Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27088	0.0095	NA	NA	NA	5.76848518550336e-52	72537426	72537426
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.3864	5.76848518550336e-52	72537426	72537426	1.21092291582274e-51	72579311	72579311
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11356	0.0028	1.21092291582274e-51	72579311	72579311	4.38055084608265e-13	109987341	109987341
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.8769	4.38055084608265e-13	109987341	109987341	1.94536318943017e-13	109989998	109989998
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	150839754	5870	5689	2e-04	1.94536318943017e-13	109989998	109989998	5.39918515073169e-15	150839754	150839754
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-1.3994	5.39918515073169e-15	150839754	150839754	9.85278422175137e-16	150846148	150846148
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	9.85278422175137e-16	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2684	0.0176	NA	NA	NA	3.05471325806418e-06	157128689	157133150
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.307	3.05471325806418e-06	157128689	157133150	6.82360915175951e-06	157136342	157138568
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	10995	-0.0076	6.82360915175951e-06	157136342	157138568	5.26189373716915e-07	185973975	185979586
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.4128	5.26189373716915e-07	185973975	185979586	6.15904059037317e-07	185988138	186000612
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	247186514	21583	20963	0.0018	6.15904059037317e-07	185988138	186000612	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35821494	12024	11689	-0.0027	NA	NA	NA	7.29584202984743e-09	35821494	35821494
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.5448	7.29584202984743e-09	35821494	35821494	3.33369402114495e-08	35844884	35851593
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	242689978	65801	63908	-0.0025	3.33369402114495e-08	35844884	35851593	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	99891210	32183	31241	-0.0029	NA	NA	NA	1.00201740440310e-91	99891210	99891210
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.8288	1.0020174044031e-91	99891210	99891210	2.13487711321636e-89	99897201	99897201
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20700	-0.0062	2.13487711321636e-89	99897201	99897201	7.97001967589702e-32	164005577	164005577
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.8295	7.97001967589702e-32	164005577	164005577	3.45272404471360e-46	164027724	164027724
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-0.4726	3.4527240447136e-46	164027724	164027724	6.95776437658567e-08	164093750	164131402
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196835413	11133	10817	-0.004	6.95776437658567e-08	164093750	164131402	4.14645183322628e-39	196822133	196905767
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196943380	23	23	-0.9436	4.14645183322628e-39	196822133	196905767	3.8575367492719e-40	196940125	196945209
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	199329592	960	937	0.0203	3.8575367492719e-40	196940125	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3290	0.0022	NA	NA	NA	2.48418782277896e-228	9815760	9815760
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.2132	2.48418782277896e-228	9815760	9815760	2.08123227911768e-211	9842644	9842644
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	191153613	51764	50170	-8e-04	2.08123227911768e-211	9842644	9842644	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	52186	-0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	55	-0.0152	NA	NA	NA	1.09759073838940e-11	230588	251128
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	45	-0.4816	1.0975907383894e-11	230588	251128	9.12220134964636e-21	314877	332608
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	31468382	11102	10798	0.0022	9.12220134964636e-21	314877	332608	3.98849250227451e-18	31456663	31488082
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31474518	31563829	27	27	0.5866	3.98849250227451e-18	31456663	31488082	1.66435131557683e-13	31555715	31586801
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31564655	32558677	447	436	0.0764	1.66435131557683e-13	31555715	31586801	1.47506960441322e-08	32543054	32567462
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	0.8681	1.47506960441322e-08	32543054	32567462	1.38068488487963e-09	32588005	32600962
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	103841482	21515	20876	0.0012	1.38068488487963e-09	32588005	32600962	1.00451107452432e-10	103827105	103841482
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103873584	5	5	1.0808	1.00451107452432e-10	103827105	103841482	2.36272827608616e-11	103873584	103882598
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103882598	111655374	2738	2666	0.0116	2.36272827608616e-11	103873584	103882598	1.21510765451147e-27	111643071	111665492
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	111657422	111751679	51	51	0.5313	1.21510765451147e-27	111643071	111665492	6.57097061324828e-28	111743357	111759658
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	111753393	170753106	20124	19530	-0.0045	6.57097061324828e-28	111743357	111759658	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	99824981	30903	29978	0.0033	NA	NA	NA	9.15821648489131e-05	99818555	99824981
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99826231	99832561	4	4	0.7802	9.15821648489131e-05	99818555	99824981	9.47681548853645e-06	99832561	99838432
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99834242	100162851	154	148	0.1012	9.47681548853645e-06	99832561	99838432	4.53176709106442e-08	100161629	100162851
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100164752	100164752	1	0	NA	4.53176709106442e-08	100161629	100162851	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100171204	3	3	-0.8343	NA	NA	NA	3.35776516690038e-06	100171204	100181104
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100174991	125833251	11374	11045	0.0049	3.35776516690038e-06	100171204	100181104	4.56053749041111e-07	125831554	125833251
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125836353	125837524	2	2	1.4229	4.56053749041111e-07	125831554	125833251	1.75537005637422e-07	125837524	125839386
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7142	-8e-04	1.75537005637422e-07	125837524	125839386	0.000382427080356008	141402937	141419692
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141429405	8	8	0.5463	0.000382427080356008	141402937	141419692	0.00119924687685613	141419692	141443577
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141431668	141690753	122	119	-0.0026	0.00119924687685613	141419692	141443577	1.49873704286390e-09	141686875	141703062
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141720324	12	11	0.749	1.4987370428639e-09	141686875	141703062	1.81914085903713e-11	141714168	141723354
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141721894	158821263	6750	6551	-0.0093	1.81914085903713e-11	141714168	141723354	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39350798	13074	12660	-0.0086	NA	NA	NA	5.07543369193535e-72	39341524	39352361
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.7905	5.07543369193535e-72	39341524	39352361	4.11668419880016e-59	39500219	39509423
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	429	0.0186	4.11668419880016e-59	39500219	39509423	3.38038563758352e-08	40892587	40892587
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.4928	3.38038563758352e-08	40892587	40892587	2.60201575761477e-08	40897469	40897469
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	58271240	3915	3786	0.0019	2.60201575761477e-08	40897469	40897469	4.52062470677322e-07	58268002	58271240
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58274145	58295259	5	5	0.8767	4.52062470677322e-07	58268002	58271240	1.53125928031142e-06	58295259	58313875
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58300815	146264846	27070	26264	0.0024	1.53125928031142e-06	58295259	58313875	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12671	-0.0053	NA	NA	NA	1.01745882319790e-33	70926188	70926188
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.9242	1.0174588231979e-33	70926188	70926188	8.18302180314181e-33	70930528	70930528
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23071	-0.0069	8.18302180314181e-33	70930528	70930528	1.67546155621682e-08	137352394	137352394
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5364	1.67546155621682e-08	137352394	137352394	2.57410534373403e-08	137356880	137361870
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	137359947	1	0	NA	2.57410534373403e-08	137356880	137361870	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137361870	140145683	1102	1057	0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9444	-0.0028	NA	NA	NA	2.41984563070600e-86	27038538	27038538
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.6133	2.419845630706e-86	27038538	27038538	3.00824085727052e-86	27041812	27041812
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45487335	4725	4572	0.0033	3.00824085727052e-86	27041812	27041812	4.74485925430129e-43	45476905	46389734
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45489823	46558272	71	67	-0.5661	4.74485925430129e-43	45476905	46389734	1.15878928866857e-36	46549806	47040444
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46561216	53683740	1775	1718	-0.0242	1.15878928866857e-36	46549806	47040444	9.9121519882562e-23	53683740	53683740
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-2.4906	9.9121519882562e-23	53683740	53683740	8.19765159193947e-24	53687880	53687880
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	77917893	8288	8036	0.0051	8.19765159193947e-24	53687880	53687880	2.02944842482780e-43	77917893	77917893
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.7228	2.0294484248278e-43	77917893	77917893	8.64665475551438e-44	77928738	77928738
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	77936034	1	0	NA	8.64665475551438e-44	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77940201	123957735	16162	15693	-5e-04	NA	NA	NA	1.36445804080685e-07	123956449	123957735
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123969584	5	5	-0.9171	1.36445804080685e-07	123956449	123957735	3.78073801797041e-07	123969584	123974228
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	135285645	4045	3941	-0.0338	3.78073801797041e-07	123969584	123974228	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1722	-0.0134	NA	NA	NA	6.33916669301332e-133	4923300	4923300
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-4.2637	6.33916669301332e-133	4923300	4923300	4.97054518170884e-111	4932214	4932214
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	349	-0.0104	4.97054518170884e-111	4932214	4932214	0	5741031	5741031
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-4.6617	0	5741031	5741031	0	5765438	5765438
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55123719	14753	14295	-0.0056	0	5765438	5765438	7.37476480779565e-13	55092628	55140052
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	-0.436	7.37476480779565e-13	55092628	55140052	1.79681061777546e-13	55194990	55235968
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	55217189	1	0	NA	1.79681061777546e-13	55194990	55235968	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27494	-0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	902	0.0651	NA	NA	NA	0	2109441	2109441
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-5.5432	0	2109441	2109441	0	2127537	2127537
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2733	-0.0038	0	2127537	2127537	2.40070194021559e-26	9516067	9543817
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	1.0701	2.40070194021559e-26	9516067	9543817	4.65206853162336e-24	9578398	9604633
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11116883	574	557	-0.026	4.65206853162336e-24	9578398	9604633	1.06009492546241e-87	11116883	11116883
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	-2.96	1.06009492546241e-87	11116883	11116883	7.77241687373268e-102	11140421	11140421
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	132289090	40825	39657	0.007	7.77241687373268e-102	11140421	11140421	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7114	-0.0049	NA	NA	NA	5.69135768223876e-23	37953582	37953582
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.419	5.69135768223876e-23	37953582	37953582	6.39147804012032e-22	37957844	37957844
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	75099943	11571	11252	-0.0063	6.39147804012032e-22	37957844	37957844	9.57318067193815e-09	75095924	75099943
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	75101906	75109797	5	5	0.9816	9.57318067193815e-09	75095924	75099943	8.60447064459283e-09	75109797	75111195
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	75111195	100690991	8164	7949	-0.0019	8.60447064459283e-09	75109797	75111195	2.06258847601886e-136	100690991	100690991
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.9101	2.06258847601886e-136	100690991	100690991	3.61162753367279e-138	100693892	100693892
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4430	-0.0175	3.61162753367279e-138	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40676611	7648	7441	0.008	NA	NA	NA	9.6855899058063e-09	40663660	40676611
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40680589	1	0	NA	9.6855899058063e-09	40663660	40676611	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.8962	NA	NA	NA	1.63808412922648e-08	40722360	40741934
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	106358491	24230	23544	-0.0025	1.63808412922648e-08	40722360	40741934	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3207	NA	NA	NA	7.4405338384617e-05	18450562	18749895
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19835471	102	95	-0.4389	7.4405338384617e-05	18450562	18749895	5.97910108860168e-54	19835471	19835471
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-4.399	5.97910108860168e-54	19835471	19835471	9.25612302749596e-69	19844217	19844217
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20316992	50	48	-0.599	9.25612302749596e-69	19844217	19844217	1.07326729010230e-30	20088256	20335887
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	28439781	2250	2182	-0.0105	1.0732672901023e-30	20088256	20335887	2.7492567225853e-15	28154955	28731195
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28728864	28791982	12	11	-0.8811	2.7492567225853e-15	28154955	28731195	1.10956460583139e-15	28748125	28801800
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28798052	29809025	330	321	-0.0089	1.10956460583139e-15	28748125	28801800	1.68369075798587e-50	29766585	29822106
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	29811424	30302213	135	132	0.5146	1.68369075798587e-50	29766585	29822106	1.07895332521156e-66	30230311	30713453
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	30326899	32514939	942	918	-0.0271	1.07895332521156e-66	30230311	30713453	1.26559735090808e-23	32452971	32520164
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32583146	23	22	-0.7801	1.26559735090808e-23	32452971	32520164	2.00840525982456e-25	32580871	32664506
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32594200	32594200	1	0	NA	2.00840525982456e-25	32580871	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	74664249	17857	17347	2e-04	NA	NA	NA	1.07818766285919e-08	74653507	74665386
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74665386	74680439	6	6	0.9009	1.07818766285919e-08	74653507	74665386	4.1383761080751e-09	74680338	74696702
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9338	-0.0049	4.1383761080751e-09	74680338	74696702	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	68693086	18299	17764	0.0097	NA	NA	NA	3.51105818153197e-12	68687301	68710277
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.8397	3.51105818153197e-12	68687301	68710277	2.10026465565258e-11	68751390	68842364
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2132	0.0016	2.10026465565258e-11	68751390	68842364	2.85330741231624e-06	75092501	75093957
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0977	2.85330741231624e-06	75092501	75093957	1.03928899479257e-06	75100865	75102639
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4985	-0.0158	1.03928899479257e-06	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	404	0.0302	NA	NA	NA	2.36488063639219e-09	1026339	1027248
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.1571	2.36488063639219e-09	1026339	1027248	1.88897183888314e-09	1030766	1031233
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36672710	13451	13052	0.0201	1.88897183888314e-09	1030766	1031233	3.00340725319873e-34	36672710	36672710
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36673853	1	0	NA	3.00340725319873e-34	36672710	36672710	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.7377	NA	NA	NA	8.9738227584522e-35	36684619	36684619
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15265	0.0211	8.9738227584522e-35	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15718	-0.0067	NA	NA	NA	3.55217449994867e-15	53092949	53092949
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.9921	3.55217449994867e-15	53092949	53092949	1.03905214626289e-14	53099601	53099601
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6551	-0.0179	1.03905214626289e-14	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	42530955	13546	13141	0.0386	NA	NA	NA	2.26982877579702e-12	42530955	42530955
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42537228	42537766	2	2	-1.7632	2.26982877579702e-12	42530955	42530955	1.24931302731929e-12	42537766	42537766
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42544684	63788698	9510	9216	0.0381	1.24931302731929e-12	42537766	42537766	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	-0.024	NA	NA	NA	2.15136933998286e-75	1506379	1506379
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.1282	2.15136933998286e-75	1506379	1506379	1.5281884048304e-80	1531162	1531162
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20385	-0.0032	1.5281884048304e-80	1531162	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13040	-0.0031	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22696038	2989	2907	0.0181	NA	NA	NA	5.83418356721243e-09	22682428	22701205
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696162	22715919	12	11	0.6852	5.83418356721243e-09	22682428	22701205	2.62159714774571e-10	22712211	22721042
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22718614	28293343	3050	2967	-0.0052	2.62159714774571e-10	22712211	22721042	5.82260014157371e-08	28282152	28301170
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28294835	28342857	23	23	0.4175	5.82260014157371e-08	28282152	28301170	5.78469447225896e-07	28327616	28358130
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28344172	31492887	1676	1618	0.0191	5.78469447225896e-07	28327616	28358130	1.15708464178806e-06	31488902	31492887
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31494622	31503066	4	4	-0.9128	1.15708464178806e-06	31488902	31492887	3.10281913704639e-06	31503066	31506455
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	31504805	35472378	1798	1754	-0.0026	3.10281913704639e-06	31503066	31506455	1.61320084123474e-45	35472378	35472378
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.3699	1.61320084123474e-45	35472378	35472378	8.23680293691205e-45	35476942	35476942
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6786	0.0147	8.23680293691205e-45	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2207	NA	NA	NA	0.00133706946997433	4893	99430
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	0.00133706946997433	4893	99430	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	0.982	NA	NA	NA	8.92770172923487e-11	104486	106242
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	16	-0.0285	8.92770172923487e-11	104486	106242	3.01506665647009e-06	122273	127113
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.9856	3.01506665647009e-06	122273	127113	2.48047644841892e-12	129544	132689
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1182356	656	632	0.0185	2.48047644841892e-12	129544	132689	1.51625954734514e-11	1177877	1274736
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1274736	1328543	16	16	0.5611	1.51625954734514e-11	1177877	1274736	3.87757822860222e-08	1322183	1340309
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1331177	1427392	81	79	0.066	3.87757822860222e-08	1322183	1340309	1.54106717329087e-11	1427392	1431240
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1361	1.54106717329087e-11	1427392	1431240	1.60646493123722e-12	1432891	1434970
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708113	1001	980	0.0058	1.60646493123722e-12	1432891	1434970	0	2706218	2708291
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	47748627	16539	16033	0.9365	0	2706218	2708291	1.85972786256701e-22	47739324	47766391
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47756715	47827887	32	32	1.5781	1.85972786256701e-22	47739324	47766391	1.77624858546639e-22	47821465	47838184
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47832365	154582414	28564	27736	0.9277	1.77624858546639e-22	47821465	47838184	6.34215427470196e-305	154570196	154586690
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0293	6.34215427470196e-305	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.8348	NA	NA	NA	2.25486660850349e-25	3219200	3772482
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.609	2.25486660850349e-25	3219200	3772482	3.79381610295833e-16	5531459	6688691
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	168	-3.5304	3.79381610295833e-16	5531459	6688691	1.78215795080387e-06	7007724	7205930
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	128	-2.6445	1.78215795080387e-06	7007724	7205930	9.94445420399368e-05	7340782	7614417
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7726921	76	75	-3.5803	9.94445420399368e-05	7340782	7614417	0.000104187124334520	7705876	7731490
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7782532	17	16	-2.1696	0.00010418712433452	7705876	7731490	4.28224153948175e-08	7774773	7789562
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7859390	29	29	-3.7029	4.28224153948175e-08	7774773	7789562	2.65803477554469e-05	7852359	7893056
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	11	-2.103	2.65803477554469e-05	7852359	7893056	5.47573079977459e-05	7895945	7938700
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	378	-3.6895	5.47573079977459e-05	7895945	7938700	5.76064772376387e-32	10513747	10515697
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11698871	18	17	-0.5679	5.76064772376387e-32	10513747	10515697	6.76337049102902e-62	11698871	11698871
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	6.76337049102902e-62	11698871	11698871	NA	NA	NA
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-4.668	NA	NA	NA	2.01379186423810e-05	12536761	12550566
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	56	-2.2262	2.0137918642381e-05	12536761	12550566	0.000176601697692565	12608293	12764220
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12926941	56	56	-3.3675	0.000176601697692565	12608293	12764220	1.45027072628506e-07	12898049	12960717
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13104920	70	68	-2.1618	1.45027072628506e-07	12898049	12960717	0.174915544561314	12953078	13114169
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.2614	0.174915544561314	12953078	13114169	1.18557954235072e-11	13121152	13133803
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14342834	409	397	-3.7623	1.18557954235072e-11	13121152	13133803	1.69869615002765e-07	14169526	14388689
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	95	-3.0503	1.69869615002765e-07	14169526	14388689	0.000164230376563634	14491287	14545228
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-1.8099	0.000164230376563634	14491287	14545228	1.78049873638649e-12	14559651	14598838
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	22930737	1619	1560	-3.5694	1.78049873638649e-12	14559651	14598838	1.19693391831169e-64	22923722	26870361
MSK_252152914733_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	79	-1.2745	1.19693391831169e-64	22923722	26870361	NA	NA	NA
