Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16704522	5781	5614	0.0094	NA	NA	NA	2.25292849857772e-16	16668773	16799711
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16963812	14	14	-0.4541	2.25292849857772e-16	16668773	16799711	3.23859646427628e-16	16926444	17086698
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	72537426	22099	21512	0.0057	3.23859646427628e-16	16926444	17086698	0	72537426	72537426
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.5068	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103904723	10105	9829	1e-04	0	72579311	72579311	3.68923690600753e-31	103901454	103904723
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	104012520	16	16	0.5647	3.68923690600753e-31	103901454	103904723	7.14580969952162e-30	104012520	104108153
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	110023268	1582	1549	-0.0012	7.14580969952162e-30	104012520	104108153	3.27879142082631e-07	110014625	110023268
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-0.5697	3.27879142082631e-07	110014625	110023268	6.5080466214669e-07	110041712	110062339
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147306304	4556	4432	-0.0012	6.5080466214669e-07	110041712	110062339	7.68501919269838e-20	146290772	147313991
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	34	0.3218	7.68501919269838e-20	146290772	147313991	2.87361995592566e-19	147490553	148081769
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150823073	1259	1221	0.0134	2.87361995592566e-19	147490553	148081769	0.000334558341585250	150816180	150836481
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150839754	3	3	-0.4362	0.00033455834158525	150816180	150836481	0.00115532913977633	150839754	150839754
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	-1.2977	0.00115532913977633	150839754	150839754	4.6893869726328e-47	150851439	150851439
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2683	0.0099	4.6893869726328e-47	150851439	150851439	4.82642171308556e-35	157133150	157133150
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.807	4.82642171308556e-35	157133150	157133150	9.3836110234644e-38	157136342	157136342
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4006	-0.004	9.3836110234644e-38	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.3246	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	194978218	9180	8921	9e-04	0	167507898	167507898	8.55928763913163e-20	194977713	195011344
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.6082	8.55928763913163e-20	194977713	195011344	2.79712788611424e-18	195048208	195091758
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200596027	2157	2096	0.0062	2.79712788611424e-18	195048208	195091758	4.8578692002033e-15	200582647	200616638
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200801004	41	40	-0.261	4.8578692002033e-15	200582647	200616638	5.06362891449234e-15	200683992	200808717
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200802204	227872808	9922	9652	-0.0031	5.06362891449234e-15	200683992	200808717	2.06848821004967e-15	227872808	227872808
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227875096	227875096	1	0	NA	2.06848821004967e-15	227872808	227872808	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8265	NA	NA	NA	3.50758236120769e-15	227882805	227889619
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246753652	7352	7152	-0.0037	3.50758236120769e-15	227882805	227889619	1.28837951423584e-24	246738832	246769018
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246755225	246862029	30	29	0.3828	1.28837951423584e-24	246738832	246769018	5.39165355971743e-21	246857496	246864725
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	95	0.0021	5.39165355971743e-21	246857496	246864725	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10614	-0.0041	NA	NA	NA	2.13304550548564e-10	33076512	33076512
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	0.9809	2.13304550548564e-10	33076512	33076512	3.50107095316116e-12	33080437	33080437
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	634	5e-04	3.50107095316116e-12	33080437	33080437	4.79025644301901e-39	34542224	34551222
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-0.6046	4.79025644301901e-39	34542224	34551222	2.4090004771045e-36	34582272	34591681
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37797909	1366	1339	-0.0023	2.4090004771045e-36	34582272	34591681	3.16058712713861e-13	37779760	37810001
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37800512	37855837	25	24	-0.3117	3.16058712713861e-13	37779760	37810001	8.58026367352441e-14	37847519	37863712
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	66357387	10363	10114	0.0035	8.58026367352441e-14	37847519	37863712	0	66357387	66357387
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-5.8894	0	66357387	66357387	0	66360747	66360747
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	106244482	10614	10356	-0.0023	0	66360747	66360747	2.05675601590183e-16	106244482	106244482
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106253229	3	3	-0.9795	2.05675601590183e-16	106244482	106244482	1.40266430310836e-16	106253229	106253229
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106256521	221116731	36329	35376	-0.0018	1.40266430310836e-16	106253229	106253229	4.96191772757716e-11	221116731	221116731
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	221118042	221120114	2	2	-0.9934	4.96191772757716e-11	221116731	221116731	3.91108955537328e-11	221120114	221120114
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	221124877	242689978	7583	7389	-0.0017	3.91108955537328e-11	221120114	221120114	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10537	-0.0061	NA	NA	NA	3.18736238456095e-45	32074432	32074432
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.9375	3.18736238456095e-45	32074432	32074432	1.58125817692703e-42	32080848	32080848
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1830	0.0018	1.58125817692703e-42	32080848	32080848	4.38104400805391e-18	37951628	37953375
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7342	4.38104400805391e-18	37951628	37953375	1.54118205253582e-17	37961110	37963014
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	46769081	3238	3129	-0.0029	1.54118205253582e-17	37961110	37963014	4.4416279872895e-36	46769081	46769081
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.905	4.4416279872895e-36	46769081	46769081	1.30169825208387e-39	46825048	46825048
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	47460892	285	282	0.0188	1.30169825208387e-39	46825048	46825048	1.28331565055821e-266	47460892	47460892
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.6307	1.28331565055821e-266	47460892	47460892	2.17228151135226e-243	47466921	47466921
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	52354724	2152	2098	0.0215	2.17228151135226e-243	47466921	47466921	9.33116499376456e-06	52329033	52369369
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52356953	52395877	20	20	-0.2162	9.33116499376456e-06	52329033	52369369	5.13692097571597e-06	52375121	52408794
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52397001	53001678	270	264	0.0186	5.13692097571597e-06	52375121	52408794	1.00208848152416e-19	52999601	53001678
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.7744	1.00208848152416e-19	52999601	53001678	2.36151537677153e-17	53011885	53014254
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	150748947	30554	29767	-0.0041	2.36151537677153e-17	53011885	53014254	0	150748947	150748947
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-5.4569	0	150748947	150748947	0	150752600	150752600
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	164005577	4268	4141	-0.0043	0	150752600	150752600	1.65390836214246e-144	164005577	164009321
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.4254	1.65390836214246e-144	164005577	164009321	1.17763662525395e-20	164019640	164027724
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	0.526	1.17763662525395e-20	164019640	164027724	2.90627955590824e-32	164105613	164112873
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194358882	10131	9871	0.0019	2.90627955590824e-32	164105613	164112873	9.53247747610538e-09	194353315	194362272
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	-0.5454	9.53247747610538e-09	194353315	194362272	9.61199829745324e-08	194364470	194375211
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1934	-0.0028	9.61199829745324e-08	194364470	194375211	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3314	0.0095	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.8797	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	64376590	13954	13612	-0.0039	0	9842644	9842644	4.59248754812669e-99	64376590	64376590
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-2.8833	4.59248754812669e-99	64376590	64376590	1.84367122672486e-93	64390333	64390333
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	84135103	5975	5821	-4e-04	1.84367122672486e-93	64390333	64390333	1.66627613997328e-10	84135103	84135103
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	84136337	84138286	2	2	-0.9648	1.66627613997328e-10	84135103	84135103	1.11404774536984e-10	84138286	84138286
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	84143520	107275274	7822	7629	-0.0041	1.11404774536984e-10	84138286	84138286	7.87920804786478e-09	107271000	107275274
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107283257	5	5	0.5518	7.87920804786478e-09	107271000	107275274	8.02575637351998e-09	107283257	107284892
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107284892	138307863	7805	7595	-1e-04	8.02575637351998e-09	107283257	107284892	5.54381793972284e-10	138307863	138307863
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-0.9247	5.54381793972284e-10	138307863	138307863	8.42933303487407e-10	138319409	138324335
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	173224400	10676	10389	-0.0038	8.42933303487407e-10	138319409	138324335	1.28067972357344e-175	173224400	173224400
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.768	1.28067972357344e-175	173224400	173224400	4.14808637451418e-199	173228860	173228860
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	0.0351	4.14808637451418e-199	173228860	173228860	3.24228443419515e-15	173660684	173660684
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.096	3.24228443419515e-15	173660684	173660684	4.46523934228465e-14	173666072	173666072
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5185	-0.0062	4.46523934228465e-14	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3863	0.0011	NA	NA	NA	3.7183873130341e-12	12857302	12857302
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.0629	3.7183873130341e-12	12857302	12857302	3.02035665329249e-13	12873052	12873052
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	68785515	15037	14620	-0.006	3.02035665329249e-13	12873052	12873052	1.43004725477021e-08	68785515	68785515
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68786286	68791405	2	2	-0.8795	1.43004725477021e-08	68785515	68785515	5.42717427892989e-09	68791405	68791405
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68792873	77721879	2491	2427	0.0027	5.42717427892989e-09	68791405	68791405	1.46536712165508e-09	77721879	77721879
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	77724204	77725392	2	2	-0.9056	1.46536712165508e-09	77721879	77721879	3.77198871901021e-09	77725392	77725392
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	77727599	150156233	22339	21751	-0.0032	3.77198871901021e-09	77725392	77725392	2.1993646599743e-09	150156233	150156233
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150161037	2	2	-0.916	2.1993646599743e-09	150156233	150156233	4.09869601499053e-28	150161037	150161037
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150162435	150181399	4	4	0.0632	4.09869601499053e-28	150161037	150161037	7.83952892832804e-19	150181399	150181399
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.9339	7.83952892832804e-19	150181399	150181399	9.18269289842194e-35	150202601	150202601
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180194323	9784	9528	-0.0013	9.18269289842194e-35	150202601	150202601	1.71879836102970e-09	180187846	180348365
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180364670	11	11	-0.4008	1.7187983610297e-09	180187846	180348365	1.63311371488558e-05	180357210	180393168
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180365950	180632269	109	107	0.0101	1.63311371488558e-05	180357210	180393168	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10329	-0.0026	NA	NA	NA	3.49272985911966e-24	29939288	29972382
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-0.5273	3.49272985911966e-24	29939288	29972382	5.37132651182421e-21	30000990	30021908
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31382291	578	555	0.019	5.37132651182421e-21	30000990	30021908	4.51256629980600e-11	31381060	31383925
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31390982	5	5	-0.6631	4.512566299806e-11	31381060	31383925	7.68909603240416e-13	31389372	31393624
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32548736	491	483	0.0157	7.68909603240416e-13	31389372	31393624	1.08948685898384e-32	32543054	32563252
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	10	0.7865	1.08948685898384e-32	32543054	32563252	7.27363515437419e-09	32595402	32609525
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	0.1568	7.27363515437419e-09	32595402	32609525	0.000118734493635503	32700719	32718991
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.6217	0.000118734493635503	32700719	32718991	1.61681484569563e-16	32728285	32731072
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862502	1346	1309	0.0027	1.61681484569563e-16	32728285	32731072	1.96093855622155e-10	35856922	35866245
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	-0.5699	1.96093855622155e-10	35856922	35866245	8.75054979069183e-11	35870753	35878656
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6706	-8e-04	8.75054979069183e-11	35870753	35878656	6.05324173074621e-30	54035000	54035000
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.314	6.05324173074621e-30	54035000	54035000	5.50834942212245e-32	54042734	54042734
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74647491	5288	5125	0.0012	5.50834942212245e-32	54042734	54042734	3.56934728370275e-10	74644381	74647491
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-0.7545	3.56934728370275e-10	74644381	74647491	5.19141723305518e-10	74655219	74655219
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	79018959	1141	1116	0.0102	5.19141723305518e-10	74655219	74655219	0	79018959	79018959
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-5.3557	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6585	0.0036	0	79091850	79091850	0	103841482	103841482
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.3287	0	103841482	103841482	0	103868154	103868154
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	155159371	17624	17178	-0.0032	0	103868154	103868154	6.97881301978689e-10	155157679	155159371
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155160734	155163895	3	3	-0.7728	6.97881301978689e-10	155157679	155159371	2.72829672146335e-10	155163895	155165959
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155165959	165643653	3479	3385	-0.0113	2.72829672146335e-10	155163895	155165959	0	165643653	165643653
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-5.0763	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1764	-0.0256	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	252	-0.0026	NA	NA	NA	2.19922720375203e-07	1037402	1038517
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.881	2.19922720375203e-07	1037402	1038517	9.22090044681627e-11	1047707	1047707
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	53578010	17969	17543	-0.0024	9.22090044681627e-11	1047707	1047707	1.94028990249834e-10	53578010	53584198
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	53584198	53593137	3	3	-0.7944	1.94028990249834e-10	53578010	53584198	1.87440411222404e-10	53588225	53593137
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	53599672	109217320	16727	16298	0.0048	1.87440411222404e-10	53588225	53593137	0	109217320	109217320
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.5232	0	109217320	109217320	0	109233214	109233214
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	118611324	4301	4207	-0.0061	0	109233214	109233214	5.68376581931376e-256	118611324	118611324
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.7953	5.68376581931376e-256	118611324	118611324	5.49939126622228e-252	118620875	118620875
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133432281	6826	6644	-0.0019	5.49939126622228e-252	118620875	118620875	2.93313442600059e-32	133426996	133432281
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133433384	133433384	1	0	NA	2.93313442600059e-32	133426996	133432281	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8361	NA	NA	NA	3.09210014648796e-34	133448277	133448277
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	139297332	2708	2643	0.0103	3.09210014648796e-34	133448277	133448277	1.06750465004123e-12	139294913	139300621
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139299516	139307142	6	6	0.5999	1.06750465004123e-12	139294913	139300621	4.95355296367915e-12	139303945	139309097
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139309097	141406414	983	962	0.0101	4.95355296367915e-12	139303945	139309097	5.61565347194253e-07	141393068	141413352
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141408013	141443577	19	18	-0.2526	5.61565347194253e-07	141393068	141413352	5.94808198119307e-06	141435643	141460982
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141446728	141690753	114	108	0.0248	5.94808198119307e-06	141435643	141460982	3.17433810645195e-24	141689547	141690753
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	0.8387	3.17433810645195e-24	141689547	141690753	8.92047720713795e-30	141711513	141711513
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	158821263	6754	6572	6e-04	8.92047720713795e-30	141711513	141711513	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.027	NA	NA	NA	1.10088574590801e-148	581533	581533
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.8787	1.10088574590801e-148	581533	581533	1.10413968165714e-174	588865	588865
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12595	-2e-04	1.10413968165714e-174	588865	588865	6.82891717153638e-237	39350798	39350798
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8474	6.82891717153638e-237	39350798	39350798	1.95633151310930e-254	39505256	39505256
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	115701209	21738	21200	-0.0022	1.9563315131093e-254	39505256	39505256	1.31307335171580e-10	115701209	115701209
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.9638	1.3130733517158e-10	115701209	115701209	6.57530877878387e-10	115711730	115711730
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9458	-0.0066	6.57530877878387e-10	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	5632749	2090	2034	-0.0043	NA	NA	NA	1.31097264912991e-08	5623484	5634019
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5634019	5647674	3	3	-0.7011	1.31097264912991e-08	5623484	5634019	8.79925382517679e-09	5646414	5660083
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5660083	15802255	3365	3270	-0.0045	8.79925382517679e-09	5646414	5660083	5.0874835620887e-13	15802255	15802255
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15813356	3	3	0.8343	5.0874835620887e-13	15802255	15802255	2.42463124580653e-12	15813356	15813954
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	22477358	2376	2315	-0.006	2.42463124580653e-12	15813356	15813954	1.63172290168222e-239	22477358	22477358
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-4.4397	1.63172290168222e-239	22477358	22477358	9.18915782633911e-238	22492603	22492603
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5084	0.0056	9.18915782633911e-238	22492603	22492603	7.7881495783302e-34	70926188	70926188
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.698	7.7881495783302e-34	70926188	70926188	3.09280339106516e-35	70930528	70930528
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	77192566	2337	2271	-0.0077	3.09280339106516e-35	70930528	70930528	1.737796853519e-13	77188784	77192566
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77194207	77200826	3	3	-0.8802	1.737796853519e-13	77188784	77192566	1.43353800636616e-12	77200826	77202889
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77202889	140145683	22530	21960	-0.0026	1.43353800636616e-12	77200826	77202889	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9479	-0.0012	NA	NA	NA	1.23062685194611e-295	27038538	27038538
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-5.0177	1.23062685194611e-295	27038538	27038538	2.45802279187882e-298	27041812	27041812
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14473	-0.0041	2.45802279187882e-298	27041812	27041812	1.49004434075099e-186	77917893	77917893
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.9714	1.49004434075099e-186	77917893	77917893	1.09867069370008e-176	77928669	77928669
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	82866553	1495	1454	-0.0066	1.09867069370008e-176	77928669	77928669	3.58249321582951e-25	82866553	82866553
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82869426	1	0	NA	3.58249321582951e-25	82866553	82866553	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82871659	82881204	5	5	-0.9647	NA	NA	NA	5.20955736477240e-26	82881204	82881204
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	135285645	18713	18212	-0.0026	5.2095573647724e-26	82881204	82881204	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	417965	84	81	-0.0162	NA	NA	NA	5.13073143302543e-07	417965	417965
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	420644	422010	2	2	0.9681	5.13073143302543e-07	417965	417965	1.98013582724924e-09	422010	422010
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	423403	5738494	2051	2009	-1e-04	1.98013582724924e-09	422010	422010	2.89449973081593e-21	5738494	5738494
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5742476	2	2	-1.4511	2.89449973081593e-21	5738494	5738494	6.03285266929699e-09	5742476	5744034
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5744034	5765438	14	14	-5.6733	6.03285266929699e-09	5742476	5744034	0	5765438	5765438
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18896166	5219	5083	-0.0043	0	5765438	5765438	3.59250768697513e-12	18892456	18896166
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.6161	3.59250768697513e-12	18892456	18896166	1.43095071747787e-12	18917191	18929375
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9271	-0.0028	1.43095071747787e-12	18917191	18929375	1.31472582309122e-39	55112618	55124730
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.4227	1.31472582309122e-39	55112618	55124730	1.59784107106358e-29	55207305	55219985
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	55322023	46	44	0.0152	1.59784107106358e-29	55207305	55219985	2.76850100800608e-25	55322023	55322023
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55325199	55328960	3	3	-0.9508	2.76850100800608e-25	55322023	55322023	5.24953208489234e-15	55328960	55328960
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55332249	81177333	9824	9562	0.0038	5.24953208489234e-15	55328960	55328960	1.58031381729671e-08	81177333	81177333
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-0.8929	1.58031381729671e-08	81177333	81177333	1.61887221992176e-12	81192409	81192409
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	81536990	80	77	0.0336	1.61887221992176e-12	81192409	81192409	3.5106998899431e-11	81536990	81536990
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81538067	81540765	2	2	0.8834	3.5106998899431e-11	81536990	81536990	3.37050979310311e-09	81540765	81540765
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	99025912	5536	5412	-0.0076	3.37050979310311e-09	81540765	81540765	4.96789705921074e-10	99006512	99027331
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99027331	99074552	22	22	0.2724	4.96789705921074e-10	99006512	99027331	1.13869806989949e-09	99072015	99085113
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	107284914	2769	2702	4e-04	1.13869806989949e-09	99072015	99085113	2.06923780573418e-78	107284914	107284914
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-2.6134	2.06923780573418e-78	107284914	107284914	6.3670142673139e-78	107292148	107292148
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9806	-0.0048	6.3670142673139e-78	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	736988	295	288	-0.0146	NA	NA	NA	5.55206377976870e-20	736988	736988
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.96	5.5520637797687e-20	736988	736988	1.06966312834343e-20	743223	743223
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3343	4e-04	1.06966312834343e-20	743223	743223	1.53563434597220e-33	9523923	9528590
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9550789	4	4	1.2193	1.5356343459722e-33	9523923	9528590	1.79454062863886e-34	9543817	9550789
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	9554149	1	0	NA	1.79454062863886e-34	9543817	9550789	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	132289090	41414	40347	0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7135	-0.0051	NA	NA	NA	4.41313583068393e-101	37953582	37953582
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9062	4.41313583068393e-101	37953582	37953582	5.81264925153975e-103	37957844	37957844
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6536	-0.0015	5.81264925153975e-103	37957844	37957844	0	56650373	56650373
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	-5.8746	0	56650373	56650373	0	56685341	56685341
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68142120	2694	2636	0	0	56685341	56685341	9.51134099585069e-09	68132217	68146755
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68168882	12	11	0.3689	9.51134099585069e-09	68132217	68146755	1.57133737803733e-09	68161714	68172973
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68169957	71375082	917	892	0.0116	1.57133737803733e-09	68161714	68172973	0	71375082	71375082
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-5.5369	0	71375082	71375082	0	71377671	71377671
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	72147236	198	191	-0.0183	0	71377671	71377671	5.34506642238107e-18	72147236	72147236
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	72150800	72163566	6	5	-0.8111	5.34506642238107e-18	72147236	72147236	4.12506349353169e-19	72163566	72163566
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	72167281	89659397	4424	4324	0.0018	4.12506349353169e-19	72163566	72163566	2.95152817397123e-23	89659397	89659397
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.4151	2.95152817397123e-23	89659397	89659397	3.83649579450049e-23	89662326	89662326
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9111	-0.0086	3.83649579450049e-23	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19492531	59	58	0.2608	NA	NA	NA	9.27891193033862e-22	19471494	19540294
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19494416	40676611	7589	7393	0.0063	9.27891193033862e-22	19471494	19540294	5.56003354362633e-12	40663660	40676611
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.5185	5.56003354362633e-12	40663660	40676611	6.42068081097362e-12	40726930	40741934
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	79174722	14685	14287	0.002	6.42068081097362e-12	40726930	40741934	1.66312480456371e-237	79174722	79174722
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79180204	3	3	-3.6552	1.66312480456371e-237	79174722	79174722	2.90354799314362e-230	79180204	79180204
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79183154	79183154	1	0	NA	2.90354799314362e-230	79180204	79180204	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	9077	-0.0026	NA	NA	NA	2.22001044390222e-14	105594189	105602602
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.4632	2.22001044390222e-14	105594189	105602602	5.55193358250303e-09	105630089	105707746
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106216726	178	169	0.02	5.55193358250303e-09	105630089	105707746	1.14614099476698e-11	106209063	106219784
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106218059	106253648	17	17	-0.4153	1.14614099476698e-11	106209063	106219784	6.81875996566885e-10	106251081	106260962
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	33	0.0053	6.81875996566885e-10	106251081	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1591	NA	NA	NA	1.81680830591396e-13	18452491	18692865
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20079935	150	149	-0.6096	1.81680830591396e-13	18452491	18692865	4.54540394173947e-319	20065525	20088256
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20088256	41638388	7355	7156	-0.0016	4.54540394173947e-319	20065525	20088256	3.82903996762865e-20	41637456	41638388
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41723580	11	10	0.5908	3.82903996762865e-20	41637456	41638388	8.60384852530776e-20	41723580	41776053
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41776053	78855195	15854	15430	1e-04	8.60384852530776e-20	41723580	41776053	4.80921340997447e-13	78855195	78855195
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	1.0831	4.80921340997447e-13	78855195	78855195	7.14459830871996e-14	78858227	78858227
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	82332155	1132	1101	-0.0026	7.14459830871996e-14	78858227	78858227	1.34115142956468e-07	82330854	82332155
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-0.8159	1.34115142956468e-07	82330854	82332155	2.98020040456493e-07	82334704	82335935
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	92685557	4039	3932	-0.0027	2.98020040456493e-07	82334704	82335935	6.49585187922363e-09	92685557	92685557
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	92687742	92689467	2	2	0.8932	6.49585187922363e-09	92685557	92685557	7.36383081210387e-09	92689467	92689467
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	92691304	100298352	2770	2696	-0.0035	7.36383081210387e-09	92689467	92689467	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2638581	1014	984	0.0041	NA	NA	NA	1.34714980703671e-65	2638581	2638581
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638643	2639798	2	2	-2.904	1.34714980703671e-65	2638581	2638581	2.57867684024117e-94	2639798	2639798
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	28512937	8599	8365	0.0067	2.57867684024117e-94	2639798	2639798	1.62010875400431e-08	28508727	28512937
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28523145	28529948	4	4	0.6385	1.62010875400431e-08	28508727	28512937	6.38843256280631e-09	28529948	28536745
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	75092501	10903	10651	0.0044	6.38843256280631e-09	28529948	28536745	3.08075911477602e-11	75089974	75092501
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	3.08075911477602e-11	75089974	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.8197	NA	NA	NA	3.6858173198236e-10	75100865	75102639
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4981	-0.0043	3.6858173198236e-10	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	19438939	7621	7431	0.0135	NA	NA	NA	7.57659425225654e-59	19438939	19438939
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19442291	19450870	3	3	-1.8574	7.57659425225654e-59	19438939	19438939	0.00106723110835450	19450870	19470000
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19455507	19478144	8	8	-4.7588	0.0010672311083545	19450870	19470000	4.69521946752791e-317	19476901	19478144
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19486276	20020846	234	226	0.0143	4.69521946752791e-317	19476901	19478144	1.17592517653985e-222	20020846	20020846
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	20022322	20022322	1	0	NA	1.17592517653985e-222	20020846	20020846	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	20024006	20159997	66	64	0.88	NA	NA	NA	4.66306465434584e-289	20159997	20159997
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	20373448	20373448	1	0	NA	4.66306465434584e-289	20159997	20159997	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	20375148	36673853	5937	5758	0.0053	NA	NA	NA	9.90974779280295e-34	36673853	36673853
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.9862	9.90974779280295e-34	36673853	36673853	8.49488199606735e-33	36684619	36684619
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	68326225	11490	11156	0.0101	8.49488199606735e-33	36684619	36684619	2.35350799760914e-11	68326225	68326225
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68329393	2	2	-1.0055	2.35350799760914e-11	68326225	68326225	2.35203724318270e-10	68329393	68329393
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68331629	68331629	1	0	NA	2.3520372431827e-10	68329393	68329393	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	72274184	1704	1657	0.0107	NA	NA	NA	1.68523404648513e-30	72274184	72274184
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72277456	72288537	6	6	-0.9815	1.68523404648513e-30	72274184	72274184	9.6135494110152e-38	72288537	72288537
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72291032	72774988	186	179	0.0096	9.6135494110152e-38	72288537	72288537	4.43036374162591e-22	72774988	72774988
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72776416	72780121	3	3	-1.0613	4.43036374162591e-22	72774988	72774988	7.13267245920046e-17	72780121	72780121
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72785841	78653545	2365	2300	0.0025	7.13267245920046e-17	72780121	72780121	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10695	-0.0041	NA	NA	NA	6.76626710348017e-88	36509250	36509250
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.7074	6.76626710348017e-88	36509250	36509250	2.89682929933264e-80	36519728	36519728
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	5066	-0.003	2.89682929933264e-80	36519728	36519728	3.32208882973529e-16	53092949	53092949
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.21	3.32208882973529e-16	53092949	53092949	2.87828544355084e-16	53099601	53099601
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6578	-0.004	2.87828544355084e-16	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	213	0.0265	NA	NA	NA	6.04639930382395e-10	790526	790526
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.0331	6.04639930382395e-10	790526	790526	1.17801637922618e-09	794978	794978
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	3353960	1199	1163	0.015	1.17801637922618e-09	794978	794978	3.985110597302e-11	3353960	3353960
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	1.1035	3.985110597302e-11	3353960	3353960	9.74167009837279e-12	3356334	3356334
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	20420327	7795	7580	0.0229	9.7416700983728e-12	3356334	3356334	3.42570272551795e-50	20420327	20425020
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20422223	20493401	14	13	-0.837	3.42570272551795e-50	20420327	20425020	6.73917187870867e-51	20472156	20493401
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	63787171	13827	13487	0.0142	6.73917187870867e-51	20472156	20493401	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	573	0.0045	NA	NA	NA	3.21833370702021e-261	1511632	1516966
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	8	-3.0483	3.21833370702021e-261	1511632	1516966	0	1525300	1531162
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20464	-9e-04	0	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	42394170	11292	11004	-0.0046	NA	NA	NA	8.43534616173902e-09	42392146	42395313
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	42395313	42402362	4	4	-0.6334	8.43534616173902e-09	42392146	42395313	7.83599703422242e-08	42399468	42403712
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	42403712	46922972	2145	2086	1e-04	7.83599703422242e-08	42399468	42403712	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2895	0.0094	NA	NA	NA	1.92173587744319e-302	22667608	22679305
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22704683	11	11	-2.4908	1.92173587744319e-302	22667608	22679305	0.00115643406707007	22696038	22710302
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22706166	22725305	11	11	-4.4822	0.00115643406707007	22696038	22710302	0	22721042	22725305
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13213	0.0073	0	22721042	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1604	NA	NA	NA	0.000136512811004372	4893	98390
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	0.8096	0.000136512811004372	4893	98390	5.44320878825261e-24	104486	106242
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2672401	1753	1700	-0.0188	5.44320878825261e-24	104486	106242	4.18544842122396e-07	2664508	2696434
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2566	4.18544842122396e-07	2664508	2696434	1.18914622108475e-173	2708291	2708291
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22351	0.9685	1.18914622108475e-173	2708291	2708291	4.97457278704797e-26	76998610	76998610
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.59	4.97457278704797e-26	76998610	76998610	3.49589278645575e-23	77010018	77010018
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	152655026	21520	20981	0.9695	3.49589278645575e-23	77010018	77010018	1.42919686592803e-17	152655026	152655026
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.4496	1.42919686592803e-17	152655026	152655026	5.88196640000214e-09	152657445	152669192
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	153329988	255	249	0.867	5.88196640000214e-09	152657445	152669192	2.84969891120241e-06	153322116	153329988
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153348763	8	8	0.3066	2.84969891120241e-06	153322116	153329988	2.48318133086510e-12	153348763	153351248
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153351248	154582414	408	396	0.9463	2.4831813308651e-12	153348763	153351248	0	154578922	154582414
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0109	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2778371	30	28	-4.513	NA	NA	NA	8.06876632124821e-06	2769294	2778371
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2779873	2784560	5	5	-2.335	8.0687663212482e-06	2769294	2778371	2.57815584628930e-06	2784560	2792940
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3733715	89	88	-4.449	2.5781558462893e-06	2784560	2792940	1.73568042910182e-40	3223585	3772482
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4948824	13	13	-0.8995	1.73568042910182e-40	3223585	3772482	2.82078505162170e-19	4846477	5531459
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5422507	7053223	177	167	-3.9335	2.8207850516217e-19	4846477	5531459	3.6191240927407e-10	7031936	7191629
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7054924	7054924	1	0	NA	3.6191240927407e-10	7031936	7191629	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	124	-2.9058	NA	NA	NA	1.38890264332062e-05	7465453	7495687
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7606496	12	11	-5.0815	1.38890264332062e-05	7465453	7495687	1.87106590293211e-07	7606496	7614571
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	18	-3.0747	1.87106590293211e-07	7606496	7614571	0.000651533998038388	7632577	7668917
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7722458	43	42	-4.3081	0.000651533998038388	7632577	7668917	1.76420942792516e-13	7714929	7723783
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	18	-2.2849	1.76420942792516e-13	7714929	7723783	4.4821876441442e-06	7776265	7806091
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-4.0068	4.4821876441442e-06	7776265	7806091	0.00085492376496365	7866716	7905286
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.9504	0.00085492376496365	7866716	7905286	1.18147667830269e-07	7914104	7918899
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8241630	78	72	-4.4727	1.18147667830269e-07	7914104	7918899	0.00446141306385203	8114544	8486504
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8245608	8956787	200	194	-3.9029	0.00446141306385203	8114544	8486504	4.77225160528319e-05	8807275	9128508
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	104	-4.522	4.77225160528319e-05	8807275	9128508	4.83819952452337e-47	10512616	10513747
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.5722	4.83819952452337e-47	10512616	10513747	0.0341926230760574	10631941	11660512
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-2.5745	0.0341926230760574	10631941	11660512	0.0363847151968511	10655750	12452734
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.6582	0.0363847151968511	10655750	12452734	7.40229522657404e-16	12537944	12542979
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12590969	24	22	-1.7887	7.40229522657404e-16	12537944	12542979	2.34026779968536e-07	12585240	12591908
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12611624	11	11	-3.6996	2.34026779968536e-07	12585240	12591908	0.000486814173185558	12605673	12634446
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	19	-2.144	0.000486814173185558	12605673	12634446	6.33507100442558e-05	12651786	12733867
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12926941	56	54	-3.6557	6.33507100442558e-05	12651786	12733867	1.44807143377954e-08	12901857	12964087
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	76	-2.2757	1.44807143377954e-08	12901857	12964087	0.000195405175399431	13078432	13155705
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13254711	42	40	-3.3777	0.000195405175399431	13078432	13155705	3.53390342684329e-07	13169265	13272362
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13508638	116	108	-4.4001	3.53390342684329e-07	13169265	13272362	4.87802311687941e-06	13497730	13510282
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13508776	13522778	6	6	-2.5635	4.87802311687941e-06	13497730	13510282	8.04982028053585e-07	13520364	13525650
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13524481	13536327	10	10	-5.3506	8.04982028053585e-07	13520364	13525650	0.00123067447049330	13529620	13562157
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13537520	13918652	102	96	-4.1346	0.0012306744704933	13529620	13562157	4.92331594553167e-08	13863657	13945101
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13918766	14122129	102	93	-4.8569	4.92331594553167e-08	13863657	13945101	0.000117433010981906	14102074	14330251
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14352278	34	34	-4.0552	0.000117433010981906	14102074	14330251	0.0335893248746656	14214157	14466597
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14524829	95	93	-3.4838	0.0335893248746656	14214157	14466597	1.54375401527950e-08	14503185	14539230
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	23	-1.8717	1.5437540152795e-08	14503185	14539230	0.053143475674012	14549297	14603508
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14681738	11	11	-3.2959	0.053143475674012	14549297	14603508	0.364727314111739	14585542	14694578
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	14700040	12	12	-4.0166	0.364727314111739	14585542	14694578	0.0353257630980267	14685149	14729413
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14883615	43	39	-4.7726	0.0353257630980267	14685149	14729413	0.000153016694924567	14823549	15005207
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15139441	47	45	-3.9116	0.000153016694924567	14823549	15005207	0.0129906361762619	15103953	15155598
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15165820	17	17	-2.8487	0.0129906361762619	15103953	15155598	0.00107542204487303	15153922	15175378
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15205160	20	20	-4.3722	0.00107542204487303	15153922	15175378	8.06071988816735e-06	15203221	15221212
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15206674	15206674	1	0	NA	8.06071988816735e-06	15203221	15221212	NA	NA	NA
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15241527	12	11	-2.0565	NA	NA	NA	0.00109638697984817	15227049	15241527
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15249591	5	4	-5.3464	0.00109638697984817	15227049	15241527	1.82268493624584e-08	15249591	15250474
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15250474	15277060	20	18	-3.3146	1.82268493624584e-08	15249591	15250474	6.50177406180709e-14	15276098	15280555
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15278175	15408015	85	80	-4.8066	6.50177406180709e-14	15276098	15280555	9.65613563422416e-05	15399621	15412637
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15422696	10	10	-3.6265	9.65613563422416e-05	15399621	15412637	0.00262621583010019	15412637	15422696
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15423625	15433122	8	8	-4.7886	0.00262621583010019	15412637	15422696	5.64312770999355e-32	15433122	15433122
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15446156	5	5	-2.1461	5.64312770999355e-32	15433122	15433122	1.122232530012e-45	15446156	15446156
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15447091	15469100	16	15	-5.2394	1.122232530012e-45	15446156	15446156	2.85895422342077e-11	15469100	15471179
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15470132	15519963	14	14	-3.6804	2.85895422342077e-11	15469100	15471179	0.000947895623687478	15517551	15519963
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15521958	15523178	2	2	-5.702	0.000947895623687478	15517551	15519963	0.295088462509911	15523178	15580942
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15587741	35	32	-3.1675	0.295088462509911	15523178	15580942	0.0884658125395114	15528826	15587741
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15617621	5	5	-4.914	0.0884658125395114	15528826	15587741	6.32435993440245e-21	15617621	15617621
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15621613	15630463	3	3	-2.4085	6.32435993440245e-21	15617621	15617621	8.38950401524693e-06	15630463	15642822
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15915466	46	43	-4.5541	8.38950401524693e-06	15630463	15642822	3.59623877597904e-08	15892492	15958396
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	100	-3.3285	3.59623877597904e-08	15892492	15958396	1.20634451617428e-13	16156464	16206224
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	22930737	1098	1053	-4.2553	1.20634451617428e-13	16156464	16206224	1.10093681795378e-107	22924754	26870361
MSK_252152915663_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.4164	1.10093681795378e-107	22924754	26870361	NA	NA	NA
