Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26838	0.0067	NA	NA	NA	9.25857910725262e-215	72537426	72537426
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72571158	12	12	-2.6289	9.25857910725262e-215	72537426	72537426	1.71845466428799e-200	72571158	72571158
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72574479	72579311	2	0	NA	1.71845466428799e-200	72571158	72571158	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150785448	17543	16834	-0.0065	NA	NA	NA	8.85702384258732e-20	150781906	150800767
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150796077	150823073	14	14	-0.7831	8.85702384258732e-20	150781906	150800767	1.78232845752854e-20	150819879	150836481
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	1.8637	1.78232845752854e-20	150819879	150836481	1.55223028522000e-77	150846148	150851439
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	167483267	6871	6613	-0.0012	1.55223028522e-77	150846148	150851439	1.98882490181209e-122	167483267	167493768
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	-2.652	1.98882490181209e-122	167483267	167493768	1.67659046005818e-117	167507882	167507898
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	167520743	1	0	NA	1.67659046005818e-117	167507882	167507898	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	231749868	22816	21929	-0.0031	NA	NA	NA	2.49912291036934e-07	231744783	231749868
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231756594	231769826	3	3	-1.0702	2.49912291036934e-07	231744783	231749868	1.74244065260825e-10	231769826	231775293
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231775293	247186514	5974	5744	0.0024	1.74244065260825e-10	231769826	231775293	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11098	0.0021	NA	NA	NA	1.07251752646740e-08	34524344	34561038
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	1.0725175264674e-08	34524344	34561038	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34583814	16	16	-0.4799	NA	NA	NA	5.02780041835288e-08	34574224	34608979
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34589997	34589997	1	0	NA	5.02780041835288e-08	34574224	34608979	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	154601442	35741	34350	-0.0062	NA	NA	NA	1.827986615396e-121	154601442	154601442
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-4.9256	1.827986615396e-121	154601442	154601442	3.18723666482197e-118	154606943	154606943
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242689978	30544	29345	-0.0034	3.18723666482197e-118	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	32074432	10795	10389	-0.0064	NA	NA	NA	1.01247746626354e-21	32074432	32074432
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.1281	1.01247746626354e-21	32074432	32074432	9.43827053852573e-22	32080848	32080848
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	99891210	21385	20625	0	9.43827053852573e-22	32080848	32080848	1.71189087224336e-38	99891210	99891210
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.8068	1.71189087224336e-38	99891210	99891210	1.50694048040716e-37	99897201	99897201
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	199329592	33447	32153	-0.0073	1.50694048040716e-37	99897201	99897201	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17704	-0.0045	NA	NA	NA	7.74629684671021e-249	68905670	69069651
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	-2.7654	7.74629684671021e-249	68905670	69069651	7.22820768910214e-239	69163312	69165814
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	187330240	35471	34103	-0.0042	7.22820768910214e-239	69163312	69165814	6.60051432392926e-73	187330240	187330240
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.9032	6.60051432392926e-73	187330240	187330240	6.91682242991337e-81	187333619	187333619
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1197	0.0088	6.91682242991337e-81	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	144848534	41583	39981	-0.0048	NA	NA	NA	1.93768514050326e-59	144845122	144853245
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	144853245	144999356	29	28	-0.9272	1.93768514050326e-59	144845122	144853245	3.10489866070342e-60	144993541	145007972
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	145007972	150155049	2235	2148	-0.0026	3.10489866070342e-60	144993541	145007972	1.10122475139949e-11	150148732	150162435
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150156233	150202601	14	14	-0.5886	1.10122475139949e-11	150148732	150162435	7.76964524945061e-12	150191627	150209789
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9527	0.0049	7.76964524945061e-12	150191627	150209789	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11219	-7e-04	NA	NA	NA	2.63158615726418e-46	32558677	32558677
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32564884	2	2	-3.0066	2.63158615726418e-46	32558677	32558677	0	32564884	32564884
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32588005	2	2	-3.3468	0	32564884	32564884	9.1621750583636e-31	32588005	32588005
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32590568	1	0	NA	9.1621750583636e-31	32588005	32588005	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32713363	40	40	-0.0534	NA	NA	NA	4.63237673429113e-06	32700719	32723722
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32766023	22	21	0.5153	4.63237673429113e-06	32700719	32723722	7.38101366956278e-13	32745036	32777022
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32767722	54035000	8245	7931	0.0055	7.38101366956278e-13	32745036	32777022	1.79820400127562e-52	54035000	54035000
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-2.6602	1.79820400127562e-52	54035000	54035000	3.4357580581891e-49	54042734	54042734
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2287	-0.0071	3.4357580581891e-49	54042734	54042734	8.00550216986822e-06	65765501	65767409
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.1642	8.00550216986822e-06	65765501	65767409	3.76160062931208e-06	65771532	65778663
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	79011979	4030	3872	0.0038	3.76160062931208e-06	65771532	65778663	6.48870078037844e-07	78970839	79018959
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	15	0.4547	6.48870078037844e-07	78970839	79018959	6.16063583271078e-07	79074911	79127731
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26819	-0.0058	6.16063583271078e-07	79074911	79127731	2.92821692096731e-61	165643653	165643653
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-2.5042	2.92821692096731e-61	165643653	165643653	3.16853667284651e-71	165650610	165650610
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	165983351	145	138	-0.0294	3.16853667284651e-71	165650610	165650610	8.47897049302584e-12	165983351	165983351
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165985570	165987667	2	2	-1.4231	8.47897049302584e-12	165983351	165983351	0	165987667	165987667
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165989836	165991036	2	2	-0.6343	0	165987667	165987667	0.0706642083581669	165991036	166039869
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165992667	170753106	1655	1588	-0.002	0.0706642083581669	165991036	166039869	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26097755	8798	8454	0.0026	NA	NA	NA	4.0902122081895e-32	26097755	26097755
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-2.5287	4.0902122081895e-32	26097755	26097755	2.83896607179555e-31	26108369	26108369
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	26112566	1	0	NA	2.83896607179555e-31	26108369	26108369	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26116974	109216032	26159	25166	0.0015	NA	NA	NA	1.19232621905522e-06	109206280	109236813
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109252574	13	13	0.4845	1.19232621905522e-06	109206280	109236813	2.60040928912436e-08	109245944	109263482
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109257646	109967918	294	287	-0.0203	2.60040928912436e-08	109245944	109263482	3.45824731085477e-112	109967918	109967918
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-4.5638	3.45824731085477e-112	109967918	109967918	5.06500362759734e-99	109974402	109974402
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	133433384	10826	10424	-0.0034	5.06500362759734e-99	109974402	109974402	3.23653500125383e-141	133433384	133436265
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-2.7361	3.23653500125383e-141	133433384	133436265	1.80655084583342e-147	133447868	133448277
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	134856657	655	627	-0.0125	1.80655084583342e-147	133447868	133448277	8.1259368392515e-24	134856657	134858375
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134858375	134867303	5	5	-1.2986	8.1259368392515e-24	134856657	134858375	2.12348818405468e-20	134865531	134867303
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134870292	141409512	3039	2908	-0.0021	2.12348818405468e-20	134865531	134867303	1.11724068900327e-08	141405145	141413352
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141410894	1	0	NA	1.11724068900327e-08	141405145	141413352	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141429405	8	8	0.6767	NA	NA	NA	1.77133949034225e-08	141426846	141434131
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141431668	141690753	122	117	0.0233	1.77133949034225e-08	141426846	141434131	1.47769729077002e-13	141687978	141698634
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	0.8578	1.47769729077002e-13	141687978	141698634	7.33497470093973e-14	141709835	141712786
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	158821263	6754	6489	-0.0011	7.33497470093973e-14	141709835	141712786	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0345	NA	NA	NA	2.93401103934318e-21	581533	581533
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.1699	2.93401103934318e-21	581533	581533	1.61655318214731e-24	588865	588865
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	5574577	1889	1825	0.002	1.61655318214731e-24	588865	588865	8.74909703291593e-13	5574577	5574577
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-1.5819	8.74909703291593e-13	5574577	5574577	1.03702473168087e-13	5591702	5591702
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	7226901	381	366	0.0406	1.03702473168087e-13	5591702	5591702	1.44772817681438e-10	6907624	7709141
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	8148437	13	13	-0.5361	1.44772817681438e-10	6907624	7709141	1.90457290154643e-08	7824059	8159991
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8150258	39350798	10668	10260	-0.0063	1.90457290154643e-08	7824059	8159991	7.29809287013928e-83	39345557	39354149
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	0.7652	7.29809287013928e-83	39345557	39354149	2.3370088306521e-82	39500219	39508035
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	58271240	4358	4179	0.0041	2.3370088306521e-82	39500219	39508035	1.24227609938716e-07	58268002	58271240
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58274145	58295259	5	5	0.8006	1.24227609938716e-07	58268002	58271240	5.52711764174096e-07	58295259	58306259
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58300815	146264846	27070	25998	-0.0017	5.52711764174096e-07	58295259	58306259	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	22477358	7836	7539	-0.0032	NA	NA	NA	5.59626082993631e-33	22477358	22477358
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-2.6036	5.59626082993631e-33	22477358	22477358	5.48395838787944e-34	22492603	22492603
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5030	-0.0024	5.48395838787944e-34	22492603	22492603	7.19000895437184e-12	70926188	70926188
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.5605	7.19000895437184e-12	70926188	70926188	1.8254745222175e-11	70930528	70930528
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	73124551	945	916	-0.0146	1.8254745222175e-11	70930528	70930528	0.225789531519017	72976305	73124551
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73126919	73133242	3	3	-0.4483	0.225789531519017	72976305	73124551	3.60850323812731e-18	73133242	73133242
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73135012	73139210	3	3	-0.9357	3.60850323812731e-18	73133242	73133242	2.06373101750992e-06	73139210	73140836
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73140836	76499969	1134	1094	-0.0023	2.06373101750992e-06	73139210	73140836	5.15329233520947e-11	76496693	76499969
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76501156	76507156	4	4	-1.0513	5.15329233520947e-11	76496693	76499969	2.50685407054004e-10	76507156	76511990
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76511990	137352394	21676	20933	-0.0023	2.50685407054004e-10	76507156	76511990	2.76749370476886e-09	137352394	137352394
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.4108	2.76749370476886e-09	137352394	137352394	1.61118968720461e-09	137356880	137359947
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1047	0.0135	1.61118968720461e-09	137356880	137359947	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23649	-0.0051	NA	NA	NA	6.1752993933674e-21	77917893	77917893
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.075	6.1752993933674e-21	77917893	77917893	7.86926414539175e-21	77928669	77928669
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	100676022	7763	7460	0.0018	7.86926414539175e-21	77928669	77928669	2.29686713147032e-30	100676022	100676022
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-2.0355	2.29686713147032e-30	100676022	100676022	2.31342070270398e-31	100686753	100686753
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	135285645	12448	11984	-0.0014	2.31342070270398e-31	100686753	100686753	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16287	-0.0036	NA	NA	NA	2.98047788964841e-16	55092628	55131703
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	36	0.4355	2.98047788964841e-16	55092628	55131703	3.31527593065865e-16	55200744	55225136
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	93129448	13765	13246	0.0055	3.31527593065865e-16	55200744	55225136	9.35739467116775e-10	93128625	93129448
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93130125	93137287	5	5	-0.9026	9.35739467116775e-10	93128625	93129448	1.11940707031967e-09	93137287	93139876
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93138702	93138702	1	0	NA	1.11940707031967e-09	93137287	93139876	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93139876	124579236	10936	10547	-4e-04	NA	NA	NA	2.01318280993517e-06	124576827	124579236
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124580889	124588223	5	4	-0.8368	2.01318280993517e-06	124576827	124579236	1.93418595512696e-06	124588223	124592369
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124591102	134450318	3648	3514	-0.0094	1.93418595512696e-06	124588223	124592369	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	59822	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	62270	736988	294	280	0.0435	NA	NA	NA	4.8276624938665e-70	736988	736988
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	3	-3.0531	4.8276624938665e-70	736988	736988	5.01858600297558e-69	743223	743223
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3323	0.0066	5.01858600297558e-69	743223	743223	1.04473882235947e-70	9523923	9528590
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	1.4049	1.04473882235947e-70	9523923	9528590	8.40618210725311e-64	9607363	9610054
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10462211	326	315	-0.0015	8.40618210725311e-64	9607363	9610054	6.64650842324606e-28	10459455	10465787
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10491341	11	11	-1.0436	6.64650842324606e-28	10459455	10465787	4.47850922538649e-28	10484956	10493984
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10493984	31132762	7060	6799	-0.0064	4.47850922538649e-28	10484956	10493984	5.94534732618547e-17	31084265	31180019
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	0.6472	5.94534732618547e-17	31084265	31180019	8.8807574790257e-17	31205337	31245432
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	130943064	33437	32155	0.0034	8.8807574790257e-17	31205337	31245432	3.59465699756063e-16	130943064	130943064
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.8469	3.59465699756063e-16	130943064	130943064	7.35958089728557e-18	130946248	130946248
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	529	0.0292	7.35958089728557e-18	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6775	-0.0093	NA	NA	NA	1.07365003782051e-75	36969571	36969571
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-3.9357	1.07365003782051e-75	36969571	36969571	3.50646346770856e-75	36982877	36982877
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	49964838	5178	4977	-0.0066	3.50646346770856e-75	36982877	36982877	3.73722906793788e-20	49964838	49964838
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.0643	3.73722906793788e-20	49964838	49964838	2.48688810757391e-19	49971732	49971732
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1748	-0.0107	2.48688810757391e-19	49971732	49971732	2.35689134853728e-15	56610886	56658479
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	13	-0.7332	2.35689134853728e-15	56610886	56658479	4.45974060004425e-16	56679017	56686863
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	114123340	17605	16910	-0.0066	4.45974060004425e-16	56679017	56686863	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5528	7e-04	NA	NA	NA	1.65608748597427e-11	34674458	34674458
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.3052	1.65608748597427e-11	34674458	34674458	6.54185136333003e-12	34683810	34683810
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	106358491	26132	25135	-0.0054	6.54185136333003e-12	34683810	34683810	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0741	NA	NA	NA	2.41533840762804e-08	18692865	18749895
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19465359	92	90	-0.6775	2.41533840762804e-08	18692865	18749895	4.48157784313878e-07	19401331	19910696
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20308014	59	55	-1.0061	4.48157784313878e-07	19401331	19910696	9.99284951377683e-135	20088256	20310916
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32517839	3672	3531	-0.0047	9.99284951377683e-135	20088256	20310916	2.51332528733536e-25	32456500	32525865
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32520164	32594200	23	23	-0.6775	2.51332528733536e-25	32456500	32525865	9.93005775066916e-25	32578483	32664506
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	100298352	27470	26364	-0.0048	9.93005775066916e-25	32578483	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14351	0.0066	NA	NA	NA	9.5981564169804e-17	57203733	57203733
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.8282	9.5981564169804e-17	57203733	57203733	1.14089930791644e-16	57206772	57206772
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5415	0.0069	1.14089930791644e-16	57206772	57206772	6.44658424604239e-10	75092501	75093957
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1771	6.44658424604239e-10	75092501	75093957	4.68446988140588e-10	75100865	75102639
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4929	-0.0033	4.68446988140588e-10	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	9918519	4350	4192	0.0215	NA	NA	NA	6.92604599836356e-100	9907549	9928274
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	9922463	10355184	193	186	0.4952	6.92604599836356e-100	9907549	9928274	3.70068605698994e-111	10348744	10361807
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10357218	36673853	9328	8963	0.006	3.70068605698994e-111	10348744	10361807	2.03411008037935e-07	36668730	36673853
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	0.8043	2.03411008037935e-07	36668730	36673853	2.46804582878724e-07	36684619	36687917
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1944	0.0225	2.46804582878724e-07	36684619	36687917	1.89615253004608e-26	41561017	41574775
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42151941	50	47	-0.4551	1.89615253004608e-26	41561017	41574775	1.24682882716309e-25	42142363	42161364
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13133	0.0116	1.24682882716309e-25	42142363	42161364	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	31202715	9558	9172	-0.0063	NA	NA	NA	2.81282290626828e-10	31199130	31202715
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	31204187	31210105	5	5	-0.9367	2.81282290626828e-10	31199130	31202715	4.74148905131288e-10	31210105	31212780
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	31212780	76116026	13401	12934	-0.0097	4.74148905131288e-10	31210105	31212780	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19694025	9027	8695	0.0363	NA	NA	NA	2.73866322922138e-80	19694025	19694025
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-3.0922	2.73866322922138e-80	19694025	19694025	2.1208069682031e-77	19700620	19700620
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	63788698	14029	13482	0.0243	2.1208069682031e-77	19700620	19700620	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	565	-0.0093	NA	NA	NA	1.98255690229972e-14	1499421	1518825
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.7359	1.98255690229972e-14	1499421	1518825	3.43244059886979e-13	1523000	1546858
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20175	0.0034	3.43244059886979e-13	1523000	1546858	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2960	-0.0041	NA	NA	NA	2.94128107483132e-09	22564705	22573420
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-1.171	2.94128107483132e-09	22564705	22573420	1.42372439114225e-09	22585040	22589739
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	36788602	5478	5252	-0.0016	1.42372439114225e-09	22585040	22589739	5.62713465547597e-11	36788602	36788602
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36789648	36789648	1	0	NA	5.62713465547597e-11	36788602	36788602	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.5261	NA	NA	NA	1.07143299284732e-11	36791668	36791668
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4709	0.0102	1.07143299284732e-11	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2866	0.0136	NA	NA	NA	6.95966713897893e-165	22667608	22686690
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-1.7837	6.95966713897893e-165	22667608	22686690	2.0371381916753e-167	22718614	22725305
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6274	0.0049	2.0371381916753e-167	22718614	22725305	7.43179856979272e-13	35472378	35472378
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.62	7.43179856979272e-13	35472378	35472378	9.51631058449033e-13	35476942	35476942
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6723	0.0152	9.51631058449033e-13	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127779	31	29	0.0501	NA	NA	NA	6.66759309480711e-30	127779	127779
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	1.3997	6.66759309480711e-30	127779	127779	7.38395150338435e-19	130528	130528
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	648323	393	380	0.0196	7.38395150338435e-19	130528	130528	3.27810564119262e-32	638059	656754
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	650773	650887	2	0	NA	3.27810564119262e-32	638059	656754	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	652530	771824	86	79	0.4146	NA	NA	NA	3.01965410136053e-08	762824	773688
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	772351	800669	20	20	-0.0082	3.01965410136053e-08	762824	773688	5.25568642818702e-09	796371	809379
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800956	1356071	188	180	0.4037	5.25568642818702e-09	796371	809379	3.02202248418722e-68	1345226	1364222
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1358352	2708291	1070	1036	0.0322	3.02202248418722e-68	1345226	1364222	0	2708113	2712641
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	13679455	4075	3910	0.8773	0	2708113	2712641	1.50094598794114e-06	13675938	13683888
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13688061	4	4	-0.1065	1.50094598794114e-06	13675938	13683888	1.35010206049971e-16	13683888	13690054
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13690054	76998610	18860	18122	0.8738	1.35010206049971e-16	13683888	13690054	1.71691643551331e-16	76998610	76998610
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.4347	1.71691643551331e-16	76998610	76998610	5.81471601561463e-12	77010018	77014050
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154442377	22161	21318	0.8778	5.81471601561463e-12	77010018	77014050	8.19090538131016e-11	154442377	154442377
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	2	2.528	8.19090538131016e-11	154442377	154442377	4.45471616249647e-15	154450309	154450309
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154456891	1	0	NA	4.45471616249647e-15	154450309	154450309	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456908	154582414	27	26	1.0071	NA	NA	NA	6.82766197127372e-95	154582414	154582414
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0489	6.82766197127372e-95	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	123	-2.6547	NA	NA	NA	7.0436098772362e-08	3772482	4272867
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-0.7341	7.0436098772362e-08	3772482	4272867	0.000262084222191476	5422507	6735310
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6969601	129	125	-2.4606	0.000262084222191476	5422507	6735310	0.000742287587323142	6894430	7040494
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6970768	7495687	174	163	-1.8577	0.000742287587323142	6894430	7040494	0.00114656905444300	7394617	7495687
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7606496	12	12	-3.2145	0.001146569054443	7394617	7495687	0.000178463914005487	7606496	7619927
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	18	-1.74	0.000178463914005487	7606496	7619927	0.00176066345751710	7640681	7668917
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7726921	45	44	-2.9213	0.0017606634575171	7640681	7668917	3.01851866425042e-10	7709619	7740117
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7914104	57	54	-1.6228	3.01851866425042e-10	7709619	7740117	1.86350628312682e-08	7870400	7970340
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8280065	84	81	-2.7641	1.86350628312682e-08	7870400	7970340	0.000105339909136042	8161536	8333193
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8693820	116	112	-2.0611	0.000105339909136042	8161536	8333193	0.000137933673398093	8581286	8869690
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8695195	10513747	189	182	-2.6696	0.000137933673398093	8581286	8869690	4.00030706517711e-14	10506718	10515697
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	18	-0.4311	4.00030706517711e-14	10506718	10515697	2.03360064264558e-25	11698871	12452734
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.0024	2.03360064264558e-25	11698871	12452734	4.1652717482758e-18	12541506	12542979
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12588578	23	21	-0.7395	4.1652717482758e-18	12541506	12542979	1.39697164462723e-06	12583843	12593244
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12590969	12611624	12	11	-2.2322	1.39697164462723e-06	12583843	12593244	0.00455622591496729	12602617	12627138
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12687167	20	18	-1.161	0.00455622591496729	12602617	12627138	0.000115778931832504	12668435	12721434
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12696242	12786515	15	14	-2.6209	0.000115778931832504	12668435	12721434	0.000371621538985016	12733867	12850287
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12792780	13128515	119	117	-1.4239	0.000371621538985016	12733867	12850287	7.18889859078459e-29	13111594	13148290
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14122129	378	356	-2.6489	7.18889859078459e-29	13111594	13148290	8.0112728592821e-08	14039969	14326935
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14508894	128	124	-2.0188	8.0112728592821e-08	14039969	14326935	1.34886137521432e-06	14500820	14524829
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	10	-0.3908	1.34886137521432e-06	14500820	14524829	0.00187965966976746	14545228	14581797
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14700040	36	34	-1.9579	0.00187965966976746	14545228	14581797	0.00158084946665106	14559651	15067468
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15915466	394	383	-2.5038	0.00158084946665106	14559651	15067468	0.00071817674091525	15560912	16062961
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	157	-2.0559	0.00071817674091525	15560912	16062961	2.78649020089379e-07	16214032	16705038
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16399608	1	0	NA	2.78649020089379e-07	16214032	16705038	NA	NA	NA
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16404836	21892301	878	843	-2.6202	NA	NA	NA	0.000124893187737807	21761022	21906618
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21896293	22003954	32	31	-3.571	0.000124893187737807	21761022	21906618	1.99815408746102e-06	21987780	22024040
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22005059	22139807	27	25	-2.5037	1.99815408746102e-06	21987780	22024040	0.00065636932495277	22043133	22158616
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22179794	11	10	-1.3185	0.00065636932495277	22043133	22158616	1.77917434249828e-06	22179794	22203194
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	25737663	93	89	-3.0639	1.77917434249828e-06	22179794	22203194	1.37631824693328e-31	22930737	25737663
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-0.8433	1.37631824693328e-31	22930737	25737663	0.000195323422469678	26943701	27003308
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-1.8124	0.000195323422469678	26943701	27003308	0.000505782898876757	27000085	27070887
MSK_252152915115_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.6607	0.000505782898876757	27000085	27070887	NA	NA	NA
