Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5647	0.0189	NA	NA	NA	1.36765097788426e-11	16817525	16888048
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17086698	9	9	-0.6114	1.36765097788426e-11	16817525	16888048	5.15481081680009e-10	17080364	17094475
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17094326	72537426	22097	21548	1e-04	5.15481081680009e-10	17080364	17094475	0	72537426	72537426
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-2.77	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150823073	17557	17113	-0.0054	0	72579311	72579311	1.43219321356603e-207	150823073	150823073
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.7098	1.43219321356603e-207	150823073	150823073	1.44011119283845e-125	150851439	150851439
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	-0.0062	1.44011119283845e-125	150851439	150851439	2.37596786476712e-11	151026228	151026228
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151033188	3	3	1.1457	2.37596786476712e-11	151026228	151026228	6.36108656562174e-12	151033188	151033188
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151036435	157133150	2680	2598	0.0027	6.36108656562174e-12	151033188	151033188	5.65023784283470e-08	157133150	157133150
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.159	5.6502378428347e-08	157133150	157133150	3.73675705683793e-08	157136342	157136342
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	166030012	3493	3420	-0.0119	3.73675705683793e-08	157136342	157136342	2.37229494808258e-06	166028846	166030012
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	166032224	166033636	2	2	-1.0538	2.37229494808258e-06	166028846	166030012	8.30191595645686e-08	166033636	166035690
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	166035690	167483267	613	600	0.0084	8.30191595645686e-08	166033636	166035690	3.41293172463908e-08	167477428	167483267
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-0.5371	3.41293172463908e-08	167477428	167483267	2.54542034701438e-06	167507898	167530480
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	173107561	2201	2153	-0.0066	2.54542034701438e-06	167507898	167530480	2.85811392657821e-10	173107561	173107561
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173110027	173113519	3	3	-1.0964	2.85811392657821e-10	173107561	173107561	6.85034647239184e-11	173113519	173116907
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173116907	247186514	26590	25968	-0.002	6.85034647239184e-11	173113519	173116907	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10584	2e-04	NA	NA	NA	3.31854752207449e-29	33076512	33076512
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.1393	3.31854752207449e-29	33076512	33076512	6.25279699454238e-28	33080437	33080437
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34551222	645	627	0.007	6.25279699454238e-28	33080437	33080437	1.86578732057852e-13	34527334	34554208
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	17	-0.5126	1.86578732057852e-13	34527334	34554208	1.05766310993783e-12	34582272	34597294
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	41091579	2875	2795	-0.0189	1.05766310993783e-12	34582272	34597294	1.3165375520315e-15	41087172	41091579
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-1.0235	1.3165375520315e-15	41087172	41091579	1.66563756476793e-15	41101640	41101640
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	242689978	63407	61801	-0.0032	1.66563756476793e-15	41101640	41101640	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	46769081	15925	15528	-0.0014	NA	NA	NA	2.98290951973761e-12	46764434	46772869
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.7153	2.98290951973761e-12	46764434	46772869	7.98247484077916e-11	46814662	46827727
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	47460892	285	278	0.0038	7.98247484077916e-11	46814662	46827727	1.37948107013087e-60	47460892	47460892
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-3.2751	1.37948107013087e-60	47460892	47460892	3.48183677335601e-66	47466921	47466921
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	164005577	37271	36354	-0.0041	3.48183677335601e-66	47466921	47466921	1.12948619599292e-74	164005577	164005577
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.1917	1.12948619599292e-74	164005577	164005577	6.48748350730661e-35	164027724	164027724
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	0.5224	6.48748350730661e-35	164027724	164027724	9.85290181158302e-17	164105613	164123806
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	174696638	3340	3250	-0.0039	9.85290181158302e-17	164105613	164123806	2.68460617312612e-08	174667253	174722441
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174698473	174778063	35	34	0.2862	2.68460617312612e-08	174667253	174722441	2.13030334640742e-08	174751544	174797985
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174779589	196907040	7760	7593	-0.0057	2.13030334640742e-08	174751544	174797985	2.86213008754970e-07	196807153	196916980
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196911010	196929826	17	17	-0.3914	2.8621300875497e-07	196807153	196916980	1.25856809460741e-06	196924077	196958467
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	938	-0.0201	1.25856809460741e-06	196924077	196958467	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	34445002	9563	9315	0.0049	NA	NA	NA	3.75836472704758e-300	34445002	34445002
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-3.947	3.75836472704758e-300	34445002	34445002	5.75008653838498e-294	34491115	34491115
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8631	-0.0076	5.75008653838498e-294	34491115	34491115	2.33599815313879e-15	68899247	69069651
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.6102	2.33599815313879e-15	68899247	69069651	1.43294504587096e-14	69153675	69656183
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	111	-0.0058	1.43294504587096e-14	69153675	69656183	1.12074694035722e-08	70108511	70150576
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70294312	5	5	-0.7383	1.12074694035722e-08	70108511	70150576	1.50877786386219e-07	70294312	70336467
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	173660684	31266	30474	-0.0018	1.50877786386219e-07	70294312	70336467	4.71396441444611e-12	173660684	173660684
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.4387	4.71396441444611e-12	173660684	173660684	1.74607718282066e-12	173666072	173666072
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3974	-0.0102	1.74607718282066e-12	173666072	173666072	8.41042724726395e-17	187330240	187330240
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.6616	8.41042724726395e-17	187330240	187330240	4.65382786426772e-17	187333619	187333619
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1215	0.0011	4.65382786426772e-17	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	178040439	52736	51464	-0.0021	NA	NA	NA	1.15488331187578e-75	178040439	178040439
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-3.4621	1.15488331187578e-75	178040439	178040439	1.43533734750182e-81	178045608	178045608
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180342860	908	880	0.0103	1.43533734750182e-81	178045608	178045608	4.92445743312618e-08	180192214	180351118
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.5738	4.92445743312618e-08	180192214	180351118	6.90319381805919e-08	180351118	180364670
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180632269	111	104	-0.0232	6.90319381805919e-08	180351118	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11409	-0.0018	NA	NA	NA	4.09461684399924e-23	32548736	32588005
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32631315	16	16	0.6728	4.09461684399924e-23	32548736	32588005	9.45984719467296e-22	32613538	32633691
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32633691	74647491	13587	13233	0.0025	9.45984719467296e-22	32613538	32633691	3.57183731773881e-145	74647491	74647491
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-4.8133	3.57183731773881e-145	74647491	74647491	2.37284469080503e-144	74653360	74653360
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	103841482	7917	7735	-0.0096	2.37284469080503e-144	74653360	74653360	9.33667547905325e-94	103841482	103845083
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.7594	9.33667547905325e-94	103841482	103845083	5.48794869141092e-96	103860573	103868154
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	132147255	9537	9298	-0.0056	5.48794869141092e-96	103860573	103868154	4.70357856545543e-09	132144732	132154299
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132150069	132159522	5	5	-0.7877	4.70357856545543e-09	132144732	132154299	6.34488846413557e-09	132151285	132161292
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	139643729	2838	2774	-0.0075	6.34488846413557e-09	132151285	132161292	6.7078162900056e-84	139643729	139643729
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-3.0058	6.7078162900056e-84	139643729	139643729	1.55497659058716e-82	139648318	139648318
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8502	-0.0077	1.55497659058716e-82	139648318	139648318	4.96828332084159e-83	165643653	165643653
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-2.6155	4.96828332084159e-83	165643653	165643653	3.4607141018629e-89	165650610	165650610
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1764	0.003	3.4607141018629e-89	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	38287	-2e-04	NA	NA	NA	3.80067882083937e-83	118611324	118611324
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-2.9715	3.80067882083937e-83	118611324	118611324	9.14991465123134e-77	118620875	118620875
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3101	0.0087	9.14991465123134e-77	118620875	118620875	1.41295415917858e-32	125831554	125831554
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-1.9442	1.41295415917858e-32	125831554	125831554	3.28841997461563e-35	125837524	125837524
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133414697	3647	3538	-0.0048	3.28841997461563e-35	125837524	125837524	9.09045540982213e-09	133404118	133419940
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133417179	133453811	16	16	0.425	9.09045540982213e-09	133404118	133419940	5.77415447376213e-09	133444486	133463680
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133455682	141410894	3699	3592	-0.0027	5.77415447376213e-09	133444486	133463680	5.6159126725653e-08	141406414	141414719
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141429405	8	8	0.5693	5.6159126725653e-08	141406414	141414719	1.82193711791297e-07	141425306	141434131
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141431668	158821263	6884	6703	0.0023	1.82193711791297e-07	141425306	141434131	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	32800775	11194	10912	-0.0024	NA	NA	NA	3.03259441151226e-12	32800775	32800775
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-1.4117	3.03259441151226e-12	32800775	32800775	1.73051575656293e-11	32808049	32808049
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	146264846	33370	32518	-0.0023	1.73051575656293e-11	32808049	32808049	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2399	-0.0032	NA	NA	NA	5.65406999718041e-10	6681606	6685358
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-1.0421	5.65406999718041e-10	6681606	6685358	1.51710813525035e-09	6698290	6701392
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	75177268	12392	12079	-0.0037	1.51710813525035e-09	6698290	6701392	8.33194401346645e-13	75177268	75177268
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75208977	75213550	2	2	-1.4625	8.33194401346645e-13	75177268	75177268	6.42680361631216e-13	75213550	75213550
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75221525	137344988	21969	21427	-0.0035	6.42680361631216e-13	75213550	75213550	2.88174682672013e-09	137339424	137347945
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137347945	137356880	4	4	0.882	2.88174682672013e-09	137339424	137347945	2.96829163300562e-10	137354256	137359947
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1079	0.0148	2.96829163300562e-10	137354256	137359947	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9491	-0.0055	NA	NA	NA	7.47844434473484e-10	27038538	27038538
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.2738	7.47844434473484e-10	27038538	27038538	9.72610461796446e-11	27041812	27041812
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1524	-0.0089	9.72610461796446e-11	27041812	27041812	4.21087595940835e-09	31284756	31284926
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.9774	4.21087595940835e-09	31284756	31284926	4.46274031942458e-08	31291525	31293140
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917893	13297	12967	-0.0038	4.46274031942458e-08	31291525	31293140	8.43357205727942e-40	77917893	77917893
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.5548	8.43357205727942e-40	77917893	77917893	7.14684053332186e-42	77928669	77928669
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19710	6e-04	7.14684053332186e-42	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16465	-0.0034	NA	NA	NA	3.64087975382539e-21	55097753	55127355
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55207305	38	36	0.4359	3.64087975382539e-21	55097753	55127355	1.61981516026495e-21	55202450	55221692
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	134450318	28361	27620	0.0014	1.61981516026495e-21	55202450	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3645	0.0102	NA	NA	NA	2.05852009751135e-37	9516067	9523923
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	1.021	2.05852009751135e-37	9516067	9523923	6.35899570006579e-36	9599999	9604633
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11116883	574	555	-0.0358	6.35899570006579e-36	9599999	9604633	1.74132712261280e-44	11116883	11121204
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-1.6973	1.7413271226128e-44	11116883	11121204	9.56146176668237e-54	11128557	11130871
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132289090	40826	39809	-7e-04	9.56146176668237e-54	11128557	11130871	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	63118944	15500	15123	-0.0091	NA	NA	NA	5.26226573220639e-08	63113626	63118944
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-1.1982	5.26226573220639e-08	63113626	63118944	3.0633972894573e-08	63130828	63140078
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	113574877	15935	15514	-5e-04	3.0633972894573e-08	63130828	63140078	2.58228814829046e-07	113571085	113574877
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113576560	113577853	2	2	1.1347	2.58228814829046e-07	113571085	113574877	2.04404150507785e-15	113577853	113577853
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113580849	113600541	12	12	0.5326	2.04404150507785e-15	113577853	113577853	6.25358258596568e-11	113600541	113604901
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113602677	114123340	193	187	0.0116	6.25358258596568e-11	113600541	113604901	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19475864	53	53	-0.6831	NA	NA	NA	8.488202714275e-73	19469681	19483933
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19478367	34674458	5697	5573	-1e-04	8.488202714275e-73	19469681	19483933	9.52662027345887e-09	34666996	34674458
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.0194	9.52662027345887e-09	34666996	34674458	6.48595169611189e-09	34683810	34685308
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40680589	1896	1852	-0.0015	6.48595169611189e-09	34683810	34685308	7.75189650562147e-166	40680589	40680589
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-3.111	7.75189650562147e-166	40680589	40680589	2.31764454466304e-185	40722360	40722360
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	105856972	24049	23471	-0.003	2.31764454466304e-185	40722360	40722360	5.30189519799757e-16	105856591	105872360
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	5	-1.0267	5.30189519799757e-16	105856591	105872360	1.48958472679366e-13	105881677	105897061
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	173	0.0254	1.48958472679366e-13	105881677	105897061	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0773	NA	NA	NA	7.23852354816004e-11	18692865	18749895
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20308014	151	145	-0.9877	7.23852354816004e-11	18692865	18749895	2.27476957888482e-233	20088256	20310916
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	21982746	321	315	-0.0083	2.27476957888482e-233	20088256	20310916	1.15326167771279e-10	21982746	21996787
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21996787	22038880	3	3	-1.1979	1.15326167771279e-10	21982746	21996787	8.84146616720254e-13	22021181	22038880
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22138119	99632987	30567	29783	-0.0061	8.84146616720254e-13	22021181	22038880	4.52730549706753e-13	99632987	99632987
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.467	4.52730549706753e-13	99632987	99632987	2.80324554103003e-12	99635701	99635701
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	266	0.007	2.80324554103003e-12	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	10326	0.0082	NA	NA	NA	1.97458295015567e-11	31813741	32525705
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33647856	47	45	0.2905	1.97458295015567e-11	31813741	32525705	1.09361373133590e-11	33525500	34061926
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	54348362	3076	3013	-0.004	1.0936137313359e-11	33525500	34061926	1.84916584426594e-07	54336421	54368717
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54390060	12	12	-0.4646	1.84916584426594e-07	54336421	54368717	1.38662248564007e-05	54379839	54390060
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54400475	2	2	1.2268	1.38662248564007e-05	54379839	54390060	4.38511448129456e-09	54400475	54400475
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54402057	75093957	6814	6660	-0.0032	4.38511448129456e-09	54400475	54400475	1.64731396407042e-07	75092501	75097331
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.9163	1.64731396407042e-07	75092501	75097331	7.39711745173452e-08	75099083	75102639
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	600	-0.0152	7.39711745173452e-08	75099083	75102639	3.09093034465559e-15	76923844	76925748
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.7708	3.09093034465559e-15	76923844	76925748	1.01483107610269e-14	76940218	76942679
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4405	0.0069	1.01483107610269e-14	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	403	0.0088	NA	NA	NA	1.74238725346214e-13	1027248	1027248
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.0294	1.74238725346214e-13	1027248	1027248	6.60131975957507e-13	1030766	1030766
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	32828797	12002	11680	0.0034	6.60131975957507e-13	1030766	1030766	9.25709800168244e-17	32828797	32828797
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-1.6393	9.25709800168244e-17	32828797	32828797	8.29351702046689e-18	32832642	32832642
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1413	7e-04	8.29351702046689e-18	32832642	32832642	3.40082321878488e-84	36673853	36673853
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.2438	3.40082321878488e-84	36673853	36673853	7.44303690210409e-83	36683509	36683509
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	78653545	15758	15418	0.0056	7.44303690210409e-83	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22417	-0.0049	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56823430	19873	19382	0.0183	NA	NA	NA	5.28350916098232e-11	56819531	56825794
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.6385	5.28350916098232e-11	56819531	56825794	4.91146784303866e-10	56837593	56844304
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3080	-0.002	4.91146784303866e-10	56837593	56844304	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	573	-0.0119	NA	NA	NA	2.78831882467072e-46	1516966	1516966
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1525300	4	4	-2.0061	2.78831882467072e-46	1516966	1516966	1.26640224132573e-52	1525300	1525300
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	62419534	20986	20450	-0.0016	1.26640224132573e-52	1525300	1525300	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	43406173	11816	11521	0.0028	NA	NA	NA	2.75942966388378e-69	43398203	43428824
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43408929	43724602	127	122	0.4358	2.75942966388378e-69	43398203	43428824	5.92571011051934e-67	43715801	43731313
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43725622	46922972	1498	1463	0.01	5.92571011051934e-67	43715801	43731313	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2907	0.0116	NA	NA	NA	1.35435622801811e-253	22667608	22679305
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-1.9194	1.35435622801811e-253	22667608	22679305	5.91373638782638e-192	22720195	22725305
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	23975676	601	584	0.0166	5.91373638782638e-192	22720195	22725305	2.84436829668184e-47	23959291	23997055
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23991961	24258091	96	95	0.4234	2.84436829668184e-47	23959291	23997055	2.18413117648318e-53	24255714	24267238
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24259822	49571068	12855	12495	0.0113	2.18413117648318e-53	24255714	24267238	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2691	NA	NA	NA	3.14030657459465e-06	4893	95819
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	1.1353	3.14030657459465e-06	4893	95819	9.80414477842507e-37	104732	104732
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2708291	1780	1739	0.0047	9.80414477842507e-37	104732	104732	0	2708113	2712641
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22357	0.863	0	2708113	2712641	1.30071854520849e-19	76998610	76998610
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.2999	1.30071854520849e-19	76998610	76998610	2.33150642301986e-20	77010018	77010018
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154442377	22161	21592	0.8668	2.33150642301986e-20	77010018	77010018	2.09859872286016e-17	154442377	154442377
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	2.4009	2.09859872286016e-17	154442377	154442377	2.90177553726392e-18	154450309	154450309
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.944	2.90177553726392e-18	154450309	154450309	2.47918885154330e-68	154582414	154586690
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0231	2.4791888515433e-68	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	10	-3.5948	NA	NA	NA	0.00557280841892513	2720603	2783745
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2954827	106	103	-2.5022	0.00557280841892513	2720603	2783745	0.0502362415947827	2895542	2969891
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2963612	3223585	7	7	-3.6222	0.0502362415947827	2895542	2969891	5.6281084762912e-15	3219200	3223585
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-0.6112	5.6281084762912e-15	3219200	3223585	1.21859659499703e-09	5531459	6696721
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6970768	130	126	-2.5132	1.21859659499703e-09	5531459	6696721	4.23251964024574e-07	6925683	7020318
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6971636	7495687	173	168	-1.7655	4.23251964024574e-07	6925683	7020318	3.12901862587363e-06	7379019	7640681
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7722458	74	73	-2.5868	3.12901862587363e-06	7379019	7640681	7.96917423372207e-05	7688250	7751430
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7914104	59	57	-1.7197	7.96917423372207e-05	7688250	7751430	1.13356519570655e-09	7870400	7951683
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8289709	85	82	-2.8229	1.13356519570655e-09	7870400	7951683	3.16791835035634e-06	8186463	8327502
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8690572	113	111	-2.1123	3.16791835035634e-06	8186463	8327502	0.000491451054698874	8573516	8852334
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10513747	191	189	-2.6369	0.000491451054698874	8573516	8852334	2.61471553268857e-14	10506718	10537808
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-0.5693	2.61471553268857e-14	10506718	10537808	1.06370857523168e-15	11698871	12502304
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-3.205	1.06370857523168e-15	11698871	12502304	6.62797122989926e-05	12530596	12550566
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	13173328	216	209	-1.5507	6.62797122989926e-05	12530596	12550566	2.48401227853822e-27	13158272	13215006
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13175367	13551853	159	155	-2.7051	2.48401227853822e-27	13158272	13215006	0.000324750951176822	13482259	13566041
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13553112	13749720	41	39	-2.0025	0.000324750951176822	13482259	13566041	2.70108738768746e-10	13717328	13759681
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13751402	13823928	22	21	-3.1308	2.70108738768746e-10	13717328	13759681	4.52814883311663e-13	13820955	13828384
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-1.5675	4.52814883311663e-13	13820955	13828384	0.000493357280737223	13863616	13880640
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	120	-2.9524	0.000493357280737223	13863616	13880640	2.38878479405764e-14	14100001	14244120
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14508021	127	125	-1.9872	2.38878479405764e-14	14100001	14244120	5.53400304038008e-06	14500820	14508021
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.53400304038008e-06	14500820	14508021	NA	NA	NA
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	9	-0.2876	NA	NA	NA	0.000262169588472812	14547168	14561228
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14700040	36	36	-1.8193	0.000262169588472812	14547168	14561228	0.00429952248546683	14601309	14758901
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15095427	76	75	-2.615	0.00429952248546683	14601309	14758901	0.000547068880586966	14916784	15154705
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15099698	15284717	95	93	-1.9595	0.000547068880586966	14916784	15154705	2.99045282414231e-08	15272429	15308025
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	77	-2.8638	2.99045282414231e-08	15272429	15308025	6.46277817649343e-05	15376350	15445193
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15682936	106	104	-2.1304	6.46277817649343e-05	15376350	15445193	8.06004395144491e-05	15582236	15719904
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15915466	38	37	-3.0224	8.06004395144491e-05	15582236	15719904	9.6388339249244e-06	15854496	15974702
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16343057	154	148	-2.0629	9.6388339249244e-06	15854496	15974702	8.19470471414776e-07	16184484	16672333
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16350833	22192409	960	929	-2.5867	8.19470471414776e-07	16184484	16672333	1.83338386389084e-09	22175425	22202315
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	24	-4.0253	1.83338386389084e-09	22175425	22202315	2.11854989899555e-08	22252795	22388804
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	63	-2.7234	2.11854989899555e-08	22252795	22388804	1.17039350337478e-27	22921089	26871442
MSK_252152915113_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.0147	1.17039350337478e-27	22921089	26871442	NA	NA	NA
