Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16704522	5781	5696	0.0388	NA	NA	NA	1.25431278859377e-12	16666760	16713074
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16963812	14	14	-0.6127	1.25431278859377e-12	16666760	16713074	5.16806761465701e-12	16961001	17094326
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	72537426	22099	21835	0.0145	5.16806761465701e-12	16961001	17094326	0	72537426	72539143
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.7673	0	72537426	72539143	0	72574479	72579311
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	17351	-0.006	0	72574479	72579311	3.34195354434953e-137	150819879	150819879
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	9	2.4652	3.34195354434953e-137	150819879	150819879	5.77806249121936e-87	150851439	150851439
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151024118	77	76	-0.0147	5.77806249121936e-87	150851439	150851439	1.31629885246167e-08	151020826	151024118
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151036435	5	5	0.8652	1.31629885246167e-08	151020826	151024118	7.90567936508868e-08	151036435	151038091
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2656	0.0195	7.90567936508868e-08	151036435	151038091	1.39777637367326e-71	157133150	157133150
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.9008	1.39777637367326e-71	157133150	157133150	6.38117467419104e-76	157136342	157136342
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1610	-0.0113	6.38117467419104e-76	157136342	157136342	2.25123331052348e-10	161099582	161099582
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.4804	2.25123331052348e-10	161099582	161099582	2.43602347395393e-10	161104791	161104791
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	192715640	11194	11067	-0.0043	2.43602347395393e-10	161104791	161104791	1.06861756984796e-10	192715640	192715640
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-1.5051	1.06861756984796e-10	192715640	192715640	4.72480221047413e-11	192719540	192719540
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	195009358	477	471	-0.0049	4.72480221047413e-11	192719540	192719540	2.49096535533945e-07	194971624	195095156
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195115164	17	17	-0.4369	2.49096535533945e-07	194971624	195095156	7.86571888642138e-08	195065867	195127881
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195119691	200609726	2152	2135	0.0075	7.86571888642138e-08	195065867	195127881	2.47470817948167e-08	200568838	200642828
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200804838	40	40	-0.2916	2.47470817948167e-08	200568838	200642828	4.96849570084075e-08	200678532	200827476
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	247186514	17404	17235	0.001	4.96849570084075e-08	200678532	200827476	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11386	0.0026	NA	NA	NA	4.00174954100046e-16	34539603	34552935
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.6152	4.00174954100046e-16	34539603	34552935	5.32351908214373e-16	34580533	34597294
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37810001	1369	1350	-0.0281	5.32351908214373e-16	34580533	34597294	1.78616345032686e-35	37803744	37815049
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.8209	1.78616345032686e-35	37803744	37815049	4.71837154358337e-35	37847519	37858379
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	42948369	2127	2110	-0.0151	4.71837154358337e-35	37847519	37858379	1.05062444021824e-09	42945507	42948369
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42951427	42976594	3	3	1.1428	1.05062444021824e-09	42945507	42948369	7.7697835934025e-09	42976594	42981601
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42981601	242501239	62699	61978	-0.0048	7.7697835934025e-09	42976594	42981601	8.99281195653476e-64	242495169	242514593
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242689978	67	66	-0.6262	8.99281195653476e-64	242495169	242514593	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	17514137	6488	6414	0.0051	NA	NA	NA	2.36811715603753e-08	17511765	17514137
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17516200	17519829	3	3	-1.0885	2.36811715603753e-08	17511765	17514137	1.33523067130190e-08	17519829	17521317
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17521317	32074432	4305	4267	-0.0247	1.3352306713019e-08	17519829	17521317	1.79099164510552e-24	32074432	32074432
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.1274	1.79099164510552e-24	32074432	32074432	3.170968313818e-22	32080848	32080848
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1866	0.0033	3.170968313818e-22	32080848	32080848	5.86713365157226e-09	37949781	37953375
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.788	5.86713365157226e-09	37949781	37953375	1.61270787110856e-16	37961110	37963736
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	133189686	31022	30632	-0.0021	1.61270787110856e-16	37961110	37963736	2.71634653026597e-88	133189686	133189686
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-4.2031	2.71634653026597e-88	133189686	133189686	6.07943528282241e-91	133194685	133194685
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9679	-0.0062	6.07943528282241e-91	133194685	133194685	1.25382805376977e-13	163987457	164019640
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164077288	20	17	-0.5771	1.25382805376977e-13	163987457	164019640	2.74394493781743e-13	164063626	164093750
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164081541	194354505	10138	10001	-0.0103	2.74394493781743e-13	164063626	164093750	0	194354505	194354505
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.6788	0	194354505	194354505	2.19767294069909e-312	194366950	194366950
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	990	-0.0029	2.19767294069909e-312	194366950	194366950	7.4974744096879e-15	196809098	196905767
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	20	-0.5723	7.4974744096879e-15	196809098	196905767	3.53797180963402e-15	196927528	196943380
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	949	0.0044	3.53797180963402e-15	196927528	196943380	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9458	0.0067	NA	NA	NA	0	34445002	34445002
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-4.9517	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8769	-0.0114	0	34491115	34491115	0	68905670	68905670
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-4.2122	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	143234410	22045	21783	-0.0109	0	69165814	69165814	4.09664737113306e-69	143227948	143238437
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	143235683	143437659	101	99	0.5125	4.09664737113306e-69	143227948	143238437	9.6999995734752e-16	143432881	143446103
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	143439543	143500080	33	33	0.0051	9.6999995734752e-16	143432881	143446103	1.68550336349497e-11	143490715	143506154
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	143501409	143668116	74	74	0.4703	1.68550336349497e-11	143490715	143506154	2.27692445875003e-43	143662549	143677717
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	143670394	173660684	9135	9022	-0.0117	2.27692445875003e-43	143662549	143677717	1.25024495210787e-27	173660684	173660684
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.3298	1.25024495210787e-27	173660684	173660684	1.10822264081250e-28	173666072	173666072
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3730	-0.0112	1.1082226408125e-28	173666072	173666072	2.69067861183627e-54	186676034	186676034
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.1929	2.69067861183627e-54	186676034	186676034	4.44732950078889e-51	186680176	186680176
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	297	-0.0287	4.44732950078889e-51	186680176	186680176	2.20078436909506e-56	187330240	187330240
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.4152	2.20078436909506e-56	187330240	187330240	2.00877662409568e-58	187333619	187333619
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190756763	1139	1133	-0.0125	2.00877662409568e-58	187333619	187333619	1.34088260241270e-11	190692881	190795976
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190761029	190921041	57	57	-0.3096	1.3408826024127e-11	190692881	190795976	1.27298155685631e-05	190887201	190950585
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191037553	37	37	0.0242	1.27298155685631e-05	190887201	190950585	5.6167689236514e-05	191024476	191116001
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191041481	191153613	8	8	-0.5406	5.6167689236514e-05	191024476	191116001	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	17395391	5466	5402	-0.0052	NA	NA	NA	2.43582832200637e-15	17392850	17398455
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17397258	17421137	12	12	-0.7253	2.43582832200637e-15	17392850	17398455	7.87273742359163e-15	17414784	17427530
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17423770	155405839	40005	39533	-0.0075	7.87273742359163e-15	17414784	17427530	1.78005152743444e-260	155405839	155405839
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-4.5203	1.78005152743444e-260	155405839	155405839	3.79999070067052e-255	155421443	155421443
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180342860	8158	8063	0.0119	3.79999070067052e-255	155421443	155421443	1.04297516116924e-06	180189516	180346557
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6217	1.04297516116924e-06	180189516	180346557	1.12655462223563e-06	180352261	180365950
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	111	0.0212	1.12655462223563e-06	180352261	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	204881	42	42	7e-04	NA	NA	NA	2.19767372643164e-17	198124	218316
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	210326	327962	60	58	-0.5104	2.19767372643164e-17	198124	218316	1.39045371320487e-37	320854	332608
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	29950805	10485	10383	6e-04	1.39045371320487e-37	320854	332608	1.01017656593520e-13	29939288	29986370
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	14	-0.638	1.0101765659352e-13	29939288	29986370	7.6169327456445e-15	29985620	30021908
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	32558677	1076	1070	0.0384	7.6169327456445e-15	29985620	30021908	7.2565716719836e-244	32558677	32564884
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	-2.7276	7.2565716719836e-244	32558677	32564884	1.57051737167014e-23	32629848	32633691
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	27	0.0182	1.57051737167014e-23	32629848	32633691	1.54118924210642e-13	32713363	32716255
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32721872	4	4	-2.5108	1.54118924210642e-13	32713363	32716255	2.4160388411628e-05	32718991	32723366
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	32762061	17	17	-0.4029	2.4160388411628e-05	32718991	32723366	1.83437642879739e-06	32728285	32777022
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	67060622	11020	10889	-0.0019	1.83437642879739e-06	32728285	32777022	3.95654949570240e-10	67055837	67060622
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.8624	3.9565494957024e-10	67055837	67060622	1.10269113526995e-10	67105238	67109079
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	79018959	3655	3611	-0.0031	1.10269113526995e-10	67105238	67109079	0	79018959	79018959
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-5.4341	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6683	-0.0172	0	79091850	79091850	2.13898296650558e-153	103841482	103841482
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.835	2.13898296650558e-153	103841482	103841482	6.83837126594864e-148	103868154	103868154
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22652	-0.0078	6.83837126594864e-148	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	14261787	4658	4599	0.0081	NA	NA	NA	2.92600004694914e-08	14259626	14263414
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	14263414	14266755	3	3	-1.0774	2.92600004694914e-08	14259626	14263414	7.57965577873247e-11	14265179	14268336
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	14268336	100753847	26662	26341	-0.0016	7.57965577873247e-11	14265179	14268336	3.82995082006375e-67	100748082	100759041
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100755213	100916809	78	77	0.593	3.82995082006375e-67	100748082	100759041	1.42195986704503e-66	100908697	100925067
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100919321	118611324	7864	7787	-0.0031	1.42195986704503e-66	100908697	100925067	1.06063126069483e-133	118611324	118611324
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.2489	1.06063126069483e-133	118611324	118611324	1.12479851715139e-137	118620875	118620875
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3129	-0.0055	1.12479851715139e-137	118620875	118620875	3.85513875187956e-121	125831554	125831554
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.9991	3.85513875187956e-121	125831554	125831554	5.0270890648652e-115	125837524	125837524
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133187389	3532	3494	0.0105	5.0270890648652e-115	125837524	125837524	7.63027703008174e-219	133183678	133189027
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133189027	133433384	122	121	-0.8726	7.63027703008174e-219	133183678	133189027	7.11681119414834e-11	133426996	133433384
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-0.0811	7.11681119414834e-11	133426996	133433384	6.80773794585182e-10	133448277	133455682
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133574222	67	66	-0.8956	6.80773794585182e-10	133448277	133455682	3.62077695612645e-124	133569820	133580513
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133580513	147702365	6285	6217	-8e-04	3.62077695612645e-124	133569820	133580513	1.37357647738141e-110	147702365	147702365
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.8239	1.37357647738141e-110	147702365	147702365	2.03306054191621e-107	147707161	147707161
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4187	0.0011	2.03306054191621e-107	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	0.0085	NA	NA	NA	3.46773463932875e-78	581533	581533
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.0068	3.46773463932875e-78	581533	581533	5.70199116677585e-77	588865	588865
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7947	-0.0049	5.70199116677585e-77	588865	588865	3.28446157078343e-16	25120552	25120552
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	3.28446157078343e-16	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.8622	NA	NA	NA	2.08139835547887e-16	25125700	25125700
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35971	-0.0013	2.08139835547887e-16	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12916	-0.0033	NA	NA	NA	6.96230282445894e-54	70926188	70926188
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.2589	6.96230282445894e-54	70926188	70926188	2.12810538181927e-51	70930528	70930528
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23487	-8e-04	2.12810538181927e-51	70930528	70930528	3.56314312780764e-15	137352394	137352394
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.8059	3.56314312780764e-15	137352394	137352394	4.26769172475831e-12	137356880	137356880
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1087	0.0194	4.26769172475831e-12	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4632	-0.0069	NA	NA	NA	1.58308512570255e-08	13553503	13553503
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.3769	1.58308512570255e-08	13553503	13553503	8.91490540570978e-09	13556315	13557998
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	5004	-0.0135	8.91490540570978e-09	13556315	13557998	9.41887018003982e-84	27038538	27038538
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.0974	9.41887018003982e-84	27038538	27038538	1.07748589880518e-81	27041812	27041812
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46558272	4796	4730	-0.0098	1.07748589880518e-81	27041812	27041812	1.18427313325365e-19	46532937	47021415
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46561216	47943524	52	52	0.3901	1.18427313325365e-19	46532937	47021415	5.72699016517341e-19	47164591	47970511
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47946216	77917893	10013	9911	-0.0041	5.72699016517341e-19	47164591	47970511	1.05351505325665e-48	77917893	77917893
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.6012	1.05351505325665e-48	77917893	77917893	1.03859566469710e-49	77928738	77928738
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	12236	0.0043	1.0385956646971e-49	77928738	77928738	3.54112656148701e-19	114100979	114100979
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.0018	3.54112656148701e-19	114100979	114100979	1.90629250019232e-18	114106460	114106460
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7733	5e-04	1.90629250019232e-18	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1755	0.0141	NA	NA	NA	7.28601363750411e-240	4923300	4923300
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.7363	7.28601363750411e-240	4923300	4923300	9.21078117139083e-263	4932214	4932214
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5736384	359	351	0.0045	9.21078117139083e-263	4932214	4932214	8.11539866796516e-16	5732077	5741031
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5738494	5766615	18	18	-0.6133	8.11539866796516e-16	5732077	5741031	3.91759143586475e-16	5763749	5775970
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	55118214	14751	14571	9e-04	3.91759143586475e-16	5763749	5775970	4.44687284665391e-23	55097753	55124730
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	33	0.5395	4.44687284665391e-23	55097753	55124730	2.91239750606111e-22	55194990	55207305
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	134450318	28366	28044	0.0057	2.91239750606111e-22	55194990	55207305	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3697	0.0232	NA	NA	NA	1.36733692926882e-138	9523923	9523923
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.4126	1.36733692926882e-138	9523923	9523923	1.53079882757372e-135	9554149	9554149
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	11116883	582	576	-0.0311	1.53079882757372e-135	9554149	9554149	3.44200394103594e-185	11116883	11116883
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.8331	3.44200394103594e-185	11116883	11116883	4.40822390684103e-81	11130871	11130871
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	70	-0.0702	4.40822390684103e-81	11130871	11130871	2.93130802325813e-14	11393473	11395862
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-1.3343	2.93130802325813e-14	11393473	11395862	1.85640347556602e-25	11435643	11435643
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	132289090	40749	40283	0.0022	1.85640347556602e-25	11435643	11435643	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	12084	-0.008	NA	NA	NA	2.60893358102853e-91	49964838	49964838
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-4.2777	2.60893358102853e-91	49964838	49964838	3.11097104341633e-91	49971732	49971732
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	114123340	19423	19189	-0.0102	3.11097104341633e-91	49971732	49971732	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.7151	NA	NA	NA	9.56969097350436e-76	19490630	19497023
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5632	0.005	9.56969097350436e-76	19490630	19497023	2.07427284124643e-15	34674458	34674458
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.4622	2.07427284124643e-15	34674458	34674458	3.16899950279798e-15	34683810	34683810
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	78227579	16078	15909	-0.0054	3.16899950279798e-15	34683810	34683810	3.79615973477106e-08	78226039	78227579
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78229428	78233664	4	4	-0.9562	3.79615973477106e-08	78226039	78227579	5.43023649776918e-09	78233664	78235693
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78235693	105923686	9888	9765	0.0027	5.43023649776918e-09	78233664	78235693	3.50495073677046e-09	105923686	105923686
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	105948347	3	3	-1.1683	3.50495073677046e-09	105923686	105923686	2.83698037602378e-07	105948347	105951399
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	13	-4.369	2.83698037602378e-07	105948347	105951399	3.11135077850137e-07	105985458	105989160
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106002179	4	4	-1.5086	3.11135077850137e-07	105985458	105989160	9.58429696304128e-15	106002179	106002179
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	139	-0.0133	9.58429696304128e-15	106002179	106002179	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1606	NA	NA	NA	2.02703139317749e-08	18452491	18741716
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20308014	152	150	-0.7077	2.02703139317749e-08	18452491	18741716	5.24754532018574e-177	20079935	20316992
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	74669752	21554	21286	-3e-04	5.24754532018574e-177	20079935	20316992	5.55240956257223e-11	74665386	74669752
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.1155	5.55240956257223e-11	74665386	74669752	1.79106327174704e-11	74680439	74696127
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	95609756	7615	7529	0.0063	1.79106327174704e-11	74680439	74696127	1.22419008240860e-09	95602982	95609756
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.8283	1.2241900824086e-09	95602982	95609756	9.10014803380236e-10	95632390	95656272
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1964	0.0053	9.10014803380236e-10	95632390	95656272	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14745	0.0177	NA	NA	NA	1.86169643526345e-07	57201427	57203733
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.3423	1.86169643526345e-07	57201427	57203733	3.79678905771664e-08	57206772	57208375
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5532	0.0062	3.79678905771664e-08	57206772	57208375	5.84729285446453e-71	75093957	75093957
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.1085	5.84729285446453e-71	75093957	75093957	1.50159730841534e-66	75100865	75100865
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5085	0.0088	1.50159730841534e-66	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	414	0.0515	NA	NA	NA	3.13460878869935e-15	1028979	1028979
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.9704	3.13460878869935e-15	1028979	1028979	9.51170020449136e-17	1030766	1030766
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36672710	13451	13296	0.0208	9.51170020449136e-17	1030766	1030766	1.76108789411672e-10	36665978	36672710
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.8564	1.76108789411672e-10	36665978	36672710	1.44052546906074e-10	36684619	36687917
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	2008	0.0384	1.44052546906074e-10	36684619	36687917	4.14275829530428e-34	41561017	41573295
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42151941	50	50	-0.5073	4.14275829530428e-34	41561017	41573295	1.56775442503863e-32	42143048	42158650
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	52440878	3475	3439	0.0174	1.56775442503863e-32	42143048	42158650	3.20942261857433e-75	52440878	52440878
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-3.2044	3.20942261857433e-75	52440878	52440878	1.54605369694097e-72	52447064	52447064
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	10069	0.0223	1.54605369694097e-72	52447064	52447064	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	53092949	16198	15993	-0.0083	NA	NA	NA	1.75190462818116e-07	53092949	53092949
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.2653	1.75190462818116e-07	53092949	53092949	3.16897581534427e-07	53099601	53101512
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6668	-0.0169	3.16897581534427e-07	53099601	53101512	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	40540618	12693	12554	0.0403	NA	NA	NA	1.02929698386201e-121	40540618	40540618
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-4.2766	1.02929698386201e-121	40540618	40540618	4.16375907969619e-124	40553315	40553315
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	59414898	8359	8234	0.0465	4.16375907969619e-124	40553315	40553315	1.0295250006331e-11	59412581	59421197
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434159	9	9	-0.7408	1.0295250006331e-11	59412581	59421197	3.1215349374211e-11	59433190	59440274
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59434202	59434202	1	0	NA	3.1215349374211e-11	59433190	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1977	0.0223	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	580	0.0053	NA	NA	NA	6.87115318397216e-20	1499421	1506379
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	1.0123	6.87115318397216e-20	1499421	1506379	3.12674492971819e-22	1531162	1532433
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3649	-9e-04	3.12674492971819e-22	1531162	1532433	2.36447104420012e-06	12089020	12095485
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.1809	2.36447104420012e-06	12089020	12095485	1.39990836893081e-07	12113855	12127349
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	14676445	877	864	-0.0352	1.39990836893081e-07	12113855	12127349	3.35068235128685e-100	14674777	14679879
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14679879	14777904	49	49	-0.932	3.35068235128685e-100	14674777	14679879	3.16672043607045e-102	14775971	14779933
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14779933	62419534	16365	16163	0.0129	3.16672043607045e-102	14775971	14779933	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13280	-0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2946	0.0381	NA	NA	NA	9.7670835242875e-171	22667608	22679305
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22704683	11	11	-2.7034	9.7670835242875e-171	22667608	22679305	0.141773081309999	22679305	22712211
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22706166	22725305	11	10	-3.872	0.141773081309999	22679305	22712211	0	22725305	22725305
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6474	0.0214	0	22725305	22725305	2.75735554899104e-50	35472378	35472378
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.3005	2.75735554899104e-50	35472378	35472378	2.57055763431901e-51	35476942	35476942
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1171	0.0566	2.57055763431901e-51	35476942	35476942	6.05921497462392e-87	37621766	37621766
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-4.3103	6.05921497462392e-87	37621766	37621766	1.52854777241304e-80	37626069	37626069
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5745	0.0304	1.52854777241304e-80	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	28	0.0198	NA	NA	NA	2.54994298652984e-10	122273	127113
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.2505	2.54994298652984e-10	122273	127113	7.09824268880903e-16	129544	132689
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	748	0.0127	7.09824268880903e-16	129544	132689	2.08305801113692e-14	1431411	1431411
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.8713	2.08305801113692e-14	1431411	1431411	3.22188252880376e-20	1432953	1432953
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	62	0.0371	3.22188252880376e-20	1432953	1432953	7.93043916847108e-08	1528179	1528282
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.8112	7.93043916847108e-08	1528179	1528282	4.39947828361546e-06	1530474	1533546
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2302065	542	540	0.0334	4.39947828361546e-06	1530474	1533546	5.08841758161669e-15	2301365	2302065
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.3456	5.08841758161669e-15	2301365	2302065	2.70712742826764e-17	2304398	2306110
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	388	-0.0143	2.70712742826764e-17	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	33948621	11989	11847	1.0224	0	2708113	2711273	7.83307725815856e-10	33939974	33948621
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33953232	33981492	5	5	0.0501	7.83307725815856e-10	33939974	33948621	1.81346158697014e-09	33981492	33988646
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33988646	76998610	10945	10819	1.0223	1.81346158697014e-09	33981492	33988646	5.42608293434266e-17	76998610	76998610
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.0476	5.42608293434266e-17	76998610	76998610	3.12503426268521e-17	77010018	77010018
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21941	1.0216	3.12503426268521e-17	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	-0.0214	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	124	-4.1705	NA	NA	NA	2.43915995396521e-35	3223585	3773948
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8609	2.43915995396521e-35	3223585	3773948	4.03034705857241e-19	4948824	6652845
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	168	-3.7639	4.03034705857241e-19	4948824	6652845	2.17865854562953e-08	7019523	7200061
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	127	-2.851	2.17865854562953e-08	7019523	7200061	9.65339859294508e-06	7350629	7614571
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	75	-3.7923	9.65339859294508e-06	7350629	7614571	1.38684758351564e-05	7708716	7731490
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	18	-2.3891	1.38684758351564e-05	7708716	7731490	2.61741271210384e-06	7774773	7821580
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	421	-3.7304	2.61741271210384e-06	7774773	7821580	3.75519694551904e-21	10511255	10513747
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10631941	12	12	-0.7997	3.75519694551904e-21	10511255	10513747	1.45407824379596e-10	10622062	10631941
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	11698871	7	5	-2.5591	1.45407824379596e-10	10622062	10631941	0.00123820574225552	11698871	12518008
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-3.9974	0.00123820574225552	11698871	12518008	0.000230877612636717	12536761	12563030
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.3094	0.000230877612636717	12536761	12563030	5.9117865695308e-12	12651786	12687167
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.4424	5.9117865695308e-12	12651786	12687167	2.10060265341885e-08	12820920	12861657
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	112	-2.6557	2.10060265341885e-08	12820920	12861657	2.15109829424756e-33	13100625	13138841
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14359748	417	414	-3.9809	2.15109829424756e-33	13100625	13138841	1.87603027174155e-07	14352278	14368151
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14381372	12	12	-2.396	1.87603027174155e-07	14352278	14368151	0.00233891630839217	14376942	14411982
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14382361	14508021	76	75	-3.6658	0.00233891630839217	14376942	14411982	2.6534507732392e-08	14500820	14538156
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-1.9495	2.6534507732392e-08	14500820	14538156	1.43751575609709e-15	14557473	14597771
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	412	-3.907	1.43751575609709e-15	14557473	14597771	1.78027689542502e-06	15695261	15990153
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16182565	108	107	-3.2388	1.78027689542502e-06	15695261	15990153	8.06737019354581e-15	16154076	16201830
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	17772524	276	271	-4.1473	8.06737019354581e-15	16154076	16201830	8.83915990415173e-09	17718554	17789346
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17775484	17822399	21	21	-2.8231	8.83915990415173e-09	17718554	17789346	7.81804335525661e-06	17802714	17858205
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17823594	22157319	696	685	-3.9662	7.81804335525661e-06	17802714	17858205	5.84687232110031e-06	22055660	22165808
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	7	-1.9985	5.84687232110031e-06	22055660	22165808	6.5787102463965e-09	22177335	22179794
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	91	-4.179	6.5787102463965e-09	22177335	22179794	3.06326693656238e-65	22926726	22930737
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-1.2254	3.06326693656238e-65	22926726	22930737	1.19689263038326e-05	26943701	27003308
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.8385	1.19689263038326e-05	26943701	27003308	9.80144713423286e-05	27006628	27068911
MSK_252152912864_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-0.9784	9.80144713423286e-05	27006628	27068911	NA	NA	NA
