Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	10385648	3488	3152	0.1167	NA	NA	NA	1.44754674072152e-08	10360240	10398029
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10389255	10445527	29	28	0.4219	1.44754674072152e-08	10360240	10398029	9.52023550683204e-06	10423229	10466299
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10446639	10667699	99	92	0.1461	9.52023550683204e-06	10423229	10466299	1.82211199957333e-14	10650334	10685436
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10668894	10901984	87	77	0.4632	1.82211199957333e-14	10650334	10685436	1.17553358394514e-26	10883191	10921043
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10904313	15409668	1497	1345	0.146	1.17553358394514e-26	10883191	10921043	1.25278818284934e-07	15409548	15409668
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15410786	15415885	4	3	-0.7053	1.25278818284934e-07	15409548	15409668	1.98325611327863e-08	15415885	15417225
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15417225	16698906	576	523	0.1657	1.98325611327863e-08	15415885	15417225	2.90966930266452e-13	16660353	16836160
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	17127039	27	24	-0.2318	2.90966930266452e-13	16660353	16836160	2.08440303969961e-10	17102601	17160385
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	21477809	1872	1697	0.1237	2.08440303969961e-10	17102601	17160385	2.88879756786789e-21	21468461	21503933
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21480421	21685945	57	49	0.4788	2.88879756786789e-21	21468461	21503933	2.89427805711940e-20	21598210	21695957
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21685978	21685978	1	0	NA	2.8942780571194e-20	21598210	21695957	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21689458	26956100	2152	1964	0.1329	NA	NA	NA	0	26949740	26963626
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26957829	46078528	7541	6872	-0.2881	0	26949740	26963626	0	46044090	46106423
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	46082146	72537426	10464	9522	-0.0543	0	46044090	46106423	0	72537426	72537426
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-3.6001	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	0	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	144003068	15697	14188	-0.059	NA	NA	NA	0	143824531	144113654
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	150839754	1862	1697	0.1843	0	143824531	144113654	2.42238362745101e-21	150839754	150839754
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	2.42238362745101e-21	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150851439	5	3	-1.2109	NA	NA	NA	8.16371277709804e-27	150851439	150851439
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	69	0.1611	8.16371277709804e-27	150851439	150851439	1.37552183482032e-278	151026228	151026228
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.4771	1.37552183482032e-278	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157128689	2678	2452	0.1866	0	151036435	151036435	1.54420177747807e-64	157128689	157128689
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157133150	157133150	1	0	NA	1.54420177747807e-64	157128689	157128689	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.7461	NA	NA	NA	1.64684122741367e-68	157136342	157136342
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3756	0.1781	1.64684122741367e-68	157136342	157136342	4.5126522129496e-10	167479184	167483267
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	-0.4363	4.5126522129496e-10	167479184	167483267	1.84884663613963e-163	167507898	167520743
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	6549	0.2666	1.84884663613963e-163	167507898	167520743	8.02002984998848e-162	185969643	185979586
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.4531	8.02002984998848e-162	185969643	185979586	1.70397848006870e-55	185988138	185988138
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200598243	4136	3745	0.2576	1.7039784800687e-55	185988138	185988138	5.35009409985894e-57	200585836	200612164
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200665389	23	23	-0.0998	5.35009409985894e-57	200585836	200612164	1.79474274060466e-10	200652799	200678532
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	212310657	4442	4045	0.243	1.79474274060466e-10	200652799	200678532	1.05036017553557e-99	212298109	212339750
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	212313680	213048147	240	213	-0.1171	1.05036017553557e-99	212298109	212339750	6.28406972309261e-183	213032993	213079619
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	213056077	227875096	5258	4812	0.3683	6.28406972309261e-183	213032993	213079619	1.50988586344453e-44	227875096	227875096
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8316	1.50988586344453e-44	227875096	227875096	5.16239395279721e-20	227882805	227882805
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	240513555	4924	4466	0.3373	5.16239395279721e-20	227882805	227882805	3.70307157567708e-11	240494698	240540338
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240517365	240609759	29	26	-0.0103	3.70307157567708e-11	240494698	240540338	4.28749802288185e-09	240566493	240622683
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240611729	245818325	2056	1846	0.3001	4.28749802288185e-09	240566493	240622683	4.15029462606036e-07	245804438	245821913
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	245819445	245846653	13	12	0.7038	4.15029462606036e-07	245804438	245821913	0.00221968153780834	245836419	245903503
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	245848782	245850924	2	0	NA	0.00221968153780834	245836419	245903503	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	245852580	247186514	456	419	0.3903	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	25553852	7568	6900	-0.4468	NA	NA	NA	0	25538809	25565510
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	25556069	31299726	2582	2344	-0.0962	0	25538809	25565510	1.69747253546543e-204	31275301	31318821
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	31301378	31301378	1	0	NA	1.69747253546543e-204	31275301	31318821	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	31302525	34543992	1371	1256	0.1588	NA	NA	NA	8.4308333041034e-10	34527334	34554208
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	12	0.6308	8.4308333041034e-10	34527334	34554208	1.07758652914939e-28	34575366	34582272
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	42322661	3252	2956	0.1118	1.07758652914939e-28	34575366	34582272	1.06613499683211e-307	42294964	42348397
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42324021	50763269	3335	3028	0.3428	1.06613499683211e-307	42294964	42348397	1.23202451304621e-157	50751826	50775196
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50764653	52600588	609	544	0.0457	1.23202451304621e-157	50751826	50775196	6.12301866232145e-14	52588009	52600588
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.9006	6.12301866232145e-14	52588009	52600588	8.111752889277e-104	52622353	52645468
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	52639605	1	0	NA	8.111752889277e-104	52622353	52645468	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52642716	66357387	4556	4135	0.1887	NA	NA	NA	3.36454897301414e-208	66357387	66357387
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-5.2455	3.36454897301414e-208	66357387	66357387	1.35654097932611e-266	66360747	66360747
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	69290089	902	822	0.3449	1.35654097932611e-266	66360747	66360747	4.16126503077047e-248	69271037	69318735
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	69292327	183496112	33284	30313	0.0969	4.16126503077047e-248	69271037	69318735	0	183470727	183512613
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	183498576	184989307	347	323	0.3625	0	183470727	183512613	1.67523094220532e-288	184977314	185008245
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184991217	242505261	19932	18071	0.0165	1.67523094220532e-288	184977314	185008245	0	242493814	242512310
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242506262	242602220	41	39	0.5353	0	242493814	242512310	3.14329445745131e-06	242586855	242630188
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242603774	242689978	25	23	0.2055	3.14329445745131e-06	242586855	242630188	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	26778711	9196	8320	-0.3685	NA	NA	NA	0	26755669	26818521
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	26782489	32074432	1600	1460	-0.0779	0	26755669	26818521	4.34943207457484e-36	32074432	32074432
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.6304	4.34943207457484e-36	32074432	32074432	0	32080848	32080848
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	66769722	13232	12038	0.0394	0	32080848	32080848	0	66756840	66783023
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	66773737	67106432	72	66	0.4438	0	66756840	66783023	4.6458278241695e-119	67089743	67124729
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67108881	96684165	7092	6480	0.1224	4.6458278241695e-119	67089743	67124729	0	96605133	96788912
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	96697026	150748947	18027	16368	-0.1616	0	96605133	96788912	3.73469815036804e-299	150748947	150748947
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-1.9427	3.73469815036804e-299	150748947	150748947	2.86250972364012e-28	150752600	150752600
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	161957489	3802	3489	0.0091	2.86250972364012e-28	150752600	150752600	0	161949617	161962670
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	161959297	163992903	463	428	0.4918	0	161949617	161962670	5.34538880459393e-39	163992903	164001657
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164012645	5	4	2.0126	5.34538880459393e-39	163992903	164001657	0.00319523353653158	164001657	164019640
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	164107951	23	21	1.0453	0.00319523353653158	164001657	164019640	1.18721915007018e-99	164105613	164115417
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	185354949	6754	6110	0.3905	1.18721915007018e-99	164105613	164115417	1.8958873385148e-181	185334471	185369636
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	185357104	186981847	706	638	0.6809	1.8958873385148e-181	185334471	185369636	3.14614239224782e-203	186969895	186995064
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	186983703	186983703	1	0	NA	3.14614239224782e-203	186969895	186995064	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	186986316	192546280	2087	1897	0.3443	NA	NA	NA	2.30526487736654e-235	192546280	192546280
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-4.2626	2.30526487736654e-235	192546280	192546280	2.94671987978271e-230	192550989	192550989
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	196822133	1581	1432	0.3812	2.94671987978271e-230	192550989	192550989	3.52032463467542e-22	196810503	196905767
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196835413	1	0	NA	3.52032463467542e-22	196810503	196905767	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196957322	28	23	-0.1345	NA	NA	NA	2.79834844006305e-23	196946355	196964180
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199321387	953	863	0.4418	2.79834844006305e-23	196946355	196964180	0.0107514890272105	199307774	199321387
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199324677	199329592	2	2	-0.2505	0.0107514890272105	199307774	199321387	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	75050	13	13	-0.2653	NA	NA	NA	0.000215998148931366	58159	103540
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78043	685953	202	183	0.0479	0.000215998148931366	58159	103540	1.80493648369313e-09	685953	685953
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.1915	1.80493648369313e-09	685953	685953	2.35259436206738e-83	691065	691065
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9815760	3176	2866	-0.1957	2.35259436206738e-83	691065	691065	5.77215126472456e-80	9764491	9815760
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.485	5.77215126472456e-80	9764491	9815760	2.52492876572999e-07	9842644	9861329
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5667	-0.2392	2.52492876572999e-07	9842644	9861329	0	34445002	34445002
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-4.1606	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	44338796	3255	2955	-0.2552	0	34491115	34491115	0	44323352	44354348
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	44342129	78330257	8433	7653	0.0553	0	44323352	44354348	0	78319700	78340577
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78331719	108279455	10159	9221	-0.3178	0	78319700	78340577	1.98390069776930e-36	108279455	108279455
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108281452	108281452	1	0	NA	1.9839006977693e-36	108279455	108279455	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108283417	108290095	3	3	-1.4243	NA	NA	NA	1.23212621310613e-14	108290095	108290095
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108296216	118199188	3065	2782	-0.3007	1.23212621310613e-14	108290095	108290095	3.88537931491104e-54	118142054	118215638
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	118203462	118935683	155	140	-0.6197	3.88537931491104e-54	118142054	118215638	0	118896819	118962867
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	118945040	173224400	14999	13641	-0.1871	0	118896819	118962867	0	173224400	173224400
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.1433	0	173224400	173224400	4.16686723214359e-75	173228860	173228860
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	174757637	662	605	-0.2469	4.16686723214359e-75	173228860	173228860	1.37310792932373e-12	174743544	174760560
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174760560	174844730	16	15	-0.6869	1.37310792932373e-12	174743544	174760560	5.9611559117575e-12	174838403	174879158
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174849301	174857984	2	0	NA	5.9611559117575e-12	174838403	174879158	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	174864307	186676034	3288	2997	-0.2424	NA	NA	NA	6.21722548760486e-23	186676034	186676034
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	1.4316	6.21722548760486e-23	186676034	186676034	6.01435814443253e-23	186680176	186680176
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190695751	1435	1320	-0.2686	6.01435814443253e-23	186680176	186680176	2.65499002691844e-14	190652522	190725579
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190701706	190921041	69	60	-0.5161	2.65499002691844e-14	190652522	190725579	2.9826776007645e-08	190907760	190953947
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	42	-0.2604	2.9826776007645e-08	190907760	190953947	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3599	0.2608	NA	NA	NA	4.77811444544424e-10	12853151	12857302
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.4064	4.77811444544424e-10	12853151	12857302	1.17650869402021e-08	12873052	13263185
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	37066127	6470	5873	0.3204	1.17650869402021e-08	12873052	13263185	0	37051902	37080649
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37067312	46150784	2680	2457	0.0436	0	37051902	37080649	2.04555397804552e-217	45924620	49650251
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	49595677	52366298	598	534	0.4043	2.04555397804552e-217	45924620	49650251	0	52362809	52369898
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52369898	58898874	2197	1992	-0.3555	0	52362809	52369898	1.55324332980744e-08	58888863	58902239
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58900737	58928310	16	16	-0.7332	1.55324332980744e-08	58888863	58902239	4.92506048578143e-09	58925027	58939725
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58929549	77721879	5569	5049	-0.3835	4.92506048578143e-09	58925027	58939725	2.00688166446454e-10	77721879	77721879
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	77724204	77727599	3	3	-1.2771	2.00688166446454e-10	77721879	77721879	7.00143224012962e-11	77727599	77737344
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	77737344	94221765	4926	4494	-0.4023	7.00143224012962e-11	77727599	77737344	8.78796645043235e-14	94218007	94221765
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94225023	94225023	1	0	NA	8.78796645043235e-14	94218007	94221765	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94227578	94230707	3	3	0.3595	NA	NA	NA	2.11131682472465e-78	94230707	94234581
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94232214	94232214	1	0	NA	2.11131682472465e-78	94230707	94234581	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94234581	137798671	12631	11526	-0.3916	NA	NA	NA	1.53530395086157e-150	137793024	137800567
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137800567	138085671	113	107	0.2225	1.53530395086157e-150	137793024	137800567	9.41541640690516e-105	138080491	138102436
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138090766	138090766	1	0	NA	9.41541640690516e-105	138080491	138102436	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138096543	141060130	1280	1171	-0.2884	NA	NA	NA	0	141041383	141092518
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	141062845	167010748	8191	7475	0.0338	0	141041383	141092518	1.39543893494289e-09	167009150	167010748
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167012359	167012359	1	0	NA	1.39543893494289e-09	167009150	167010748	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167015034	167018925	3	3	-0.8758	NA	NA	NA	8.7811830719074e-09	167018925	167018925
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167020614	167851470	410	372	0.0145	8.7811830719074e-09	167018925	167018925	1.34637338654618e-07	167847557	167853033
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167853033	167861637	6	5	0.6593	1.34637338654618e-07	167847557	167853033	5.92295839996894e-07	167857980	167868695
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167865748	177501851	3421	3129	0.0377	5.92295839996894e-07	167857980	167868695	0	177493930	177512258
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177504486	180644810	1268	1164	-0.3484	0	177493930	177512258	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	236535	54	49	-0.134	NA	NA	NA	2.20789887123818e-11	224667	246974
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	40	-0.508	2.20789887123818e-11	224667	246974	5.36585864264938e-27	320854	331014
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	9822145	3340	3049	-0.094	5.36585864264938e-27	320854	331014	0	9810706	9842267
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	9824700	26801068	5924	5399	0.208	0	9810706	9842267	5.27491698661923e-14	26801068	26801068
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26811016	26811016	1	0	NA	5.27491698661923e-14	26801068	26801068	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.7517	NA	NA	NA	3.36823763545589e-25	26861184	26863540
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32564884	2309	2109	0.1247	3.36823763545589e-25	26861184	26863540	1.47731335973566e-45	32564884	32564884
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32567462	1	0	NA	1.47731335973566e-45	32564884	32564884	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32588005	32590568	2	2	-2.5229	NA	NA	NA	0	32590568	32590568
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32595402	2	2	-1.4842	0	32590568	32590568	1.34864883163733e-279	32595402	32595402
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	54033505	8304	7542	0.15	1.34864883163733e-279	32595402	32595402	5.13137115968176e-269	54033505	54033505
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54035000	54035000	1	0	NA	5.13137115968176e-269	54033505	54033505	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.9395	NA	NA	NA	1.11671329349581e-176	54042734	54042734
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	57407278	1294	1159	0.3036	1.11671329349581e-176	54042734	54042734	9.4017665953196e-64	57399799	57416904
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57410137	57672491	99	88	-0.107	9.4017665953196e-64	57399799	57416904	6.36068983552327e-25	57623527	57754710
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57683389	74762234	3919	3569	0.1715	6.36068983552327e-25	57623527	57754710	7.82189670655857e-23	74759340	74762234
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74766480	74773321	5	5	1.0238	7.82189670655857e-23	74759340	74762234	6.18302918553001e-10	74773321	74780074
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	74869247	17	16	0.3018	6.18302918553001e-10	74773321	74780074	2.3303031000508e-05	74820588	75041517
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74871359	74871359	1	0	NA	2.3303031000508e-05	74820588	75041517	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74873731	76530342	557	514	0.1207	NA	NA	NA	8.1207080835833e-11	76530342	76530342
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	76531971	76533273	2	2	-1.0542	8.1207080835833e-11	76530342	76530342	8.01738870303412e-10	76533273	76533273
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	76535137	79008946	535	491	0.1371	8.01738870303412e-10	76533273	76533273	4.35883326628252e-16	78990768	79011979
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79011979	79091850	16	16	0.68	4.35883326628252e-16	78990768	79011979	2.20371518934909e-40	79079988	79105311
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	85438877	1727	1549	0.2005	2.20371518934909e-40	79079988	79105311	6.55678551166297e-37	85436785	85438877
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	85441755	85446540	3	3	-0.6288	6.55678551166297e-37	85436785	85438877	0.000100155899647482	85446540	85454566
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	85451031	85451031	1	0	NA	0.000100155899647482	85446540	85454566	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	85453259	99581996	3791	3436	0.0444	NA	NA	NA	0	99568612	99614687
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99593006	103841482	1240	1145	-0.3978	0	99568612	99614687	9.28319367928675e-25	103841482	103841482
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.8593	9.28319367928675e-25	103841482	103841482	2.93835442563003e-23	103868154	103868154
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	103873584	1	0	NA	2.93835442563003e-23	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103882598	116268427	3976	3608	-0.3919	NA	NA	NA	2.86565428175521e-45	116221078	116339318
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	116273913	116660556	152	139	-0.692	2.86565428175521e-45	116221078	116339318	8.20711989609696e-53	116645357	116676600
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	116663066	143316064	9131	8315	-0.3723	8.20711989609696e-53	116645357	116676600	1.36588877499822e-36	143309687	143318805
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	143318805	143363128	14	12	0.2101	1.36588877499822e-36	143309687	143318805	1.26896715811788e-34	143346628	143382304
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	143366384	143366384	1	0	NA	1.26896715811788e-34	143346628	143382304	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	143369576	156763167	4827	4377	-0.1958	NA	NA	NA	0	156751264	156798196
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	156769265	168114265	3925	3532	0.1439	0	156751264	156798196	5.00305352001955e-27	168091970	168114265
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168118314	168128760	4	4	0.586	5.00305352001955e-27	168091970	168114265	3.7721195223307e-05	168128760	168134787
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168130666	169357462	429	390	-0.0129	3.7721195223307e-05	168128760	168134787	1.48921801174223e-07	169354667	169357462
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	169359279	169361741	2	2	1.005	1.48921801174223e-07	169354667	169357462	1.66625077078229e-08	169361741	169363046
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	169363046	170753106	452	417	-0.0172	1.66625077078229e-08	169361741	169363046	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	57412514	19095	17349	0.2385	NA	NA	NA	9.83342410682551e-66	57276412	57483517
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57421285	57537313	26	26	0.4788	9.8334241068255e-66	57276412	57483517	4.20095822200631e-278	57531993	57566117
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57540358	100164752	11941	10876	0.0139	4.20095822200631e-278	57531993	57566117	3.18242418796722e-268	100162851	100164752
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100166257	1	0	NA	3.18242418796722e-268	100162851	100164752	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-0.9442	NA	NA	NA	1.98128527845296e-168	100174991	100174991
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	118611324	8199	7436	0.0722	1.98128527845296e-168	100174991	100174991	1.41259512607736e-162	118611324	118611324
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.0479	1.41259512607736e-162	118611324	118611324	7.76054951527045e-98	118620875	118620875
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2888	0.0541	7.76054951527045e-98	118620875	118620875	6.20075844009922e-106	125831554	125831554
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.175	6.20075844009922e-106	125831554	125831554	7.40494231194979e-108	125837524	125837524
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	140073768	6749	6155	-0.0434	7.40494231194979e-108	125837524	125837524	1.60573987048418e-110	140069879	140073768
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140076216	140077609	2	0	NA	1.60573987048418e-110	140069879	140073768	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140079941	140095280	8	8	0.7208	NA	NA	NA	1.48181870395129e-12	140095280	140098824
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140097620	141410894	603	537	0.0749	1.48181870395129e-12	140095280	140098824	6.64988554005787e-12	141405145	141414719
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5724	6.64988554005787e-12	141405145	141414719	8.83863399840206e-127	141434131	141446728
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	158811268	6877	6286	0.0165	8.83863399840206e-127	141434131	141446728	3.39152112993676e-123	158790943	158811268
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158815157	158821263	2	2	0.8022	3.39152112993676e-123	158790943	158811268	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	110	-0.2761	NA	NA	NA	4.38051595417078e-49	581533	581533
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.7595	4.38051595417078e-49	581533	581533	1.58565007267355e-106	588865	588865
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	594169	2	0	NA	1.58565007267355e-106	588865	588865	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	595784	37997440	12412	11371	-0.3064	NA	NA	NA	0	37972619	38000372
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	37998344	131346042	27313	24889	0.2113	0	37972619	38000372	0	131336922	131355638
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131349509	132265746	304	281	0.6033	0	131336922	131355638	4.00734017050242e-93	132224667	132321236
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	132270398	146264846	4414	3988	0.2907	4.00734017050242e-93	132224667	132321236	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	4976	-0.0067	NA	NA	NA	2.50491094378118e-105	15802255	15802255
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.6714	2.50491094378118e-105	15802255	15802255	1.62755559956679e-108	15807123	15807123
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	17900268	793	723	0.1779	1.62755559956679e-108	15807123	15807123	2.87834233453013e-45	17815415	17953821
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	17905189	17905189	1	0	NA	2.87834233453013e-45	17815415	17953821	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	17912020	18774518	219	198	0.4566	NA	NA	NA	8.07014398920196e-70	18761843	18786432
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	18775733	26376895	2104	1933	0.1558	8.07014398920196e-70	18761843	18786432	1.37384747560917e-41	26299182	26443233
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	26389827	27127724	210	193	0.405	1.37384747560917e-41	26299182	26443233	1.20270597393312e-32	27113561	27143670
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27130516	27514323	180	164	0.1097	1.20270597393312e-32	27113561	27143670	6.35021941313442e-53	27498621	27527657
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27515987	27515987	1	0	NA	6.35021941313442e-53	27498621	27527657	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27517842	29725644	701	642	0.4311	NA	NA	NA	1.26406790487418e-122	29691517	29778581
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	29731615	32221273	519	467	0.0964	1.26406790487418e-122	29691517	29778581	2.82069194851585e-114	32148037	32263996
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32230295	39048058	2538	2327	0.3822	2.82069194851585e-114	32148037	32263996	0	38745124	39091349
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39062211	39062211	1	0	NA	0	38745124	39091349	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39088753	86960197	5707	5190	-0.1899	NA	NA	NA	3.45107785675794e-112	86951640	86960197
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.7308	3.45107785675794e-112	86951640	86960197	5.01659414410391e-41	86965458	86968271
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	100348045	4557	4147	-0.2992	5.01659414410391e-41	86965458	86968271	6.12766758075185e-79	100348045	100348045
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-3.599	6.12766758075185e-79	100348045	100348045	2.89666580647441e-81	100350814	100350814
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116122595	5546	5070	-0.3855	2.89666580647441e-81	100350814	100350814	3.4029037743679e-14	116122595	116122595
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116124007	116124007	1	0	NA	3.4029037743679e-14	116122595	116122595	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.753	NA	NA	NA	1.54651910731809e-13	116130333	116130333
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	131194258	5860	5323	-0.3783	1.54651910731809e-13	116130333	116130333	1.44211272987678e-126	131155234	131257124
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	131200918	133250165	796	713	-0.1461	1.44211272987678e-126	131155234	131257124	6.35974408051732e-08	133250165	133250165
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133251786	133254922	2	2	-1.2112	6.35974408051732e-08	133250165	133250165	2.30671765124554e-07	133254922	133257756
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133257756	137352394	1637	1499	-0.1555	2.30671765124554e-07	133254922	133257756	8.09396455560015e-20	137352394	137352394
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.543	8.09396455560015e-20	137352394	137352394	1.59823430598000e-17	137356880	137356880
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	998	-0.1328	1.59823430598e-17	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	33079771	11894	10804	-0.2185	NA	NA	NA	0	33078253	33079771
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	33081186	33083487	2	2	0.7069	0	33078253	33079771	1.91531280437381e-08	33083487	33089794
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	33089794	34463359	366	332	-0.2907	1.91531280437381e-08	33083487	33089794	1.25226920852695e-111	34460483	34465405
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	34465405	34564394	49	45	0.4908	1.25226920852695e-111	34460483	34465405	3.09455190755269e-12	34557927	34565693
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	34565693	34591530	14	14	0.8775	3.09455190755269e-12	34557927	34565693	8.61157759210095e-08	34589602	34604146
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	34594515	34672026	39	35	0.5325	8.61157759210095e-08	34589602	34604146	1.77098818201599e-44	34668848	34679653
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	34674413	43434589	1512	1356	0.0418	1.77098818201599e-44	34668848	34679653	3.74128722639174e-28	43434589	43434589
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43436980	43437056	2	2	-1.088	3.74128722639174e-28	43434589	43434589	1.98091400392345e-29	43437056	43443788
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	43443788	53683740	2424	2200	-0.1388	1.98091400392345e-29	43437056	43443788	6.5828680266976e-32	53679935	53683740
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-1.183	6.5828680266976e-32	53679935	53683740	4.73614203302922e-75	53687880	53687880
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	77917893	8288	7551	-0.1368	4.73614203302922e-75	53687880	53687880	4.76137506560127e-71	77917893	77917893
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.2	4.76137506560127e-71	77917893	77917893	1.73748031627159e-28	77928738	77928738
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	95166992	5428	4928	-0.3828	1.73748031627159e-28	77928738	77928738	1.85712877057150e-22	95142687	95181080
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95169925	95348269	86	78	-0.1044	1.8571287705715e-22	95142687	95181080	3.98517476996223e-22	95331831	95368429
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	95349493	102461507	2925	2643	-0.3799	3.98517476996223e-22	95331831	95368429	0	102446962	102475145
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	102464542	135285645	11774	10699	0.0122	0	102446962	102475145	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	1936	-0.3583	NA	NA	NA	1.68656751741483e-95	5741031	5741031
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-1.7268	1.68656751741483e-95	5741031	5741031	4.48675489941183e-101	5765438	5765438
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	11337855	2362	2155	-0.3531	4.48675489941183e-101	5765438	5765438	0	11325387	11350153
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	11339868	32949800	7186	6532	-0.0327	0	11325387	11350153	1.49555049443011e-125	32934158	32958443
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	32951876	33117008	81	73	-0.3485	1.49555049443011e-125	32934158	32958443	7.46761088774912e-15	33096480	33142472
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	33119491	36594177	1431	1294	-0.1181	7.46761088774912e-15	33096480	33142472	5.53548387471476e-15	36558119	36609544
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	36596816	37140368	84	78	0.106	5.53548387471476e-15	36558119	36609544	1.15251091790635e-24	37072602	37237368
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	37144960	49671267	3422	3108	-0.187	1.15251091790635e-24	37072602	37237368	1.03166321804672e-142	49671267	49683052
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49697128	5	5	-2.9618	1.03166321804672e-142	49671267	49683052	5.84000966360836e-72	49694659	49697128
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49699428	54834320	107	96	-0.2497	5.84000966360836e-72	49694659	49697128	4.62227429993316e-10	51270601	54868139
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	54837079	55118214	74	69	0.0222	4.62227429993316e-10	51270601	54868139	1.04555332805486e-18	55097753	55124730
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	36	0.4786	1.04555332805486e-18	55097753	55124730	1.85602245900731e-86	55207305	55219985
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	71821013	6476	5833	-0.082	1.85602245900731e-86	55207305	55219985	1.32007355023549e-75	71807007	71826212
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	71823432	71857659	12	12	0.3733	1.32007355023549e-75	71807007	71826212	2.43009774516939e-28	71851786	71861247
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	71861247	73242773	627	562	-0.4049	2.43009774516939e-28	71851786	71861247	4.21040663369541e-315	73233140	73250590
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73245427	88258072	5340	4897	0.0194	4.21040663369541e-315	73233140	73250590	4.14551574784815e-117	88241826	88281076
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88258151	88268465	2	0	NA	4.14551574784815e-117	88241826	88281076	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88270043	88305485	13	13	-0.4538	NA	NA	NA	3.69271286221939e-23	88299249	88309871
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88306930	92995711	1216	1094	0.1263	3.69271286221939e-23	88299249	88309871	1.33688860253574e-16	92994078	92995711
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92998398	93005517	4	3	-0.7241	1.33688860253574e-16	92994078	92995711	5.30655028086589e-100	93005517	93008346
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93008346	107284914	4595	4162	0.1047	5.30655028086589e-100	93005517	93008346	6.95952037956911e-102	107284914	107284914
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-2.3692	6.95952037956911e-102	107284914	107284914	2.50159887716043e-168	107292148	107292148
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9162	0.0251	2.50159887716043e-168	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	1774798	768	697	0.2208	NA	NA	NA	1.28132512035100e-108	1752360	1805336
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	1778149	9523923	2974	2734	-0.0084	1.281325120351e-108	1752360	1805336	3.23090049021353e-25	9456107	9531133
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	16	0.6567	3.23090049021353e-25	9456107	9531133	8.11980703599417e-24	9604633	9626623
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10462211	326	305	-0.0299	8.11980703599417e-24	9604633	9626623	2.35897234173086e-16	10459455	10466791
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10485848	10	9	-0.7777	2.35897234173086e-16	10459455	10466791	1.19811310836445e-19	10482217	10491341
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11112600	234	213	-0.0134	1.19811310836445e-19	10482217	10491341	1.97769176455181e-26	11110735	11112600
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	8	0.9027	1.97769176455181e-26	11110735	11112600	3.00034274994962e-27	11140421	11140421
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	16417900	2129	1939	0	3.00034274994962e-27	11140421	11140421	2.30448891636174e-186	16404851	16442219
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	16419378	19281482	665	603	0.3151	2.30448891636174e-186	16404851	16442219	3.68095318318421e-137	19262385	19292960
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19282675	25516077	2217	2030	0.0423	3.68095318318421e-137	19262385	19292960	0	25501237	25528407
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	25517271	32812516	2477	2219	0.3661	0	25501237	25528407	0	32802463	32821957
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	32814427	32814427	1	0	NA	0	32802463	32821957	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	32817122	47153673	3705	3352	-0.0577	NA	NA	NA	5.31421863500806e-09	47101002	47169308
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47154130	47237207	27	26	0.2504	5.31421863500806e-09	47101002	47169308	7.65362778398032e-08	47207497	47258664
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47237793	51819057	2077	1867	-0.0477	7.65362778398032e-08	47207497	47258664	4.61922876510447e-36	51798742	51837705
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51828389	52069843	111	98	0.2787	4.61922876510447e-36	51798742	51837705	8.83857240434677e-37	52058849	52090385
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52070985	69138621	5928	5399	-0.0327	8.83857240434677e-37	52058849	52090385	8.45808413950929e-23	69138621	69138621
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-1.7498	8.45808413950929e-23	69138621	69138621	8.31989076872184e-20	69164231	69164231
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	78665408	2876	2607	-0.1055	8.31989076872184e-20	69164231	69164231	1.37984349716168e-15	78663063	78665408
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78668041	78686371	7	5	-0.8138	1.37984349716168e-15	78663063	78665408	4.0128958192943e-08	78686371	78690106
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	130943064	18051	16367	-0.1388	4.0128958192943e-08	78686371	78690106	1.09173158126579e-37	130943064	130943064
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.0728	1.09173158126579e-37	130943064	130943064	5.80396209222243e-34	130946248	130946248
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	490	-0.152	5.80396209222243e-34	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	24261559	2075	1877	0.0685	NA	NA	NA	0	24251803	24275339
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24264274	28166817	1661	1509	-0.2721	0	24251803	24275339	0	28145566	28175163
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	28170330	31797266	1331	1236	0.1112	0	28145566	28175163	7.96168243442613e-171	31788549	31805687
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31798738	31798738	1	0	NA	7.96168243442613e-171	31788549	31805687	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31800267	32984271	512	467	-0.2416	NA	NA	NA	2.28539173520738e-50	32963938	33000234
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	32986317	33441679	160	142	0.1141	2.28539173520738e-50	32963938	33000234	1.99879344568586e-28	33400457	33474196
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33443424	40172906	2486	2279	0.3536	1.99879344568586e-28	33400457	33474196	0	40155139	40197868
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	40173939	45654351	2351	2156	0.7094	0	40155139	40197868	0	45640031	45667464
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	45657363	56937354	3517	3175	0.377	0	45640031	45667464	0	56888367	57028791
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56946038	56946038	1	0	NA	0	56888367	57028791	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56952687	71375082	3568	3245	0.0827	NA	NA	NA	4.60520400331735e-139	71375082	71375082
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.1438	4.60520400331735e-139	71375082	71375082	1.19350635056915e-143	71377671	71377671
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	100690991	9415	8623	0.0943	1.19350635056915e-143	71377671	71377671	9.38181596291262e-218	100690991	100690991
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.1172	9.38181596291262e-218	100690991	100690991	7.45554625400787e-204	100693892	100693892
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113767184	4399	3988	0.1934	7.45554625400787e-204	100693892	100693892	2.14973379808789e-101	113657214	113780846
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113768612	114115707	161	141	0.6524	2.14973379808789e-101	113657214	113780846	0.058615552030804	114051233	114115707
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114118270	114123340	2	2	-0.0076	0.058615552030804	114051233	114115707	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19535787	62	57	0.6572	NA	NA	NA	4.04355939552075e-29	19489920	19552203
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19538610	21523818	987	889	0.2785	4.04355939552075e-29	19489920	19552203	4.03518941708935e-53	21503195	21540156
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21526238	22061243	270	250	0.5419	4.03518941708935e-53	21503195	21540156	2.26488191600085e-79	22051630	22077968
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	34674458	4431	4047	0.2581	2.26488191600085e-79	22051630	22077968	7.83200648750468e-56	34666996	34674458
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.3822	7.83200648750468e-56	34666996	34674458	2.41296407896706e-17	34683810	34683810
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40680589	1896	1728	0.1549	2.41296407896706e-17	34683810	34683810	9.3193853070502e-09	40670538	40680589
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.4702	9.3193853070502e-09	40670538	40680589	1.47320416750681e-18	40722360	40741934
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	52632375	3396	3090	0.1372	1.47320416750681e-18	40722360	40741934	0	52617564	52641862
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	52633908	69924808	6987	6359	-0.2033	0	52617564	52641862	3.13025292438735e-293	69909231	69943961
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69927262	73071404	1382	1257	0.0608	3.13025292438735e-293	69909231	69943961	2.33910355315488e-11	73060301	73071404
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.7223	2.33910355315488e-11	73060301	73071404	1.20159967194773e-39	73092112	73104540
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	101827031	10727	9758	0.0705	1.20159967194773e-39	73092112	73104540	1.70620270677163e-35	101827031	101827031
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101828754	101830021	2	2	-1.3293	1.70620270677163e-35	101827031	101827031	5.14444313406783e-15	101830021	101830021
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101831148	106358491	1729	1562	0.2351	5.14444313406783e-15	101830021	101830021	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.256	NA	NA	NA	1.44608631821780e-22	18452491	18452491
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-1.0562	1.4460863182178e-22	18452491	18452491	0.000180193632827745	18835660	18846835
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18857376	7	6	-1.6265	0.000180193632827745	18835660	18846835	2.627745485429e-08	18851513	18860281
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18860281	19537035	77	72	-0.9101	2.627745485429e-08	18851513	18860281	2.24397652777408e-10	19412049	19819961
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	51	-0.5706	2.24397652777408e-10	19412049	19819961	1.39669167021866e-43	20053008	20316992
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32678940	3703	3374	-0.1153	1.39669167021866e-43	20053008	20316992	0	32570228	32740038
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32681788	74678353	17854	16266	-0.354	0	32570228	32740038	4.25887102766673e-109	74678353	74678353
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74680338	74680439	2	2	-2.7968	4.25887102766673e-109	74678353	74678353	9.5650217334791e-40	74680439	74680439
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	82332155	2794	2539	-0.4131	9.5650217334791e-40	74680439	74680439	5.22467679902744e-12	82332155	82332155
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-1.7365	5.22467679902744e-12	82332155	82332155	4.92945204298439e-13	82334704	82334704
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	82335935	1	0	NA	4.92945204298439e-13	82334704	82334704	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82340013	87384281	1866	1687	-0.4188	NA	NA	NA	0	87362289	87394728
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87394728	99630163	4669	4241	0.2379	0	87362289	87394728	3.36550760145935e-73	99630163	99630163
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99632987	99632987	1	0	NA	3.36550760145935e-73	99630163	99630163	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.1472	NA	NA	NA	3.54493695369258e-24	99635701	99635701
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	244	0.2734	3.54493695369258e-24	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2689550	1029	946	-0.1991	NA	NA	NA	3.33634390599441e-10	2528832	2709126
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2691706	2859473	77	71	0.0308	3.33634390599441e-10	2528832	2709126	1.61405237627951e-13	2838171	2893900
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2861055	8656236	2162	1968	-0.2015	1.61405237627951e-13	2838171	2893900	1.64484130059451e-32	8656236	8656236
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8660007	8674380	9	9	-1.1848	1.64484130059451e-32	8656236	8656236	3.38212628842852e-43	8674380	8674380
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8678561	30822555	6896	6315	-0.1547	3.38212628842852e-43	8674380	8674380	0	30800414	30856002
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30824644	75087724	10347	9431	-0.4	0	30800414	30856002	2.10692541317481e-65	74974058	75087724
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75089974	75093957	3	3	-0.7996	2.10692541317481e-65	74974058	75087724	8.9264620309684e-69	75093957	75093957
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75097331	1	0	NA	8.9264620309684e-69	75093957	75093957	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75099083	75100865	2	2	1.322	NA	NA	NA	1.47779357877052e-24	75100865	75100865
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	554	-0.4475	1.47779357877052e-24	75100865	75100865	2.51399579051689e-97	76925748	76931247
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.4665	2.51399579051689e-97	76925748	76931247	6.57371695794905e-111	76937156	76940218
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4117	-0.4453	6.57371695794905e-111	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	378	-0.4269	NA	NA	NA	1.17798134790203e-23	1028979	1028979
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4925	1.17798134790203e-23	1028979	1028979	1.00745928151663e-26	1030766	1030766
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	390	-0.3774	1.00745928151663e-26	1030766	1030766	9.69619483397953e-10	1903358	1904451
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906352	2	2	0.7675	9.69619483397953e-10	1903358	1904451	8.94911229145416e-10	1906352	1906352
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906391	1906391	1	0	NA	8.94911229145416e-10	1906352	1906352	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	4615069	1193	1096	-0.3975	NA	NA	NA	2.100727556286e-46	4615069	4615069
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4617676	4628105	6	6	-1.8431	2.100727556286e-46	4615069	4615069	1.68236659162892e-42	4628105	4628105
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4629628	4629628	1	0	NA	1.68236659162892e-42	4628105	4628105	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4633220	7048224	959	859	-0.4226	NA	NA	NA	9.01794434096913e-175	7037103	7058840
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	7049565	11886335	2176	1972	-0.7182	9.01794434096913e-175	7037103	7058840	2.57596257807787e-257	11864126	11897248
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	11888449	16523708	1451	1335	-0.4131	2.57596257807787e-257	11864126	11897248	2.44648376431087e-244	16506846	16744687
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	16525075	22408902	1645	1486	-0.0924	2.44648376431087e-244	16506846	16744687	0	22022794	22459548
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22414320	34154612	4489	4091	0.2312	0	22022794	22459548	0	34149822	34160236
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34156260	36673853	1094	1003	-0.1849	0	34149822	34160236	1.96573952978873e-182	36673853	36673853
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	4	-3.7032	1.96573952978873e-182	36673853	36673853	4.1283282602442e-172	36683509	36683509
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	39352681	1156	1047	-0.1673	4.1283282602442e-172	36683509	36683509	1.06919865972067e-292	39342393	39367061
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39361514	41566540	877	808	0.2544	1.06919865972067e-292	39342393	39367061	1.13435175686507e-42	41562786	41573295
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41568539	1	0	NA	1.13435175686507e-42	41562786	41573295	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41710400	45	41	-0.2879	NA	NA	NA	1.80202987493861e-100	41706870	42143048
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	58435991	5911	5351	0.2668	1.80202987493861e-100	41706870	42143048	5.13045962245262e-101	58392690	58435991
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58452260	7	6	0.6196	5.13045962245262e-101	58392690	58435991	1.73335346221634e-52	58452260	58480117
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	78653545	7761	7091	0.1839	1.73335346221634e-52	58452260	58480117	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	112131	2	2	-0.1825	NA	NA	NA	0.00452648024121965	112131	123157
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	115020	3111261	1064	967	0.4857	0.00452648024121965	112131	123157	1.50902477092945e-31	3102629	3121460
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	3115574	3253192	61	54	0.8894	1.50902477092945e-31	3102629	3121460	3.27711889064431e-40	3246409	3265872
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	3255978	21213542	5516	4996	0.4379	3.27711889064431e-40	3246409	3265872	0	21208910	21225985
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	21220392	43306995	6333	5783	-0.1795	0	21208910	21225985	0	43289145	43330416
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	43309963	76116026	9987	9084	-0.5215	0	43289145	43330416	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	10	-0.5604	NA	NA	NA	1.28712755560108e-29	239700	239700
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.1516	1.28712755560108e-29	239700	239700	1.76765331357079e-17	243026	243026
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	588365	130	122	-0.446	1.76765331357079e-17	243026	243026	1.25129377035436e-16	560930	626534
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	588480	1398325	348	310	-0.1946	1.25129377035436e-16	560930	626534	8.4727727001515e-13	1398325	1398325
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3043	8.4727727001515e-13	1398325	1398325	1.67900571060547e-105	1400840	1400840
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1409386	2	0	NA	1.67900571060547e-105	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1410598	11219692	4569	4156	-0.0603	NA	NA	NA	1.42835562096025e-116	11195226	11236052
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11220766	11445761	106	95	0.2128	1.42835562096025e-116	11195226	11236052	4.24630495201723e-13	11445761	11445761
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11448975	11448975	1	0	NA	4.24630495201723e-13	11445761	11445761	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.5185	NA	NA	NA	1.62701517293812e-19	11452390	11452390
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	19694025	3853	3504	0.2577	1.62701517293812e-19	11452390	11452390	1.04593013468882e-172	19694025	19694025
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.0048	1.04593013468882e-172	19694025	19694025	1.72561379070428e-184	19700620	19700620
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	51305541	8265	7518	0.2802	1.72561379070428e-184	19700620	19700620	0	51264007	51326581
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51306244	63788698	5764	5232	0.0225	0	51264007	51326581	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	537	0.3618	NA	NA	NA	2.65639080596730e-119	1506379	1506379
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-2.0555	2.6563908059673e-119	1506379	1506379	1.97516445976085e-164	1531162	1531162
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3335	0.4429	1.97516445976085e-164	1531162	1531162	1.33193074707636e-10	12095485	12095485
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.6275	1.33193074707636e-10	12095485	12095485	1.47726181438357e-290	12113855	12113855
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	15744	0.229	1.47726181438357e-290	12113855	12113855	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	13876293	54	45	0.1943	NA	NA	NA	8.38594982092676e-07	13869389	13893162
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13877546	13879604	2	0	NA	8.38594982092676e-07	13869389	13893162	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13882260	14047236	8	8	-0.3799	NA	NA	NA	5.08921493050241e-53	13894824	14088878
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14088878	36789648	8481	7780	0.2347	5.08921493050241e-53	13894824	14088878	1.05338486099276e-51	36789648	36789648
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.9066	1.05338486099276e-51	36789648	36789648	3.89061531517267e-25	36791668	36791668
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	36792708	1	0	NA	3.89061531517267e-25	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36793649	37993939	575	524	0.163	NA	NA	NA	1.42654287562372e-292	37989460	38002299
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	37995584	37995584	1	0	NA	1.42654287562372e-292	37989460	38002299	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	37998189	46922972	4317	3942	-0.2722	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2732	0.2478	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	-2.7546	0	22667608	22679305	0	22721042	22725305
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	25605511	1520	1390	0.3772	0	22721042	22725305	4.60327213258072e-17	25579767	25614493
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	25607208	25673652	45	43	0.0878	4.60327213258072e-17	25579767	25614493	3.95754900744875e-52	25656134	25707856
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	25675494	32107727	3475	3172	-0.142	3.95754900744875e-52	25656134	25707856	6.81942368508616e-204	32107727	32107727
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32108954	32110063	2	0	NA	6.81942368508616e-204	32107727	32107727	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-5.4697	NA	NA	NA	2.52129435383606e-216	32112051	32112051
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	33857917	656	595	-0.2034	2.52129435383606e-216	32112051	32112051	2.04142022274906e-19	33835975	33877344
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	33861494	34008487	63	59	0.1106	2.04142022274906e-19	33835975	33877344	2.56482950349604e-15	33989003	34026157
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	34010088	35472378	784	703	-0.1676	2.56482950349604e-15	33989003	34026157	1.25496227109159e-12	35472378	35472378
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.4852	1.25496227109159e-12	35472378	35472378	2.10218973225054e-11	35476942	35476942
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1101	-0.1962	2.10218973225054e-11	35476942	35476942	1.35992731137996e-56	37685496	37690142
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-1.2365	1.35992731137996e-56	37685496	37690142	5.64089376321409e-53	37706998	37715385
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49567768	5775	5259	-0.2214	5.64089376321409e-53	37706998	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2303192	1401	1279	0.3728	NA	NA	NA	2.12079129917769e-10	2302065	2303192
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	1.5486	2.12079129917769e-10	2302065	2303192	1.04805805804121e-09	2304398	2306110
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2416516	123	112	0.4571	1.04805805804121e-09	2304398	2306110	1.68720474622449e-05	2415736	2416516
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2417450	2418497	3	3	-0.366	1.68720474622449e-05	2415736	2416516	1.19639722502134e-06	2418497	2419541
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2418980	2673365	238	222	0.4548	1.19639722502134e-06	2418497	2419541	0.0106632897808395	2634485	2695951
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	24	0.2564	0.0106632897808395	2634485	2695951	1.0418103803762e-65	2708291	2711273
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3175751	186	172	1.5348	1.0418103803762e-65	2708291	2711273	2.34274215038824e-08	3173109	3175751
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3178554	3180568	2	2	-0.0107	2.34274215038824e-08	3173109	3175751	3.77854155115580e-25	3180568	3180568
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3185987	14425217	4129	3762	1.6151	3.7785415511558e-25	3180568	3180568	0	14406815	14429370
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	14429370	25010311	4353	3954	0.8798	0	14406815	14429370	0	24998524	25073625
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	25014037	25027390	2	0	NA	0	24998524	25073625	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	25035985	41092424	5575	5071	0.5262	NA	NA	NA	1.47770452050371e-143	41086594	41105992
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	41095175	42047752	358	329	0.8765	1.47770452050371e-143	41086594	41105992	6.89289372079167e-112	42038905	42074324
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	42060678	61915481	4595	4217	1.2406	6.89289372079167e-112	42038905	42074324	0	58314675	61966811
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	61964601	154442377	25902	23485	0.703	0	58314675	61966811	0	154442377	154442377
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	2.5229	0	154442377	154442377	4.24891045338437e-30	154450309	154450309
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	24	0.6868	4.24891045338437e-30	154450309	154450309	1.60971182623877e-81	154582414	154586690
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	185	-0.339	1.60971182623877e-81	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	109	-3.4016	NA	NA	NA	1.46761991861856e-16	3219200	3773948
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.9895	1.46761991861856e-16	3219200	3773948	3.60644434496671e-09	5422507	6696721
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	163	-3.0419	3.60644434496671e-09	5422507	6696721	1.23759573747583e-08	7021965	7193174
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7485594	126	110	-2.0687	1.23759573747583e-08	7021965	7193174	8.4164743149924e-05	7410906	7485594
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7608619	15	13	-3.8053	8.4164743149924e-05	7410906	7485594	2.14459896650729e-11	7608619	7614417
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	15	-1.7847	2.14459896650729e-11	7608619	7614417	8.15239437301802e-11	7648873	7656915
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7719658	42	39	-3.5787	8.15239437301802e-11	7648873	7656915	4.21704447689606e-08	7713973	7744396
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7722458	7914104	60	54	-2.3869	4.21704447689606e-08	7713973	7744396	1.31899097097907e-08	7855856	7964586
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8289709	85	73	-3.5272	1.31899097097907e-08	7855856	7964586	0.000129838343359238	8121402	8363122
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8697715	118	98	-2.8711	0.000129838343359238	8121402	8363122	2.47095549199258e-05	8591072	8804652
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10473791	174	155	-3.498	2.47095549199258e-05	8591072	8804652	0.0173344113441618	10373935	10503821
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10475426	10515697	13	12	-2.4505	0.0173344113441618	10373935	10503821	2.11750091681466e-07	10511255	10515697
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	10	-0.5634	2.11750091681466e-07	10511255	10515697	0.000674996409677013	10645500	11660512
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-1.9681	0.000674996409677013	10645500	11660512	2.36047460101537e-05	11249952	12511461
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	9	-4.0951	2.36047460101537e-05	11249952	12511461	1.19766222504914e-08	12541506	12545716
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	44	-1.5261	1.19766222504914e-08	12541506	12545716	8.17665901018135e-06	12658135	12696242
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	8	-3.7835	8.17665901018135e-06	12658135	12696242	0.0015414592124998	12725675	12796639
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12741404	1	0	NA	0.0015414592124998	12725675	12796639	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12745259	12924438	44	41	-2.321	NA	NA	NA	0.00380764323741473	12876008	12999095
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13040293	46	43	-1.4648	0.00380764323741473	12876008	12999095	0.00166940285807232	13010597	13040293
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13061201	10	8	-3.3839	0.00166940285807232	13010597	13040293	2.78081580862431e-11	13061201	13066543
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13062151	13128515	25	25	-1.416	2.78081580862431e-11	13061201	13066543	8.30721076810304e-12	13119344	13138841
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	40	-2.8696	8.30721076810304e-12	13119344	13138841	5.44099485030434e-07	13241181	13272362
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13329968	22	21	-4.0042	5.44099485030434e-07	13241181	13272362	3.64467972045567e-11	13328273	13330707
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13330707	13344526	7	7	-1.9266	3.64467972045567e-11	13328273	13330707	0.00185004838104249	13339008	13355297
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13347152	13383467	17	16	-3.1119	0.00185004838104249	13339008	13355297	0.00317287327490704	13363320	13394877
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13384630	13405447	12	9	-3.9954	0.00317287327490704	13363320	13394877	1.61566915881048e-05	13397939	13409104
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13407320	13440139	18	16	-2.8717	1.61566915881048e-05	13397939	13409104	0.0385735906798183	13422642	13445263
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13440916	13459603	10	8	-2.2493	0.0385735906798183	13422642	13445263	2.20871229597151e-07	13459603	13465108
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13460540	13537520	43	39	-3.7134	2.20871229597151e-07	13459603	13465108	1.05932662338851e-06	13529620	13551853
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13539170	13772047	57	49	-2.7873	1.05932662338851e-06	13529620	13551853	6.85488421353422e-08	13760710	13773971
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13773971	13820955	14	12	-4.3152	6.85488421353422e-08	13760710	13773971	1.69864723771530e-19	13820955	13820955
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13823928	13823928	1	0	NA	1.6986472377153e-19	13820955	13820955	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.1044	NA	NA	NA	2.2513814018885e-10	13863616	13868296
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14043659	85	80	-3.7352	2.2513814018885e-10	13863616	13868296	0.000122282620408758	14035462	14045293
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14045293	14056906	4	4	-2.1775	0.000122282620408758	14035462	14045293	6.31028793612182e-05	14047049	14064204
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14063795	14098914	23	20	-3.7832	6.31028793612182e-05	14047049	14064204	0.00380255359007196	14095118	14322984
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14100001	14100001	1	0	NA	0.00380255359007196	14095118	14322984	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14102074	14508021	137	121	-2.8736	NA	NA	NA	9.6252729182071e-15	14503185	14536962
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14524829	2	0	NA	9.6252729182071e-15	14503185	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	22	-0.7847	NA	NA	NA	7.64876504438327e-19	14566592	14587291
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14875973	65	57	-3.541	7.64876504438327e-19	14566592	14587291	0.00304305129334721	14737877	15175378
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	14883615	1	0	NA	0.00304305129334721	14737877	15175378	NA	NA	NA
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	16387273	513	470	-2.8715	NA	NA	NA	6.1282360424477e-06	16102267	16929465
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22139807	938	826	-3.2189	6.1282360424477e-06	16102267	16929465	2.25097531909263e-05	22031798	22158616
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22182080	13	13	-1.7317	2.25097531909263e-05	22031798	22158616	1.19400875449083e-21	22181855	22192409
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22192409	22930737	89	80	-3.9276	1.19400875449083e-21	22181855	22192409	4.21349490314928e-92	22930737	22930737
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-0.8471	4.21349490314928e-92	22930737	22930737	2.03275718094492e-16	26945893	26950080
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.5754	2.03275718094492e-16	26945893	26950080	0.000102070507597999	26965406	26998633
MSK_252152912824_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	42	-1.0905	0.000102070507597999	26965406	26998633	NA	NA	NA
