Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72519056	27883	27136	0.0035	NA	NA	NA	6.96107354377439e-07	72503382	72528790
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72520196	72579311	25	24	0.3288	6.96107354377439e-07	72503382	72528790	3.37302450768118e-07	72550248	72652073
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150823073	17557	17056	-0.0035	3.37302450768118e-07	72550248	72652073	1.87672880093694e-118	150823073	150836481
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.0857	1.87672880093694e-118	150823073	150836481	2.46029969160552e-117	150848509	150851439
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2686	0.0012	2.46029969160552e-117	150848509	150851439	1.13697832775870e-55	157133150	157133150
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.0266	1.1369783277587e-55	157133150	157133150	1.74639321527456e-54	157136342	157136342
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167493768	4109	3998	-0.0107	1.74639321527456e-54	157136342	157136342	1.0897769341512e-06	167479184	167493768
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167495719	167507898	7	7	-0.5966	1.0897769341512e-06	167479184	167493768	1.22076895453151e-06	167507898	167525669
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	194978218	9180	8930	-0.0028	1.22076895453151e-06	167507898	167525669	3.86547370131370e-11	194977713	194978218
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195022854	5	5	-0.8951	3.8654737013137e-11	194977713	194978218	1.51772245350467e-12	195022854	195022854
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195046932	195103883	8	8	0.0941	1.51772245350467e-12	195022854	195022854	5.06175022746604e-06	195095156	195108311
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195104207	195149990	22	21	0.5574	5.06175022746604e-06	195095156	195108311	2.99152970016478e-19	195146732	195191938
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195158448	195158448	1	0	NA	2.99152970016478e-19	195146732	195191938	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195187023	243702540	18178	17676	-0.0034	NA	NA	NA	6.90759263479206e-10	243699611	243704923
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243717078	9	9	-0.6298	6.90759263479206e-10	243699611	243704923	1.70181607727813e-09	243714007	243720139
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243718709	246769018	1266	1229	-0.0041	1.70181607727813e-09	243714007	243720139	5.9088134016369e-21	246753652	246806669
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	30	-0.5104	5.9088134016369e-21	246753652	246806669	4.0847392194063e-23	246863179	246882156
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	93	0.0412	4.0847392194063e-23	246863179	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11210	0.0018	NA	NA	NA	9.6410269866252e-08	34520482	34554208
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34580533	15	15	0.4336	9.6410269866252e-08	34520482	34554208	2.27022506876590e-08	34574224	34595734
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	66355634	11756	11417	-0.0069	2.2702250687659e-08	34574224	34595734	8.1483694591862e-167	66355634	66355634
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66357387	66357387	1	0	NA	8.1483694591862e-167	66355634	66355634	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-5.1693	NA	NA	NA	5.46409464790324e-160	66360747	66360747
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	242689978	54531	53118	-0.002	5.46409464790324e-160	66360747	66360747	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10491	-8e-04	NA	NA	NA	1.08042397579599e-34	32074432	32074432
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.4116	1.08042397579599e-34	32074432	32074432	2.79973820562920e-34	32080848	32080848
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	61799408	11392	11080	0.005	2.7997382056292e-34	32080848	32080848	3.98323453046861e-09	61797058	61799408
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	61801830	61810681	5	4	-0.8989	3.98323453046861e-09	61797058	61799408	1.38713893274644e-08	61810681	61812559
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	61812559	164005577	31296	30435	-0.0031	1.38713893274644e-08	61810681	61812559	7.61763580308199e-17	163992903	164038917
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164107951	25	24	-0.5018	7.61763580308199e-17	163992903	164038917	4.18475701195108e-16	164083826	164126256
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9852	-0.0107	4.18475701195108e-16	164083826	164126256	0	194354505	194354505
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.913	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1943	-0.0083	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	45025004	12947	12550	0.0021	NA	NA	NA	6.62610981067513e-52	45015937	45025004
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	45029949	45131383	18	18	-0.9762	6.62610981067513e-52	45015937	45025004	3.95396557311255e-50	45127618	45136557
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	45136557	123571256	23107	22453	-0.0043	3.95396557311255e-50	45127618	45136557	1.42799744583105e-10	123571256	123571256
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	123572417	123576109	3	3	-1.1333	1.42799744583105e-10	123571256	123571256	6.38994321311348e-11	123576109	123576109
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	123580441	173224400	13565	13168	-0.0038	6.38994321311348e-11	123576109	123576109	8.2074789470241e-17	173224400	173224400
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.692	8.2074789470241e-17	173224400	173224400	7.59682516720562e-17	173228860	173228860
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	0.0157	7.59682516720562e-17	173228860	173228860	4.29965993624947e-19	173660684	173660684
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.7977	4.29965993624947e-19	173660684	173660684	6.92226898753893e-20	173666072	173666072
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5197	-2e-04	6.92226898753893e-20	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3870	0.0134	NA	NA	NA	1.19592129893869e-10	12857302	12857302
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.3342	1.19592129893869e-10	12857302	12857302	8.75842133947483e-11	12873052	12873052
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	21480789	2375	2308	-0.0056	8.75842133947483e-11	12873052	12873052	1.11203986328989e-13	21480789	21480789
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.5096	1.11203986328989e-13	21480789	21480789	1.17066650593184e-12	21487474	21487474
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	137833920	32735	31829	-0.0066	1.17066650593184e-12	21487474	21487474	6.48572618861281e-09	137831933	137833920
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137836466	137843309	4	4	-0.913	6.48572618861281e-09	137831933	137833920	1.17375297748685e-09	137843309	137844931
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	180187846	14549	14187	0.0088	1.17375297748685e-09	137843309	137844931	1.18130009853798e-06	180173443	180194323
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180189516	180364670	14	14	-0.4077	1.18130009853798e-06	180173443	180194323	0.000179344314112412	180355807	180400893
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180365950	180644810	110	107	-0.0387	0.000179344314112412	180355807	180400893	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11358	-0.0044	NA	NA	NA	1.07086094890641e-128	32558677	32588005
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-2.3274	1.07086094890641e-128	32558677	32588005	1.22314100651680e-09	32588005	32605300
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	-0.2131	1.2231410065168e-09	32588005	32605300	0.00221959432275134	32695015	32718991
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	-1.1812	0.00221959432275134	32695015	32718991	1.95820587688488e-28	32728487	32728487
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	103841482	21469	20900	-0.0047	1.95820587688488e-28	32728487	32728487	2.22717604227335e-109	103841482	103841482
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.0213	2.22717604227335e-109	103841482	103841482	9.04479957976083e-111	103868154	103868154
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	139643729	12380	12044	-0.0071	9.04479957976083e-111	103868154	103868154	4.48257585422164e-140	139643729	139643729
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-3.9191	4.48257585422164e-140	139643729	139643729	7.08388717423501e-134	139648318	139648318
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	170753106	10531	10228	-0.0031	7.08388717423501e-134	139648318	139648318	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	256	0.043	NA	NA	NA	3.03567642145131e-09	1033418	1036135
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1047707	4	4	-0.8557	3.03567642145131e-09	1033418	1036135	9.85274290521014e-08	1047707	1049599
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	133433384	45833	44578	-3e-04	9.85274290521014e-08	1047707	1049599	1.13461962374292e-09	133426996	133433384
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6669	1.13461962374292e-09	133426996	133433384	5.99934504168974e-11	133448277	133455682
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3601	-0.0032	5.99934504168974e-11	133448277	133455682	6.40354367406885e-09	141406414	141410894
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141429405	8	7	0.6465	6.40354367406885e-09	141406414	141410894	6.35292697431134e-08	141429405	141432778
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141431668	143503317	791	773	0.0106	6.35292697431134e-08	141429405	141432778	1.68280192446789e-09	143500499	143503317
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.0491	1.68280192446789e-09	143500499	143503317	1.23951524568683e-08	143584350	143705425
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	147702365	1850	1802	4e-04	1.23951524568683e-08	143584350	143705425	7.7164107836945e-23	147702365	147702365
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.0786	7.7164107836945e-23	147702365	147702365	3.56118791845491e-25	147707161	147707161
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4105	3e-04	3.56118791845491e-25	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	0.0041	NA	NA	NA	1.27286255121283e-10	581533	581533
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.5062	1.27286255121283e-10	581533	581533	4.45599672227422e-13	588865	588865
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25022606	8008	7789	0.0015	4.45599672227422e-13	588865	588865	7.15298115762181e-88	25022606	25030003
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-3.1277	7.15298115762181e-88	25022606	25030003	9.1856013452302e-86	25034970	25039370
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4816	-0.0083	9.1856013452302e-86	25034970	25039370	4.37295124549283e-100	39345557	39352361
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.7781	4.37295124549283e-100	39345557	39352361	4.79179660045929e-82	39500219	39508035
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	428	0.0072	4.79179660045929e-82	39500219	39508035	1.06843757887327e-13	40892587	40892587
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.5524	1.06843757887327e-13	40892587	40892587	1.36667123523728e-13	40897469	40897469
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30114	0.001	1.36667123523728e-13	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	39146895	12731	12381	-0.0029	NA	NA	NA	9.64004056258242e-64	39146895	43445839
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	-2.6746	9.64004056258242e-64	39146895	43445839	2.45701839136688e-47	43530076	43599449
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	70926188	338	327	-0.0152	2.45701839136688e-47	43530076	43599449	1.81530210115535e-50	70926188	70926188
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.0188	1.81530210115535e-50	70926188	70926188	1.01448709112629e-54	70930528	70930528
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23109	-0.0042	1.01448709112629e-54	70930528	70930528	1.21603780273357e-30	137352394	137352394
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.2658	1.21603780273357e-30	137352394	137352394	1.28639048494037e-28	137356880	137356880
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1068	0.0041	1.28639048494037e-28	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9488	-0.0083	NA	NA	NA	2.53612451807149e-10	27038538	27038538
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.3351	2.53612451807149e-10	27038538	27038538	2.99154557494780e-10	27041812	27041812
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	70949263	11944	11646	-0.0127	2.9915455749478e-10	27041812	27041812	3.16444201158865e-09	70947915	70949263
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.9205	3.16444201158865e-09	70947915	70949263	3.73182478209139e-10	70960187	70964344
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2844	0.01	3.73182478209139e-10	70960187	70964344	8.48580933741586e-78	77917893	77917893
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.9076	8.48580933741586e-78	77917893	77917893	2.20722665300921e-77	77928738	77928738
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	12062	-0.0021	2.20722665300921e-77	77928738	77928738	1.58590277451933e-64	114100979	114100979
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.2515	1.58590277451933e-64	114100979	114100979	1.65483839392166e-62	114106460	114106460
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7603	0.0028	1.65483839392166e-62	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	341662	61	57	0.0151	NA	NA	NA	4.81688764870738e-10	332555	341662
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	343347	381470	10	9	0.6194	4.81688764870738e-10	332555	341662	2.59954137864603e-09	381470	393800
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	385301	5741031	2067	2003	0.0012	2.59954137864603e-09	381470	393800	1.91148224277445e-18	5734978	5742476
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6649	1.91148224277445e-18	5734978	5742476	6.80446483513203e-19	5763749	5769776
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14342	4e-04	6.80446483513203e-19	5763749	5769776	7.08865837981456e-18	55093758	55129329
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	-0.4126	7.08865837981456e-18	55093758	55129329	1.71206608032533e-19	55200744	55223056
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4541	0.0063	1.71206608032533e-19	55200744	55223056	2.09162955120928e-27	66463477	66463477
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.1107	2.09162955120928e-27	66463477	66463477	1.55151655103764e-26	66469412	66469412
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23114	0.002	1.55151655103764e-26	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3627	0.0114	NA	NA	NA	2.43728974984879e-83	9523923	9528590
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	1.3606	2.43728974984879e-83	9523923	9528590	3.61437765361753e-73	9607363	9610054
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	555	-0.0329	3.61437765361753e-73	9607363	9610054	5.26544924019794e-123	11116883	11125311
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.148	5.26544924019794e-123	11116883	11125311	8.88140020869925e-45	11125311	11130871
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	71	-0.0417	8.88140020869925e-45	11125311	11130871	6.26572486819791e-23	11393473	11395862
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-1.347	6.26572486819791e-23	11393473	11395862	5.03728150504833e-31	11435643	11435643
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31132762	6743	6579	-0.0077	5.03728150504833e-31	11435643	11435643	2.65467415421043e-17	31098259	31173065
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	0.5923	2.65467415421043e-17	31098259	31173065	2.80393515332621e-17	31225941	31245432
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	80662066	16169	15713	-0.003	2.80393515332621e-17	31225941	31245432	4.67966787641838e-43	80662066	80662066
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-2.7089	4.67966787641838e-43	80662066	80662066	3.44236161242703e-43	80666751	80666751
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	132289090	17818	17299	8e-04	3.44236161242703e-43	80666751	80666751	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6848	-0.0053	NA	NA	NA	2.98225742163647e-174	36969571	36969571
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-5.3873	2.98225742163647e-174	36969571	36969571	1.19465982684438e-174	36982877	36982877
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	290	8e-04	1.19465982684438e-174	36982877	36982877	1.14618971586142e-57	37953582	37953582
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-3.1175	1.14618971586142e-57	37953582	37953582	5.83963330833659e-59	37957844	37957844
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4733	-0.0112	5.83963330833659e-59	37957844	37957844	8.75971669414533e-54	49964838	49964838
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.9798	8.75971669414533e-54	49964838	49964838	8.58529724273636e-52	49971732	49971732
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	114123340	19423	18872	-0.0031	8.58529724273636e-52	49971732	49971732	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5569	0.0038	NA	NA	NA	3.20335751689011e-12	34674458	34674458
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.2257	3.20335751689011e-12	34674458	34674458	1.34301112547072e-12	34683810	34683810
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	105597555	25889	25233	-0.002	1.34301112547072e-12	34683810	34683810	0	105597555	105602602
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.1226	0	105597555	105602602	5.1213765676052e-83	105630089	105632168
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105948347	72	68	0.021	5.1213765676052e-83	105630089	105632168	7.55762070975003e-240	105948347	105948347
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	13	-4.2791	7.55762070975003e-240	105948347	105948347	1.46447369852924e-20	105989160	105989160
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106013552	5	5	-0.6752	1.46447369852924e-20	105989160	105989160	2.90461548460816e-05	106013552	106019719
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106015449	106358491	141	139	0.0208	2.90461548460816e-05	106013552	106019719	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18824622	11	11	0.3077	NA	NA	NA	2.77530725814913e-06	18810004	18824622
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18826924	18848213	8	8	0.9607	2.77530725814913e-06	18810004	18824622	0.00019083942429249	18846835	18876677
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19819961	85	81	0.5014	0.00019083942429249	18846835	18876677	2.77578144266494e-63	19803092	19839695
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19822150	52517110	11896	11588	-0.0039	2.77578144266494e-63	19803092	19839695	1.56336385602925e-14	52517110	52517110
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.6065	1.56336385602925e-14	52517110	52517110	1.05281508114098e-14	52533227	52533227
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	74669752	9709	9417	-0.0034	1.05281508114098e-14	52533227	52533227	0.00664598122869138	74650035	74669752
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74678353	2	2	0.7646	0.00664598122869138	74650035	74669752	0	74678353	74678353
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74680338	74680439	2	2	1.1592	0	74678353	74678353	9.0412838020766e-08	74680439	74696127
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	82330854	2793	2721	6e-04	9.0412838020766e-08	74680439	74696127	5.8654897161363e-19	82330854	82330854
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82332155	82332155	1	0	NA	5.8654897161363e-19	82330854	82330854	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-1.785	NA	NA	NA	4.82246938091413e-19	82334704	82334704
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	100151597	6750	6568	0.0034	4.82246938091413e-19	82334704	82334704	3.55805086859873e-95	100147408	100152857
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100152857	100186344	37	36	0.9327	3.55805086859873e-95	100147408	100152857	4.35486210642035e-42	100186344	100187361
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100187361	100298352	24	23	-0.0469	4.35486210642035e-42	100186344	100187361	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	756456	283	274	0.0485	NA	NA	NA	6.09841097264751e-13	756456	756456
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	759120	764070	2	2	-1.4078	6.09841097264751e-13	756456	756456	1.81887702843646e-11	764070	764070
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	768304	31845232	10285	10020	0.004	1.81887702843646e-11	764070	764070	9.81650001141554e-47	31842335	32513457
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31854794	33559207	48	47	0.5806	9.81650001141554e-47	31842335	32513457	2.91385240440660e-26	33528385	33830585
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	34317157	89	87	-0.0134	2.9138524044066e-26	33528385	33830585	4.38984397572133e-78	34310087	34325501
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	52	0.8699	4.38984397572133e-78	34310087	34325501	2.16724574229132e-123	34596655	34617260
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	57203733	4150	4038	-0.0076	2.16724574229132e-123	34596655	34617260	2.05776291379139e-08	57203733	57203733
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1924	2.05776291379139e-08	57203733	57203733	2.38856888274375e-08	57206772	57206772
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3298	0.0062	2.38856888274375e-08	57206772	57206772	3.06297790346386e-06	68674071	68693086
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.4571	3.06297790346386e-06	68674071	68693086	7.76030912297061e-06	68753209	68856824
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2136	-0.004	7.76030912297061e-06	68753209	68856824	1.36586281462074e-10	75092501	75093957
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0911	1.36586281462074e-10	75092501	75093957	5.88560926015871e-10	75100865	75102639
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5004	0.0074	5.88560926015871e-10	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13467	0.0055	NA	NA	NA	1.50699773186189e-139	36673853	36673853
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.0345	1.50699773186189e-139	36673853	36673853	3.00606661055368e-142	36683509	36683509
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41566540	2033	1980	0.0108	3.00606661055368e-142	36683509	36683509	5.06924946957691e-35	41555295	41570512
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	50	-0.4734	5.06924946957691e-35	41555295	41570512	3.64681125437411e-34	42147225	42159958
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13312	0.0039	3.64681125437411e-34	42147225	42159958	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15797	-0.0052	NA	NA	NA	1.19973585916971e-09	53092949	53092949
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.3025	1.19973585916971e-09	53092949	53092949	1.10517746114307e-09	53099601	53099601
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	73393601	5822	5672	-0.0057	1.10517746114307e-09	53099601	53099601	2.77878086857557e-09	73393601	73393601
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	73396037	73401920	2	2	1.2655	2.77878086857557e-09	73393601	73393601	3.4833092547326e-08	73401920	73406457
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	73406457	76116026	939	914	0.0183	3.4833092547326e-08	73401920	73406457	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22410	0.0076	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	565	-0.0209	NA	NA	NA	3.21660554653022e-82	1506379	1515948
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.0407	3.21660554653022e-82	1506379	1515948	1.45550542236385e-101	1525300	1531162
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	52080395	17246	16703	0.0027	1.45550542236385e-101	1525300	1531162	8.56062043749475e-08	52080395	52080395
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52086193	2	2	-1.1806	8.56062043749475e-08	52080395	52080395	5.6097260670722e-17	52086193	52086193
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52087787	52090393	3	3	-0.5962	5.6097260670722e-17	52086193	52086193	0.00510642983768972	52090393	52101308
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3623	0.0084	0.00510642983768972	52090393	52101308	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13057	0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22696038	2989	2916	0.01	NA	NA	NA	2.19627313934747e-11	22682428	22701123
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696162	22718614	13	13	0.5743	2.19627313934747e-11	22682428	22701123	2.11648126567399e-12	22714979	22725305
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22720195	35472378	6550	6364	0.0073	2.11648126567399e-12	22714979	22725305	9.71015011152806e-11	35472378	35472378
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.3442	9.71015011152806e-11	35472378	35472378	1.71821526567418e-10	35476942	35476942
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	43787733	4305	4184	0.0025	1.71821526567418e-10	35476942	35476942	1.08231315084298e-11	43786740	43787733
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43788948	43797968	4	4	-0.9972	1.08231315084298e-11	43786740	43787733	1.10797956892629e-11	43797968	43800278
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43800278	49571068	2694	2619	0.0169	1.10797956892629e-11	43797968	43800278	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.3138	NA	NA	NA	4.33462357635558e-19	94062	94062
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.1416	4.33462357635558e-19	94062	94062	2.13199215733225e-20	104732	104732
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	16	-0.0248	2.13199215733225e-20	104732	104732	6.28679068654652e-05	122273	127779
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-0.8613	6.28679068654652e-05	122273	127779	3.98240280830225e-10	129104	132689
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	725	0.0139	3.98240280830225e-10	129104	132689	4.26826472717338e-11	1431411	1431411
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.2646	4.26826472717338e-11	1431411	1431411	2.13695065416458e-11	1432953	1432953
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2303192	610	596	0.0037	2.13695065416458e-11	1432953	1432953	2.83519849696089e-33	2303192	2303192
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-1.7551	2.83519849696089e-33	2303192	2303192	2.25509166038272e-36	2304398	2304398
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	379	-0.0301	2.25509166038272e-36	2304398	2304398	0	2708291	2711273
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22281	0.9089	0	2708291	2711273	1.47521680603865e-25	76998610	76998610
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.216	1.47521680603865e-25	76998610	76998610	1.11853366435251e-25	77010018	77010018
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21554	0.9133	1.11853366435251e-25	77010018	77010018	0	154578922	154582414
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0323	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3780462	127	124	-3.8057	NA	NA	NA	1.02527857601838e-14	3772482	3780462
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4174561	5593746	12	11	-1.0449	1.02527857601838e-14	3772482	3780462	1.55678671098920e-08	5531459	6692482
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6955902	120	119	-3.5607	1.5567867109892e-08	5531459	6692482	4.11158616512391e-06	6912779	7029972
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6956705	7653082	214	209	-2.7577	4.11158616512391e-06	6912779	7029972	5.71450919554283e-05	7584183	7660965
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-3.9105	5.71450919554283e-05	7584183	7660965	2.7625916391289e-06	7701303	7729757
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7914104	67	60	-2.7385	2.7625916391289e-06	7701303	7729757	1.15529861375381e-06	7841425	8005148
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8956787	278	272	-3.5921	1.15529861375381e-06	7841425	8005148	0.000380176649841287	8856239	9069601
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	34	-4.4312	0.000380176649841287	8856239	9069601	1.60396413982299e-14	9155283	9160624
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10012024	11	10	-2.1336	1.60396413982299e-14	9155283	9160624	6.97381500927269e-10	10012024	10030654
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10014777	1	0	NA	6.97381500927269e-10	10012024	10030654	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10025706	10513747	63	61	-3.9188	NA	NA	NA	7.57497680610628e-48	10513747	10515697
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.4385	7.57497680610628e-48	10513747	10515697	0.0465274709985601	10631941	11660512
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-2.1218	0.0465274709985601	10631941	11660512	0.00243283627948937	10655750	11698871
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	0.00243283627948937	10655750	11698871	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-4.653	NA	NA	NA	2.10561284564861e-10	12536761	12542979
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	56	-1.8726	2.10561284564861e-10	12536761	12542979	2.92480063703332e-10	12658135	12700767
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12804329	19	19	-3.9802	2.92480063703332e-10	12658135	12700767	2.48473719114032e-07	12776542	12852769
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	13133803	118	115	-2.2132	2.48473719114032e-07	12776542	12852769	0.000783663050597633	13059372	13165652
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13286708	52	48	-3.102	0.000783663050597633	13059372	13165652	0.000133495240612026	13208776	13344526
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13296819	14342834	355	340	-3.8349	0.000133495240612026	13208776	13344526	6.19177783314777e-08	14210847	14386474
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	94	-3.0932	6.19177783314777e-08	14210847	14386474	2.7360799558925e-08	14492454	14530134
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.7360799558925e-08	14492454	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.4505	NA	NA	NA	4.8494507119685e-14	14569287	14598838
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	404	-3.4927	4.8494507119685e-14	14569287	14598838	0.0116810407935627	15788556	15915466
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15949457	8	7	-1.8244	0.0116810407935627	15788556	15915466	0.0106735374992144	15947948	15990153
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15951430	16035717	35	33	-3.1509	0.0106735374992144	15947948	15990153	0.000283296808510175	16017681	16036892
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.2969	0.000283296808510175	16017681	16036892	3.91044223220323e-05	16042966	16064208
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	22139807	1051	1010	-3.6558	3.91044223220323e-05	16042966	16064208	1.57040271125705e-07	22052726	22157319
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.3443	1.57040271125705e-07	22052726	22157319	1.35833511507329e-08	22176501	22181855
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	88	-3.8412	1.35833511507329e-08	22176501	22181855	1.66984351412130e-33	22930737	25737663
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.1293	1.6698435141213e-33	22930737	25737663	1.34598219191687e-09	26945084	26952278
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.0422	1.34598219191687e-09	26945084	26952278	0.000597250310192601	26957814	26989053
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	12	-1.1946	0.000597250310192601	26957814	26989053	1.05927323120224e-09	27011035	27019256
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.9318	1.05927323120224e-09	27011035	27019256	1.13373502674952e-07	27039222	27063070
MSK_252152915053_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.6936	1.13373502674952e-07	27039222	27063070	NA	NA	NA
