Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	104892344	38167	37635	0.011	NA	NA	NA	2.98344965744941e-18	104885922	104892344
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104912040	104973892	7	7	-1.0867	2.98344965744941e-18	104885922	104892344	2.75331203861466e-18	104973892	104983508
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104983508	110014625	1435	1421	-0.0107	2.75331203861466e-18	104973892	104983508	4.81418006722992e-08	110010176	110023268
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110015739	1	0	NA	4.81418006722992e-08	110010176	110023268	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110023268	110041712	5	5	-0.8682	NA	NA	NA	3.78408589902248e-08	110039388	110058441
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150841957	5854	5782	-0.0048	3.78408589902248e-08	110039388	110058441	4.10777514273296e-24	150841957	150841957
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150843192	150843192	1	0	NA	4.10777514273296e-24	150841957	150841957	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-2.2949	NA	NA	NA	5.39114491482823e-24	150846148	150846148
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	5.39114491482823e-24	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	247186514	35675	35182	0.0016	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11384	0.0035	NA	NA	NA	2.73654728025992e-14	34539603	34551222
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-0.6051	2.73654728025992e-14	34539603	34551222	1.02296309894766e-14	34582272	34597294
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37813211	1371	1355	-0.0194	1.02296309894766e-14	34582272	34597294	4.68845671383882e-07	37787637	37825108
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37815049	37855837	20	20	-0.4007	4.68845671383882e-07	37787637	37825108	3.30803985019783e-07	37847519	37874432
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5701	-0.005	3.30803985019783e-07	37847519	37874432	3.86955069733869e-269	52600588	52600588
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-4.6375	3.86955069733869e-269	52600588	52600588	6.56307617249012e-262	52635695	52635695
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25958	-0.0018	6.56307617249012e-262	52635695	52635695	3.35857996954836e-215	146571330	146571330
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	3	-5.4303	3.35857996954836e-215	146571330	146571330	1.09858882742251e-213	146592775	146592775
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242501239	32682	32195	-0.0044	1.09858882742251e-213	146592775	146592775	1.26899039046071e-56	242495169	242514593
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242689978	67	66	-0.6042	1.26899039046071e-56	242495169	242514593	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	75798154	26881	26520	1e-04	NA	NA	NA	1.26241498118202e-11	75787094	75803353
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75799026	75875904	13	13	-0.633	1.26241498118202e-11	75787094	75803353	2.09584899160877e-12	75871755	76006248
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	99891210	5289	5219	0.0044	2.09584899160877e-12	75871755	76006248	1.69979895278986e-111	99891210	99891210
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.7512	1.69979895278986e-111	99891210	99891210	7.32313848755872e-109	99897201	99897201
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11354	-0.0053	7.32313848755872e-109	99897201	99897201	6.25763875588716e-79	133189686	133189686
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-4.0522	6.25763875588716e-79	133189686	133189686	4.07937425348161e-81	133194685	133194685
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	152993150	6315	6203	-0.0049	4.07937425348161e-81	133194685	133194685	1.95589541531262e-31	152991040	152996121
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	152996121	153036955	19	19	-0.8293	1.95589541531262e-31	152991040	152996121	2.22234649636982e-30	153032375	153039457
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	153039457	163989367	3442	3402	-0.0027	2.22234649636982e-30	153032375	153039457	1.29452048124863e-09	163977334	164012645
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163992903	163992903	1	0	NA	1.29452048124863e-09	163977334	164012645	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164077288	20	20	-0.4652	NA	NA	NA	1.07333910311340e-09	164061418	164100804
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164081541	199329592	12124	11963	-0.0054	1.0733391031134e-09	164061418	164100804	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	69085386	18436	18191	-0.0027	NA	NA	NA	1.79099910747544e-12	68905670	69109815
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69088563	69677857	15	15	-0.5303	1.79099910747544e-12	68905670	69109815	1.11059613402732e-09	69643272	69700130
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69684769	104202467	11810	11664	-0.0031	1.11059613402732e-09	69643272	69700130	6.28004908691391e-67	104194050	104206363
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	104203576	104563077	109	108	0.4984	6.28004908691391e-67	104194050	104206363	1.07939641446411e-68	104557329	104575435
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	104566967	173224400	19270	19023	-0.0079	1.07939641446411e-68	104557329	104575435	7.15116000838453e-49	173224400	173224400
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.1469	7.15116000838453e-49	173224400	173224400	1.46785858018133e-58	173228860	173228860
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	191	0.0199	1.46785858018133e-58	173228860	173228860	1.15397722411420e-60	173660684	173660684
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.2494	1.1539772241142e-60	173660684	173660684	4.89262912357966e-52	173666072	173666072
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3716	-0.0083	4.89262912357966e-52	173666072	173666072	1.1425117331058e-17	186676034	186676034
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-1.9173	1.1425117331058e-17	186676034	186676034	2.73698265357871e-17	186680176	186680176
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1534	-0.016	2.73698265357871e-17	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	221	0.0072	NA	NA	NA	3.29515945816051e-09	729262	737829
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.8492	3.29515945816051e-09	729262	737829	2.74146004396734e-10	816789	870657
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3691	-0.0035	2.74146004396734e-10	816789	870657	2.30240717714951e-99	12857302	12857302
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.4338	2.30240717714951e-99	12857302	12857302	1.48912857742476e-98	12873052	12873052
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	97060205	23494	23178	-0.007	1.48912857742476e-98	12873052	12873052	2.86211565806343e-15	97057534	97060205
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-0.9614	2.86211565806343e-15	97057534	97060205	4.99508524475547e-15	97119376	97126918
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	180342860	26168	25828	0.003	4.99508524475547e-15	97119376	97126918	1.27992244433604e-07	180192214	180346557
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	0.7103	1.27992244433604e-07	180192214	180346557	1.69067502494947e-10	180352261	180364670
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	-0.003	1.69067502494947e-10	180352261	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11525	-5e-04	NA	NA	NA	6.11317352375207e-193	32558677	32567462
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.218	6.11317352375207e-193	32558677	32567462	5.10671599018471e-21	32628420	32633691
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	0.0531	5.10671599018471e-21	32628420	32633691	9.44158334218106e-18	32713363	32713363
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32721872	4	4	-2.1745	9.44158334218106e-18	32713363	32713363	6.04913806729111e-45	32720656	32721872
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	103841482	21473	21154	-0.0035	6.04913806729111e-45	32720656	32721872	1.02129203160073e-117	103841482	103841482
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.4964	1.02129203160073e-117	103841482	103841482	6.93308484321027e-119	103868154	103868154
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20841	-0.007	6.93308484321027e-119	103868154	103868154	1.22183683607501e-13	165642393	165643653
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2071	1.22183683607501e-13	165642393	165643653	6.43134188959624e-13	165650610	165653315
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1776	-0.0044	6.43134188959624e-13	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5318	0.0069	NA	NA	NA	4.16249601169456e-43	16135701	16135701
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.002	4.16249601169456e-43	16135701	16135701	3.58231207821560e-43	16140018	16140018
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	48555191	11676	11522	-0.0048	3.5823120782156e-43	16140018	16140018	4.56912094423621e-09	48554059	48555191
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48556704	48562631	5	5	-0.9014	4.56912094423621e-09	48554059	48555191	6.63477061682257e-09	48562631	48575004
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48572106	109698536	18088	17830	0.006	6.63477061682257e-09	48562631	48575004	5.49954108859135e-98	109696614	109700140
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109700140	109818999	49	49	-0.917	5.49954108859135e-98	109696614	109700140	1.23814098078521e-99	109817785	109822657
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109822657	125831554	7230	7131	-0.0065	1.23814098078521e-99	109817785	109822657	3.18359904254415e-14	125829681	125831554
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.409	3.18359904254415e-14	125829681	125831554	3.59928249792187e-13	125837524	125837524
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125839386	1	0	NA	3.59928249792187e-13	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125840585	133433384	3653	3600	0.0052	NA	NA	NA	9.36662218403063e-11	133426996	133433384
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7852	9.36662218403063e-11	133426996	133433384	3.90531122492234e-11	133448277	133455682
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3653	-0.005	3.90531122492234e-11	133448277	133455682	0	141410894	141410894
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-4.1767	0	141410894	141410894	3.86662318363827e-300	141440184	141440184
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	115	0.0206	3.86662318363827e-300	141440184	141440184	2.84123931482852e-17	141687978	141698634
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.9014	2.84123931482852e-17	141687978	141698634	3.31941430838752e-18	141712786	141720303
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2474	0.0038	3.31941430838752e-18	141712786	141720303	4.00220443811136e-111	147702365	147702365
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.8834	4.00220443811136e-111	147702365	147702365	4.39400597434797e-106	147707161	147707161
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4183	-0.0073	4.39400597434797e-106	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0033	NA	NA	NA	3.98528033678293e-47	581533	581533
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.4859	3.98528033678293e-47	581533	581533	1.48412242642493e-58	588865	588865
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7327293	2275	2241	-0.0032	1.48412242642493e-58	588865	588865	4.91123358929416e-21	7327293	7327293
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7697025	7824059	5	5	-1.3364	4.91123358929416e-21	7327293	7327293	4.98688976213748e-20	7824059	7824059
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	32797545	8792	8660	-0.0011	4.98688976213748e-20	7824059	7824059	5.7598875979845e-18	32797545	32797545
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.6373	5.7598875979845e-18	32797545	32797545	1.68637270573539e-19	32808049	32808049
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1858	0.0078	1.68637270573539e-19	32808049	32808049	2.28263198616061e-97	39341524	39352361
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39500219	57	55	0.8643	2.28263198616061e-97	39341524	39352361	1.28708924813015e-99	39499752	39504332
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39504332	146264846	31435	30984	-3e-04	1.28708924813015e-99	39499752	39504332	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12876	-0.0046	NA	NA	NA	2.17949709840243e-21	70926188	70926188
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.0973	2.17949709840243e-21	70926188	70926188	9.79593830732262e-20	70930528	70930528
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24478	-0.001	9.79593830732262e-20	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9591	-0.0095	NA	NA	NA	2.03495374351103e-41	27038538	27038538
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.9621	2.03495374351103e-41	27038538	27038538	4.32127935622332e-41	27041812	27041812
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	47058901	4803	4745	-0.0119	4.32127935622332e-41	27041812	27041812	2.01500797578829e-18	46558272	47068616
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47060942	47946216	46	46	0.4058	2.01500797578829e-18	46558272	47068616	2.65869878591819e-17	47164591	47975485
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47948906	77917893	10012	9876	-1e-04	2.65869878591819e-17	47164591	47975485	1.21743009450641e-60	77917893	77917893
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.5811	1.21743009450641e-60	77917893	77917893	1.77522836645884e-59	77928669	77928669
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19970	-3e-04	1.77522836645884e-59	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2108	0.0166	NA	NA	NA	6.76759742451111e-16	5734978	5741031
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7097	6.76759742451111e-16	5734978	5741031	2.51779745842374e-17	5765438	5769776
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14567	0.0015	2.51779745842374e-17	5765438	5769776	5.45154590517385e-14	55090306	55136234
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55219985	41	41	-0.3877	5.45154590517385e-14	55090306	55136234	6.15884151496688e-14	55202450	55238200
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55221692	134450318	28358	27960	0.0054	6.15884151496688e-14	55202450	55238200	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3678	0.016	NA	NA	NA	3.60539551609761e-89	9523923	9531133
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.7572	3.60539551609761e-89	9523923	9531133	1.1757197319156e-73	9590351	9599999
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11121204	575	570	-0.0499	1.1757197319156e-73	9590351	9599999	3.99142212383692e-121	11121204	11121204
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11140421	6	6	-3.4777	3.99142212383692e-121	11121204	11121204	3.31189776156066e-170	11140421	11140421
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6755	-0.0033	3.31189776156066e-170	11140421	11140421	2.1423251270672e-12	31081498	31173065
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	0.5652	2.1423251270672e-12	31081498	31173065	8.97912266759092e-12	31225941	31248212
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	132289090	33989	33496	0.0032	8.97912266759092e-12	31225941	31248212	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7249	-0.0051	NA	NA	NA	2.53172126774167e-69	37953582	37953582
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.7986	2.53172126774167e-69	37953582	37953582	3.04784106645749e-69	37957844	37957844
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	57060356	6769	6679	-0.0064	3.04784106645749e-69	37957844	37957844	2.30328309980336e-12	57033078	57072278
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57068528	57098127	11	11	0.6951	2.30328309980336e-12	57033078	57072278	3.22134827758491e-13	57092430	57104075
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57100759	57100759	1	0	NA	3.22134827758491e-13	57092430	57104075	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57101868	71375082	3542	3499	-0.0034	NA	NA	NA	2.13927567566768e-30	71375082	71375082
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.4617	2.13927567566768e-30	71375082	71375082	7.3015883722504e-30	71377671	71377671
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4566	-0.0022	7.3015883722504e-30	71377671	71377671	2.34715132522234e-81	89659397	89659397
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.0235	2.34715132522234e-81	89659397	89659397	6.74551410757321e-77	89662326	89662326
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9224	-0.008	6.74551410757321e-77	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	60	-0.6716	NA	NA	NA	7.11651092014854e-66	19490630	19497023
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5602	0.0075	7.11651092014854e-66	19490630	19497023	9.28257173044387e-14	34674458	34674458
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.4132	9.28257173044387e-14	34674458	34674458	2.70511640935941e-13	34683810	34683810
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	105945006	25971	25656	-0.0017	2.70511640935941e-13	34683810	34683810	1.57721885145225e-16	105921895	105951399
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	19	-0.6247	1.57721885145225e-16	105921895	105951399	4.07299062609898e-11	105996176	106017453
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106214372	88	86	0.0247	4.07299062609898e-11	105996176	106017453	4.05669267634101e-06	106193881	106218059
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.448	4.05669267634101e-06	106193881	106218059	1.19988486737984e-09	106251081	106260962
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.1005	1.19988486737984e-09	106251081	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0546	NA	NA	NA	1.31019064872574e-09	18692865	18818949
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19835471	101	99	-0.9461	1.31019064872574e-09	18692865	18818949	1.47610054186549e-58	19835471	19835471
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-5.1191	1.47610054186549e-58	19835471	19835471	4.55464461828945e-56	19844217	19844217
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20308014	48	48	-1.1598	4.55464461828945e-56	19844217	19844217	5.91193050559257e-146	20088256	20308014
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	59468560	14824	14620	-0.0066	5.91193050559257e-146	20088256	20308014	3.57460424309446e-15	59468560	59468560
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-1.526	3.57460424309446e-15	59468560	59468560	4.81082426085671e-15	59483715	59483715
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	74669752	6727	6621	0.011	4.81082426085671e-15	59483715	59483715	1.60686345162074e-71	74669752	74671626
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.8529	1.60686345162074e-71	74669752	74671626	4.87041414371187e-75	74680338	74680439
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9485	7e-04	4.87041414371187e-75	74680338	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34329518	10709	10560	0.0181	NA	NA	NA	2.98665836239747e-21	34285301	34347190
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34630537	55	55	0.4463	2.98665836239747e-21	34285301	34347190	6.33366775886459e-25	34617260	34643569
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34631759	75093957	9759	9634	0.002	6.33366775886459e-25	34617260	34643569	6.74902747749535e-27	75093957	75093957
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.9722	6.74902747749535e-27	75093957	75093957	2.99723429228962e-25	75100865	75100865
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5068	0.0085	2.99723429228962e-25	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	412	0.0625	NA	NA	NA	4.71547441610352e-13	1028979	1028979
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.8607	4.71547441610352e-13	1028979	1028979	4.59810503371018e-14	1030766	1030766
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	8147124	3123	3074	0.0279	4.59810503371018e-14	1030766	1030766	6.33396781230304e-08	8144634	8147124
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.4226	6.33396781230304e-08	8144634	8147124	2.38349491116356e-08	8149084	8154339
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	31457889	8493	8389	0.013	2.38349491116356e-08	8149084	8154339	1.61627396454300e-47	31451114	31461588
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	1.0698	1.616273964543e-47	31451114	31461588	5.7969179092168e-50	31503774	31889566
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32850723	376	369	0	5.7969179092168e-50	31503774	31889566	2.99222552557906e-71	32850723	32850723
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-3.8181	2.99222552557906e-71	32850723	32850723	7.636135713907e-72	32854956	32854956
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	36673853	1437	1410	0.0191	7.636135713907e-72	32854956	32854956	1.90306387001061e-120	36673853	36673853
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.148	1.90306387001061e-120	36673853	36673853	4.12853742020511e-111	36683509	36683509
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1986	0.0317	4.12853742020511e-111	36683509	36683509	2.87563491317319e-10	41506317	41526558
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	0.514	2.87563491317319e-10	41506317	41526558	6.83458258561894e-12	41558893	41574775
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	52440878	3526	3478	0.0127	6.83458258561894e-12	41558893	41574775	5.11167704629804e-08	52438207	52440878
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52454171	4	4	-0.9374	5.11167704629804e-08	52438207	52440878	2.71949111545240e-07	52454171	52455229
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52455229	78653545	10195	10054	0.0149	2.7194911154524e-07	52454171	52455229	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15980	-0.008	NA	NA	NA	2.22888750428328e-42	53092949	53092949
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.9403	2.22888750428328e-42	53092949	53092949	1.61555635807284e-40	53099601	53099601
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6685	-0.0168	1.61555635807284e-40	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	59414898	21055	20756	0.0317	NA	NA	NA	3.90672524359009e-14	59412581	59414898
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.8073	3.90672524359009e-14	59412581	59414898	1.47405911651659e-14	59434202	59440274
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1971	0.0171	1.47405911651659e-14	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	578	7e-04	NA	NA	NA	3.22621452553334e-18	1499421	1506379
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9071	3.22621452553334e-18	1499421	1506379	3.97736185650534e-18	1532433	1546858
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	8303692	2389	2357	0.0084	3.97736185650534e-18	1532433	1546858	4.35062477050771e-07	8301250	8303692
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8304958	8305019	2	2	1.2895	4.35062477050771e-07	8301250	8303692	1.33132486401522e-06	8305019	8316776
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8316776	62419534	18592	18331	0.0056	1.33132486401522e-06	8305019	8316776	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13249	-0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	37621766	10742	10602	0.0203	NA	NA	NA	1.64330466032074e-19	37621766	37621766
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.1407	1.64330466032074e-19	37621766	37621766	8.65874207716966e-19	37626069	37626069
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5726	0.0197	8.65874207716966e-19	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.4005	NA	NA	NA	7.37112053355362e-11	94062	95819
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.5582	7.37112053355362e-11	94062	95819	2.05224048879054e-06	106242	114905
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	1431411	773	765	0.026	2.05224048879054e-06	106242	114905	2.89820924663453e-15	1431411	1431411
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.9497	2.89820924663453e-15	1431411	1431411	1.19289008162038e-17	1432953	1432953
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2303192	610	602	0.0269	1.19289008162038e-17	1432953	1432953	2.35072790954379e-60	2303192	2303192
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.9446	2.35072790954379e-60	2303192	2303192	3.3903500935961e-64	2304398	2304398
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2638587	322	320	-0.0079	3.3903500935961e-64	2304398	2304398	1.39628313629692e-08	2637964	2638587
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2640484	2	2	1.3106	1.39628313629692e-08	2637964	2638587	2.89853818778579e-09	2640484	2640484
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642054	2708291	65	65	-0.0767	2.89853818778579e-09	2640484	2640484	6.68660674319284e-166	2708291	2711273
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	54583223	18536	18277	1.0167	6.68660674319284e-166	2708291	2711273	4.53169434672893e-16	54573775	54592920
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	54584583	54764927	31	31	1.5209	4.53169434672893e-16	54573775	54592920	4.13639716498243e-16	54748410	54791537
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	54772382	134575130	20454	20187	1.0176	4.13639716498243e-16	54748410	54791537	1.11499884981496e-30	134558998	134593094
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134584985	134669952	29	29	1.7269	1.11499884981496e-30	134558998	134593094	2.20112113411319e-29	134659331	134801361
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134732880	154582414	6084	6007	1.0116	2.20112113411319e-29	134659331	134801361	0	154578922	154586690
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0282	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	124	-4.0314	NA	NA	NA	1.07457179880374e-34	3223585	3733715
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.906	1.07457179880374e-34	3223585	3733715	2.13804700802716e-21	5593746	5672441
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	113	-3.773	2.13804700802716e-21	5593746	5672441	0.000938173178084824	6902863	7070931
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7914104	318	313	-3.1879	0.000938173178084824	6902863	7070931	6.06483232173625e-08	7713973	8096693
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	379	-3.7202	6.06483232173625e-08	7713973	8096693	3.35506474141111e-26	10512616	10535786
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	17	-1.022	3.35506474141111e-26	10512616	10535786	4.25522528232404e-07	10655750	12533900
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12973899	138	135	-2.9642	4.25522528232404e-07	10655750	12533900	0.000584171382041628	12869489	13022741
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13128515	63	62	-2.1096	0.000584171382041628	12869489	13022741	2.37131774129247e-08	13101234	13146483
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13259414	44	44	-3.4767	2.37131774129247e-08	13101234	13146483	0.0180710840297924	13146483	13357259
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13261173	13539987	133	131	-4.0006	0.0180710840297924	13146483	13357259	1.66858619968683e-05	13511347	13566041
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13541025	13716000	43	41	-3.2425	1.66858619968683e-05	13511347	13566041	2.66426049781896e-06	13644667	13772047
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14358464	196	195	-4.0628	2.66426049781896e-06	13644667	13772047	8.21642588704837e-09	14322984	14391767
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	89	-3.2972	8.21642588704837e-09	14322984	14391767	1.77366119687702e-09	14502379	14530328
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-1.679	1.77366119687702e-09	14502379	14530328	3.28978341818013e-16	14563486	14596156
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15208612	153	151	-3.7132	3.28978341818013e-16	14563486	14596156	7.56163137681368e-05	15199550	15222741
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15244060	12	11	-2.0827	7.56163137681368e-05	15199550	15222741	2.89037592109452e-06	15227049	15252823
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15244992	15920478	253	252	-3.806	2.89037592109452e-06	15227049	15252823	0.00053013083089174	15626220	16040789
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16180512	106	106	-3.2581	0.00053013083089174	15626220	16040789	1.11931954665486e-08	16102267	16224597
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16182565	22139807	993	977	-3.9057	1.11931954665486e-08	16102267	16224597	3.65412585729607e-09	22055660	22157319
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.6615	3.65412585729607e-09	22055660	22157319	3.56623497064939e-10	22175425	22179794
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	92	-4.0088	3.56623497064939e-10	22175425	22179794	6.64828015004695e-58	22926726	22930737
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-1.1399	6.64828015004695e-58	22926726	22930737	8.56571691491233e-08	26943701	26980386
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27003308	12	12	-2.855	8.56571691491233e-08	26943701	26980386	0.000820170673577791	26990807	27031809
MSK_252152912863_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	57440809	41	40	-1.1807	0.000820170673577791	26990807	27031809	NA	NA	NA
