Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	114201866	41233	40664	-0.0222	NA	NA	NA	8.4226049143691e-68	114154754	114201866
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	114203451	114204752	2	2	-1.1036	8.4226049143691e-68	114154754	114201866	8.33517090484374e-16	114204752	114213960
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	114206619	187246779	18537	18286	0.1931	8.33517090484374e-16	114204752	114213960	3.35524452491471e-15	187212252	187295703
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187251015	187326961	14	13	-0.6168	3.35524452491471e-15	187212252	187295703	1.44474647603331e-96	187295703	187347904
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187330737	247186514	21362	21061	0.1148	1.44474647603331e-96	187295703	187347904	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34558824	11527	11379	0.1186	NA	NA	NA	6.24008450938705e-13	34554208	34563081
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34561038	34579933	9	9	-1.2357	6.24008450938705e-13	34554208	34563081	6.16329414538386e-94	34571897	34583814
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	169033425	40515	39875	0.0253	6.16329414538386e-94	34571897	34583814	2.69771299357825e-99	169029402	169033425
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	169037544	169056163	9	9	1.3469	2.69771299357825e-99	169029402	169033425	0	169052051	169061720
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	169058034	242493814	25697	25316	0.1767	0	169052051	169061720	0	242484747	242514593
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242495169	242689978	70	67	-0.6583	0	242484747	242514593	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	199055033	65515	64608	0.0831	NA	NA	NA	0	199038163	199061234
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199057238	199065475	5	5	-0.9629	0	199038163	199061234	7.66627775986795e-06	199058690	199072418
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199068995	199329592	112	112	0.2587	7.66627775986795e-06	199058690	199072418	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	191153613	55161	54330	-0.135	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	5481422	1715	1692	0.1988	NA	NA	NA	1.17622388391510e-07	5473874	5485951
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	5483498	5500939	11	11	1.1477	1.1762238839151e-07	5473874	5485951	1.13222262158694e-07	5498280	5507180
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	5502444	7592696	550	540	0.1901	1.13222262158694e-07	5498280	5507180	6.30564107818386e-06	7587422	7592696
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7594987	7598474	3	3	-1.4202	6.30564107818386e-06	7587422	7592696	0	7596645	7609615
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7600396	180644810	51487	50666	-0.041	0	7596645	7609615	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26811016	9366	9243	0.1001	NA	NA	NA	1.17913813695342e-38	26797255	26849722
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26865624	6	6	-1.1717	1.17913813695342e-38	26797255	26849722	0	26861184	27100629
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26868404	170753106	46745	46020	-0.1185	0	26861184	27100629	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	102853818	32076	31649	0.0024	NA	NA	NA	2.27098646194934e-170	102819449	102872115
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	102855182	102893850	13	13	-0.5954	2.27098646194934e-170	102819449	102872115	2.44566692137718e-147	102860878	102927704
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	102895593	158821263	24606	24239	0.0115	2.44566692137718e-147	102860878	102927704	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	146264846	44566	43898	0.0381	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	37362	-0.0775	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	135285645	44808	44150	0.0154	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	187649	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	190215	5756408	2147	2114	0.1127	NA	NA	NA	1.09861609614671e-13	5755299	5756408
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5757515	5763749	4	4	-1.9646	1.09861609614671e-13	5755299	5756408	1.11830905037608e-211	5763749	5765438
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	134450318	43152	42492	0.0767	1.11830905037608e-211	5763749	5765438	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	129044319	43876	43233	0.0463	NA	NA	NA	4.42622248021929e-86	129036177	129044319
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129050605	129061836	5	5	1.459	4.42622248021929e-86	129036177	129044319	2.22727061887531e-08	129061836	129066709
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129065037	132289090	1280	1261	0.0422	2.22727061887531e-08	129061836	129066709	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	104731760	28296	27878	0.0048	NA	NA	NA	0	104249270	104753106
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	104737296	104737296	1	0	NA	0	104249270	104753106	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	104741989	104768697	5	5	-0.4209	NA	NA	NA	0.0159797874725351	104747513	104885595
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	104773758	114123340	3342	3286	0.3928	0.0159797874725351	104747513	104885595	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	106358491	31885	31405	-0.1684	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	98232932	30408	29976	-0.0776	NA	NA	NA	0	98223721	98232932
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-1.6722	0	98223721	98232932	1.90339541639251e-07	98239454	98243586
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	890	0.1579	1.90339541639251e-07	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	68734100	18303	18039	-0.0759	NA	NA	NA	1.95233075451244e-107	68693086	68745887
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68741822	68861601	17	15	-0.971	1.95233075451244e-107	68693086	68745887	7.53807850969651e-10	68850394	68883995
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68863005	88690571	7337	7204	-0.2725	7.53807850969651e-10	68850394	68883995	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	41572001	15912	15680	-0.163	NA	NA	NA	1.04428957996246e-30	41558893	41577520
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41573295	41587723	9	9	-1.1071	1.04428957996246e-30	41558893	41577520	5.49997031137667e-15	41581624	41592453
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41591135	78653545	13713	13491	0.0902	5.49997031137667e-15	41581624	41592453	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22615	-0.0352	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22714	0.0248	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	62419534	21579	21279	0.1998	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13221	-0.0191	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	16314	-0.1758	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	154888224	47128	46431	0.2301	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	57440809	3421	3364	-0.3711	NA	NA	NA	NA	NA	NA
