Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	7883080	2440	2362	0.0177	NA	NA	NA	2.22702389092206e-08	7878235	7883080
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7885017	7886774	2	2	-0.8471	2.22702389092206e-08	7878235	7883080	8.54392830178733e-09	7886774	7889514
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7889514	16704522	3339	3264	0.0104	8.54392830178733e-09	7886774	7889514	2.63542086955094e-38	16668773	16817525
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17148592	27	26	-0.482	2.63542086955094e-38	16668773	16817525	2.07592973654829e-38	17102601	17154037
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17154037	34869589	7086	6902	0.0079	2.07592973654829e-38	17102601	17154037	5.73919490518743e-10	34859068	34869589
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.6386	5.73919490518743e-10	34859068	34869589	7.34383937269369e-10	34883375	34884849
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72525842	14990	14608	-0.0023	7.34383937269369e-10	34883375	34884849	1.40421008887752e-22	72523186	72533856
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72579311	20	20	0.4194	1.40421008887752e-22	72523186	72533856	1.51975081963510e-24	72568009	72589682
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	10854	-0.0096	1.5197508196351e-24	72568009	72589682	7.79718535383947e-10	108531247	108533257
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-0.7252	7.79718535383947e-10	108531247	108533257	3.11066254078846e-10	108538662	108541074
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109984914	556	545	-5e-04	3.11066254078846e-10	108538662	108541074	2.44824708480738e-06	109983588	109984914
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109987341	109989998	3	3	0.5745	2.44824708480738e-06	109983588	109984914	1.85885061637357e-10	109989998	109989998
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110015739	12	12	0.0532	1.85885061637357e-10	109989998	109989998	4.38878778106575e-13	110015739	110033018
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110023268	110023268	1	0	NA	4.38878778106575e-13	110015739	110033018	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	0.7504	NA	NA	NA	4.02310657180854e-15	110041712	110041712
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147203277	4555	4428	-0.0059	4.02310657180854e-15	110041712	110041712	3.77555811952764e-23	146290772	147326097
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147306304	1	0	NA	3.77555811952764e-23	146290772	147326097	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147497268	33	33	-0.331	NA	NA	NA	1.69918095717641e-24	147471665	147644831
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150823073	1261	1225	0.0089	1.69918095717641e-24	147471665	147644831	7.00158512840762e-24	150823073	150823073
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	5	-0.8388	7.00158512840762e-24	150823073	150823073	3.73930412063327e-21	150851439	150851439
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	0.0055	3.73930412063327e-21	150851439	150851439	0	151026228	151026228
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-5.0346	0	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2607	0.0013	0	151036435	151036435	2.75460837386654e-86	157133150	157133150
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.5292	2.75460837386654e-86	157133150	157133150	1.40451088347995e-83	157136342	157136342
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1581	-0.0055	1.40451088347995e-83	157136342	157136342	9.100091634252e-15	161099582	161099582
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.09	9.100091634252e-15	161099582	161099582	7.06049215005591e-16	161104791	161104791
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2421	-0.0036	7.06049215005591e-16	161104791	161104791	1.09526611017261e-11	167479184	167497116
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167523140	10	10	-0.4234	1.09526611017261e-11	167479184	167497116	2.2100987188526e-11	167507882	167529221
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	173060997	2175	2119	-0.0081	2.2100987188526e-11	167507882	167529221	1.68540389932614e-09	173059045	173060997
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-0.7009	1.68540389932614e-09	173059045	173060997	5.77486107344297e-09	173067337	173068576
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	185979586	5029	4915	-0.0043	5.77486107344297e-09	173067337	173068576	9.57868879249766e-15	185979586	185979586
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.0763	9.57868879249766e-15	185979586	185979586	1.33299031543676e-14	185988138	185988138
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	227875096	14099	13763	-0.0032	1.33299031543676e-14	185988138	185988138	0	227875096	227875096
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-4.1084	0	227875096	227875096	0	227882805	227882805
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246433956	7256	7086	-0.0065	0	227882805	227882805	2.34317251830666e-49	246425385	246477760
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246440949	246878405	130	127	0.2339	2.34317251830666e-49	246425385	246477760	7.18297913793016e-14	246840442	246907655
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246882156	247186514	94	94	-0.0126	7.18297913793016e-14	246840442	246907655	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20231737	5876	5715	-0.0044	NA	NA	NA	2.37570148287542e-12	20231737	20231737
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-0.9964	2.37570148287542e-12	20231737	20231737	2.52921343997803e-12	20236210	20236210
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	34543992	5644	5513	0.0012	2.52921343997803e-12	20236210	20236210	8.80716437063988e-34	34542224	34551222
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-0.5572	8.80716437063988e-34	34542224	34551222	2.40748559922072e-33	34583814	34591681
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	45577953	4529	4414	0.001	2.40748559922072e-33	34583814	34591681	4.72165526468334e-24	45577953	45577953
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45583661	45589486	5	5	-0.8749	4.72165526468334e-24	45577953	45577953	2.39076937412889e-25	45589486	45589486
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45591115	53084028	2759	2670	-0.0064	2.39076937412889e-25	45589486	45589486	4.5636352793463e-20	53084028	53084028
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	53088812	53097140	3	3	-1.007	4.5636352793463e-20	53084028	53084028	2.05035939826011e-19	53097140	53097140
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	53104774	79182762	8758	8519	-0.003	2.05035939826011e-19	53097140	53097140	2.39828207395119e-09	79180906	79182762
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79184112	79196200	5	5	0.5467	2.39828207395119e-09	79180906	79182762	1.31412563285687e-09	79196200	79198028
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79198028	87721951	2309	2254	-0.011	1.31412563285687e-09	79196200	79198028	4.78324078593779e-10	87661927	88008343
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88038874	6	6	0.511	4.78324078593779e-10	87661927	88008343	8.69601563827054e-10	87968898	88080817
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	146571330	15160	14797	-0.0046	8.69601563827054e-10	87968898	88080817	2.27378432403626e-14	146562545	146571330
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.7597	2.27378432403626e-14	146562545	146571330	3.13904521198885e-15	146592775	146597405
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2156	-0.0117	3.13904521198885e-15	146592775	146597405	6.27520056815647e-114	154601442	154601442
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-3.1253	6.27520056815647e-114	154601442	154601442	7.84437056456818e-127	154606943	154606943
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	178545984	8459	8252	-0.0073	7.84437056456818e-127	154606943	154606943	2.8359039778208e-16	178545984	178545984
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178552260	178555242	3	3	-0.9146	2.8359039778208e-16	178545984	178545984	1.51489849865579e-18	178555242	178555242
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178556781	179767214	537	521	-0.0034	1.51489849865579e-18	178555242	178555242	1.47961544671303e-13	179764819	179767214
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.7747	1.47961544671303e-13	179764819	179767214	9.49214623436496e-12	179778919	179778919
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	208057199	9107	8905	-0.0078	9.49214623436496e-12	179778919	179778919	6.71828935240974e-09	208049901	208057199
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-0.8493	6.71828935240974e-09	208049901	208057199	1.671546981305e-15	208066245	208071101
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	242490167	12361	12026	-8e-04	1.671546981305e-15	208066245	208071101	2.37975741949485e-19	242477420	242505261
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242492286	242649724	59	56	0.2351	2.37975741949485e-19	242477420	242505261	0.0217462090374939	242501239	242677011
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242651363	242689978	13	13	0.0695	0.0217462090374939	242501239	242677011	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	12666995	4602	4487	-0.0068	NA	NA	NA	2.10915688715805e-20	12666995	12666995
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12671263	12675329	3	3	-1.0126	2.10915688715805e-20	12666995	12666995	5.3107492774676e-15	12675329	12677130
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12677130	13114287	185	181	-0.0165	5.3107492774676e-15	12675329	12677130	8.30907923448692e-09	13110773	13114287
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	13118383	13124689	3	3	-0.7909	8.30907923448692e-09	13110773	13114287	2.08246398441566e-11	13124689	13129410
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	13129410	47460892	11425	11138	-0.0045	2.08246398441566e-11	13124689	13129410	9.26505066698238e-267	47460892	47460892
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.5175	9.26505066698238e-267	47460892	47460892	1.76288581990190e-263	47466921	47466921
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	53001678	2442	2383	0.0166	1.7628858199019e-263	47466921	47466921	6.31194153556741e-22	53001678	53001678
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.8224	6.31194153556741e-22	53001678	53001678	1.15731588361629e-21	53011885	53014254
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	99891210	13516	13144	-0.0122	1.15731588361629e-21	53011885	53014254	9.55561276660797e-78	99891210	99891210
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.4324	9.55561276660797e-78	99891210	99891210	1.74168626753486e-76	99897201	99897201
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20742	-0.0075	1.74168626753486e-76	99897201	99897201	2.57026347455900e-112	164005577	164005577
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164019640	3	3	2.3737	2.570263474559e-112	164005577	164005577	0.00195110835881950	164012645	164019640
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164023502	164027724	2	2	1.0112	0.0019511083588195	164012645	164019640	1.10414559551026e-20	164027724	164027724
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-0.4565	1.10414559551026e-20	164027724	164027724	3.33734227651143e-26	164101776	164115417
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9306	-0.0045	3.33734227651143e-26	164101776	164115417	2.56232157164699e-10	192544305	192546280
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.6508	2.56232157164699e-10	192544305	192546280	2.5759853492348e-10	192552734	192554451
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	570	-0.0197	2.5759853492348e-10	192552734	192554451	0	194354505	194354505
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.0995	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	194368145	1	0	NA	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	199329592	1979	1919	0.0091	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	6701455	2354	2278	0.0186	NA	NA	NA	7.69709869398381e-12	6700282	6701455
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	6703791	6712531	4	4	0.7232	7.69709869398381e-12	6700282	6701455	1.78980487847771e-12	6712531	6714765
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	6714765	9815760	1035	1010	0.0139	1.78980487847771e-12	6712531	6714765	3.05956121957207e-14	9800777	9815760
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.7677	3.05956121957207e-14	9800777	9815760	1.10862593599411e-16	9842644	9842644
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	6011	-0.015	1.10862593599411e-16	9842644	9842644	0	34445002	34445002
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-5.5604	0	34445002	34445002	0	34491115	34491115
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	35043614	83	81	0.0122	0	34491115	34491115	1.71655107624074e-07	35036009	35043614
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35049183	35056779	2	2	-0.731	1.71655107624074e-07	35036009	35043614	4.67857363957371e-07	35056779	35063810
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35063810	39380124	1437	1400	-0.0034	4.67857363957371e-07	35056779	35063810	2.84432028055809e-19	39380124	39380124
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39382435	39387900	4	4	-0.8376	2.84432028055809e-19	39380124	39380124	2.06255302468262e-18	39387900	39387900
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39391819	53897054	3718	3634	-0.0086	2.06255302468262e-18	39387900	39387900	5.83176410937422e-95	53897054	53907050
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53898778	53898778	1	0	NA	5.83176410937422e-95	53897054	53907050	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53907050	53935647	17	17	-0.912	NA	NA	NA	1.92342831940578e-98	53934433	53935647
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53938229	68905670	3601	3503	-0.0072	1.92342831940578e-98	53934433	53935647	4.06566644331743e-50	68905670	69075140
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	-0.7515	4.06566644331743e-50	68905670	69075140	5.44786704130264e-47	69153675	69656183
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	69643272	1	0	NA	5.44786704130264e-47	69153675	69656183	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69656183	173224400	31192	30380	-0.0103	NA	NA	NA	2.3859829272595e-52	173224400	173224400
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.9808	2.3859829272595e-52	173224400	173224400	1.45368883016005e-59	173228860	173228860
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	189	0.0167	1.45368883016005e-59	173228860	173228860	8.22295115283445e-69	173660684	173660684
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.1217	8.22295115283445e-69	173660684	173660684	1.82254978165988e-62	173666072	173666072
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5182	-0.0073	1.82254978165988e-62	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	21480789	6352	6188	-0.0032	NA	NA	NA	2.53673544799944e-14	21480789	21480789
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.0591	2.53673544799944e-14	21480789	21480789	4.65421452974179e-14	21487474	21487474
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	150156233	37494	36533	-0.0072	4.65421452974179e-14	21487474	21487474	0	150156233	150156233
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150161037	2	2	-6.186	0	150156233	150156233	0	150161037	150161037
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150162435	150181399	4	4	0.1132	0	150161037	150161037	1.45993467978384e-47	150181399	150181399
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-3.8846	1.45993467978384e-47	150181399	150181399	0	150202601	150202601
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180346557	9787	9540	-0.0011	0	150202601	150202601	7.94877431533908e-18	180344964	180346557
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	0.6974	7.94877431533908e-18	180344964	180346557	3.33457335460653e-22	180358977	180358977
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	102	0.0443	3.33457335460653e-22	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.0111	NA	NA	NA	7.20643576579618e-13	186875	200350
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	237952	15	15	0.3114	7.20643576579618e-13	186875	200350	1.21793294981547e-09	237952	248239
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	29941766	10531	10276	-0.0051	1.21793294981547e-09	237952	248239	2.23516507583204e-12	29937319	29966336
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	30005338	15	14	0.3635	2.23516507583204e-12	29937319	29966336	2.80736116956328e-09	29998009	30026699
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31382291	579	563	0.0068	2.80736116956328e-09	29998009	30026699	1.20574226692391e-08	31381060	31382291
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-0.8906	1.20574226692391e-08	31381060	31382291	8.01429014242476e-10	31385778	31385778
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	32558677	495	485	-0.0051	8.01429014242476e-10	31385778	31385778	2.12419422134276e-197	32558677	32558677
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32563252	1	0	NA	2.12419422134276e-197	32558677	32558677	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32595402	6	5	-2.5534	NA	NA	NA	1.99240328406548e-25	32595402	32595402
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32628420	7	7	-0.0245	1.99240328406548e-25	32595402	32595402	6.78656131047263e-26	32628420	32628420
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-2.3488	6.78656131047263e-26	32628420	32628420	1.58126582967101e-51	32633691	32633691
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	27	-0.0743	1.58126582967101e-51	32633691	32633691	1.65801859994119e-18	32713363	32718991
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32721872	4	4	-1.9988	1.65801859994119e-18	32713363	32718991	0.00617147507861247	32718991	32721872
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	32739800	10	9	-0.6751	0.00617147507861247	32718991	32721872	7.46613385380438e-26	32732764	32742767
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	54035000	8253	8023	-0.0043	7.46613385380438e-26	32732764	32742767	2.84735255666924e-38	54035000	54035000
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.3977	2.84735255666924e-38	54035000	54035000	3.77696255229872e-40	54042734	54042734
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4420	-0.0103	3.77696255229872e-40	54042734	54042734	1.1313955462687e-10	72917267	72919733
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-0.7513	1.1313955462687e-10	72917267	72919733	8.33892728388031e-11	72924440	72931542
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	77490500	1612	1574	-0.0034	8.33892728388031e-11	72924440	72931542	2.44383144652936e-08	77484980	77490500
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	0.657	2.44383144652936e-08	77484980	77490500	1.50823254107366e-08	77509983	77517630
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79018959	279	272	-0.0021	1.50823254107366e-08	77509983	77517630	2.48540365526818e-19	79015901	79024557
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	0.498	2.48540365526818e-19	79015901	79024557	9.86373989312047e-20	79085247	79101978
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	79095415	1	0	NA	9.86373989312047e-20	79085247	79101978	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	165643653	27871	27117	-0.0077	NA	NA	NA	0	165643653	165643653
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-5.3837	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1754	0.0017	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	43590850	15487	15103	-0.0038	NA	NA	NA	1.06761668165123e-14	43589344	43590850
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43592620	43595143	2	2	-0.8798	1.06761668165123e-14	43589344	43590850	2.81220297800186e-09	43595143	43595143
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43597673	133433384	30606	29843	-0.0045	2.81220297800186e-09	43595143	43595143	0	133433384	133436265
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.9298	0	133433384	133436265	0	133447868	133448277
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3624	1e-04	0	133447868	133448277	9.19238779486785e-22	141409512	141414719
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	-0.5136	9.19238779486785e-22	141409512	141414719	8.48205932250848e-19	141432778	141440184
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	111	-0.0099	8.48205932250848e-19	141432778	141440184	3.62667757431758e-36	141690753	141698634
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	8	0.8417	3.62667757431758e-36	141690753	141698634	2.02007709999377e-23	141712786	141714168
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142140540	164	162	0.0373	2.02007709999377e-23	141712786	141714168	1.20369485085592e-05	142112002	142152205
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142141101	142198376	17	17	0.3064	1.20369485085592e-05	142112002	142152205	5.75530975908259e-09	142194531	142215216
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142202274	158821263	6571	6394	0.0029	5.75530975908259e-09	142194531	142215216	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0121	NA	NA	NA	4.05296872107512e-23	581533	581533
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.7763	4.05296872107512e-23	581533	581533	9.08288346749175e-38	588865	588865
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	6926661	2270	2216	-0.0021	9.08288346749175e-38	588865	588865	1.01401122510760e-13	6907624	7260442
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7156900	1	0	NA	1.0140112251076e-13	6907624	7260442	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.5015	NA	NA	NA	5.20671310367854e-14	7729311	8137794
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	40892587	11173	10873	-0.003	5.20671310367854e-14	7729311	8137794	2.83496380930902e-20	40892587	40892587
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.2583	2.83496380930902e-20	40892587	40892587	1.41275651025718e-19	40897469	40897469
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51345531	1793	1745	0.0035	1.41275651025718e-19	40897469	40897469	2.38636293677183e-11	51341868	51345531
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51348335	51348335	1	0	NA	2.38636293677183e-11	51341868	51345531	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51351691	51359923	4	4	0.6852	NA	NA	NA	3.48327651987770e-12	51359923	51361569
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51361569	131919337	24653	24009	-0.0121	3.4832765198777e-12	51359923	51361569	2.6769337228545e-15	131919337	131919337
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131921399	131923149	2	2	-1.1088	2.6769337228545e-15	131919337	131919337	1.94780018838757e-14	131923149	131923149
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131926292	146264846	4537	4418	-0.0047	1.94780018838757e-14	131923149	131923149	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	7717193	2778	2699	-0.0081	NA	NA	NA	2.19855392963538e-20	7717193	7717193
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	7723767	7760197	6	5	-0.7764	2.19855392963538e-20	7717193	7717193	9.94329552672593e-20	7760197	7763087
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	7763087	14994045	2346	2291	-0.0149	9.94329552672593e-20	7760197	7763087	6.19955244299166e-51	14992204	14998328
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	14996706	15065811	29	28	0.5014	6.19955244299166e-51	14992204	14998328	2.10620739502969e-46	15059504	15069504
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15069504	15802255	299	294	-1e-04	2.10620739502969e-46	15059504	15069504	2.99345796969384e-21	15802255	15802255
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15813356	3	3	0.9877	2.99345796969384e-21	15802255	15802255	5.1115027943466e-19	15813356	15813356
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	70926188	7611	7388	-0.0071	5.1115027943466e-19	15813356	15813356	2.21076202579462e-44	70926188	70926188
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.8642	2.21076202579462e-44	70926188	70926188	8.00110085423164e-45	70930528	70930528
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	15012	-0.0024	8.00110085423164e-45	70930528	70930528	2.03615264594077e-13	116124007	116124007
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0379	2.03615264594077e-13	116124007	116124007	5.69560948934317e-13	116130333	116130333
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	129219834	4961	4813	-0.0028	5.69560948934317e-13	116130333	116130333	1.62694319488287e-14	129219834	129219834
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129221786	129224728	3	3	-0.8946	1.62694319488287e-14	129219834	129219834	9.76088159107151e-14	129224728	129224728
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	137352394	3331	3254	0.0219	9.76088159107151e-14	129224728	129224728	1.18769443779342e-47	137352394	137352394
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.0814	1.18769443779342e-47	137352394	137352394	5.06471523787389e-45	137356880	137356880
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1066	0.0346	5.06471523787389e-45	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	47021415	14531	14186	-8e-04	NA	NA	NA	6.13961691146969e-57	46568496	47057097
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47040444	47938346	47	46	0.4264	6.13961691146969e-57	46568496	47057097	7.92227868373028e-56	47167144	47946216
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47943524	70949263	7097	6921	-0.0103	7.92227868373028e-56	47167144	47946216	1.00391601211509e-11	70947915	70949263
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.703	1.00391601211509e-11	70947915	70949263	7.76778485611726e-13	70960187	70964344
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2835	0.0058	7.76778485611726e-13	70960187	70964344	4.09787084202621e-09	77917870	77917893
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.7009	4.09787084202621e-09	77917870	77917893	1.22032678865689e-09	77928738	77936034
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	87835309	2847	2756	-0.0101	1.22032678865689e-09	77928738	77936034	2.58112371896919e-16	87835309	87835309
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87836745	87838296	2	2	-1.1307	2.58112371896919e-16	87835309	87835309	5.3118825386464e-16	87838296	87838296
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87847532	132797428	16428	16004	-0.0018	5.3118825386464e-16	87838296	87838296	3.90289095214122e-11	132797428	132797428
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.9501	3.90289095214122e-11	132797428	132797428	2.28373116287632e-08	132801463	132802775
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	916	0.0317	2.28373116287632e-08	132801463	132802775	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2075	0.0066	NA	NA	NA	2.36915330288288e-39	5738494	5741031
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6856	2.36915330288288e-39	5738494	5741031	4.87171556754836e-42	5765438	5766615
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	9811055	1752	1719	-0.007	4.87171556754836e-42	5765438	5766615	6.87153292162369e-11	9811055	9811055
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9812637	9815455	2	2	-0.9639	6.87153292162369e-11	9811055	9811055	9.03591294695353e-12	9815455	9815455
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9817028	20799632	4239	4117	-0.0054	9.03591294695353e-12	9815455	9815455	2.12802093134128e-24	20799632	20799632
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-1.1172	2.12802093134128e-24	20799632	20799632	2.27503325178101e-23	20806094	20806094
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	55123719	8757	8549	-0.0088	2.27503325178101e-23	20806094	20806094	3.35420684705301e-47	55114405	55129329
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	37	-0.4555	3.35420684705301e-47	55114405	55129329	5.17417202354681e-48	55203706	55219985
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	99021938	15493	15075	-0.0016	5.17417202354681e-48	55203706	55219985	1.48902064354025e-07	98999593	99032916
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99025912	99074552	23	23	0.2268	1.48902064354025e-07	98999593	99032916	6.96260788176233e-08	99060172	99092970
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	105150478	2064	1996	-0.009	6.96260788176233e-08	99060172	99092970	1.78875325323905e-09	105150478	105150478
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	105153563	105155940	2	2	-0.8783	1.78875325323905e-09	105150478	105150478	3.13867228481425e-10	105155940	105155940
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	105157675	106733851	456	452	-0.0063	3.13867228481425e-10	105155940	105155940	1.93824415439710e-08	106732431	106733851
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106746568	3	3	0.6416	1.9382441543971e-08	106732431	106733851	9.82623065740967e-08	106746568	106747920
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106747920	132421856	9543	9294	-0.0046	9.82623065740967e-08	106746568	106747920	1.39709753125326e-53	132421856	132421856
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	132425384	132438566	7	7	-1.0772	1.39709753125326e-53	132421856	132421856	1.23240358704029e-53	132438566	132438566
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	132441322	134450318	769	750	-0.0017	1.23240358704029e-53	132438566	132438566	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	901	-0.0049	NA	NA	NA	2.15665104552692e-24	2106791	2109441
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.7754	2.15665104552692e-24	2106791	2109441	1.56459385265016e-25	2127537	2128807
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	7884886	2319	2275	0.0023	1.56459385265016e-25	2127537	2128807	2.36397995796919e-09	7843117	7926710
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	8009244	47	46	0.1916	2.36397995796919e-09	7843117	7926710	1.02700172712091e-09	7971343	8028866
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8011957	9523923	449	432	-0.0012	1.02700172712091e-09	7971343	8028866	2.69502973348759e-34	9516067	9531133
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	16	0.5877	2.69502973348759e-34	9516067	9531133	5.84402426796807e-37	9604633	9626623
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	78679297	22797	22189	-0.005	5.84402426796807e-37	9604633	9626623	1.04859544172828e-11	78676440	78679297
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78681634	78686371	3	3	-0.7945	1.04859544172828e-11	78676440	78679297	1.23150466804146e-11	78686371	78688893
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	130943064	18051	17600	-9e-04	1.23150466804146e-11	78686371	78688893	5.6171411206584e-11	130943064	130943064
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	0.9451	5.6171411206584e-11	130943064	130943064	8.25715975833571e-11	130946248	130946248
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	537	0.015	8.25715975833571e-11	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5437	-0.0041	NA	NA	NA	4.88582642388676e-17	33030946	33030946
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.9572	4.88582642388676e-17	33030946	33030946	3.92991054051477e-18	33042557	33042557
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	68138912	11135	10849	-0.0091	3.92991054051477e-18	33042557	33042557	4.35705743892958e-12	68134536	68142120
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68142120	68163523	11	10	0.4193	4.35705743892958e-12	68134536	68142120	2.20679314016638e-12	68161714	68168882
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	97327189	8737	8502	-0.0128	2.20679314016638e-12	68161714	68168882	1.78031004444946e-11	97321844	97327189
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-0.9446	1.78031004444946e-11	97321844	97327189	5.93057756348124e-12	97330568	97330568
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	100690991	1597	1557	0.0055	5.93057756348124e-12	97330568	97330568	0	100690991	100690991
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.8583	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	100695073	1	0	NA	0	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100696985	114123340	4561	4434	-0.0045	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40676611	7648	7447	0.0045	NA	NA	NA	2.27036946669972e-19	40663660	40676611
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.5468	2.27036946669972e-19	40663660	40676611	8.13249289220351e-16	40726930	40741934
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69084841	9971	9713	-0.0039	8.1324928922035e-16	40726930	40741934	2.30120108202823e-18	69084841	69084841
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69086125	69086125	1	0	NA	2.30120108202823e-18	69084841	69084841	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-0.9701	NA	NA	NA	3.04040468139341e-18	69092211	69092211
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	85526127	6375	6214	-0.0082	3.04040468139341e-18	69092211	69092211	1.99028879935727e-38	85526127	85526127
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85531343	85557854	6	6	-0.9869	1.99028879935727e-38	85526127	85526127	7.08649630361854e-36	85557854	85557854
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85567783	105597555	7630	7440	0.006	7.08649630361854e-36	85557854	85557854	1.24306206795488e-17	105594189	105602602
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105681007	14	14	0.4663	1.24306206795488e-17	105594189	105602602	1.98338158029283e-10	105632168	105724133
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105948347	70	65	0.0589	1.98338158029283e-10	105632168	105724133	1.87244925028804e-38	105948347	105948347
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	13	-0.7308	1.87244925028804e-38	105948347	105948347	4.51719393958362e-24	105985458	105994646
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106218059	94	89	0.0109	4.51719393958362e-24	105985458	105994646	1.32256864894287e-16	106214372	106219784
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	0.5876	1.32256864894287e-16	106214372	106219784	7.52554140588861e-30	106253648	106255190
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	-0.0358	7.52554140588861e-30	106253648	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.1293	NA	NA	NA	7.66030184898864e-06	18692865	18749895
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	18837737	9	9	-0.6312	7.66030184898864e-06	18692865	18749895	6.95377375665354e-05	18831600	18837737
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-0.1075	6.95377375665354e-05	18831600	18837737	1.04769033232802e-05	18848213	18857376
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	20088256	137	133	-0.7245	1.04769033232802e-05	18848213	18857376	0	20079935	20308014
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	30325	-0.0012	0	20079935	20308014	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2593067	1012	977	0.0198	NA	NA	NA	1.2222607567493e-13	2587173	2638581
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2600740	2672074	11	11	0.5014	1.2222607567493e-13	2587173	2638581	5.12723545146715e-17	2666932	2677004
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2677004	14687636	4444	4327	0.0079	5.12723545146715e-17	2666932	2677004	8.96144289765624e-12	14674185	14956252
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	14876356	1	0	NA	8.96144289765624e-12	14674185	14956252	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.3584	NA	NA	NA	2.34038738479942e-11	15023848	15039224
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	27243115	3635	3540	-0.001	2.34038738479942e-11	15023848	15039224	6.01922343891643e-22	27243115	27243115
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	27244587	27256211	6	5	-0.8222	6.01922343891643e-22	27243115	27243115	4.36952109587161e-21	27256211	27256211
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	27259091	32379126	1450	1410	0.0056	4.36952109587161e-21	27256211	27256211	1.14307810300965e-12	31835555	32527388
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	42	0.231	1.14307810300965e-12	31835555	32527388	1.48950564779551e-14	33525500	33868686
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	54352394	3079	3004	0.0034	1.48950564779551e-14	33525500	33868686	1.18661068785101e-15	54348362	54363713
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.4796	1.18661068785101e-15	54348362	54363713	7.9914720298646e-08	54376805	54379839
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.5877	7.9914720298646e-08	54376805	54379839	6.83102046081909e-13	54402057	54410800
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	68533486	4572	4447	0.0046	6.83102046081909e-13	54402057	54410800	1.00016543878968e-11	68529419	68623996
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68534289	68753209	25	24	-0.2745	1.00016543878968e-11	68529419	68623996	1.73704918691818e-11	68734100	68851938
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72917554	1452	1410	-0.0062	1.73704918691818e-11	68734100	68851938	1.64142607632685e-11	72914152	72918129
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72918129	72964783	8	8	-0.4675	1.64142607632685e-11	72914152	72918129	1.67752796368757e-12	72963578	73030029
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	73022578	1	0	NA	1.67752796368757e-12	72963578	73030029	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73025340	73789765	316	308	0.0016	NA	NA	NA	1.42247246084449e-06	73783225	73805719
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73792179	73812685	9	9	-0.3339	1.42247246084449e-06	73783225	73805719	1.94938222937591e-06	73795489	73820478
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73815706	75093957	428	420	0.0051	1.94938222937591e-06	73795489	73820478	0	75093957	75093957
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-4.1667	0	75093957	75093957	0	75100865	75100865
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	0	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	88690571	5130	5003	0.0093	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31461588	12038	11714	0.0096	NA	NA	NA	2.47990815039788e-21	31451114	31462463
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31503774	18	18	-0.4247	2.47990815039788e-21	31451114	31462463	1.07219812074609e-20	31499568	31891535
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1764	0.0128	1.07219812074609e-20	31499568	31891535	8.43984001291205e-18	36672710	36673853
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.7147	8.43984001291205e-18	36672710	36673853	4.83055020852385e-18	36684619	36686013
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78637954	15756	15338	0.0094	4.83055020852385e-18	36684619	36686013	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78653545	78653545	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	32065820	9847	9581	-0.0052	NA	NA	NA	6.00207055948204e-10	32065820	32065820
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32082834	32082850	2	2	0.8807	6.00207055948204e-10	32065820	32065820	3.46195947237763e-10	32082850	32082850
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32085209	53092949	6350	6193	-0.0075	3.46195947237763e-10	32082850	32082850	2.79729486728353e-10	53092949	53092949
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-0.9009	2.79729486728353e-10	53092949	53092949	1.82079888075816e-10	53099601	53099601
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6568	-9e-04	1.82079888075816e-10	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	40352568	12609	12292	0.0176	NA	NA	NA	9.90027727958875e-12	40352568	40352568
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.0119	9.90027727958875e-12	40352568	40352568	5.78302051423374e-12	40356341	40356341
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	63788698	10448	10191	0.0038	5.78302051423374e-12	40356341	40356341	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	573	0.0182	NA	NA	NA	0	1511632	1515948
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	8	-3.2092	0	1511632	1515948	0	1528899	1531162
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	43633334	14118	13741	-8e-04	0	1528899	1531162	1.68374870221454e-10	43633334	43633334
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43637768	43638107	2	2	-0.9279	1.68374870221454e-10	43633334	43633334	4.8071069933289e-11	43638107	43638107
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43640726	52080395	3126	3041	0.0027	4.8071069933289e-11	43638107	43638107	3.69048507446877e-29	52080395	52080395
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.9391	3.69048507446877e-29	52080395	52080395	1.58985381092202e-27	52090393	52090393
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3631	0.0117	1.58985381092202e-27	52090393	52090393	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	43980496	12064	11750	-0.0038	NA	NA	NA	2.46487275630015e-14	43980496	43980496
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43984707	43985080	2	2	-1.0722	2.46487275630015e-14	43980496	43980496	3.59078153490967e-12	43985080	43985080
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43986033	46922972	1375	1341	0.0288	3.59078153490967e-12	43985080	43985080	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2908	0.0141	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-3.8126	0	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6361	0.0063	0	22720195	22725305	1.48898274972789e-28	35472378	35472378
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.5126	1.48898274972789e-28	35472378	35472378	8.48974691558639e-26	35476942	35476942
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6800	0.0172	8.48974691558639e-26	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.1715	NA	NA	NA	2.07805392035029e-18	94062	94062
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	106242	8	8	0.5829	2.07805392035029e-18	94062	94062	6.09013747245395e-17	106242	108902
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	2302065	1386	1350	-0.0019	6.09013747245395e-17	106242	108902	7.78630298471409e-26	2302065	2302065
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0164	7.78630298471409e-26	2302065	2302065	3.74668806491722e-27	2304398	2304398
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2674962	366	360	0.002	3.74668806491722e-27	2304398	2304398	4.82975760025221e-09	2671030	2696434
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2676476	2708291	23	23	-0.2607	4.82975760025221e-09	2671030	2696434	4.2695908360543e-179	2708291	2708291
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	153329988	44718	43537	0.9911	4.2695908360543e-179	2708291	2708291	5.44061789485557e-13	153329988	153329988
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153333629	2	2	-0.0361	5.44061789485557e-13	153329988	153329988	1.12601739493886e-07	153333629	153335752
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153335752	154038318	281	275	0.96	1.12601739493886e-07	153333629	153335752	1.39832905524308e-37	154037006	154038318
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	11	0.0191	1.39832905524308e-37	154037006	154038318	3.63018579072543e-53	154079002	154079002
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	114	1.0012	3.63018579072543e-53	154079002	154079002	0	154582414	154582414
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	0.0016	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2775895	28	27	-4.6368	NA	NA	NA	0.000104411257306205	2756034	2777308
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2777308	2784560	7	7	-2.8924	0.000104411257306205	2756034	2777308	1.55505020743131e-19	2784560	2784560
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	2817193	15	15	-5.0106	1.55505020743131e-19	2784560	2784560	6.61393771377809e-06	2817193	2834262
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2819272	2819272	1	0	NA	6.61393771377809e-06	2817193	2834262	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2824225	2865081	18	16	-3.7071	NA	NA	NA	0.146674457871071	2827298	2868108
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2865932	2875705	8	8	-4.539	0.146674457871071	2827298	2868108	0.000115882456994898	2868108	2876787
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2876787	2888494	9	9	-5.6323	0.000115882456994898	2868108	2876787	1.38687299812354e-05	2887698	2899298
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2890269	4174561	43	41	-4.6062	1.38687299812354e-05	2887698	2899298	2.30599508283465e-31	4174561	4413507
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.4034	2.30599508283465e-31	4174561	4413507	3.02153235200836e-15	5422507	6652845
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-4.2892	3.02153235200836e-15	5422507	6652845	4.8307850964603e-11	7034323	7196517
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	116	-3.1711	4.8307850964603e-11	7034323	7196517	2.61999549930937e-05	7338262	7581867
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7713973	76	73	-4.2003	2.61999549930937e-05	7338262	7581867	0.00876255856237436	7663037	7836700
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7714929	8043008	89	88	-3.5427	0.00876255856237436	7663037	7836700	1.77976599060520e-06	7964586	8057124
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8047462	8174858	31	30	-4.7943	1.7797659906052e-06	7964586	8057124	8.6341189025444e-05	8141547	8179883
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8176058	8176058	1	0	NA	8.6341189025444e-05	8141547	8179883	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8178487	8208164	11	11	-3.8239	NA	NA	NA	1.94177361690368e-06	8201959	8212681
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8211300	8229100	8	7	-4.8675	1.94177361690368e-06	8201959	8212681	0.194154636879536	8225409	8568582
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8230756	8681965	117	114	-3.874	0.194154636879536	8225409	8568582	0.00087817583230787	8527977	8712094
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	8943871	81	79	-4.4465	0.00087817583230787	8527977	8712094	9.20626772648775e-09	8935134	8943871
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8949553	8956787	4	4	-1.9671	9.20626772648775e-09	8935134	8943871	3.40728319275649e-10	8956787	8958121
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10515697	112	105	-4.5395	3.40728319275649e-10	8956787	8958121	7.3829970410939e-70	10515697	10515697
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10631941	11	11	-0.5184	7.3829970410939e-70	10515697	10515697	0.0374943333367022	10598354	10645500
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	11673476	6	5	-1.0474	0.0374943333367022	10598354	10645500	5.48335242673237e-15	11673476	11698871
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12537944	12	10	-4.7228	5.48335242673237e-15	11673476	11698871	9.20619276781267e-05	12533900	12556034
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	53	-2.567	9.20619276781267e-05	12533900	12556034	4.25628462909578e-05	12618263	12733867
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12926941	56	54	-3.7796	4.25628462909578e-05	12618263	12733867	0.000319452389689758	12888523	12980114
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13104920	70	70	-2.7489	0.000319452389689758	12888523	12980114	0.191788637830455	12970269	13111594
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.5813	0.191788637830455	12970269	13111594	5.38565811340515e-23	13121152	13128515
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-4.7888	5.38565811340515e-23	13121152	13128515	0.000956801927595877	13149825	13173328
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13262997	33	33	-3.5802	0.000956801927595877	13149825	13173328	5.31685666309054e-10	13238502	13286708
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14122129	332	323	-4.605	5.31685666309054e-10	13238502	13286708	1.27383961899085e-08	14118164	14122129
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.656	1.27383961899085e-08	14118164	14122129	1.29625087687080e-09	14143748	14169526
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14328579	21	21	-4.4752	1.2962508768708e-09	14143748	14169526	0.000167530123557352	14320016	14330251
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14330251	14352278	10	9	-5.553	0.000167530123557352	14320016	14330251	1.13443788170942e-12	14352278	14354682
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14380301	16	16	-3.0569	1.13443788170942e-12	14352278	14354682	0.00507208418777946	14368151	14409975
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14508021	77	74	-3.9924	0.00507208418777946	14368151	14409975	7.26360295873875e-20	14506319	14508021
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	7.26360295873875e-20	14506319	14508021	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	11	-1.2005	NA	NA	NA	0.0048460983352290	14539230	14566592
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14644293	23	23	-3.0268	0.004846098335229	14539230	14566592	5.93260463237592e-06	14569287	14695441
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14681738	1	0	NA	5.93260463237592e-06	14569287	14695441	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	15208612	142	141	-4.3069	NA	NA	NA	4.43217880114652e-06	15201695	15223545
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	10	-2.478	4.43217880114652e-06	15201695	15223545	1.00934808344762e-05	15223545	15249591
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15523178	165	159	-4.1478	1.00934808344762e-05	15223545	15249591	5.44851946758377e-05	15472479	15554463
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15587741	35	34	-3.2065	5.44851946758377e-05	15472479	15554463	0.00337763073564822	15559959	15587741
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15617621	5	5	-5.439	0.00337763073564822	15559959	15587741	0.000154725315243264	15614125	15639408
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15621613	15690301	13	12	-3.9681	0.000154725315243264	15614125	15639408	5.67976784850026e-06	15675166	15699459
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15761232	11	11	-5.252	5.67976784850026e-06	15675166	15699459	0.000190759740823912	15734650	15780423
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15765251	15821860	11	11	-4.3047	0.000190759740823912	15734650	15780423	1.78385229700224e-06	15807366	15829553
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15826121	15915466	14	14	-5.4125	1.78385229700224e-06	15807366	15829553	9.18023866131568e-11	15915466	15937162
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16062961	54	50	-2.9434	9.18023866131568e-11	15915466	15937162	0.000104983366438659	16007396	16082040
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16064208	16215750	72	68	-3.9667	0.000104983366438659	16007396	16082040	0.00140554477257677	16143653	16457556
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16217583	16217583	1	0	NA	0.00140554477257677	16143653	16457556	NA	NA	NA
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	19610243	412	395	-4.5014	NA	NA	NA	1.15968923038188e-08	19606814	19610243
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.1994	1.15968923038188e-08	19606814	19610243	1.80111088998737e-15	19613864	19613864
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	19813320	61	57	-4.5375	1.80111088998737e-15	19613864	19613864	0.0100878571301960	19687436	19926729
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19818734	20084862	35	35	-3.9901	0.010087857130196	19687436	19926729	8.21930872548897e-05	19989200	20116319
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20086711	20384639	119	116	-4.7255	8.21930872548897e-05	19989200	20116319	4.651263727588e-07	20367138	20384639
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20387629	20393111	3	2	-1.3696	4.651263727588e-07	20367138	20384639	7.84883638024391e-06	20393111	20428887
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20400879	21036503	74	71	-4.4715	7.84883638024391e-06	20393111	20428887	2.13614486915006e-08	21036411	21036503
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21047798	4	3	-1.429	2.13614486915006e-08	21036411	21036503	3.638807720785e-08	21047798	21048365
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21048365	21497583	142	135	-4.4376	3.638807720785e-08	21047798	21048365	7.30934222482552e-09	21490803	21497583
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21559551	4	4	-1.717	7.30934222482552e-09	21490803	21497583	6.36572974502442e-10	21559551	21569358
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21569358	22165808	120	115	-4.3305	6.36572974502442e-10	21559551	21569358	8.96671904528293e-12	22157319	22166564
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22166564	22177335	6	6	-1.946	8.96671904528293e-12	22157319	22166564	9.8837741297057e-15	22176501	22178964
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	89	-4.731	9.8837741297057e-15	22176501	22178964	5.20785204939763e-101	22926726	25737663
MSK_252152914242_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	79	-1.3508	5.20785204939763e-101	22926726	25737663	NA	NA	NA
