Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27408	0.0033	NA	NA	NA	9.27728440291092e-232	72537426	72537426
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72539143	1	0	NA	9.27728440291092e-232	72537426	72537426	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72579311	13	11	-3.3572	NA	NA	NA	2.81434613000914e-223	72579311	72579311
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	2.81434613000914e-223	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	94060783	6989	6866	0.0116	NA	NA	NA	3.32385630853465e-09	94060783	94060783
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-1.6395	3.32385630853465e-09	94060783	94060783	4.91217893004088e-09	94062928	94062928
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	157133150	13336	13116	-0.0012	4.91217893004088e-09	94062928	94062928	4.1213521848049e-41	157133150	157133150
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.3842	4.1213521848049e-41	157133150	157133150	4.16253622173585e-40	157136342	157136342
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11150	-7e-04	4.16253622173585e-40	157136342	157136342	1.81801859557908e-08	185979586	185979586
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.6084	1.81801859557908e-08	185979586	185979586	1.77439649310438e-08	185988138	185988138
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	247186514	21583	21275	8e-04	1.77439649310438e-08	185988138	185988138	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20231737	5876	5779	-0.0024	NA	NA	NA	1.141321118592e-07	20231737	20231737
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.4825	1.141321118592e-07	20231737	20231737	2.75657703424470e-07	20236210	20237659
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	34558824	5649	5556	0.0017	2.7565770342447e-07	20236210	20237659	2.12037465672041e-09	34551222	34563081
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34561038	34589997	13	13	-0.6545	2.12037465672041e-09	34551222	34563081	6.60381405277927e-09	34582272	34599239
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	242689978	66287	65203	0.0013	6.60381405277927e-09	34582272	34599239	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10623	-1e-04	NA	NA	NA	1.58100401065429e-13	32074432	32074432
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.961	1.58100401065429e-13	32074432	32074432	2.21157826513765e-13	32080848	32080848
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	89475107	19843	19549	0.0034	2.21157826513765e-13	32080848	32080848	5.76236942215765e-20	89471984	89475107
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89499433	12	12	-0.9628	5.76236942215765e-20	89471984	89475107	6.56997953723022e-19	89499433	89502757
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89500935	164005577	22838	22466	0.0011	6.56997953723022e-19	89499433	89502757	4.86794713295853e-55	164005577	164005577
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.8069	4.86794713295853e-55	164005577	164005577	5.60998417830118e-55	164027724	164027724
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9980	-0.0033	5.60998417830118e-55	164027724	164027724	1.78210787041732e-225	194354505	194354505
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.631	1.78210787041732e-225	194354505	194354505	2.58308431784142e-228	194366950	194366950
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196801358	986	975	-0.0132	2.58308431784142e-228	194366950	194366950	5.52602577150117e-07	196789992	196807153
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196802920	196928503	29	28	0.369	5.52602577150117e-07	196789992	196807153	7.62125977548479e-07	196917833	196964180
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929805	199329592	965	952	-0.0134	7.62125977548479e-07	196917833	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3339	0.0091	NA	NA	NA	5.15017360605032e-177	9815760	9815760
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.7707	5.15017360605032e-177	9815760	9815760	4.06586564742337e-162	9842644	9842644
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	186676034	50213	49439	0.0061	4.06586564742337e-162	9842644	9842644	8.15186162701265e-33	186676034	186676034
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.0838	8.15186162701265e-33	186676034	186676034	4.18567997975816e-34	186680176	186680176
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1522	-0.0073	4.18567997975816e-34	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	17395391	5466	5391	-0.001	NA	NA	NA	1.81255773693770e-15	17394016	17395391
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17397258	17411379	9	9	-0.9646	1.8125577369377e-15	17394016	17395391	3.19230148067944e-14	17411379	17414784
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17414784	180644810	48291	47486	0.001	3.19230148067944e-14	17411379	17414784	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	56	-0.022	NA	NA	NA	9.4968182453005e-13	232366	251128
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	327962	46	45	-0.5057	9.4968182453005e-13	232366	251128	4.64156406605845e-21	318496	335212
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	26811016	9264	9141	0.0026	4.64156406605845e-21	318496	335212	3.48368426084193e-14	26811016	26811016
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-1.4046	3.48368426084193e-14	26811016	26811016	4.42269426290244e-14	26861184	26861184
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32548736	2306	2265	0.008	4.42269426290244e-14	26861184	26861184	1.08342593929115e-40	32548736	32548736
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	1.6865	1.08342593929115e-40	32548736	32548736	1.27952727361531e-48	32595402	32595402
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	54035000	8305	8184	0.0073	1.27952727361531e-48	32595402	32595402	1.37664046950931e-25	54033505	54035000
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.2606	1.37664046950931e-25	54033505	54035000	9.64006805557108e-08	54042734	54045472
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74766480	5313	5216	0.0096	9.64006805557108e-08	54042734	54045472	8.51043487461615e-09	74762234	74768342
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74768342	74773321	4	4	1.16	8.51043487461615e-09	74762234	74768342	4.33328932273676e-09	74772169	74780074
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	103841482	7890	7756	-0.0028	4.33328932273676e-09	74772169	74780074	1.67011322468220e-12	103827105	103841482
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.3479	1.6701132246822e-12	103827105	103841482	3.35176900058788e-12	103868154	103873584
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22579	0.0033	3.35176900058788e-12	103868154	103873584	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	141690753	49933	49144	0.0033	NA	NA	NA	8.20512234186465e-251	141690753	141690753
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-4.1739	8.20512234186465e-251	141690753	141690753	0.00205468716651602	141709835	141711513
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141714168	2	2	-1.8166	0.00205468716651602	141709835	141711513	8.18583937882518e-11	141714168	141714168
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2477	0.0176	8.18583937882518e-11	141714168	141714168	5.97593011064882e-37	147702365	147702365
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.3101	5.97593011064882e-37	147702365	147702365	1.71724218431649e-39	147707161	147707161
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4168	-0.0111	1.71724218431649e-39	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39350798	13074	12857	-0.0024	NA	NA	NA	0	39350798	39352361
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	-3.8151	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	432	0.0299	0	39504332	39505256	3.87209868904303e-62	40892587	40892587
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.018	3.87209868904303e-62	40892587	40892587	8.69613063804977e-59	40897469	40897469
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	58271240	3915	3847	2e-04	8.69613063804977e-59	40897469	40897469	1.07472979688935e-07	58268002	58271240
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58274145	58300815	6	6	0.867	1.07472979688935e-07	58268002	58271240	5.96009397798812e-07	58300815	58318848
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58306259	146264846	27069	26603	0.0075	5.96009397798812e-07	58300815	58318848	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7883	0.0047	NA	NA	NA	5.77509749887695e-65	23343915	23343915
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.4392	5.77509749887695e-65	23343915	23343915	1.67036290607411e-66	23365926	23365926
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	23377660	1	0	NA	1.67036290607411e-66	23365926	23365926	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23395558	70926188	5068	4972	0.0022	NA	NA	NA	2.47912687604857e-10	70926188	70926188
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7051	2.47912687604857e-10	70926188	70926188	7.78671082340814e-10	70930528	70930528
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23393	-0.003	7.78671082340814e-10	70930528	70930528	1.25924683490892e-19	137352394	137352394
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.3558	1.25924683490892e-19	137352394	137352394	5.74456122235377e-19	137356880	137356880
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1074	0.0085	5.74456122235377e-19	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	46389734	14460	14235	-0.0077	NA	NA	NA	0.000226456434639708	45464831	46394835
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46391653	46431590	20	19	-0.3888	0.000226456434639708	45464831	46394835	8.5604265809789e-07	46426199	46468860
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46432886	77917893	10112	9956	-0.0018	8.5604265809789e-07	46426199	46468860	4.6995047200588e-32	77917893	77917893
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.4635	4.6995047200588e-32	77917893	77917893	1.52182555575043e-32	77928738	77928738
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	12213	0.001	1.52182555575043e-32	77928738	77928738	1.47429163612633e-55	114100979	114100979
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.923	1.47429163612633e-55	114100979	114100979	5.50161649799768e-56	114106460	114106460
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	114108041	1	0	NA	5.50161649799768e-56	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114109303	135285645	7818	7703	-0.0137	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5733442	2134	2108	9e-04	NA	NA	NA	2.35955103020527e-13	5727997	5738494
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5734978	5765438	19	19	-0.653	2.35955103020527e-13	5727997	5738494	1.00090227277497e-13	5760117	5775970
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14511	8e-04	1.00090227277497e-13	5760117	5775970	3.60842195808311e-15	55095200	55129329
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	33	0.5211	3.60842195808311e-15	55095200	55129329	1.42787512417381e-15	55190146	55209626
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	93000699	13694	13490	9e-04	1.42787512417381e-15	55190146	55209626	2.05934974720053e-07	93000699	93000699
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93003167	93005517	2	2	-1.4949	2.05934974720053e-07	93000699	93000699	1.39165152745607e-07	93005517	93005517
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93008346	134450318	14670	14450	1e-04	1.39165152745607e-07	93005517	93005517	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3684	0.0045	NA	NA	NA	7.39578210442476e-24	9516067	9531133
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.0153	7.39578210442476e-24	9516067	9531133	2.07535533055686e-23	9589725	9607363
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	9604633	1	0	NA	2.07535533055686e-23	9589725	9607363	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	11116883	573	556	-0.0214	NA	NA	NA	4.20444203877279e-94	11116883	11116883
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.0977	4.20444203877279e-94	11116883	11116883	9.6603990236435e-103	11130871	11130871
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132289090	40826	40183	0.0042	9.6603990236435e-103	11130871	11130871	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7218	-0.0013	NA	NA	NA	1.09474962511029e-19	37953582	37953582
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.3644	1.09474962511029e-19	37953582	37953582	5.60738199023459e-19	37957844	37957844
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	89659397	14953	14703	0.0011	5.60738199023459e-19	37957844	37957844	7.47437757044533e-48	89659397	89659397
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-3.7092	7.47437757044533e-48	89659397	89659397	4.58510754141213e-51	89662326	89662326
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4693	0.0056	4.58510754141213e-51	89662326	89662326	1.33631818475645e-121	100690991	100690991
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.6994	1.33631818475645e-121	100690991	100690991	2.23359848229147e-119	100693892	100693892
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4488	-0.0072	2.23359848229147e-119	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	73061942	19419	19147	0.0027	NA	NA	NA	7.23450046459791e-51	73061942	73071404
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	8	-1.9116	7.23450046459791e-51	73061942	73071404	3.74035995357531e-52	73091980	73092112
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	12020	-0.0051	3.74035995357531e-52	73091980	73092112	2.92526198174716e-195	105597555	105597555
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.1301	2.92526198174716e-195	105597555	105597555	1.85597937952672e-123	105632168	105632168
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105945006	70	66	-0.0443	1.85597937952672e-123	105632168	105632168	3.67062178362865e-11	105916075	105946993
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106013552	20	20	-0.6441	3.67062178362865e-11	105916075	105946993	5.33441122402269e-14	106002179	106019719
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106015449	106358491	141	140	0.027	5.33441122402269e-14	106002179	106019719	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2593	NA	NA	NA	6.53005510437019e-27	18452491	18452491
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18843998	12	12	-1.5355	6.53005510437019e-27	18452491	18452491	5.2806554165055e-18	18843998	18843998
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18846835	18848213	2	2	-4.0796	5.2806554165055e-18	18843998	18843998	1.84724297969162e-11	18848213	18848213
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19845942	91	89	-1.5304	1.84724297969162e-11	18848213	18848213	4.17669385076034e-33	19845942	19845942
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-5.3772	4.17669385076034e-33	19845942	19845942	9.07848034952715e-53	19882711	19882711
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	43	-1.0979	9.07848034952715e-53	19882711	19882711	5.6280814623215e-92	20079935	20308014
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74664249	21553	21257	-0.0054	5.6280814623215e-92	20079935	20308014	2.84661977758368e-08	74653507	74665386
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74665386	74680439	6	6	0.9136	2.84661977758368e-08	74653507	74665386	2.65808817543442e-08	74680338	74696702
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	169	-0.0145	2.65808817543442e-08	74680338	74696702	7.92526261285883e-15	75115806	75115806
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	2.0847	7.92526261285883e-15	75115806	75115806	2.60326780810666e-15	75119713	75119713
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9282	-0.0061	2.60326780810666e-15	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	988	0.0144	NA	NA	NA	1.55262426815099e-42	2600740	2638581
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-2.8864	1.55262426815099e-42	2600740	2638581	8.98118417977698e-46	2638643	2639798
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	75093957	19507	19204	-0.0011	8.98118417977698e-46	2638643	2639798	8.07799712892263e-33	75093957	75093957
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75099083	2	2	-2.9972	8.07799712892263e-33	75093957	75093957	1.31795622777019e-33	75099083	75099083
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75100865	76925748	611	601	-0.0207	1.31795622777019e-33	75099083	75099083	1.11797957353038e-223	76925748	76925748
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.0006	1.11797957353038e-223	76925748	76925748	1.12239161546720e-230	76940218	76940218
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4445	-0.0056	1.1223916154672e-230	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36672710	13870	13640	0.0025	NA	NA	NA	2.62995371570321e-07	36664609	36672710
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.7959	2.62995371570321e-07	36664609	36672710	7.76022068608191e-08	36684619	36687917
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1982	0.0068	7.76022068608191e-08	36684619	36687917	5.10908123796168e-13	41512318	41522429
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	21	0.5881	5.10908123796168e-13	41512318	41522429	1.52405243615784e-12	41564408	41574775
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	58439971	5957	5874	0.0023	1.52405243615784e-12	41564408	41574775	2.28764583312472e-06	58432074	58439971
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58441144	58452260	6	6	0.8002	2.28764583312472e-06	58432074	58439971	2.25112146979161e-06	58452260	58459873
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	78653545	7761	7630	0.0016	2.25112146979161e-06	58452260	58459873	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	76116026	22963	22606	-0.0043	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22680	0.009	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	579	-0.0383	NA	NA	NA	1.43268716812823e-14	1499421	1515948
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	0.9652	1.43268716812823e-14	1499421	1515948	3.74040624830772e-13	1525300	1532433
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	21231072	7126	6996	-0.0032	3.74040624830772e-13	1525300	1532433	1.72012274324502e-09	21231072	21231072
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21233374	21236012	2	2	-1.6633	1.72012274324502e-09	21231072	21231072	1.86818969920797e-09	21236012	21236012
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21242143	62419534	13856	13656	-0.0037	1.86818969920797e-09	21236012	21236012	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13208	0.0023	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22696162	2990	2952	0.0111	NA	NA	NA	7.28713498839902e-08	22686690	22701123
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22710302	7	7	0.8195	7.28713498839902e-08	22686690	22701123	2.40713911326813e-08	22710302	22713972
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22712211	35472378	6555	6445	-0.003	2.40713911326813e-08	22710302	22713972	1.38727902179112e-37	35472378	35472378
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.1735	1.38727902179112e-37	35472378	35472378	4.61421368369885e-39	35476942	35476942
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	38921192	1821	1791	0.0041	4.61421368369885e-39	35476942	35476942	5.41743421541877e-07	38916171	38923041
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	38923041	38929566	4	4	-0.9738	5.41743421541877e-07	38916171	38923041	2.15411358308945e-06	38927964	38932314
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	38930545	49571068	5178	5094	-5e-04	2.15411358308945e-06	38927964	38932314	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127779	31	30	-0.0226	NA	NA	NA	8.0062406339801e-07	127113	127779
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	-1.2197	8.0062406339801e-07	127113	127779	5.73231077988348e-10	130528	132689
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	741	0.0052	5.73231077988348e-10	130528	132689	1.32064070478257e-13	1427338	1431240
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.2398	1.32064070478257e-13	1427338	1431240	2.9386081844188e-13	1432891	1432953
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	597	0.0031	2.9386081844188e-13	1432891	1432953	1.18303643161947e-05	2300485	2302065
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.8194	1.18303643161947e-05	2300485	2302065	1.42113572504549e-07	2304398	2306110
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708113	388	381	-0.0521	1.42113572504549e-07	2304398	2306110	0	2706218	2711273
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	154582414	45135	44392	0.9484	0	2706218	2711273	1.81903187367331e-299	154578922	154586690
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0331	1.81903187367331e-299	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	120	-3.575	NA	NA	NA	3.10007000011518e-17	2965000	3219200
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	18	-1.1057	3.10007000011518e-17	2965000	3219200	6.00043661444584e-12	5531459	6692482
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	171	-3.359	6.00043661444584e-12	5531459	6692482	5.33554963401016e-07	7016002	7204505
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	120	-2.464	5.33554963401016e-07	7016002	7204505	4.86183993584126e-05	7338262	7603458
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7709619	73	72	-3.4371	4.86183993584126e-05	7338262	7603458	0.000377319282404116	7668037	7726921
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	26	-2.3636	0.000377319282404116	7668037	7726921	0.0063481955751094	7723783	7806091
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7859390	29	29	-3.2847	0.0063481955751094	7723783	7806091	1.92679402487810e-05	7852359	7870400
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	11	-1.8428	1.9267940248781e-05	7852359	7870400	2.45180458429003e-05	7905286	7947666
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	380	-3.4939	2.45180458429003e-05	7905286	7947666	1.59002375218881e-20	10511255	10537808
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	19	-1.0308	1.59002375218881e-20	10511255	10537808	1.45933616657143e-11	11249952	11698871
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12537944	11	11	-4.1439	1.45933616657143e-11	11249952	11698871	5.05118108472825e-06	12537944	12556034
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	53	-1.9857	5.05118108472825e-06	12537944	12556034	0.000287615858750589	12614562	12772155
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12924438	54	54	-3.1219	0.000287615858750589	12614562	12772155	2.16614443301206e-06	12872417	12965378
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13129843	82	80	-1.9986	2.16614443301206e-06	12872417	12965378	5.70070031798583e-23	13111594	13146483
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13716331	220	218	-3.3827	5.70070031798583e-23	13111594	13146483	0.000605746181670172	13508776	13895192
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	14342834	188	186	-3.8142	0.000605746181670172	13508776	13895192	2.2285474675565e-10	14310145	14377844
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	93	-2.899	2.2285474675565e-10	14310145	14377844	0.000189487182070029	14491287	14540351
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-1.6888	0.000189487182070029	14491287	14540351	0.0008034633438583	14550971	14601309
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14708015	30	30	-3.0579	0.0008034633438583	14550971	14601309	0.00987465677046719	14603508	14734647
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14709446	14875973	35	35	-3.9751	0.00987465677046719	14603508	14734647	5.37911056659672e-05	14812822	15014767
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	15303557	141	138	-2.9649	5.37911056659672e-05	14812822	15014767	3.32101203321772e-06	15274383	15321153
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15304956	15408015	67	67	-3.842	3.32101203321772e-06	15274383	15321153	0.00112741612387685	15379192	15514330
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	16212418	268	263	-3.1785	0.00112741612387685	15379192	15514330	0.000406842385640541	16027648	16631496
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16214032	21036503	709	693	-3.5452	0.000406842385640541	16027648	16631496	9.98761782151084e-06	21034708	21042490
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.1894	9.98761782151084e-06	21034708	21042490	4.65016071881943e-07	21048365	21060047
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	254	-3.6582	4.65016071881943e-07	21048365	21060047	4.01053970839526e-05	22043133	22169951
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22179794	11	11	-2.0719	4.01053970839526e-05	22043133	22169951	0.000135803050077404	22175425	22204143
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	25737663	93	91	-3.7392	0.000135803050077404	22175425	22204143	3.01929848435144e-32	22930737	25737663
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	29	-1.0732	3.01929848435144e-32	22930737	25737663	0.000384832449743672	26943701	27006628
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.241	0.000384832449743672	26943701	27006628	5.09542030945694e-05	27007874	27068911
MSK_252152915054_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.7412	5.09542030945694e-05	27007874	27068911	NA	NA	NA
