Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	554287	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	736471	6360237	1804	1459	-0.4356	NA	NA	NA	2.69636306431433e-08	6356693	6360237
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	6361493	6368094	2	2	-2.0453	2.69636306431433e-08	6356693	6360237	4.18838048847804e-08	6368094	6368094
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	6369598	12789063	2709	2193	-0.4654	4.18838048847804e-08	6368094	6368094	3.38201098415376e-186	12759176	12839991
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12790795	15005001	477	380	0.1172	3.38201098415376e-186	12759176	12839991	6.06806726249289e-122	14995703	15014690
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15007203	15007203	1	0	NA	6.06806726249289e-122	14995703	15014690	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15008630	17102601	806	652	-0.4451	NA	NA	NA	2.81226836938095e-06	17094475	17102601
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17104345	17107476	2	2	-1.8603	2.81226836938095e-06	17094475	17102601	2.46482539101024e-06	17107476	17112697
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17112697	34876833	7093	5721	-0.458	2.46482539101024e-06	17107476	17112697	3.56964061179788e-29	34876833	34876833
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34878816	34881595	2	2	-3.3967	3.56964061179788e-29	34876833	34876833	9.44031520184108e-28	34881595	34881595
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34883375	35349395	203	173	-0.5093	9.44031520184108e-28	34881595	34881595	3.0271830758471e-131	35342876	35357692
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35351391	35352488	2	0	NA	3.0271830758471e-131	35342876	35357692	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35354551	49243415	5557	4499	0.1534	NA	NA	NA	0	49236088	49255483
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	49250367	72537426	9235	7454	-0.5415	0	49236088	49255483	1.25718138853063e-85	72537426	72540240
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	-2.8096	1.25718138853063e-85	72537426	72540240	8.50447142242618e-86	72568009	72574479
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	8.50447142242618e-86	72568009	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	8938	-0.555	NA	NA	NA	1.78350139585552e-09	108533257	108533257
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-1.9629	1.78350139585552e-09	108533257	108533257	2.50538779760934e-09	108538662	108538662
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	120415520	4403	3522	-0.5471	2.50538779760934e-09	108538662	108538662	3.01945280240091e-87	120410287	120705146
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120705146	142730208	66	48	0.5104	3.01945280240091e-87	120410287	120705146	7.75301032857399e-25	142725580	143631346
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143238284	143238284	1	0	NA	7.75301032857399e-25	142725580	143631346	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143623628	144093719	98	84	-0.147	NA	NA	NA	7.83435498699844e-61	143971430	144099712
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	148648131	866	695	0.5238	7.83435498699844e-61	143971430	144099712	3.04884875867217e-06	148619047	148665315
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148651545	148696780	22	19	0.9672	3.04884875867217e-06	148619047	148665315	2.40042802781263e-05	148680022	148724264
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148698284	150839754	973	774	0.5269	2.40042802781263e-05	148680022	148724264	3.73199202973254e-25	150839754	150839754
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150848509	6	5	2.3263	3.73199202973254e-25	150839754	150839754	0	150848509	150852858
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	150851439	1	0	NA	0	150848509	150852858	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	194977713	16058	12964	0.6078	NA	NA	NA	0	194977713	194977713
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	194978218	194978218	1	0	NA	0	194977713	194977713	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195022854	5	5	-2.8595	NA	NA	NA	1.17333990184056e-93	195022854	195022854
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195046932	195046932	1	0	NA	1.17333990184056e-93	195022854	195022854	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195048208	207609207	4831	3890	0.7559	NA	NA	NA	1.85301837846276e-188	207592087	207638789
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	207616333	208446862	343	262	0.0607	1.85301837846276e-188	207592087	207638789	2.72689204542551e-84	208414070	208475978
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	208451361	247179232	14431	11537	0.5142	2.72689204542551e-84	208414070	208475978	1.40371919653674e-43	247062970	247179232
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247179701	247185356	2	2	1.2384	1.40371919653674e-43	247062970	247179232	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247186514	247186514	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	10043767	3082	2524	0.0943	NA	NA	NA	0	10037330	10048589
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	10045404	18260769	2396	1901	-0.5482	0	10037330	10048589	0	18238495	18276657
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	18265512	32594497	5166	4162	0.1162	0	18238495	18276657	2.83325407292254e-194	32586211	32603374
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	32596488	34543992	878	699	0.5448	2.83325407292254e-194	32586211	32603374	5.37114084087379e-06	34527334	34551222
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34558824	5	5	1.4355	5.37114084087379e-06	34527334	34551222	5.13552107746575e-06	34556434	34566082
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34561038	37789939	1377	1123	0.5476	5.13552107746575e-06	34556434	34566082	5.93156668606623e-07	37769721	37813211
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	24	0.1099	5.93156668606623e-07	37769721	37813211	4.62358471886976e-26	37846240	37876992
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	70333679	11725	9487	0.5569	4.62358471886976e-26	37846240	37876992	0	70325535	70345293
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	70334679	109256825	9984	8072	0.1022	0	70325535	70345293	7.72285136002784e-10	109251012	109261821
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	109259528	109274068	8	8	0.9727	7.72285136002784e-10	109251012	109261821	7.63664733210913e-10	109269041	109282736
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	109275467	109277021	2	0	NA	7.63664733210913e-10	109269041	109282736	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	109279746	122479294	3590	2886	0.1189	NA	NA	NA	0	122450747	122514139
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	122483235	132405798	2112	1709	0.6519	0	122450747	122514139	1.16209596231073e-11	132397397	132405798
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132724793	132739926	6	6	-0.5287	1.16209596231073e-11	132397397	132405798	1.79488501977344e-13	132739926	132747227
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132747227	164977055	10250	8324	0.6792	1.79488501977344e-13	132739926	132747227	0	164929742	165018452
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	164990512	212890878	16527	13346	0.1165	0	164929742	165018452	0	212889077	212890878
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212896080	3	3	-1.2504	0	212889077	212890878	8.27356185423405e-162	212896080	212900857
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212898875	212898875	1	0	NA	8.27356185423405e-162	212896080	212900857	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	8629	0.0548	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	8700	0.173	NA	NA	NA	7.75468018468448e-09	32062765	32074432
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.7886	7.75468018468448e-09	32062765	32074432	5.81946765939401e-09	32080848	32094956
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37955930	1885	1503	0.157	5.81946765939401e-09	32080848	32094956	6.61293903840894e-06	37954819	37955930
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37957762	37961110	4	3	-0.9356	6.61293903840894e-06	37954819	37955930	6.07255251203656e-06	37961110	37964405
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	37963736	2	0	NA	6.07255251203656e-06	37961110	37964405	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37964405	41058947	1100	884	0.1183	NA	NA	NA	1.22346939409013e-11	41053211	41058947
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41067389	41067389	1	0	NA	1.22346939409013e-11	41053211	41058947	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41072537	41117565	7	6	-0.9099	NA	NA	NA	1.49196906654555e-10	41117565	41143429
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41125393	41133707	2	0	NA	1.49196906654555e-10	41117565	41143429	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41143429	75798154	13082	10454	0.1196	NA	NA	NA	6.13487451876626e-10	75784655	75845446
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75799026	76000715	14	14	-0.5362	6.13487451876626e-10	75784655	75845446	6.38881185583506e-151	75874255	76034950
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76006248	114995660	9791	7899	0.1831	6.38881185583506e-151	75874255	76034950	5.5257240608016e-309	114991129	115000161
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	114997783	115641345	304	249	1.049	5.5257240608016e-309	114991129	115000161	5.1905293359796e-121	115632088	115650745
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	115642634	160323692	15309	12376	0.4979	5.1905293359796e-121	115632088	115650745	0	160322296	160326228
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	160326228	169937623	2651	2147	-0.5009	0	160322296	160326228	0	169915257	169947051
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	169944023	169944023	1	0	NA	0	169915257	169947051	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	169947051	176940227	2850	2326	0.6141	NA	NA	NA	5.3995199157625e-19	176931572	176940227
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176940297	176981596	24	21	1.3753	5.3995199157625e-19	176931572	176940227	1.07139898948918e-20	176981596	176994414
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176989205	199329592	7807	6218	0.5981	1.07139898948918e-20	176981596	176994414	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	2726	0.1586	NA	NA	NA	1.21677720608017e-83	9815760	9815760
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.3766	1.21677720608017e-83	9815760	9815760	2.40357886743138e-86	9842644	9842644
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	92057942	22902	18333	0.1623	2.40357886743138e-86	9842644	9842644	0	92047022	92071647
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92061771	94068864	594	470	-0.5483	0	92047022	92071647	7.37359419458754e-11	94068864	94068864
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94070673	94073863	2	0	NA	7.37359419458754e-11	94068864	94068864	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-2.3968	NA	NA	NA	2.0273236527357e-09	94078581	94078581
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	94086315	2	0	NA	2.0273236527357e-09	94078581	94078581	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94088879	94859600	357	273	-0.5386	NA	NA	NA	4.91045697168237e-305	94859600	94869438
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94860974	94864796	3	0	NA	4.91045697168237e-305	94859600	94869438	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94869438	95607072	206	164	-2.3978	NA	NA	NA	7.28025803085342e-05	95585064	95607072
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95609111	95621086	8	7	-1.2153	7.28025803085342e-05	95585064	95607072	1.19771984224561e-06	95621086	95632308
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95625144	95889474	114	93	-2.4109	1.19771984224561e-06	95621086	95632308	0	95878179	95889474
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95892166	138307863	11375	9185	-0.5488	0	95878179	95889474	7.08024391610873e-25	138307863	138307863
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-3.2779	7.08024391610873e-25	138307863	138307863	8.9774109051334e-28	138319409	138319409
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	138324335	1	0	NA	8.9774109051334e-28	138319409	138319409	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138329289	143960078	1864	1506	-0.5114	NA	NA	NA	1.19400096226085e-07	143954496	143960078
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	143961808	143976135	9	7	0.2809	1.19400096226085e-07	143954496	143960078	4.47544082235402e-07	143976135	143985013
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	143979098	143979098	1	0	NA	4.47544082235402e-07	143976135	143985013	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	143981834	173224400	8801	7013	-0.516	NA	NA	NA	1.51010447625721e-09	173224400	173224400
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.2288	1.51010447625721e-09	173224400	173224400	2.40742756486160e-09	173228860	173228860
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	177849869	1524	1214	-0.5164	2.4074275648616e-09	173228860	173228860	3.65099098198347e-09	177849869	177849869
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	177856322	177858064	3	2	-2.2117	3.65099098198347e-09	177849869	177849869	8.16486789821812e-09	177858064	177858064
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	177859471	191133836	3991	3185	-0.5406	8.16486789821812e-09	177858064	177858064	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191153613	191153613	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	220219	40	35	0.9449	NA	NA	NA	2.03918174384482e-09	183280	252311
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	221775	221775	1	0	NA	2.03918174384482e-09	183280	252311	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	223199	8750027	2562	2059	0.5257	NA	NA	NA	2.56962171756308e-12	8744438	8750027
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.6116	2.56962171756308e-12	8744438	8750027	1.81170266080615e-12	8800001	8809384
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	33533052	6638	5336	0.5477	1.81170266080615e-12	8800001	8809384	0	33506224	33550302
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	33535119	52452784	4519	3629	0.1222	0	33506224	33550302	4.06947305116467e-10	52446510	52456634
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52456634	52527648	15	11	-0.6176	4.06947305116467e-10	52446510	52456634	2.80414632140926e-09	52516538	52548698
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52529859	52529859	1	0	NA	2.80414632140926e-09	52516538	52548698	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52544972	67656854	4939	3998	0.1057	NA	NA	NA	0	67641392	67671066
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	67661561	74215886	1487	1191	-0.5738	0	67641392	67671066	5.72591039429757e-44	74215886	74215886
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	74219024	74221728	3	3	-3.5937	5.72591039429757e-44	74215886	74215886	4.60686416478424e-47	74221728	74221728
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	74224010	94452186	6330	5071	-0.5619	4.60686416478424e-47	74221728	74221728	1.40782204913895e-10	94443552	94459507
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94456101	94456101	1	0	NA	1.40782204913895e-10	94443552	94459507	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94457255	94492468	16	13	0.1444	NA	NA	NA	9.2057558490515e-11	94489205	94498950
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	94493818	125619825	8114	6525	-0.5665	9.2057558490515e-11	94489205	94498950	1.83956799101904e-23	125606757	125630695
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	125630695	125759105	18	14	0.4295	1.83956799101904e-23	125606757	125630695	1.77523279296009e-22	125754566	125769344
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	125765443	134570770	3144	2517	-0.5372	1.77523279296009e-22	125754566	125769344	0	134568449	134573587
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	134573587	136085555	521	426	0.5068	0	134568449	134573587	0	136077647	136103931
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	136092670	136096766	2	0	NA	0	136077647	136103931	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	136103931	148169432	4523	3681	-0.5352	NA	NA	NA	0	148167965	148174586
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148174586	149261663	550	434	0.5257	0	148167965	148174586	0	149258096	149266925
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	149263549	149263549	1	0	NA	0	149258096	149266925	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	149266925	150156233	417	337	-0.4528	NA	NA	NA	7.38574549995848e-12	150155049	150181399
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150204134	14	10	-1.2843	7.38574549995848e-12	150155049	150181399	3.55159675693895e-08	150162435	150212516
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	150207307	1	0	NA	3.55159675693895e-08	150162435	150212516	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150209789	150629725	167	133	-0.49	NA	NA	NA	7.40125089825613e-126	150625863	150633608
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150633608	151095344	192	153	0.4992	7.40125089825613e-126	150625863	150633608	4.95975453721085e-265	151093396	151103552
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	151097631	151100695	2	0	NA	4.95975453721085e-265	151093396	151103552	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	151103552	156482484	1681	1377	-0.5299	NA	NA	NA	6.57153433805358e-111	156478859	156482484
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	156490636	156644518	76	59	0.5062	6.57153433805358e-111	156478859	156482484	1.05005002771812e-113	156644518	156646988
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	156645668	156645668	1	0	NA	1.05005002771812e-113	156644518	156646988	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	156646988	172037832	4868	3907	-0.5272	NA	NA	NA	1.24516511007511e-17	172036503	172037832
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172041555	172041555	1	0	NA	1.24516511007511e-17	172036503	172037832	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172044123	172057686	8	6	0.7624	NA	NA	NA	1.80974046163105e-15	172057686	172059628
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172059628	176023172	1160	928	-0.4852	1.80974046163105e-15	172057686	172059628	0	176021562	176030019
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176027129	176984696	411	338	0.5104	0	176021562	176030019	0.00017778824593702	176943291	177040018
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176986754	177310711	17	15	0.0201	0.00017778824593702	176943291	177040018	1.88774358381662e-06	177214164	177327715
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177316379	177485195	43	35	0.5872	1.88774358381662e-06	177214164	177327715	1.19726413950599e-68	177477512	177486686
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177486686	180632269	1275	1034	-0.4655	1.19726413950599e-68	177477512	177486686	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	109360	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	111259	236535	52	42	0.4372	NA	NA	NA	9.13258324316965e-12	224667	241674
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	39	-0.2136	9.13258324316965e-12	224667	241674	1.01007697667377e-33	320854	331014
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	327962	1	0	NA	1.01007697667377e-33	320854	331014	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	26795887	9261	7423	0.5111	NA	NA	NA	2.78263401404836e-08	26774582	26795887
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26797255	26801068	2	0	NA	2.78263401404836e-08	26774582	26795887	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26811016	26861184	5	3	-0.8193	NA	NA	NA	3.5372137920386e-09	26861184	26861184
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	27727572	281	222	0.5006	3.5372137920386e-09	26861184	26861184	2.48522861309359e-06	27703436	27746161
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	27732550	27767270	14	13	1.0509	2.48522861309359e-06	27703436	27746161	6.38903024725215e-06	27744135	27786315
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	27770913	29950805	922	729	0.4904	6.38903024725215e-06	27744135	27786315	2.29472669498768e-11	29939288	29966336
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	29962849	1	0	NA	2.29472669498768e-11	29939288	29966336	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29966336	30010234	14	10	-0.3735	NA	NA	NA	7.69926793197754e-13	30005338	30026699
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	30021908	1	0	NA	7.69926793197754e-13	30005338	30026699	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30025480	32564884	1076	875	0.572	NA	NA	NA	3.69330422770587e-27	32564884	32590568
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32567462	1	0	NA	3.69330422770587e-27	32564884	32590568	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32588005	32600962	6	6	-1.2439	NA	NA	NA	4.87889547487629e-05	32595402	32600962
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32626619	4	4	1.0459	4.87889547487629e-05	32595402	32600962	1.10079192342538e-08	32609525	32709263
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	56465673	9190	7405	0.5196	1.10079192342538e-08	32609525	32709263	0	56445183	56494712
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	56467062	56467062	1	0	NA	0	56445183	56494712	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	56468986	103827105	12317	9909	0.1239	NA	NA	NA	4.85257940018727e-09	103772986	103827105
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103841482	103841482	1	0	NA	4.85257940018727e-09	103772986	103827105	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103873584	5	5	1.1882	NA	NA	NA	1.70565561991126e-09	103873584	103894634
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103882598	139831552	12444	9998	0.1157	1.70565561991126e-09	103873584	103894634	0	139814393	139858983
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139835330	151546355	3836	3071	-0.5633	0	139814393	139858983	2.04062062575751e-33	151546355	151546355
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151549525	151551028	2	2	-3.734	2.04062062575751e-33	151546355	151546355	3.83177200499382e-33	151551028	151551028
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151552684	154670580	1144	934	-0.5597	3.83177200499382e-33	151551028	151551028	2.97043215489593e-05	154659105	154677476
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	154672895	154694300	10	8	0.0926	2.97043215489593e-05	154659105	154677476	3.50367419178950e-10	154691863	154700226
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	154695426	155026717	135	106	-0.6313	3.5036741917895e-10	154691863	154700226	2.51983078354006e-05	154972572	155026717
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155035758	155069447	11	7	-0.0803	2.51983078354006e-05	154972572	155026717	0.000615434174273779	155069447	155088828
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155071882	155157679	40	34	-0.6414	0.000615434174273779	155069447	155088828	1.17128475497716e-05	155155770	155160734
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155159371	155159371	1	0	NA	1.17128475497716e-05	155155770	155160734	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155160734	155163895	3	3	-2.2012	NA	NA	NA	8.46287657996547e-13	155162293	155163895
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155165959	170753106	5287	4244	-0.5586	8.46287657996547e-13	155162293	155163895	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	13233889	4375	3558	0.1163	NA	NA	NA	2.70803580878584e-27	13233889	13233889
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13240376	13249035	3	3	-2.2333	2.70803580878584e-27	13233889	13233889	5.5205638660867e-29	13249035	13249035
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13259733	13259733	1	0	NA	5.5205638660867e-29	13249035	13249035	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13268964	16135701	1009	805	0.1337	NA	NA	NA	4.58169448847501e-27	16135701	16135701
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-2.661	4.58169448847501e-27	16135701	16135701	6.37080300253802e-26	16140018	16140018
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	33154071	6336	5105	0.1113	6.37080300253802e-26	16140018	16140018	3.56063052741401e-09	33151368	33154071
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	33156030	33164840	8	7	1.012	3.56063052741401e-09	33151368	33154071	3.56552577356071e-08	33164840	33181504
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	33180933	33372009	91	73	0.1261	3.56552577356071e-08	33164840	33181504	4.29849550595112e-58	33364065	33380669
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	33373963	43380299	3557	2844	-0.567	4.29849550595112e-58	33364065	33380669	0	43378879	43382059
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43382059	52047851	2594	2093	0.5432	0	43378879	43382059	1.57963054985050e-127	51965691	52114925
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52054948	55282948	709	577	0.1305	1.5796305498505e-127	51965691	52114925	1.44360830113755e-12	55253701	55311559
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	55288365	55432128	41	33	0.6248	1.44360830113755e-12	55253701	55311559	1.83974825257929e-13	55414360	55468845
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	55434092	55436328	2	0	NA	1.83974825257929e-13	55414360	55468845	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	55439657	74126410	3667	2949	0.1178	NA	NA	NA	1.28281756826092e-75	73765457	75003455
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	74208640	74208640	1	0	NA	1.28281756826092e-75	73765457	75003455	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	74899863	75977218	367	292	0.5305	NA	NA	NA	1.79804604833566e-64	75885498	76271458
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75982631	80472935	1566	1263	0.1321	1.79804604833566e-64	75885498	76271458	2.28170075157108e-07	80426601	80472935
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	80480160	80480160	1	0	NA	2.28170075157108e-07	80426601	80472935	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	80488353	80547049	8	7	-0.6775	NA	NA	NA	2.67109278264295e-07	80547049	80568885
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	80556219	112341468	12043	9687	0.1377	2.67109278264295e-07	80547049	80568885	9.98814498525302e-30	112331419	112353653
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	112342646	112484333	65	49	-0.4634	9.98814498525302e-30	112331419	112353653	7.98532494408747e-29	112476289	112491792
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	112486374	116071403	1626	1286	0.1579	7.98532494408747e-29	112476289	112491792	3.21773047833534e-96	116050143	116083951
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	116073830	117123514	516	429	0.5921	3.21773047833534e-96	116050143	116083951	1.06296480428289e-119	117101168	117146898
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	117124756	125829681	3849	3132	0.1528	1.06296480428289e-119	117101168	117146898	3.95695801331226e-11	125829681	125829681
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125831554	125837524	4	3	-1.3837	3.95695801331226e-11	125829681	125829681	1.71430655278126e-11	125837524	125837524
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141409512	7361	5915	0.1331	1.71430655278126e-11	125837524	125837524	3.95665402462021e-06	141394308	141417702
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141435643	13	13	0.6773	3.95665402462021e-06	141394308	141417702	0.000618810963665927	141429405	141471956
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141687978	116	91	0.1218	0.000618810963665927	141429405	141471956	7.65819234888195e-07	141678342	141698634
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141689547	141690753	2	0	NA	7.65819234888195e-07	141678342	141698634	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.9385	NA	NA	NA	2.14386718988884e-143	141711513	141723354
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	2.14386718988884e-143	141711513	141723354	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158821263	6751	5415	0.0121	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25119007	8158	6592	-0.5376	NA	NA	NA	1.78640594246493e-09	25114132	25119007
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25125700	4	3	0.8593	1.78640594246493e-09	25114132	25119007	4.43438621568991e-10	25125700	25127887
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32057299	2659	2117	-0.5588	4.43438621568991e-10	25125700	25127887	4.77931009886735e-18	32057299	32057299
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32058923	32058923	1	0	NA	4.77931009886735e-18	32057299	32057299	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32062187	32071615	6	4	-2.1857	NA	NA	NA	6.85913149630055e-19	32071615	32071615
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32075464	39230757	2202	1757	-0.5382	6.85913149630055e-19	32071615	32071615	4.53752771507847e-15	39222775	39233926
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39233926	39268605	16	14	0.2528	4.53752771507847e-15	39222775	39233926	0.00267972128219167	39255192	39293654
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39281207	39350798	28	23	0.6213	0.00267972128219167	39255192	39293654	9.84137353455319e-11	39350798	39363050
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	48	1.3477	9.8413735345532e-11	39350798	39363050	1.18518053736981e-38	39492095	39514180
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	39508035	1	0	NA	1.18518053736981e-38	39492095	39514180	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39509423	40888127	439	354	0.5721	NA	NA	NA	6.60546999135385e-07	40886585	40888127
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40892587	40892587	1	0	NA	6.60546999135385e-07	40886585	40888127	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	2.0534	NA	NA	NA	2.19936880001460e-266	40897469	40904488
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	122955902	23520	18959	0.4523	2.1993688000146e-266	40897469	40904488	0	122874954	123024233
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122962746	122962746	1	0	NA	0	122874954	123024233	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122973746	137757481	4619	3703	0.9393	NA	NA	NA	1.63805606805240e-67	137751905	137762418
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137762418	137922591	30	25	-0.0821	1.6380560680524e-67	137751905	137762418	4.23233840669331e-23	137915829	137940544
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	146253929	2819	2286	0.7285	4.23233840669331e-23	137915829	137940544	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146264846	146264846	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	10570	0.0999	NA	NA	NA	1.60432493962250e-21	70926188	70926188
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.6174	1.6043249396225e-21	70926188	70926188	1.80272057095513e-21	70930528	70930528
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	138005538	24030	19254	0.0905	1.80272057095513e-21	70930528	70930528	2.67200046465625e-210	137989027	138029121
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138009083	138009083	1	0	NA	2.67200046465625e-210	137989027	138029121	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138010900	140138841	837	672	0.5241	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140145632	140145683	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	3058052	1114	895	-0.504	NA	NA	NA	0	3048265	3075196
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3063009	3066714	2	0	NA	0	3048265	3075196	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3068729	30074559	9772	7858	0.1627	NA	NA	NA	0	30044720	30144885
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	30078638	30083276	3	0	NA	0	30044720	30144885	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	30087325	38669536	2622	2114	0.517	NA	NA	NA	6.2629949019389e-204	38623159	42216178
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	39116538	46394835	950	762	0.0442	6.2629949019389e-204	38623159	42216178	7.53699685217168e-13	45474003	46407311
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46396163	46396163	1	0	NA	7.53699685217168e-13	45474003	46407311	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46399272	46558272	63	54	-0.3484	NA	NA	NA	7.77369399832359e-14	46545343	47066466
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46561216	70898543	7124	5741	0.0417	7.77369399832359e-14	46545343	47066466	1.70867175999765e-239	70876784	70913831
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70900112	73683264	1098	876	0.465	1.70867175999765e-239	70876784	70913831	9.42065391901947e-06	73664419	73694763
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73684456	73721232	16	14	0.9734	9.42065391901947e-06	73664419	73694763	7.97124638436605e-16	73716219	73735082
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73725006	73725006	1	0	NA	7.97124638436605e-16	73716219	73735082	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73729290	73871682	59	51	0.0409	NA	NA	NA	8.05575109045453e-18	73850948	73884595
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73874656	77917893	1767	1437	0.513	8.05575109045453e-18	73850948	73884595	1.65016647901169e-25	77917893	77917893
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.7665	1.65016647901169e-25	77917893	77917893	3.53659673554013e-25	77928738	77928738
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	81651103	1104	876	0.6267	3.53659673554013e-25	77928738	77928738	0	81570223	81668995
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	81661275	122036641	14351	11503	-0.0174	0	81570223	81668995	0	121992014	122070287
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122041887	135285645	4758	3841	-0.5433	0	121992014	122070287	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	61589534	19484	15736	0.1124	NA	NA	NA	0	61524814	61647245
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61597573	66460753	2097	1702	0.5317	0	61524814	61647245	4.80086775997904e-08	66459299	66460753
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66463477	66463477	1	0	NA	4.80086775997904e-08	66459299	66460753	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.1492	NA	NA	NA	5.75331555407755e-180	66469412	66469412
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	103096899	12316	9929	0.5806	5.75331555407755e-180	66469412	66469412	0	103039394	103140261
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	103105079	103105079	1	0	NA	0	103039394	103140261	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	103109323	134450318	11403	9190	0.1059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11395862	4406	3582	0.1386	NA	NA	NA	1.69172871458645e-13	11393473	11419189
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-1.1424	1.69172871458645e-13	11393473	11419189	8.08040625017326e-13	11433210	11440927
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	99330777	28509	22928	0.1147	8.08040625017326e-13	11433210	11440927	1.07605759699286e-34	99308858	99342396
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99332925	99788199	167	128	0.5156	1.07605759699286e-34	99308858	99342396	3.12774393976021e-37	99773096	99811814
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	99790174	126655368	9941	7991	0.1062	3.12774393976021e-37	99773096	99811814	0	126647991	126675955
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	126658407	130943064	1580	1244	-0.5444	0	126647991	126675955	3.13641357738879e-10	130943064	130943064
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.1992	3.13641357738879e-10	130943064	130943064	4.99704428454542e-10	130946248	130946248
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	130947790	1	0	NA	4.99704428454542e-10	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130950835	132289090	549	451	-0.48	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	9838	0.1097	NA	NA	NA	3.85777914041869e-19	49964838	49964838
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.2455	3.85777914041869e-19	49964838	49964838	4.50150654046499e-18	49971732	49971732
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	83935005	8954	7236	0.0997	4.50150654046499e-18	49971732	49971732	9.59262169490602e-06	83928744	83935005
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	83937912	83945343	3	3	-1.0199	9.59262169490602e-06	83928744	83935005	7.2800920066408e-06	83945343	83953088
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	83953088	93801992	2811	2253	0.0606	7.2800920066408e-06	83945343	83953088	1.17462483748205e-66	93783079	93821981
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	93803874	94507276	295	245	0.4745	1.17462483748205e-66	93783079	93821981	1.86946350892348e-65	94491951	94520509
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	94508481	104882772	4034	3286	0.0621	1.86946350892348e-65	94491951	94520509	1.81785864360197e-30	104782727	104908997
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	104885595	105423084	123	99	0.4944	1.81785864360197e-30	104782727	104908997	1.37287146368689e-20	105358672	105553503
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	105432029	110100167	1701	1366	0.1299	1.37287146368689e-20	105358672	105553503	0	110091378	110106056
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	110101530	114123340	1502	1180	-0.5089	0	110091378	110106056	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	47	-0.5095	NA	NA	NA	1.01627521577857e-33	19483933	19538610
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	57536360	12657	10179	0.1438	1.01627521577857e-33	19483933	19538610	0	57527219	57541514
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	57538661	59678736	929	761	-0.549	0	57527219	57541514	1.04874282985029e-07	59672455	59681355
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	59680275	59694345	10	7	-1.3559	1.04874282985029e-07	59672455	59681355	2.59781879828975e-07	59687714	59697546
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	59695969	96425064	14519	11620	-0.5448	2.59781879828975e-07	59687714	59697546	0	96419065	96434108
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	96426160	106358491	3710	3037	0.1212	0	96419065	96434108	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.2201	NA	NA	NA	3.50005052523842e-05	18450562	18818949
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18692865	1	0	NA	3.50005052523842e-05	18450562	18818949	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20014017	139	114	-1.2694	NA	NA	NA	1.16650748198034e-65	20006117	20029653
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20014107	22974630	568	463	-0.5619	1.16650748198034e-65	20006117	20029653	5.05235716698045e-11	22974630	22974630
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22976410	22978400	2	2	-2.4412	5.05235716698045e-11	22974630	22974630	5.42230053931277e-12	22978400	22978400
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22981628	43878721	7785	6327	-0.5503	5.42230053931277e-12	22978400	22978400	0	43857773	43907427
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43882288	74669752	13211	10654	0.1178	0	43857773	43907427	8.48752513468518e-08	74655153	74669752
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.2173	8.48752513468518e-08	74655153	74669752	2.91668824290319e-08	74680439	74696127
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	138	0.1118	2.91668824290319e-08	74680439	74696127	2.37072118906175e-17	75115806	75115806
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	2.3665	2.37072118906175e-17	75115806	75115806	7.65746195514906e-17	75119713	75119713
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	99632987	9161	7355	0.1377	7.65746195514906e-17	75119713	75119713	2.18785086764886e-10	99632987	99632987
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.9086	2.18785086764886e-10	99632987	99632987	3.4035786246986e-08	99635701	99635701
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	220	0.1865	3.4035786246986e-08	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	8863839	3361	2663	-0.5054	NA	NA	NA	0	8854130	8870847
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8866390	68488909	14885	11963	0.1205	0	8854130	8870847	0	68476821	68497882
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68492431	75093957	2277	1842	-0.4856	0	68476821	68497882	1.62530346727699e-18	75093957	75093957
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	1.3975	1.62530346727699e-18	75093957	75093957	9.56413647791857e-15	75100865	75100865
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76915079	604	468	-0.5816	9.56413647791857e-15	75100865	75100865	0	76904074	76919570
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76916931	88038723	4231	3398	0.0928	0	76904074	76919570	1.64452545593899e-09	88007008	88045667
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88039987	88096618	32	26	0.562	1.64452545593899e-09	88007008	88045667	1.48264305411028e-06	88091898	88127598
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88098058	88676988	263	196	0.1275	1.48264305411028e-06	88091898	88127598	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88690571	88690571	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	2165727	989	814	0.0994	NA	NA	NA	0	2148327	2177935
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	2167868	2167868	1	0	NA	0	2148327	2177935	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	2171684	26448700	8926	7139	-0.5224	NA	NA	NA	0	26448700	26453026
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26451026	26818076	167	134	-1.982	0	26448700	26453026	0	26811720	26818076
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26819331	36672710	3787	3081	-0.5149	0	26811720	26818076	2.58170716081433e-18	36672710	36672710
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36675987	2	0	NA	2.58170716081433e-18	36672710	36672710	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36678537	36683509	4	4	1.1365	NA	NA	NA	7.75020169590007e-18	36683509	36683509
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	36684619	1	0	NA	7.75020169590007e-18	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40874079	1807	1437	-0.4495	NA	NA	NA	2.08694430656021e-05	40863808	40874079
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41031191	6	6	-1.1818	2.08694430656021e-05	40863808	40874079	4.08600859612651e-06	41031191	41067756
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41568539	220	174	-0.4695	4.08600859612651e-06	41031191	41067756	3.31142209714118e-23	41562786	41573295
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42151941	50	44	-1.0204	3.31142209714118e-23	41562786	41573295	4.82137353762865e-24	42143048	42162729
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	42153189	1	0	NA	4.82137353762865e-24	42143048	42162729	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42155643	58435991	5905	4723	-0.4507	NA	NA	NA	1.41483005952378e-07	58432074	58435991
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58439971	1	0	NA	1.41483005952378e-07	58432074	58435991	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58441144	58452260	6	5	0.5197	NA	NA	NA	1.15770251349479e-11	58452260	58470009
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	58454995	1	0	NA	1.15770251349479e-11	58452260	58470009	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58458306	78653545	7760	6213	-0.4018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	30038237	9181	7399	-8e-04	NA	NA	NA	6.13618547375698e-314	30019709	30048336
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	30042440	32785137	976	776	-0.542	6.13618547375698e-314	30019709	30048336	5.35714939219238e-18	32785137	32785137
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32787508	32787508	1	0	NA	5.35714939219238e-18	32785137	32785137	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32791206	32797440	3	3	-2.3307	NA	NA	NA	7.6111955211901e-19	32797440	32797440
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32798897	32798897	1	0	NA	7.6111955211901e-19	32797440	32797440	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	32799923	36509250	820	666	-0.5392	NA	NA	NA	7.996863183284e-15	36509250	36509250
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.4865	7.996863183284e-15	36509250	36509250	1.26215158380472e-12	36519728	36519728
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	4185	-0.5367	1.26215158380472e-12	36519728	36519728	1.80314379959665e-11	53092949	53092949
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.4008	1.80314379959665e-11	53092949	53092949	9.7521935487901e-12	53099601	53099601
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76113758	6762	5492	-0.5355	9.7521935487901e-12	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76116026	76116026	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	45016936	14695	11784	0.0968	NA	NA	NA	0	45010107	45023973
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45018484	56365301	4956	4015	-0.4753	0	45010107	45023973	0	56355115	56378646
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56368403	63787171	3407	2769	0.0964	0	56355115	56378646	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1518825	590	485	0.7258	NA	NA	NA	1.68633566823749e-07	1499421	1523000
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1521410	1532433	6	6	1.6259	1.68633566823749e-07	1499421	1523000	6.77216507662691e-97	1528899	1548251
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	1544485	1	0	NA	6.77216507662691e-97	1528899	1548251	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1546858	12095485	3689	2987	0.6284	NA	NA	NA	3.26538401878844e-93	12089020	12095485
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	2.0414	3.26538401878844e-93	12089020	12095485	5.39525096437489e-08	12113855	12127349
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	13765099	475	379	0.4852	5.39525096437489e-08	12113855	12127349	5.51511326733622e-65	13731608	13788663
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	13767296	17924824	1719	1409	0.8439	5.51511326733622e-65	13731608	13788663	1.13170589999712e-180	17890074	17972936
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	17926469	26142400	2549	2030	0.486	1.13170589999712e-180	17890074	17972936	8.25574248715744e-15	26141755	26150897
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26144661	26161111	13	8	-0.5858	8.25574248715744e-15	26141755	26150897	2.60122976629455e-14	26156944	26162094
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	62379059	12533	10138	0.4609	2.60122976629455e-14	26156944	26162094	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62382266	62419534	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10152384	19	16	-0.4452	NA	NA	NA	7.2748746013614e-11	10136303	10165953
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	13635227	10	9	0.4949	7.2748746013614e-11	10136303	10165953	0.000148944113028343	13562263	13686813
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13676572	13889359	29	21	-0.0571	0.000148944113028343	13562263	13686813	9.92112621453528e-08	13879604	13889359
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13893162	13992109	5	4	-0.9635	9.92112621453528e-08	13879604	13889359	0	13992109	14047236
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	46922972	13378	10860	0.3073	0	13992109	14047236	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15459877	5	3	-0.507	NA	NA	NA	0.0517115364785763	15457366	15567878
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15461843	15461843	1	0	NA	0.0517115364785763	15457366	15567878	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15464955	19088083	1465	1149	0.187	NA	NA	NA	0	19075124	19095844
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	19089566	22696038	1518	1211	-0.4204	0	19075124	19095844	7.19863577222719e-06	22682428	22696038
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696162	22696162	1	0	NA	7.19863577222719e-06	22682428	22696038	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22710302	7	6	0.362	NA	NA	NA	1.32206865023613e-06	22710302	22713972
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22712211	49571068	13560	10989	-0.4738	1.32206865023613e-06	22710302	22713972	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	106242	14	12	0.658	NA	NA	NA	1.84773040511815e-07	100162	113927
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	2708291	1779	1418	0.0271	1.84773040511815e-07	100162	113927	0	2708113	2717626
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	2711273	1	0	NA	0	2708113	2717626	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	28265320	9481	7613	1.0711	NA	NA	NA	0	28227839	28286725
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	28277051	33099563	2293	1854	0.3871	0	28227839	28286725	0	33095131	33105945
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33100699	43611531	3253	2606	1.052	0	33095131	33105945	1.23898356198480e-214	43596970	43653860
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	43615912	43617738	2	0	NA	1.2389835619848e-214	43596970	43653860	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	43619631	47575997	1440	1144	1.5049	NA	NA	NA	7.47324337605997e-292	47548038	47596040
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47577566	81739402	7285	5868	1.0138	7.47324337605997e-292	47548038	47596040	1.24522069739798e-177	81695911	81819521
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	81748748	84879262	652	522	1.5517	1.24522069739798e-177	81695911	81819521	0	84863354	84887971
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	84887971	116989387	8749	6976	0.3687	0	84863354	84887971	5.64734401893577e-77	116989387	116989387
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	116990677	116994308	3	0	NA	5.64734401893577e-77	116989387	116989387	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	116996093	117011218	9	7	-2.065	NA	NA	NA	6.5859390226711e-76	117011218	117011218
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	117013295	154582414	11966	9638	0.3889	6.5859390226711e-76	117011218	117011218	1.39756242843058e-217	154570196	154599547
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	165	-0.4725	1.39756242843058e-217	154570196	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	6997136	279	214	-2.3771	NA	NA	NA	5.79473879420961e-06	6909375	7147206
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6998513	7653082	195	151	-1.7637	5.79473879420961e-06	6909375	7147206	0.000369411956002741	7320048	7799614
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	8956787	380	304	-2.242	0.000369411956002741	7320048	7799614	0.000149437455836646	8856239	9070629
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9153682	33	25	-3.2964	0.000149437455836646	8856239	9070629	0.0190078680499198	9071723	10254943
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9155283	9155283	1	0	NA	0.0190078680499198	9071723	10254943	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9157232	10515697	78	59	-2.3929	NA	NA	NA	3.29098408060808e-08	10503821	10515697
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	12	-0.3771	3.29098408060808e-08	10503821	10515697	2.52689408635437e-09	11673476	12502304
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	10	-2.6888	2.52689408635437e-09	11673476	12502304	0.000939853426243167	12527445	12559410
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	42	-1.2005	0.000939853426243167	12527445	12559410	2.04674179525543e-06	12646477	12710000
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12786515	16	13	-2.9017	2.04674179525543e-06	12646477	12710000	2.14859036172023e-06	12741404	12833424
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12792780	13109337	112	90	-1.3699	2.14859036172023e-06	12741404	12833424	8.07957113903336e-15	13080405	13153920
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13111594	13111594	1	0	NA	8.07957113903336e-15	13080405	13153920	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13112411	22924754	2154	1690	-2.3306	NA	NA	NA	1.23420671870491e-22	22916746	22926726
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22926726	26945893	35	28	-0.2524	1.23420671870491e-22	22916746	22926726	1.46024634296511e-05	26938967	27003308
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27096477	31	25	-1.2717	1.46024634296511e-05	26938967	27003308	0.0294633894797568	26995399	27113201
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27099210	27099210	1	0	NA	0.0294633894797568	26995399	27113201	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27113201	57437557	20	11	-0.4087	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914502_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	57440809	57440809	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
