Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27201	0.0071	NA	NA	NA	3.04561000340531e-257	72537426	72537426
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.5365	3.04561000340531e-257	72537426	72537426	5.42089505655423e-248	72579311	72579311
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150841957	17561	17116	-0.0033	5.42089505655423e-248	72579311	72579311	1.95465561342616e-15	150841957	150841957
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150843192	150846148	3	3	-1.8799	1.95465561342616e-15	150841957	150841957	1.60529854201455e-16	150846148	150846148
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.60529854201455e-16	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2697	0.0083	NA	NA	NA	3.46961793800754e-08	157133150	157133150
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.644	3.46961793800754e-08	157133150	157133150	7.29816929895718e-08	157136342	157138568
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1578	-0.0085	7.29816929895718e-08	157136342	157138568	8.64840861109295e-09	161099582	161099582
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.7325	8.64840861109295e-09	161099582	161099582	3.32450641855767e-08	161104791	161104791
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	247186514	31286	30497	-3e-04	3.32450641855767e-08	161104791	161104791	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11233	0.0023	NA	NA	NA	0	34543992	34551222
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-3.8887	0	34543992	34551222	0	34583814	34589997
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37810001	1369	1336	-0.0269	0	34583814	34589997	1.56153193989014e-15	37797909	37819785
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.71	1.56153193989014e-15	37797909	37819785	3.3149145291536e-16	37843380	37862351
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	106244482	20979	20467	-0.007	3.3149145291536e-16	37843380	37862351	2.09139954287833e-14	106244482	106244482
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-2.2107	2.09139954287833e-14	106244482	106244482	1.26927264642140e-13	106250718	106250718
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	242689978	43915	42843	-0.0026	1.2692726464214e-13	106250718	106250718	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10538	-0.0037	NA	NA	NA	4.36467235231798e-15	32074432	32074432
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.2526	4.36467235231798e-15	32074432	32074432	6.36689273711875e-16	32080848	32080848
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5287	0.0125	6.36689273711875e-16	32080848	32080848	4.48655243859113e-56	47460892	47460892
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.1773	4.48655243859113e-56	47460892	47460892	7.89515858899884e-52	47466921	47466921
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	163992903	37268	36321	-0.0033	7.89515858899884e-52	47466921	47466921	2.65797106722219e-23	163984178	164023502
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164112873	29	26	0.7827	2.65797106722219e-23	163984178	164023502	5.94511259590556e-24	164083826	164121847
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9876	-0.0073	5.94511259590556e-24	164083826	164121847	1.68961739576395e-154	194354505	194354505
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.1173	1.68961739576395e-154	194354505	194354505	1.19028530919823e-156	194366950	194366950
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1920	-0.006	1.19028530919823e-156	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3316	0.0205	NA	NA	NA	3.92543690825962e-138	9815760	9815760
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.5421	3.92543690825962e-138	9815760	9815760	1.01057469884409e-123	9842644	9842644
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	151358223	39673	38704	-0.0038	1.01057469884409e-123	9842644	9842644	2.92699788427627e-08	151358223	151358223
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151359426	151362088	2	2	1.753	2.92699788427627e-08	151358223	151358223	1.47652688716103e-08	151362088	151363764
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151363764	173224400	6568	6404	-4e-04	1.47652688716103e-08	151362088	151363764	5.02697592930013e-30	173224400	173224400
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.1996	5.02697592930013e-30	173224400	173224400	2.58716306231884e-32	173228860	173228860
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	0.012	2.58716306231884e-32	173228860	173228860	7.94957640826935e-28	173660684	173660684
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.9757	7.94957640826935e-28	173660684	173660684	1.39886437942640e-26	173666072	173666072
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5210	-0.0038	1.3988643794264e-26	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	219	0.0265	NA	NA	NA	3.78102477810776e-07	729262	813837
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	905462	8	8	0.7437	3.78102477810776e-07	729262	813837	6.3064448953147e-07	870657	913468
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	910211	12857302	3744	3658	-0.0026	6.3064448953147e-07	870657	913468	2.18218452413732e-07	12853151	12857302
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.5338	2.18218452413732e-07	12853151	12857302	1.83192261658393e-06	12873052	13263185
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	59521690	12226	11916	-0.0056	1.83192261658393e-06	12873052	13263185	1.29159641980915e-07	59519685	59521690
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59525396	59531344	3	3	-1.3589	1.29159641980915e-07	59519685	59521690	1.69496832428882e-07	59531344	59535295
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59535295	150155049	27641	26932	-0.0044	1.69496832428882e-07	59531344	59535295	5.54590095578421e-07	150144129	150162435
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150156233	150204134	15	15	-0.5917	5.54590095578421e-07	150144129	150162435	8.48529259314296e-08	150197673	150219836
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	180644810	9904	9672	0.0101	8.48529259314296e-08	150197673	150219836	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	40	0.0824	NA	NA	NA	1.71515209353116e-15	198124	200350
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	241674	17	17	-0.7161	1.71515209353116e-15	198124	200350	5.0002609475836e-13	241674	248239
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	32558677	11620	11309	-5e-04	5.0002609475836e-13	241674	248239	1.12346548539734e-06	32539864	32563252
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	6	0.8843	1.12346548539734e-06	32539864	32563252	4.07401549577137e-06	32588005	32600962
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	37	0.09	4.07401549577137e-06	32588005	32600962	6.6858581802099e-11	32711957	32718991
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.0807	6.6858581802099e-11	32711957	32718991	2.92515974809263e-13	32723722	32732764
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862270	1345	1308	0.0121	2.92515974809263e-13	32723722	32732764	1.66875605940436e-06	35853209	35862270
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35862502	35872078	6	6	0.8865	1.66875605940436e-06	35853209	35862270	1.79403948671823e-06	35872078	35878656
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35873335	65767409	9309	9068	4e-04	1.79403948671823e-06	35872078	35878656	8.71719024868676e-42	65767409	65767409
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-3.7321	8.71719024868676e-42	65767409	65767409	7.75963907784547e-42	65771532	65771532
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	170753106	33725	32893	-0.0045	7.75963907784547e-42	65771532	65771532	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	5644321	2039	1997	0.0289	NA	NA	NA	9.52212797711227e-30	5634506	5659324
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5647373	5856032	76	75	0.5364	9.52212797711227e-30	5634506	5659324	1.22758305661797e-33	5831318	5889952
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5857936	16135701	3273	3191	-0.0047	1.22758305661797e-33	5831318	5889952	2.25762435319263e-47	16135701	16135701
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-3.8809	2.25762435319263e-47	16135701	16135701	1.0295195332061e-44	16140018	16140018
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	147702365	47065	45915	1e-04	1.0295195332061e-44	16140018	16140018	5.55490232864354e-45	147702365	147702365
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.8925	5.55490232864354e-45	147702365	147702365	5.87476206263063e-47	147707161	147707161
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4154	-0.0088	5.87476206263063e-47	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.0098	NA	NA	NA	5.6041230205947e-30	581533	581533
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.1384	5.6041230205947e-30	581533	581533	9.88807908077222e-30	588865	588865
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	32797545	11072	10781	-0.0069	9.88807908077222e-30	588865	588865	2.67643302394696e-26	32797545	32797545
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-2.4155	2.67643302394696e-26	32797545	32797545	6.25404558112489e-26	32808049	32808049
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	146264846	33370	32502	0.0012	6.25404558112489e-26	32808049	32808049	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2412	0.0058	NA	NA	NA	7.02274873744971e-123	6685358	6685358
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-5.138	7.02274873744971e-123	6685358	6685358	1.89394685823852e-119	6698290	6698290
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	8340800	414	403	-0.0195	1.89394685823852e-119	6698290	6698290	4.40851701294082e-08	8339341	8342705
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	8342705	8345409	3	3	-1.3419	4.40851701294082e-08	8339341	8342705	1.07276068848989e-07	8344218	8347993
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	8347993	70926188	10181	9936	0.0011	1.07276068848989e-07	8344218	8347993	7.09331053861759e-09	70923005	70926188
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7567	7.09331053861759e-09	70923005	70926188	5.33306996882788e-09	70930528	70935055
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9673	-0.0057	5.33306996882788e-09	70930528	70935055	2.32145813595315e-43	100348045	100348045
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-3.7581	2.32145813595315e-43	100348045	100348045	5.44959595137762e-43	100350814	100350814
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	140145683	14949	14569	-0.0042	5.44959595137762e-43	100350814	100350814	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	100861282	32426	31534	-0.0052	NA	NA	NA	5.30394851667589e-14	100861282	100861282
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100862720	100863972	2	2	-2.1981	5.30394851667589e-14	100861282	100861282	2.45692597275301e-14	100863972	100863972
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100865503	100865503	1	0	NA	2.45692597275301e-14	100863972	100863972	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100866864	114100979	4558	4443	0.0016	NA	NA	NA	1.26847368663114e-24	114100979	114100979
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.8509	1.26847368663114e-24	114100979	114100979	3.21187416481054e-25	114106460	114106460
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	123957735	3769	3665	-0.0036	3.21187416481054e-25	114106460	114106460	2.00944898526122e-06	123955023	123957735
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123969584	5	5	-0.9403	2.00944898526122e-06	123955023	123957735	2.18396321519824e-06	123969584	123974228
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	135285645	4045	3938	-0.01	2.18396321519824e-06	123969584	123974228	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1722	-0.0029	NA	NA	NA	2.50876837669701e-145	4923300	4923300
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.3879	2.50876837669701e-145	4923300	4923300	4.47832859436684e-146	4932214	4932214
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55124730	15130	14729	-0.0029	4.47832859436684e-146	4932214	4932214	3.29125133162286e-14	55097806	55131703
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55196550	30	30	0.5695	3.29125133162286e-14	55097806	55131703	2.39620637101694e-14	55191277	55205278
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55197848	134450318	28367	27634	0.0023	2.39620637101694e-14	55191277	55205278	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3655	0.0103	NA	NA	NA	8.88876305594889e-22	9516067	9523923
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	1.115	8.88876305594889e-22	9516067	9523923	5.57499702069192e-22	9599999	9604633
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	132289090	41406	40363	0.0037	5.57499702069192e-22	9599999	9604633	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6864	-0.0113	NA	NA	NA	2.4632989645968e-53	36969571	36969571
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.2061	2.4632989645968e-53	36969571	36969571	1.83383274190843e-49	36982877	36982877
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	291	-0.0021	1.83383274190843e-49	36982877	36982877	8.53295035450368e-16	37953582	37953582
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.3891	8.53295035450368e-16	37953582	37953582	1.65562649321197e-16	37957844	37957844
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	100690991	19740	19239	-0.0048	1.65562649321197e-16	37957844	37957844	2.46921174796727e-22	100690991	100690991
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.7738	2.46921174796727e-22	100690991	100690991	3.85448167160975e-23	100693892	100693892
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4458	-0.0125	3.85448167160975e-23	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19490630	58	57	-0.6369	NA	NA	NA	3.80647296248585e-34	19475864	19535787
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19492531	40680589	7591	7416	0.0029	3.80647296248585e-34	19475864	19535787	2.13234483511353e-09	40670538	40680589
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-1.0536	2.13234483511353e-09	40670538	40680589	4.33324478793221e-09	40722360	40726930
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73061942	11764	11458	-0.0113	4.33324478793221e-09	40722360	40726930	1.61123661521236e-22	73060301	73072457
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73071404	1	0	NA	1.61123661521236e-22	73060301	73072457	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73101327	8	8	-1.3995	NA	NA	NA	2.80970602728003e-23	73092112	73104540
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	106355517	12456	12149	-0.0013	2.80970602728003e-23	73092112	73104540	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106358491	106358491	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18450562	4	4	0.1251	NA	NA	NA	7.16568589958272e-16	18450562	18450562
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18452491	18452491	1	0	NA	7.16568589958272e-16	18450562	18450562	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18843998	12	11	-1.4825	NA	NA	NA	1.78550930007526e-27	18843998	18843998
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18846835	18848213	2	2	-4.2882	1.78550930007526e-27	18843998	18843998	1.06724866252060e-14	18848213	18848213
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19910696	95	90	-1.5699	1.0672486625206e-14	18848213	18848213	2.15880839805826e-11	19835471	19932166
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19927040	20088256	42	42	-0.9581	2.15880839805826e-11	19835471	19932166	1.52300615371811e-56	20065525	20308014
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	52517110	11844	11562	-0.0084	1.52300615371811e-56	20065525	20308014	2.13873477866859e-09	52517110	52517110
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.8464	2.13873477866859e-09	52517110	52517110	1.24469707692059e-09	52533227	52533227
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	67553998	6721	6546	-0.0079	1.24469707692059e-09	52533227	52533227	8.03195461781654e-09	67551868	67553998
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67557495	67558995	2	2	1.7571	8.03195461781654e-09	67551868	67553998	7.84223911125018e-09	67558995	67558995
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67561019	74669752	2986	2907	2e-04	7.84223911125018e-09	67558995	67558995	2.62987949642578e-07	74655153	74669752
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.1358	2.62987949642578e-07	74655153	74669752	6.91969394163502e-08	74680439	74696127
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	164	6e-04	6.91969394163502e-08	74680439	74696127	5.35169529693372e-19	75115806	75115806
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.491	5.35169529693372e-19	75115806	75115806	1.05439533650405e-18	75119713	75119713
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9193	-0.0043	1.05439533650405e-18	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54348362	13695	13355	0.0065	NA	NA	NA	5.55519944532545e-48	54348362	54365385
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-1.6738	5.55519944532545e-48	54348362	54365385	0.00129548237106748	54365385	54379839
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	1.2777	0.00129548237106748	54365385	54379839	1.14760649234428e-09	54399890	54405667
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	75093957	6813	6630	0.0033	1.14760649234428e-09	54399890	54405667	2.05023615834872e-21	75093957	75093957
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.1459	2.05023615834872e-21	75093957	75093957	6.85226940842392e-22	75100865	75100865
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5006	-0.0038	6.85226940842392e-22	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	401	0.0375	NA	NA	NA	1.02359554096214e-07	1026339	1027248
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1027736	1	0	NA	1.02359554096214e-07	1026339	1027248	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1028979	1030766	3	3	1.3025	NA	NA	NA	4.36646833058521e-07	1030766	1031233
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	41568539	15491	15109	0.0116	4.36646833058521e-07	1030766	1031233	2.95580875490289e-19	41552048	41573295
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42151941	50	50	-0.4924	2.95580875490289e-19	41552048	41573295	6.14188602809441e-19	42142363	42162729
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13351	0.0076	6.14188602809441e-19	42142363	42162729	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22394	-0.0086	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20420327	9217	8998	0.0307	NA	NA	NA	7.71566679118782e-188	20420327	20425020
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20422223	20493401	14	13	-2.9434	7.71566679118782e-188	20420327	20425020	8.12706000351008e-185	20472156	20493401
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	55769042	10124	9887	0.027	8.12706000351008e-185	20472156	20493401	1.66973249744201e-13	55769042	55769042
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-2.0545	1.66973249744201e-13	55769042	55769042	3.53636754393761e-14	55772729	55772729
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56822197	515	503	0.0147	3.53636754393761e-14	55772729	55772729	3.33279798742621e-08	56811268	56822197
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56823430	56842447	10	10	0.7195	3.33279798742621e-08	56811268	56822197	2.59655149048575e-07	56842447	56851287
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56844304	63788698	3177	3097	0.0117	2.59655149048575e-07	56842447	56851287	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	573	-0.0185	NA	NA	NA	2.32765684404296e-10	1499034	1518825
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.7948	2.32765684404296e-10	1499034	1518825	3.48541247131456e-09	1523000	1548251
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20478	0.0026	3.48541247131456e-09	1523000	1548251	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13108	8e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21571489	2521	2451	0.0074	NA	NA	NA	1.59430164478344e-15	21571489	21571489
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.8241	1.59430164478344e-15	21571489	21571489	4.76009389960705e-15	21576859	21576859
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	35472378	7028	6838	0.0118	4.76009389960705e-15	21576859	21576859	2.37426136350205e-34	35472378	35472378
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.3015	2.37426136350205e-34	35472378	35472378	6.43008290023786e-35	35476942	35476942
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6833	0.0122	6.43008290023786e-35	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	106242	14	14	0.5505	NA	NA	NA	4.68062251346661e-07	98390	113927
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	1431411	775	762	0.0252	4.68062251346661e-07	98390	113927	1.91397340868939e-07	1431240	1431411
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.3792	1.91397340868939e-07	1431240	1431411	1.78063288514459e-08	1432953	1432953
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	969	0.0432	1.78063288514459e-08	1432953	1432953	0	2708113	2713845
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	2711273	1	0	NA	0	2708113	2713845	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	76998610	22938	22284	0.9178	NA	NA	NA	1.43262435658461e-12	76998610	76998610
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.3129	1.43262435658461e-12	76998610	76998610	1.51269481070707e-12	77010018	77010018
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21615	0.9215	1.51269481070707e-12	77010018	77010018	6.2780492802562e-248	154570196	154586690
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0548	6.2780492802562e-248	154570196	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-3.4741	NA	NA	NA	1.78520186654288e-20	3034907	3773948
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5672441	17	16	-0.7266	1.78520186654288e-20	3034907	3773948	6.52149318487763e-12	5531459	6692482
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7054924	174	165	-3.1542	6.52149318487763e-12	5531459	6692482	0.000101047874072464	6997136	7248437
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	122	-2.3966	0.000101047874072464	6997136	7248437	2.75669910123179e-06	7331655	7652302
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	8956787	411	396	-3.1292	2.75669910123179e-06	7331655	7652302	0.00012921408509732	8856239	8963617
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9133230	29	28	-4.2538	0.00012921408509732	8856239	8963617	0.000668195887859611	9118845	10058016
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9135034	9135034	1	0	NA	0.000668195887859611	9118845	10058016	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9145335	10513747	81	80	-3.2532	NA	NA	NA	1.10376268244369e-17	10511255	10513747
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.3224	1.10376268244369e-17	10511255	10513747	0.0113709367726232	10622062	11660512
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-1.5911	0.0113709367726232	10622062	11660512	0.0156841101326151	11660512	12527445
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-3.769	0.0156841101326151	11660512	12527445	5.80448925236446e-05	12527445	12557151
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	13128515	189	185	-1.9716	5.80448925236446e-05	12527445	12557151	1.78524854493212e-05	13106723	13133803
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	12	-3.8052	1.78524854493212e-05	13106723	13133803	0.00691645133440243	13148290	13175367
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	28	-2.5845	0.00691645133440243	13148290	13175367	0.000344739640572352	13208776	13313420
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13562157	147	146	-3.5465	0.000344739640572352	13208776	13313420	0.000445241873232767	13527753	13587025
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13563756	13705594	30	29	-2.6342	0.000445241873232767	13527753	13587025	5.65726256324468e-06	13649497	13773971
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14358464	197	194	-3.7106	5.65726256324468e-06	13649497	13773971	4.6896830154173e-08	14353244	14361732
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14376942	9	9	-1.5622	4.6896830154173e-08	14353244	14361732	0.0630979075014803	14368151	14459118
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14508021	80	76	-2.7483	0.0630979075014803	14368151	14459118	0.00181073918309688	14489032	14547168
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	25	-1.6161	0.00181073918309688	14489032	14547168	2.12675885673519e-07	14554415	14601309
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15206674	151	143	-3.1634	2.12675885673519e-07	14554415	14601309	2.18489288222259e-05	15203221	15206674
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15221212	5	4	-0.1565	2.18489288222259e-05	15203221	15206674	3.80392627409082e-05	15221212	15227049
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15222741	15222741	1	0	NA	3.80392627409082e-05	15221212	15227049	NA	NA	NA
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15223545	15920478	261	257	-3.2943	NA	NA	NA	0.00084753920132221	15862122	15928904
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	15953710	9	9	-1.4825	0.00084753920132221	15862122	15928904	0.00607325342683738	15949457	15986595
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15955821	16035717	33	30	-2.9445	0.00607325342683738	15949457	15986595	0.00401305642704962	16004746	16035717
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.1431	0.00401305642704962	16004746	16035717	0.000288489989999282	16042966	16064208
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	22192409	1065	1037	-3.3693	0.000288489989999282	16042966	16064208	6.59651717934588e-06	22158616	22203194
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	22	-4.7288	6.59651717934588e-06	22158616	22203194	3.87703836868021e-06	22248936	22388804
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	63	-3.4162	3.87703836868021e-06	22248936	22388804	1.13092010967397e-28	22923722	26871442
MSK_252152915112_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.2908	1.13092010967397e-28	22923722	26871442	NA	NA	NA
