Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	8280958	2581	2529	0.0282	NA	NA	NA	1.19516795031627e-10	8280958	8280958
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8283325	8285554	2	2	-1.0516	1.19516795031627e-10	8280958	8280958	1.72602874836197e-11	8285554	8285554
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8288503	16961001	3211	3160	0.0187	1.72602874836197e-11	8285554	8285554	1.22191576399329e-08	16917759	17094326
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16963812	17127039	13	13	-0.349	1.22191576399329e-08	16917759	17094326	4.98479430443505e-15	17112697	17157415
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	72537426	22087	21716	0.0063	4.98479430443505e-15	17112697	17157415	0	72537426	72537426
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.8296	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11510	-0.0068	0	72579311	72579311	4.78966756518996e-10	110015739	110023268
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	0.7567	4.78966756518996e-10	110015739	110023268	9.13210567092409e-10	110039388	110041712
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147308557	4558	4492	-0.0048	9.13210567092409e-10	110039388	110041712	2.28998995513206e-18	146294654	147326097
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147311437	147311437	1	0	NA	2.28998995513206e-18	146294654	147326097	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147313991	147497268	31	31	0.3165	NA	NA	NA	4.55689304871718e-16	147471665	148081769
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150839754	1264	1239	0.0063	4.55689304871718e-16	147471665	148081769	9.21046073571182e-123	150839754	150839754
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	3	-2.6918	9.21046073571182e-123	150839754	150839754	2.80833062425936e-87	150846148	150846148
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	2.80833062425936e-87	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	78	-0.0364	NA	NA	NA	1.16883746275536e-303	151026228	151026228
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.8699	1.16883746275536e-303	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157128689	2678	2633	0.0168	0	151036435	151036435	3.32385616962708e-180	157128689	157128689
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157133150	157133150	1	0	NA	3.32385616962708e-180	157128689	157128689	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.9615	NA	NA	NA	4.30852894000577e-179	157136342	157136342
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4043	-0.0094	4.30852894000577e-179	157136342	157136342	1.00741577718741e-13	167479184	167493768
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-0.5685	1.00741577718741e-13	167479184	167493768	3.91523313264121e-14	167507882	167520743
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	173060997	2177	2142	-0.0131	3.91523313264121e-14	167507882	167520743	5.13914418351206e-09	173059045	173060997
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-0.7432	5.13914418351206e-09	173059045	173060997	3.77744257122124e-09	173067337	173068576
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	185979586	5029	4949	-0.0076	3.77744257122124e-09	173067337	173068576	9.11984308865188e-13	185979586	185979586
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.0476	9.11984308865188e-13	185979586	185979586	6.68102518246144e-15	185988138	185988138
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1464	-0.0076	6.68102518246144e-15	185988138	185988138	1.77720253248602e-21	192715640	192715640
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-1.2833	1.77720253248602e-21	192715640	192715640	4.47868815529752e-18	192719540	192719540
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	192723635	1	0	NA	4.47868815529752e-18	192719540	192719540	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192727583	200598243	2642	2594	0.0035	NA	NA	NA	1.45096799778912e-14	200584100	200620756
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200803726	42	42	-0.2505	1.45096799778912e-14	200584100	200620756	9.8651496152968e-15	200696309	200813827
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	227875096	9921	9759	0.0015	9.8651496152968e-15	200696309	200813827	4.70563139019281e-15	227872808	227875096
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8212	4.70563139019281e-15	227872808	227875096	2.18292174601450e-15	227882805	227889619
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246702361	7347	7220	-0.0026	2.1829217460145e-15	227882805	227889619	9.43488445840006e-28	246691241	246755225
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246713340	246875016	38	38	0.2777	9.43488445840006e-28	246691241	246755225	1.41071361910279e-08	246852126	246907655
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	95	0.0471	1.41071361910279e-08	246852126	246907655	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11310	2e-04	NA	NA	NA	3.20238015676649e-10	34527334	34552935
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	15	0.3543	3.20238015676649e-10	34527334	34552935	3.90657391282653e-11	34575366	34589997
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	52600588	7195	7073	-0.0048	3.90657391282653e-11	34575366	34589997	8.2356277784011e-20	52588009	52600588
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.814	8.2356277784011e-20	52588009	52600588	4.96601675712026e-20	52635695	52639605
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4474	-0.0048	4.96601675712026e-20	52635695	52639605	9.11778232255829e-86	66357387	66357387
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-2.7359	9.11778232255829e-86	66357387	66357387	6.44944495454345e-88	66360747	66360747
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	154601442	23985	23556	-0.0021	6.44944495454345e-88	66360747	66360747	5.13421138504699e-10	154601442	154601442
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.9518	5.13421138504699e-10	154601442	154601442	3.88103949834413e-10	154606943	154606943
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242386891	30437	29898	-0.007	3.88103949834413e-10	154606943	154606943	1.37914201378203e-33	242386891	242386891
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242390844	242414970	7	7	-0.9098	1.37914201378203e-33	242386891	242386891	7.95949284495263e-34	242414970	242414970
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242417825	242506262	35	32	0.005	7.95949284495263e-34	242414970	242414970	7.45966524115035e-09	242496751	242523086
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242512310	242586855	32	31	0.3298	7.45966524115035e-09	242496751	242523086	3.37445888867853e-05	242561304	242595315
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242589535	242689978	33	32	0.0862	3.37445888867853e-05	242561304	242595315	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	7373793	2514	2472	-0.0106	NA	NA	NA	1.28362398279069e-08	7368059	7373793
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7375107	7376517	2	2	-0.8526	1.28362398279069e-08	7368059	7373793	1.25898887154502e-07	7376517	7378691
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7378691	32074432	8280	8136	-0.0089	1.25898887154502e-07	7376517	7378691	8.4611506854174e-37	32074432	32074432
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.7823	8.4611506854174e-37	32074432	32074432	4.68759812830083e-35	32080848	32080848
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5319	0.0074	4.68759812830083e-35	32080848	32080848	1.51622571546605e-199	47460892	47460892
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.1915	1.51622571546605e-199	47460892	47460892	2.30252862371762e-213	47466921	47466921
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	150748947	33001	32407	-0.0047	2.30252862371762e-213	47466921	47466921	0	150748947	150748947
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-5.3186	0	150748947	150748947	0	150752600	150752600
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	164005577	4268	4204	-0.0073	0	150752600	150752600	9.94787896546067e-107	164005577	164009321
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.1018	9.94787896546067e-107	164005577	164009321	3.48636205149593e-18	164019640	164027724
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5284	3.48636205149593e-18	164019640	164027724	6.96825142415749e-35	164105613	164112873
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9388	-0.0061	6.96825142415749e-35	164105613	164112873	0	192546280	192546280
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-4.8834	0	192546280	192546280	0	192550989	192550989
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	196835413	1582	1564	-0.0044	0	192550989	192550989	3.01617609854782e-36	196820428	196907040
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196961238	30	30	-0.4834	3.01617609854782e-36	196820428	196907040	3.25055972405768e-33	196952514	196966631
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	931	0.0019	3.25055972405768e-33	196952514	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3315	0.0212	NA	NA	NA	3.0691912035848e-11	9800777	9815760
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.7876	3.0691912035848e-11	9800777	9815760	4.50664679017405e-15	9842644	9842644
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	6065	-0.0116	4.50664679017405e-15	9842644	9842644	0	34445002	34445002
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-5.1564	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	108281452	21848	21472	-0.0098	0	34491115	34491115	6.53285914644385e-11	108279455	108281452
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108283417	108290095	3	3	-0.8075	6.53285914644385e-11	108279455	108281452	1.25341919661805e-11	108290095	108296216
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108296216	138307863	7541	7405	-0.0086	1.25341919661805e-11	108290095	108296216	2.52836106226753e-14	138307863	138307863
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-1.0889	2.52836106226753e-14	138307863	138307863	9.53048251047437e-14	138319409	138319409
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	173224400	10676	10522	-0.0127	9.53048251047437e-14	138319409	138319409	1.28855463623008e-108	173224400	173224400
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.9684	1.28855463623008e-108	173224400	173224400	2.86067933271662e-119	173228860	173228860
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	-0.0038	2.86067933271662e-119	173228860	173228860	3.03784865240071e-150	173660684	173660684
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.3603	3.03784865240071e-150	173660684	173660684	1.16859413489141e-140	173666072	173666072
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186672888	3772	3684	-0.0033	1.16859413489141e-140	173666072	173666072	6.94061214207077e-126	186672888	186672888
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186676034	186676034	1	0	NA	6.94061214207077e-126	186672888	186672888	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.1744	NA	NA	NA	3.9054918474376e-124	186680176	186680176
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	297	-0.0115	3.9054918474376e-124	186680176	186680176	5.21331934601242e-09	187329037	187331981
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.6047	5.21331934601242e-09	187329037	187331981	1.15158394499748e-08	187335827	187346058
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	190710812	1129	1116	-0.006	1.15158394499748e-08	187335827	187346058	2.7776148467021e-40	190701706	190725579
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	63	-0.3381	2.7776148467021e-40	190701706	190725579	1.81079082848127e-14	190913517	190940021
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	43	-0.0409	1.81079082848127e-14	190913517	190940021	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	32144814	8732	8552	-0.0044	NA	NA	NA	6.65953002266538e-54	32143140	32146491
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32146491	32203336	30	30	0.5465	6.65953002266538e-54	32143140	32146491	2.25034289733216e-55	32202136	32206845
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32206845	167012359	39896	39162	-0.0071	2.25034289733216e-55	32202136	32206845	7.27435424831388e-16	167012359	167012359
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167015034	167020614	4	3	-0.9654	7.27435424831388e-16	167012359	167012359	7.13356462191312e-15	167020614	167020614
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167022098	180644810	5104	5007	0.01	7.13356462191312e-15	167020614	167020614	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	9206	-0.0042	NA	NA	NA	6.30944382782021e-17	26811016	26811016
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.846	6.30944382782021e-17	26811016	26811016	2.43928054627502e-14	26861184	26863540
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29966336	1219	1201	0.0019	2.43928054627502e-14	26861184	26863540	9.06051058869493e-16	29941766	30005338
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	30062908	29	29	0.3463	9.06051058869493e-16	29941766	30005338	1.64840424348894e-14	30025480	30069635
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30065034	31385778	564	551	0.0104	1.64840424348894e-14	30025480	30069635	2.60919568179702e-17	31385778	31385778
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31390982	3	3	-1.0242	2.60919568179702e-17	31385778	31385778	1.04764898489952e-19	31390982	31390982
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	484	0.0413	1.04764898489952e-19	31390982	31390982	5.22446567587949e-149	32558677	32563252
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32593151	6	6	-2.2279	5.22446567587949e-149	32558677	32563252	1.11269452889247e-20	32590568	32593151
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32713363	39	39	-0.037	1.11269452889247e-20	32590568	32593151	0.0579976169884524	32626619	32728487
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32762061	21	20	0.2876	0.0579976169884524	32626619	32728487	4.43675161263859e-07	32734957	32778933
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	35864636	1334	1312	0.0126	4.43675161263859e-07	32734957	32778933	7.68474533996516e-08	35862270	35864636
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35866245	35872078	4	4	0.6489	7.68474533996516e-08	35862270	35864636	1.32489464482454e-09	35872078	35873335
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35873335	54035000	6908	6781	-0.0023	1.32489464482454e-09	35872078	35873335	4.70954552252801e-295	54035000	54035000
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0363	4.70954552252801e-295	54035000	54035000	1.24675800909695e-293	54042734	54042734
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72917267	4534	4453	-0.0099	1.24675800909695e-293	54042734	54042734	9.9631694353277e-10	72916886	72917267
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72919733	72924440	4	4	-0.6637	9.9631694353277e-10	72916886	72917267	4.12524082856434e-10	72924440	72931542
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74759340	773	760	0.0029	4.12524082856434e-10	72924440	72931542	7.36528123123883e-23	74759340	74759340
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74762234	74762234	1	0	NA	7.36528123123883e-23	74759340	74759340	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74766480	74773321	5	5	0.8889	NA	NA	NA	3.4344114814942e-27	74773321	74773321
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	76530342	575	568	-0.0017	3.4344114814942e-27	74773321	74773321	1.19913834117299e-13	76530342	76530342
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	76531971	76533273	2	2	-1.0047	1.19913834117299e-13	76530342	76530342	6.38247288605842e-11	76533273	76533273
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	76535137	79018959	538	524	-0.0156	6.38247288605842e-11	76533273	76533273	1.65375698358956e-17	79011979	79018959
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79101978	15	15	0.442	1.65375698358956e-17	79011979	79018959	4.58208073682216e-19	79101978	79112799
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79105311	103841482	6760	6648	-0.0138	4.58208073682216e-19	79101978	79112799	1.23123434836224e-31	103841482	103841482
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.1145	1.23123434836224e-31	103841482	103841482	5.17858940903841e-30	103868154	103868154
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22498	-0.0102	5.17858940903841e-30	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	100164752	31062	30487	-0.0021	NA	NA	NA	7.53792062975431e-15	100161629	100164752
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.5511	7.5379206297543e-15	100161629	100164752	1.64052689737192e-06	100174991	100181104
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109967918	4201	4116	0.0021	1.64052689737192e-06	100174991	100181104	7.4266182019603e-10	109967918	109967918
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	0.9513	7.4266182019603e-10	109967918	109967918	1.36652773136374e-10	109974402	109974402
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3929	-0.0143	1.36652773136374e-10	109974402	109974402	1.42705957800852e-250	118611324	118611324
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.7447	1.42705957800852e-250	118611324	118611324	2.00999071013051e-260	118620875	118620875
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3100	-0.0057	2.00999071013051e-260	118620875	118620875	8.80865588632063e-317	125831554	125831554
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.1438	8.80865588632063e-317	125831554	125831554	1.95313182004643e-303	125837524	125837524
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7242	-0.0013	1.95313182004643e-303	125837524	125837524	2.14254638464917e-19	141409512	141417702
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5108	2.14254638464917e-19	141409512	141417702	1.72246465692471e-19	141432778	141440184
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	146350117	1962	1925	-0.0031	1.72246465692471e-19	141432778	141440184	4.87458199083283e-13	146350117	146350117
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146351946	146353730	2	2	-1.0747	4.87458199083283e-13	146350117	146350117	8.18690207563874e-12	146353730	146353730
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	146356235	158821263	4915	4844	0.0029	8.18690207563874e-12	146353730	146353730	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	0.0187	NA	NA	NA	1.77990001563883e-170	581533	581533
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.7841	1.77990001563883e-170	581533	581533	3.21884236895131e-171	588865	588865
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	40892587	13453	13238	-0.003	3.21884236895131e-171	588865	588865	4.22924197408357e-287	40892587	40892587
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.8947	4.22924197408357e-287	40892587	40892587	1.64871062061227e-283	40897469	40897469
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1714	-0.0021	1.64871062061227e-283	40897469	40897469	6.12961110372949e-13	51189068	51191560
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.7555	6.12961110372949e-13	51189068	51191560	1.06931694422812e-12	51200291	51202490
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	146264846	29250	28751	-0.0062	1.06931694422812e-12	51200291	51202490	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15801123	5457	5375	-0.0085	NA	NA	NA	1.14427215755307e-227	15801123	15801123
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15802255	15802255	1	0	NA	1.14427215755307e-227	15801123	15801123	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-4.2959	NA	NA	NA	1.53424130703712e-227	15807123	15807123
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	39048058	7266	7144	-0.0074	1.53424130703712e-227	15807123	15807123	4.77694206996795e-08	38721373	43530076
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39062211	45359327	13	13	-0.3141	4.77694206996795e-08	38721373	43530076	1.94061263697306e-06	43445839	67903104
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	47002187	70926188	333	326	-0.0138	1.94061263697306e-06	43445839	67903104	3.79883815124578e-172	70926188	70926188
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.7069	3.79883815124578e-172	70926188	70926188	5.40909746027133e-162	70930528	70930528
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	86960197	5360	5276	-0.0122	5.40909746027133e-162	70930528	70930528	4.69785501590958e-10	86960197	86960197
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.9361	4.69785501590958e-10	86960197	86960197	1.31387484039556e-09	86965458	86965458
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	100348045	4557	4482	-0.003	1.31387484039556e-09	86965458	86965458	5.41006780157362e-49	100348045	100348045
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.0974	5.41006780157362e-49	100348045	100348045	1.10596311156176e-51	100350814	100350814
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5442	-0.0049	1.10596311156176e-51	100350814	100350814	3.31276965440443e-12	116124007	116124007
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0308	3.31276965440443e-12	116124007	116124007	4.99377796365118e-11	116130333	116130333
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8141	0.0095	4.99377796365118e-11	116130333	116130333	2.80634287661705e-19	137352394	137352394
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3675	2.80634287661705e-19	137352394	137352394	4.38333120132849e-15	137356880	137356880
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1077	0.0165	4.38333120132849e-15	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45489823	14457	14199	-0.0081	NA	NA	NA	8.72151196857237e-15	45461800	46411187
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47017598	73	73	0.1816	8.72151196857237e-15	45461800	46411187	1.16921000132537e-14	46529536	47072924
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47021415	67602429	5660	5542	-0.0085	1.16921000132537e-14	46529536	47072924	1.46670399057728e-08	67597133	67602429
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67605132	67606786	2	2	-0.8906	1.46670399057728e-08	67597133	67602429	1.52106106664723e-08	67606786	67606786
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67609931	77917893	4400	4322	0.0079	1.52106106664723e-08	67606786	67606786	1.73787170573339e-40	77917893	77917893
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.563	1.73787170573339e-40	77917893	77917893	1.63470953293165e-41	77928738	77928738
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19880	-0.0012	1.63470953293165e-41	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1737	0.0224	NA	NA	NA	1.39901711714699e-15	4920907	4923300
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.8211	1.39901711714699e-15	4920907	4923300	3.63101939761989e-14	4932214	4934594
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	350	-0.0029	3.63101939761989e-14	4932214	4934594	1.87084818287200e-35	5738494	5742476
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7541	1.870848182872e-35	5738494	5742476	7.5885396333597e-49	5763749	5766615
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18896166	5219	5147	3e-04	7.5885396333597e-49	5763749	5766615	8.60796405955762e-13	18892456	18896166
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.6204	8.60796405955762e-13	18892456	18896166	4.04849076023829e-13	18917191	18929375
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	49663240	9339	9186	-0.001	4.04849076023829e-13	18917191	18929375	4.47817881039059e-11	49663240	49663240
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49666382	49671267	2	2	-0.9911	4.47817881039059e-11	49663240	49663240	0.195573091594269	49671267	49699428
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49710027	8	8	-2.3339	0.195573091594269	49671267	49699428	8.47060776925966e-112	49699428	49710027
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55124730	180	177	-0.0137	8.47060776925966e-112	49699428	49710027	1.41359753118466e-29	55114405	55129329
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55209626	37	37	0.4331	1.41359753118466e-29	55114405	55129329	1.39614146606918e-35	55205278	55221692
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	88258151	12456	12221	0.0075	1.39614146606918e-35	55205278	55221692	1.84682927943226e-21	88254559	88272470
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88268465	88305485	14	13	-0.5541	1.84682927943226e-21	88254559	88272470	3.40220051202585e-22	88299438	88306930
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88306930	107284914	5815	5728	-0.0134	3.40220051202585e-22	88299438	88306930	1.86601842522191e-108	107284914	107284914
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-3.1215	1.86601842522191e-108	107284914	107284914	9.0304112849293e-109	107292148	107292148
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9886	9e-04	9.0304112849293e-109	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3675	0.008	NA	NA	NA	3.98888259130507e-46	9523923	9531133
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	0.8906	3.98888259130507e-46	9523923	9531133	1.08529767890198e-42	9578398	9589725
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	10462211	331	325	-0.0146	1.08529767890198e-42	9578398	9589725	6.43783994133094e-10	10457163	10466791
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10491341	11	11	-0.4432	6.43783994133094e-10	10457163	10466791	1.62876587396421e-08	10480460	10498541
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10493984	11104973	230	222	-0.0286	1.62876587396421e-08	10480460	10498541	2.01543315926684e-35	11104973	11109483
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	0.7958	2.01543315926684e-35	11104973	11109483	9.07564074806298e-41	11130871	11143592
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	69138621	19337	18990	-0.0019	9.07564074806298e-41	11130871	11143592	2.40420757559412e-52	69138621	69138621
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-2.1252	2.40420757559412e-52	69138621	69138621	1.02457703039259e-51	69164231	69164231
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	132289090	21486	21096	7e-04	1.02457703039259e-51	69164231	69164231	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7217	-0.008	NA	NA	NA	3.79088070081174e-155	37953582	37953582
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.6793	3.79088070081174e-155	37953582	37953582	2.76461666584715e-164	37957844	37957844
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	63118944	8160	8034	-0.0098	2.76461666584715e-164	37957844	37957844	1.13806319641239e-14	63118944	63118944
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-1.1365	1.13806319641239e-14	63118944	63118944	8.74670780336202e-17	63130828	63130828
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	68142120	1232	1213	-0.0039	8.74670780336202e-17	63130828	63130828	7.03308113186365e-09	68134536	68147831
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68168882	12	11	0.3524	7.03308113186365e-09	68134536	68147831	3.60490742023324e-08	68163523	68179586
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68169957	71373779	916	900	-0.0072	3.60490742023324e-08	68163523	68179586	7.24943269103167e-56	71373779	71373779
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71375082	71375082	1	0	NA	7.24943269103167e-56	71373779	71373779	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.3794	NA	NA	NA	5.46553627603624e-22	71377671	71377671
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	71703277	105	101	-0.0016	5.46553627603624e-22	71377671	71377671	4.7374137359625e-08	71703277	71703277
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-0.8827	4.7374137359625e-08	71703277	71703277	5.50959820370694e-09	71708737	71720727
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	100690991	9308	9166	-0.0067	5.50959820370694e-09	71708737	71720727	3.21765396561580e-67	100690991	100690991
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.3522	3.2176539656158e-67	100690991	100690991	8.87316973777973e-61	100693892	100693892
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113657214	4393	4303	-0.0073	8.87316973777973e-61	100693892	100693892	1.43612833221706e-28	113654946	113759859
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113758453	113788788	17	17	0.5361	1.43612833221706e-28	113654946	113759859	9.63592392760367e-18	113788788	113788788
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-0.8952	9.63592392760367e-18	113788788	113788788	2.53138030185971e-15	113792974	113792974
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	113828449	15	15	0.3655	2.53138030185971e-15	113792974	113792974	0.0345280964421128	113805042	113892403
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113828757	114123340	135	133	0.5492	0.0345280964421128	113805042	113892403	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	5	0.1965	NA	NA	NA	0.00082471503614869	18508651	19323579
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	19494416	55	54	0.5479	0.00082471503614869	18508651	19323579	1.87831354842319e-91	19492531	19497023
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5595	-0.0025	1.87831354842319e-91	19492531	19497023	1.80268122843669e-20	34674458	34674458
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1103	1.80268122843669e-20	34674458	34674458	4.61689853882808e-23	34683810	34683810
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1864	-0.0053	4.61689853882808e-23	34683810	34683810	1.31003008871535e-10	40659171	40676611
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.5071	1.31003008871535e-10	40659171	40676611	3.55463998571467e-10	40722360	40741934
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	60898943	6485	6365	-0.0109	3.55463998571467e-10	40722360	40741934	3.51892383753879e-21	60898943	60898943
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	60901636	60909492	4	4	-0.943	3.51892383753879e-21	60898943	60898943	5.60160779344034e-20	60909492	60909492
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	60912874	72595934	5040	4952	-0.0038	5.60160779344034e-20	60909492	60909492	4.98452376290597e-17	72595934	72595934
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72597009	72600731	3	3	-1.0077	4.98452376290597e-17	72595934	72595934	2.17795189546674e-15	72600731	72600731
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72602517	73071404	233	230	-0.0069	2.17795189546674e-15	72600731	72600731	4.92392021640629e-15	73061942	73071404
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.6426	4.92392021640629e-15	73061942	73071404	1.91408939650947e-15	73092112	73101327
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	101827031	10727	10513	5e-04	1.91408939650947e-15	73092112	73101327	9.05743983817649e-11	101827031	101827031
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101828754	101830021	2	2	-1.0125	9.05743983817649e-11	101827031	101827031	3.18373295371983e-09	101830021	101830021
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101831148	106358491	1729	1688	0.018	3.18373295371983e-09	101830021	101830021	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.0434	NA	NA	NA	8.87147260337128e-07	18692865	18810004
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19421704	88	86	-0.5138	8.87147260337128e-07	18692865	18810004	5.09843837942926e-06	19412049	19424067
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19424067	19537035	5	5	-1.0035	5.09843837942926e-06	19412049	19424067	0.00160124321225735	19465359	19822150
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20308014	58	58	-0.5525	0.00160124321225735	19465359	19822150	8.92605905990354e-99	20065525	20310916
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	74669752	21554	21200	-0.0032	8.92605905990354e-99	20065525	20310916	8.81544686997343e-260	74669752	74669752
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.3814	8.81544686997343e-260	74669752	74669752	1.79587115829359e-245	74680439	74680439
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	169	0.0049	1.79587115829359e-245	74680439	74680439	5.68189279733803e-24	75115806	75115806
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.3575	5.68189279733803e-24	75115806	75115806	1.08592343005858e-20	75119713	75119713
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9253	-9e-04	1.08592343005858e-20	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	8656236	3268	3213	0.0164	NA	NA	NA	1.81458110323939e-43	8656236	8656236
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8660007	8674380	9	9	-0.9472	1.81458110323939e-43	8656236	8656236	2.67638197833848e-44	8674380	8674380
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8678561	31862577	7295	7163	0.0117	2.67638197833848e-44	8674380	8674380	8.67346150983383e-09	31843922	32481309
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	32379126	1	0	NA	8.67346150983383e-09	31843922	32481309	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	32535587	11	10	0.4288	NA	NA	NA	0.000588716277325386	32532079	32809658
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32537830	33469289	16	15	0.1229	0.000588716277325386	32532079	32809658	3.86659987466867e-05	33348511	33501907
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33495501	33536526	16	16	0.4104	3.86659987466867e-05	33348511	33501907	2.93374197302503e-14	33533440	33647856
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	75093957	9907	9733	0.0038	2.93374197302503e-14	33533440	33647856	1.9068575190378e-18	75093957	75093957
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0657	1.9068575190378e-18	75093957	75093957	9.82902648929976e-20	75100865	75100865
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	602	-0.0155	9.82902648929976e-20	75100865	75100865	8.60274795976843e-312	76925748	76925748
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76935880	5	5	-3.629	8.60274795976843e-312	76925748	76925748	0.000296471654177661	76933534	76935880
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76937156	76942679	4	3	-1.1966	0.000296471654177661	76933534	76935880	9.41572232787258e-22	76942679	76942679
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88690571	4512	4433	0.0038	9.41572232787258e-22	76942679	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	0.0382	NA	NA	NA	2.76145464987396e-13	1028979	1028979
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.2382	2.76145464987396e-13	1028979	1028979	5.56707462686684e-15	1030766	1030766
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	4615069	1631	1606	0.0147	5.56707462686684e-15	1030766	1030766	1.14093842434819e-20	4613550	4615069
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4617676	4629628	7	6	-0.8118	1.14093842434819e-20	4613550	4615069	2.57254165665895e-22	4629628	4633220
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4633220	32828797	10364	10140	0.0125	2.57254165665895e-22	4629628	4633220	3.11872053697476e-242	32828797	32828797
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.6199	3.11872053697476e-242	32828797	32828797	6.35223616618738e-214	32832642	32832642
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1412	0.0114	6.35223616618738e-214	32832642	32832642	1.00261548825055e-228	36673853	36673853
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-2.8621	1.00261548825055e-228	36673853	36673853	1.44630688013694e-235	36684619	36684619
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	38785056	918	895	0.0203	1.44630688013694e-235	36684619	36684619	1.56177771367283e-09	38784700	38785056
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38793428	38797777	3	3	0.8052	1.56177771367283e-09	38784700	38785056	2.63547921011462e-09	38797777	38800654
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38800654	41566540	1111	1088	0.0276	2.63547921011462e-09	38797777	38800654	3.72167600835239e-58	41562786	41570512
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	45	-0.4793	3.72167600835239e-58	41562786	41570512	1.46561254500348e-60	41704093	42143048
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	58435991	5911	5814	0.0093	1.46561254500348e-60	41704093	42143048	3.40231304150205e-07	58432074	58441144
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58452260	7	7	0.4503	3.40231304150205e-07	58432074	58441144	4.9673092210066e-07	58445744	58459873
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	74875257	6290	6174	0.0103	4.9673092210066e-07	58445744	58459873	4.85463785950048e-28	74872990	74875257
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74877854	74904114	15	15	0.5913	4.85463785950048e-28	74872990	74875257	4.41798700286728e-23	74904114	74905971
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78653545	1456	1423	0.0139	4.41798700286728e-23	74904114	74905971	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	173	0.0355	NA	NA	NA	1.46366937676587e-16	500897	500897
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	-1.0961	1.46366937676587e-16	500897	500897	7.19385263036635e-14	505456	505456
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	53092949	16022	15733	-0.0078	7.19385263036635e-14	505456	505456	2.55827738232928e-183	53092949	53092949
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-3.8597	2.55827738232928e-183	53092949	53092949	1.07794480842045e-173	53099601	53099601
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6651	-0.0091	1.07794480842045e-173	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19694025	9027	8859	0.0348	NA	NA	NA	0	19694025	19694025
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-5.3125	0	19694025	19694025	0	19700620	19700620
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	63788698	14029	13794	0.0237	0	19700620	19700620	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	576	0.0109	NA	NA	NA	1.05296160353516e-218	1506379	1511632
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-2.5574	1.05296160353516e-218	1506379	1511632	0	1531162	1532433
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20597	0.0039	0	1531162	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	13612839	27	26	0.2978	NA	NA	NA	1.06469152224278e-12	10152384	13686813
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13615502	43645627	11871	11657	-0.0033	1.06469152224278e-12	10152384	13686813	6.02119177138427e-16	43644038	43648176
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43661998	9	9	0.566	6.02119177138427e-16	43644038	43648176	2.79889559903941e-13	43659103	43664367
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43663166	46922972	1534	1502	0.0139	2.79889559903941e-13	43659103	43664367	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2922	0.0189	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-3.6474	0	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32110063	5042	4946	0.0141	0	22720195	22725305	0	32110063	32110063
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-5.6814	0	32110063	32110063	0	32112051	32112051
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	35472378	1503	1473	0.0073	0	32112051	32112051	5.92266232247951e-29	35472378	35472378
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.6541	5.92266232247951e-29	35472378	35472378	3.37473633997648e-20	35476942	35476942
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35905262	247	241	0.0466	3.37473633997648e-20	35476942	35476942	6.78102585873898e-06	35904346	35905262
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35906129	35909117	2	2	0.8764	6.78102585873898e-06	35904346	35905262	3.88369965227557e-07	35909117	35912023
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35912023	37685496	962	936	0.0386	3.88369965227557e-07	35909117	35912023	1.87349887781728e-44	37683516	37689058
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	14	-0.7465	1.87349887781728e-44	37683516	37689058	1.31379598591321e-41	37715370	37718669
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41220567	1824	1795	0.0057	1.31379598591321e-41	37715370	37718669	9.8525177385462e-14	41216678	41246992
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41279485	11	11	0.4991	9.8525177385462e-14	41216678	41246992	4.6911314446184e-12	41248301	41287060
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	49571068	3941	3871	0.0173	4.6911314446184e-12	41248301	41287060	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	-0.0201	NA	NA	NA	5.93648723416005e-08	122273	127113
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.8424	5.93648723416005e-08	122273	127113	1.1342081002535e-16	129544	132689
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	739	0.0142	1.1342081002535e-16	129544	132689	3.18408799404741e-21	1427392	1431240
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.07	3.18408799404741e-21	1427392	1431240	2.46787088903846e-23	1432891	1432953
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	597	0.0204	2.46787088903846e-23	1432891	1432953	4.77242748521323e-22	2302065	2302065
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0629	4.77242748521323e-22	2302065	2302065	2.00077137231613e-24	2304398	2304398
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2673365	364	358	0.0039	2.00077137231613e-24	2304398	2304398	1.04795359678234e-08	2671030	2674962
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2692523	9	9	-0.4255	1.04795359678234e-08	2671030	2674962	0.029059487691803	2687501	2699364
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2693493	2693493	1	0	NA	0.029059487691803	2687501	2699364	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	13	-0.112	NA	NA	NA	2.84009585902870e-69	2708291	2708291
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	44292	0.9733	2.8400958590287e-69	2708291	2708291	0	154578922	154582414
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	-0.0326	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	124	-4.1974	NA	NA	NA	5.40475952588453e-35	3733715	3733715
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	9	-0.0204	5.40475952588453e-35	3733715	3733715	7.8547326338097e-05	4425391	4948824
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	5593746	6	6	-1.8586	7.8547326338097e-05	4425391	4948824	0.00152059040540112	5422507	6728131
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	173	-3.8637	0.00152059040540112	5422507	6728131	4.30890424996356e-10	7028989	7189475
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-2.8548	4.30890424996356e-10	7028989	7189475	1.45863874261520e-07	7372772	7598374
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7712882	68	67	-3.9696	1.4586387426152e-07	7372772	7598374	6.44078342730943e-10	7705876	7717556
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7713973	7782532	25	25	-2.4168	6.44078342730943e-10	7705876	7717556	0.000253016977008994	7749796	7807668
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-3.4215	0.000253016977008994	7749796	7807668	8.7956047503528e-05	7893056	7905286
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.104	8.7956047503528e-05	7893056	7905286	3.96022213288089e-14	7914104	7914104
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7985612	15	15	-4.1555	3.96022213288089e-14	7914104	7914104	1.22237345598281e-05	7985459	7992221
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992095	8010446	7	7	-2.744	1.22237345598281e-05	7985459	7992221	0.000410769394313162	7999759	8057124
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8280065	62	59	-4.1748	0.000410769394313162	7999759	8057124	3.44475938176437e-12	8259766	8280065
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8313045	11	10	-2.0539	3.44475938176437e-12	8259766	8280065	2.07777803853453e-10	8308608	8324328
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	8538835	48	48	-4.0141	2.07777803853453e-10	8308608	8324328	4.78701459120561e-06	8501447	8550197
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8689019	54	53	-3.1741	4.78701459120561e-06	8501447	8550197	1.21798404358558e-06	8666055	8730690
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8690572	10513747	192	189	-3.9547	1.21798404358558e-06	8666055	8730690	5.34548202140218e-35	10512616	10513747
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.6353	5.34548202140218e-35	10512616	10513747	5.37007142483804e-18	10645500	10645500
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	10655750	2	2	-4.5781	5.37007142483804e-18	10645500	10645500	2.64881821308915e-31	10655750	10655750
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11249952	11698871	4	4	-1.1906	2.64881821308915e-31	10655750	10655750	7.0462309086274e-20	11698871	11698871
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.3958	7.0462309086274e-20	11698871	11698871	3.25934838389964e-27	12541506	12541506
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12557151	7	7	-1.0421	3.25934838389964e-27	12541506	12541506	3.94817159150002e-07	12557151	12557151
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12558585	12558585	1	0	NA	3.94817159150002e-07	12557151	12557151	NA	NA	NA
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12559410	12575215	7	7	-3.0985	NA	NA	NA	8.75440845223071e-05	12573266	12579534
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12576110	12590969	9	9	-1.2575	8.75440845223071e-05	12573266	12579534	0.00146703529750008	12586920	12608293
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12973899	102	100	-2.9913	0.00146703529750008	12586920	12608293	0.000401111292440522	12882767	13012038
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13129843	64	64	-2.1804	0.000401111292440522	12882767	13012038	4.95734371486126e-09	13112411	13147329
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13256555	42	38	-3.5387	4.95734371486126e-09	13112411	13147329	0.00159917158337507	13150942	13314244
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13508638	115	114	-4.1998	0.00159917158337507	13150942	13314244	0.00258989720765595	13485512	13520364
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13508776	13525650	8	8	-3.0763	0.00258989720765595	13485512	13520364	0.00172769443648771	13520364	13533864
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13526852	13570660	29	29	-4.1597	0.00172769443648771	13520364	13533864	0.00134692608867173	13549185	13591921
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13572080	13716000	25	24	-3.5005	0.00134692608867173	13549185	13591921	4.77244110483098e-17	13701755	13717328
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	13823928	27	27	-4.7803	4.77244110483098e-17	13701755	13717328	5.88008754253724e-09	13820955	13851627
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-3.0856	5.88008754253724e-09	13820955	13851627	1.60927323820163e-06	13853174	13870089
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	122	-4.4661	1.60927323820163e-06	13853174	13870089	7.32382084649369e-10	14122036	14122129
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.8573	7.32382084649369e-10	14122036	14122129	9.1334510556008e-22	14143748	14143748
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14310145	12	12	-4.6421	9.1334510556008e-22	14143748	14143748	3.00236010857518e-07	14266331	14318786
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14312365	14326935	8	8	-3.7548	3.00236010857518e-07	14266331	14318786	3.201429276536e-06	14325320	14330251
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14328579	14342834	8	8	-4.7174	3.201429276536e-06	14325320	14330251	0.0190054001926066	14340202	14404979
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	94	-3.5102	0.0190054001926066	14340202	14404979	2.95176138046786e-15	14503927	14530134
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	23	-1.4769	2.95176138046786e-15	14503927	14530134	1.60201018061674e-16	14563486	14596156
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15296498	202	196	-3.6691	1.60201018061674e-16	14563486	14596156	0.00296561196989525	15251900	15303557
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15298885	15327221	22	22	-4.6379	0.00296561196989525	15251900	15303557	8.33221457433862e-06	15319560	15330645
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15329893	15348526	12	12	-3.527	8.33221457433862e-06	15319560	15330645	0.000567694314651195	15343136	15364426
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15350821	15408015	37	37	-4.4311	0.000567694314651195	15343136	15364426	3.07116177115713e-05	15402860	15443458
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15687088	107	104	-3.4174	3.07116177115713e-05	15402860	15443458	4.3815145986814e-06	15590299	15707307
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15915466	37	37	-4.516	4.3815145986814e-06	15590299	15707307	7.83208195138794e-07	15873423	15956978
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	158	-3.4871	7.83208195138794e-07	15873423	15956978	7.92992593073268e-12	16247995	16541139
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17772524	222	220	-4.2499	7.92992593073268e-12	16247995	16541139	1.54655222053686e-07	17746562	17782139
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17775484	17792907	8	7	-2.113	1.54655222053686e-07	17746562	17782139	4.13073311240361e-06	17789346	17801068
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17795392	25737663	812	794	-4.0454	4.13073311240361e-06	17789346	17801068	1.84315728322793e-63	23283689	26870361
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26952278	33	30	-1.1082	1.84315728322793e-63	23283689	26870361	0.000218063639041944	26945084	27006628
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26957814	27039222	19	19	-2.6308	0.000218063639041944	26945084	27006628	0.000109986621135793	27006628	27068911
MSK_252152912766_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.7088	0.000109986621135793	27006628	27068911	NA	NA	NA
