225526172
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	225526172	225529335	3	3	-1.0163	9.71377930634358e-19	225524594	225526172	3.66056433935786e-15	225527907	225529335
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	225533375	228522126	1022	1010	-0.0152	3.66056433935786e-15	225527907	225529335	3.72110165943264e-06	228490667	228534808
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228523973	228584379	35	34	-0.2058	3.72110165943264e-06	228490667	228534808	1.98417755183737e-07	228570092	228610203
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228586562	229983952	600	591	-0.0094	1.98417755183737e-07	228570092	228610203	3.31713784231474e-12	229974646	229988285
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229985455	230020468	19	19	0.3235	3.31713784231474e-12	229974646	229988285	9.76729772944046e-12	230013928	230029280
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	230022318	244897635	5775	5706	0.0018	9.76729772944046e-12	230013928	230029280	4.23098126601422e-09	244890119	244907498
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244899897	244937126	16	16	0.3124	4.23098126601422e-09	244890119	244907498	3.45070281174168e-07	244930655	244961159
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244939759	247186514	834	829	0.0128	3.45070281174168e-07	244930655	244961159	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	176745	51	50	0.0022	NA	NA	NA	9.48201990152557e-14	176138	183756
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179761	203774	10	10	0.5411	9.48201990152557e-14	176138	183756	0.0305639817147883	183756	203774
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205023	215025	6	6	0.2688	0.0305639817147883	183756	203774	6.99302029019978e-25	215025	239215
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	216706	27107808	8217	8114	-0.0171	6.99302029019978e-25	215025	239215	1.23395004942517e-26	27104657	27107808
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27109048	27115647	5	5	0.5062	1.23395004942517e-26	27104657	27107808	1.02957809778722e-09	27115647	27120244
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27118035	29892229	1298	1281	0.0022	1.02957809778722e-09	27115647	27120244	8.17145262980474e-10	29885483	29894769
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29894769	29923986	15	15	0.3539	8.17145262980474e-10	29885483	29894769	7.43872816311715e-11	29922279	29932261
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29926250	34543992	1920	1895	0.0053	7.43872816311715e-11	29922279	29932261	5.5096738217359e-41	34542224	34551222
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.6023	5.5096738217359e-41	34542224	34551222	6.22825370385796e-38	34583814	34591681
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35553983	381	379	-0.025	6.22825370385796e-38	34583814	34591681	1.25292550930373e-07	35552710	35553983
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-0.7958	1.25292550930373e-07	35552710	35553983	1.97638788488333e-08	35562007	35564203
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	35821494	101	99	-0.0117	1.97638788488333e-08	35562007	35564203	4.68349853819068e-14	35821494	35821494
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	0.996	4.68349853819068e-14	35821494	35821494	2.36575311481262e-13	35844884	35844884
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37800512	881	867	-0.0134	2.36575311481262e-13	35844884	35844884	6.15641971202077e-19	37789939	37813211
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37803744	1	0	NA	6.15641971202077e-19	37789939	37813211	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37810001	37855837	23	22	-0.3809	NA	NA	NA	1.81402418648596e-20	37848754	37862351
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5719	0.0109	1.81402418648596e-20	37848754	37862351	1.49906285575074e-18	52588009	52600588
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.7927	1.49906285575074e-18	52588009	52600588	9.81367435055075e-20	52635695	52635695
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	79182762	8857	8752	0.0036	9.81367435055075e-20	52635695	52635695	1.90994393190602e-21	79182762	79182762
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79184112	79196200	5	5	0.8251	1.90994393190602e-21	79182762	79182762	3.0199805318302e-19	79196200	79198028
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79198028	97059077	3387	3346	-0.0069	3.0199805318302e-19	79196200	79198028	2.58024111633647e-08	97026541	97179661
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97092174	97390919	13	13	-0.353	2.58024111633647e-08	97026541	97179661	3.66686513365153e-09	97231582	97629870
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97534597	106244482	2911	2877	-0.0156	3.66686513365153e-09	97231582	97629870	3.36295281699007e-13	106244482	106244482
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.0365	3.36295281699007e-13	106244482	106244482	4.55160041540076e-12	106250718	106250718
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	138037037	8466	8377	-0.0122	4.55160041540076e-12	106250718	106250718	1.98824177911833e-11	138037037	138037037
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	138038658	138040050	2	2	-1.0102	1.98824177911833e-11	138037037	138037037	1.76413930699767e-12	138040050	138040050
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	138044165	179767214	13902	13732	-0.0058	1.76413930699767e-12	138040050	138040050	5.13595596828919e-11	179767214	179767214
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.7678	5.13595596828919e-11	179767214	179767214	7.45788297614286e-11	179778919	179778919
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	221521431	14040	13849	0	7.45788297614286e-11	179778919	179778919	7.30075497368422e-11	221521431	221521431
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	221532971	221538566	2	2	-0.9407	7.30075497368422e-11	221521431	221521431	9.59691758678885e-11	221538566	221538566
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	221541322	232438658	3652	3613	-0.0036	9.59691758678885e-11	221538566	221538566	1.89045242413305e-09	232433938	232444294
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232440710	232456647	12	12	0.3494	1.89045242413305e-09	232433938	232444294	6.84706007165624e-10	232452428	232461063
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232457549	242689978	3836	3795	-0.0146	6.84706007165624e-10	232452428	232461063	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	13321535	4824	4785	-0.012	NA	NA	NA	5.74340907332011e-09	13312449	13335158
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	13324533	13343219	8	8	0.3965	5.74340907332011e-09	13312449	13335158	2.65946827816328e-11	13331299	13348554
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	13345430	65160634	18678	18441	-0.0032	2.65946827816328e-11	13331299	13348554	3.96855355357044e-12	65160634	65160634
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-1.038	3.96855355357044e-12	65160634	65160634	1.62106980471884e-12	65184180	65184180
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	133189686	20197	19978	-0.01	1.62106980471884e-12	65184180	65184180	3.08402313397863e-26	133189686	133189686
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4522	3.08402313397863e-26	133189686	133189686	4.9142252999787e-26	133194685	133194685
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9657	-0.0084	4.9142252999787e-26	133194685	133194685	4.2232651029578e-31	163987457	164001657
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	27	-0.4428	4.2232651029578e-31	163987457	164001657	1.40398201000478e-33	164100804	164115417
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	198012513	11580	11424	0.0042	1.40398201000478e-33	164100804	164115417	7.96401220783406e-18	198002627	198017057
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198014255	198038358	13	13	0.4774	7.96401220783406e-18	198002627	198017057	3.76516134683908e-15	198035494	198042681
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	199329592	523	514	0.0188	3.76516134683908e-15	198035494	198042681	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	37093756	10156	10024	-0.0134	NA	NA	NA	2.01703821758626e-05	37059041	37117176
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	37095546	37144124	28	28	-0.1996	2.01703821758626e-05	37059041	37117176	4.49660369559944e-10	37126326	37169545
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	37146170	68905670	8249	8159	-0.0019	4.49660369559944e-10	37126326	37169545	0	68905670	68905670
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-3.4923	0	68905670	68905670	2.82849955929053e-289	69165814	69165814
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	117	-0.0386	2.82849955929053e-289	69165814	69165814	1.12147644319893e-75	70150576	70150576
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-2.3341	1.12147644319893e-75	70150576	70150576	2.08087028236116e-140	70216707	70216707
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	138307863	20394	20122	-0.0072	2.08087028236116e-140	70216707	70216707	1.27611010526164e-52	138307863	138307863
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-2.0351	1.27611010526164e-52	138307863	138307863	5.90747485736613e-54	138319409	138319409
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	151792778	4308	4265	-0.0058	5.90747485736613e-54	138319409	138319409	4.10299893976545e-09	151790074	151792778
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151794415	151803851	6	6	0.4779	4.10299893976545e-09	151790074	151792778	1.84080844443068e-08	151803851	151808844
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151806385	173224400	6362	6278	-0.0089	1.84080844443068e-08	151803851	151808844	8.87962359292767e-20	173224400	173224400
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.2583	8.87962359292767e-20	173224400	173224400	3.92802699623287e-23	173228860	173228860
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	191	-0.0089	3.92802699623287e-23	173228860	173228860	3.12175797998929e-90	173660684	173660684
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.5335	3.12175797998929e-90	173660684	173660684	1.41116575888168e-92	173666072	173666072
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	727	-0.0224	1.41116575888168e-92	173666072	173666072	5.83404368853503e-205	175860235	175860235
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	-3.7406	5.83404368853503e-205	175860235	175860235	5.33499901515524e-184	175863396	175863396
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3294	-0.0035	5.33499901515524e-184	175863396	175863396	7.33081637372928e-47	187330240	187330240
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.9427	7.33081637372928e-47	187330240	187330240	4.48673626209974e-44	187333619	187333619
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1229	-0.0177	4.48673626209974e-44	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	228	-0.0115	NA	NA	NA	1.70053122029881e-13	829954	829954
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-1.1829	1.70053122029881e-13	829954	829954	6.38168242969085e-16	873365	873365
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3699	-0.0403	6.38168242969085e-16	873365	873365	3.66968769476064e-18	12857302	12857302
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.1774	3.66968769476064e-18	12857302	12857302	1.99621347455897e-17	12873052	12873052
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	104452261	25021	24757	-0.0071	1.99621347455897e-17	12873052	12873052	7.4481042845072e-61	104443917	104452261
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104461541	104528444	12	12	-0.8944	7.4481042845072e-61	104443917	104452261	1.70744143045836e-57	104528444	104528444
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104533570	113351802	2560	2532	-0.0114	1.70744143045836e-57	104528444	104528444	3.84814013028392e-08	113351802	113351802
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	113358868	113363761	2	2	-0.8469	3.84814013028392e-08	113351802	113351802	1.12301760493307e-08	113363761	113363761
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	113374740	130627096	4619	4579	-0.007	1.12301760493307e-08	113363761	113363761	0.00339910486625157	130526038	130627096
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130628724	130638815	5	4	0.2881	0.00339910486625157	130526038	130627096	2.19406898055595e-06	130638815	130640651
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130640651	130650977	7	7	0.5702	2.19406898055595e-06	130638815	130640651	2.36893635279868e-06	130649467	130650977
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130652439	130659704	5	5	0.2778	2.36893635279868e-06	130649467	130650977	1.43032020551199e-09	130657743	130718252
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130661367	137833920	2881	2842	-0.0064	1.43032020551199e-09	130657743	130718252	1.00063977535105e-13	137831933	137833920
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137836466	137843309	4	4	-0.8134	1.00063977535105e-13	137831933	137833920	2.96093812402396e-17	137843309	137844931
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	140533456	1131	1119	0.0337	2.96093812402396e-17	137843309	137844931	3.88239888957214e-15	140533456	140533456
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.0902	3.88239888957214e-15	140533456	140533456	3.85762623561718e-14	140538666	140538666
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	172345157	10748	10616	-0.0034	3.85762623561718e-14	140538666	140538666	9.10362486104912e-09	172345157	172345157
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172348216	172349917	2	2	-0.8722	9.10362486104912e-09	172345157	172345157	1.90266623714988e-09	172349917	172349917
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172351264	174084859	515	508	0.0155	1.90266623714988e-09	172349917	172349917	1.72391745603936e-15	174078177	174089673
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174086025	174121702	13	13	0.4656	1.72391745603936e-15	174078177	174089673	3.36737239383617e-15	174110180	174131366
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174125438	178316821	1343	1326	0.0167	3.36737239383617e-15	174110180	174131366	6.42417872430748e-06	178297957	178324316
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178319154	178349900	15	15	0.2822	6.42417872430748e-06	178297957	178324316	2.1598781670985e-06	178342403	178361316
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178352191	180342860	784	775	0.0119	2.1598781670985e-06	178342403	178361316	6.02875474216547e-12	180194323	180346557
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180357210	7	7	-0.5228	6.02875474216547e-12	180194323	180346557	1.28799799231479e-10	180351118	180358977
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180358977	180644810	113	109	-0.0068	1.28799799231479e-10	180351118	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0401	NA	NA	NA	1.99438377712398e-46	198124	202063
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	61	-0.5852	1.99438377712398e-46	198124	202063	2.94480303795534e-131	323898	327962
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29972382	10489	10362	0.0022	2.94480303795534e-131	323898	327962	3.2977411580611e-10	29927310	30000990
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29973024	30062908	28	28	0.225	3.2977411580611e-10	29927310	30000990	9.34538356210933e-05	30026699	30115442
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30065034	32558677	1059	1045	0.0415	9.34538356210933e-05	30026699	30115442	2.52939010988703e-35	32558677	32558677
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	0.9975	2.52939010988703e-35	32558677	32558677	4.09504854515450e-37	32595402	32595402
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	39992419	3243	3205	0.0224	4.0950485451545e-37	32595402	32595402	8.1193281708458e-13	39971416	40004502
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	39994692	40020403	13	13	0.2696	8.1193281708458e-13	39971416	40004502	2.13651413600515e-05	40011252	40033956
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40022561	54571849	5247	5189	-0.0038	2.13651413600515e-05	40011252	40033956	1.31106821021402e-20	54571849	54571849
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54574942	54576286	2	2	-1.3129	1.31106821021402e-20	54571849	54571849	3.05665407394307e-22	54576286	54576286
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54580538	65767409	2201	2170	-0.0119	3.05665407394307e-22	54576286	54576286	1.51178169636723e-11	65767409	65767409
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-0.9599	1.51178169636723e-11	65767409	65767409	5.24420045957472e-12	65771532	65771532
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	74647491	2888	2848	-1e-04	5.24420045957472e-12	65771532	65771532	5.54806234892075e-06	74644381	74647491
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-0.5639	5.54806234892075e-06	74644381	74647491	2.46907830729187e-05	74655219	74665873
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	79018959	1141	1127	-0.0086	2.46907830729187e-05	74655219	74665873	1.92009009245674e-16	79011979	79018959
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79095415	14	14	0.4337	1.92009009245674e-16	79011979	79018959	2.68136555059078e-17	79095415	79105311
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	103841482	6761	6690	-0.008	2.68136555059078e-17	79095415	79105311	2.04416106130917e-33	103841482	103841482
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.1293	2.04416106130917e-33	103841482	103841482	4.6205287150651e-32	103868154	103868154
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20834	-0.0051	4.6205287150651e-32	103868154	103868154	0	165643653	165643653
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.0283	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1780	-0.0442	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5320	0.0124	NA	NA	NA	1.45306898550318e-43	16135701	16135701
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-1.9317	1.45306898550318e-43	16135701	16135701	3.06775672554748e-44	16140018	16140018
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	21900877	1952	1930	-0.007	3.06775672554748e-44	16140018	16140018	0.000191501730497629	21846127	21904082
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	21902828	21911266	7	7	-0.2275	0.000191501730497629	21846127	21904082	1.74316216674184e-08	21908836	22087018
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	21912987	38254010	6249	6170	-0.0144	1.74316216674184e-08	21908836	22087018	7.9438303680386e-11	38252620	38254010
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38257171	38270942	6	6	0.532	7.9438303680386e-11	38252620	38254010	9.87325547909634e-12	38270942	38274436
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38274436	64343985	5890	5816	-0.0133	9.87325547909634e-12	38270942	38274436	1.30586438561676e-22	64343339	64347803
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64346121	64370592	11	11	0.5883	1.30586438561676e-22	64343339	64347803	3.1484672008094e-18	64364689	64373092
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64373092	75693631	3157	3121	0.0453	3.1484672008094e-18	64364689	64373092	3.79234356166679e-15	75656657	75707893
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75695040	75777770	39	38	0.2463	3.79234356166679e-15	75656657	75707893	7.68630338121543e-15	75767377	75789318
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75779817	93162991	5747	5664	-0.007	7.68630338121543e-15	75767377	75789318	1.1255471283059e-09	93162991	93162991
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.8917	1.1255471283059e-09	93162991	93162991	5.40343770443275e-09	93168978	93168978
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	99826231	2454	2429	0.0176	5.40343770443275e-09	93168978	93168978	1.43934521992155e-09	99824981	99826231
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99828088	99829757	2	2	0.8422	1.43934521992155e-09	99824981	99826231	2.10535723101559e-06	99829757	99832561
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99832561	100166257	157	157	0.1417	2.10535723101559e-06	99829757	99832561	2.79588574026951e-16	100164752	100166257
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-0.7762	2.79588574026951e-16	100164752	100166257	7.84769904848723e-13	100174991	100178968
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	100382347	93	92	0.0825	7.84769904848723e-13	100174991	100178968	6.48973685959872e-15	100378178	100384616
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100384616	100405440	11	11	-0.4056	6.48973685959872e-15	100378178	100384616	5.07191765240839e-09	100399493	100413739
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100409126	100478691	27	27	-0.0471	5.07191765240839e-09	100399493	100413739	2.48025583172599e-05	100472049	100478691
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100480588	100487101	4	4	0.3556	2.48025583172599e-05	100472049	100478691	1.01555140761434e-27	100487101	100517000
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100488651	109967918	4066	4031	0.0155	1.01555140761434e-27	100487101	100517000	6.12558739589001e-312	109967918	109967918
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-4.9964	6.12558739589001e-312	109967918	109967918	2.35943287157936e-312	109974402	109974402
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	7078	-0.0096	2.35943287157936e-312	109974402	109974402	8.14448853851105e-31	125831554	125831554
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.2838	8.14448853851105e-31	125831554	125831554	4.96320710030146e-28	125837524	125837524
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	131395304	2640	2610	0.0165	4.96320710030146e-28	125837524	125837524	2.45377744785936e-17	131386962	131400393
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131398229	131424513	15	15	0.3425	2.45377744785936e-17	131386962	131400393	3.74734227154713e-10	131417470	131431668
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131426580	141409512	4706	4652	-4e-04	3.74734227154713e-10	131417470	131431668	3.50893323593747e-14	141406414	141414719
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141440184	15	15	-0.4028	3.50893323593747e-14	141406414	141414719	7.53063809876675e-12	141434131	141446728
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	111	-0.0171	7.53063809876675e-12	141434131	141446728	0	141690753	141690753
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-4.5687	0	141690753	141690753	0.000477061670883689	141711513	141711513
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141714168	2	2	-1.9796	0.000477061670883689	141711513	141711513	8.48165060117356e-45	141714168	141714168
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2489	-0.0116	8.48165060117356e-45	141714168	141714168	4.52534340359176e-49	147702365	147702365
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.087	4.52534340359176e-49	147702365	147702365	7.90289921779154e-45	147707161	147707161
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1615	0.0022	7.90289921779154e-45	147707161	147707161	5.52284365782870e-07	151702948	151728811
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.4104	5.5228436578287e-07	151702948	151728811	4.87316858183537e-06	151743145	151751920
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158765920	2588	2554	-0.033	4.87316858183537e-06	151743145	151751920	1.95904759616781e-09	158612902	158790943
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158767781	158821263	12	12	0.2048	1.95904759616781e-09	158612902	158790943	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	119	-0.0662	NA	NA	NA	3.38197829113695e-16	581533	581533
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.1995	3.38197829113695e-16	581533	581533	5.85664749815168e-16	588865	588865
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	6508423	2114	2090	-0.0233	5.85664749815168e-16	588865	588865	6.45752237975381e-08	6501314	6510207
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	6510207	6537415	9	9	0.371	6.45752237975381e-08	6501314	6510207	8.19510363851199e-11	6532533	6543443
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	6541093	7226901	149	148	-0.0485	8.195103638512e-11	6532533	6543443	4.35986906211336e-10	7156900	7709141
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-0.5106	4.35986906211336e-10	7156900	7709141	3.29191644672194e-11	7697025	8139999
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	15987191	2806	2775	-0.0042	3.29191644672194e-11	7697025	8139999	9.55784728519037e-161	15987191	15993734
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15990019	15990019	1	0	NA	9.55784728519037e-161	15987191	15993734	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15993734	16067927	31	31	-0.9581	NA	NA	NA	3.00249947758789e-165	16066056	16067927
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16069607	18894239	945	931	-0.0088	3.00249947758789e-165	16066056	16067927	2.28286070392699e-44	18894239	18894239
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18896032	18908287	7	7	-1.0305	2.28286070392699e-44	18894239	18894239	7.04790390138752e-43	18908287	18908287
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18910176	26934767	2739	2709	-0.0026	7.04790390138752e-43	18908287	18908287	1.52220016975374e-09	26934767	26934767
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26935578	26936405	2	2	-0.9284	1.52220016975374e-09	26934767	26934767	4.7831045173901e-10	26936405	26936405
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26937497	32797545	2261	2229	0.0037	4.7831045173901e-10	26936405	26936405	6.67396216926378e-32	32797545	32797545
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	6.67396216926378e-32	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-1.6285	NA	NA	NA	1.96787023593611e-34	32808049	32808049
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1862	0.0156	1.96787023593611e-34	32808049	32808049	5.25214373738644e-236	39345557	39350798
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.8212	5.25214373738644e-236	39345557	39350798	5.7176496220898e-208	39505256	39505256
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	434	0.0226	5.7176496220898e-208	39505256	39505256	7.87102809161946e-12	40892587	40892587
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	0.9999	7.87102809161946e-12	40892587	40892587	3.71570387772705e-12	40897469	40897469
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	58274145	3916	3858	-0.0044	3.71570387772705e-12	40897469	40897469	1.90352044341947e-08	58271240	58274145
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58277102	58290326	3	3	0.6766	1.90352044341947e-08	58271240	58274145	3.80471268439181e-19	58290326	58295259
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58295259	68401801	2981	2938	-0.0108	3.80471268439181e-19	58290326	58295259	5.9627418620639e-18	68378892	68403436
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68403436	68411005	4	4	-0.3766	5.9627418620639e-18	68378892	68403436	9.12727927580674e-13	68407423	68446359
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68412847	145336073	23788	23484	-0.0101	9.12727927580674e-13	68407423	68446359	6.7513862036589e-12	145330767	145341415
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145339830	145464363	8	8	0.452	6.7513862036589e-12	145330767	145341415	8.1962379729924e-08	145351798	145473753
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145467093	146264846	290	290	0.027	8.1962379729924e-08	145351798	145473753	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2452	-0.0039	NA	NA	NA	3.47758258958076e-12	6681606	6685358
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-0.798	3.47758258958076e-12	6681606	6685358	1.12381511735307e-11	6698290	6701392
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	8340800	414	410	-0.0272	1.12381511735307e-11	6698290	6701392	1.68073757579317e-08	8339341	8342705
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	8342705	8345409	3	3	-0.6949	1.68073757579317e-08	8339341	8342705	1.17848992299620e-08	8344218	8347993
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	8347993	23343915	5109	5055	-0.0061	1.1784899229962e-08	8344218	8347993	1.28655227302800e-17	23343915	23343915
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.9594	1.286552273028e-17	23343915	23343915	3.50388871826478e-16	23365926	23365926
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	5014	-5e-04	3.50388871826478e-16	23365926	23365926	6.11381033261066e-90	70926188	70926188
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.7279	6.11381033261066e-90	70926188	70926188	1.05632431894432e-86	70930528	70930528
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	75177268	1792	1773	-0.0047	1.05632431894432e-86	70930528	70930528	1.18517550830567e-10	75172123	75177268
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75208977	75213550	2	2	-0.9784	1.18517550830567e-10	75172123	75177268	4.34305995020798e-11	75213550	75213550
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75221525	116118907	13672	13506	-0.0097	4.34305995020798e-11	75213550	75213550	1.08895291558139e-13	116116077	116118907
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116132839	5	5	-0.6863	1.08895291558139e-13	116116077	116118907	2.28291819838525e-13	116132839	116137111
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	128657974	4689	4622	-0.0073	2.28291819838525e-13	116132839	116137111	1.40404588118840e-26	128656749	128660686
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128660686	128695681	17	17	0.5063	1.4040458811884e-26	128656749	128660686	8.70029617190735e-17	128693556	128699467
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128697140	130449254	842	835	0.0402	8.70029617190735e-17	128693556	128699467	3.02710377326182e-07	130417618	130464445
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130451027	130509204	29	29	0.2757	3.02710377326182e-07	130417618	130464445	5.02252143556635e-09	130496470	130530732
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130515658	133607124	1239	1227	0.0272	5.02252143556635e-09	130496470	130530732	1.08058597461934e-06	133603324	133607124
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133609822	133612653	3	3	0.6887	1.08058597461934e-06	133603324	133607124	1.48396344383685e-07	133612653	133614121
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133614121	137352394	1475	1456	0.0051	1.48396344383685e-07	133612653	133614121	4.6064885128692e-20	137352394	137352394
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3473	4.6064885128692e-20	137352394	137352394	3.22865500519621e-17	137356880	137356880
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	139345200	783	759	0.0055	3.22865500519621e-17	137356880	137356880	1.41797239195754e-09	139329943	139368626
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139355210	139402776	18	18	0.3476	1.41797239195754e-09	139329943	139368626	3.61642872052879e-10	139396602	139412738
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139404030	140145683	302	299	-0.0224	3.61642872052879e-10	139396602	139412738	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	493401	166	165	-0.0626	NA	NA	NA	2.10942163966053e-07	478420	493401
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	496404	533688	15	14	0.2478	2.10942163966053e-07	478420	493401	1.03914253422832e-21	531429	551764
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	535766	53830907	16178	15971	-0.0018	1.03914253422832e-21	531429	551764	2.31929804772733e-22	53828758	53830907
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53832408	53839618	3	3	-0.7446	2.31929804772733e-22	53828758	53830907	6.26192377380111e-10	53839618	53841120
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53841120	56114489	668	660	-0.0187	6.26192377380111e-10	53839618	53841120	1.85486862955427e-07	56104431	56120991
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56115736	56142414	13	13	-0.324	1.85486862955427e-07	56104431	56120991	9.94748503678781e-17	56138767	56156253
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56143873	77917893	7549	7456	0.0058	9.94748503678781e-17	56138767	56156253	9.12645508671365e-42	77917893	77917893
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.5277	9.12645508671365e-42	77917893	77917893	6.11237864234047e-42	77928738	77928738
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	98989818	7034	6945	-0.0102	6.11237864234047e-42	77928738	77928738	1.31870582531131e-09	98982403	98993621
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	98993621	99013267	10	10	0.3877	1.31870582531131e-09	98982403	98993621	4.58558157111627e-15	99010856	99020344
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	99015755	124337128	9291	9169	0.0032	4.58558157111627e-15	99010856	99020344	3.25580663640008e-14	124337128	124337128
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337860	124340356	2	2	-0.9405	3.25580663640008e-14	124337128	124337128	2.47332002684932e-09	124340356	124368725
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	132797428	2940	2898	-0.0478	2.47332002684932e-09	124340356	124368725	7.29146975849808e-10	132797428	132797428
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.8681	7.29146975849808e-10	132797428	132797428	2.10949403836071e-07	132801463	132802775
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	927	-0.0456	2.10949403836071e-07	132801463	132802775	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1751	0.0041	NA	NA	NA	3.01159100244193e-15	4920907	4923300
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.7901	3.01159100244193e-15	4920907	4923300	9.16983890578294e-17	4932214	4932214
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	14239206	3827	3793	-0.0155	9.16983890578294e-17	4932214	4932214	1.00984621668823e-05	14224305	14241248
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	14241248	14268203	14	13	0.2734	1.00984621668823e-05	14224305	14241248	5.67014096042345e-06	14266669	14281219
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	14269550	18896166	1754	1737	-0.0077	5.67014096042345e-06	14266669	14281219	1.59932299190362e-09	18890351	18896166
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.5235	1.59932299190362e-09	18890351	18896166	1.35815064290265e-12	18917191	18932031
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55124730	9529	9422	-0.0099	1.35815064290265e-12	18917191	18932031	8.75793929256553e-37	55114405	55129329
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55209626	37	37	0.3952	8.75793929256553e-37	55114405	55129329	7.64310437613858e-31	55205278	55221692
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	65009902	4000	3947	0.0147	7.64310437613858e-31	55205278	55221692	2.90154261898828e-17	65003889	65011475
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65011475	65054293	17	16	0.4212	2.90154261898828e-17	65003889	65011475	6.45302162025705e-13	65052102	65062840
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65055650	66463477	621	613	0.0392	6.45302162025705e-13	65052102	65062840	5.64397917965541e-73	66463477	66463477
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.4736	5.64397917965541e-73	66463477	66463477	1.83548138383521e-70	66469412	66469412
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81524127	5314	5251	-0.0016	1.83548138383521e-70	66469412	66469412	2.27658274489340e-09	81515157	81530809
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81530809	81540765	4	4	0.5317	2.2765827448934e-09	81515157	81530809	4.34237667462411e-07	81538067	81544262
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	99021938	5535	5476	-0.0155	4.34237667462411e-07	81538067	81544262	2.45874263313215e-13	99010068	99030209
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99025912	99074552	23	23	0.2921	2.45874263313215e-13	99010068	99030209	1.71319766839014e-12	99064450	99081056
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	101807001	959	949	-0.0064	1.71319766839014e-12	99064450	99081056	7.19239745385286e-07	101803012	101812787
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101812021	101821135	4	4	-0.5402	7.19239745385286e-07	101803012	101812787	5.28597878783576e-07	101812787	101824737
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101822991	106733851	1559	1542	-0.0181	5.28597878783576e-07	101812787	101824737	9.10093749372236e-07	106730906	106733851
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.4944	9.10093749372236e-07	106730906	106733851	4.93438462925617e-07	106747920	106756347
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	118712459	4399	4342	0.0026	4.93438462925617e-07	106747920	106756347	8.06073792891507e-10	118700608	118712459
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118714207	118731039	9	9	0.4364	8.06073792891507e-10	118700608	118712459	4.59353156390219e-15	118731039	118734825
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118732455	134450318	5910	5855	-0.0234	4.59353156390219e-15	118731039	118734825	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	5861605	2425	2396	-0.0111	NA	NA	NA	3.97043353922421e-13	5836402	5870494
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5862752	5896237	16	15	0.2138	3.97043353922421e-13	5836402	5870494	0.0225239861832159	5881481	5970808
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5898166	9523923	1301	1280	0.0309	0.0225239861832159	5881481	5970808	1.20385729455379e-33	9516067	9550789
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	16	0.6751	1.20385729455379e-33	9516067	9550789	3.54444177963988e-45	9599999	9626623
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11104973	567	557	-0.0249	3.54444177963988e-45	9599999	9626623	4.92185522442615e-17	11104973	11104973
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	-0.8294	4.92185522442615e-17	11104973	11104973	8.38099688792359e-14	11116883	11116883
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-2.922	8.38099688792359e-14	11116883	11116883	8.98282637812081e-317	11130871	11130871
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	78676440	22219	21962	0.0089	8.98282637812081e-317	11130871	11130871	2.00940443560162e-09	78668041	78676440
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78679297	78686371	4	4	-0.5703	2.00940443560162e-09	78668041	78676440	5.8967356559799e-12	78686371	78688893
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	98316278	5921	5854	-1e-04	5.8967356559799e-12	78686371	78688893	5.56634060651981e-11	98314473	98316278
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98320165	3	3	-0.6349	5.56634060651981e-11	98314473	98316278	2.60462531830230e-13	98320165	98327582
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98327582	119353826	7943	7845	0.0129	2.6046253183023e-13	98320165	98327582	3.98572951850183e-26	119351273	119353826
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119355352	119372494	11	11	0.6478	3.98572951850183e-26	119351273	119353826	5.39440897138054e-26	119372494	119373964
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119373964	125558844	2368	2344	0.0334	5.39440897138054e-26	119372494	119373964	1.44847881577845e-24	125558844	125558844
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125565039	125570308	2	2	-1.1213	1.44847881577845e-24	125558844	125558844	4.87893200005636e-14	125570308	125570308
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125576897	128851140	984	975	-0.0368	4.87893200005636e-14	125570308	125570308	2.37237360566291e-14	128845604	128862871
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128857892	128888941	17	17	0.3442	2.37237360566291e-14	128845604	128862871	6.32782636955146e-14	128883385	128892254
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128890948	130694393	708	699	-0.044	6.32782636955146e-14	128883385	128892254	2.54923393911314e-09	130694393	130694393
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.8735	2.54923393911314e-09	130694393	130694393	2.79565419657595e-08	130701040	130701040
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	635	1e-04	2.79565419657595e-08	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	44771931	10147	9999	-0.0096	NA	NA	NA	1.40322898735030e-09	44757931	44780069
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	44773705	44801951	16	15	0.2967	1.4032289873503e-09	44757931	44780069	3.42050632936955e-08	44790707	44810909
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	44804005	49964838	2056	2031	0.0013	3.42050632936955e-08	44790707	44810909	7.32925013716322e-33	49964838	49964838
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.6117	7.32925013716322e-33	49964838	49964838	2.6544583595302e-32	49971732	49971732
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	99442329	14299	14116	-0.0087	2.6544583595302e-32	49971732	49971732	6.20743527888363e-10	99431458	99451911
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99443464	99499614	26	26	0.244	6.20743527888363e-10	99431458	99451911	4.07326918121672e-05	99491312	99502256
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99502256	99521558	9	9	0.5597	4.07326918121672e-05	99491312	99502256	0.00114078093666468	99519611	99525496
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99522802	99537679	5	5	0.2457	0.00114078093666468	99519611	99525496	0.0488303809900388	99524407	99563217
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99538892	114123340	5084	5012	-0.0312	0.0488303809900388	99524407	99563217	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	20008825	310	309	-0.037	NA	NA	NA	1.46814861172980e-10	19995996	20018647
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20010282	20067018	29	29	0.236	1.4681486117298e-10	19995996	20018647	5.1651263217868e-08	20049907	20086253
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20068404	22163851	1033	1018	0.0134	5.1651263217868e-08	20049907	20086253	1.98121256252437e-06	22154006	22168823
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22164967	22181002	8	8	0.3631	1.98121256252437e-06	22154006	22168823	2.09011222973082e-13	22170973	22187302
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22182863	34674458	4370	4310	0.0071	2.09011222973082e-13	22170973	22187302	4.66250045808982e-29	34674458	34674458
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.2611	4.66250045808982e-29	34674458	34674458	7.33066062753583e-30	34683810	34683810
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40680589	1896	1875	0.0019	7.33066062753583e-30	34683810	34683810	2.46160488450404e-13	40676611	40680589
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40726930	7	7	-0.5553	2.46160488450404e-13	40676611	40680589	6.48155012621993e-13	40726930	40746865
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69086125	9972	9830	-0.001	6.48155012621993e-13	40726930	40746865	2.11035462986567e-11	69084841	69086125
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-0.7992	2.11035462986567e-11	69084841	69086125	1.61254576671218e-11	69092211	69093444
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73061942	1788	1759	0.0032	1.61254576671218e-11	69092211	69093444	4.87215689172061e-21	73060301	73061942
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	8	0.6594	4.87215689172061e-21	73060301	73061942	6.2496450703589e-18	73092112	73101327
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	78227579	2404	2370	0.0139	6.2496450703589e-18	73092112	73101327	5.52293429492270e-15	78227579	78227579
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78229428	78229428	1	0	NA	5.5229342949227e-15	78227579	78227579	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78230562	78233664	3	3	-0.953	NA	NA	NA	4.39985325726440e-15	78233664	78233664
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78235693	105597555	9807	9693	-0.0096	4.3998532572644e-15	78233664	78233664	0	105597555	105597555
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.8552	0	105597555	105597555	5.16826327142814e-41	105632168	105632168
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	21	-0.1437	5.16826327142814e-41	105632168	105632168	1.72352087604371e-06	105776293	105788623
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.5644	1.72352087604371e-06	105776293	105788623	0.000247805372852815	105795807	105804040
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105850033	21	19	-0.0931	0.000247805372852815	105795807	105804040	6.95855502027161e-36	105850033	105850033
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	1.215	6.95855502027161e-36	105850033	105850033	2.05792873806157e-42	105881893	105881893
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106207549	119	118	-0.0533	2.05792873806157e-42	105881893	105881893	2.16443635633076e-08	106193881	106214372
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106209063	106253648	21	19	-0.4164	2.16443635633076e-08	106193881	106214372	1.51167613454358e-09	106251081	106260876
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.0024	1.51167613454358e-09	106251081	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.0903	NA	NA	NA	4.79633121958896e-14	18452491	18452491
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-0.6831	4.79633121958896e-14	18452491	18452491	8.71725276364935e-19	18837737	18837737
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	0.1069	8.71725276364935e-19	18837737	18837737	1.03113857768017e-24	18848213	18848213
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19117783	13	13	-0.7245	1.03113857768017e-24	18848213	18848213	0.00229187546697285	19109124	19202505
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19120442	19537035	67	67	-0.4635	0.00229187546697285	19109124	19202505	1.22502579476892e-05	19391934	19882711
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	57	-0.6884	1.22502579476892e-05	19391934	19882711	6.31954850770933e-146	20079935	20308014
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32356331	3588	3543	-0.0229	6.31954850770933e-146	20079935	20308014	0.000615164727369578	32344342	32356331
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32357361	32373583	7	7	-0.351	0.000615164727369578	32344342	32356331	4.43119612430502e-11	32373583	32380978
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32375063	54475616	9020	8901	0.0035	4.43119612430502e-11	32373583	32380978	3.41061135313605e-12	54467980	54489709
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	54478090	54506271	14	14	-0.2542	3.41061135313605e-12	54467980	54489709	3.88866730954901e-05	54491503	54513726
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	54507071	75115806	9100	8992	0.0089	3.88866730954901e-05	54491503	54513726	1.05349346176166e-32	75115806	75115806
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.6738	1.05349346176166e-32	75115806	75115806	2.38010078949537e-33	75119713	75119713
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9318	-0.0141	2.38010078949537e-33	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14687636	5467	5387	0.018	NA	NA	NA	6.29702247332611e-08	14666341	14876356
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15037844	17	17	-0.2763	6.29702247332611e-08	14666341	14876356	1.08798809629931e-08	15029941	15049658
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	23897362	2590	2557	0.0256	1.08798809629931e-08	15029941	15049658	7.15065784331805e-08	23892842	23901943
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23899481	23917604	9	9	0.4218	7.15065784331805e-08	23892842	23901943	1.29686094399355e-11	23910062	23924805
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23919902	31862577	2489	2464	0.0326	1.29686094399355e-11	23910062	23924805	5.46961349998345e-68	31854794	32379126
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33647856	47	46	-0.495	5.46961349998345e-68	31854794	32379126	8.89098782099235e-69	33538171	33841331
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	75093957	9904	9800	0.0104	8.89098782099235e-69	33538171	33841331	2.33675668697364e-26	75093957	75093957
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0345	2.33675668697364e-26	75093957	75093957	3.76682498917578e-18	75100865	75100865
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88208878	4922	4868	-0.0073	3.76682498917578e-18	75100865	75100865	2.85208365312260e-09	88197187	88216091
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88210523	88245955	16	16	0.3204	2.8520836531226e-09	88197187	88216091	1.16960715658258e-07	88239736	88255542
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88248356	88690571	193	193	0.0014	1.16960715658258e-07	88239736	88255542	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11886	0.0232	NA	NA	NA	6.85147456685282e-17	31437168	31471890
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.2755	6.85147456685282e-17	31437168	31471890	1.56955874434898e-10	31489333	31895551
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	362	0.0277	1.56955874434898e-10	31489333	31895551	7.21154486875494e-46	32828797	32828797
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.0805	7.21154486875494e-46	32828797	32828797	5.37998222519652e-47	32832642	32832642
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1425	0.0362	5.37998222519652e-47	32832642	32832642	0	36673853	36673853
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.5341	0	36673853	36673853	0	36683509	36683509
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41566540	2033	2005	0.0541	0	36683509	36683509	3.41584009932776e-52	41562786	41570512
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	51	-0.3871	3.41584009932776e-52	41562786	41570512	5.74989133001196e-51	42143048	42155643
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	56621287	5277	5216	0.0271	5.74989133001196e-51	42143048	42155643	2.30398172167068e-13	56612462	56623442
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56623442	56634988	7	7	0.4264	2.30398172167068e-13	56612462	56623442	5.56634991432078e-06	56633255	56640557
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56636364	72842733	6055	5978	0.0266	5.56634991432078e-06	56633255	56640557	4.97545693188799e-09	72826615	72861257
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72853012	72887814	19	19	0.323	4.97545693188799e-09	72826615	72861257	5.32370011094167e-10	72879536	72897599
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72889190	73927306	402	399	0.0061	5.32370011094167e-10	72879536	72897599	2.07494246202293e-12	73916911	73930042
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73928796	73963637	20	20	0.3465	2.07494246202293e-12	73916911	73930042	6.02859165074346e-12	73960702	73979103
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73966050	78653545	1894	1870	0.0052	6.02859165074346e-12	73960702	73979103	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	17464066	5265	5204	-0.0122	NA	NA	NA	1.02834676648857e-14	17454508	17473206
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17467332	17494981	17	17	0.3186	1.02834676648857e-14	17454508	17473206	1.44460753702257e-11	17490834	17500922
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17496561	74063563	16942	16744	-0.0157	1.44460753702257e-11	17490834	17500922	2.74330553317586e-09	74001130	74083642
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	74067180	74122545	17	16	0.1808	2.74330553317586e-09	74001130	74083642	1.00045346083168e-05	74108563	74150751
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	74125354	76116026	723	713	-0.0598	1.00045346083168e-05	74108563	74150751	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	763200	210	209	0.0398	NA	NA	NA	8.27220039122125e-12	743065	782819
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	768675	893511	53	53	0.2817	8.27220039122125e-12	743065	782819	1.64170917062352e-09	865986	928633
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	896098	3353960	1157	1133	0.0776	1.64170917062352e-09	865986	928633	1.26306595485833e-07	3349931	3353960
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	1.0015	1.26306595485833e-07	3349931	3353960	1.51084300083859e-25	3356334	3356334
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	59414898	19633	19399	0.058	1.51084300083859e-25	3356334	3356334	1.25414495694548e-25	59414645	59414898
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434159	9	9	-0.6259	1.25414495694548e-25	59414645	59414898	7.87500255780107e-16	59433190	59440262
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59434202	59434202	1	0	NA	7.87500255780107e-16	59433190	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59586140	76	76	-0.0391	NA	NA	NA	4.09836452781292e-11	59581707	59587098
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59587098	59624976	16	15	0.3486	4.09836452781292e-11	59581707	59587098	6.54240080367908e-08	59618986	59637666
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59626135	63788698	1902	1879	0.0357	6.54240080367908e-08	59618986	59637666	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	576	-0.002	NA	NA	NA	4.23190000207234e-175	1506379	1515948
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.2416	4.23190000207234e-175	1506379	1515948	4.00135861206399e-262	1525300	1531162
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	54712760	17905	17685	-0.0021	4.00135861206399e-262	1525300	1531162	5.26050943932053e-16	54706301	54712760
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	54715194	54728970	8	8	0.3818	5.26050943932053e-16	54706301	54712760	1.40130897813327e-09	54728970	54734506
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	54730482	62419534	3071	3042	-0.0214	1.40130897813327e-09	54728970	54734506	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	36783398	8541	8444	-0.0064	NA	NA	NA	4.86721636963902e-12	36779960	36787538
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36785392	36798623	11	11	0.4173	4.86721636963902e-12	36779960	36787538	5.26348194244609e-11	36795372	36800914
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36799869	44627824	3826	3786	-0.0114	5.26348194244609e-11	36795372	36800914	3.97262175218772e-08	44620917	44637544
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44634707	44634707	1	0	NA	3.97262175218772e-08	44620917	44637544	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44637544	44662766	10	10	0.3781	NA	NA	NA	3.88332687918888e-08	44660199	44669596
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44666832	46922972	1052	1038	-0.028	3.88332687918888e-08	44660199	44669596	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2945	0.011	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	20	-3.0331	0	22667608	22679305	0	22718614	22721042
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	35472378	6548	6479	0.0108	0	22718614	22721042	1.55207671292002e-23	35472378	35472378
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.4296	1.55207671292002e-23	35472378	35472378	5.75414645180808e-24	35476942	35476942
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	40663050	2813	2777	0.0439	5.75414645180808e-24	35476942	35476942	8.49207336141394e-07	40659633	40664675
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40664675	40670048	4	4	0.6079	8.49207336141394e-07	40659633	40664675	4.05322239201552e-07	40670048	40673250
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40671866	44816157	1983	1961	0.0108	4.05322239201552e-07	40670048	40673250	1.27995325177916e-06	44814677	44816157
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44817721	44819731	2	2	-0.8043	1.27995325177916e-06	44814677	44816157	1.73921189337487e-07	44819731	44821283
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44821283	48448446	1699	1684	-0.0319	1.73921189337487e-07	44819731	44821283	5.12393273531445e-14	48448446	48448446
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48455492	3	3	0.9156	5.12393273531445e-14	48448446	48448446	4.98148408012353e-12	48455492	48455492
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48458933	49571068	499	495	0.0046	4.98148408012353e-12	48455492	48455492	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	767408	512	505	0.0823	NA	NA	NA	1.13923873550573e-05	742385	771824
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	769172	809379	28	28	-0.1254	1.13923873550573e-05	742385	771824	2.20665202231351e-06	800956	818287
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	809584	851066	30	29	0.1147	2.20665202231351e-06	800956	818287	6.11631041774592e-07	849437	853672
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851251	859452	6	5	-0.4101	6.11631041774592e-07	849437	853672	1.4504966753606e-10	853836	861050
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2673365	1192	1177	0.0844	1.4504966753606e-10	853836	861050	1.90728423246131e-14	2672401	2674962
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2693493	10	10	-0.3783	1.90728423246131e-14	2672401	2674962	0.0146579094505433	2687501	2700840
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	15	-0.0668	0.0146579094505433	2687501	2700840	8.66821701365244e-65	2708291	2711273
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	13679455	4075	4024	0.9361	8.66821701365244e-65	2708291	2711273	4.2386361657548e-11	13677276	13681110
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	3	-0.0121	4.2386361657548e-11	13677276	13681110	1.07301394928466e-13	13683888	13686085
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	19392639	2406	2367	0.9619	1.07301394928466e-13	13683888	13686085	8.04195412350872e-15	19390420	19394773
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19394773	19416401	10	10	1.5155	8.04195412350872e-15	19390420	19394773	3.81769210631034e-15	19414718	19418845
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19418845	118939747	27589	27257	0.952	3.81769210631034e-15	19414718	19418845	1.08697432669754e-22	118939747	118939747
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118941322	118947618	5	5	1.9439	1.08697432669754e-22	118939747	118939747	6.21870596636945e-23	118947618	118947618
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118950054	154582414	11046	10921	0.9394	6.21870596636945e-23	118947618	118947618	0	154582414	154582414
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	-0.0421	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.8078	NA	NA	NA	4.20891625276948e-26	3223585	3772482
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9082	4.20891625276948e-26	3223585	3772482	1.64567636966178e-15	5531459	6688691
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	172	-3.3899	1.64567636966178e-15	5531459	6688691	2.12238966029836e-07	7017919	7204505
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	128	-2.5452	2.12238966029836e-07	7017919	7204505	0.000347558996606988	7424495	7568006
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7606496	12	12	-4.2541	0.000347558996606988	7424495	7568006	2.88442108948665e-09	7606496	7614417
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7645258	14	14	-2.0744	2.88442108948665e-09	7606496	7614417	8.30085709908854e-06	7631265	7653082
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	7722458	48	48	-3.4907	8.30085709908854e-06	7631265	7653082	2.56081727576441e-11	7714929	7726921
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	19	-1.8594	2.56081727576441e-11	7714929	7726921	0.000240213873706424	7758635	7829133
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-3.0826	0.000240213873706424	7758635	7829133	0.00673171586437308	7860364	7905286
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.8486	0.00673171586437308	7860364	7905286	8.5039617104671e-06	7914104	7919636
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8536761	142	139	-3.6264	8.5039617104671e-06	7914104	7919636	1.28812020201577e-05	8450784	8555993
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8538835	8687580	54	54	-2.8778	1.28812020201577e-05	8450784	8555993	2.04315005760748e-05	8633358	8730690
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8689019	10511255	191	186	-3.6179	2.04315005760748e-05	8633358	8730690	2.66651103227162e-30	10504879	10513747
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10512616	12452734	22	21	-1.0338	2.66651103227162e-30	10504879	10513747	8.93346638754818e-17	11673476	12452734
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	8	-4.355	8.93346638754818e-17	11673476	12452734	6.93123012928565e-08	12536761	12542979
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	54	-1.8594	6.93123012928565e-08	12536761	12542979	1.90960038032002e-08	12658135	12700767
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	15	-3.9872	1.90960038032002e-08	12658135	12700767	3.28444183197106e-08	12745259	12804329
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13050965	89	87	-2.0893	3.28444183197106e-08	12745259	12804329	0.000250434850063115	13029929	13050965
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13052633	13062151	7	7	-3.96	0.000250434850063115	13029929	13050965	5.21458406766019e-11	13062151	13066849
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13128515	24	24	-1.6606	5.21458406766019e-11	13062151	13066849	9.2449004821419e-26	13119344	13136828
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14353244	413	408	-3.7223	9.2449004821419e-26	13119344	13136828	5.36544506163889e-07	14339170	14354682
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14375855	11	11	-2.1278	5.36544506163889e-07	14339170	14354682	1.51065700022205e-08	14375855	14377844
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14376942	14407293	16	16	-4.0742	1.51065700022205e-08	14375855	14377844	0.00809804993883643	14388689	14440701
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14508021	65	61	-2.9739	0.00809804993883643	14388689	14440701	2.85751179930117e-05	14491287	14539230
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14572190	25	25	-1.5639	2.85751179930117e-05	14491287	14539230	0.0283818421211517	14546195	14601309
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14700040	24	24	-2.6262	0.0283818421211517	14546195	14601309	6.36786387893072e-09	14695441	14705886
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14937488	52	50	-4.103	6.36786387893072e-09	14695441	14705886	2.01177953988253e-05	14868114	15095427
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14941202	15313932	139	137	-3.2104	2.01177953988253e-05	14868114	15095427	2.62488343097253e-05	15272429	15327001
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15315201	15408015	59	59	-4.0125	2.62488343097253e-05	15272429	15327001	1.23137252664516e-05	15399621	15447091
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15690301	108	105	-3.0741	1.23137252664516e-05	15399621	15447091	5.84569648521592e-06	15585797	15707307
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15915466	36	36	-4.2621	5.84569648521592e-06	15585797	15707307	7.1523111956126e-16	15911389	15943877
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	49	-2.462	7.1523111956126e-16	15911389	15943877	3.09169371109369e-05	15998663	16074125
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16350833	106	106	-3.2866	3.09169371109369e-05	15998663	16074125	0.0108478419540045	16180512	16765920
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16354465	22014413	923	910	-3.6706	0.0108478419540045	16180512	16765920	0.00367768272685877	21880575	22139807
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22015735	22192409	36	35	-2.9673	0.00367768272685877	21880575	22139807	1.65343061087875e-11	22178964	22200078
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	24	-4.687	1.65343061087875e-11	22178964	22200078	2.78655550190933e-06	22261337	22379285
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22407622	12	12	-3.5406	2.78655550190933e-06	22261337	22379285	0.000337776000987023	22382215	22768795
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22767553	22836305	17	17	-4.4346	0.000337776000987023	22382215	22768795	0.0009500616220805	22827867	22878671
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22843728	25737663	37	35	-3.5611	0.0009500616220805	22827867	22878671	3.64137240429110e-21	23283689	26881458
MSK_252152912765_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	78	-1.1954	3.6413724042911e-21	23283689	26881458	NA	NA	NA
