Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1637771	210	202	0.1368	NA	NA	NA	2.52324884800099e-13	1637771	1637771
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1640562	1654026	3	3	-1.1627	2.52324884800099e-13	1637771	1637771	5.18314153506275e-16	1652866	1654026
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	5001131	1220	1170	0.0974	5.18314153506275e-16	1652866	1654026	1.56857949405937e-264	4971768	5067371
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	5027101	10866881	2256	2185	-0.2159	1.56857949405937e-264	4971768	5067371	1.24350801093876e-09	10866881	10866881
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10871894	10873098	2	2	0.9798	1.24350801093876e-09	10866881	10866881	8.63917704459875e-09	10873098	10877780
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10877780	16704522	2090	2006	-0.2146	8.63917704459875e-09	10873098	10877780	6.73961977012384e-10	16657837	16917759
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17148592	27	26	-0.5689	6.73961977012384e-10	16657837	16917759	1.04327917030877e-10	17094475	17164768
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	28377659	4712	4541	-0.2136	1.04327917030877e-10	17094475	17164768	2.87283902386339e-29	28360023	28392400
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	28379832	28548483	79	78	0.1211	2.87283902386339e-29	28360023	28392400	2.38192180593807e-11	28545401	28548483
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	28550132	28557796	5	5	-0.7532	2.38192180593807e-11	28545401	28548483	7.55634627563666e-12	28557796	28559781
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	28559781	32066472	1159	1127	0.0597	7.55634627563666e-12	28557796	28559781	0	32058882	32071507
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32068481	40851064	3463	3362	0.5307	0	32058882	32071507	6.64137401502628e-08	40830157	40871770
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	40857376	40902690	23	22	0.1998	6.64137401502628e-08	40830157	40871770	4.56594366441388e-08	40890109	40914907
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	40904400	41470542	267	258	0.5565	4.56594366441388e-08	40890109	40914907	5.15116705516012e-39	41429504	41513142
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41471854	41471854	1	0	NA	5.15116705516012e-39	41429504	41513142	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41473521	45319047	1607	1554	0.3214	NA	NA	NA	0	45308952	45321849
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	45321031	51481598	2372	2303	-0.2286	0	45308952	45321849	7.56268031785839e-11	51478044	51481598
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51483083	51491827	4	4	-1.1156	7.56268031785839e-11	51478044	51481598	2.73615583799925e-11	51491827	51493140
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51493140	72525842	8388	8125	-0.2418	2.73615583799925e-11	51491827	51493140	2.55523483177966e-05	72520196	72534975
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	0.1883	2.55523483177966e-05	72520196	72534975	4.76156825751328e-91	72537426	72537426
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72545984	5	5	-5.0351	4.76156825751328e-91	72537426	72537426	1.15966834270588e-06	72545984	72545984
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72550248	72579311	9	9	-3.4765	1.15966834270588e-06	72545984	72545984	0	72579311	72579311
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	83914775	3261	3163	-0.2448	0	72579311	72579311	3.09237934375001e-17	83886571	83936383
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	83918773	84069018	52	51	0.0383	3.09237934375001e-17	83886571	83936383	1.74450266757663e-15	84053502	84087264
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84071873	86171390	907	870	-0.2324	1.74450266757663e-15	84053502	84087264	3.41199704072855e-21	86171390	86171390
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86173546	86175273	2	2	-1.7907	3.41199704072855e-21	86171390	86171390	9.23591601222049e-19	86175273	86175273
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	109987341	7466	7227	-0.2414	9.23591601222049e-19	86175273	86175273	2.71748750563553e-10	109987341	109987341
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	0.9223	2.71748750563553e-10	109987341	109987341	1.13106745085825e-08	109989998	109994195
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	112555616	1030	987	-0.2225	1.13106745085825e-08	109989998	109994195	2.01018721740119e-28	112541718	112563022
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	112563022	112663895	19	19	0.4436	2.01018721740119e-28	112541718	112563022	1.74704934290076e-11	112657379	112663895
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	112672754	112691370	7	6	-0.4237	1.74704934290076e-11	112657379	112663895	1.67770977959519e-16	112691370	112691370
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	112695328	112833103	62	58	0.4574	1.67770977959519e-16	112691370	112691370	1.34349475591729e-75	112823732	112836129
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	112836129	113358295	226	216	-0.2195	1.34349475591729e-75	112823732	112836129	2.84572844566716e-16	113351853	113364815
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113364815	113396719	11	11	0.4491	2.84572844566716e-16	113351853	113364815	2.24555350647066e-21	113396719	113399675
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113399675	113636585	74	68	-0.3169	2.24555350647066e-21	113396719	113399675	1.90922813208571e-11	113626637	113636585
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113644792	113695950	6	6	0.4173	1.90922813208571e-11	113626637	113636585	1.09645220856152e-09	113695950	113709534
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113701232	114276922	240	232	-0.2294	1.09645220856152e-09	113695950	113709534	1.81242916890681e-44	114275030	114280892
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	114278413	114332088	31	31	0.4249	1.81242916890681e-44	114275030	114280892	8.47830768472113e-47	114328277	114334173
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	114334173	115087198	272	262	-0.2395	8.47830768472113e-47	114328277	114334173	1.21718065521596e-29	115085989	115093915
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115091008	115091008	1	0	NA	1.21718065521596e-29	115085989	115093915	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115093915	115152465	22	22	0.365	NA	NA	NA	3.81131391332437e-26	115149935	115158076
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115156771	115461481	113	107	-0.2512	3.81131391332437e-26	115149935	115158076	2.54959887276131e-20	115458756	115461481
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115470394	115532732	13	13	0.4281	2.54959887276131e-20	115458756	115461481	8.69924009207691e-21	115532732	115543139
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115543139	115614830	15	15	-0.3277	8.69924009207691e-21	115532732	115543139	1.63039468366776e-32	115612478	115618252
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115618252	115651705	19	19	0.4811	1.63039468366776e-32	115612478	115618252	3.00700056770606e-23	115650297	115652931
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115652931	115691384	20	19	-0.2469	3.00700056770606e-23	115650297	115652931	5.47531659120653e-09	115687256	115693145
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115693145	115779111	9	9	0.3983	5.47531659120653e-09	115687256	115693145	1.17232765001314e-11	115744628	115798948
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	115798948	115999090	32	31	-0.2229	1.17232765001314e-11	115744628	115798948	0.000115162538662363	115990159	116015748
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116000339	116038644	21	20	0.1277	0.000115162538662363	115990159	116015748	1.04238406621711e-11	116026522	116048313
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116040588	143793179	1734	1669	-0.2598	1.04238406621711e-11	116026522	116048313	4.77896187758675e-10	143776468	143803856
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143793256	144093719	32	31	0.0326	4.77896187758675e-10	143776468	143803856	3.46685735652770e-21	143975987	144105332
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150819879	1857	1790	0.4904	3.4668573565277e-21	143975987	144105332	1.14734054929532e-45	150819879	150819879
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	2.3394	1.14734054929532e-45	150819879	150819879	9.50593132519137e-15	150839754	150839754
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	3.6632	9.50593132519137e-15	150839754	150839754	2.80251283711707e-200	150851439	150851439
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2660	0.5016	2.80251283711707e-200	150851439	150851439	2.06262212710836e-129	157133150	157133150
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.903	2.06262212710836e-129	157133150	157133150	1.03697167329130e-138	157136342	157136342
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3954	0.496	1.0369716732913e-138	157136342	157136342	5.38796405857615e-07	167473499	167493768
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167523140	10	10	0.0368	5.38796405857615e-07	167473499	167493768	7.18945513423023e-16	167520743	167530480
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	179692688	4817	4639	0.4992	7.18945513423023e-16	167520743	167530480	3.65122588698217e-14	179688484	179692688
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179694500	179702422	4	4	-0.2497	3.65122588698217e-14	179688484	179692688	3.28621912044321e-07	179696436	179702660
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179702660	179768817	40	37	0.4691	3.28621912044321e-07	179696436	179702660	3.38450746867114e-74	179760885	179782292
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179770842	191607619	3649	3507	0.116	3.38450746867114e-74	179760885	179782292	1.00827413253867e-163	191580542	191648604
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	191625980	193785778	331	323	-0.2885	1.00827413253867e-163	191580542	191648604	2.09747924188191e-117	193734333	193832245
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	193790819	209884304	6117	5904	0.0373	2.09747924188191e-117	193734333	193832245	4.09182386406223e-46	209882754	209893858
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	209889240	209980681	33	31	-0.6117	4.09182386406223e-46	209882754	209893858	7.40518011934564e-45	209971559	209982948
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	209982948	211070042	432	412	0.0387	7.40518011934564e-45	209971559	209982948	5.13376334132078e-07	211067168	211070042
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211072658	211079988	3	3	0.8362	5.13376334132078e-07	211067168	211070042	3.29571113175021e-07	211079988	211082419
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211082419	227875096	5882	5664	0.0225	3.29571113175021e-07	211079988	211082419	5.82004943383629e-17	227875096	227875096
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-1.0335	5.82004943383629e-17	227875096	227875096	9.02137962667265e-17	227882805	227882805
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246429285	7253	7015	0.0129	9.02137962667265e-17	227882805	227882805	1.76199348934315e-21	246402630	246445611
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246430621	246628657	74	72	0.2919	1.76199348934315e-21	246402630	246445611	9.76142320484388e-09	246617245	246639998
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246630400	246630400	1	0	NA	9.76142320484388e-09	246617245	246639998	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246632140	246751473	23	22	-0.0252	NA	NA	NA	4.58790759482184e-11	246738832	246769018
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246875016	34	32	0.3876	4.58790759482184e-11	246738832	246769018	1.18813755187130e-10	246858820	246911251
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	94	0.0191	1.1881375518713e-10	246858820	246911251	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20229868	5875	5688	0.0436	NA	NA	NA	6.24157618976115e-05	20219338	20237659
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20231737	20241942	6	6	-0.4304	6.24157618976115e-05	20219338	20237659	1.44941314022992e-05	20234103	20249893
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20243779	22526609	624	596	0.0523	1.44941314022992e-05	20234103	20249893	1.36921929646439e-07	22510236	22536406
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	22532251	22572052	9	9	-0.4049	1.36921929646439e-07	22510236	22536406	1.16714506534303e-06	22565428	22598366
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	22581432	33076512	4362	4209	0.0739	1.16714506534303e-06	22565428	22598366	3.05031551903639e-08	33076512	33076512
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.1942	3.05031551903639e-08	33076512	33076512	5.52101089149126e-10	33080437	33080437
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	35821494	1146	1105	0.0459	5.52101089149126e-10	33080437	33080437	5.02689127101315e-11	35821494	35821494
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.1777	5.02689127101315e-11	35821494	35821494	1.48906593037073e-11	35844884	35844884
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	59967130	8977	8691	0.0645	1.48906593037073e-11	35844884	35844884	1.6247024263532e-15	59960414	59967130
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	59972869	59972869	1	0	NA	1.6247024263532e-15	59960414	59967130	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	59976177	60016773	9	9	-0.6079	NA	NA	NA	1.24054792338383e-16	60016773	60023207
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	60023207	64042726	1452	1397	0.0822	1.24054792338383e-16	60016773	60023207	4.88116147345041e-17	64032915	64052723
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	64044379	64135401	33	32	-0.2932	4.88116147345041e-17	64032915	64052723	8.8361363678318e-15	64113837	64167091
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	64140427	66038336	723	697	0.0615	8.8361363678318e-15	64113837	64167091	1.82380616411255e-11	66032733	66038336
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.9356	1.82380616411255e-11	66032733	66038336	2.08957635615754e-10	66049853	66055464
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	105954995	10596	10236	0.0519	2.08957635615754e-10	66049853	66055464	9.95987514690394e-59	105948122	105971471
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	105971471	106065211	26	26	-0.7235	9.95987514690394e-59	105948122	105971471	2.81705040647634e-55	106060946	106066711
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106066711	132210342	6499	6291	0.0234	2.81705040647634e-55	106060946	106066711	8.96379442564388e-17	132055046	132389588
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132227025	132227025	1	0	NA	8.96379442564388e-17	132055046	132389588	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132366131	132820205	31	31	-0.3589	NA	NA	NA	4.97208111656638e-16	132793108	132850403
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132823716	146571330	4697	4546	0.003	4.97208111656638e-16	132793108	132850403	0	146571330	146571330
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-6.1574	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	10790	0.0212	0	146592775	146592775	3.72153307173663e-12	179764819	179767214
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.0351	3.72153307173663e-12	179764819	179767214	4.28413158159045e-12	179778919	179778919
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	197880750	5252	5067	0.0266	4.28413158159045e-12	179778919	179778919	8.832924555224e-08	197878172	197880750
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197883024	197884226	2	2	1.0299	8.832924555224e-08	197878172	197880750	5.68515459507179e-08	197884226	197885450
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197885450	208057199	3853	3712	0.022	5.68515459507179e-08	197884226	197885450	2.54745618506166e-11	208057199	208057199
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-1.1681	2.54745618506166e-11	208057199	208057199	5.8510087883497e-10	208066245	208066245
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	239848888	11402	11021	0.0337	5.8510087883497e-10	208066245	208066245	1.74062224617934e-237	239836459	239879193
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239851031	242689978	1031	999	-0.2341	1.74062224617934e-237	239836459	239879193	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	9719037	3348	3239	0.0502	NA	NA	NA	4.80908582616627e-09	9719037	9719037
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9720244	9722646	2	2	1.0986	4.80908582616627e-09	9719037	9719037	6.3041367261907e-08	9722646	9728245
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9728245	32074432	7446	7217	0.0659	6.3041367261907e-08	9722646	9728245	8.5363981522332e-67	32074432	32074432
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.825	8.5363981522332e-67	32074432	32074432	3.91769673250449e-63	32080848	32080848
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32674239	242	230	0.0873	3.91769673250449e-63	32080848	32080848	1.75145980410105e-13	32633417	32692951
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32679694	32742172	28	28	-0.2925	1.75145980410105e-13	32633417	32692951	2.02491110015134e-24	32734632	32753867
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32743957	75474341	15807	15263	0.0595	2.02491110015134e-24	32734632	32753867	1.56098968094449e-27	75325502	75862566
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75479859	76080028	41	39	-0.1848	1.56098968094449e-27	75325502	75862566	1.15046239285014e-07	76042344	76099337
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76081578	77114662	411	400	0.05	1.15046239285014e-07	76042344	76099337	0	77109146	77118268
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77116909	77116909	1	0	NA	0	77109146	77118268	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77118268	82622792	1626	1572	0.6639	NA	NA	NA	0	82592704	82658500
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	82636509	89747986	1788	1718	0.2964	0	82592704	82658500	2.66248697764775e-12	89747986	89747986
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89754033	89757490	2	2	-0.901	2.66248697764775e-12	89747986	89747986	0	89757490	89757490
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89768924	164005577	22747	21937	0.368	0	89757490	89757490	0	164005577	164005577
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.8851	0	164005577	164005577	1.96601958465684e-109	164023502	164027724
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	198038358	11613	11198	0.5076	1.96601958465684e-109	164023502	164027724	1.15154526073861e-09	198038358	198038358
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.6469	1.15154526073861e-09	198038358	198038358	1.36801515561032e-08	198042681	198044259
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199329592	521	505	0.5112	1.36801515561032e-08	198042681	198044259	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3290	0.0803	NA	NA	NA	9.26750658512003e-235	9815760	9815760
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.1692	9.26750658512003e-235	9815760	9815760	7.34821453726815e-277	9842644	9842644
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	12591856	550	532	0.0211	7.34821453726815e-277	9842644	9842644	1.31056326840256e-11	12585385	12600973
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	12600973	12634411	5	5	-0.7601	1.31056326840256e-11	12585385	12600973	3.11338067298773e-12	12622132	12646913
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	12646913	20314044	2264	2179	0.0309	3.11338067298773e-12	12622132	12646913	0	20296253	20335461
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20315370	37671414	4180	4058	0.2808	0	20296253	20335461	2.86610213563790e-11	37665928	37671414
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	37673397	37689964	10	10	-0.249	2.8661021356379e-11	37665928	37671414	4.04051480310628e-11	37689964	37695234
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	37692021	42564318	1955	1875	0.3021	4.04051480310628e-11	37689964	37695234	0	42553239	42570860
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	42568273	52395837	1917	1871	-0.2626	0	42553239	42570860	7.50809799490019e-154	52380712	52413358
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52398004	53952669	564	541	0.0332	7.50809799490019e-154	52380712	52413358	6.45951921619507e-105	53931259	53977002
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53956074	58676537	1485	1417	0.2927	6.45951921619507e-105	53931259	53977002	1.80467652527613e-115	58592365	58755877
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	58681897	62406299	686	667	0.0472	1.80467652527613e-115	58592365	58755877	1.52160192349717e-268	62397584	62416676
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	62408717	72115650	2166	2087	0.4166	1.52160192349717e-268	62397584	62416676	0	72112414	72144779
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	72136741	77866075	1885	1807	1.0084	0	72112414	72144779	0	77862061	77867350
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	77867350	85297841	2647	2562	0.2817	0	77862061	77867350	1.45700446647798e-08	85237023	85321322
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	85300904	85423207	43	40	0.0421	1.45700446647798e-08	85237023	85321322	1.01161965434464e-09	85409928	85507647
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	85425698	101122665	5507	5333	0.2877	1.01161965434464e-09	85409928	85507647	0	101122665	101122665
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	101125963	127501052	7753	7521	-0.6459	0	101122665	101122665	0	127478905	127516044
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	127510786	142877541	3406	3283	-0.0942	0	127478905	127516044	0	142856414	142910912
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	142883131	173224400	9220	8903	0.1641	0	142856414	142910912	2.51944052820378e-36	173224400	173224400
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	2.2896	2.51944052820378e-36	173224400	173224400	1.12683244302276e-37	173228860	173228860
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	176860040	1174	1113	0.1648	1.12683244302276e-37	173228860	173228860	1.53606403549515e-06	176858614	176860040
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	176862886	176864047	2	2	-0.745	1.53606403549515e-06	176858614	176860040	2.07846285905254e-06	176864047	176865957
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	176865957	186676034	2792	2696	0.1525	2.07846285905254e-06	176864047	176865957	4.07208669869313e-14	186676034	186676034
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	1.4577	4.07208669869313e-14	186676034	186676034	9.03279348338448e-14	186680176	186680176
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	296	0.1348	9.03279348338448e-14	186680176	186680176	2.49320003520458e-07	187329037	187330240
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-0.8388	2.49320003520458e-07	187329037	187330240	1.50912696154086e-07	187333619	187335827
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190421503	1048	1010	0.1344	1.50912696154086e-07	187333619	187335827	1.59614754080997e-24	190421503	190425991
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190424374	190437365	5	5	-0.9334	1.59614754080997e-24	190421503	190425991	1.48928280917105e-15	190431567	190437365
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190439544	190752920	84	84	0.0625	1.48928280917105e-15	190431567	190437365	3.65974049219719e-20	190725579	190761029
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190754887	190921041	59	54	-0.3013	3.65974049219719e-20	190725579	190761029	3.63667963013589e-21	190915643	190927969
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191020124	31	30	0.1693	3.63667963013589e-21	190915643	190927969	0.000213902902536812	191000504	191037553
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191021815	191153613	14	13	-0.1617	0.000213902902536812	191000504	191037553	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	17890588	5550	5353	0.2824	NA	NA	NA	0	17882720	17897087
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17894384	20453474	614	595	-0.2571	0	17882720	17897087	8.94750067007434e-39	20427994	20477332
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20456934	20969714	111	108	0.0684	8.94750067007434e-39	20427994	20477332	6.50317700942579e-15	20926992	20989196
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20974560	21305155	56	55	-0.2499	6.50317700942579e-15	20926992	20989196	1.50672716947255e-21	21291420	21428366
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21415212	21490654	25	23	0.1789	1.50672716947255e-21	21291420	21428366	3.07861963290052e-07	21475818	21493505
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21493505	21600853	15	15	-0.1108	3.07861963290052e-07	21475818	21493505	1.61776589100761e-117	21598643	21616990
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21606184	46150784	6756	6537	0.3191	1.61776589100761e-117	21598643	21616990	0	46008694	49606346
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	49595677	61496737	3651	3527	-0.2555	0	46008694	49606346	1.11988123540436e-28	61491834	61496737
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	61508397	61605861	10	9	-1.16	1.11988123540436e-28	61491834	61496737	1.29829175850862e-31	61605861	61608861
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	61608861	106905126	12617	12189	-0.2502	1.29829175850862e-31	61605861	61608861	0	106899724	106914356
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	106908486	112329287	1819	1765	-0.6474	0	106899724	106914356	0	112326239	112333541
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112333541	150156233	12624	12189	0.055	0	112326239	112333541	1.77493490847100e-09	150156233	150156233
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150161037	2	2	-1.0862	1.774934908471e-09	150156233	150156233	1.29146020308268e-14	150161037	150161037
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150162435	150181399	4	4	0.1278	1.29146020308268e-14	150161037	150161037	1.36410353015770e-12	150181399	150181399
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.9766	1.3641035301577e-12	150181399	150181399	5.50445304578237e-28	150202601	150202601
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	152245510	681	664	0.0506	5.50445304578237e-28	150202601	150202601	1.26500909496965e-16	152243757	152245510
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	152252256	152272756	7	7	-0.7415	1.26500909496965e-16	152243757	152245510	7.74430983942367e-17	152272756	152279659
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	152279659	176392626	7620	7365	0.0496	7.74430983942367e-17	152272756	152279659	3.79213063252735e-29	176374446	176401314
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176394507	176553757	76	73	0.371	3.79213063252735e-29	176374446	176401314	7.44978968878404e-16	176538677	176591820
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176554976	180192214	1399	1356	0.0947	7.44978968878404e-16	176538677	176591820	4.94823935341981e-10	180186425	180194323
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180194323	180364670	12	12	-0.4415	4.94823935341981e-10	180186425	180194323	1.99776061133863e-12	180362342	180365977
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180365950	180644810	110	103	0.1077	1.99776061133863e-12	180362342	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	37	0.0752	NA	NA	NA	7.32696668943885e-06	176670	211079
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	241674	17	15	-0.2375	7.32696668943885e-06	176670	211079	4.61378164627792e-08	240119	251128
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	326323	44	42	-0.6668	4.61378164627792e-08	240119	251128	6.54064660059345e-82	322557	327962
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10118	0.0353	6.54064660059345e-82	322557	327962	4.46308454884155e-29	29941766	29966336
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-0.6699	4.46308454884155e-29	29941766	29966336	2.13202169470863e-23	30004636	30021908
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32558677	1075	1039	0.0461	2.13202169470863e-23	30004636	30021908	2.79537901489339e-124	32558677	32567462
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.2691	2.79537901489339e-124	32558677	32567462	2.90064861248915e-17	32593151	32600962
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	35	-0.0304	2.90064861248915e-17	32593151	32600962	3.70245796546026e-06	32707427	32723366
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-0.794	3.70245796546026e-06	32707427	32723366	4.45973305904853e-12	32721872	32731072
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	33025912	127	122	0.0176	4.45973305904853e-12	32721872	32731072	3.24001245026616e-25	32988165	33049704
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33028018	54035000	8132	7866	-0.2221	3.24001245026616e-25	32988165	33049704	1.10334834560329e-13	54035000	54035000
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	0.9053	1.10334834560329e-13	54035000	54035000	1.69905619616819e-10	54042734	54045472
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	54603757	207	201	-0.1972	1.69905619616819e-10	54042734	54045472	2.95554025600965e-15	54570513	54641009
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54607030	54996685	113	109	0.0627	2.95554025600965e-15	54570513	54641009	8.66635871933831e-69	54987839	55007322
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55007322	55195727	45	44	0.8155	8.66635871933831e-69	54987839	55007322	1.44661343217714e-181	55186109	55195727
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55198655	80069504	6308	6090	-0.2265	1.44661343217714e-181	55186109	55195727	6.02578614089166e-95	80069504	80069504
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	80071156	80107358	14	14	-1.3096	6.02578614089166e-95	80069504	80069504	1.79282784224928e-66	80107358	80107358
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	80109337	84886867	1356	1315	-0.2469	1.79282784224928e-66	80107358	80107358	8.18368974427778e-09	84845983	84902547
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	84891242	84891242	1	0	NA	8.18368974427778e-09	84845983	84902547	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	84893090	84951646	27	25	0.0496	NA	NA	NA	3.88358978160513e-09	84938056	84970276
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	84953854	84953854	1	0	NA	3.88358978160513e-09	84938056	84970276	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	84957522	100036533	4042	3912	-0.25	NA	NA	NA	0	100032842	100037707
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100037707	114251877	4656	4507	0.4358	0	100032842	100037707	0	114244779	114256748
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	114254398	139643729	8821	8511	-0.0861	0	114244779	114256748	6.12763155431843e-08	139641158	139643729
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	0.739	6.12763155431843e-08	139641158	139643729	3.44071362274583e-97	139648318	139651247
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8409	-0.1469	3.44071362274583e-97	139648318	139651247	1.59598238278488e-100	165643653	165643653
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-1.3665	1.59598238278488e-100	165643653	165643653	1.82677797624366e-18	165650610	165650610
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1729	-0.256	1.82677797624366e-18	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	2893414	964	931	-0.1813	NA	NA	NA	9.58166660387372e-13	2888562	2898567
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	2898567	2905404	5	5	-1.1176	9.58166660387372e-13	2888562	2898567	1.81006830386058e-14	2903503	2908133
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	2908133	14429866	3765	3646	-0.2375	1.81006830386058e-14	2903503	2908133	0	14424626	14436351
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	14431308	37965546	8788	8469	-0.6514	0	14424626	14436351	0	37941757	38011946
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	37967235	66920923	6546	6324	-0.4115	0	37941757	38011946	0	66889826	66963983
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	66926319	100164752	10994	10631	-0.0798	0	66889826	66963983	6.2218161397658e-08	100160244	100166257
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.8216	6.2218161397658e-08	100160244	100166257	1.03609940962776e-07	100171204	100181104
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	100178968	1	0	NA	1.03609940962776e-07	100171204	100181104	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100181104	109217320	3894	3783	-0.083	NA	NA	NA	8.51111558128929e-09	109216032	109217320
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-0.9897	8.51111558128929e-09	109216032	109217320	4.38540276160024e-08	109233214	109236813
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109967918	303	291	-0.08	4.38540276160024e-08	109233214	109236813	5.43329115097399e-215	109967918	109967918
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-5.7359	5.43329115097399e-215	109967918	109967918	5.15221455941276e-260	109974402	109974402
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3874	-0.0736	5.15221455941276e-260	109974402	109974402	4.66592779098592e-31	118611324	118611324
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.5403	4.66592779098592e-31	118611324	118611324	1.75815706927396e-28	118620875	118620875
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	119644768	387	377	-0.0669	1.75815706927396e-28	118620875	118620875	7.08908522548748e-14	119644768	119644768
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	119646295	119648614	2	2	-1.4451	7.08908522548748e-14	119644768	119644768	5.19296474303735e-14	119648614	119648614
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	119652835	125831554	2781	2692	-0.0819	5.19296474303735e-14	119648614	119648614	1.84075862706641e-24	125831554	125831554
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3776	1.84075862706641e-24	125831554	125831554	9.05379206121307e-23	125837524	125837524
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3525	-0.0734	9.05379206121307e-23	125837524	125837524	1.76758942301233e-24	133432281	133433384
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8472	1.76758942301233e-24	133432281	133433384	1.58498109620923e-26	133448277	133453811
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	135181436	822	800	-0.0676	1.58498109620923e-26	133448277	133453811	7.81105472650428e-53	135176191	135181436
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	135190300	135190300	1	0	NA	7.81105472650428e-53	135176191	135181436	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	135191763	135267438	34	30	-0.7377	NA	NA	NA	1.10732134057982e-05	135253804	135271939
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	135270005	135288335	11	11	-1.0504	1.10732134057982e-05	135253804	135271939	5.93117765688472e-38	135288335	135289706
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	135289706	140315273	2323	2226	-0.0713	5.93117765688472e-38	135288335	135289706	6.00354052197083e-173	140307979	140321347
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140318069	140752847	210	198	-0.5797	6.00354052197083e-173	140307979	140321347	3.57739268886244e-129	140748936	140758609
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140755886	140755886	1	0	NA	3.57739268886244e-129	140748936	140758609	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140756995	141413352	299	288	-0.0738	NA	NA	NA	6.83658324127556e-18	141409512	141417702
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141440184	13	13	0.5034	6.83658324127556e-18	141409512	141417702	1.41902514344972e-15	141435643	141443577
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	156483966	5821	5620	-0.0736	1.41902514344972e-15	141435643	141443577	3.85030660232559e-12	156480019	156485711
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	3	0.9917	3.85030660232559e-12	156480019	156485711	1.49919288832065e-09	156488598	156492262
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1030	-0.0481	1.49919288832065e-09	156488598	156492262	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.2665	NA	NA	NA	3.60923430876913e-106	581533	581533
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.947	3.60923430876913e-106	581533	581533	1.20645463986016e-103	588865	588865
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	11398262	3675	3543	-0.2537	1.20645463986016e-103	588865	588865	4.90497548589129e-21	11385175	11407249
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	11400091	11495702	44	43	-0.6191	4.90497548589129e-21	11385175	11407249	7.43107671555436e-24	11483153	11510263
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	11498132	16304869	1455	1412	-0.2475	7.43107671555436e-24	11483153	11510263	6.34969594159816e-31	16304869	16304869
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16309306	16315130	2	2	-2.1675	6.34969594159816e-31	16304869	16304869	1.13687287465589e-27	16315130	16315130
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16373516	25120552	2862	2756	-0.2282	1.13687287465589e-27	16315130	16315130	7.80840258191569e-10	25120552	25120552
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	7.80840258191569e-10	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.4051	NA	NA	NA	3.35405814815074e-09	25125700	25127887
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25463846	163	158	-0.2557	3.35405814815074e-09	25125700	25127887	1.24300408210231e-20	25463846	25463846
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25470598	3	3	-1.6697	1.24300408210231e-20	25463846	25463846	1.72089536291574e-23	25470598	25470598
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25472648	39350798	4746	4584	-0.2356	1.72089536291574e-23	25470598	25470598	8.33310637716804e-186	39345557	39352361
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.6988	8.33310637716804e-186	39345557	39352361	1.40897079253467e-119	39504332	39508035
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	39767514	99	97	-0.2119	1.40897079253467e-119	39504332	39508035	1.63028616775746e-89	39761395	39771578
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39769357	51416055	2164	2099	0.3017	1.63028616775746e-89	39761395	39771578	5.06080283597502e-185	51380884	51441247
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51418826	55320869	1184	1135	0.0449	5.06080283597502e-185	51380884	51441247	2.81812500947186e-207	55264213	55384396
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	55332976	59333285	1162	1121	-0.2576	2.81812500947186e-207	55264213	55384396	0	59317443	59344895
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	59337526	68763690	2886	2784	0.2947	0	59317443	59344895	0	68747569	68785903
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68766653	68768157	2	0	NA	0	68747569	68785903	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68772407	87787508	5402	5214	-0.0174	NA	NA	NA	0	87783450	87790679
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87790679	108380136	6964	6750	0.8067	0	87783450	87790679	0	108355800	108399726
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	108381929	138981192	8917	8602	1.0544	0	108355800	108399726	0	138978739	138986584
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	138983039	138983039	1	0	NA	0	138978739	138986584	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	138986584	146264846	2652	2566	0.2172	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2377	-0.2598	NA	NA	NA	7.61847875225457e-09	6681606	6692831
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-1.0976	7.61847875225457e-09	6681606	6692831	5.29461241951784e-09	6695783	6701392
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	15802255	2984	2877	-0.2523	5.29461241951784e-09	6695783	6701392	4.19620258677661e-23	15802255	15802255
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.8923	4.19620258677661e-23	15802255	15802255	2.71773640015368e-20	15807123	15807123
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70217543	7300	7063	-0.2507	2.71773640015368e-20	15807123	15807123	6.17597252834563e-116	67942846	70229901
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70221479	70926188	312	300	0.0706	6.17597252834563e-116	67942846	70229901	3.33997311299201e-27	70926188	70926188
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.9146	3.33997311299201e-27	70926188	70926188	7.15111702670078e-28	70930528	70930528
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	85337130	4763	4609	0.0358	7.15111702670078e-28	70930528	70930528	5.85923140955667e-149	85315909	85368631
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85338663	87344320	684	652	0.2932	5.85923140955667e-149	85315909	85368631	8.62331339353498e-17	87337232	87346132
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	87346132	87381207	19	18	-0.2427	8.62331339353498e-17	87337232	87346132	1.10670819424192e-19	87379386	87385536
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	87383621	89762204	786	758	0.2957	1.10670819424192e-19	87379386	87385536	1.93769561163150e-163	89714096	89776271
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89764155	91286222	493	473	0.6835	1.9376956116315e-163	89714096	89776271	0	91283355	91287627
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	91287627	95631150	1396	1354	-0.2547	0	91283355	91287627	1.07627725986528e-247	95571559	95724805
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	95654032	100348045	1778	1728	0.0451	1.07627725986528e-247	95571559	95724805	2.63825496120577e-30	100348045	100348045
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.0609	2.63825496120577e-30	100348045	100348045	2.78133047859225e-28	100350814	100350814
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	101332028	381	370	0.044	2.78133047859225e-28	100350814	100350814	1.36705510749469e-09	101288679	101342684
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	101342684	101424478	20	19	-0.3283	1.36705510749469e-09	101288679	101342684	3.19053592033509e-09	101421188	101439642
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	101426404	111992181	3419	3310	0.0265	3.19053592033509e-09	101421188	101439642	1.52282462504406e-83	111990340	111996172
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	111994926	112109524	52	49	-0.6259	1.52282462504406e-83	111990340	111996172	8.84439003096558e-83	112102811	112116924
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112116924	116124007	1675	1611	0.0522	8.84439003096558e-83	112102811	112116924	5.37938304913363e-10	116124007	116124007
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1196	5.37938304913363e-10	116124007	116124007	7.46885252822697e-09	116130333	116130333
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	123451454	2435	2355	0.0013	7.46885252822697e-09	116130333	116130333	1.72203105942505e-16	123451454	123451454
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123453227	123455396	2	2	1.5138	1.72203105942505e-16	123451454	123451454	2.29439041570743e-13	123455396	123455396
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123458013	137352394	5858	5646	0.0709	2.29439041570743e-13	123455396	123455396	1.29010323429048e-21	137352394	137352394
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.8889	1.29010323429048e-21	137352394	137352394	5.90833072130244e-17	137356880	137356880
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1058	0.1034	5.90833072130244e-17	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	409266	129	124	0.0404	NA	NA	NA	7.93837167816727e-158	406592	410578
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	410578	746824	153	147	0.9127	7.93837167816727e-158	406592	410578	1.47259761296194e-05	724432	774846
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	749265	822180	22	21	1.2178	1.47259761296194e-05	724432	774846	6.09597510657199e-06	781616	850414
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	824582	2619231	677	655	0.9215	6.09597510657199e-06	781616	850414	2.61396114899091e-86	2619231	2619231
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	2625606	2676386	15	14	-0.3949	2.61396114899091e-86	2619231	2619231	7.18690180704641e-74	2676386	2676386
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	2680928	11299346	2731	2648	0.7878	7.18690180704641e-74	2676386	2676386	0	11287793	11316105
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	11302600	11302600	1	0	NA	0	11287793	11316105	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	11306576	15479464	1862	1801	0.4525	NA	NA	NA	1.75307848899165e-72	15446129	15567230
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	15488253	16958873	484	465	0.6845	1.75307848899165e-72	15446129	15567230	3.2459073163478e-135	16948191	16979944
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	16963166	31284926	5218	5044	0.3932	3.2459073163478e-135	16948191	16979944	0	31284926	31284926
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-6.2326	0	31284926	31284926	0	31291525	31291525
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	45489823	3162	3049	0.3477	0	31291525	31291525	9.7989277369981e-119	45478103	46384985
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47021415	74	73	-0.3186	9.7989277369981e-119	45478103	46384985	3.1159708916151e-122	46568496	47040444
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47040444	76051456	9208	8901	0.3434	3.1159708916151e-122	46568496	47040444	1.73256035673855e-58	76043357	76053112
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76053112	76134222	37	36	-0.3089	1.73256035673855e-58	76043357	76053112	1.20551131983644e-57	76129083	76138938
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76135755	76135755	1	0	NA	1.20551131983644e-57	76129083	76138938	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76138938	77917893	815	781	0.3236	NA	NA	NA	1.48686755919940e-144	77917893	77917893
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.1587	1.4868675591994e-144	77917893	77917893	3.90394109875352e-141	77928738	77928738
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	79168029	488	473	0.2757	3.90394109875352e-141	77928738	77928738	6.95412899307566e-09	79168004	79168029
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	79172691	79178985	4	4	-0.4577	6.95412899307566e-09	79168004	79168029	7.76510038546575e-15	79178985	79191486
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	79191486	127563278	17003	16462	0.3409	7.76510038546575e-15	79178985	79191486	7.57563928678405e-17	127560827	127566573
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	10	-0.3496	7.57563928678405e-17	127560827	127566573	1.61592106171459e-20	127584239	127592138
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	128368823	337	319	0.3529	1.61592106171459e-20	127584239	127592138	7.31272595140647e-43	128364930	128376888
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128373812	128465372	31	30	-0.2561	7.31272595140647e-43	128364930	128376888	4.89139117661988e-35	128461042	128474408
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128467480	132168122	1217	1170	0.3346	4.89139117661988e-35	128461042	128474408	6.22283223706438e-31	132162458	132172434
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132172434	132234723	23	23	-0.1443	6.22283223706438e-31	132162458	132172434	9.00177768596873e-07	132219483	132257748
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132237381	132797428	162	157	0.1467	9.00177768596873e-07	132219483	132257748	7.30996458713315e-10	132787561	132797428
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	1.2838	7.30996458713315e-10	132787561	132797428	3.44985742789762e-06	132801463	132802775
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	909	0.1918	3.44985742789762e-06	132801463	132802775	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	2020604	741	723	-0.1361	NA	NA	NA	3.03203281180179e-05	2002328	2020604
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2022931	2043108	7	7	-0.6968	3.03203281180179e-05	2002328	2020604	8.88878837611964e-05	2043108	2070199
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2048826	4923300	1024	991	-0.2216	8.88878837611964e-05	2043108	2070199	1.29636875880829e-313	4923300	4923300
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.6195	1.29636875880829e-313	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	20536942	6264	6054	-0.2467	0	4932214	4932214	9.33120902980873e-16	20512536	20559637
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20544188	20597114	24	22	-0.6911	9.33120902980873e-16	20512536	20559637	2.07445155939196e-16	20594322	20602889
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20599618	48959014	8501	8236	-0.245	2.07445155939196e-16	20594322	20602889	2.20556543608520e-10	48953963	48959014
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48986600	49001848	4	4	0.596	2.2055654360852e-10	48953963	48959014	6.66048168952132e-10	49001848	49032039
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49032039	49186869	37	36	-0.0902	6.66048168952132e-10	49001848	49032039	2.24830866191631e-15	49179852	49222824
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49189482	55118214	298	290	0.2808	2.24830866191631e-15	49179852	49222824	1.08200763483277e-19	55097753	55124730
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	31	-0.1811	1.08200763483277e-19	55097753	55124730	1.78531151875052e-24	55194990	55203706
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	73291280	7147	6933	0.3197	1.78531151875052e-24	55194990	55203706	3.8355122741421e-37	73279783	73295908
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73293318	73446006	70	70	0.7293	3.8355122741421e-37	73279783	73295908	9.39523984672193e-39	73439290	73458208
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	73448283	77282771	1586	1531	0.3233	9.39523984672193e-39	73439290	73458208	6.67216473523368e-07	77267863	77295422
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	77284783	77330898	11	11	-0.1143	6.67216473523368e-07	77267863	77295422	3.51487371033418e-95	77301533	77356918
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	77343676	119381146	13827	13328	0.332	3.51487371033418e-95	77301533	77356918	0	119361422	119392244
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	119392244	120994783	695	680	-0.2434	0	119361422	119392244	1.21205030147783e-11	120985943	120996469
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	120996469	121042811	18	18	-0.6606	1.21205030147783e-11	120985943	120996469	3.05058101781005e-11	121036501	121078305
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121046775	122197455	390	374	-0.2504	3.05058101781005e-11	121036501	121078305	2.52579207280673e-22	122183026	122213036
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	122209332	122330350	60	58	0.0904	2.52579207280673e-22	122183026	122213036	7.19269219528864e-26	122322185	122342484
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	122331673	122331673	1	0	NA	7.19269219528864e-26	122322185	122342484	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	122333266	134443483	4560	4419	-0.2597	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134450318	134450318	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3636	0.4781	NA	NA	NA	2.83988015126267e-103	9523923	9531133
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9607363	15	15	1.8977	2.83988015126267e-103	9523923	9531133	2.39813935934497e-100	9599999	9607363
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11104973	568	543	0.4922	2.39813935934497e-100	9599999	9607363	1.66448493521597e-31	11104085	11110735
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	10	1.4085	1.66448493521597e-31	11104085	11110735	8.16603109042977e-17	11126558	11143592
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11393473	69	63	0.5193	8.16603109042977e-17	11126558	11143592	2.94558679101442e-06	11385262	11395862
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11395862	11435643	7	7	-0.0559	2.94558679101442e-06	11385262	11395862	2.45244838529419e-07	11433210	11466807
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	28480961	6042	5848	0.4789	2.45244838529419e-07	11433210	11466807	1.69508477103158e-26	28472405	28486517
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28483247	28554165	32	31	0.0088	1.69508477103158e-26	28472405	28486517	1.06168577986225e-23	28548481	28560170
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28556179	31132762	669	648	0.4622	1.06168577986225e-23	28548481	28560170	1.60188587429835e-18	31098259	31171313
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	16	1.011	1.60188587429835e-18	31098259	31171313	8.81791775789379e-15	31231952	31246624
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	37130808	1055	1014	0.4899	8.81791775789379e-15	31231952	31246624	3.59425570698285e-140	37091903	37158920
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	37137828	38118860	265	261	0.9203	3.59425570698285e-140	37091903	37158920	6.06643724091052e-15	38099888	38157813
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	38121632	38320569	60	60	0.6387	6.06643724091052e-15	38099888	38157813	9.7973898795256e-31	38310810	38326571
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	38322673	38675659	145	137	1.0892	9.7973898795256e-31	38310810	38326571	1.88593400732277e-95	38670922	38685502
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	38680393	42031809	1086	1056	0.6603	1.88593400732277e-95	38670922	38685502	0	42031809	42031809
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	42034204	43673623	624	606	-0.2424	0	42031809	42031809	0	43668333	43680218
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	43680218	45440208	563	549	0.4473	0	43668333	43680218	3.77232571067092e-82	45400753	45456903
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	45443687	46992235	513	497	0.7318	3.77232571067092e-82	45400753	45456903	1.29523053579967e-177	46992235	46992235
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-4.1822	1.29523053579967e-177	46992235	46992235	5.17200024532352e-208	46996769	46996769
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	47242183	75	73	0.6881	5.17200024532352e-208	46996769	46996769	4.56601143065313e-16	47218969	47306638
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47243326	58161513	4499	4348	0.4268	4.56601143065313e-16	47218969	47306638	1.29178654193119e-42	58138177	58177456
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	58168183	58425288	82	79	0.0221	1.29178654193119e-42	58138177	58177456	7.21513828794722e-52	58416429	58438612
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	58426453	82491854	7677	7413	0.4322	7.21513828794722e-52	58416429	58438612	0	82456378	82520577
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	82501989	112972426	10345	10014	0.0525	0	82456378	82520577	0	112917744	113026052
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112985843	130943064	6446	6212	-0.2271	0	112917744	113026052	1.87114063082830e-38	130943064	130943064
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.0946	1.8711406308283e-38	130943064	130943064	9.06592334026482e-37	130946248	130946248
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	533	-0.1966	9.06592334026482e-37	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18843779	184	179	0.3017	NA	NA	NA	0.000926481687182876	18820675	18864923
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18846451	18988055	11	11	-0.0721	0.000926481687182876	18820675	18864923	4.03407657834669e-08	18857237	19026155
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18998989	20435485	563	547	0.4028	4.03407657834669e-08	18857237	19026155	1.19435743391301e-07	20426627	20435485
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	20437323	20455414	9	9	-0.0952	1.19435743391301e-07	20426627	20435485	7.17472992583445e-06	20450490	20526224
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	20456454	25106567	1662	1623	0.1461	7.17472992583445e-06	20450490	20526224	3.10588735160232e-29	25097381	25108742
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	25108716	25196871	40	40	-0.291	3.10588735160232e-29	25097381	25108742	6.9283236745774e-19	25186961	25205093
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	25198162	50674617	10044	9699	0.0558	6.9283236745774e-19	25186961	25205093	2.73269267665977e-103	50650706	50701140
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50678998	51539349	415	401	0.3134	2.73269267665977e-103	50650706	50701140	0	51533915	51542883
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51542883	68136198	3804	3684	-0.275	0	51533915	51542883	5.8006107667574e-09	68130387	68136198
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68138912	68138912	1	0	NA	5.8006107667574e-09	68130387	68136198	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68142120	68167758	12	10	0.1969	NA	NA	NA	1.15770388142827e-09	68167758	68169957
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68168882	71320282	891	863	-0.2622	1.15770388142827e-09	68167758	68169957	1.36865445052871e-10	71309631	71320282
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71322115	71356133	19	18	-0.6201	1.36865445052871e-10	71309631	71320282	2.40254410625421e-05	71353901	71368140
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71360451	71375082	8	8	-0.2777	2.40254410625421e-05	71353901	71368140	9.01126064719446e-130	71375082	71375082
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-5.0356	9.01126064719446e-130	71375082	71375082	6.97916268453122e-200	71377671	71377671
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89042262	4473	4337	-0.2662	6.97916268453122e-200	71377671	71377671	2.75495168792274e-68	88974574	89087324
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89049240	89659397	155	152	0.06	2.75495168792274e-68	88974574	89087324	1.96965228131628e-193	89659397	89659397
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.5943	1.96965228131628e-193	89659397	89659397	3.59236866763205e-190	89662326	89662326
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	91061235	421	409	0.0485	3.59236866763205e-190	89662326	89662326	6.83422333421269e-45	91047822	91071838
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	91062281	91062281	1	0	NA	6.8342233342127e-45	91047822	91071838	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	91063797	91371655	150	149	-0.263	NA	NA	NA	1.05928573696666e-57	91354055	91382119
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	91373053	100690991	4213	4080	0.0537	1.05928573696666e-57	91354055	91382119	2.54889958907591e-279	100690991	100690991
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.8166	2.54889958907591e-279	100690991	100690991	3.40297816019223e-279	100693892	100693892
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	102648467	884	850	0.032	3.40297816019223e-279	100693892	100693892	9.18831095444691e-187	102603913	102697696
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	102651758	113787620	3525	3401	-0.2385	9.18831095444691e-187	102603913	102697696	3.13460199409853e-23	113787620	113787620
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113788788	113788788	1	0	NA	3.13460199409853e-23	113787620	113787620	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	1.036	NA	NA	NA	2.17313388796211e-13	113794669	113797828
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	143	-0.1678	2.17313388796211e-13	113794669	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.9406	NA	NA	NA	6.17314440445238e-81	19492531	19497023
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20015441	254	247	-0.2366	6.17314440445238e-81	19492531	19497023	7.41622088115743e-63	20003370	20028610
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20017479	21270813	617	603	0.0708	7.41622088115743e-63	20003370	20028610	3.45860025912294e-15	21252826	21288715
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21272850	21425829	72	69	-0.1815	3.45860025912294e-15	21252826	21288715	9.61299879384481e-08	21412148	21431585
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21426967	21470699	23	22	-0.5214	9.61299879384481e-08	21412148	21431585	2.80980441345909e-19	21457258	21498439
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21474576	34674458	4724	4572	-0.2414	2.80980441345909e-19	21457258	21498439	3.59102621638147e-27	34666996	34674458
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	0.6339	3.59102621638147e-27	34666996	34674458	1.93619936654623e-08	34683810	34685308
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1838	-0.2369	1.93619936654623e-08	34683810	34685308	9.27026491099196e-16	40670538	40676611
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.4823	9.27026491099196e-16	40670538	40676611	1.02798113757724e-17	40726930	40741934
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	41964478	281	274	-0.2567	1.02798113757724e-17	40726930	40741934	3.99428030575606e-16	41955689	41967407
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	41967407	42022302	19	19	-0.7194	3.99428030575606e-16	41955689	41967407	1.38671860387193e-16	42017506	42029718
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	42025431	82416310	15416	14883	-0.2423	1.38671860387193e-16	42017506	42029718	1.67928716202148e-272	82390571	82445082
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	82431083	84678301	397	385	0.1825	1.67928716202148e-272	82390571	82445082	5.72695669667371e-175	84673300	84678301
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	84683188	84683188	1	0	NA	5.72695669667371e-175	84673300	84678301	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	84690389	84880341	62	59	-0.7121	NA	NA	NA	7.25395774232596e-193	84880341	84880341
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	84887089	90068361	1616	1561	0.1715	7.25395774232596e-193	84880341	84880341	3.86145290570882e-10	90060643	90077184
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90070271	90096939	13	13	0.6076	3.86145290570882e-10	90060643	90077184	7.4691955226241e-08	90088078	90107254
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90099087	105597555	6181	5954	0.208	7.4691955226241e-08	90088078	90107254	2.10068457196964e-09	105588527	105602602
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.662	2.10068457196964e-09	105588527	105602602	2.73520730050697e-14	105630089	105681007
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	46	0.1734	2.73520730050697e-14	105630089	105681007	1.02352479286484e-50	105850033	105850033
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-0.964	1.02352479286484e-50	105850033	105850033	1.11273335877687e-32	105881893	105881893
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	174	0.1708	1.11273335877687e-32	105881893	105881893	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0397	NA	NA	NA	1.13490641637240e-07	18452491	18741716
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	145	-0.7122	1.1349064163724e-07	18452491	18741716	1.26885728865613e-275	20065525	20308014
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	30712426	2733	2641	0.0162	1.26885728865613e-275	20065525	20308014	0	30227452	30728771
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	30713453	72503065	17887	17273	0.2785	0	30227452	30728771	0	72483963	72520512
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	72504401	99632987	10272	9920	0.0352	0	72483963	72520512	2.08759820853290e-28	99632987	99632987
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.0414	2.0875982085329e-28	99632987	99632987	1.53656879315598e-26	99635701	99635701
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100151597	211	203	-0.0152	1.53656879315598e-26	99635701	99635701	5.77358579052475e-25	100089883	100154687
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100152857	100217283	57	55	0.3947	5.77358579052475e-25	100089883	100154687	8.35108558871864e-08	100212401	100217283
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	-0.3001	8.35108558871864e-08	100212401	100217283	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	15075728	5503	5320	0.0808	NA	NA	NA	0	15058535	15399818
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15076986	35004950	5310	5133	-0.2471	0	15058535	15399818	0	34969229	45089889
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45058242	57047527	4023	3912	0.0575	0	34969229	45089889	1.38427992469029e-08	57046150	57051030
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57051030	57054683	3	3	0.9576	1.38427992469029e-08	57046150	57051030	1.94754857073099e-10	57053358	57056800
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57056800	58046943	266	260	0.0435	1.94754857073099e-10	57053358	57056800	0	58032559	58058816
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	58058816	59842160	382	376	-0.7048	0	58032559	58058816	3.07027937815992e-303	59833638	59850186
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	59850186	61788514	429	413	-1.2948	3.07027937815992e-303	59833638	59850186	0	61782847	61792768
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	61792768	69397102	2646	2561	-0.62	0	61782847	61792768	1.34427551169798e-87	69389927	69409493
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69398720	69401319	2	0	NA	1.34427551169798e-87	69389927	69409493	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69402880	69761372	162	157	-0.2095	NA	NA	NA	1.07857854351330e-108	69753919	69768177
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69763173	72941901	1038	1016	-0.6459	1.0785785435133e-108	69753919	69768177	4.46679252276563e-09	72918129	72941901
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72964783	5	5	-1.3183	4.46679252276563e-09	72918129	72941901	4.60360285736326e-08	72964783	73025340
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	730	-0.6392	4.60360285736326e-08	72964783	73025340	5.11292056898404e-73	75093957	75093957
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.2169	5.11292056898404e-73	75093957	75093957	2.59453542770078e-66	75100865	75100865
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4944	-0.6167	2.59453542770078e-66	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1904451	854	832	0.2268	NA	NA	NA	4.9471601249785e-08	1904451	1904451
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906352	2	2	1.388	4.9471601249785e-08	1904451	1904451	4.56318613744286e-07	1906352	1906391
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906391	4383531	1091	1054	0.2192	4.56318613744286e-07	1906352	1906391	1.08631679063457e-08	4371403	4387104
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4384967	4414100	13	13	-0.2888	1.08631679063457e-08	4371403	4387104	2.27907918747449e-180	4393276	4596141
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4416092	31431640	10069	9711	-0.121	2.27907918747449e-180	4393276	4596141	8.0230687126621e-189	31427855	31437168
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31436580	31503774	27	26	-0.6316	8.0230687126621e-189	31427855	31437168	1.70678681481518e-15	31492553	31893451
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32228055	100	96	-0.1602	1.70678681481518e-15	31492553	31893451	2.53230250980009e-06	32221174	32228055
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32235846	32251318	4	4	-0.8637	2.53230250980009e-06	32221174	32228055	1.12546540847503e-07	32240819	32273588
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32259517	32707677	189	187	-0.2333	1.12546540847503e-07	32240819	32273588	2.97782149287988e-05	32704194	32707677
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32709516	32711885	3	3	-0.829	2.97782149287988e-05	32704194	32707677	0.00401709408718982	32711885	32718349
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32713789	32850723	80	79	-0.1801	0.00401709408718982	32711885	32718349	7.78089475648658e-85	32850723	32850723
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-4.3211	7.78089475648658e-85	32850723	32850723	1.30836453180564e-115	32854956	32854956
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	36673853	1437	1390	-0.1945	1.30836453180564e-115	32854956	32854956	5.74337333499973e-286	36673853	36673853
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-4.3061	5.74337333499973e-286	36673853	36673853	2.12865882708763e-262	36683509	36683509
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41558893	2029	1966	-0.1935	2.12865882708763e-262	36683509	36683509	2.58753232258502e-39	41553226	41566540
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41561017	41710400	50	46	-0.7281	2.58753232258502e-39	41553226	41566540	4.3030068041101e-42	41704093	42143048
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52915365	3685	3546	-0.2199	4.3030068041101e-42	41704093	42143048	0	52904517	52930502
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52916910	78636731	9992	9632	0.0993	0	52904517	52930502	2.02210828485559e-25	78633619	78636731
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78637954	78653545	2	2	-0.6627	2.02210828485559e-25	78633619	78636731	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	168	-0.13	NA	NA	NA	2.89149905110346e-16	500897	500897
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	1.2329	2.89149905110346e-16	500897	500897	6.66024415065385e-15	505456	505456
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	18062149	5358	5180	-0.1517	6.66024415065385e-15	505456	505456	2.06089645621475e-21	18052489	18067867
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18064868	18138667	25	25	0.3131	2.06089645621475e-21	18052489	18067867	6.66715000131334e-82	18114900	18192131
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18144012	35545624	5270	5106	-0.0261	6.66715000131334e-82	18114900	18192131	3.96712721145762e-103	35535587	35556103
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35547538	36509250	152	147	-0.4566	3.96712721145762e-103	35535587	35556103	6.58476253812853e-16	36509250	36509250
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-1.8856	6.58476253812853e-16	36509250	36509250	1.61452141798210e-16	36519728	36519728
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	5062	-0.4352	1.6145214179821e-16	36519728	36519728	1.31702048312553e-10	53092949	53092949
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.6115	1.31702048312553e-10	53092949	53092949	5.62759536807164e-12	53099601	53099601
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76106692	6760	6541	-0.4285	5.62759536807164e-12	53099601	53099601	1.50064601057457e-12	76035300	76106692
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76110964	76110964	1	0	NA	1.50064601057457e-12	76035300	76106692	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76113758	76116026	2	2	0.022	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	472	-0.1349	NA	NA	NA	1.25590242706548e-29	1398325	1398325
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.1623	1.25590242706548e-29	1398325	1398325	6.18685875970355e-32	1400840	1400840
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	12026895	4889	4696	-0.1982	6.18685875970355e-32	1400840	1400840	9.48946370079631e-121	12019908	12030199
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12027913	12342932	143	137	0.3579	9.4894637007963e-121	12019908	12030199	3.85114176223192e-31	12328793	12363863
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12343141	13446694	522	500	0.0511	3.85114176223192e-31	12328793	12363863	5.16261258322996e-89	13417533	13466923
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13447669	20616809	3205	3107	-0.2031	5.16261258322996e-89	13417533	13466923	0	20577520	20651057
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20617277	56823430	10620	10257	0.0525	0	20577520	20651057	3.02296124764142e-08	56816785	56825794
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.5525	3.02296124764142e-08	56816785	56825794	2.18790673784075e-07	56837593	56846683
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	60582406	1648	1596	0.018	2.18790673784075e-07	56837593	56846683	1.65661155849855e-05	60566082	60591610
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60586005	60619367	15	15	0.3815	1.65661155849855e-05	60566082	60591610	7.5254678334781e-07	60607343	60630475
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60621757	60848754	111	107	0.0173	7.5254678334781e-07	60607343	60630475	3.5603761868665e-07	60838774	60860846
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60850973	60884879	20	20	0.3549	3.5603761868665e-07	60838774	60860846	1.53989167659512e-06	60873389	60903915
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60887276	63787171	1383	1343	0.0205	1.53989167659512e-06	60873389	60903915	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	562	-0.2375	NA	NA	NA	2.17398658128656e-11	1499421	1506379
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-1.3366	2.17398658128656e-11	1499421	1506379	0.0177204722731482	1516966	1523000
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-3.3878	0.0177204722731482	1516966	1523000	3.74314954242756e-234	1525300	1531162
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	28266113	8457	8202	-0.2405	3.74314954242756e-234	1525300	1531162	0	28250082	29306447
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	32354098	1328	1287	0.3227	0	28250082	29306447	3.60473547935343e-07	32352453	32354098
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	32357683	32360063	2	2	1.3825	3.60473547935343e-07	32352453	32354098	5.86101273439271e-07	32360063	32363985
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	32363985	36191684	1690	1635	0.3298	5.86101273439271e-07	32360063	32363985	6.39435315063974e-15	36172169	36205524
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	36193877	36302306	52	50	0.0235	6.39435315063974e-15	36172169	36205524	5.12469212438309e-40	36295180	36312781
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	36305063	42288577	2008	1937	0.4428	5.12469212438309e-40	36295180	36312781	1.21287449810975e-25	42285538	42288577
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	42291478	42296867	3	3	1.4041	1.21287449810975e-25	42285538	42288577	4.57411474251148e-22	42296867	42298600
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	42298600	62419534	7444	7171	0.5114	4.57411474251148e-22	42296867	42298600	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10167413	22	22	-0.4422	NA	NA	NA	1.06766650780904e-07	10146866	13600227
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13435755	2	0	NA	1.06766650780904e-07	10146866	13600227	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13562263	13842398	25	24	0.0351	NA	NA	NA	0.00710095800696056	13712631	13877546
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13856599	13992109	14	14	-0.3008	0.00710095800696056	13712631	13877546	4.37489912872262e-10	13889359	14092232
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	20227261	2189	2117	0.1128	4.37489912872262e-10	13889359	14092232	2.63639598162543e-18	20227261	20227261
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	20233784	20246448	3	3	-1.0708	2.63639598162543e-18	20227261	20227261	1.31615343740226e-15	20246448	20246448
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	20263504	36789648	6290	6059	0.0911	1.31615343740226e-15	20246448	20246448	1.66479816512859e-21	36789648	36789648
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.752	1.66479816512859e-21	36789648	36789648	7.38572644827585e-19	36791668	36791668
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	44054130	3557	3445	0.0967	7.38572644827585e-19	36791668	36791668	1.03161933004515e-11	44050927	44054130
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44056754	44069095	6	6	0.7763	1.03161933004515e-11	44050927	44054130	1.88878916628479e-07	44069095	44075042
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44070917	46922972	1331	1286	0.1274	1.88878916628479e-07	44069095	44075042	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18125356	1131	1096	-0.2109	NA	NA	NA	2.57541904400713e-09	18123761	18125356
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	1.0186	2.57541904400713e-09	18123761	18125356	1.93213983540616e-08	18129194	18131561
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22667608	1849	1788	-0.2098	1.93213983540616e-08	18129194	18131561	0	22667608	22679305
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-3.5444	0	22667608	22679305	0	22718614	22725305
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	28284692	3041	2952	-0.2384	0	22718614	22725305	1.48383486495859e-233	28284692	28286642
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28286642	28396926	62	60	-1.3037	1.48383486495859e-233	28284692	28286642	1.89506232768091e-232	28395869	28396926
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28398931	35472378	3444	3330	-0.2445	1.89506232768091e-232	28395869	28396926	5.25323679567173e-19	35472378	35472378
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.9188	5.25323679567173e-19	35472378	35472378	1.37120530356184e-18	35476942	35476942
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	43991025	4394	4244	-0.2114	1.37120530356184e-18	35476942	35476942	8.31766841500834e-09	43990242	43991025
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43992403	43993113	2	2	0.9797	8.31766841500834e-09	43990242	43991025	4.03042726313751e-08	43993113	43993976
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43993976	49571068	2607	2496	-0.2026	4.03042726313751e-08	43993113	43993976	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0735	NA	NA	NA	5.13228217928126e-13	94062	94062
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.037	5.13228217928126e-13	94062	94062	7.70837345981498e-10	104732	108902
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2302065	1387	1338	-0.2924	7.70837345981498e-10	104732	108902	2.15384968706713e-11	2301365	2302065
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.7639	2.15384968706713e-11	2301365	2302065	5.55627211222695e-14	2304398	2306110
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2426938	136	130	-0.3439	5.55627211222695e-14	2304398	2306110	5.34577065924032e-18	2426938	2426938
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.4485	5.34577065924032e-18	2426938	2426938	8.5422719232335e-17	2428307	2428307
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2431918	4	4	-0.6256	8.5422719232335e-17	2428307	2428307	0.123775690165468	2431918	2490293
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2432847	2672401	220	210	-0.2575	0.123775690165468	2431918	2490293	2.66135816994055e-10	2668473	2686565
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	25	-0.6447	2.66135816994055e-10	2668473	2686565	3.42397810850551e-116	2708291	2711273
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6773792	1259	1218	0.7107	3.42397810850551e-116	2708291	2711273	1.66071010217955e-89	6724257	6802677
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6783819	7769323	295	288	0.3357	1.66071010217955e-89	6724257	6802677	3.79814464434017e-09	7769323	7769323
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	7773950	7773981	2	2	1.4703	3.79814464434017e-09	7769323	7769323	1.20962915217437e-07	7773981	7779354
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	7779354	12904690	2250	2179	0.3831	1.20962915217437e-07	7773981	7779354	8.52545197179362e-233	12897548	12911082
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	12906036	14204666	476	461	0.8039	8.52545197179362e-233	12897548	12911082	6.16408648893992e-260	14186091	14235266
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	14207772	43631848	10754	10403	0.392	6.16408648893992e-260	14186091	14235266	0	43619631	43642221
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	43633583	69646994	6175	5934	0.7633	0	43619631	43642221	6.08878145029151e-41	69646994	69646994
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69649160	69650824	2	2	-1.013	6.08878145029151e-41	69646994	69646994	1.89619807608006e-173	69650824	69650824
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69659613	112858755	10857	10478	0.881	1.89619807608006e-173	69650824	69650824	7.91432727504275e-167	112858755	112858755
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	112866679	112911949	10	10	-0.3464	7.91432727504275e-167	112858755	112858755	2.51179058161757e-55	112911949	112911949
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	112918316	127627558	4164	4031	0.938	2.51179058161757e-55	112911949	112911949	0	127595561	127658049
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127638274	154582414	8890	8569	0.5971	0	127595561	127658049	0	154578922	154582414
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	188	-0.4304	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-4.1588	NA	NA	NA	2.987996476963e-15	3780462	4421500
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.795	2.987996476963e-15	3780462	4421500	8.00489683378613e-09	4948824	6688691
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-4.0075	8.00489683378613e-09	4948824	6688691	1.59109885764690e-06	7022973	7242656
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7645258	154	150	-3.2112	1.5910988576469e-06	7022973	7242656	2.42719760075465e-06	7590569	7648873
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	7709619	40	37	-4.5475	2.42719760075465e-06	7590569	7648873	1.09945869301593e-09	7707621	7733351
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7996758	85	81	-3.1877	1.09945869301593e-09	7707621	7733351	2.32122938635039e-12	7914104	8058483
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10515697	372	361	-4.0805	2.32122938635039e-12	7914104	8058483	3.53803560029838e-33	10513747	10515697
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.8563	3.53803560029838e-33	10513747	10515697	9.56736694435277e-07	10631941	12452734
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13090026	194	189	-3.1153	9.56736694435277e-07	10631941	12452734	0.0677133334696284	12994193	13101234
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13090512	13128515	13	12	-1.9238	0.0677133334696284	12994193	13101234	6.78018300018096e-08	13119344	13137597
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	43	-3.6676	6.78018300018096e-08	13119344	13137597	0.00841572716930054	13153117	13357259
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13649497	166	163	-4.1836	0.00841572716930054	13153117	13357259	2.90666230161616e-06	13597813	13670791
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13705594	10	10	-2.822	2.90666230161616e-06	13597813	13670791	1.82220617513232e-07	13701755	13729067
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14359748	198	189	-4.3551	1.82220617513232e-07	13701755	13729067	1.13661227769633e-07	14310145	14407293
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14508021	88	84	-3.6702	1.13661227769633e-07	14310145	14407293	1.69771147678449e-09	14500052	14530328
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.69771147678449e-09	14500052	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-2.127	NA	NA	NA	7.4691112208696e-05	14561228	14579298
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.3254	7.4691112208696e-05	14561228	14579298	2.7146186876562e-07	14598838	14601309
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14681738	5	5	-1.7893	2.7146186876562e-07	14598838	14601309	2.64522427650729e-05	14605090	14689490
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	15208612	142	136	-4.0868	2.64522427650729e-05	14605090	14689490	0.000159698403527848	15171394	15252823
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15284717	41	39	-3.1809	0.000159698403527848	15171394	15252823	6.52305348615494e-10	15268792	15291532
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	77	-4.3627	6.52305348615494e-10	15268792	15291532	5.86950661725395e-06	15406461	15409110
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15412637	4	4	-2.4465	5.86950661725395e-06	15406461	15409110	7.61341323169254e-06	15411509	15413514
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15413514	15443458	16	16	-4.3939	7.61341323169254e-06	15411509	15413514	1.85717114472764e-09	15434486	15443458
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15444246	15447091	4	4	-2.2014	1.85717114472764e-09	15434486	15443458	6.12995478336593e-08	15447091	15448670
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	29	-4.2622	6.12995478336593e-08	15447091	15448670	4.33638454757254e-13	15521958	15525955
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15541293	10	9	-2.1857	4.33638454757254e-13	15521958	15525955	0.000129811324833684	15537260	15548828
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15542314	15566377	18	18	-3.9949	0.000129811324833684	15537260	15548828	0.0013178973379173	15558235	15580942
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15587741	7	7	-2.0369	0.0013178973379173	15558235	15580942	1.34086250937381e-11	15582236	15590299
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	54	-4.2724	1.34086250937381e-11	15582236	15590299	8.43311127599238e-10	15892492	15951430
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16085263	68	66	-3.137	8.43311127599238e-10	15892492	15951430	1.76739009814053e-16	16065378	16100397
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16087502	19610243	471	454	-4.2018	1.76739009814053e-16	16065378	16100397	2.77626919739136e-12	19610243	19610243
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	0.6113	2.77626919739136e-12	19610243	19610243	1.80890907661781e-15	19613864	19613864
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	20384639	215	202	-4.0986	1.80890907661781e-15	19613864	19613864	5.9493271586004e-06	20366162	20384639
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20387629	20400879	4	4	-2.007	5.9493271586004e-06	20366162	20384639	2.70247090457110e-08	20400879	20448276
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20428887	21036411	72	69	-4.1922	2.7024709045711e-08	20400879	20448276	2.45264306056105e-10	21035621	21036411
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21047798	5	5	-1.9734	2.45264306056105e-10	21035621	21036411	2.96688745647576e-07	21047798	21054519
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21048365	22157319	264	249	-4.1066	2.96688745647576e-07	21047798	21054519	2.40932516376295e-09	22058759	22157319
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-2.1975	2.40932516376295e-09	22058759	22157319	3.45544167422479e-26	22177335	22178964
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22780866	48	45	-4.7025	3.45544167422479e-26	22177335	22178964	5.38381889148271e-08	22768795	22789287
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22782417	22854382	16	14	-3.6214	5.38381889148271e-08	22768795	22789287	0.0609413198516748	22848638	22918955
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22855219	25737663	31	29	-4.4006	0.0609413198516748	22848638	22918955	4.83250002916339e-31	23283689	26871442
MSK_252152912743_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	83	-1.2474	4.83250002916339e-31	23283689	26871442	NA	NA	NA
