Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	10866881	3689	3593	0.0827	NA	NA	NA	8.05167757433253e-13	10866881	10866881
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10871894	10873098	2	2	1.2921	8.05167757433253e-13	10866881	10866881	9.70208920087863e-13	10873098	10873098
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10877780	34869589	9203	8955	0.0875	9.70208920087863e-13	10873098	10873098	0	34869589	34869589
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-4.772	0	34869589	34869589	0	34883375	34883375
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14625	0.0681	0	34883375	34883375	9.5395660030447e-18	72534975	72539143
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	12	0.6171	9.5395660030447e-18	72534975	72539143	2.04430643091411e-21	72571158	72589682
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	2.04430643091411e-21	72571158	72589682	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	86171390	4220	4127	0.051	NA	NA	NA	1.23764124238815e-07	86159135	86171390
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86173546	86175273	2	2	-0.7944	1.23764124238815e-07	86159135	86171390	2.45671709303860e-07	86175273	86175273
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	99375628	4582	4456	0.0562	2.4567170930386e-07	86175273	86175273	0	99369304	99385460
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	99381126	103080625	1133	1104	0.5312	0	99369304	99385460	2.11440358947682e-201	103054658	103090980
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103089420	103932025	181	175	0.0764	2.11440358947682e-201	103054658	103090980	2.16114967538345e-63	103932025	103932025
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	103962495	2	2	-3.0471	2.16114967538345e-63	103932025	103932025	6.09271703309155e-96	103962495	103962495
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110023268	1583	1549	0.0622	6.09271703309155e-96	103962495	103962495	8.65971765996957e-32	110023268	110023268
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-1.3407	8.65971765996957e-32	110023268	110023268	1.19567111410474e-30	110039388	110039388
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2166	0.078	1.19567111410474e-30	110039388	110039388	1.03714477862635e-07	116028595	116029725
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	0.9694	1.03714477862635e-07	116028595	116029725	1.43081940915416e-08	116033402	116033402
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	147306304	2333	2263	0.0554	1.43081940915416e-08	116033402	116033402	0	147306304	147313991
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	34	-2.112	0	147306304	147313991	0	147490608	147510532
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150839754	1262	1215	0.0852	0	147490608	147510532	9.3882737731505e-100	150839754	150839754
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	9.3882737731505e-100	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-3.1259	NA	NA	NA	7.4060757526695e-12	150846148	150846148
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	7.4060757526695e-12	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	150851439	2	2	-1.2225	NA	NA	NA	5.15078366971816e-17	150851439	150851439
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	154151307	1489	1452	0.089	5.15078366971816e-17	150851439	150851439	2.72008358281182e-101	154148239	154152858
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154152858	154318372	87	85	0.5862	2.72008358281182e-101	154148239	154152858	5.16774234649798e-102	154315955	154322688
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154320650	157133150	1185	1150	0.0723	5.16774234649798e-102	154315955	154322688	2.24997596336544e-124	157133150	157133150
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.5079	2.24997596336544e-124	157133150	157133150	3.08960593063185e-131	157136342	157136342
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	162599438	2071	2015	0.0712	3.08960593063185e-131	157136342	157136342	5.4875812473742e-13	162597597	162599438
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	162601802	162611836	5	4	-0.7413	5.4875812473742e-13	162597597	162599438	2.53343012794277e-14	162611836	162611836
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	162613526	185979586	9249	9000	0.0695	2.53343012794277e-14	162611836	162611836	1.62661555258425e-13	185979586	185979586
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.1847	1.62661555258425e-13	185979586	185979586	1.42923893763021e-14	185988138	185988138
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194977713	1968	1918	0.0568	1.42923893763021e-14	185988138	185988138	1.53183038459318e-18	194976022	195011344
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	194978218	195065867	10	10	-0.5141	1.53183038459318e-18	194976022	195011344	7.7461082713951e-18	195046932	195091758
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200679934	2189	2132	0.0876	7.7461082713951e-18	195046932	195091758	1.67849150653132e-08	200673525	200689399
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200683992	200787319	7	7	-0.3193	1.67849150653132e-08	200673525	200689399	2.73053712471447e-15	200698665	200803726
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	221192993	7420	7198	0.072	2.73053712471447e-15	200698665	200803726	2.34716061077614e-167	221188710	221196326
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	221194510	221602788	173	170	0.514	2.34716061077614e-167	221188710	221196326	3.74784832408026e-156	221598283	221613091
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	221605821	227501432	2146	2090	0.084	3.74784832408026e-156	221598283	221613091	0	227498508	227506646
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227503933	227503933	1	0	NA	0	227498508	227506646	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227505176	240474830	5102	4968	0.5137	NA	NA	NA	5.36722320208813e-27	240468647	240489591
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240477864	240589826	34	34	0.1352	5.36722320208813e-27	240468647	240489591	4.64913178757597e-17	240579429	240604046
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240596160	241340181	128	123	0.468	4.64913178757597e-17	240579429	240604046	1.64193852338624e-12	241091628	241370219
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241350083	241431284	32	32	0.1659	1.64193852338624e-12	241091628	241370219	2.86271809273852e-22	241418448	241446026
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241433682	246427528	2145	2089	0.5243	2.86271809273852e-22	241418448	241446026	2.22295008480342e-17	246382899	246460435
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246429285	246429285	1	0	NA	2.22295008480342e-17	246382899	246460435	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246430621	246648963	82	78	0.7295	NA	NA	NA	3.32534724818691e-07	246633505	246669591
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246668425	246738832	14	13	0.3834	3.32534724818691e-07	246633505	246669591	4.12061282251792e-09	246738832	246753652
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246750352	246875016	36	36	0.8747	4.12061282251792e-09	246738832	246753652	5.05594113403537e-15	246858820	246902470
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	95	0.4975	5.05594113403537e-15	246858820	246902470	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13430872	4210	4085	0.052	NA	NA	NA	2.80051087552163e-12	13430872	13430872
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13444674	13454720	2	2	-0.9327	2.80051087552163e-12	13430872	13430872	2.94187262591323e-15	13454720	13454720
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13461042	27578567	4300	4192	0.0538	2.94187262591323e-15	13454720	13454720	4.73223029574563e-280	27572361	27581858
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27580442	28147073	249	242	0.5379	4.73223029574563e-280	27572361	27581858	5.791069281394e-232	28144687	28154011
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28150954	33076512	2115	2053	0.0657	5.791069281394e-232	28144687	28154011	1.82327116343410e-16	33076512	33076512
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.4071	1.8232711634341e-16	33076512	33076512	1.19003318817049e-20	33080437	33080437
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	630	0.0364	1.19003318817049e-20	33080437	33080437	4.70334052233678e-17	34539740	34552935
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34583814	17	17	-0.3965	4.70334052233678e-17	34539740	34552935	2.14125767354773e-18	34580533	34591681
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34589997	37810001	1370	1337	0.0599	2.14125767354773e-18	34580533	34591681	1.02666994335892e-91	37810001	37812045
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.8374	1.02666994335892e-91	37810001	37812045	3.05770959033877e-91	37854350	37855837
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	45608480	3152	3067	0.059	3.05770959033877e-91	37854350	37855837	7.45379922942548e-08	45606374	45608480
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45611646	45613469	2	2	-0.8344	7.45379922942548e-08	45606374	45608480	5.01256672005229e-08	45613469	45615532
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45615532	76781406	10780	10478	0.053	5.01256672005229e-08	45613469	45615532	3.43380031939283e-13	76777680	76781406
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76789219	76802732	4	4	-0.7379	3.43380031939283e-13	76777680	76781406	1.80384764647128e-15	76802732	76810154
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76810154	89902365	3487	3395	0.0415	1.80384764647128e-15	76802732	76810154	6.12527308881103e-17	89885961	91127894
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	91270311	14	14	-0.447	6.12527308881103e-17	89885961	91127894	5.95179598146455e-17	91173586	94892170
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	132227025	9976	9700	0.0494	5.95179598146455e-17	91173586	94892170	4.75076597789518e-10	132061245	132397397
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132366131	132776951	23	23	-0.2532	4.75076597789518e-10	132061245	132397397	9.68844003002983e-11	132755508	132812062
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132778589	146571330	4705	4579	0.0353	9.68844003002983e-11	132755508	132812062	2.85889731589226e-12	146562545	146571330
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.6994	2.85889731589226e-12	146562545	146571330	9.02270845707684e-13	146592775	146597405
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	175091554	9371	9111	0.0503	9.02270845707684e-13	146592775	146597405	3.29133431260115e-22	175091554	175091554
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175094522	175104030	5	5	-0.8239	3.29133431260115e-22	175091554	175091554	1.06512427799059e-21	175104030	175104030
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175107823	197880750	7083	6892	0.0499	1.06512427799059e-21	175104030	175104030	3.20897255216133e-09	197880750	197880750
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197883024	197884226	2	2	0.9682	3.20897255216133e-09	197880750	197880750	3.90579800879614e-09	197884226	197884226
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197885450	197885450	1	0	NA	3.90579800879614e-09	197884226	197884226	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197892562	208057199	3852	3757	0.0481	NA	NA	NA	0	208057199	208057199
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-5.8509	0	208057199	208057199	0	208066245	208066245
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	218844854	3964	3864	0.0409	0	208066245	208066245	2.83212771489404e-07	218842100	218844854
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218847224	218849164	2	2	0.8737	2.83212771489404e-07	218842100	218844854	7.27685625153668e-18	218849164	218850436
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218850436	242506262	8402	8206	0.0561	7.27685625153668e-18	218849164	218850436	5.77854468641213e-142	242501239	242514593
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242512310	242689978	65	64	-0.6227	5.77854468641213e-142	242501239	242514593	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	586636	198	189	0.0177	NA	NA	NA	1.15175353837808e-11	580586	589224
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	589224	635754	12	12	-0.3673	1.15175353837808e-11	580586	589224	1.89140366876286e-10	632762	643285
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	11383299	3877	3784	0.0382	1.89140366876286e-10	632762	643285	1.11793447807328e-07	11381714	11383299
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-0.6059	1.11793447807328e-07	11381714	11383299	1.99030911870371e-06	11389624	11392863
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	32074432	6706	6526	0.0499	1.99030911870371e-06	11389624	11392863	3.82168832210104e-32	32074432	32074432
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.7791	3.82168832210104e-32	32074432	32074432	5.2061955387659e-29	32080848	32080848
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5294	0.0616	5.2061955387659e-29	32080848	32080848	9.35301196569685e-12	47460892	47460892
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.172	9.35301196569685e-12	47460892	47460892	1.59315507904122e-27	47466921	47466921
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75479859	10656	10377	0.0533	1.59315507904122e-27	47466921	47466921	9.8584055930546e-28	75469606	75787094
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	18	-0.4485	9.8584055930546e-28	75469606	75787094	4.5810468667435e-25	75868882	76006248
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	117662833	10931	10644	0.0525	4.5810468667435e-25	75868882	76006248	8.96741179589569e-53	117635235	117711831
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117664990	118499089	188	182	-0.168	8.96741179589569e-53	117635235	117711831	4.89889346624214e-48	118450240	118566470
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118506732	133189686	5696	5554	0.0662	4.89889346624214e-48	118450240	118566470	1.81326450366517e-28	133189686	133189686
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.7707	1.81326450366517e-28	133189686	133189686	5.39723186883332e-31	133194685	133194685
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	138072549	1750	1701	0.0634	5.39723186883332e-31	133194685	133194685	2.12049123066914e-09	138072549	138072549
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	138078049	138078103	2	2	1.0221	2.12049123066914e-09	138072549	138072549	1.05418020587335e-09	138078103	138078103
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	138078182	164019640	8031	7837	0.0606	1.05418020587335e-09	138078103	138078103	3.04277738685555e-36	164009321	164027724
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164023502	164107951	22	22	0.6081	3.04277738685555e-36	164009321	164027724	4.5113054835976e-38	164101776	164112873
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	176559755	4109	3996	0.0562	4.5113054835976e-38	164101776	164112873	2.89267580787419e-196	176559755	176559755
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176563796	176566161	2	2	-4.0507	2.89267580787419e-196	176559755	176559755	1.64285211411002e-188	176566161	176566161
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176568986	198038358	7482	7297	0.0586	1.64285211411002e-188	176566161	176566161	1.23041767981533e-10	198038358	198038358
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.9473	1.23041767981533e-10	198038358	198038358	6.89525236371009e-10	198042681	198044259
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199329592	521	511	0.0833	6.89525236371009e-10	198042681	198044259	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.4509	NA	NA	NA	1.34382397144382e-10	53781	65688
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	9815760	3384	3290	0.0777	1.34382397144382e-10	53781	65688	0	9815760	9815760
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.2267	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	26563737	4811	4687	0.0291	0	9842644	9842644	2.31415859092713e-13	26563737	26563737
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-1.0718	2.31415859092713e-13	26563737	26563737	2.82301113551857e-15	26566345	26566345
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	34445002	1354	1319	0.035	2.82301113551857e-15	26566345	26566345	6.99328400216798e-15	34439897	34445002
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.5969	6.99328400216798e-15	34439897	34445002	1.07670839837774e-13	34491115	34506297
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	54750004	5584	5450	0.0553	1.07670839837774e-13	34491115	34506297	0	54745680	54750004
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	54751822	66141184	2592	2496	0.8534	0	54745680	54750004	0	66130107	66153594
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	66144415	75985895	2617	2552	1.1282	0	66130107	66153594	0	75985895	75985895
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	75991394	89057407	4788	4645	-0.668	0	75985895	75985895	8.36477530876298e-07	89053053	89057407
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	89059058	89061750	2	2	0.2055	8.36477530876298e-07	89053053	89057407	1.74031025066525e-07	89061750	89068627
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	89068627	100240716	3811	3723	-0.6699	1.74031025066525e-07	89061750	89068627	0	100240716	100240716
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100244817	100351083	29	28	-3.1246	0	100240716	100240716	0	100351083	100351083
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100353659	107275274	2159	2105	-0.6617	0	100351083	100351083	1.02399556177730e-08	107271000	107275274
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.0159	1.0239955617773e-08	107271000	107275274	2.17934544731011e-08	107281410	107283257
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	119550771	3680	3585	-0.6592	2.17934544731011e-08	107281410	107283257	4.64097746828386e-24	119535270	119639593
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119623202	119700930	22	22	-0.1798	4.64097746828386e-24	119535270	119639593	6.54035898355753e-25	119684734	119722485
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119720703	125241506	1717	1681	-0.673	6.54035898355753e-25	119684734	119722485	1.40286038713124e-47	125238799	125241506
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	125249458	125347704	17	17	0.092	1.40286038713124e-47	125238799	125241506	1.77020263717471e-47	125347704	125351369
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	125351369	129949524	1012	997	-0.6688	1.77020263717471e-47	125347704	125351369	9.30909894078406e-11	129949524	129949524
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	129950848	129952427	2	2	0.4026	9.30909894078406e-11	129949524	129949524	5.79228869231041e-11	129952427	129952427
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	129954909	187330240	16312	15897	-0.6684	5.79228869231041e-11	129952427	129952427	2.34986604436247e-175	187330240	187330240
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.8066	2.34986604436247e-175	187330240	187330240	1.67489996837761e-171	187333619	187333619
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1206	-0.6936	1.67489996837761e-171	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	191	0.087	NA	NA	NA	2.03064664323345e-12	681141	681141
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	1.3216	2.03064664323345e-12	681141	681141	4.49830376550941e-18	686701	686701
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	21490654	6157	6001	0.0387	4.49830376550941e-18	686701	686701	7.32712703153877e-10	21480789	21559709
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21493505	21606184	16	14	-0.3245	7.32712703153877e-10	21480789	21559709	2.31038766526785e-10	21598643	21616990
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21610433	114033978	25369	24776	0.0463	2.31038766526785e-10	21598643	21616990	1.07313367784165e-09	114033978	114033978
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114041084	114043256	2	2	-0.9053	1.07313367784165e-09	114033978	114033978	4.58921402567518e-10	114043256	114043256
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114046919	146599404	10506	10232	0.056	4.58921402567518e-10	114043256	114043256	5.59316504247757e-10	146598274	146599404
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	146601381	146603091	2	2	0.9668	5.59316504247757e-10	146598274	146599404	1.36688582512734e-08	146603091	146604851
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	146604851	155405839	3232	3154	0.0599	1.36688582512734e-08	146603091	146604851	8.51286198623684e-06	155401645	155405839
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155420791	4	4	-0.4733	8.51286198623684e-06	155401645	155405839	8.91521310288468e-08	155420791	155432745
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155421443	179429409	7855	7636	0.0529	8.91521310288468e-08	155420791	155432745	4.00016630220758e-10	179429409	179429409
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	1.0851	4.00016630220758e-10	179429409	179429409	4.51504417062689e-09	179431937	179433578
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180107298	269	259	0.0611	4.51504417062689e-09	179431937	179433578	4.45777952067135e-06	180104277	180107298
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180110133	180115895	3	3	0.7504	4.45777952067135e-06	180104277	180107298	4.01537102212461e-06	180115895	180135156
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180135156	180644810	150	146	0.0745	4.01537102212461e-06	180115895	180135156	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	31385778	11182	10893	-0.6589	NA	NA	NA	0	31385778	31385778
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-4.5241	0	31385778	31385778	1.01099520833038e-253	31418006	31418006
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	474	-0.6402	1.01099520833038e-253	31418006	31418006	1.82456749889256e-102	32548736	32558677
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	10	1.0813	1.82456749889256e-102	32548736	32558677	4.6419883691022e-12	32597877	32613538
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32762061	57	56	-0.2217	4.6419883691022e-12	32597877	32613538	5.51330121102828e-42	32720656	32767722
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	54035000	8246	8024	-0.6458	5.51330121102828e-42	32720656	32767722	8.51770397553233e-26	54035000	54035000
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-2.0621	8.51770397553233e-26	54035000	54035000	1.48629548552747e-27	54042734	54042734
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2693	-0.6735	1.48629548552747e-27	54042734	54042734	0	67060622	67078860
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-5.2069	0	67060622	67078860	0	67093216	67105238
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	67109079	1	0	NA	0	67093216	67105238	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67111812	74647491	2510	2449	-0.6614	NA	NA	NA	3.29733015473057e-49	74647491	74647491
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-2.8561	3.29733015473057e-49	74647491	74647491	3.87864925130920e-48	74653360	74653360
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1114	-0.652	3.8786492513092e-48	74653360	74653360	9.06522197664573e-08	78999263	79028813
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.2956	9.06522197664573e-08	78999263	79028813	2.37724814630573e-08	79079988	79112799
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6599	-0.6651	2.37724814630573e-08	79079988	79112799	1.90561529938701e-20	103841482	103841482
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.3542	1.90561529938701e-20	103841482	103841482	3.60299709286805e-19	103868154	103868154
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	162924709	20342	19829	-0.6562	3.60299709286805e-19	103868154	103868154	1.05384079290121e-11	162922206	162924709
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162926519	162930169	3	3	-1.4433	1.05384079290121e-11	162922206	162924709	3.29540722232372e-08	162930169	162931397
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162931397	165640218	759	734	-0.671	3.29540722232372e-08	162930169	162931397	3.48770227272518e-10	165634602	165643653
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165642393	165650610	6	6	-0.0642	3.48770227272518e-10	165634602	165643653	2.29221043501555e-09	165648188	165655123
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1763	-0.6664	2.29221043501555e-09	165648188	165655123	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	5685121	2056	2001	0.0671	NA	NA	NA	6.0244330447597e-28	5675003	5693165
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5687283	5861574	61	61	0.4043	6.0244330447597e-28	5675003	5693165	2.34409452440376e-42	5851216	5890852
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5878458	38258332	11483	11181	0.049	2.34409452440376e-42	5851216	5890852	1.21578521131657e-16	38247267	38274436
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38335964	38	37	0.3383	1.21578521131657e-16	38247267	38274436	3.6337447176413e-14	38327469	38347160
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	76551428	9147	8917	0.0547	3.6337447176413e-14	38327469	38347160	1.44637985848586e-58	76365382	76571953
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76561367	76762561	69	68	0.4735	1.44637985848586e-58	76365382	76571953	5.3368261691475e-66	76756167	76779222
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76776839	109217320	12107	11789	0.0489	5.3368261691475e-66	76756167	76779222	4.10376106142878e-09	109216032	109217320
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	0.6489	4.10376106142878e-09	109216032	109217320	8.01613241695829e-10	109240210	109244233
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	118611324	4299	4178	0.051	8.01613241695829e-10	109240210	109244233	2.90494269291937e-45	118611324	118611324
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.6699	2.90494269291937e-45	118611324	118611324	8.02805412053768e-41	118620875	118620875
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	120089714	604	588	0.0404	8.02805412053768e-41	118620875	118620875	2.38537517609614e-23	120089714	120089714
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120092153	120098907	5	5	-0.9183	2.38537517609614e-23	120089714	120089714	5.81026094992323e-25	120098907	120098907
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120101979	133433384	6218	6047	0.0529	5.81026094992323e-25	120098907	120098907	5.7123281972369e-39	133433384	133433384
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	1.0081	5.7123281972369e-39	133433384	133433384	6.81198108217222e-38	133448277	133448277
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3599	0.0557	6.81198108217222e-38	133448277	133448277	1.51540219392768e-19	141408013	141414719
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	0.5778	1.51540219392768e-19	141408013	141414719	1.24494643460654e-20	141435643	141443577
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	147702365	2638	2578	0.0426	1.24494643460654e-20	141435643	141443577	9.50393807272933e-115	147702365	147702365
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.2426	9.50393807272933e-115	147702365	147702365	1.71732864248609e-110	147707161	147707161
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1583	0.0777	1.71732864248609e-110	147707161	147707161	1.94885040267170e-06	151701438	151730250
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.3372	1.9488504026717e-06	151701438	151730250	1.30630821223977e-05	151740878	151751920
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	156483966	1543	1493	0.0525	1.30630821223977e-05	151740878	151751920	1.78708313141596e-13	156483966	156483966
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	1.2345	1.78708313141596e-13	156483966	156483966	2.69755621226771e-10	156490484	156492262
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1023	0.0754	2.69755621226771e-10	156490484	156492262	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.6566	NA	NA	NA	1.04624702529387e-106	581533	581533
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.5096	1.04624702529387e-106	581533	581533	1.35834330505683e-128	588865	588865
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2229727	614	599	-0.6611	1.35834330505683e-128	588865	588865	3.27650043698104e-99	2229727	2229727
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2231804	2234351	2	0	NA	3.27650043698104e-99	2229727	2229727	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-3.0576	NA	NA	NA	1.61483318608368e-101	2251011	2251011
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	14908682	4148	4050	-0.6763	1.61483318608368e-101	2251011	2251011	2.24543686352507e-23	14907511	14908682
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	14910298	14913874	3	2	0.3314	2.24543686352507e-23	14907511	14908682	2.91357807941595e-08	14913874	14916316
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	14916316	25022606	3237	3143	-0.6557	2.91357807941595e-08	14913874	14916316	7.24600543656494e-48	25022606	25022606
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-2.5466	7.24600543656494e-48	25022606	25022606	2.62168346512202e-46	25039370	25039370
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25463846	193	189	-0.6587	2.62168346512202e-46	25039370	25039370	8.63125485847256e-45	25463846	25463846
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25470598	3	3	-2.5022	8.63125485847256e-45	25463846	25463846	5.91173398808516e-50	25470598	25470598
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25472648	27079959	666	647	-0.6625	5.91173398808516e-50	25470598	25470598	0	27076195	27079959
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27081377	27532654	208	204	0.0902	0	27076195	27079959	0	27532654	27534310
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27534310	39350798	3872	3759	-0.6616	0	27532654	27534310	5.95727440246221e-254	39350798	39350798
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.2838	5.95727440246221e-254	39350798	39350798	1.05022418148095e-226	39505256	39508035
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	427	-0.6724	1.05022418148095e-226	39505256	39508035	9.80547640495845e-14	40892587	40892587
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	0.5563	9.80547640495845e-14	40892587	40892587	8.24575891095155e-12	40897469	40897469
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	40904488	1	0	NA	8.24575891095155e-12	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40911342	43647063	904	881	-0.617	NA	NA	NA	0	43647063	43647063
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	47058319	87255865	11339	11071	0.4971	0	43647063	43647063	6.39422308981416e-29	87255865	87255865
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-0.7886	6.39422308981416e-29	87255865	87255865	5.50374613273651e-29	87262662	87262662
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	107810250	7045	6871	0.5075	5.50374613273651e-29	87262662	87262662	1.43941568089663e-31	107798912	107815307
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107811044	108003220	44	44	0.8611	1.43941568089663e-31	107798912	107815307	2.08467312775007e-30	107979798	108046988
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	108008010	146264846	11654	11325	0.5008	2.08467312775007e-30	107979798	108046988	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	5080443	1900	1851	0.0412	NA	NA	NA	0.000631759252249088	5066730	5087082
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5082049	5103256	8	8	-0.258	0.000631759252249088	5066730	5087082	0.000592025965495732	5090028	5120488
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5104764	15802255	3550	3459	0.0447	0.000592025965495732	5090028	5120488	2.2602372523473e-22	15802255	15802255
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.4125	2.2602372523473e-22	15802255	15802255	5.21121640048096e-20	15807123	15807123
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2474	0.0485	5.21121640048096e-20	15807123	15807123	2.87211115841606e-15	23343915	23343915
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	1.0254	2.87211115841606e-15	23343915	23343915	4.83203103320224e-14	23365926	23377660
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39146895	4728	4593	0.0481	4.83203103320224e-14	23365926	23377660	8.13611783705712e-11	39130211	39146895
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	0.7743	8.13611783705712e-11	39130211	39146895	4.27980200887988e-05	43599449	43626920
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	67859114	8	8	-0.0022	4.27980200887988e-05	43599449	43626920	0.000156291530349009	44199401	67903104
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67903104	67927172	10	10	-0.45	0.000156291530349009	44199401	67903104	5.42463656059831e-13	67927172	68483889
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	309	0.0428	5.42463656059831e-13	67927172	68483889	3.11656137617869e-39	70926188	70926188
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.9165	3.11656137617869e-39	70926188	70926188	2.29355959856332e-37	70930528	70930528
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	15101	0.0382	2.29355959856332e-37	70930528	70930528	4.19769008955805e-13	116124007	116124007
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0959	4.19769008955805e-13	116124007	116124007	7.65308488506541e-12	116130333	116130333
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	123451454	2435	2378	0.0086	7.65308488506541e-12	116130333	116130333	6.68322783761101e-12	123451454	123451454
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123453227	123455396	2	2	1.0695	6.68322783761101e-12	123451454	123451454	2.41303384472821e-08	123455396	123458013
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123458013	134612031	4842	4706	0.0645	2.41303384472821e-08	123455396	123458013	1.41676821630603e-09	134609758	134612031
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134613502	134616971	3	3	-0.8107	1.41676821630603e-09	134609758	134612031	1.50218824376690e-08	134616971	134616971
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134619449	137352394	1013	980	0.0616	1.5021882437669e-08	134616971	134616971	1.40673235657077e-38	137352394	137352394
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.2889	1.40673235657077e-38	137352394	137352394	5.42311958465847e-36	137356880	137356880
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1075	0.071	5.42311958465847e-36	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	766548	289	286	-0.3019	NA	NA	NA	9.3437911443101e-19	766548	766548
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	771247	774846	2	2	1.1785	9.3437911443101e-19	766548	766548	3.76214269458926e-22	774846	774846
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	777917	27038538	9438	9197	-0.3036	3.76214269458926e-22	774846	774846	2.77497235014057e-24	27038538	27038538
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.246	2.77497235014057e-24	27038538	27038538	6.00441057056887e-22	27041812	27041812
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46384985	4727	4596	-0.2863	6.00441057056887e-22	27041812	27041812	1.09319723357568e-68	45487335	46389734
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	47040444	74	70	-0.7428	1.09319723357568e-68	45487335	46389734	1.23044862541965e-65	47017598	47058901
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47057097	53683740	1770	1730	-0.3026	1.23044862541965e-65	47017598	47058901	2.63460341793729e-07	53683740	53683740
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-1.1816	2.63460341793729e-07	53683740	53683740	9.79154601202625e-29	53687880	53687880
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	53689554	1	0	NA	9.79154601202625e-29	53687880	53687880	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53691276	77917893	8287	8067	-0.2914	NA	NA	NA	1.42966576415674e-58	77917893	77917893
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.2462	1.42966576415674e-58	77917893	77917893	1.16846368165875e-54	77928738	77928738
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	90947373	3938	3840	-0.2998	1.16846368165875e-54	77928738	77928738	6.21103534429327e-266	90939367	90948997
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	90948997	91311673	161	161	0.2918	6.21103534429327e-266	90939367	90948997	1.53979199869968e-261	91309975	91312754
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	91312754	100676022	3663	3574	-0.2847	1.53979199869968e-261	91309975	91312754	3.85710222295515e-134	100676022	100676022
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-3.2823	3.85710222295515e-134	100676022	100676022	3.56812056968791e-129	100686753	100686753
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	100686787	1	0	NA	3.56812056968791e-129	100686753	100686753	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	101581383	326	319	-0.2997	NA	NA	NA	3.54903030645651e-09	101581383	101581383
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	101584028	101586617	2	2	0.603	3.54903030645651e-09	101581383	101581383	6.59392958780707e-14	101586617	101590904
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	101590904	114100979	4298	4188	-0.2973	6.59392958780707e-14	101586617	101590904	1.57472873397629e-166	114100979	114100979
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-4.3952	1.57472873397629e-166	114100979	114100979	8.38073297604086e-164	114106460	114106460
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	114108041	1	0	NA	8.38073297604086e-164	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114109303	134739406	7607	7415	-0.2754	NA	NA	NA	2.72099439856277e-30	134739406	134739406
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	1.5139	2.72099439856277e-30	134739406	134739406	1.44745615002232e-15	134743423	134743423
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	205	-0.2249	1.44745615002232e-15	134743423	134743423	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1103180	363	354	0.1142	NA	NA	NA	7.48566531383795e-11	1101451	1104014
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1104014	1105351	3	3	1.1729	7.48566531383795e-11	1101451	1104014	1.52791409659814e-14	1104734	1105351
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1106234	4923300	1406	1368	0.0812	1.52791409659814e-14	1104734	1105351	2.30718440839832e-13	4920907	4923300
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.7279	2.30718440839832e-13	4920907	4923300	9.2951154269583e-14	4932214	4934594
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	350	0.0366	9.2951154269583e-14	4932214	4934594	0	5741031	5741031
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-5.3585	0	5741031	5741031	0	5765438	5765438
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	47343151	13959	13586	0.0557	0	5765438	5765438	9.31599330516856e-10	47341091	47343151
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47345012	47345012	1	0	NA	9.31599330516856e-10	47341091	47343151	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47350773	47355105	4	4	0.7646	NA	NA	NA	1.31391270554435e-09	47355105	47357351
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47357351	55118214	788	770	0.0522	1.31391270554435e-09	47355105	47357351	1.09623864239551e-27	55097806	55129329
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	0.4483	1.09623864239551e-27	55097806	55129329	5.83696829820291e-27	55202450	55223056
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	99025912	15494	15074	0.0656	5.83696829820291e-27	55202450	55223056	4.82038872978676e-20	99004343	99042990
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99027331	99074552	22	22	0.3295	4.82038872978676e-20	99004343	99042990	4.38208157926363e-08	99051142	99092970
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	101680277	901	872	0.055	4.38208157926363e-08	99051142	99092970	2.27638988977253e-06	101668802	101684405
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101682241	101697749	7	7	0.4845	2.27638988977253e-06	101668802	101684405	4.40043020610520e-06	101693959	101708426
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101700922	101700922	1	0	NA	4.4004302061052e-06	101693959	101708426	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101703021	134450318	11935	11632	0.0544	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	286	0.0387	NA	NA	NA	2.77495418275465e-07	731485	736988
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.6193	2.77495418275465e-07	731485	736988	9.14974088099173e-09	743223	745410
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3360	0.0592	9.14974088099173e-09	743223	745410	1.61540446185235e-42	9516067	9543817
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.8756	1.61540446185235e-42	9516067	9543817	9.82492561547053e-43	9578398	9599999
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11123452	576	562	0.063	9.82492561547053e-43	9578398	9599999	6.19388480661413e-05	11112600	11123452
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11125311	11130871	4	4	0.5438	6.19388480661413e-05	11112600	11123452	9.95374474986444e-06	11130871	11147675
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	68	0.0369	9.95374474986444e-06	11130871	11147675	9.4229224588851e-07	11389830	11395862
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-0.4811	9.4229224588851e-07	11389830	11395862	1.49490657961292e-07	11435643	11452868
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	33184017	7510	7311	0.0544	1.49490657961292e-07	11435643	11452868	1.58235136346349e-06	33178741	33184017
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.7372	1.58235136346349e-06	33178741	33184017	6.45958652994206e-06	33198331	33201796
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	78676440	14630	14272	0.0529	6.45958652994206e-06	33198331	33201796	1.00120161797693e-11	78675711	78676440
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78679297	78686371	4	4	-0.7092	1.00120161797693e-11	78675711	78676440	4.61386311345441e-15	78686371	78686371
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	80662066	783	761	0.0552	4.61386311345441e-15	78686371	78686371	2.02419178151147e-09	80662066	80662066
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-0.8056	2.02419178151147e-09	80662066	80662066	7.06215708634747e-13	80666751	80666751
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130943064	17266	16800	0.0584	7.06215708634747e-13	80666751	80666751	1.75745230577011e-64	130943064	130943064
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.5691	1.75745230577011e-64	130943064	130943064	1.41139215841614e-52	130946248	130946248
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	131810497	352	338	0.0891	1.41139215841614e-52	130946248	130946248	1.62175817591713e-51	131806639	131816489
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131812664	131989836	82	79	0.5168	1.62175817591713e-51	131806639	131816489	1.65143967741523e-49	131985631	131998683
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131991857	132289090	116	113	0.0544	1.65143967741523e-49	131985631	131998683	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13650	0.0477	NA	NA	NA	4.29461351049548e-58	56650373	56650373
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	-0.798	4.29461351049548e-58	56650373	56650373	1.97774682189258e-64	56685341	56685341
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	62453055	1360	1305	0.0354	1.97774682189258e-64	56685341	56685341	4.75289743776903e-07	62427951	62485058
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62456486	62530764	11	11	-0.2941	4.75289743776903e-07	62427951	62485058	2.86002475491866e-07	62519386	62551560
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62534030	68138912	1322	1286	0.0318	2.86002475491866e-07	62519386	62551560	7.72009379882154e-12	68134536	68142120
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68142120	68163523	11	10	0.4614	7.72009379882154e-12	68134536	68142120	1.74159981284067e-10	68161714	68168882
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	89659397	5549	5416	0.0435	1.74159981284067e-10	68161714	68168882	2.40036818344567e-08	89657473	89659397
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	0.8828	2.40036818344567e-08	89657473	89659397	3.30742110570324e-07	89662326	89663261
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4664	0.0546	3.30742110570324e-07	89662326	89663261	0	100690991	100690991
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-6.1119	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4309	0.0555	0	100693892	100693892	5.66995930952295e-27	113788788	113788788
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	1.6908	5.66995930952295e-27	113788788	113788788	1.46886759638767e-14	113792974	113797828
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	113794669	1	0	NA	1.46886759638767e-14	113792974	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	145	0.1172	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	6	-0.1413	NA	NA	NA	2.60844531209923e-07	18798641	19273289
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	52	-0.7101	2.60844531209923e-07	18798641	19273289	3.75993801706842e-131	19492531	19497023
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20030143	262	255	0.066	3.75993801706842e-131	19492531	19497023	3.27686842275277e-96	20027368	20035793
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20034343	20258563	127	126	0.5124	3.27686842275277e-96	20027368	20035793	4.55509034704454e-97	20252418	20265854
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20259505	21426967	555	542	0.084	4.55509034704454e-97	20252418	20265854	5.60001323056127e-54	21408994	21448635
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21428282	22051630	309	301	0.3248	5.60001323056127e-54	21408994	21448635	6.41195865491982e-115	22042671	22062453
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22052799	34674458	4437	4324	0.0476	6.41195865491982e-115	22042671	22062453	5.42582071912982e-20	34674458	34674458
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1778	5.42582071912982e-20	34674458	34674458	2.390823642384e-21	34683810	34683810
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1852	0.0617	2.390823642384e-21	34683810	34683810	2.65286084195105e-17	40670538	40676611
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.6789	2.65286084195105e-17	40670538	40676611	3.83620226691057e-18	40726930	40741934
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	52245737	3222	3121	0.0461	3.83620226691057e-18	40726930	40741934	9.89602374875389e-08	52244535	52245737
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	52247460	52249751	2	2	0.8596	9.8960237487539e-08	52244535	52245737	1.18203621716273e-23	52249751	52250862
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	52250862	67678700	6051	5898	0.0779	1.18203621716273e-23	52249751	52250862	0	67674729	67682067
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	67680521	68543280	438	430	0.5441	0	67674729	67682067	0	68539975	68551797
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	68548275	73061942	2050	1981	0.0584	0	68539975	68551797	2.28626377755183e-78	73061942	73061942
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	1.5076	2.28626377755183e-78	73061942	73061942	1.24178375571507e-67	73092112	73092112
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	76413748	1527	1491	0.0713	1.24178375571507e-67	73092112	73092112	3.72515457998811e-145	76406219	76422020
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	76416094	77106441	360	349	0.4024	3.72515457998811e-145	76406219	76422020	2.47329367392455e-188	77094608	77114998
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	77108343	105948347	10412	10152	0.0621	2.47329367392455e-188	77094608	77114998	4.75971399144075e-27	105948347	105948347
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105966378	5	5	-1.0086	4.75971399144075e-27	105948347	105948347	1.68129890406063e-10	105966378	105968122
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105968122	106002179	12	10	-0.4962	1.68129890406063e-10	105966378	105968122	8.18677479059887e-14	106002179	106015449
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	141	0.0664	8.18677479059887e-14	106002179	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.5503	NA	NA	NA	0.000102655470215017	18692865	18824622
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19465359	92	91	-1.0369	0.000102655470215017	18692865	18824622	1.12125271426142e-46	19430207	19800789
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	56	-1.8045	1.12125271426142e-46	19430207	19800789	1.33306059715016e-301	20079935	20088256
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32448816	3666	3554	-0.6662	1.33306059715016e-301	20079935	20088256	1.10689309335425e-13	32442322	32530001
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32450056	32721469	50	48	-0.4021	1.10689309335425e-13	32442322	32530001	4.37267158272363e-12	32681788	32772265
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32726383	41619183	3632	3523	-0.6477	4.37267158272363e-12	32681788	32772265	0	41618903	41625154
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41625154	46845516	2056	2009	0.0529	0	41618903	41625154	2.54537209665471e-122	46840410	46848309
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	46846654	47097486	135	132	0.4852	2.54537209665471e-122	46840410	46848309	1.12058406179769e-124	47096253	47101212
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47098633	74669752	12016	11723	0.0576	1.12058406179769e-124	47096253	47101212	0	74669752	74669752
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.9163	0	74669752	74669752	9.37348303532884e-249	74680439	74680439
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	76887995	847	828	0.0722	9.37348303532884e-249	74680439	74680439	4.91515168744096e-11	76887995	76887995
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	76890122	76891128	2	2	1.1922	4.91515168744096e-11	76887995	76887995	7.76776476173793e-13	76891128	76891128
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	76893003	95609756	6766	6589	0.0577	7.76776476173793e-13	76891128	76891128	1.55116884758898e-14	95606006	95609756
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.5935	1.55116884758898e-14	95606006	95609756	2.83325205600246e-12	95632390	95656272
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	99632987	1712	1674	0.0615	2.83325205600246e-12	95632390	95656272	3.09798934595058e-18	99632987	99632987
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.4345	3.09798934595058e-18	99632987	99632987	5.49584222210231e-18	99635701	99635701
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	265	0.0298	5.49584222210231e-18	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	459	-0.2548	NA	NA	NA	1.87276368637011e-16	1296767	1296767
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.2758	1.87276368637011e-16	1296767	1296767	6.06515925322034e-17	1300341	1300341
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	2600740	538	529	-0.2401	6.06515925322034e-17	1300341	1300341	5.00973661715113e-15	2600740	2600740
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-1.404	5.00973661715113e-15	2600740	2600740	1.40172893623227e-17	2639798	2639798
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	8623609	2233	2176	-0.2889	1.40172893623227e-17	2639798	2639798	1.02577103177283e-16	8529682	8642453
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8624972	8666865	24	23	-0.0624	1.02577103177283e-16	8529682	8642453	9.5058552563082e-05	8643749	8702581
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8669161	34059589	7355	7169	-0.2863	9.5058552563082e-05	8643749	8702581	0	33538171	34077326
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34061029	57203733	4281	4179	-0.4951	0	33538171	34077326	4.6365899692116e-14	57203733	57203733
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	0.7544	4.6365899692116e-14	57203733	57203733	1.45398536812310e-40	57206772	57206772
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	72941901	4853	4752	-0.5003	1.4539853681231e-40	57206772	57206772	3.03540585677751e-41	72918129	72941901
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72964783	5	5	-1.0353	3.03540585677751e-41	72918129	72941901	6.23294584472726e-07	72964783	73025340
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	732	-0.5001	6.23294584472726e-07	72964783	73025340	2.00708635112047e-42	75093957	75093957
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.6879	2.00708635112047e-42	75093957	75093957	3.74031220042561e-43	75100865	75100865
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	86065514	4138	4032	-0.5099	3.74031220042561e-43	75100865	75100865	2.06952201694375e-10	86055765	86090259
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	86070596	86120766	14	14	-0.8447	2.06952201694375e-10	86055765	86090259	1.13274115338017e-06	86096221	86134521
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	86126915	88690571	979	946	-0.437	1.13274115338017e-06	86096221	86134521	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1902148	852	837	-0.6066	NA	NA	NA	3.45864815403464e-10	1899977	1902148
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1903358	1906391	5	5	0.1439	3.45864815403464e-10	1899977	1902148	1.70166512971245e-12	1906391	1909371
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	15629313	5444	5290	-0.6434	1.70166512971245e-12	1906391	1909371	3.90462402492392e-38	15629313	15629313
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15727076	15727076	1	0	NA	3.90462402492392e-38	15629313	15629313	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-2.842	NA	NA	NA	6.21173091570332e-40	15733964	15733964
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	24066576	2602	2523	-0.6086	6.21173091570332e-40	15733964	15733964	1.31969657338333e-62	24065443	24070036
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24067980	24067980	1	0	NA	1.31969657338333e-62	24065443	24070036	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24070036	24144522	35	32	0.0913	NA	NA	NA	2.17737060248842e-26	24139819	24149608
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24145841	24564941	227	222	0.5421	2.17737060248842e-26	24139819	24149608	6.35684503228927e-30	24559486	24566138
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24566138	24630411	29	29	0.0358	6.35684503228927e-30	24559486	24566138	4.69790803929436e-57	24628593	24634189
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24634189	25898780	586	571	-0.6347	4.69790803929436e-57	24628593	24634189	5.10534116233025e-16	25894470	26024574
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25900388	26073893	7	7	0.1035	5.10534116233025e-16	25894470	26024574	3.08858982578652e-16	26036063	26128808
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26128808	32707677	2558	2492	-0.6406	3.08858982578652e-16	26036063	26128808	2.21172120039788e-11	32707677	32707677
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32709516	32711048	2	2	-1.7432	2.21172120039788e-11	32707677	32707677	5.242198360368e-11	32711048	32711048
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32711885	32828797	70	67	-0.6194	5.242198360368e-11	32711048	32711048	2.90732514589641e-31	32828797	32828797
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.5383	2.90732514589641e-31	32828797	32828797	2.81992142669597e-29	32832642	32832642
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1406	-0.6149	2.81992142669597e-29	32832642	32832642	2.36399985259672e-59	36673853	36673853
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.9573	2.36399985259672e-59	36673853	36673853	1.47797940676478e-54	36684619	36684619
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	38470803	863	848	-0.6053	1.47797940676478e-54	36684619	36684619	6.3582341553157e-62	38467486	38474138
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38474138	38534236	30	29	0.1632	6.3582341553157e-62	38467486	38474138	5.78948020992754e-39	38531352	38540145
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38536651	38536651	1	0	NA	5.78948020992754e-39	38531352	38540145	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38540145	38933454	88	85	-0.5802	NA	NA	NA	1.12906510065374e-151	38929291	38935717
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38935717	41566540	1050	1018	0.0924	1.12906510065374e-151	38929291	38935717	1.06149974271590e-55	41562786	41572001
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	46	-0.4503	1.0614997427159e-55	41562786	41572001	2.68235285356791e-57	41704093	42143048
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	54544716	4425	4292	0.0626	2.68235285356791e-57	41704093	42143048	2.74753895257198e-06	54508081	54558781
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54546951	54589192	42	42	0.2468	2.74753895257198e-06	54508081	54558781	2.19541651781789e-05	54578666	54635190
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54589971	57119828	1008	988	0.0766	2.19541651781789e-05	54578666	54635190	0	57116466	57125891
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	57125561	59018097	687	667	0.5224	0	57116466	57125891	0	59010383	59021226
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	59019602	65010209	2416	2360	0.0687	0	59010383	59021226	0.00215034290320056	64996998	65010209
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	65012462	65018896	3	3	0.5777	0.00215034290320056	64996998	65010209	3.55167294931479e-06	65018896	65024614
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	65020574	69452402	1275	1249	0.0346	3.55167294931479e-06	65018896	65024614	2.60166918995847e-263	69429289	69466470
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	69458200	70238623	298	291	0.5076	2.60166918995847e-263	69429289	69466470	5.91543182900106e-176	70231215	70245683
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	70239798	78653545	3525	3420	0.104	5.91543182900106e-176	70231215	70245683	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	169	-0.6557	NA	NA	NA	1.99692141282924e-12	500897	500897
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	0.509	1.99692141282924e-12	500897	500897	4.37441841312505e-14	505456	505456
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	18339689	5424	5286	-0.6462	4.37441841312505e-14	505456	505456	4.56980384025373e-107	18278089	18419913
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18360932	18360932	1	0	NA	4.56980384025373e-107	18278089	18419913	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18375310	19489045	388	379	-0.3953	NA	NA	NA	4.59058668500984e-128	19472792	19499502
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	19490272	31176859	3562	3462	-0.6614	4.59058668500984e-128	19472792	19499502	9.91234466898828e-07	31166073	31176859
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	31178572	31178572	1	0	NA	9.91234466898828e-07	31166073	31176859	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	31179982	31206273	7	7	-0.2184	NA	NA	NA	1.61727755198436e-06	31206273	31210105
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	31207524	53092949	6639	6456	-0.6722	1.61727755198436e-06	31206273	31210105	5.87674453105912e-17	53092949	53092949
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.0088	5.87674453105912e-17	53092949	53092949	2.78863952451007e-17	53099601	53099601
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6605	-0.6527	2.78863952451007e-17	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	475	-0.5681	NA	NA	NA	1.24383246001227e-17	1398325	1398325
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.1053	1.24383246001227e-17	1398325	1398325	3.79090289833872e-18	1400840	1400840
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	7652932	2943	2853	-0.5885	3.79090289833872e-18	1400840	1400840	0	7649425	7656173
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7656173	9939434	943	912	0.0839	0	7649425	7656173	0	9937967	9942386
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9940467	10457692	263	259	-0.6196	0	9937967	9942386	9.3949692348533e-08	10456539	10457692
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10460798	10464421	3	3	0.3285	9.3949692348533e-08	10456539	10457692	1.53363683450709e-05	10464421	10471823
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10466998	10466998	1	0	NA	1.53363683450709e-05	10464421	10471823	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10470223	15623907	2395	2335	1.0755	NA	NA	NA	8.78931614030576e-227	15588553	15652533
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15625037	19694025	1985	1928	0.8341	8.78931614030576e-227	15588553	15652533	2.81745092741514e-215	19694025	19694025
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-3.5481	2.81745092741514e-215	19694025	19694025	2.16672108219757e-247	19700620	19700620
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	22542644	746	721	0.816	2.16672108219757e-247	19700620	19700620	7.2828048730184e-18	22542644	22542644
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22556621	22565772	7	6	-0.0126	7.2828048730184e-18	22542644	22542644	6.54139652720836e-13	22565772	22565772
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22567876	22581216	7	6	0.8488	6.54139652720836e-13	22565772	22565772	3.49213634356575e-16	22581216	22583989
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22583989	59414898	11265	10967	0.0397	3.49213634356575e-16	22581216	22583989	4.61248187267922e-22	59414645	59414898
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440262	11	11	-0.654	4.61248187267922e-22	59414645	59414898	4.80312304795083e-21	59440262	59440274
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63788698	1993	1936	0.0324	4.80312304795083e-21	59440262	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	0.0754	NA	NA	NA	3.63787635338031e-297	1506379	1511632
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-3.2949	3.63787635338031e-297	1506379	1511632	0	1528899	1531162
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	26148764	8441	8229	0.0484	0	1528899	1531162	1.88728748824665e-11	26145205	26155133
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26150897	28266113	16	16	-0.3228	1.88728748824665e-11	26145205	26155133	5.6394456345787e-14	28247413	29309668
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	31552312	999	969	0.0925	5.6394456345787e-14	28247413	29309668	8.99152933836238e-14	31550652	31552312
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	31555067	31560953	5	5	-0.6398	8.99152933836238e-14	31550652	31552312	3.42444585679416e-11	31560953	31566875
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	31566875	62419534	11523	11203	0.0683	3.42444585679416e-11	31560953	31566875	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	13992109	63	62	-0.2154	NA	NA	NA	6.35191129310836e-24	13868917	14294338
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	41106927	10683	10383	0.0518	6.35191129310836e-24	13868917	14294338	3.3062826795462e-14	41105959	41106927
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	41108222	41113173	4	4	-0.7612	3.3062826795462e-14	41105959	41106927	2.13314272318075e-12	41113173	41114609
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	41114609	43501555	1102	1072	0.096	2.13314272318075e-12	41113173	41114609	9.91426734794434e-273	43490047	43536279
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43505612	44408507	428	418	0.5504	9.91426734794434e-273	43490047	43536279	1.01338836016026e-268	44404262	44413436
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44412158	46922972	1161	1134	0.0876	1.01338836016026e-268	44404262	44413436	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	399	-0.605	NA	NA	NA	1.12006482363321e-38	16521073	16521073
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-2.8329	1.12006482363321e-38	16521073	16521073	4.91987227769246e-34	16524408	16524408
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22677959	2576	2522	-0.6001	4.91987227769246e-34	16524408	16524408	7.50647620157649e-20	22643742	22682428
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22725305	21	20	-0.0553	7.50647620157649e-20	22643742	22682428	8.57086663702987e-27	22720195	22736990
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	28534093	3180	3098	-0.639	8.57086663702987e-27	22720195	22736990	5.41388301956038e-64	28532637	28535159
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28535159	28606054	36	33	0.0585	5.41388301956038e-64	28532637	28535159	0.00014837685726163	28596616	28615108
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28610900	28627112	9	9	-0.3243	0.00014837685726163	28596616	28615108	7.32317511668847e-07	28617053	28631930
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28628752	29606704	535	522	0.0998	7.32317511668847e-07	28617053	28631930	0	29605336	29608976
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	29608976	35472378	2787	2707	-0.642	0	29605336	29608976	3.51127163288393e-106	35472378	35472378
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-4.1593	3.51127163288393e-106	35472378	35472378	8.34103946025152e-98	35476942	35476942
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1169	-0.5944	8.34103946025152e-98	35476942	35476942	0	37685496	37685496
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-2.9445	0	37685496	37685496	0	37715385	37715385
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	48446915	5273	5138	-0.6116	0	37715385	37715385	7.66836904381566e-14	48446915	48446915
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48448446	48448446	1	0	NA	7.66836904381566e-14	48446915	48446915	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	0.7573	NA	NA	NA	8.3694537176644e-11	48452959	48455492
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	485	-0.5671	8.3694537176644e-11	48452959	48455492	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.0357	NA	NA	NA	9.28526483244453e-18	124528	127113
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	1.3891	9.28526483244453e-18	124528	127113	1.66920343736434e-15	129544	132689
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	208495	33	33	-0.0094	1.66920343736434e-15	129544	132689	1.29824346356579e-12	205706	213243
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	208682	369273	136	135	0.4324	1.29824346356579e-12	205706	213243	2.36433375093529e-80	363205	377967
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	369425	369425	1	0	NA	2.36433375093529e-80	363205	377967	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	375857	2302065	1196	1168	-0.0051	NA	NA	NA	6.91480690354403e-17	2302065	2302065
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0842	6.91480690354403e-17	2302065	2302065	6.38914568099518e-16	2304398	2306110
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	377	0.0014	6.38914568099518e-16	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3558012	349	344	0.9887	0	2708113	2711273	0.000315827779459107	3549438	3558012
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3560182	3565615	3	3	0.1826	0.000315827779459107	3549438	3558012	7.72737258488671e-10	3565615	3566606
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3566606	32317149	10982	10696	1.0739	7.72737258488671e-10	3565615	3566606	0	32315589	32318241
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32318241	32675236	213	209	0.3511	0	32315589	32318241	0	32673745	32677278
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32677278	74365882	11064	10785	1.0757	0	32673745	32677278	5.2370236895506e-35	74353191	74383616
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	74380482	74569045	46	46	1.527	5.2370236895506e-35	74353191	74383616	1.05540356140887e-38	74566478	74586352
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	74586268	153329988	22061	21436	1.0711	1.05540356140887e-38	74566478	74586352	2.20272732029514e-09	153329988	153329988
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153333629	2	2	-0.0429	2.20272732029514e-09	153329988	153329988	2.44051473771698e-08	153333629	153333629
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153335752	154582414	414	403	1.0621	2.44051473771698e-08	153333629	153333629	0	154582414	154586690
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154863196	183	179	-0.0013	0	154582414	154586690	0.000194730497838707	154838880	154878434
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154863234	154888224	18	17	-0.275	0.000194730497838707	154838880	154878434	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	125	-4.4572	NA	NA	NA	1.12221135048601e-15	3777766	4421500
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.6863	1.12221135048601e-15	3777766	4421500	4.72923700721223e-08	4948824	6692482
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7256919	227	216	-4.0935	4.72923700721223e-08	4948824	6692482	7.1310314161874e-09	7237274	7287810
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7258171	7401540	61	60	-2.8262	7.1310314161874e-09	7237274	7287810	3.14069337366809e-18	7347578	7456245
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7410906	10515697	538	520	-4.2056	3.14069337366809e-18	7347578	7456245	5.33333653251244e-30	10513747	10515697
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.7347	5.33333653251244e-30	10513747	10515697	3.2545987120132e-07	10645500	11698871
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13104920	198	192	-3.3025	3.2545987120132e-07	10645500	11698871	0.0195246222960288	12978637	13106723
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.6678	0.0195246222960288	12978637	13106723	1.67110475915645e-11	13128515	13133803
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13286708	54	54	-3.9725	1.67110475915645e-11	13128515	13133803	2.96318275649115e-05	13202163	13358173
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13296819	14352278	358	347	-4.5327	2.96318275649115e-05	13202163	13358173	2.69524225433933e-09	14323815	14418116
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	91	-3.8676	2.69524225433933e-09	14323815	14418116	9.31741710240318e-14	14503185	14526446
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	9.31741710240318e-14	14503185	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-0.9646	NA	NA	NA	1.85375493338600e-07	14545228	14547168
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14554415	4	4	-4.1512	1.853754933386e-07	14545228	14547168	4.84153341387902e-08	14554415	14557473
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14555872	14579298	9	8	-1.0757	4.84153341387902e-08	14554415	14557473	1.04064560528384e-13	14579298	14585542
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15207522	152	148	-4.1031	1.04064560528384e-13	14579298	14585542	2.21896336299748e-06	15200639	15220050
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15208612	15241527	11	11	-2.3107	2.21896336299748e-06	15200639	15220050	8.92013465905127e-07	15225775	15244992
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15284717	31	28	-4.1404	8.92013465905127e-07	15225775	15244992	0.0304591302447138	15255162	15319560
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15389388	67	64	-4.7747	0.0304591302447138	15255162	15319560	2.59795411290781e-07	15371826	15423625
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15390599	16387273	318	308	-3.9095	2.59795411290781e-07	15371826	15423625	9.3770585196984e-24	16224597	16517319
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	20367138	593	573	-4.5921	9.3770585196984e-24	16224597	16517319	1.14123559688922e-07	20364200	20367138
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20384639	20428887	6	6	-2.6013	1.14123559688922e-07	20364200	20367138	1.71915519982649e-05	20428887	20496781
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20448276	22139807	339	327	-4.4588	1.71915519982649e-05	20428887	20496781	6.28628699508365e-07	22044579	22157319
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22181855	12	12	-2.9852	6.28628699508365e-07	22044579	22157319	7.22214353580504e-13	22181855	22192409
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22864834	66	65	-4.8353	7.22214353580504e-13	22181855	22192409	3.9180624234573e-05	22856903	22864834
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22866553	22877495	6	5	-3.0939	3.9180624234573e-05	22856903	22864834	2.07708200075510e-05	22877495	22884090
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22930737	18	17	-4.5198	2.0770820007551e-05	22877495	22884090	4.55601596645197e-21	22930737	26870361
MSK_252152912742_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.3284	4.55601596645197e-21	22930737	26870361	NA	NA	NA
