Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72519056	27883	27348	-0.7983	NA	NA	NA	3.53061211097567e-18	72427928	72533856
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72520196	72537426	11	11	-0.476	3.53061211097567e-18	72427928	72533856	8.20622549857836e-14	72537426	72540240
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.7239	8.20622549857836e-14	72537426	72540240	1.10687559503817e-179	72574479	72579311
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	85742732	4043	3965	-0.8106	1.10687559503817e-179	72574479	72579311	4.17253683844433e-16	85740131	85742732
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85745222	85771035	12	12	0.0958	4.17253683844433e-16	85740131	85742732	9.05145573510636e-16	85771035	85776171
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85772922	112858186	8764	8583	-0.8078	9.05145573510636e-16	85771035	85776171	5.63361363086757e-13	112854071	112859629
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	112859629	112889258	13	13	-0.0166	5.63361363086757e-13	112854071	112859629	2.47765589669173e-14	112886548	112895145
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	112891227	116099211	1128	1103	-0.8059	2.47765589669173e-14	112886548	112895145	0	116097885	116101220
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116101220	119588373	1251	1227	0.1924	0	116097885	116101220	2.69987907402452e-36	119577974	119595509
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	119591467	119620141	14	13	0.8884	2.69987907402452e-36	119577974	119595509	0.000810885930355158	119603902	119669737
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	119623051	150836484	2334	2288	0.4958	0.000810885930355158	119603902	119669737	1.07222253999570e-36	150836484	150844444
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150839754	150851439	8	5	-1.5078	1.0722225399957e-36	150836484	150844444	1.32064617507805e-36	150848509	150851439
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2705	0.514	1.32064617507805e-36	150848509	150851439	3.66638363603048e-71	157133150	157133150
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.8986	3.66638363603048e-71	157133150	157133150	6.28773792561571e-71	157136342	157136342
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1590	0.5066	6.28773792561571e-71	157136342	157136342	7.00418243526053e-13	161099582	161099582
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.4032	7.00418243526053e-13	161099582	161099582	2.33565337071754e-12	161104791	161104791
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	247186514	31286	30719	0.5148	2.33565337071754e-12	161104791	161104791	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11281	-0.0117	NA	NA	NA	5.00569732071219e-77	34543992	34543992
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34556434	4	4	-3.238	5.00569732071219e-77	34543992	34543992	2.10498182220527e-18	34556434	34556434
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34558824	34579933	10	9	-5.4592	2.10498182220527e-18	34556434	34556434	2.1931128416634e-08	34579933	34579933
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34589997	4	4	-3.56	2.1931128416634e-08	34579933	34579933	6.58617409673234e-92	34589997	34589997
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37810001	1369	1341	-0.0224	6.58617409673234e-92	34589997	34589997	1.38277675855956e-25	37797909	37815049
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.8309	1.38277675855956e-25	37797909	37815049	7.43061752735593e-27	37848754	37859985
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	106244482	20979	20567	-0.0103	7.43061752735593e-27	37848754	37859985	1.15879757063801e-20	106244482	106244482
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-2.4069	1.15879757063801e-20	106244482	106244482	4.53805945554093e-20	106250718	106250718
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	199059842	28087	27519	0.0046	4.53805945554093e-20	106250718	106250718	3.14500456244897e-10	199050664	199059842
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	199064168	199105680	8	8	-0.8757	3.14500456244897e-10	199050664	199059842	1.25817761038305e-10	199105680	199115525
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	199110982	218970587	7416	7264	0.0092	1.25817761038305e-10	199105680	199115525	5.20952829225683e-11	218970587	218970587
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218971708	218972428	2	2	1.8083	5.20952829225683e-11	218970587	218970587	3.94155660917863e-11	218972428	218972428
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218975318	242689978	8402	8249	-0.0146	3.94155660917863e-11	218972428	218972428	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15901	-1e-04	NA	NA	NA	1.46862071282631e-69	47460892	47460892
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.3853	1.46862071282631e-69	47460892	47460892	1.2002500900413e-68	47466921	47466921
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	133189686	27489	26933	-0.0023	1.2002500900413e-68	47466921	47466921	5.67081426144587e-09	133189686	133189686
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6548	5.67081426144587e-09	133189686	133189686	4.37780965158986e-09	133194685	133194685
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	4.37780965158986e-09	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164001657	9778	9612	8e-04	NA	NA	NA	9.42459953672207e-31	164001657	164001657
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164027724	6	6	1.7125	9.42459953672207e-31	164001657	164001657	5.03585320556017e-12	164019640	164027724
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.5133	5.03585320556017e-12	164019640	164027724	2.45013186038385e-09	164105613	164134797
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9941	-0.0034	2.45013186038385e-09	164105613	164134797	1.58532665887068e-298	194354505	194354505
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.272	1.58532665887068e-298	194354505	194354505	1.38341933903186e-300	194366950	194366950
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1943	-0.0247	1.38341933903186e-300	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	212	0.0283	NA	NA	NA	6.78297855013212e-10	679789	682752
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	6.78297855013212e-10	679789	682752	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.5821	NA	NA	NA	2.95843502858657e-08	691065	693668
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9815760	3176	3117	0.0227	2.95843502858657e-08	691065	693668	2.50389829296141e-229	9815760	9815760
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.6103	2.50389829296141e-229	9815760	9815760	2.28176397725672e-223	9842644	9842644
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34457648	6168	6056	0.0046	2.28176397725672e-223	9842644	9842644	4.69454771764475e-07	34439897	34457648
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34485596	4	4	-1.0365	4.69454771764475e-07	34439897	34457648	7.32107835286412e-07	34485596	34506297
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34491115	173224400	40071	39346	0.0096	7.32107835286412e-07	34485596	34506297	6.77584674270034e-33	173224400	173224400
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.0424	6.77584674270034e-33	173224400	173224400	8.93749151203848e-34	173228860	173228860
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5411	-0.003	8.93749151203848e-34	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	219	0.0487	NA	NA	NA	1.42858663143477e-09	727098	776194
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	905462	9	9	0.8202	1.42858663143477e-09	727098	776194	4.34335841243246e-10	873365	911839
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	910211	150156233	43617	42805	-8e-04	4.34335841243246e-10	873365	911839	8.07796886476064e-09	150148732	150166447
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150204134	14	14	-0.621	8.07796886476064e-09	150148732	150166447	2.42837311033013e-09	150197673	150212516
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	180187846	9780	9588	0.0021	2.42837311033013e-09	150197673	150212516	3.23901506177154e-06	180157116	180351118
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180189516	180395507	22	22	-0.3728	3.23901506177154e-06	180157116	180351118	1.08282393154896e-05	180391341	180398319
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180398319	180404671	4	4	0.6054	1.08282393154896e-05	180391341	180398319	0.00108833799828008	180403519	180410867
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180406030	180632269	97	95	-0.0633	0.00108833799828008	180403519	180410867	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	202063	41	39	0.5315	NA	NA	NA	4.01256577750265e-14	198124	202063
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	204881	234115	12	12	-0.2341	4.01256577750265e-14	198124	202063	7.10924872686035e-12	232366	240119
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	26811016	9313	9129	0.495	7.10924872686035e-12	232366	240119	2.42209628504374e-11	26801068	26811016
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.7743	2.42209628504374e-11	26801068	26811016	3.86230825579318e-12	26861184	26863540
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	30968329	1650	1620	0.4983	3.86230825579318e-12	26861184	26863540	1.66186864444442e-186	30957407	30977695
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30968786	32558677	657	642	0.0354	1.66186864444442e-186	30957407	30977695	7.10356704447928e-10	32543054	32558677
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	0.9518	7.10356704447928e-10	32543054	32558677	5.3364300971388e-08	32595402	32600962
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	37	0.0504	5.3364300971388e-08	32595402	32600962	7.58216003603447e-11	32709263	32716255
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.0682	7.58216003603447e-11	32709263	32716255	9.12751281321748e-15	32728487	32732764
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862270	1345	1328	-0.0037	9.12751281321748e-15	32728487	32732764	3.82075683456395e-08	35851495	35864636
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35862502	35873335	7	7	0.8578	3.82075683456395e-08	35851495	35864636	5.83733009577374e-09	35870753	35878656
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6786	-0.0029	5.83733009577374e-09	35870753	35878656	7.29124385834391e-08	54033505	54035000
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.2339	7.29124385834391e-08	54033505	54035000	1.45744101932454e-07	54042734	54045472
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2358	0.015	1.45744101932454e-07	54042734	54045472	3.17603846811704e-68	65767409	65767409
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-4.3357	3.17603846811704e-68	65767409	65767409	7.34294695555836e-68	65771532	65771532
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	170753106	33725	33083	0.002	7.34294695555836e-68	65771532	65771532	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	5644321	2039	1996	0.0224	NA	NA	NA	7.88115855044212e-35	5636062	5653380
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5647373	5861574	78	76	0.5617	7.88115855044212e-35	5636062	5653380	4.00899053473013e-42	5851216	5890852
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5878458	16135701	3271	3204	0.0099	4.00899053473013e-42	5851216	5890852	5.9015714039611e-44	16135701	16135701
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.4313	5.9015714039611e-44	16135701	16135701	8.48076888852767e-42	16140018	16140018
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	141422860	44418	43587	0.004	8.48076888852767e-42	16140018	16140018	1.81627401826884e-10	141417702	141426846
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141425306	141440184	9	9	-0.8379	1.81627401826884e-10	141417702	141426846	1.51286914165185e-10	141435643	141443577
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	147702365	2638	2595	0.0128	1.51286914165185e-10	141435643	141443577	2.92013470072323e-74	147702365	147702365
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.6608	2.92013470072323e-74	147702365	147702365	1.16476211621694e-77	147707161	147707161
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4147	-0.0061	1.16476211621694e-77	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	8016	0.0069	NA	NA	NA	8.68556106495287e-18	25120552	25120552
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.8212	8.68556106495287e-18	25120552	25120552	6.18043185724159e-17	25125700	25125700
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	92945609	19289	18905	0.0118	6.18043185724159e-17	25125700	25125700	5.57160297070916e-09	92941273	92945609
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	92958640	92970814	3	3	-1.3348	5.57160297070916e-09	92941273	92945609	6.63669383954609e-09	92970814	92980052
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	92980052	146264846	17112	16762	0.0123	6.63669383954609e-09	92970814	92980052	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2423	-0.0164	NA	NA	NA	1.71110297895178e-139	6685358	6685358
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-5.1798	1.71110297895178e-139	6685358	6685358	4.9988000347987e-148	6698290	6698290
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	70926188	10598	10373	-8e-04	4.9988000347987e-148	6698290	6698290	8.6408288426241e-12	70926188	70926188
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.838	8.6408288426241e-12	70926188	70926188	6.81412236589778e-12	70930528	70930528
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9739	-0.0134	6.81412236589778e-12	70930528	70930528	7.45955662210492e-28	100348045	100348045
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.8093	7.45955662210492e-28	100348045	100348045	5.58772873092836e-27	100350814	100350814
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	137352394	13844	13613	-0.0085	5.58772873092836e-27	100350814	100350814	9.61839044017946e-07	137347945	137352394
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.4481	9.61839044017946e-07	137347945	137352394	3.87171685011017e-06	137356880	137359947
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1071	0.0102	3.87171685011017e-06	137356880	137359947	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	56115736	17031	16699	0.5013	NA	NA	NA	8.9622627910692e-13	56109520	56115736
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	10	1.3539	8.9622627910692e-13	56109520	56115736	1.23467407867484e-12	56138767	56143873
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	70949263	4634	4529	0.5109	1.23467407867484e-12	56138767	56143873	5.07812267581600e-17	70949263	70949263
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-1.0266	5.078122675816e-17	70949263	70949263	1.83547769940965e-16	70960187	70960187
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	100861282	10747	10544	0.5098	1.83547769940965e-16	70960187	70960187	1.27314276575150e-122	100861282	100861282
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100862720	100863972	2	2	-5.3059	1.2731427657515e-122	100861282	100861282	1.78774498302788e-122	100863972	100863972
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100865503	114100979	4559	4473	0.5164	1.78774498302788e-122	100863972	100863972	1.96751486491325e-31	114100979	114100979
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.4832	1.96751486491325e-31	114100979	114100979	1.31939142965850e-31	114106460	114106460
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7666	0.5054	1.3193914296585e-31	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1743	-0.7461	NA	NA	NA	6.46719343168435e-96	4923300	4923300
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.5401	6.46719343168435e-96	4923300	4923300	5.03747442987684e-112	4932214	4932214
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	34101125	10362	10179	-0.8128	5.03747442987684e-112	4932214	4932214	0	34097652	34102447
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34102447	38697729	1351	1322	0.1542	0	34097652	34102447	0	38673295	38729046
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	38715189	41620063	749	736	0.8194	0	38673295	38729046	0	41599692	41644939
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	41636348	45550941	1097	1070	0.153	0	41599692	41644939	1.60843924025504e-61	45496609	45616213
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	45557416	46435641	351	339	0.5204	1.60843924025504e-61	45496609	45616213	0	46433817	46437041
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46437041	50337200	1125	1106	-0.7392	0	46433817	46437041	6.0058100607528e-07	50246893	50337200
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	51235737	51241169	3	3	0.0419	6.0058100607528e-07	50246893	50337200	0.0230290599782899	51239273	54843571
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	51242477	55118214	90	89	0.5629	0.0230290599782899	51239273	54843571	1.63284457471339e-16	55097806	55131703
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55205278	37	37	1.0616	1.63284457471339e-16	55097806	55131703	1.97229158413213e-19	55197848	55221692
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55207305	76753000	8599	8421	0.5108	1.97229158413213e-19	55197848	55221692	5.49737153370778e-149	76751417	76757549
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	76757549	76857297	48	46	-0.834	5.49737153370778e-149	76751417	76757549	6.58126716507842e-56	76852522	76860051
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	76858917	134450318	19715	19358	-0.0092	6.58126716507842e-56	76852522	76860051	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3672	3e-04	NA	NA	NA	5.78100252196834e-28	9516067	9528590
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	1.1773	5.78100252196834e-28	9516067	9528590	4.9376323961498e-29	9589725	9604633
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	130943064	40854	40133	0.0019	4.9376323961498e-29	9589725	9604633	7.87532612545109e-13	130943064	130943064
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.9589	7.87532612545109e-13	130943064	130943064	4.65439946529131e-13	130946248	130946248
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	537	0.0082	4.65439946529131e-13	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6903	-0.0093	NA	NA	NA	9.1511111482309e-94	36969571	36969571
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-5.1043	9.1511111482309e-94	36969571	36969571	2.89216419048549e-89	36982877	36982877
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	293	0.0129	2.89216419048549e-89	36982877	36982877	1.85253020726435e-22	37953582	37953582
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.5858	1.85253020726435e-22	37953582	37953582	1.60686434231165e-23	37957844	37957844
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	100690991	19740	19348	3e-04	1.60686434231165e-23	37957844	37957844	4.72892862767851e-108	100690991	100690991
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.4643	4.72892862767851e-108	100690991	100690991	6.61002194538497e-109	100693892	100693892
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4473	-0.0094	6.61002194538497e-109	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19490630	58	57	-0.653	NA	NA	NA	4.73947853199568e-43	19483933	19497023
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19492531	40680589	7591	7449	0.0034	4.73947853199568e-43	19483933	19497023	1.90054102840713e-08	40670538	40680589
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.9172	1.90054102840713e-08	40670538	40680589	5.3345597623483e-09	40722360	40741934
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	44242718	661	650	-0.0045	5.3345597623483e-09	40722360	40741934	6.9263027701477e-09	44224015	44251821
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	44251821	44292300	7	7	-0.847	6.9263027701477e-09	44224015	44251821	3.7887103092792e-08	44288343	44300487
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	44296502	73061942	11096	10890	-0.0103	3.7887103092792e-08	44288343	44300487	6.31828310553359e-84	73061942	73071404
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-2.5948	6.31828310553359e-84	73061942	73071404	1.31590332551669e-80	73092018	73092112
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	106358491	12458	12216	-0.0063	1.31590332551669e-80	73092018	73092112	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2292	NA	NA	NA	1.49274658921632e-21	18452491	18692865
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18842565	11	11	-1.5053	1.49274658921632e-21	18452491	18692865	5.87002061914429e-12	18842565	18842565
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18843998	18848213	3	3	-4.093	5.87002061914429e-12	18842565	18842565	8.19876312488422e-15	18848213	18848213
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19882711	94	92	-1.5698	8.19876312488422e-15	18848213	18848213	1.25394510204823e-05	19415360	19943587
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	19910696	1	0	NA	1.25394510204823e-05	19415360	19943587	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19927040	20088256	42	41	-1.1152	NA	NA	NA	6.9379364344216e-88	20065525	20308014
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	21154	-0.0203	6.9379364344216e-88	20065525	20308014	2.24480812513968e-11	74665386	74669752
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.286	2.24480812513968e-11	74665386	74669752	6.33785251688393e-12	74680439	74696127
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	99632987	9333	9162	-0.0203	6.33785251688393e-12	74680439	74696127	8.54564507189874e-09	99632987	99632987
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.582	8.54564507189874e-09	99632987	99632987	4.62304060144263e-10	99635701	99635701
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	266	-0.0259	4.62304060144263e-10	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10391	0.0045	NA	NA	NA	1.54266658027326e-18	31842335	32518665
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	34054713	52	52	-0.4529	1.54266658027326e-18	31842335	32518665	9.50082266492723e-18	33830585	34067256
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	54352394	3071	3025	-0.0121	9.50082266492723e-18	33830585	34067256	1.05403361759744e-90	54352394	54363713
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-2.31	1.05403361759744e-90	54352394	54363713	5.47442682949652e-05	54368717	54379839
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	1.5085	5.47442682949652e-05	54368717	54379839	4.17994650138188e-16	54399890	54402057
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	75093957	6813	6687	2e-04	4.17994650138188e-16	54399890	54402057	1.27734274510101e-39	75093957	75093957
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.7131	1.27734274510101e-39	75093957	75093957	1.23358205641362e-39	75100865	75100865
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5043	-0.0034	1.23358205641362e-39	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	406	-0.774	NA	NA	NA	1.9690073471658e-13	1026339	1027736
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	0.7957	1.9690073471658e-13	1026339	1027736	4.76731243925949e-15	1030715	1030766
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	9956952	3947	3866	-0.78	4.76731243925949e-15	1030715	1030766	0	9946921	9960392
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	9959152	37055494	9710	9522	-2e-04	0	9946921	9960392	7.67649124274295e-08	37014754	37060412
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37057150	37093401	16	16	0.5371	7.67649124274295e-08	37014754	37060412	4.26445422924154e-07	37087569	37105816
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37096272	38536651	679	666	0.004	4.26445422924154e-07	37087569	37105816	1.6428163791334e-211	38521618	38557922
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38540145	41568539	1139	1116	0.54	1.6428163791334e-211	38521618	38557922	3.34557987074202e-23	41558893	41573295
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42143048	47	47	0.0042	3.34557987074202e-23	41558893	41573295	5.2465780678988e-22	41706870	42155643
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42147225	68326225	9410	9235	0.5178	5.2465780678988e-22	41706870	42155643	5.58619071835683e-09	68326225	68326225
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68329393	2	2	-1.1049	5.58619071835683e-09	68326225	68326225	8.91381554590316e-09	68329393	68329393
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68331629	68331629	1	0	NA	8.91381554590316e-09	68329393	68329393	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	76214811	3255	3197	0.5103	NA	NA	NA	1.19379804909371e-11	76213226	76214811
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	76218706	76227620	5	5	1.6791	1.19379804909371e-11	76213226	76214811	5.96488450611202e-11	76227620	76232766
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	76229547	78653545	1004	985	0.5235	5.96488450611202e-11	76227620	76232766	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15885	-0.0066	NA	NA	NA	4.06826954714419e-11	53092949	53092949
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.7937	4.06826954714419e-11	53092949	53092949	5.54599266930067e-11	53099601	53099601
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6650	-0.017	5.54599266930067e-11	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	213	0.0295	NA	NA	NA	3.05546141335769e-11	786616	790526
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	2.1017	3.05546141335769e-11	786616	790526	8.10511294472925e-13	794978	794978
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	261	0.0661	8.10511294472925e-13	794978	794978	1.30132385948877e-12	1398325	1398325
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.1065	1.30132385948877e-12	1398325	1398325	1.25674108887208e-13	1400840	1400840
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4588	0.0234	1.25674108887208e-13	1400840	1400840	1.25290135081217e-13	11448975	11448975
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.1051	1.25290135081217e-13	11448975	11448975	1.23569814894798e-14	11452390	11452390
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	20386500	4041	3965	0.025	1.23569814894798e-14	11452390	11452390	0	20386500	20386500
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20507235	17	17	-3.3573	0	20386500	20386500	0	20507235	20507235
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20510787	55769042	10123	9919	0.0132	0	20507235	20507235	2.87476608120886e-85	55769042	55769042
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-4.9065	2.87476608120886e-85	55769042	55769042	5.47630834286846e-85	55772729	55772729
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56822197	515	504	0.0029	5.47630834286846e-85	55772729	55772729	5.94371324122007e-08	56812893	56823430
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56823430	56840346	9	9	0.73	5.94371324122007e-08	56812893	56823430	3.16455464191911e-08	56837593	56846683
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3115	-0.0102	3.16455464191911e-08	56837593	56846683	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	-0.0156	NA	NA	NA	1.07619713113254e-15	1499034	1515948
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9431	1.07619713113254e-15	1499034	1515948	8.98685835329102e-16	1528899	1544485
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	21231072	7125	6967	-0.0095	8.98685835329102e-16	1528899	1544485	6.2378811154233e-12	21231072	21231072
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21233374	21236012	2	2	-1.8731	6.2378811154233e-12	21231072	21231072	6.94326573210976e-12	21236012	21236012
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21242143	62419534	13856	13633	-0.0087	6.94326573210976e-12	21236012	21236012	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13233	-0.0102	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21571489	2521	2476	-0.0065	NA	NA	NA	1.77121180374610e-16	21571489	21571489
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.8113	1.7712118037461e-16	21571489	21571489	1.1290745979022e-16	21576859	21576859
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	454	0.0176	1.1290745979022e-16	21576859	21576859	1.22358029916320e-07	22601987	22696038
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-0.4592	1.2235802991632e-07	22601987	22696038	3.74714404108699e-07	22710302	22751788
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6428	-0.0074	3.74714404108699e-07	22710302	22751788	4.49676981377472e-33	35472378	35472378
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.0462	4.49676981377472e-33	35472378	35472378	9.84828862623403e-32	35476942	35476942
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	45328093	5090	4989	-0.0018	9.84828862623403e-32	35476942	35476942	7.1038870569921e-11	45318648	45328093
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45329712	45373056	19	18	0.6032	7.1038870569921e-11	45318648	45328093	3.76144694658993e-11	45373056	45383682
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45374188	49571068	1894	1842	-0.0061	3.76144694658993e-11	45373056	45383682	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	106242	14	14	0.7464	NA	NA	NA	2.72797045124890e-12	99430	109064
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	2708291	1779	1748	0.0321	2.7279704512489e-12	99430	109064	0	2706218	2712641
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	44260	0.9537	0	2706218	2712641	0	154578922	154586690
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	-0.0863	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-4.3187	NA	NA	NA	7.26464105929951e-31	3223585	3773948
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9264	7.26464105929951e-31	3223585	3773948	1.52870877962065e-29	4948824	5672441
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	167	-4.1429	1.52870877962065e-29	4948824	5672441	3.00708453443484e-10	7025866	7184431
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7461576	123	119	-3.2361	3.00708453443484e-10	7025866	7184431	8.59043821744546e-11	7344413	7608619
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	10513747	529	515	-4.0113	8.59043821744546e-11	7344413	7608619	6.02202562217745e-28	10512616	10515697
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.6577	6.02202562217745e-28	10512616	10515697	5.04267486149412e-05	10617908	12511461
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	69	-2.8615	5.04267486149412e-05	10617908	12511461	0.00789891448606611	12574148	12833424
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12973899	72	70	-3.7135	0.00789891448606611	12574148	12833424	2.15846243033574e-05	12922667	13008662
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13128515	63	61	-2.669	2.15846243033574e-05	12922667	13008662	0.000199467460827911	13066849	13148290
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	46	-3.6208	0.000199467460827911	13066849	13148290	0.00287083799610736	13167862	13347152
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13606316	160	155	-4.1951	0.00287083799610736	13167862	13347152	2.69614410017828e-07	13591921	13606316
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13699223	10	9	-2.5278	2.69614410017828e-07	13591921	13606316	1.41013797367938e-11	13699223	13701755
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14352278	196	191	-4.5002	1.41013797367938e-11	13699223	13701755	3.35825946728522e-10	14323815	14386474
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14524829	95	89	-3.7375	3.35825946728522e-10	14323815	14386474	1.17676142697601e-08	14506319	14524829
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14538156	6	6	-1.1765	1.17676142697601e-08	14506319	14524829	1.44311581546552e-06	14538156	14545228
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14539230	15270384	200	193	-3.768	1.44311581546552e-06	14538156	14545228	0.0143173095754269	15115689	15381088
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15272429	15566377	174	167	-4.1755	0.0143173095754269	15115689	15381088	3.73912443748135e-05	15558235	15573648
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15587741	7	7	-2.2324	3.73912443748135e-05	15558235	15573648	2.89236270482184e-05	15583573	15617621
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	53	-4.2635	2.89236270482184e-05	15583573	15617621	1.73901057356829e-05	15854496	15937162
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15975479	19	19	-2.9077	1.73901057356829e-05	15854496	15937162	3.84432783584235e-06	15965605	15998663
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15977755	25737663	1185	1149	-4.1816	3.84432783584235e-06	15965605	15998663	4.32205817180585e-60	23283689	26870361
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.0929	4.32205817180585e-60	23283689	26870361	4.25833109338352e-06	26941769	26989053
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.8658	4.25833109338352e-06	26941769	26989053	5.67325384408103e-06	27007874	27068911
MSK_252152914176_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.9041	5.67325384408103e-06	27007874	27068911	NA	NA	NA
