Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12217042	4265	4144	0.0239	NA	NA	NA	3.64649752696414e-19	12204151	12222393
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12219806	12272851	25	25	0.5943	3.64649752696414e-19	12204151	12222393	8.54446663703366e-18	12268407	12280011
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12276119	12445633	82	80	-0.0209	8.54446663703366e-18	12268407	12280011	1.50631979084940e-21	12437136	12450396
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12446985	12526431	36	36	0.5934	1.5063197908494e-21	12437136	12450396	1.07448206137273e-15	12521590	12535948
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12527609	12686314	77	76	-0.013	1.07448206137273e-15	12521590	12535948	2.83578577231585e-24	12679082	12698435
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12697702	12697702	1	0	NA	2.83578577231585e-24	12679082	12698435	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12698435	13101056	36	34	-0.7919	NA	NA	NA	4.52685589180603e-47	12839991	13647633
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13104898	116029725	37314	36312	1e-04	4.52685589180603e-47	12839991	13647633	3.71610922146208e-21	116029725	116029725
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-2.2174	3.71610922146208e-21	116029725	116029725	6.25384510104129e-22	116033402	116033402
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	143659690	1689	1647	-0.008	6.25384510104129e-22	116033402	116033402	9.59338356782196e-10	143635542	143715443
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143787504	45	44	-0.3264	9.59338356782196e-10	143635542	143715443	1.92333757156913e-10	143774565	143806379
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143789484	150819879	1892	1849	0.0173	1.92333757156913e-10	143774565	143806379	5.00579937564611e-90	150819879	150836481
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150823073	1	0	NA	5.00579937564611e-90	150819879	150836481	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	2.099	NA	NA	NA	6.74662941154023e-64	150847304	150851439
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0292	6.74662941154023e-64	150847304	150851439	1.42962058072683e-07	151022179	151026228
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151033188	3	3	0.9537	1.42962058072683e-07	151022179	151026228	1.84036817760822e-05	151033188	151036435
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151036435	157133150	2680	2606	0.0154	1.84036817760822e-05	151033188	151036435	2.56788348443319e-56	157133150	157133150
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.527	2.56788348443319e-56	157133150	157133150	8.15080263074301e-57	157136342	157136342
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1565	-0.0028	8.15080263074301e-57	157136342	157136342	8.15729155625092e-15	161099582	161099582
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.8258	8.15729155625092e-15	161099582	161099582	7.51133896976686e-14	161104791	161104791
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2433	-0.0184	7.51133896976686e-14	161104791	161104791	1.89536608690107e-224	167483267	167483267
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.611	1.89536608690107e-224	167483267	167483267	8.92340204733835e-223	167507898	167507898
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7022	-0.0072	8.92340204733835e-223	167507898	167507898	2.76234069307986e-21	185979586	185979586
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.2644	2.76234069307986e-21	185979586	185979586	3.84200492620227e-22	185988138	185988138
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	247186514	21583	21047	5e-04	3.84200492620227e-22	185988138	185988138	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	7019	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20341	34556434	11525	11195	-2e-04	NA	NA	NA	3.11064821088956e-09	34542224	34556434
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34558824	34589997	14	13	-0.5763	3.11064821088956e-09	34542224	34556434	1.71229701843937e-09	34589997	34599239
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	467	-0.0021	1.71229701843937e-09	34589997	34599239	1.01059732414315e-09	35821494	35821494
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.4813	1.01059732414315e-09	35821494	35821494	1.05554072150155e-08	35844884	35844884
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	242501239	65734	64057	-0.007	1.05554072150155e-08	35844884	35844884	6.29316188912749e-09	242471854	242525959
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242603774	43	43	0.3176	6.29316188912749e-09	242471854	242525959	0.000234588237116922	242584505	242634956
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242607326	242689978	24	23	-0.0422	0.000234588237116922	242584505	242634956	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11383299	4087	4000	0.0061	NA	NA	NA	4.6066124969399e-13	11383299	11383299
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.401	4.6066124969399e-13	11383299	11383299	3.71692291803215e-12	11389624	11389624
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	32074432	6706	6531	-0.0107	3.71692291803215e-12	11389624	11389624	1.88376266543330e-11	32074432	32074432
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.6657	1.8837626654333e-11	32074432	32074432	3.72330504728854e-12	32080848	32080848
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5285	0.0049	3.72330504728854e-12	32080848	32080848	3.68742976862456e-34	47460892	47460892
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.7505	3.68742976862456e-34	47460892	47460892	7.83334925455322e-33	47466921	47466921
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	133189686	27489	26765	-0.0051	7.83334925455322e-33	47466921	47466921	4.11313160307356e-08	133189686	133189686
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4195	4.11313160307356e-08	133189686	133189686	2.79704058447506e-08	133194685	133194685
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163997228	9778	9525	-0.0099	2.79704058447506e-08	133194685	133194685	2.66524196411289e-38	163997228	163997228
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164001657	164001657	1	0	NA	2.66524196411289e-38	163997228	163997228	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164027724	6	6	1.709	NA	NA	NA	7.89259431782052e-38	164027724	164027724
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9868	-0.0083	7.89259431782052e-38	164027724	164027724	7.04596229300551e-217	194354505	194354505
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.0845	7.04596229300551e-217	194354505	194354505	2.28226108102333e-240	194366950	194366950
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196943380	1020	989	0.0103	2.28226108102333e-240	194366950	194366950	3.62513629130875e-06	196929805	196943380
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	196961238	7	7	0.6367	3.62513629130875e-06	196929805	196943380	6.09851235595874e-06	196961238	196970927
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	929	0.0015	6.09851235595874e-06	196961238	196970927	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3297	0.0221	NA	NA	NA	2.2280562853232e-105	9815760	9815760
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.3137	2.2280562853232e-105	9815760	9815760	1.50698733584413e-94	9842644	9842644
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14630	-0.0081	1.50698733584413e-94	9842644	9842644	2.32833069222713e-12	68897538	69069651
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.665	2.32833069222713e-12	68897538	69069651	2.20665550392564e-12	69163312	69665979
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	151358223	24623	23968	-0.0062	2.20665550392564e-12	69163312	69665979	8.60020340256968e-08	151358223	151358223
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151359426	151362088	2	2	1.4063	8.60020340256968e-08	151358223	151358223	2.13492514365618e-08	151362088	151362088
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151363764	173224400	6568	6424	-0.0084	2.13492514365618e-08	151362088	151362088	2.37825199102832e-16	173224400	173224400
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.9303	2.37825199102832e-16	173224400	173224400	1.30010651040023e-16	173228860	173228860
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173229983	1	0	NA	1.30010651040023e-16	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173231156	191153613	5518	5356	-0.008	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	776194	223	217	-0.0039	NA	NA	NA	2.96093494737079e-13	737829	776194
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	829954	5	5	-0.9822	2.96093494737079e-13	737829	776194	3.82201877850486e-11	829954	870657
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3638	-9e-04	3.82201877850486e-11	829954	870657	7.15233997294888e-39	12857302	12857302
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-2.8456	7.15233997294888e-39	12857302	12857302	2.25566338924234e-37	12873052	12873052
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	32144814	4755	4638	-4e-04	2.25566338924234e-37	12873052	12873052	1.35681110093072e-15	32137514	32149912
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32146491	32203336	30	30	0.4805	1.35681110093072e-15	32137514	32149912	2.22146836858015e-15	32197362	32215506
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32206845	140203440	31318	30521	-0.0106	2.22146836858015e-15	32197362	32215506	4.95289208005318e-19	140201609	140203440
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	7	-1.1363	4.95289208005318e-19	140201609	140203440	7.58300961266606e-20	140216524	140219465
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180342860	13559	13176	0.0042	7.58300961266606e-20	140216524	140219465	0.000111886640210512	180180648	180344964
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.5091	0.000111886640210512	180180648	180344964	0.000139730103329139	180355807	180379663
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	104	-0.016	0.000139730103329139	180355807	180379663	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	54	-0.0072	NA	NA	NA	4.95979902589168e-12	228968	251128
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	44	-0.4473	4.95979902589168e-12	228968	251128	1.85877497171591e-19	314877	335212
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	1938517	647	632	0.0051	1.85877497171591e-19	314877	335212	7.61765928662867e-10	1936172	1938517
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	1941073	1951728	6	6	-0.8506	7.61765928662867e-10	1936172	1938517	2.41883863398450e-09	1951728	1954898
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	1952904	32558677	10923	10653	0.003	2.4188386339845e-09	1951728	1954898	1.26345353756641e-131	32558677	32558677
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32590568	5	5	-3.3826	1.26345353756641e-131	32558677	32558677	1.89336917292695e-19	32590568	32590568
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32600962	4	4	-1.1576	1.89336917292695e-19	32590568	32590568	1.83495493941414e-11	32597877	32605300
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	54035000	8303	8089	0.0018	1.83495493941414e-11	32597877	32605300	9.01252729989588e-108	54035000	54035000
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.9955	9.01252729989588e-108	54035000	54035000	4.00830093445662e-101	54042734	54042734
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2339	-0.011	4.00830093445662e-101	54042734	54042734	1.61448825692644e-07	65765501	65767409
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.3824	1.61448825692644e-07	65765501	65767409	6.06172075911598e-08	65771532	65778663
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	79018959	4032	3926	-0.0016	6.06172075911598e-08	65771532	65778663	0	79018959	79018959
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-4.6859	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	170753106	29680	28917	-0.0087	0	79091850	79091850	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	805131	151	148	0.0373	NA	NA	NA	8.18199998528828e-06	798416	805131
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	807106	809546	3	3	-0.9096	8.18199998528828e-06	798416	805131	8.81171952009043e-05	809546	818147
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	814333	71894353	21633	21065	-0.0024	8.81171952009043e-05	809546	818147	4.77737667854864e-16	71894353	71894353
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-1.9189	4.77737667854864e-16	71894353	71894353	1.14023133245486e-15	71912065	71912065
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	100164752	9273	9037	0.0041	1.14023133245486e-15	71912065	71912065	7.59000785450831e-05	100158582	100166257
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100178968	5	5	-0.7043	7.59000785450831e-05	100158582	100166257	2.07486245256650e-06	100174991	100186012
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100181104	125831554	11371	11098	-0.0042	2.0748624525665e-06	100174991	100186012	8.61339928268784e-08	125829681	125831554
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.1393	8.61339928268784e-08	125829681	125831554	3.37199984769950e-08	125837524	125839386
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7181	-0.0021	3.3719998476995e-08	125837524	125839386	4.25451998970308e-09	141409512	141413352
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141422860	5	5	0.9261	4.25451998970308e-09	141409512	141413352	4.93970035282873e-08	141419692	141425306
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141425306	147702365	2647	2571	0.0047	4.93970035282873e-08	141419692	141425306	7.84725196609384e-10	147702365	147702365
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.5986	7.84725196609384e-10	147702365	147702365	2.19633853015757e-11	147707161	147707161
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4117	-0.005	2.19633853015757e-11	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2150932	716	698	0.0057	NA	NA	NA	9.8091232726396e-11	2145922	2154433
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2154433	2171384	5	5	-0.9754	9.8091232726396e-11	2145922	2154433	1.8819417093387e-11	2165688	2183619
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2183619	3795210	656	635	-0.0054	1.8819417093387e-11	2165688	2183619	7.5845522898038e-19	3793211	3795210
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3796486	3808799	8	8	-0.9885	7.5845522898038e-19	3793211	3795210	3.94408790491258e-17	3808799	3810355
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3810355	25120552	6774	6600	-0.0062	3.94408790491258e-17	3808799	3810355	2.94938853783251e-26	25120552	25120552
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	2	2.4086	2.94938853783251e-26	25120552	25120552	1.99985145968765e-24	25125700	25125700
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32797545	3031	2945	-0.0098	1.99985145968765e-24	25125700	25125700	4.15713035032047e-12	32792898	32797545
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	3	-1.4157	4.15713035032047e-12	32792898	32797545	1.94772695447245e-12	32808049	32808049
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	146264846	33370	32511	-0.0023	1.94772695447245e-12	32808049	32808049	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7771	-0.0044	NA	NA	NA	1.18873511802773e-54	23343915	23343915
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-2.8906	1.18873511802773e-54	23343915	23343915	1.17262621918108e-55	23365926	23365926
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	137352394	28836	28104	-0.0053	1.17262621918108e-55	23365926	23365926	1.83670830653378e-09	137352394	137352394
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5126	1.83670830653378e-09	137352394	137352394	3.07770187780573e-09	137356880	137356880
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1058	0.0099	3.07770187780573e-09	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23945	-0.005	NA	NA	NA	1.80142799325017e-43	77917893	77917893
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.1329	1.80142799325017e-43	77917893	77917893	1.91998379523559e-43	77928669	77928669
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19707	-0.0046	1.91998379523559e-43	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2073	-0.0028	NA	NA	NA	8.8438293637836e-16	5734978	5744034
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7328	8.8438293637836e-16	5734978	5744034	1.82362167162094e-16	5762182	5769776
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	25561757	7277	7070	-0.0062	1.82362167162094e-16	5762182	5769776	7.1232339704387e-14	25556811	25567254
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25565913	25582814	8	8	-0.9226	7.1232339704387e-14	25556811	25567254	1.23171199186983e-14	25577345	25591472
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25591472	55123719	7468	7241	7e-04	1.23171199186983e-14	25577345	25591472	6.21592509221269e-13	55088012	55136234
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55221692	41	40	-0.3893	6.21592509221269e-13	55088012	55136234	6.91305207668074e-13	55202450	55238200
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55223056	134450318	28357	27630	5e-04	6.91305207668074e-13	55202450	55238200	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3642	0.0072	NA	NA	NA	5.94777199459174e-47	9523923	9528590
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9550789	4	4	-2.3049	5.94777199459174e-47	9523923	9528590	1.27920840419717e-46	9543817	9550789
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	9554149	1	0	NA	1.27920840419717e-46	9543817	9550789	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	130694393	40768	39685	2e-04	NA	NA	NA	4.82481518548936e-08	130694393	130694393
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	-1.4269	4.82481518548936e-08	130694393	130694393	3.31970976157381e-10	130701040	130701040
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	629	-2e-04	3.31970976157381e-10	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6841	-0.0077	NA	NA	NA	2.22582349649165e-90	36969571	36969571
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.5375	2.22582349649165e-90	36969571	36969571	8.98074383688197e-88	36982877	36982877
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	286	0.0036	8.98074383688197e-88	36982877	36982877	7.63540899106239e-27	37953582	37953582
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.5308	7.63540899106239e-27	37953582	37953582	2.98242616052696e-28	37957844	37957844
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	114123340	24304	23675	-0.0088	2.98242616052696e-28	37957844	37957844	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40676611	7648	7451	0.0064	NA	NA	NA	2.61029802573338e-08	40659171	40676611
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.7576	2.61029802573338e-08	40659171	40676611	4.38808131003665e-08	40722360	40741934
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73071404	11765	11470	-0.009	4.38808131003665e-08	40722360	40741934	3.11379405892282e-37	73071404	73072457
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	-1.562	3.11379405892282e-37	73071404	73072457	6.82530313073458e-36	73092018	73092112
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	88253911	5256	5133	-0.0039	6.82530313073458e-36	73092018	73092112	1.57406861834278e-06	88251048	88260000
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	88255686	88263825	4	4	-0.9137	1.57406861834278e-06	88251048	88260000	6.34497361342121e-07	88262713	88264987
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	88264987	105923686	7036	6849	0.007	6.34497361342121e-07	88262713	88264987	7.13348660231144e-18	105919618	105946993
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	105945006	1	0	NA	7.13348660231144e-18	105919618	105946993	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106013552	20	18	-0.6718	NA	NA	NA	4.49491069762112e-15	106002179	106017453
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106015449	106358491	141	136	-0.0352	4.49491069762112e-15	106002179	106017453	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.091	NA	NA	NA	1.65377128398752e-05	18452491	18749895
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20310916	153	147	-0.601	1.65377128398752e-05	18452491	18749895	1.70756067441927e-112	20079935	20330200
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20316992	74669752	21553	20954	-0.0075	1.70756067441927e-112	20079935	20330200	1.63506597253582e-08	74665386	74669752
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74671626	1	0	NA	1.63506597253582e-08	74665386	74669752	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74678353	74680439	3	3	1.1859	NA	NA	NA	3.23508346561092e-09	74680439	74696127
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	82332155	2794	2721	-0.0092	3.23508346561092e-09	74680439	74696127	2.07686175236379e-12	82332155	82332155
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-1.6992	2.07686175236379e-12	82332155	82332155	1.98735581178985e-12	82334704	82334704
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	99632987	6537	6390	-0.0079	1.98735581178985e-12	82334704	82334704	1.85990584100110e-07	99632987	99632987
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.3222	1.8599058410011e-07	99632987	99632987	3.26724550367900e-07	99635701	99636724
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	263	0.0093	3.267245503679e-07	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34329518	10709	10392	0.0162	NA	NA	NA	2.29283474436378e-24	34297461	34350707
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34621068	53	53	0.4685	2.29283474436378e-24	34297461	34350707	1.88212083721264e-25	34596655	34635765
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34623136	75093957	9761	9497	0.0017	1.88212083721264e-25	34596655	34635765	3.55689783345028e-30	75093957	75093957
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.1249	3.55689783345028e-30	75093957	75093957	2.37713934056441e-30	75100865	75100865
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4994	0.0013	2.37713934056441e-30	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	405	0.0345	NA	NA	NA	1.87393570585482e-16	1028979	1028979
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.9632	1.87393570585482e-16	1028979	1028979	1.57536317379551e-16	1030766	1030766
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	32828797	12002	11654	0.0138	1.57536317379551e-16	1030766	1030766	5.590850961878e-83	32828797	32828797
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.2752	5.590850961878e-83	32828797	32828797	2.64317383543e-88	32832642	32832642
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36672710	1447	1394	0.0139	2.64317383543e-88	32832642	32832642	5.75526360354138e-10	36665978	36672710
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.8006	5.75526360354138e-10	36665978	36672710	4.17195300489052e-09	36684619	36687917
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1985	0.0267	4.17195300489052e-09	36684619	36687917	4.99681162921542e-30	41561017	41574775
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42151941	50	50	-0.4961	4.99681162921542e-30	41561017	41574775	1.34212143178383e-27	41710400	42159958
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	52440878	3475	3383	0.006	1.34212143178383e-27	41710400	42159958	1.18028525028582e-06	52438207	52440878
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52454171	4	4	-0.8554	1.18028525028582e-06	52438207	52440878	2.90209942137023e-06	52454171	52462590
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52455229	78653545	10195	9942	0.0127	2.90209942137023e-06	52454171	52462590	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22389	-0.0105	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	59414898	21055	20480	0.0331	NA	NA	NA	5.96480617227222e-09	59406523	59422642
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59442709	14	14	-0.5148	5.96480617227222e-09	59406523	59422642	2.83465695382275e-08	59440274	59451659
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59443697	63788698	1990	1946	0.013	2.83465695382275e-08	59440274	59451659	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	566	-0.021	NA	NA	NA	6.97998150538736e-76	1506379	1516966
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-2.0005	6.97998150538736e-76	1506379	1516966	8.01079976496231e-92	1525300	1532433
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	52080395	17245	16761	0.0032	8.01079976496231e-92	1525300	1532433	9.56158138321412e-08	52076473	52080395
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.857	9.56158138321412e-08	52076473	52080395	8.40081007050765e-08	52090393	52094361
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3630	-0.0028	8.40081007050765e-08	52090393	52094361	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13069	-0.0023	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	20637583	2068	2016	0.0219	NA	NA	NA	4.77534933779352e-82	20631121	20652057
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20643128	20904936	149	144	0.5393	4.77534933779352e-82	20631121	20652057	8.39474884370639e-76	20898157	20915523
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20911250	22644243	765	748	0.0173	8.3947488437064e-76	20898157	20915523	5.8564872188917e-10	22592087	22696038
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22747085	29	29	-0.3821	5.8564872188917e-10	22592087	22696038	9.21575608033488e-10	22721042	22761511
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22748062	22748062	1	0	NA	9.21575608033488e-10	22721042	22761511	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22751788	37685496	7753	7544	0.0132	NA	NA	NA	1.09378186048753e-18	37683516	37691481
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.7114	1.09378186048753e-18	37683516	37691481	1.90475068054950e-18	37706959	37721849
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5626	0.0138	1.9047506805495e-18	37706959	37721849	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.0379	NA	NA	NA	2.46167392869508e-09	4926	94062
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-0.9152	2.46167392869508e-09	4926	94062	2.13892873104086e-19	104732	108902
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	106242	1	0	NA	2.13892873104086e-19	104732	108902	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	1427392	773	750	0.0301	NA	NA	NA	7.66685451876274e-10	1427338	1432891
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1435082	6	6	-0.7098	7.66685451876274e-10	1427338	1432891	7.2437697985903e-09	1432891	1437132
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1437132	2708291	1000	978	0.0324	7.2437697985903e-09	1432891	1437132	0	2708113	2712641
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22335	0.9024	0	2708113	2712641	6.32676192504552e-09	76998610	76998610
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.5501	6.32676192504552e-09	76998610	76998610	5.22635781760655e-09	77010018	77010018
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21596	0.9023	5.22635781760655e-09	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0528	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	123	-3.2872	NA	NA	NA	3.75732666927564e-18	3034907	3772482
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-0.6802	3.75732666927564e-18	3034907	3772482	3.64662443510365e-13	5422507	6688691
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	170	-3.163	3.64662443510365e-13	5422507	6688691	2.63288500937822e-05	7006750	7233066
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	122	-2.3854	2.63288500937822e-05	7006750	7233066	0.00129053788990204	7386947	7572591
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	13	-3.9514	0.00129053788990204	7386947	7572591	0.000676254968393809	7605311	7630477
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	18	-2.4226	0.000676254968393809	7605311	7630477	0.000811207512676538	7632577	7668037
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7722458	43	42	-3.6821	0.000811207512676538	7632577	7668037	1.93900379603393e-11	7714929	7726921
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7723783	1	0	NA	1.93900379603393e-11	7714929	7726921	NA	NA	NA
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	18	-1.759	NA	NA	NA	0.00229736505978480	7756907	7828009
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-2.7321	0.0022973650597848	7756907	7828009	0.00664425298962991	7859390	7905286
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.8016	0.00664425298962991	7859390	7905286	0.000880280746175306	7914104	7928317
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8538835	143	139	-3.3196	0.000880280746175306	7914104	7928317	0.000581361297573242	8341218	8558646
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8690572	55	53	-2.6142	0.000581361297573242	8341218	8558646	0.000151865939295824	8637652	8742435
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	9160624	116	113	-3.4215	0.000151865939295824	8637652	8742435	0.000289916246397966	9097219	9164547
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10012024	11	11	-1.9346	0.000289916246397966	9097219	9164547	2.51934260425151e-05	10004173	10050351
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10513747	64	62	-3.3814	2.51934260425151e-05	10004173	10050351	2.76021529734974e-27	10512616	10513747
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.3311	2.76021529734974e-27	10512616	10513747	0.000987126815109195	10631941	11660512
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	6	-2.0607	0.000987126815109195	10631941	11660512	0.00146705509540565	11249952	12502304
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-4.1443	0.00146705509540565	11249952	12502304	4.32480151146137e-09	12533900	12541506
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12601014	31	30	-1.5773	4.32480151146137e-09	12533900	12541506	0.000355106368213402	12588578	12602617
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12602617	12611624	6	6	-3.6215	0.000355106368213402	12588578	12602617	7.22168014221068e-05	12608293	12615455
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	19	-1.5619	7.22168014221068e-05	12608293	12615455	0.00379206070000009	12649357	12839975
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12926941	56	54	-2.8401	0.00379206070000009	12649357	12839975	0.00010277104729717	12872417	12973132
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	79	-1.8206	0.00010277104729717	12872417	12973132	4.44999972636653e-20	13106723	13140274
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13716000	220	212	-3.1608	4.44999972636653e-20	13106723	13140274	0.000415080074586536	13501633	13898474
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14340202	188	186	-3.6052	0.000415080074586536	13501633	13898474	1.10820448699665e-10	14312365	14381372
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14342834	14508894	98	97	-2.6956	1.10820448699665e-10	14312365	14381372	7.8927236594435e-05	14491287	14545228
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.4238	7.8927236594435e-05	14491287	14545228	3.7376985769816e-09	14557473	14603508
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	16194420	533	522	-3.0154	3.7376985769816e-09	14557473	14603508	5.09197382894369e-07	15980898	16626771
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16195788	22930737	1086	1055	-3.3631	5.09197382894369e-07	15980898	16626771	6.46067275455632e-70	22923722	26870361
MSK_252152915114_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	85	-1.1534	6.46067275455632e-70	22923722	26870361	NA	NA	NA
