Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	13110044	4524	4430	0.015	NA	NA	NA	6.80541633570865e-10	13110044	13110044
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13647633	13649201	2	2	-0.971	6.80541633570865e-10	13110044	13110044	1.55735296054829e-09	13649201	13649201
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13654754	72537426	23368	22985	0.0051	1.55735296054829e-09	13649201	13649201	3.16692226714776e-19	72534975	72541443
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	13	0.5365	3.16692226714776e-19	72534975	72541443	5.29572408894636e-20	72568009	72596993
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	110033018	11705	11508	-0.0031	5.29572408894636e-20	72568009	72596993	3.14351299907272e-12	110033018	110033018
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.084	3.14351299907272e-12	110033018	110033018	2.42901198723725e-12	110039388	110039388
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2184	-0.0016	2.42901198723725e-12	110039388	110039388	3.10534151096657e-21	116029725	116029725
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.4288	3.10534151096657e-21	116029725	116029725	1.64194600946473e-21	116033402	116033402
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	147313991	2336	2298	-0.0177	1.64194600946473e-21	116033402	116033402	7.60266292297395e-10	146286735	147352661
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	147475854	27	27	0.2446	7.60266292297395e-10	146286735	147352661	1.90570057403065e-07	147441409	148081769
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147490553	150839754	1267	1249	0.0129	1.90570057403065e-07	147441409	148081769	3.49969259239391e-58	150839754	150839754
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	3.49969259239391e-58	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-2.2812	NA	NA	NA	7.91431702155364e-58	150846148	150846148
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	7.91431702155364e-58	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2718	0.0072	NA	NA	NA	2.60069024594113e-69	157133150	157133150
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.5089	2.60069024594113e-69	157133150	157133150	1.59010719364364e-71	157136342	157136342
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4026	-0.0083	1.59010719364364e-71	157136342	157136342	3.19997710914309e-09	167479184	167495719
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.4566	3.19997710914309e-09	167479184	167495719	2.23690750031384e-08	167506259	167525669
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	194977713	9179	8990	1e-04	2.23690750031384e-08	167506259	167525669	1.94289282136981e-07	194969848	194977713
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	194978218	195065867	10	10	0.3867	1.94289282136981e-07	194969848	194977713	7.27109345784835e-08	195065867	195103883
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200613454	2163	2128	0.0026	7.27109345784835e-08	195065867	195103883	5.63434306403315e-17	200600795	200642828
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200787319	33	33	-0.3078	5.63434306403315e-17	200600795	200642828	3.63814249144557e-16	200676505	200804838
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	246806669	17287	17001	-0.0014	3.63814249144557e-16	200676505	200804838	2.61927137217046e-28	246769018	246811355
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246811355	246862029	24	24	0.3921	2.61927137217046e-28	246769018	246811355	1.94354716230617e-22	246858820	246864725
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	92	0.0141	1.94354716230617e-22	246858820	246864725	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33074522	10875	10717	-0.004	NA	NA	NA	3.20327496141882e-33	33074522	33074522
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33076512	33076512	1	0	NA	3.20327496141882e-33	33074522	33074522	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-1.7509	NA	NA	NA	9.73358170714652e-30	33080437	33080437
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34551222	645	633	0.0054	9.73358170714652e-30	33080437	33080437	3.61826790336801e-29	34543992	34552935
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	17	-0.566	3.61826790336801e-29	34543992	34552935	1.69384407010569e-29	34583814	34591681
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	7067	-0.0015	1.69384407010569e-29	34583814	34591681	9.5877895014359e-19	52588009	52600588
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8327	9.5877895014359e-19	52588009	52600588	2.24139663890999e-18	52635695	52639605
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146562545	26336	25861	-0.0019	2.24139663890999e-18	52635695	52639605	3.27282082556664e-09	146552736	146562545
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146571330	146597405	6	6	-0.555	3.27282082556664e-09	146552736	146562545	4.75473996590899e-09	146597405	146606708
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146601593	242689978	32748	32177	-0.0033	4.75473996590899e-09	146597405	146606708	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	8800797	2989	2939	-0.0078	NA	NA	NA	1.08977790846247e-11	8794447	8801504
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8801504	8828722	7	7	0.5525	1.08977790846247e-11	8794447	8801504	1.82544274726435e-11	8825809	8838332
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8835272	32074432	7800	7668	-0.0068	1.82544274726435e-11	8825809	8838332	6.70223447001011e-27	32074432	32074432
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.5692	6.70223447001011e-27	32074432	32074432	2.68589881006412e-26	32080848	32080848
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	133189686	32911	32345	-0.0022	2.68589881006412e-26	32080848	32080848	5.2816851279719e-32	133189686	133189686
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.7258	5.2816851279719e-32	133189686	133189686	2.46547674841880e-33	133194685	133194685
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	2.4654767484188e-33	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	150443815	5400	5320	-0.0054	NA	NA	NA	1.41890811362801e-11	150443815	150443815
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150446135	150448380	2	2	-1.0438	1.41890811362801e-11	150443815	150443815	1.49369732134996e-11	150448380	150448380
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150453399	163992903	4374	4297	-0.0047	1.49369732134996e-11	150448380	150448380	2.29248680547779e-25	163984178	164019640
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	25	-0.4367	2.29248680547779e-25	163984178	164019640	1.05565525269769e-24	164093750	164115417
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9961	-0.0027	1.05565525269769e-24	164093750	164115417	0	194354505	194354505
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.6547	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	975	0.001	0	194366950	194366950	7.62998361497152e-47	196820428	196904349
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	31	-0.5182	7.62998361497152e-47	196820428	196904349	4.16016593093621e-43	196957322	196966631
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	935	0.0127	4.16016593093621e-43	196957322	196966631	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9403	-0.0037	NA	NA	NA	9.637755165425e-17	34439897	34445002
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.736	9.637755165425e-17	34439897	34445002	2.41074704441385e-17	34491115	34506297
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	64376590	7781	7654	-0.0035	2.41074704441385e-17	34491115	34506297	0	64376590	64376590
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.7226	0	64376590	64376590	0	64390333	64390333
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1065	0.0018	0	64390333	64390333	0	68905670	68905670
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	-4.2794	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	107275274	12705	12505	-0.0011	0	69165814	69165814	4.66465873022e-09	107274138	107275274
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.6739	4.66465873022e-09	107274138	107275274	2.91107112656497e-09	107281410	107283257
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	175860235	19424	19088	-0.001	2.91107112656497e-09	107281410	107283257	1.09448657430160e-09	175860235	175860235
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.9734	1.0944865743016e-09	175860235	175860235	2.25091516667967e-10	175863396	175866055
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	186676034	3028	2982	8e-04	2.25091516667967e-10	175863396	175866055	3.47304607858904e-102	186676034	186676034
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.976	3.47304607858904e-102	186676034	186676034	9.65989338942858e-104	186680176	186680176
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	303	-0.0231	9.65989338942858e-104	186680176	186680176	1.61188800659492e-303	187330240	187330240
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-5.1523	1.61188800659492e-303	187330240	187330240	3.64956959841163e-302	187333619	187333619
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190772330	1143	1129	-0.0042	3.64956959841163e-302	187333619	187333619	2.30775479339141e-33	190756763	190789240
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190921041	53	53	-0.3491	2.30775479339141e-33	190756763	190789240	1.67077643610570e-14	190913517	190930709
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191037553	37	35	0.0414	1.6707764361057e-14	190913517	190930709	0.158653291564952	190963484	191133609
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191041481	191153613	8	8	-0.1867	0.158653291564952	190963484	191133609	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3918	-0.0126	NA	NA	NA	5.05603513317651e-300	12857302	12857302
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-5.2139	5.05603513317651e-300	12857302	12857302	2.06201441693491e-305	12873052	12873052
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	42686660	8247	8099	-0.0066	2.06201441693491e-305	12873052	12873052	2.11022087916437e-08	42685371	42686660
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42688146	42692627	3	3	-0.7403	2.11022087916437e-08	42685371	42686660	5.30450738352587e-08	42692627	42694034
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42694034	140533456	27997	27533	-0.003	5.30450738352587e-08	42692627	42694034	5.33316249428538e-09	140533456	140533456
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-0.9545	5.33316249428538e-09	140533456	140533456	1.34073165166611e-09	140538666	140538666
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	150181399	3628	3568	-0.0039	1.34073165166611e-09	140538666	140538666	1.03322575728662e-28	150181399	150181399
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8668	1.03322575728662e-28	150181399	150181399	7.4881714929367e-29	150202601	150202601
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9760	0.0013	7.4881714929367e-29	150202601	150202601	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.0041	NA	NA	NA	1.84609594733792e-51	198124	202063
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	61	-0.6083	1.84609594733792e-51	198124	202063	2.14925945952302e-124	323898	327962
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32548736	11575	11366	-5e-04	2.14925945952302e-124	323898	327962	3.11038268416322e-69	32548736	32563252
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	9	-1.1876	3.11038268416322e-69	32548736	32563252	2.38553122833705e-11	32595402	32605300
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	0.0349	2.38553122833705e-11	32595402	32605300	0.00297127215694211	32697056	32723366
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.5641	0.00297127215694211	32697056	32723366	2.59515107583238e-13	32723366	32731072
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	67078860	11035	10843	-0.0023	2.59515107583238e-13	32723366	32731072	8.73513490900936e-14	67068673	67078860
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67086412	67105238	4	4	-0.8156	8.73513490900936e-14	67068673	67078860	7.5299141835422e-14	67105238	67105238
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	67109079	1	0	NA	7.5299141835422e-14	67105238	67105238	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67111812	79018959	3654	3598	0.0013	NA	NA	NA	7.19801678829827e-11	79008946	79028813
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.403	7.19801678829827e-11	79008946	79028813	1.32251481093393e-10	79074911	79105311
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	134631701	17247	16963	-0.0035	1.32251481093393e-10	79074911	79105311	1.60338901517044e-08	134629897	134631701
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.7557	1.60338901517044e-08	134629897	134631701	1.88000935565543e-08	134635779	134639397
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	170753106	12430	12223	-0.0053	1.88000935565543e-08	134635779	134639397	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	254	0.0117	NA	NA	NA	3.41978004998861e-14	1033418	1036135
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1047707	4	4	-0.856	3.41978004998861e-14	1033418	1036135	8.34022263607527e-15	1047707	1047707
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	5175996	1614	1583	0.0025	8.34022263607527e-15	1047707	1047707	6.91178256968287e-07	5173548	5175996
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5177954	5180757	2	2	-0.8389	6.91178256968287e-07	5173548	5175996	1.64896342956079e-07	5180757	5180757
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5182289	16135701	3510	3443	-0.0012	1.64896342956079e-07	5180757	5180757	2.15521808329589e-305	16135701	16135701
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-5.1497	2.15521808329589e-305	16135701	16135701	6.73706440926755e-287	16140018	16140018
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	109216032	29570	29082	5e-04	6.73706440926755e-287	16140018	16140018	3.63060555426631e-09	109212149	109230336
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109244233	7	7	0.5177	3.63060555426631e-09	109212149	109230336	4.32017795125113e-10	109236813	109247295
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	118611324	4298	4227	-0.006	4.32017795125113e-10	109236813	109247295	0	118611324	118611324
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.7956	0	118611324	118611324	0	118620875	118620875
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	120089714	604	595	0.0039	0	118620875	118620875	1.98725915047131e-19	120087494	120089714
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120092153	120098907	5	5	-0.8681	1.98725915047131e-19	120087494	120089714	1.70151869355971e-20	120098907	120098907
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120101979	125831554	2561	2511	1e-04	1.70151869355971e-20	120098907	120098907	1.90874558215275e-237	125831554	125831554
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.7627	1.90874558215275e-237	125831554	125831554	1.92779621223681e-237	125837524	125837524
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3587	3e-04	1.92779621223681e-237	125837524	125837524	4.73073429082418e-30	133432281	133433384
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8292	4.73073429082418e-30	133432281	133433384	6.22910347730448e-31	133448277	133453811
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141413352	3701	3649	9e-04	6.22910347730448e-31	133448277	133453811	2.16675698021362e-09	141406414	141419692
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141440184	13	13	-0.3649	2.16675698021362e-09	141406414	141419692	4.66830663067189e-09	141434131	141449014
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	143503317	785	774	0.0173	4.66830663067189e-09	141434131	141449014	7.44352744041619e-17	143503317	143503317
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.0501	7.44352744041619e-17	143503317	143503317	3.71530926150199e-16	143584350	143584350
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	158821263	6090	5973	-0.0089	3.71530926150199e-16	143584350	143584350	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	6926661	2391	2352	-0.0044	NA	NA	NA	6.71735824685956e-15	6907624	7156900
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	8137794	11	10	-0.5396	6.71735824685956e-15	6907624	7156900	3.45843166679144e-17	7824059	8139999
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8139999	9531510	481	473	0.0172	3.45843166679144e-17	7824059	8139999	4.80110298295988e-16	9531510	9531510
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9533226	9533226	1	0	NA	4.80110298295988e-16	9531510	9531510	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-0.9551	NA	NA	NA	9.24747138118112e-14	9538031	9538031
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	39350798	10187	9971	-0.0034	9.24747138118112e-14	9538031	9538031	8.79979112692005e-225	39350798	39352361
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	0.8673	8.79979112692005e-225	39350798	39352361	4.61425678883888e-207	39504332	39505256
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	432	0.0073	4.61425678883888e-207	39504332	39505256	1.98949333132476e-314	40892587	40892587
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.2496	1.98949333132476e-314	40892587	40892587	2.80484887603943e-301	40897469	40897469
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1704	0.0062	2.80484887603943e-301	40897469	40897469	0	51191560	51191560
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	0	51191560	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-5.005	NA	NA	NA	0	51200291	51200291
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	0	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	91683155	11684	11487	-7e-04	NA	NA	NA	1.37725076359921e-55	91683155	91683155
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	91685096	91710596	10	10	-0.9922	1.37725076359921e-55	91683155	91683155	9.13673526712313e-53	91710596	91710596
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	91713067	146264846	17555	17253	-0.0027	9.13673526712313e-53	91710596	91710596	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2439	0.0063	NA	NA	NA	7.96100831695943e-12	6685358	6685358
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-0.8539	7.96100831695943e-12	6685358	6685358	1.59983709522275e-11	6698290	6701392
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	15802255	2984	2936	-0.0039	1.59983709522275e-11	6698290	6701392	2.09482660981654e-267	15802255	15802255
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-4.8932	2.09482660981654e-267	15802255	15802255	2.92242022244794e-265	15807123	15807123
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	39088753	7268	7131	-0.0028	2.92242022244794e-265	15807123	15807123	2.14456070661201e-21	38745124	39130211
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39091349	70217543	32	32	-0.3561	2.14456070661201e-21	38745124	39130211	7.6222370192945e-18	70207320	70227334
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70221479	70926188	312	306	-0.0249	7.6222370192945e-18	70207320	70227334	1.23676607562647e-94	70926188	70926188
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.886	1.23676607562647e-94	70926188	70926188	5.00974463297154e-93	70930528	70930528
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	75177268	1792	1755	-0.0027	5.00974463297154e-93	70930528	70930528	2.34322866529687e-13	75177268	75177268
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75208977	75213550	2	2	-1.1161	2.34322866529687e-13	75177268	75177268	3.09758082771794e-13	75213550	75213550
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75221525	116118907	13672	13435	-0.0046	3.09758082771794e-13	75213550	75213550	2.16687434346132e-10	116116077	116118907
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116130333	4	3	-0.8152	2.16687434346132e-10	116116077	116118907	1.80860959894944e-10	116130333	116132839
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	118385389	838	827	-0.0037	1.80860959894944e-10	116130333	116132839	0	118383981	118385389
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118388982	118607074	97	94	-0.8968	0	118383981	118385389	0	118607074	118607074
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	118608198	137352394	7360	7239	0.0058	0	118607074	118607074	2.11146676841434e-26	137352394	137352394
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.6121	2.11146676841434e-26	137352394	137352394	1.68372878936882e-24	137356880	137356880
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1080	0.0028	1.68372878936882e-24	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4591	-0.0065	NA	NA	NA	2.75932893268664e-09	13553503	13553503
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.9479	2.75932893268664e-09	13553503	13553503	1.49953954659185e-09	13556315	13556315
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4949	-0.0019	1.49953954659185e-09	13556315	13556315	2.49281930934771e-30	27038538	27038538
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.661	2.49281930934771e-30	27038538	27038538	2.07520090066158e-29	27041812	27041812
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45476905	4721	4647	-0.0046	2.07520090066158e-29	27041812	27041812	7.0931983503647e-19	45452446	46391653
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45478103	47078975	90	87	-0.2077	7.0931983503647e-19	45452446	46391653	2.70542898333437e-16	47021415	47124718
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47080155	53683740	1760	1733	-0.0134	2.70542898333437e-16	47021415	47124718	5.4231847189127e-26	53683740	53683740
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-1.6074	5.4231847189127e-26	53683740	53683740	6.77015570992536e-27	53687880	53687880
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	55633248	499	485	0.0051	6.77015570992536e-27	53687880	53687880	8.25349905655415e-08	55631838	55633248
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	55635036	55637478	2	2	-0.8387	8.25349905655415e-08	55631838	55633248	2.92071133016611e-07	55637478	55637478
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	55639074	77917893	7787	7656	-9e-04	2.92071133016611e-07	55637478	55637478	7.30214587277463e-165	77917893	77917893
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.8223	7.30214587277463e-165	77917893	77917893	3.16029380334868e-161	77928669	77928669
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	114100979	12393	12205	6e-04	3.16029380334868e-161	77928669	77928669	1.05501390815503e-95	114100979	114100979
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.9504	1.05501390815503e-95	114100979	114100979	3.86361128184739e-94	114106460	114106460
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	127566573	5102	4998	-0.0029	3.86361128184739e-94	114106460	114106460	8.98504215496333e-09	127552919	127569849
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127599309	14	14	-0.3542	8.98504215496333e-09	127552919	127569849	2.47148894687752e-08	127590461	127612803
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127607438	134739406	2492	2437	-0.0157	2.47148894687752e-08	127590461	127612803	1.03274307277693e-08	134739406	134739406
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	-0.9275	1.03274307277693e-08	134739406	134739406	3.24411112298039e-06	134743423	134746574
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135110218	160	159	-0.0054	3.24411112298039e-06	134743423	134746574	3.56438708908254e-36	135105125	135118395
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135117546	135227463	39	38	0.5559	3.56438708908254e-36	135105125	135118395	4.06415355602678e-10	135220726	135227463
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135229796	135285645	10	10	0.0049	4.06415355602678e-10	135220726	135227463	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1745	-0.0018	NA	NA	NA	1.57023051699628e-09	4920907	4923300
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.648	1.57023051699628e-09	4920907	4923300	2.31423423448072e-09	4932214	4934594
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	350	0.0088	2.31423423448072e-09	4932214	4934594	1.41312079138246e-31	5738494	5742476
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6845	1.41312079138246e-31	5738494	5742476	6.31159491536114e-38	5763749	5766615
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55124730	14754	14497	-0.0013	6.31159491536114e-38	5763749	5766615	4.99952084545495e-50	55118214	55129329
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55205278	35	35	0.5114	4.99952084545495e-50	55118214	55129329	2.11507948015108e-45	55203706	55209626
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55207305	66463477	4640	4559	0.0132	2.11507948015108e-45	55203706	55209626	2.50777633754806e-11	66463477	66463477
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0714	2.50777633754806e-11	66463477	66463477	8.52982930631651e-12	66469412	66469412
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	106733851	13398	13178	-0.0046	8.52982930631651e-12	66469412	66469412	3.66771841644739e-11	106732431	106733851
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.7369	3.66771841644739e-11	106732431	106733851	1.85141104897314e-12	106747920	106754784
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	107157031	185	183	0.0204	1.85141104897314e-12	106747920	106754784	3.31417223055311e-16	107155002	107157031
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107160270	107177546	9	9	0.5681	3.31417223055311e-16	107155002	107157031	6.45537866194202e-17	107177546	107178916
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107178916	134450318	10124	9962	-0.0039	6.45537866194202e-17	107177546	107178916	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3676	0.0045	NA	NA	NA	7.1601827347758e-20	9523923	9528590
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	3	-1.1367	7.1601827347758e-20	9523923	9528590	1.02472837294095e-19	9543817	9554149
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	46992235	11736	11545	-0.0032	1.02472837294095e-19	9543817	9554149	5.41696818921622e-105	46992235	46992235
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-3.1472	5.41696818921622e-105	46992235	46992235	3.71309987909162e-107	46996769	46996769
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	80662066	11856	11645	0.0046	3.71309987909162e-107	46996769	46996769	0	80662066	80662066
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-5.9693	0	80662066	80662066	0	80666751	80666751
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	91075688	2508	2472	-0.0018	0	80666751	80666751	1.53747082729478e-07	91070982	91075688
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	91076803	91082981	4	4	0.6114	1.53747082729478e-07	91070982	91075688	1.67978596080992e-07	91082981	91086220
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	91084481	130694393	14660	14388	0.0056	1.67978596080992e-07	91082981	91086220	1.74117478036419e-11	130694393	130694393
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.0471	1.74117478036419e-11	130694393	130694393	2.29320917594326e-11	130701040	130701040
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	629	-1e-04	2.29320917594326e-11	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5483	-0.0031	NA	NA	NA	2.70505144553791e-17	33030946	33030946
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-1.0495	2.70505144553791e-17	33030946	33030946	5.44340127768077e-17	33042557	33042557
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	68146755	11138	10933	-0.0041	5.44340127768077e-17	33042557	33042557	4.21090006589864e-07	68138912	68146755
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68147831	68163523	8	7	0.4513	4.21090006589864e-07	68138912	68146755	7.53692172021337e-07	68163523	68171943
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	894	-0.0026	7.53692172021337e-07	68163523	68171943	2.44492883288681e-241	71375082	71375082
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.8846	2.44492883288681e-241	71375082	71375082	9.37547382912404e-262	71377671	71377671
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4558	-0.0032	9.37547382912404e-262	71377671	71377671	5.04972823113163e-18	89659397	89659397
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.2999	5.04972823113163e-18	89659397	89659397	2.62253055946199e-17	89662326	89662326
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	97327189	3186	3151	-0.0045	2.62253055946199e-17	89662326	89662326	1.31076048269040e-13	97327189	97327189
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-1.1662	1.3107604826904e-13	97327189	97327189	1.88111240859846e-14	97330568	97330568
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	100690991	1597	1555	-0.0062	1.88111240859846e-14	97330568	97330568	0	100690991	100690991
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.8047	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4336	-0.0144	0	100693892	100693892	1.86938834829680e-10	113788788	113788788
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.0261	1.8693883482968e-10	113788788	113788788	2.92233338384262e-11	113792974	113792974
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	146	0.0075	2.92233338384262e-11	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.6658	NA	NA	NA	5.6401566954707e-123	19492531	19497023
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20411202	455	447	-0.0078	5.6401566954707e-123	19492531	19497023	3.70872008678407e-09	20387667	20434898
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20424171	20481852	25	25	0.2574	3.70872008678407e-09	20387667	20434898	1.93181976798297e-07	20464483	20507349
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20488177	21563050	530	521	0.0165	1.93181976798297e-07	20464483	20507349	5.97647859310566e-39	21545394	21588390
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21569312	22061243	249	244	0.2245	5.97647859310566e-39	21545394	21588390	3.59909118439931e-66	22047168	22077968
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	73071404	18101	17806	-9e-04	3.59909118439931e-66	22047168	22077968	1.99103025891857e-13	73061942	73071404
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.6089	1.99103025891857e-13	73061942	73071404	3.1575685865949e-13	73092112	73101327
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	78448685	2529	2485	0.0088	3.1575685865949e-13	73092112	73101327	5.44784386199398e-05	78443154	78448685
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78449832	78455420	4	4	0.5101	5.44784386199398e-05	78443154	78448685	3.0301920621689e-05	78455420	78459450
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78458008	105584008	9674	9506	-0.0049	3.0301920621689e-05	78455420	78459450	2.68866631212967e-08	105566498	105592583
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105585666	105622008	16	16	-0.2951	2.68866631212967e-08	105566498	105592583	0.000435098565305637	105597555	105632168
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105623070	105783533	24	23	-0.0279	0.000435098565305637	105597555	105632168	8.23874568281051e-06	105768318	105789767
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105787390	105805371	12	12	-0.3486	8.23874568281051e-06	105768318	105789767	1.73682212996206e-06	105800545	105816181
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105812803	105850033	16	16	0.0577	1.73682212996206e-06	105800545	105816181	9.21242299363058e-09	105846004	105850033
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.5634	9.21242299363058e-09	105846004	105850033	1.37432647227280e-10	105881893	105898108
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105945006	15	14	0.0266	1.3743264722728e-10	105881893	105898108	4.39635794802957e-16	105923686	105946993
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106015449	21	20	-0.5732	4.39635794802957e-16	105923686	105946993	3.09103934769465e-25	106013552	106019719
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106017453	106358491	140	136	0.0319	3.09103934769465e-25	106013552	106019719	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18450562	4	4	0.1302	NA	NA	NA	0.0230175000805110	18427151	18810004
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18452491	18886649	26	25	-0.1994	0.023017500080511	18427151	18810004	8.96221993700632e-07	18863056	19140215
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	19465359	68	67	0.0366	8.96221993700632e-07	18863056	19140215	5.61695561022011e-40	19427350	19800789
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	56	-0.4034	5.61695561022011e-40	19427350	19800789	7.7472988513591e-47	20065525	20321772
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	20308014	1	0	NA	7.7472988513591e-47	20065525	20321772	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	59468560	14824	14585	-0.0025	NA	NA	NA	4.24719993846186e-19	59468560	59468560
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59475528	59483715	3	3	-1.1203	4.24719993846186e-19	59468560	59468560	6.71908578012838e-20	59483715	59483715
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59488251	95609756	14346	14109	0.0039	6.71908578012838e-20	59483715	59483715	4.9901129004484e-22	95609756	95609756
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.8311	4.9901129004484e-22	95609756	95609756	2.13712144459875e-23	95632390	95656272
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1947	-0.0118	2.13712144459875e-23	95632390	95656272	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	22338034	7548	7409	0.0097	NA	NA	NA	2.26582788867023e-07	22315373	22553207
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22617217	11	11	-0.3587	2.26582788867023e-07	22315373	22553207	1.87462442954149e-06	22598209	22661197
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	23841444	483	472	0.0055	1.87462442954149e-06	22598209	22661197	8.95431338084118e-08	23840280	23841444
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23842653	23844021	2	2	-0.919	8.95431338084118e-08	23840280	23841444	0	23844021	23844021
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23846877	23848772	2	2	-0.5568	0	23844021	23844021	0.00430459372518100	23848772	23855033
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23850580	32379126	2527	2483	0.0146	0.004304593725181	23848772	23855033	3.3572153940872e-71	31862577	32513457
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	34054713	52	52	-0.4941	3.3572153940872e-71	31862577	32513457	3.69508858675272e-68	33846647	34058222
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	56438210	3952	3889	-0.0071	3.69508858675272e-68	33846647	34058222	2.87561049673548e-09	56438210	56438210
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	56440370	56444066	2	2	-0.9401	2.87561049673548e-09	56438210	56438210	6.36425420334287e-10	56444066	56444066
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	56448594	57203733	330	325	0.001	6.36425420334287e-10	56444066	56444066	1.07442482280977e-132	57203733	57203733
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.3917	1.07442482280977e-132	57203733	57203733	2.13708833441324e-132	57206772	57206772
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3336	0.0106	2.13708833441324e-132	57206772	57206772	5.04237433130426e-16	68687301	68710277
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.5282	5.04237433130426e-16	68687301	68710277	5.74706513267238e-14	68751390	68842364
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1423	-0.0094	5.74706513267238e-14	68751390	68842364	4.66864352075821e-05	72906433	72956298
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	73030029	10	10	-0.3302	4.66864352075821e-05	72906433	72956298	2.58122040895648e-06	72963578	73043507
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73032723	73636868	252	247	0.0212	2.58122040895648e-06	72963578	73043507	1.08428209269260e-05	73631224	73638318
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73638318	73644230	3	3	-0.5745	1.0842820926926e-05	73631224	73638318	1.40299905261990e-05	73640230	73647597
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73647597	75093957	496	491	0.0148	1.4029990526199e-05	73640230	73647597	5.07346753909511e-20	75093957	75093957
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1056	5.07346753909511e-20	75093957	75093957	2.7055937770788e-19	75100865	75100865
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	2.7055937770788e-19	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	88690571	5130	5052	-0.0063	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	410	0.0156	NA	NA	NA	9.99977858819215e-15	1028979	1028979
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.2653	9.99977858819215e-15	1028979	1028979	1.40692278835364e-16	1030766	1030766
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31443186	11615	11402	0.0092	1.40692278835364e-16	1030766	1030766	1.12253819248299e-15	31437168	31457889
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31447686	31889566	23	23	-0.3519	1.12253819248299e-15	31437168	31457889	1.13031218842337e-15	31492553	31895551
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	32828797	364	360	0.001	1.13031218842337e-15	31492553	31895551	2.56917222924182e-11	32828797	32828797
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.9808	2.56917222924182e-11	32828797	32828797	7.7652150382894e-09	32832642	32832642
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1416	0.0198	7.7652150382894e-09	32832642	32832642	8.1973005516517e-28	36673853	36673853
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.9888	8.1973005516517e-28	36673853	36673853	4.39118722577533e-30	36684619	36684619
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1997	0.0218	4.39118722577533e-30	36684619	36684619	2.33102609927405e-65	41564408	41568539
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	45	-0.5026	2.33102609927405e-65	41564408	41568539	3.81714088863882e-60	41708551	42142363
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3417	0.0041	3.81714088863882e-60	41708551	42142363	8.81513213700919e-11	52440878	52440878
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.8382	8.81513213700919e-11	52440878	52440878	1.76167249978480e-11	52447064	52454171
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	56471985	1735	1704	0.0145	1.7616724997848e-11	52447064	52454171	1.83227727546380e-16	56469996	56471985
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56473793	56480300	6	6	-0.7045	1.8322772754638e-16	56469996	56471985	2.89068185169347e-15	56480300	56484552
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56484552	78653545	8455	8297	0.008	2.89068185169347e-15	56480300	56484552	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22583	-0.0078	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19694025	9027	8854	0.0241	NA	NA	NA	0	19694025	19694025
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.9139	0	19694025	19694025	0	19700620	19700620
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	46027905	6121	5993	0.0154	0	19700620	19700620	6.60890209502076e-14	46027876	46046859
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46032427	46063357	7	6	-0.662	6.60890209502076e-14	46027876	46046859	5.40041907142137e-14	46059213	46086240
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46086240	63788698	7901	7761	0.0163	5.40041907142137e-14	46059213	46086240	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	577	-0.0094	NA	NA	NA	1.17585623582632e-46	1506379	1515948
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9273	1.17585623582632e-46	1506379	1515948	3.50920831136984e-46	1528899	1532433
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20602	-7e-04	3.50920831136984e-46	1528899	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13220	-0.0035	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2923	0.0095	NA	NA	NA	9.4064373296967e-08	22601987	22696162
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	21	-0.2712	9.4064373296967e-08	22601987	22696162	1.51626193746891e-08	22712211	22739574
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	23991961	603	591	0.0089	1.51626193746891e-08	22712211	22739574	2.03973019222052e-74	23966733	23997055
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23994618	24253162	92	91	0.4202	2.03973019222052e-74	23966733	23997055	2.39905946536848e-83	24239149	24258091
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24255714	35472378	5853	5744	0.0078	2.39905946536848e-83	24239149	24258091	1.96992917387052e-30	35472378	35472378
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.6805	1.96992917387052e-30	35472378	35472378	1.28366065801302e-29	35476942	35476942
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	41213175	3048	2998	0.011	1.28366065801302e-29	35476942	35476942	1.14755674798561e-09	41191968	41226643
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41216678	41287060	16	15	0.3679	1.14755674798561e-09	41191968	41226643	6.11084410432052e-10	41274958	41295673
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41289552	49567768	3938	3854	0.002	6.11084410432052e-10	41274958	41295673	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.1355	NA	NA	NA	1.18794259432494e-09	122273	127113
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.0554	1.18794259432494e-09	122273	127113	1.42061814825343e-24	129544	130528
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	848806	534	524	-0.0056	1.42061814825343e-24	129544	130528	8.49756908903626e-13	843648	851066
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	849437	859452	8	8	-0.6021	8.49756908903626e-13	843648	851066	1.39674661245232e-07	853836	860688
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	893769	25	24	-0.0665	1.39674661245232e-07	853836	860688	9.6423164284790e-05	890703	894789
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	894789	897945	4	4	-0.5634	9.642316428479e-05	890703	894789	1.19153730747976e-05	896136	903987
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	898717	1431411	184	181	-8e-04	1.19153730747976e-05	896136	903987	1.63382209053838e-16	1431411	1431411
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.3344	1.63382209053838e-16	1431411	1431411	1.50321986935410e-16	1432953	1432953
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	593	-0.0127	1.5032198693541e-16	1432953	1432953	3.18358497960856e-22	2302065	2302065
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0734	3.18358497960856e-22	2302065	2302065	2.75611489889776e-26	2304398	2304398
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2638587	322	317	-0.0333	2.75611489889776e-26	2304398	2304398	1.56608536889726e-08	2637964	2638587
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2640484	2	2	0.857	1.56608536889726e-08	2637964	2638587	4.75654299248266e-07	2640484	2642054
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642054	2708291	65	64	-0.0791	4.75654299248266e-07	2640484	2642054	3.05158780807348e-190	2708291	2711273
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6146726	1107	1092	0.968	3.05158780807348e-190	2708291	2711273	1.58533999988422e-14	6145632	6146726
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6148661	6150055	2	2	-0.1842	1.58533999988422e-14	6145632	6146726	1.97481345129997e-10	6150055	6152223
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6152223	8452395	682	672	1.0102	1.97481345129997e-10	6150055	6152223	1.47461300485360e-07	8446489	8459880
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.4579	1.4746130048536e-07	8446489	8459880	2.59019401457925e-08	8461739	8477126
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	2.59019401457925e-08	8461739	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	13679455	2276	2243	1.0037	NA	NA	NA	6.0067751503688e-09	13677276	13681110
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	3	0.1425	6.0067751503688e-09	13677276	13681110	3.19206296618228e-09	13683888	13688061
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	47748627	12460	12227	1.015	3.19206296618228e-09	13683888	13688061	9.93676395243262e-130	47747688	47748627
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47756715	47845497	39	39	0.1403	9.93676395243262e-130	47747688	47748627	2.57715330127639e-117	47843433	47898068
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47898068	154582414	28557	28016	1.0076	2.57715330127639e-117	47843433	47898068	0	154582414	154582414
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888033	200	197	-0.0265	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154888224	154888224	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-4.3231	NA	NA	NA	3.36681411182131e-19	3777766	4413507
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5672441	12	12	-1.2772	3.36681411182131e-19	3777766	4413507	4.39280904612457e-07	5531459	6711090
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7259689	228	224	-3.6196	4.39280904612457e-07	5531459	6711090	9.28128956016624e-09	7249762	7266323
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	22	-1.6581	9.28128956016624e-09	7249762	7266323	0.00293192410902676	7284775	7340782
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7495687	51	49	-2.9991	0.00293192410902676	7284775	7340782	1.28287696684531e-05	7401540	7606496
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7722458	74	72	-4.2362	1.28287696684531e-05	7401540	7606496	2.48102037433453e-10	7711759	7723783
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	17	-2.0373	2.48102037433453e-10	7711759	7723783	0.00179018342453661	7756907	7833760
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8005148	61	59	-3.2255	0.00179018342453661	7756907	7833760	2.31665559825414e-06	7951683	8058483
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8010446	1	0	NA	2.31665559825414e-06	7951683	8058483	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8178487	36	31	-4.5283	NA	NA	NA	0.0218065671018453	8094987	8343165
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8685946	137	135	-3.8239	0.0218065671018453	8094987	8343165	0.00093199165174258	8554113	8719458
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8687580	8949553	80	76	-4.4299	0.00093199165174258	8554113	8719458	1.38351794696297e-06	8938284	8949553
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.6869	1.38351794696297e-06	8938284	8949553	5.97942282622361e-06	8956787	8959151
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	107	-4.455	5.97942282622361e-06	8956787	8959151	5.33433310868249e-56	10512616	10515697
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	19	-0.8664	5.33433310868249e-56	10512616	10515697	1.08430184694461e-26	11673476	11698871
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.5058	1.08430184694461e-26	11673476	11698871	9.26423792470985e-07	12537944	12554612
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.0948	9.26423792470985e-07	12537944	12554612	2.04189856060669e-07	12649357	12700767
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.1468	2.04189856060669e-07	12649357	12700767	1.13329381698787e-05	12804329	12865349
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13048283	80	79	-2.3701	1.13329381698787e-05	12804329	12865349	0.000371523679591498	13026029	13048283
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13066849	10	9	-4.5748	0.000371523679591498	13026029	13048283	3.62527388835926e-13	13066849	13076862
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13128515	22	21	-1.8342	3.62527388835926e-13	13066849	13076862	2.75211702754585e-06	13111594	13140274
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	45	-3.3034	2.75211702754585e-06	13111594	13140274	4.32927314419383e-12	13238502	13286708
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14340202	362	352	-4.3967	4.32927314419383e-12	13238502	13286708	5.86343063895443e-15	14322984	14380301
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14342834	14508021	97	96	-3.4258	5.86343063895443e-15	14322984	14380301	2.65995109953322e-11	14500820	14528771
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.65995109953322e-11	14500820	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	23	-1.2603	NA	NA	NA	1.82638276283991e-17	14569287	14587291
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	15139441	114	112	-3.9863	1.82638276283991e-17	14569287	14587291	0.000138702142808597	15014767	15171394
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15270384	69	66	-3.025	0.000138702142808597	15014767	15171394	1.42710704568704e-11	15249591	15279629
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15272429	15433122	109	106	-4.2501	1.42710704568704e-11	15249591	15279629	7.78609369490791e-10	15431247	15433122
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.5101	7.78609369490791e-10	15431247	15433122	3.5673253599317e-43	15447091	15447091
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15467288	13	13	-4.8978	3.5673253599317e-43	15447091	15447091	3.46848517882899e-17	15467288	15467288
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15468160	15517551	14	13	-3.1907	3.46848517882899e-17	15467288	15467288	2.26807551661388e-09	15517551	15517551
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15518749	15523178	4	4	-5.0591	2.26807551661388e-09	15517551	15517551	1.03968838639830e-06	15523178	15525955
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	13	-1.8519	1.0396883863983e-06	15523178	15525955	3.06517887207564e-07	15542314	15551462
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15920478	77	76	-4.0492	3.06517887207564e-07	15542314	15551462	1.73879126746437e-06	15854496	15937162
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	15980898	21	20	-2.3675	1.73879126746437e-06	15854496	15937162	3.9740820433185e-12	15977755	15980898
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15982684	15998663	8	8	-4.9386	3.9740820433185e-12	15977755	15980898	7.33300118531024e-06	15998663	16007396
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16002819	16042966	19	19	-2.4828	7.33300118531024e-06	15998663	16007396	0.000139202194492771	16025800	16071977
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16387273	113	108	-3.7618	0.000139202194492771	16025800	16071977	0.0146078141064552	16163786	16669423
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17087869	105	103	-4.2709	0.0146078141064552	16163786	16669423	7.48049881447927e-06	17076673	17087869
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17093068	17101969	3	3	-1.1521	7.48049881447927e-06	17076673	17087869	7.33704596978935e-26	17101969	17101969
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17107617	17143034	7	7	-4.5743	7.33704596978935e-26	17101969	17101969	0.00339092526783699	17143034	17188480
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17147469	17238655	16	16	-3.4582	0.00339092526783699	17143034	17188480	3.78874421483581e-08	17214550	17251951
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17242317	17473674	41	41	-4.7337	3.78874421483581e-08	17214550	17251951	1.98194522076326e-06	17451391	17583495
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17482749	17893954	91	88	-3.5843	1.98194522076326e-06	17451391	17583495	0.000835935776530979	17767311	18067360
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	19610243	114	111	-4.3014	0.000835935776530979	17767311	18067360	1.52511263560541e-05	19603607	19610243
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19614809	3	3	-1.0285	1.52511263560541e-05	19603607	19610243	1.8405946452303e-07	19614809	19615891
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19615891	21036411	290	280	-4.285	1.8405946452303e-07	19614809	19615891	1.99261330741391e-12	21034708	21036503
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.5232	1.99261330741391e-12	21034708	21036503	3.14793395396310e-09	21047798	21057446
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	250	-4.2022	3.1479339539631e-09	21047798	21057446	3.49526759838745e-08	22051284	22139807
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	10	-2.1014	3.49526759838745e-08	22051284	22139807	3.02598884272435e-19	22178964	22181855
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22930737	92	85	-4.7152	3.02598884272435e-19	22178964	22181855	4.57925979020445e-106	22926726	25737663
MSK_252152913041_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	82	-1.2047	4.57925979020445e-106	22926726	25737663	NA	NA	NA
