Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12793354	4518	4408	0.0014	NA	NA	NA	1.35313456427143e-08	12790795	12793354
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12831942	12835156	2	2	-0.9487	1.35313456427143e-08	12790795	12793354	3.5567130096681e-08	12835156	12839991
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	36361655	9015	8791	-0.0046	3.5567130096681e-08	12835156	12839991	3.14571198780109e-08	36361655	36361655
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36362761	36364509	2	2	0.9423	3.14571198780109e-08	36361655	36361655	1.23538907754327e-08	36364509	36364509
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36366824	72537426	14357	14007	-0.0023	1.23538907754327e-08	36364509	36364509	0	72537426	72537426
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-4.2643	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	11145	0.0046	0	72579311	72579311	2.11419119575285e-10	109373255	109373255
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.9983	2.11419119575285e-10	109373255	109373255	2.39024250002078e-11	109376249	109376249
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110015739	294	290	-6e-04	2.39024250002078e-11	109376249	109376249	9.66533920984963e-12	110014625	110015739
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110023268	110041712	5	5	0.6499	9.66533920984963e-12	110014625	110015739	6.02725645100332e-11	110041712	110058441
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	146294654	4553	4440	-0.0069	6.02725645100332e-11	110041712	110058441	5.49280855725389e-30	146279228	147306304
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147847659	40	39	-0.3912	5.49280855725389e-30	146279228	147306304	5.92858713051971e-32	147510532	148084402
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	151026228	1345	1306	0.003	5.92858713051971e-32	147510532	148084402	4.34146230640712e-12	151024118	151026228
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7578	4.34146230640712e-12	151024118	151026228	9.02526025607923e-11	151036435	151038091
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2611	-0.0042	9.02526025607923e-11	151036435	151038091	5.16772774397229e-21	157133150	157133150
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.4827	5.16772774397229e-21	157133150	157133150	6.94919274287731e-23	157136342	157136342
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4014	-0.0081	6.94919274287731e-23	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.5245	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7041	-0.0051	0	167507898	167507898	2.70002387790091e-17	185979586	185979586
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.2543	2.70002387790091e-17	185979586	185979586	1.72558133333163e-17	185988138	185988138
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1927	0.0081	1.72558133333163e-17	185988138	185988138	0	194978218	194978218
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195062793	8	8	-4.0922	0	194978218	194978218	0	195062793	195062793
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195065867	246648963	19461	19005	-0.0046	0	195062793	195062793	7.40230330644357e-08	246516224	246676851
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246668425	246702361	12	12	-0.1891	7.40230330644357e-08	246516224	246676851	2.16395353426029e-09	246702361	246751473
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246713340	246862029	35	33	0.3586	2.16395353426029e-09	246702361	246751473	4.35398273243648e-12	246847818	246878405
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	95	0.0152	4.35398273243648e-12	246847818	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13410506	4209	4103	-0.0027	NA	NA	NA	1.32966718854216e-09	13403868	13410506
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13430872	13454720	3	3	-0.8006	1.32966718854216e-09	13403868	13410506	1.37438420577745e-09	13454720	13461042
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13461042	20231737	1664	1616	-0.0142	1.37438420577745e-09	13454720	13461042	6.14099669674069e-19	20231737	20231737
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.3511	6.14099669674069e-19	20231737	20231737	6.31240986845128e-18	20236210	20236210
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	33076512	4998	4880	-0.0068	6.31240986845128e-18	20236210	20236210	3.11161499031015e-11	33076512	33076512
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.0676	3.11161499031015e-11	33076512	33076512	1.90699525997981e-12	33080437	33080437
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	33081681	1	0	NA	1.90699525997981e-12	33080437	33080437	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33083568	34543992	643	631	-0.0178	NA	NA	NA	6.60614895442769e-22	34539740	34554208
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.4693	6.60614895442769e-22	34539740	34554208	2.89946884716371e-18	34580533	34595734
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35818921	483	471	-0.0011	2.89946884716371e-18	34580533	34595734	4.98744853103896e-16	35818921	35818921
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35821494	35844884	3	3	1.0554	4.98744853103896e-16	35818921	35818921	1.71200699936296e-17	35844884	35844884
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	1.71200699936296e-17	35844884	35844884	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	89902365	18329	17912	0.0024	NA	NA	NA	1.85896614221877e-11	89877995	91127894
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	94892766	17	17	-0.3602	1.85896614221877e-11	89877995	91127894	1.16586189068475e-10	94784165	94942193
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94920265	146571330	14701	14348	-0.0045	1.16586189068475e-10	94784165	94942193	5.04861205400171e-09	146562545	146571330
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.6833	5.04861205400171e-09	146562545	146571330	5.86376147353141e-10	146592775	146597405
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	178545984	10664	10421	3e-04	5.86376147353141e-10	146592775	146597405	1.54227809280556e-09	178544895	178545984
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178552260	178555242	3	3	-0.7735	1.54227809280556e-09	178544895	178545984	8.15104144895027e-09	178555242	178556781
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178556781	242496751	22014	21538	4e-04	8.15104144895027e-09	178555242	178556781	2.95618652953406e-18	242478404	242521765
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242501239	242686945	67	65	0.234	2.95618652953406e-18	242478404	242521765	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10541	-0.0066	NA	NA	NA	3.38754328758634e-29	32074432	32074432
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.6352	3.38754328758634e-29	32074432	32074432	9.6545360600763e-28	32080848	32080848
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5285	-0.0094	9.6545360600763e-28	32080848	32080848	1.37090323142169e-12	47460892	47460892
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.1129	1.37090323142169e-12	47460892	47460892	1.26121882186188e-12	47466921	47466921
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	89475107	14421	14066	-0.004	1.26121882186188e-12	47466921	47466921	2.28505037432328e-54	89475107	89475107
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.8924	2.28505037432328e-54	89475107	89475107	6.17249675809351e-59	89500935	89500935
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	89502757	1	0	NA	6.17249675809351e-59	89500935	89500935	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89504141	116136208	6576	6429	0.0024	NA	NA	NA	1.89991680034447e-20	116136208	116136208
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116137442	116137442	1	0	NA	1.89991680034447e-20	116136208	116136208	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116140997	116146946	4	4	-0.9574	NA	NA	NA	9.12712253641393e-20	116146946	116146946
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116155373	122247183	1893	1835	-0.0074	9.12712253641393e-20	116146946	116146946	2.94355591269178e-07	122244291	122257830
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	122251797	122299637	9	9	0.3854	2.94355591269178e-07	122244291	122257830	5.3935873276129e-07	122259452	122314149
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	122301126	133189686	4571	4462	-0.0101	5.3935873276129e-07	122259452	122314149	9.35085062535607e-33	133189686	133189686
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.7465	9.35085062535607e-33	133189686	133189686	2.31631644244179e-32	133194685	133194685
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	2.31631644244179e-32	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	150443815	5400	5286	0.0022	NA	NA	NA	2.37472666597413e-09	150441598	150443815
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150446135	150448380	2	2	-0.9567	2.37472666597413e-09	150441598	150443815	5.39102860268741e-10	150448380	150448380
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150453399	164005577	4377	4273	0.0018	5.39102860268741e-10	150448380	150448380	2.02617933580383e-131	164005577	164005577
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.1484	2.02617933580383e-131	164005577	164005577	1.21051524552584e-24	164023502	164027724
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	0.5374	1.21051524552584e-24	164023502	164027724	7.12733624817388e-30	164105613	164115417
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9329	0.0083	7.12733624817388e-30	164105613	164115417	9.39500784118658e-11	192544305	192546280
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.6971	9.39500784118658e-11	192544305	192546280	5.27641353774661e-11	192552734	192554451
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	565	-0.009	5.27641353774661e-11	192552734	192554451	0	194354505	194354505
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.8641	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	198038358	1457	1432	-0.005	0	194366950	194366950	1.76764394141780e-07	198036999	198038358
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.885	1.7676439414178e-07	198036999	198038358	8.44591382759993e-08	198042681	198044259
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	198534609	202	200	0.0154	8.44591382759993e-08	198042681	198044259	3.98824553532018e-10	198534609	198534609
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198537274	198540676	2	2	-1.0091	3.98824553532018e-10	198534609	198534609	4.84192895271293e-09	198540676	198542488
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198542488	199329592	317	305	-0.008	4.84192895271293e-09	198540676	198542488	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	58159	8	8	-0.506	NA	NA	NA	5.5280287019803e-11	58159	71148
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	9815760	3384	3318	0.009	5.5280287019803e-11	58159	71148	4.59914314987201e-13	9800777	9815760
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.8582	4.59914314987201e-13	9800777	9815760	1.44248644204930e-15	9842644	9842644
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	48402366	10725	10476	-1e-04	1.4424864420493e-15	9842644	9842644	6.33673599893441e-10	48400731	48402366
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48404390	48415927	5	5	-0.6212	6.33673599893441e-10	48400731	48402366	1.24026240198813e-09	48415927	48418976
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48418976	191153613	41034	40120	7e-04	1.24026240198813e-09	48415927	48418976	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3881	0.0028	NA	NA	NA	2.51927159988006e-14	12857302	12857302
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.1866	2.51927159988006e-14	12857302	12857302	7.55071374271402e-15	12873052	12873052
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	140200229	36101	35246	-0.0017	7.55071374271402e-15	12873052	12873052	2.98664154975564e-32	140198797	140200229
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.8126	2.98664154975564e-32	140198797	140200229	1.70866563647157e-30	140216524	140219465
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180644810	13679	13331	-0.0061	1.70866563647157e-30	140216524	140219465	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29981912	10593	10350	-0.0028	NA	NA	NA	7.72021274188046e-09	29973024	29992946
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29985620	30000990	6	6	0.5401	7.72021274188046e-09	29973024	29992946	2.12028108001339e-07	29992946	30005338
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30004636	31889575	788	769	-0.0049	2.12028108001339e-07	29992946	30005338	5.2769454900687e-15	31887126	31889575
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31893557	31902818	6	6	-0.7668	5.2769454900687e-15	31887126	31889575	6.76651985313948e-13	31902818	31905636
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31905636	32558677	284	278	-0.0327	6.76651985313948e-13	31902818	31905636	3.90952498646324e-80	32558677	32563252
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32588005	4	3	-2.7919	3.90952498646324e-80	32558677	32563252	1.12187428946102e-21	32564884	32588005
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32713363	41	40	-0.1282	1.12187428946102e-21	32564884	32588005	3.15327038653083e-05	32700719	32713363
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.5587	3.15327038653083e-05	32700719	32713363	2.79133814642424e-11	32728487	32732764
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862502	1346	1324	-0.0092	2.79133814642424e-11	32728487	32732764	9.65061735008718e-11	35862270	35866245
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35864636	1	0	NA	9.65061735008718e-11	35862270	35866245	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35866245	35873335	5	5	-0.7113	NA	NA	NA	5.18947902564785e-13	35872078	35875112
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6734	-0.004	5.18947902564785e-13	35872078	35875112	2.15748361137212e-39	54035000	54035000
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.5577	2.15748361137212e-39	54035000	54035000	8.28643423218166e-40	54042734	54042734
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6275	0.002	8.28643423218166e-40	54042734	54042734	5.84142325072583e-17	79011979	79024557
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	0.5157	5.84142325072583e-17	79011979	79024557	8.4071704134337e-18	79079988	79101978
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	711	-0.0053	8.4071704134337e-18	79079988	79101978	6.84640829263757e-18	81334248	81334248
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-1.0439	6.84640829263757e-18	81334248	81334248	1.78996403313268e-18	81348170	81348170
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	103841482	6031	5883	0.0088	1.78996403313268e-18	81348170	81348170	0	103841482	103841482
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.5379	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22371	-0.0037	0	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	125831554	42438	41447	8e-04	NA	NA	NA	4.08664804468583e-171	125831554	125831554
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.2771	4.08664804468583e-171	125831554	125831554	4.56497473596895e-169	125837524	125837524
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3563	-0.0041	4.56497473596895e-169	125837524	125837524	0	133433384	133433384
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.7103	0	133433384	133433384	7.99574663373099e-150	133448277	133448277
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133780869	169	167	0.0071	7.99574663373099e-150	133448277	133448277	2.94919900407399e-38	133780869	133783586
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133783586	133811538	12	12	-0.8401	2.94919900407399e-38	133780869	133783586	2.16839560494490e-46	133810168	133811538
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133815249	141410894	3519	3440	4e-04	2.1683956049449e-46	133810168	133811538	5.88734628251505e-06	141394308	141419692
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.2895	5.88734628251505e-06	141394308	141419692	8.79239362551282e-07	141431668	141452085
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	116	-0.0114	8.79239362551282e-07	141431668	141452085	1.01979644148290e-38	141690753	141698634
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	0.8879	1.0197964414829e-38	141690753	141698634	3.11547204743467e-30	141709835	141711513
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	158821263	6754	6577	0.0023	3.11547204743467e-30	141709835	141711513	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7156900	2392	2348	-7e-04	NA	NA	NA	5.05102785540366e-15	6926661	7322035
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.5698	5.05102785540366e-15	6926661	7322035	1.00235312971041e-14	7709141	8137794
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5608	0.0064	1.00235312971041e-14	7709141	8137794	3.2241134399357e-172	25022606	25030003
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-3.379	3.2241134399357e-172	25022606	25030003	4.73209666372518e-183	25034970	25039370
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	40892587	5442	5309	-0.002	4.73209666372518e-183	25034970	25039370	1.73715348115926e-294	40892587	40892587
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.1594	1.73715348115926e-294	40892587	40892587	1.84197375423571e-293	40897469	40897469
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	40904488	1	0	NA	1.84197375423571e-293	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40911342	85422157	11661	11386	-0.0014	NA	NA	NA	6.74442892172867e-27	85422157	85422157
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	5	-1.0021	6.74442892172867e-27	85422157	85422157	7.60999057885217e-26	85431319	85431319
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	85434122	1	0	NA	7.60999057885217e-26	85431319	85431319	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85436597	146264846	19322	18897	-0.0065	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	39091349	12729	12420	0.0012	NA	NA	NA	5.18360245447585e-19	38745124	43644906
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39130211	70225166	34	33	-0.3299	5.18360245447585e-19	38745124	43644906	3.49496883433561e-15	70207320	70229901
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70227334	70926188	309	297	-0.0054	3.49496883433561e-15	70207320	70229901	3.68266763831945e-28	70926188	70926188
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.8569	3.68266763831945e-28	70926188	70926188	4.91539839729121e-39	70930528	70930528
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	93434678	7285	7116	-0.003	4.91539839729121e-39	70930528	70930528	1.60116235664928e-13	93434678	93434678
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93436073	93439862	3	3	-0.9028	1.60116235664928e-13	93434678	93434678	2.80485761369051e-12	93439862	93445852
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93443960	93443960	1	0	NA	2.80485761369051e-12	93439862	93445852	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93445852	116124007	8179	8005	-0.0026	NA	NA	NA	1.34474148066734e-11	116124007	116124007
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0757	1.34474148066734e-11	116124007	116124007	7.12118768313394e-12	116130333	116130333
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	129219834	4961	4853	-0.0099	7.12118768313394e-12	116130333	116130333	6.0605858528157e-14	129219834	129219834
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129221786	129224728	3	3	-0.9496	6.0605858528157e-14	129219834	129219834	5.34014597646383e-12	129224728	129224728
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	137352394	3331	3257	0.0043	5.34014597646383e-12	129224728	129224728	2.58266414075863e-47	137352394	137352394
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.2833	2.58266414075863e-47	137352394	137352394	1.02218298462899e-46	137356880	137356880
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1076	-0.0053	1.02218298462899e-46	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	42519043	13605	13285	-0.0023	NA	NA	NA	7.88281908175312e-10	42500743	42530047
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	42522711	42576282	19	18	0.3284	7.88281908175312e-10	42500743	42530047	1.79066577085401e-09	42563921	42600025
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	42583626	42583626	1	0	NA	1.79066577085401e-09	42563921	42600025	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	42586761	45489823	832	812	3e-04	NA	NA	NA	5.48650849005086e-20	45464831	46394835
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47057097	76	73	-0.2432	5.48650849005086e-20	45464831	46394835	1.53578582301212e-18	46556477	47080155
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47058901	51881155	971	946	-0.0046	1.53578582301212e-18	46556477	47080155	7.2193143319361e-13	51881155	51881155
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51883696	51886109	2	2	-1.1693	7.2193143319361e-13	51881155	51881155	3.15140105259267e-15	51886109	51886109
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51889743	53683740	796	773	0.0062	3.15140105259267e-15	51886109	51886109	7.91514462495038e-29	53683740	53683740
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-1.6762	7.91514462495038e-29	53683740	53683740	2.25710120459203e-29	53687880	53687880
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	77917893	8288	8079	-0.0044	2.25710120459203e-29	53687880	53687880	7.45139416093616e-161	77917893	77917893
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.1632	7.45139416093616e-161	77917893	77917893	5.02652163280488e-164	77928738	77928738
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	77936034	1	0	NA	5.02652163280488e-164	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77940201	94343730	5110	5003	-0.01	NA	NA	NA	2.94181140192336e-08	94340717	94343730
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94346797	94353740	3	3	-0.738	2.94181140192336e-08	94340717	94343730	5.86961414870317e-08	94353740	94356407
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94356407	124328915	11220	10956	-5e-04	5.86961414870317e-08	94353740	94356407	4.91957750853738e-14	124328915	124328915
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.9615	4.91957750853738e-14	124328915	124328915	9.0818092320821e-14	124340356	124368725
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	127563278	1158	1139	-0.0029	9.0818092320821e-14	124340356	124368725	3.76531291440225e-08	127552919	127569849
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	12	-0.3772	3.76531291440225e-08	127552919	127569849	5.59948221654168e-08	127582694	127608087
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	135285645	2706	2653	-5e-04	5.59948221654168e-08	127582694	127608087	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	417965	84	84	-0.0199	NA	NA	NA	1.9979390326161e-09	416161	420644
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	420644	424510	4	4	0.7006	1.9979390326161e-09	416161	420644	1.26740400350471e-07	423403	434372
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	428782	428782	1	0	NA	1.26740400350471e-07	423403	434372	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	430900	3191670	1133	1106	0.005	NA	NA	NA	3.29240003159268e-07	3191396	3191670
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3194235	3194235	1	0	NA	3.29240003159268e-07	3191396	3191670	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3196874	3200134	2	2	-0.9488	NA	NA	NA	9.68347031014113e-09	3200134	3200134
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	3202804	55118214	15680	15325	-0.0041	9.68347031014113e-09	3200134	3200134	7.31624962594633e-38	55112618	55124730
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.4265	7.31624962594633e-38	55112618	55124730	7.08997858581823e-36	55205278	55221692
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	81177333	9874	9654	-0.0031	7.08997858581823e-36	55205278	55221692	2.65972087804741e-12	81177333	81177333
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-1.1332	2.65972087804741e-12	81177333	81177333	1.40271351654568e-13	81192409	81192409
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	99025912	5618	5483	0.0017	1.40271351654568e-13	81192409	81192409	7.0404994684753e-08	99001305	99030209
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99027331	99074552	22	22	0.2667	7.0404994684753e-08	99001305	99030209	5.15093647571601e-08	99068718	99091528
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	107284914	2769	2700	-3e-04	5.15093647571601e-08	99068718	99091528	1.43005681421225e-87	107284914	107284914
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-2.9586	1.43005681421225e-87	107284914	107284914	1.74717390415677e-91	107292148	107292148
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9830	-0.0055	1.74717390415677e-91	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7884886	3246	3164	-0.0055	NA	NA	NA	4.74290271784829e-09	7854025	7917603
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7890143	7978723	37	34	0.2286	4.74290271784829e-09	7854025	7917603	4.35558092729034e-08	7956956	8009244
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7979868	9523923	459	442	0.0029	4.35558092729034e-08	7956956	8009244	6.64905075386377e-34	9523923	9550789
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	12	0.7761	6.64905075386377e-34	9523923	9550789	3.99826373314355e-38	9573313	9590351
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	132289090	41407	40370	-7e-04	3.99826373314355e-38	9573313	9590351	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7177	-0.0035	NA	NA	NA	6.4967072428697e-89	37953582	37953582
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9386	6.4967072428697e-89	37953582	37953582	1.32815067680657e-93	37957844	37957844
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4766	-0.0032	1.32815067680657e-93	37957844	37957844	3.40872520623839e-107	49964838	49964838
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.1521	3.40872520623839e-107	49964838	49964838	4.14591444184617e-110	49971732	49971732
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	68138912	4512	4409	0.0011	4.14591444184617e-110	49971732	49971732	8.65901619854645e-11	68134536	68144264
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68142120	68163523	11	10	0.4541	8.65901619854645e-11	68134536	68144264	5.7122365910253e-11	68160625	68169957
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	100690991	10336	10081	-6e-04	5.7122365910253e-11	68160625	68169957	0	100690991	100690991
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-6.1353	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4448	-0.0023	0	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18505611	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18508651	19490630	56	53	-0.2389	NA	NA	NA	4.56100611498654e-16	19471494	19543544
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19492531	34674458	5692	5562	0.0082	4.56100611498654e-16	19471494	19543544	2.63885343733113e-12	34674458	34674458
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	0.9177	2.63885343733113e-12	34674458	34674458	1.26514445450972e-13	34683810	34683810
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40680589	1896	1865	0.0082	1.26514445450972e-13	34683810	34683810	1.04301879975399e-14	40676611	40680589
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40726930	7	7	0.6272	1.04301879975399e-14	40676611	40680589	1.30263656230538e-14	40726930	40741934
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	73061942	11763	11444	-1e-04	1.30263656230538e-14	40726930	40741934	2.56927169164787e-14	73060301	73061942
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73101327	9	8	0.5809	2.56927169164787e-14	73060301	73061942	3.77507114121258e-14	73101327	73104540
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	79174722	2913	2840	-0.0038	3.77507114121258e-14	73101327	73104540	6.52013547099184e-216	79174722	79174722
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.17	6.52013547099184e-216	79174722	79174722	1.51946083787852e-200	79183154	79183154
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105632168	9309	9107	-0.0032	1.51946083787852e-200	79183154	79183154	6.13486383714113e-99	105630089	105681007
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	50	0.6295	6.13486383714113e-99	105630089	105681007	1.75592206718571e-53	105850033	105874293
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	106358491	181	175	0.0373	1.75592206718571e-53	105850033	105874293	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0386	NA	NA	NA	1.56325318051196e-10	18452491	18692865
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	145	-1.2356	1.56325318051196e-10	18452491	18692865	0	20079935	20088256
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	50050784	10847	10639	-0.0035	0	20079935	20088256	6.01198524331565e-12	50050476	50050784
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50053032	50059941	3	3	-0.8985	6.01198524331565e-12	50050476	50050784	3.75974995105410e-12	50059941	50059941
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50062594	63326243	5734	5599	-0.0016	3.7597499510541e-12	50059941	50059941	3.32937023543493e-08	63324387	63326243
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63327658	63331733	3	3	-0.7469	3.32937023543493e-08	63324387	63326243	3.82613788491766e-08	63331733	63333032
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63333032	75518598	5310	5185	-5e-04	3.82613788491766e-08	63331733	63333032	1.31555849005338e-13	75518598	75518598
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75519691	75520672	2	2	-1.1661	1.31555849005338e-13	75518598	75518598	4.48737937918176e-14	75520672	75520672
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75521740	100298352	9267	9058	-0.0032	4.48737937918176e-14	75520672	75520672	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	4072412	1621	1585	0.0053	NA	NA	NA	2.89051927212288e-16	4070847	4072412
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4074751	4080313	4	4	-0.9573	2.89051927212288e-16	4070847	4072412	3.4529552837723e-18	4080313	4080313
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4083178	34422716	9096	8897	-0.0026	3.4529552837723e-18	4080313	4080313	5.10333816769942e-08	34359308	34452774
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34432738	34522753	17	17	0.3126	5.10333816769942e-08	34359308	34452774	2.56949357775609e-08	34493798	34539890
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34524439	68712507	7563	7360	-0.0027	2.56949357775609e-08	34493798	34539890	7.88569413292519e-29	68712507	68712507
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68732367	68751390	7	7	-0.8919	7.88569413292519e-29	68712507	68712507	7.70297063548599e-27	68751390	68751390
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68753209	68753209	1	0	NA	7.70297063548599e-27	68751390	68751390	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1426	-0.0195	NA	NA	NA	9.44861023106198e-23	72917554	72918129
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.825	9.44861023106198e-23	72917554	72918129	8.36387130258235e-25	72964783	72964783
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	743	-0.001	8.36387130258235e-25	72964783	72964783	1.58067312983838e-117	75093957	75097331
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.934	1.58067312983838e-117	75093957	75097331	2.42556147963323e-110	75099083	75100865
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	592	-0.0105	2.42556147963323e-110	75099083	75100865	1.09073709726567e-36	76925748	76925748
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9347	1.09073709726567e-36	76925748	76925748	5.06872511822076e-35	76940218	76940218
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4417	-0.0039	5.06872511822076e-35	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31441419	12033	11716	0.0026	NA	NA	NA	1.07101015187075e-14	31431640	31451114
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31443186	31503774	23	22	-0.3684	1.07101015187075e-14	31431640	31451114	2.05907801330261e-16	31490899	31893451
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	359	0.0097	2.05907801330261e-16	31490899	31893451	8.03938196539719e-14	32828797	32828797
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.1221	8.03938196539719e-14	32828797	32828797	1.43949965809408e-13	32832642	32832642
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1410	0.0022	1.43949965809408e-13	32832642	32832642	0	36673853	36673853
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.599	0	36673853	36673853	1.79163069662095e-291	36683509	36683509
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1965	0.0031	1.79163069662095e-291	36683509	36683509	3.673892919801e-76	41519702	41521544
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	19	0.9365	3.673892919801e-76	41519702	41521544	2.55921705112114e-07	41558893	41574775
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41704093	44	44	0.5275	2.55921705112114e-07	41558893	41574775	9.96941173086225e-62	41697532	41708551
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	78653545	13682	13352	0.0019	9.96941173086225e-62	41697532	41708551	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22451	-0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	477	0.0196	NA	NA	NA	1.71416326589635e-11	1398325	1398325
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.2019	1.71416326589635e-11	1398325	1398325	1.85519376638899e-12	1400840	1400840
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	41532062	12654	12345	0.0072	1.85519376638899e-12	1400840	1400840	5.73769776568371e-28	41532062	41532062
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-1.7578	5.73769776568371e-28	41532062	41532062	4.78649072764209e-29	41538649	41538649
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	63788698	9909	9649	-1e-04	4.78649072764209e-29	41538649	41538649	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.0023	NA	NA	NA	1.81230948005358e-46	1506379	1506379
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8815	1.81230948005358e-46	1506379	1506379	1.31596856939695e-40	1532433	1532433
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20485	-0.0053	1.31596856939695e-40	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	13889359	58	55	-0.0805	NA	NA	NA	6.38877380443741e-06	13879604	13889359
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13893162	13992109	5	5	-0.7013	6.38877380443741e-06	13879604	13889359	1.84712047567772e-12	13992109	14047236
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	46922972	13378	13058	-4e-04	1.84712047567772e-12	13992109	14047236	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2925	-0.0062	NA	NA	NA	1.27928578437127e-250	22667608	22667608
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22682428	3	3	-4.2868	1.27928578437127e-250	22667608	22667608	0.000180742154101831	22682428	22682428
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22686690	22702398	7	7	-1.8798	0.000180742154101831	22682428	22682428	1.59657347668165e-13	22702398	22702398
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22704683	22720195	10	9	-4.5411	1.59657347668165e-13	22702398	22702398	7.08630274601118e-17	22720195	22720195
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	22725305	2	2	-1.648	7.08630274601118e-17	22720195	22720195	1.31846411160660e-27	22725305	22725305
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	31794253	4923	4790	0.0017	1.3184641116066e-27	22725305	22725305	1.30415102226108e-08	31788433	31797252
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31796115	31807643	7	7	0.5061	1.30415102226108e-08	31788433	31797252	3.13024058454187e-09	31801995	31816689
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31810213	35472378	1617	1581	-3e-04	3.13024058454187e-09	31801995	31816689	4.37189000717842e-132	35472378	35472378
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4932	4.37189000717842e-132	35472378	35472378	1.14715800934043e-112	35476942	35476942
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1162	-7e-04	1.14715800934043e-112	35476942	35476942	5.67477392783973e-43	37621766	37621766
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.2353	5.67477392783973e-43	37621766	37621766	1.61758092336571e-45	37626069	37626069
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5667	0.0039	1.61758092336571e-45	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	772351	516	506	-0.0446	NA	NA	NA	2.18672879972545e-07	762824	773688
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	773688	793712	16	15	-0.4285	2.18672879972545e-07	762824	773688	8.11145362839456e-11	788996	800669
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	796371	1431411	257	250	-0.0311	8.11145362839456e-11	788996	800669	5.91812967833163e-11	1431411	1431411
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.1086	5.91812967833163e-11	1431411	1431411	1.00246298510123e-10	1432953	1432953
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1691644	214	204	-0.0624	1.00246298510123e-10	1432953	1432953	1.65280917640217e-16	1687568	1693138
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1691671	1712236	19	18	0.3828	1.65280917640217e-16	1687568	1693138	1.01246681785061e-14	1710966	1720574
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1715594	2672401	742	729	-0.0316	1.01246681785061e-14	1710966	1720574	1.85607403857050e-07	2666368	2686115
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2781	1.8560740385705e-07	2666368	2686115	1.79471454842709e-178	2708291	2708291
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	73407324	22263	21737	0.9969	1.79471454842709e-178	2708291	2708291	1.18774071921517e-21	73406753	73407324
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	73407852	73409982	4	4	0.0145	1.18774071921517e-21	73406753	73407324	3.56538091600512e-14	73409982	73410873
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	73410873	76998610	672	657	0.9776	3.56538091600512e-14	73409982	73410873	3.96002125338028e-29	76998610	76998610
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.9159	3.96002125338028e-29	76998610	76998610	3.72684208781478e-40	77010018	77010018
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	77390104	19	19	1.1504	3.72684208781478e-40	77010018	77010018	3.74298774556549e-22	77390104	77390104
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77408943	77410052	2	2	-0.1382	3.74298774556549e-22	77390104	77390104	3.98409568278449e-10	77410052	77410052
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77412083	149329035	20146	19633	1.004	3.98409568278449e-10	77410052	77410052	1.18581121470298e-11	149326902	149332411
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	149331120	149344410	6	6	0.3003	1.18581121470298e-11	149326902	149332411	1.06364743419713e-07	149342737	149347290
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	149346225	154582414	2020	1976	0.9517	1.06364743419713e-07	149342737	149347290	0	154578922	154582414
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	0.0036	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	117	-4.2469	NA	NA	NA	1.95224164561491e-26	2973379	3223585
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	18	-1.2561	1.95224164561491e-26	2973379	3223585	1.32412733386763e-12	4948824	6692482
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7259689	229	224	-3.6655	1.32412733386763e-12	4948824	6692482	5.36630056092352e-11	7249762	7264547
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	23	-1.6593	5.36630056092352e-11	7249762	7264547	0.000330537219243461	7292494	7340782
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7495687	51	49	-3.0991	0.000330537219243461	7292494	7340782	0.000357389618095445	7375948	7614571
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7712882	68	67	-4.1391	0.000357389618095445	7375948	7614571	2.08747677326811e-06	7688718	7751430
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7713973	8036254	89	87	-3.0931	2.08747677326811e-06	7688718	7751430	5.11552118273072e-12	7985612	8057124
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	8280065	60	56	-4.434	5.11552118273072e-12	7985612	8057124	0.00165278711238396	8186463	8486504
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8968640	202	199	-3.8336	0.00165278711238396	8186463	8486504	9.78328445570325e-06	8928870	9069601
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8970039	9160624	28	26	-4.8807	9.78328445570325e-06	8928870	9069601	5.78498181920823e-14	9157232	9171109
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10032083	15	14	-3.091	5.78498181920823e-14	9157232	9171109	4.96504218248291e-06	10014777	10058016
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10049346	10515697	61	59	-4.4549	4.96504218248291e-06	10014777	10058016	2.20269431352761e-42	10513747	10535786
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11698871	18	18	-0.9505	2.20269431352761e-42	10513747	10535786	1.37556406113748e-06	11249952	12532441
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	13104920	192	186	-2.8577	1.37556406113748e-06	11249952	12532441	0.0068280033579313	13035511	13109337
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.3086	0.0068280033579313	13035511	13109337	1.73076272643878e-13	13121152	13129843
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13241181	39	39	-3.6474	1.73076272643878e-13	13121152	13129843	5.8866976721757e-05	13238502	13241682
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13241682	13256555	4	4	-1.5852	5.8866976721757e-05	13238502	13241682	3.70243529232332e-06	13254711	13262997
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14342834	366	356	-4.2499	3.70243529232332e-06	13254711	13262997	9.87895841242348e-11	14321882	14383746
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	94	-3.3754	9.87895841242348e-11	14321882	14383746	6.36719329374623e-05	14500052	14530134
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	10	-1.2974	6.36719329374623e-05	14500052	14530134	0.0038105427402385	14538156	14563486
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14684159	25	24	-3.0512	0.0038105427402385	14538156	14563486	0.221695496624049	14553021	14986956
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14685149	15299931	192	185	-3.6906	0.221695496624049	14553021	14986956	1.07485738858468e-05	15261976	15317370
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15408015	69	68	-4.4583	1.07485738858468e-05	15261976	15317370	0.0241135292615390	15382506	15431247
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15433122	18	18	-3.6513	0.024113529261539	15382506	15431247	0.000518687126665525	15426319	15433122
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.418	0.000518687126665525	15426319	15433122	4.31188009698222e-17	15447091	15447091
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15465021	11	11	-4.5263	4.31188009698222e-17	15447091	15447091	0.000482005258653055	15459443	15467288
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15465845	15499052	13	12	-3.3281	0.000482005258653055	15459443	15467288	0.000146495416045502	15477260	15501930
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15501930	15523178	7	7	-4.512	0.000146495416045502	15477260	15501930	0.0844172900021914	15523178	15559959
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15587741	35	34	-3.0452	0.0844172900021914	15523178	15559959	1.18911515054340e-05	15557173	15621613
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	51	-4.3251	1.1891151505434e-05	15557173	15621613	1.06376578841196e-05	15862122	15975479
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16156464	90	87	-3.2388	1.06376578841196e-05	15862122	15975479	6.11032084942835e-10	16087502	16178192
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16158338	17473674	244	238	-4.1787	6.11032084942835e-10	16087502	16178192	3.08956917602519e-07	17435559	17482749
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17482749	17566412	15	14	-2.571	3.08956917602519e-07	17435559	17482749	0.00053143963749659	17557953	17640348
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17583495	17789346	41	38	-4.0996	0.00053143963749659	17557953	17640348	0.00103879801821312	17767311	17791088
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17791088	17801068	6	6	-1.8522	0.00103879801821312	17767311	17791088	6.91203808443376e-08	17799408	17804686
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17802714	19610243	143	138	-4.185	6.91203808443376e-08	17799408	17804686	9.66930947838204e-08	19608039	19610243
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.2702	9.66930947838204e-08	19608039	19610243	2.33154318429019e-06	19613864	19614809
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036503	292	278	-4.133	2.33154318429019e-06	19613864	19614809	2.39019961910554e-12	21036411	21041164
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.0169	2.39019961910554e-12	21036411	21041164	1.58928430250032e-11	21048365	21054605
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	255	-4.1461	1.58928430250032e-11	21048365	21054605	4.36942139083484e-07	22052726	22158616
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.1339	4.36942139083484e-07	22052726	22158616	7.61233598738832e-20	22176501	22178964
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22367156	31	31	-4.7807	7.61233598738832e-20	22176501	22178964	5.23770202266381e-07	22263267	22367156
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22371003	22388804	6	6	-3.0835	5.23770202266381e-07	22263267	22367156	0.00040276943512161	22388804	22774861
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22393417	22930737	56	48	-4.3488	0.00040276943512161	22388804	22774861	1.72759076723962e-115	22926726	22930737
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0535	1.72759076723962e-115	22926726	22930737	7.98069748785193e-21	26945893	26950080
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.7934	7.98069748785193e-21	26945893	26950080	0.000143316135368724	26957814	26995399
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	11	-1.5046	0.000143316135368724	26957814	26995399	1.45144109941701e-06	27009433	27019256
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.1077	1.45144109941701e-06	27009433	27019256	4.27077029223768e-37	27039222	27039222
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.6021	4.27077029223768e-37	27039222	27039222	2.11345511901992e-17	27137064	27137064
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27167148	2	2	-3.7692	2.11345511901992e-17	27137064	27137064	1.29168038904177e-13	27167148	27172283
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27171797	27171797	1	0	NA	1.29168038904177e-13	27167148	27172283	NA	NA	NA
MSK_252152914287_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	13	-0.6193	NA	NA	NA	NA	NA	NA
