Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2105739	392	377	0.4482	NA	NA	NA	2.43929713951870e-11	2096598	2113202
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2107025	2158943	22	21	1.0215	2.4392971395187e-11	2096598	2113202	2.28984879767288e-14	2145421	2164195
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2160429	7365376	1799	1750	0.4667	2.28984879767288e-14	2145421	2164195	0	7344643	7384766
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7367328	27785621	8042	7745	0.1041	0	7344643	7384766	2.10752923877182e-11	27771306	27811562
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27787328	27859402	35	32	0.4589	2.10752923877182e-11	27771306	27811562	8.00995098601818e-13	27825497	27868977
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27860520	50532444	8847	8552	0.0922	8.00995098601818e-13	27825497	27868977	5.4222777378554e-314	50516469	50543520
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	50537802	51891559	548	533	0.5353	5.4222777378554e-314	50516469	50543520	0	51882439	51899362
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51894105	72537426	8209	7921	0.0877	0	51882439	51899362	0	72537426	72537426
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.6828	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	11041	0.0943	0	72579311	72579311	2.07151251714945e-23	109373255	109373255
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.6996	2.07151251714945e-23	109373255	109373255	5.14689765301615e-16	109376249	109376249
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	270	0.1284	5.14689765301615e-16	109376249	109376249	3.38481566213893e-14	109984914	109987341
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.7083	3.38481566213893e-14	109984914	109987341	2.55027065993898e-08	109989998	109989998
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	11	0.0821	2.55027065993898e-08	109989998	109989998	0.00255774486624911	110011494	110023268
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.8541	0.00255774486624911	110011494	110023268	4.67502038721438e-09	110039388	110041712
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	117379571	2714	2631	0.0995	4.67502038721438e-09	110039388	110041712	3.49621137159161e-136	117369542	117386012
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117381026	117866748	223	219	0.5402	3.49621137159161e-136	117369542	117386012	7.89324438969903e-130	117856682	117872204
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117867214	120851476	893	861	0.0821	7.89324438969903e-130	117856682	117872204	4.98183221017078e-14	120358263	120876592
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120854952	121030970	55	55	-0.1916	4.98183221017078e-14	120358263	120876592	3.33567676248113e-23	121015302	121052394
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	121038335	143791143	75	75	0.1983	3.33567676248113e-23	121015302	121052394	1.59394999751538e-11	143789484	143791143
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143793179	143793256	2	2	1.1418	1.59394999751538e-11	143789484	143791143	3.49902557522139e-13	143793256	143793256
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143799153	143820820	15	14	0.2254	3.49902557522139e-13	143793256	143793256	0.00973983068080887	143815233	144093719
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143822873	144107002	21	20	0.523	0.00973983068080887	143815233	144093719	0.000696892929069272	143952457	144139227
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144108338	150819879	1852	1787	0.7908	0.000696892929069272	143952457	144139227	3.88934808749688e-77	150819879	150819879
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150848509	10	9	-0.9165	3.88934808749688e-77	150819879	150819879	2.32402761403408e-76	150848509	150848509
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	150851439	1	0	NA	2.32402761403408e-76	150848509	150848509	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	158317231	3217	3110	0.7947	NA	NA	NA	2.75667117126832e-10	158298040	158330874
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	158318365	158416011	46	44	1.0843	2.75667117126832e-10	158298040	158330874	1.52944450491865e-06	158399176	158450163
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	158419417	158881066	200	190	0.8197	1.52944450491865e-06	158399176	158450163	5.94681744072025e-83	158866651	158893124
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	158883523	167479184	3406	3306	0.4536	5.94681744072025e-83	158866651	158893124	2.69642341797705e-18	167477428	167481271
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167507898	10	10	-0.2793	2.69642341797705e-18	167477428	167481271	6.63296221845311e-19	167506259	167520743
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	169526100	771	741	0.4376	6.63296221845311e-19	167506259	167520743	2.07525762622730e-104	169514291	169553604
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	169534972	170389216	395	383	0.7769	2.0752576262273e-104	169514291	169553604	1.97314200236186e-141	170384258	170398083
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	170390943	177595302	2822	2737	0.4255	1.97314200236186e-141	170384258	170398083	1.57353650656712e-16	177595302	177595302
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	2	-1.1495	1.57353650656712e-16	177595302	177595302	2.70559158007465e-16	177599597	177599597
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	177601540	1	0	NA	2.70559158007465e-16	177599597	177599597	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177604352	182328325	1937	1882	0.4789	NA	NA	NA	0	182320903	182349713
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	182333847	229459891	16003	15494	0.0268	0	182320903	182349713	0	229445513	229464249
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229461459	240485842	4297	4165	0.4395	0	229445513	229464249	7.89109132377532e-14	240468647	240513555
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240489591	240572868	28	27	0.0482	7.89109132377532e-14	240468647	240513555	1.58736627434630e-12	240553456	240589826
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240579429	246702361	2404	2330	0.4364	1.5873662743463e-12	240553456	240589826	3.94286870206217e-18	246676851	246794552
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246713340	246862029	35	35	0.7743	3.94286870206217e-18	246676851	246794552	7.99418352971964e-12	246852126	246902260
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247185356	97	96	0.3542	7.99418352971964e-12	246852126	246902260	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247186514	247186514	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	17836771	5353	5183	0.0643	NA	NA	NA	0	17833422	17839560
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17839560	19002765	247	243	0.821	0	17833422	17839560	0	18998216	19007250
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	19007250	33076512	5276	5118	0.11	0	18998216	19007250	1.04977206020706e-66	33076512	33076512
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-3.0671	1.04977206020706e-66	33076512	33076512	6.44703583181812e-88	33080437	33080437
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	33617141	254	246	0.0933	6.44703583181812e-88	33080437	33080437	6.6039162524579e-37	33617141	33617141
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-2.3769	6.6039162524579e-37	33617141	33617141	5.09088792592192e-33	33621111	33621111
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	34543992	388	374	0.0725	5.09088792592192e-33	33621111	33621111	0	34543992	34543992
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-4.2455	0	34543992	34543992	0	34589997	34589997
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	471	0.0752	0	34589997	34589997	4.70738892626673e-12	35821494	35821494
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.4262	4.70738892626673e-12	35821494	35821494	8.31764985080259e-12	35844884	35851593
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	859	0.1103	8.31764985080259e-12	35844884	35851593	2.22677172656642e-46	37803744	37813211
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.6845	2.22677172656642e-46	37803744	37813211	8.81374569029447e-49	37848754	37858379
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	40887644	1393	1336	0.1165	8.81374569029447e-49	37848754	37858379	0	40879018	40898494
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40890084	40890084	1	0	NA	0	40879018	40898494	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40892201	48991788	3154	3046	0.5317	NA	NA	NA	0	48981999	48997340
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	48993188	52600588	1253	1221	0.0691	0	48981999	48997340	5.55117123969403e-12	52588009	52600588
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8549	5.55117123969403e-12	52588009	52600588	3.6353636450092e-12	52635695	52639605
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	54433689	568	542	0.0801	3.6353636450092e-12	52635695	52639605	1.99978980276153e-18	54427827	54436797
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	54435519	54510349	30	29	0.4814	1.99978980276153e-18	54427827	54436797	4.28976374940831e-15	54505083	54524593
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	54513001	55556490	458	436	0.0997	4.28976374940831e-15	54505083	54524593	1.46272684009551e-13	55537790	55561941
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55557868	55602752	22	21	0.525	1.46272684009551e-13	55537790	55561941	1.09576195863026e-11	55597341	55613831
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55604654	55866999	98	92	0.0985	1.09576195863026e-11	55597341	55613831	1.63050482660298e-08	55859549	55866999
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55876506	55893340	3	3	-0.7884	1.63050482660298e-08	55859549	55866999	1.15739186319774e-11	55893340	55903616
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55903616	63801314	2466	2376	0.0942	1.15739186319774e-11	55893340	55903616	0	63796142	63815171
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	63805252	63805252	1	0	NA	0	63796142	63815171	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	63810375	66357387	911	885	-0.5459	NA	NA	NA	3.34027833927371e-120	66357387	66357387
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-4.8718	3.34027833927371e-120	66357387	66357387	2.36589687157521e-131	66360747	66360747
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	84914906	5772	5587	-0.5716	2.36589687157521e-131	66360747	66360747	6.53910383864607e-179	84914101	84919287
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	84919287	85183297	108	102	0.1377	6.53910383864607e-179	84914101	84919287	5.42591225451654e-36	85158457	85210668
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85189609	85643326	192	178	0.5949	5.42591225451654e-36	85158457	85210668	2.2532704467783e-164	85635538	85648988
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85646597	177410500	25932	25075	0.0865	2.2532704467783e-164	85635538	85648988	0	177405669	177416847
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	177416847	178947027	620	601	-0.538	0	177405669	177416847	1.08042293069608e-50	178943667	178949861
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178949861	179031246	40	39	0.053	1.08042293069608e-50	178943667	178949861	1.33389384657676e-49	179028631	179035131
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179033243	184767585	1809	1747	-0.5545	1.33389384657676e-49	179028631	179035131	0	184747768	184773069
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184773069	186036203	342	328	0.1052	0	184747768	184773069	3.9405998004204e-22	186021763	186051122
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	186045562	186154863	21	21	0.6605	3.9405998004204e-22	186021763	186051122	4.06422997122455e-22	186151598	186192550
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	186175241	190579182	1357	1313	0.1338	4.06422997122455e-22	186151598	186192550	5.40773836367965e-62	190541956	190599966
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190583589	190886876	113	111	0.5292	5.40773836367965e-62	190541956	190599966	2.51094271759258e-73	190882352	190891823
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190888484	212890878	7533	7309	0.1021	2.51094271759258e-73	190882352	190891823	5.00120951184543e-12	212889077	212890878
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.8235	5.00120951184543e-12	212889077	212890878	9.05535490397973e-16	212898875	212898875
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	213901446	372	362	0.1179	9.05535490397973e-16	212898875	212898875	8.38133969981877e-156	213895460	213915037
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213908087	216165526	923	892	0.5063	8.38133969981877e-156	213895460	213915037	1.06437384844386e-258	216146981	216182155
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	216171638	218970587	989	951	0.1105	1.06437384844386e-258	216146981	216182155	1.24640448545949e-11	218970587	218970587
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218971708	218972428	2	2	1.448	1.24640448545949e-11	218970587	218970587	2.77875575537211e-12	218972428	218972428
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218975318	236573319	6129	5950	0.0767	2.77875575537211e-12	218972428	218972428	0	236571413	236578017
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	236575060	242689978	2273	2185	-0.5651	0	236571413	236578017	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	1163539	366	352	-0.5493	NA	NA	NA	3.31496421218245e-46	1151813	1170460
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1167180	1416569	115	109	-0.1204	3.31496421218245e-46	1151813	1170460	1.74378811285886e-71	1411841	1424055
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1418935	8200681	2294	2230	-0.5471	1.74378811285886e-71	1411841	1424055	0	8192488	8205282
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8205282	9803617	609	591	0.13	0	8192488	8205282	0	9799196	9810607
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9806974	24392327	5124	4961	-0.5251	0	9799196	9810607	2.63240725297866e-16	24388943	24396262
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	24394809	24427058	16	16	0.0358	2.63240725297866e-16	24388943	24396262	9.65547187017231e-19	24423269	24433929
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	24429180	32074432	2272	2209	-0.5417	9.6554718701723e-19	24423269	24433929	2.95801771927163e-18	32074432	32074432
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.1499	2.95801771927163e-18	32074432	32074432	2.06139165282816e-17	32080848	32080848
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	43582206	3947	3804	-0.5268	2.06139165282816e-17	32080848	32080848	2.13759031377446e-62	43582206	43582206
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43589222	43589222	1	0	NA	2.13759031377446e-62	43582206	43582206	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43591380	43606935	8	7	-2.1488	NA	NA	NA	2.78460386642069e-61	43606935	43606935
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43614537	47460892	1464	1395	-0.5226	2.78460386642069e-61	43606935	43606935	4.32478042268738e-26	47460892	47460892
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.5534	4.32478042268738e-26	47460892	47460892	1.87053827379068e-22	47466921	47466921
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	47817133	150	144	-0.4867	1.87053827379068e-22	47466921	47466921	4.14447957807865e-22	47817133	47817133
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47820355	47821866	2	2	1.2699	4.14447957807865e-22	47817133	47817133	1.34198388784222e-18	47821866	47821866
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47823711	53083352	2330	2238	-0.4887	1.34198388784222e-18	47821866	47821866	3.84495272425586e-176	53078631	53088877
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53087210	53498769	177	170	0.1119	3.84495272425586e-176	53078631	53088877	3.76772719865561e-283	53492948	53501431
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53501431	113530860	17270	16712	-0.5664	3.76772719865561e-283	53492948	53501431	1.76766956156533e-26	113526746	113534177
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	113532273	113573468	21	21	0.0289	1.76766956156533e-26	113526746	113534177	1.88533640491972e-25	113570348	113578401
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	113576046	125556117	4386	4246	-0.5586	1.88533640491972e-25	113570348	113578401	2.48280468279893e-17	125551812	125556117
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	125560064	125585384	14	13	0.0605	2.48280468279893e-17	125551812	125556117	6.42153185791576e-16	125585384	125590268
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	125586858	156936555	10506	10162	-0.546	6.42153185791576e-16	125585384	125590268	0	156929364	156938177
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	156938177	157868020	381	372	0.107	0	156929364	156938177	0	157860968	157869547
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	157869547	163992903	2031	1959	-0.4833	0	157860968	157869547	2.73109352178669e-52	163992903	163992903
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-2.6133	2.73109352178669e-52	163992903	163992903	9.54917596778797e-28	164005577	164005577
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	0.6464	9.54917596778797e-28	164005577	164005577	1.20962870965007e-31	164027724	164027724
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-2.4544	1.20962870965007e-31	164027724	164027724	6.5103656333167e-263	164107951	164107951
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	168674485	1053	998	-0.498	6.5103656333167e-263	164107951	164107951	0	168670655	168676743
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	168676743	195146781	9398	9055	0.1562	0	168670655	168676743	1.76382985718929e-18	195140777	195151565
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	195148363	195197965	24	22	0.6464	1.76382985718929e-18	195140777	195151565	8.13197410145142e-16	195190231	195214391
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	195199919	199329592	1641	1581	0.1589	8.13197410145142e-16	195190231	195214391	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	92093	17	17	-0.3691	NA	NA	NA	9.85187166547878e-06	78043	107346
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	93573	418732	109	107	0.0594	9.85187166547878e-06	78043	107346	2.44173480157665e-89	413891	424006
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	422662	1589656	384	376	0.7725	2.44173480157665e-89	413891	424006	4.46094405003935e-176	1583811	1595475
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1591361	2473395	361	353	0.1124	4.46094405003935e-176	1583811	1595475	2.79983118785134e-08	2468365	2475683
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	2475683	2493519	8	7	0.8449	2.79983118785134e-08	2468365	2475683	2.25809221011897e-11	2489054	2506588
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	2506588	4680674	673	648	0.0781	2.25809221011897e-11	2489054	2506588	0	4670554	4687567
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4685066	9815760	1841	1782	-0.5273	0	4670554	4687567	1.21937031761325e-159	9815760	9815760
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	-4.7827	1.21937031761325e-159	9815760	9815760	9.76251815846114e-189	9842644	9842644
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	52380712	10875	10518	-0.5751	9.76251815846114e-189	9842644	9842644	0	48777734	52383858
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52383858	69075140	4163	4030	0.0705	0	48777734	52383858	4.36558919143143e-13	68905670	69085386
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69085386	69165814	12	11	-0.5116	4.36558919143143e-13	68905670	69085386	1.53234391347188e-14	69163312	69643272
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	75738379	1853	1787	0.0867	1.53234391347188e-14	69163312	69643272	5.5536440349463e-29	75730821	75757903
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	75743496	75743496	1	0	NA	5.5536440349463e-29	75730821	75757903	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	75753375	75916460	35	35	0.5608	NA	NA	NA	1.45744361445976e-22	75908333	75921104
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	75917649	80053108	1659	1605	0.106	1.45744361445976e-22	75908333	75921104	0	80050597	80059201
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	80056341	94510317	5105	4925	-0.562	0	80050597	80059201	6.7355125194122e-57	94508981	94513254
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94513254	94569677	27	27	0.2032	6.7355125194122e-57	94508981	94513254	1.58328180382338e-59	94566770	94572619
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94572619	107244255	4017	3895	-0.5668	1.58328180382338e-59	94566770	94572619	8.52582796873992e-11	107240549	107244255
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107255275	107275274	8	8	0.0472	8.52582796873992e-11	107240549	107244255	4.23395100285617e-35	107275274	107275274
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-2.7062	4.23395100285617e-35	107275274	107275274	3.76510601607487e-45	107281410	107281410
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	107323273	17	17	0.18	3.76510601607487e-45	107281410	107281410	9.52592285134467e-35	107323273	107324868
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107324868	149105694	11252	10863	-0.5701	9.52592285134467e-35	107323273	107324868	7.48740802011411e-94	149103660	149107185
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	149107185	149222405	55	52	0.1313	7.48740802011411e-94	149103660	149107185	3.00049209471758e-84	149221275	149229418
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	149229418	173660684	7355	7116	-0.5517	3.00049209471758e-84	149221275	149229418	7.0677706759026e-26	173660684	173660684
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.492	7.0677706759026e-26	173660684	173660684	7.29079171113889e-26	173666072	173666072
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3653	-0.5772	7.29079171113889e-26	173666072	173666072	1.38413393554182e-86	186676034	186676034
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.893	1.38413393554182e-86	186676034	186676034	1.79759968155208e-86	186680176	186680176
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1499	-0.6214	1.79759968155208e-86	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	1130006	318	307	0.1843	NA	NA	NA	1.72179894203825e-10	1107847	1143092
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1131749	1206067	29	29	0.5858	1.72179894203825e-10	1107847	1143092	3.00414093795693e-13	1192962	1224451
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1212858	6073853	1478	1427	0.1987	3.00414093795693e-13	1192962	1224451	0	6016376	6113156
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	6083756	12857302	2150	2079	0.5837	0	6016376	6113156	1.0246673238653e-105	12857302	12857302
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-3.4346	1.0246673238653e-105	12857302	12857302	2.13133462640835e-117	12873052	12873052
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	21490654	2379	2291	0.6223	2.13133462640835e-117	12873052	12873052	8.5466016151381e-19	21487474	21559709
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21493505	21606184	16	15	0.0204	8.5466016151381e-19	21487474	21559709	9.62094264891647e-22	21598643	21610433
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21610433	23675665	677	646	0.6404	9.62094264891647e-22	21598643	21610433	1.39933765995452e-209	23656978	23690225
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	23685319	24682544	242	241	1.2017	1.39933765995452e-209	23656978	23690225	2.35006004319348e-145	24673849	24727406
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	24684976	35455145	2592	2503	0.8348	2.35006004319348e-145	24673849	24727406	7.49219292655319e-80	35443337	35461510
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	35458972	35637705	33	32	1.2554	7.49219292655319e-80	35443337	35461510	2.97057621799462e-29	35627840	35653713
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	35643650	36969085	484	468	0.7329	2.97057621799462e-29	35627840	35653713	0.0165203920824909	36930413	36981637
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36970747	36985949	8	8	1.0462	0.0165203920824909	36930413	36981637	0.00536326950134877	36978653	36985949
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	36988558	36999770	6	6	1.5862	0.00536326950134877	36978653	36985949	1.08075662398116e-06	36999770	37006819
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37001734	37515693	214	209	0.945	1.08075662398116e-06	36999770	37006819	8.32981823811019e-87	37506132	37527387
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	37516166	38527514	345	336	0.479	8.32981823811019e-87	37506132	37527387	9.47119488964897e-188	38520587	38533303
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	38529616	46136065	2153	2091	0.0609	9.47119488964897e-188	38520587	38533303	0	46008694	49595677
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	46150784	58790443	2743	2661	-0.58	0	46008694	49595677	2.40041344607234e-14	58789108	58790443
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58792023	58808454	9	9	0.0786	2.40041344607234e-14	58789108	58790443	2.53634957710245e-12	58808454	58812424
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58811053	76680148	5242	5072	-0.559	2.53634957710245e-12	58808454	58812424	0	76678524	76680148
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76681910	101948862	7313	7092	0.4774	0	76678524	76680148	2.35050369001825e-141	101918820	101969238
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	101960362	102782522	260	249	0.8672	2.35050369001825e-141	101918820	101969238	7.37666918667173e-157	102752547	102816732
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	102787881	117408114	3901	3761	0.4632	7.37666918667173e-157	102752547	102816732	1.28887138061262e-45	117408114	117408114
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	117417457	117420898	2	2	-1.9314	1.28887138061262e-45	117408114	117408114	1.21686102743201e-38	117420898	117420898
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	117423638	140200229	7482	7251	0.4934	1.21686102743201e-38	117420898	117420898	4.52585049738688e-09	140196482	140203440
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.0725	4.52585049738688e-09	140196482	140203440	1.46994745580396e-09	140213216	140221835
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140425807	86	84	0.5343	1.46994745580396e-09	140213216	140221835	1.61918045826769e-15	140415985	140435408
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140427074	140533456	51	49	0.9322	1.61918045826769e-15	140415985	140435408	3.69312932842912e-09	140533456	140533456
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-0.2966	3.69312932842912e-09	140533456	140533456	1.85863492049508e-11	140538666	140541178
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	140833983	135	131	0.8884	1.85863492049508e-11	140538666	140541178	2.18920989300491e-07	140820415	140838300
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140836249	140862901	15	14	0.506	2.18920989300491e-07	140820415	140838300	0.00468405693494339	140841884	140882978
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140864027	140937303	31	31	0.8047	0.00468405693494339	140841884	140882978	1.35024268137225e-07	140920426	140961685
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140938544	144286513	1079	1044	0.5057	1.35024268137225e-07	140920426	140961685	0	144286513	144307489
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	144307489	161230469	6043	5840	-0.5572	0	144286513	144307489	0	161230469	161230469
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	161233018	167012359	1129	1094	-2.2143	0	161230469	161230469	0	167012359	167012359
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167015034	180346557	4990	4826	0.0545	0	167012359	167012359	2.7505155317015e-07	180342860	180346557
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	0.7018	2.7505155317015e-07	180342860	180346557	1.56830627631211e-06	180358977	180365950
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	111	0.0471	1.56830627631211e-06	180358977	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	326323	101	96	-0.1539	NA	NA	NA	3.79806512716974e-14	293805	347016
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	2687322	942	907	0.0762	3.79806512716974e-14	293805	347016	1.14117131355737e-49	2681759	2689431
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	2689431	2744945	28	28	0.818	1.14117131355737e-49	2681759	2689431	1.38063740189726e-54	2743435	2745679
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	2745679	26102632	7980	7753	0.0757	1.38063740189726e-54	2743435	2745679	1.49063316712783e-16	26089621	26111511
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26105935	26177484	33	31	0.4698	1.49063316712783e-16	26089621	26111511	3.36449944255044e-17	26172549	26190217
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26181838	30054565	1531	1478	0.0537	3.36449944255044e-17	26172549	26190217	2.72796073154375e-13	30052053	30054565
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30057524	30081128	8	7	0.8221	2.72796073154375e-13	30052053	30054565	4.041154408745e-10	30081128	30089884
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30085931	32548736	1053	1024	0.1047	4.041154408745e-10	30081128	30089884	2.95692597409799e-74	32548736	32558677
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	1.8582	2.95692597409799e-74	32548736	32558677	5.61833304212455e-06	32590568	32609525
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32762061	59	58	0.6617	5.61833304212455e-06	32590568	32609525	1.3196997995536e-43	32728487	32767722
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	34752558	838	809	0.0608	1.3196997995536e-43	32728487	32767722	0	34746730	34756094
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	34754666	40471613	2469	2398	-0.5457	0	34746730	34756094	3.15277003160785e-33	40471613	40471613
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40474346	40476041	2	2	-2.8724	3.15277003160785e-33	40471613	40471613	2.200843342282e-36	40476041	40476041
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40477327	54035000	4937	4783	-0.5554	2.200843342282e-36	40476041	40476041	4.08275101269233e-107	54035000	54035000
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.7882	4.08275101269233e-107	54035000	54035000	6.99091962380449e-112	54042734	54042734
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	57298746	1248	1211	-0.5509	6.99091962380449e-112	54042734	54042734	6.45717753827322e-43	57284833	57323506
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57300498	57724750	150	144	-0.8612	6.45717753827322e-43	57284833	57323506	4.84715169540854e-44	57620628	57773448
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57747241	79018959	5034	4866	-0.5653	4.84715169540854e-44	57620628	57773448	1.07903025748416e-162	79018959	79018959
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-2.4136	1.07903025748416e-162	79018959	79018959	3.23924769789557e-163	79091850	79091850
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6552	-0.5577	3.23924769789557e-163	79091850	79091850	4.79583078136874e-40	103841482	103841482
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.2241	4.79583078136874e-40	103841482	103841482	1.21863882319614e-39	103868154	103868154
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22157	-0.5457	1.21863882319614e-39	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	524935	82	76	0.0517	NA	NA	NA	6.68781799069718e-18	322848	656554
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	634336	1047707	180	175	0.4278	6.68781799069718e-18	322848	656554	2.03263747706388e-59	1028806	1053543
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	4922886	1544	1494	0.063	2.03263747706388e-59	1028806	1053543	4.41078003740563e-46	4913285	4940738
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4927241	5220374	89	87	0.5006	4.41078003740563e-46	4913285	4940738	2.27257633130258e-52	5208256	5228522
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5222099	38258332	11705	11344	0.0892	2.27257633130258e-52	5208256	5228522	1.79793905083627e-08	38227478	38281765
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38335964	38	38	0.3477	1.79793905083627e-08	38227478	38281765	1.60257985146244e-09	38320617	38372692
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	39989884	698	671	0.0733	1.60257985146244e-09	38320617	38372692	4.44211927615151e-113	39987127	39993801
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	39991761	40203986	99	99	-0.5252	4.44211927615151e-113	39987127	39993801	1.96297690271207e-113	40201131	40207840
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	40205202	64043712	5027	4849	0.0702	1.96297690271207e-113	40201131	40207840	1.16556901092303e-46	64043712	64043712
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64050963	64055092	2	2	-2.6042	1.16556901092303e-46	64043712	64043712	1.00787038348002e-51	64055092	64055092
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64056350	89682882	7632	7362	0.0888	1.00787038348002e-51	64055092	64055092	0	89672708	89689271
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89684312	92117068	935	907	0.5107	0	89672708	89689271	0	92109772	92126135
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92119478	92119478	1	0	NA	0	92109772	92126135	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92121658	115877830	9945	9653	0.0869	NA	NA	NA	1.07215796376516e-08	115864678	115892101
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	115881860	115881860	1	0	NA	1.07215796376516e-08	115864678	115892101	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	115883166	115921436	17	17	0.4846	NA	NA	NA	3.52065382765444e-08	115913167	115933845
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	115923845	120865378	2247	2169	0.1197	3.52065382765444e-08	115913167	115933845	3.71123907505061e-11	120865378	120868807
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120868807	120872125	3	3	-0.8931	3.71123907505061e-11	120865378	120868807	3.27036944161988e-10	120870445	120872125
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120874365	125829681	2192	2125	0.0695	3.27036944161988e-10	120870445	120872125	5.57822799852804e-146	125829681	125829681
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125831554	125831554	1	0	NA	5.57822799852804e-146	125829681	125829681	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.4637	NA	NA	NA	3.23575006832364e-127	125837524	125837524
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	128247025	1120	1080	0.0792	3.23575006832364e-127	125837524	125837524	3.81969600021786e-12	128237613	128254482
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	128249372	128276857	17	17	0.549	3.81969600021786e-12	128237613	128254482	1.89521596299557e-12	128269203	128284406
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	128279579	134297301	2935	2829	0.0886	1.89521596299557e-12	128269203	128284406	1.05127824407277e-11	134287701	134308998
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134298640	134333384	16	15	0.565	1.05127824407277e-11	134287701	134308998	4.81904727672793e-10	134324544	134347805
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134338052	141409512	3273	3174	0.1079	4.81904727672793e-10	134324544	134347805	0	141409512	141409512
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141410894	1	0	NA	0	141409512	141409512	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-3.8021	NA	NA	NA	9.4975005022313e-286	141440184	141440184
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141689547	115	113	0.116	9.4975005022313e-286	141440184	141440184	7.62187169500035e-18	141687978	141689547
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	7.62187169500035e-18	141687978	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.9586	NA	NA	NA	2.61700670965721e-14	141712786	141720324
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142156165	168	160	0.2358	2.61700670965721e-14	141712786	141720324	5.27401873138304e-41	142156165	142159173
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142167908	5	5	-1.7124	5.27401873138304e-41	142156165	142159173	5.93056119525687e-54	142166710	142167908
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	147702365	2339	2270	0.0704	5.93056119525687e-54	142166710	142167908	3.29248270546082e-14	147702365	147702365
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147710037	4	4	-0.9543	3.29248270546082e-14	147702365	147702365	1.19942892255361e-12	147710037	147710037
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147711471	156483966	3179	3079	0.0846	1.19942892255361e-12	147710037	147710037	2.15478444168568e-18	156483966	156483966
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	2	1.8435	2.15478444168568e-18	156483966	156483966	2.38771117285513e-16	156490484	156490484
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1024	0.0656	2.38771117285513e-16	156490484	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0285	NA	NA	NA	1.37008679239151e-17	581533	581533
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.5888	1.37008679239151e-17	581533	581533	1.42040563663631e-15	588865	588865
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2195811	605	586	0.0287	1.42040563663631e-15	588865	588865	1.06095293382573e-05	2165688	2195811
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2201180	2229727	9	9	-0.4409	1.06095293382573e-05	2165688	2195811	1.01199381521316e-05	2229727	2245838
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2231804	2514408	75	74	-0.0041	1.01199381521316e-05	2229727	2245838	7.1921588026129e-12	2507568	2514408
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2518673	2542532	7	7	0.7384	7.1921588026129e-12	2507568	2514408	8.16104110376406e-12	2542532	2549456
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2546679	6926661	1574	1521	0.0226	8.16104110376406e-12	2542532	2549456	1.76091665478419e-07	6905670	7260442
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	-0.4595	1.76091665478419e-07	6905670	7260442	2.15567701477915e-09	7709141	8139999
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	10891422	1138	1100	0.0964	2.15567701477915e-09	7709141	8139999	0	10890017	10895936
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10894147	25120552	4620	4465	-0.5697	0	10890017	10895936	2.54009125274182e-19	25120552	25120552
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	-2.0448	2.54009125274182e-19	25120552	25120552	3.63704112219308e-20	25125700	25125700
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25463846	163	155	-0.568	3.63704112219308e-20	25125700	25125700	8.13034459938686e-40	25463846	25467611
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25470598	3	3	-2.8097	8.13034459938686e-40	25463846	25467611	3.47594781894343e-48	25469017	25470598
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25472648	26452734	436	425	-0.5943	3.47594781894343e-48	25469017	25470598	0.0059949176645002	26440021	26473263
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26457474	26476802	6	6	-0.9986	0.0059949176645002	26440021	26473263	2.03260238183556e-24	26473263	26476802
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26479851	32797545	2423	2329	0.094	2.03260238183556e-24	26473263	26476802	6.06079844519847e-08	32797545	32797545
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	6.06079844519847e-08	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-0.9911	NA	NA	NA	1.04070058642593e-19	32808049	32808049
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1825	0.0648	1.04070058642593e-19	32808049	32808049	7.35536467035552e-157	39345557	39352361
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.954	7.35536467035552e-157	39345557	39352361	1.83156420008191e-163	39504332	39508035
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	78187436	10451	10103	0.0769	1.83156420008191e-163	39504332	39508035	2.13075601469867e-262	78148373	78206456
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	78192590	80831629	480	470	0.4735	2.13075601469867e-262	78148373	78206456	2.22669223851744e-24	80818052	80842053
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	80831995	81013798	70	68	0.7969	2.22669223851744e-24	80818052	80842053	4.26955318383541e-17	80990863	81033147
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	81016055	83493595	793	772	0.522	4.26955318383541e-17	80990863	81033147	1.21023133132629e-164	83404703	83561176
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	83498834	99014668	4526	4381	0.7913	1.21023133132629e-164	83404703	83561176	0	99006236	99025282
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	99018258	110313703	4109	3970	1.1872	0	99006236	99025282	1.20955887076032e-148	110312165	110315886
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	110315886	110458559	57	53	2.0172	1.20955887076032e-148	110312165	110315886	5.46743614989887e-106	110451369	110459951
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	110459951	122120604	3321	3210	1.2412	5.46743614989887e-106	110451369	110459951	3.38862702070368e-118	122120604	122120604
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122126258	122131217	2	2	-2.9459	3.38862702070368e-118	122120604	122120604	6.83541746256756e-120	122131217	122131217
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122138819	141247229	5742	5543	1.353	6.83541746256756e-120	122131217	122131217	3.21992190257385e-16	141235115	141262649
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141250478	141333969	38	38	1.7109	3.21992190257385e-16	141235115	141262649	2.21811578725044e-24	141327281	141341873
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141335277	141711484	166	159	1.2356	2.21811578725044e-24	141327281	141341873	3.53818784318614e-16	141700922	141716471
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141713215	141759181	21	21	1.7387	3.53818784318614e-16	141700922	141716471	3.18066162240415e-14	141757945	141768322
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141761373	146264846	1657	1598	1.121	3.18066162240415e-14	141757945	141768322	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	8985593	3211	3115	0.0894	NA	NA	NA	0	8983425	8989932
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	8987000	15802255	2247	2186	-0.5623	0	8983425	8989932	6.76574056831406e-13	15802255	15802255
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	0.8027	6.76574056831406e-13	15802255	15802255	1.23649769476836e-12	15807123	15807123
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2460	-0.5669	1.23649769476836e-12	15807123	15807123	8.62169514131282e-07	23338535	23353267
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.2619	8.62169514131282e-07	23338535	23353267	1.53003977000563e-07	23357805	23377660
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	33032341	2509	2421	-0.59	1.53003977000563e-07	23357805	23377660	1.04904129284309e-276	33030263	33036145
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33036145	33369952	157	152	0.1334	1.04904129284309e-276	33030263	33036145	0.0988044416996264	33285520	33369952
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33374723	33378506	2	2	-0.3852	0.0988044416996264	33285520	33369952	0	33378506	33378506
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33385106	33385109	2	2	-1.0154	0	33378506	33378506	4.87286377131628e-06	33385109	33394349
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33394349	34185046	251	242	0.1674	4.87286377131628e-06	33385109	33394349	0	34180213	34190356
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34190356	74953342	3874	3752	-0.5453	0	34180213	34190356	0	74950778	74954547
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	74954547	100348045	8195	7921	0.0845	0	74950778	74954547	1.49193954237101e-33	100348045	100348045
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.1417	1.49193954237101e-33	100348045	100348045	1.15131954887876e-33	100350814	100350814
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	111537589	3593	3494	0.0824	1.15131954887876e-33	100350814	100350814	0	111536121	111541985
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	111539751	123520906	4427	4294	-0.5648	0	111536121	111541985	0	123518980	123524958
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	123523107	137352394	5824	5625	0.0846	0	123518980	123524958	3.02808662934051e-38	137352394	137352394
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.646	3.02808662934051e-38	137352394	137352394	2.65638482234183e-30	137356880	137356880
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1064	0.0457	2.65638482234183e-30	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	6692190	2449	2387	0.4904	NA	NA	NA	5.43560792367824e-09	6692190	6692190
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	6696409	6702434	2	2	-0.7016	5.43560792367824e-09	6692190	6692190	3.82655897106386e-09	6702434	6702434
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	6705454	16610923	3476	3346	0.5021	3.82655897106386e-09	6702434	6702434	0	16604435	16616164
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	16613503	19445445	915	890	1.0028	0	16604435	16616164	2.81593157950064e-236	19432105	19473414
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	19456627	20477780	390	378	0.4909	2.81593157950064e-236	19432105	19473414	1.71959894387502e-228	20472311	20484039
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	20480001	64430502	12160	11762	0.0733	1.71959894387502e-228	20472311	20484039	0	64421708	64441654
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	64435332	65622308	411	401	-0.5566	0	64421708	64441654	0	65618540	65630054
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	65624105	65624105	1	0	NA	0	65618540	65630054	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	65630054	74443947	3263	3126	0.105	NA	NA	NA	0	74435007	74463179
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	74447636	77917893	1525	1486	0.5089	0	74435007	74463179	7.90037802443226e-73	77917893	77917893
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.711	7.90037802443226e-73	77917893	77917893	8.07428605974771e-64	77928669	77928669
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	87899773	2872	2778	0.4881	8.07428605974771e-64	77928669	77928669	0	87899773	87899773
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	87901358	117632757	10938	10557	-0.5523	0	87899773	87899773	5.53630103014926e-193	117632757	117632757
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	117634312	117687130	26	24	-2.102	5.53630103014926e-193	117632757	117632757	5.18724679258645e-187	117687130	117687130
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	117688989	119148763	620	597	-0.593	5.18724679258645e-187	117687130	117687130	6.39431363821141e-09	119148763	119148763
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	119152411	119155484	2	2	0.5353	6.39431363821141e-09	119148763	119148763	1.91992490582328e-15	119155484	119158873
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	119158873	135285645	5756	5537	-0.5731	1.91992490582328e-15	119155484	119158873	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	187649	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	190215	2630829	961	933	0.0327	NA	NA	NA	0	2589790	2638046
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2633143	7896236	2105	2043	-0.5665	0	2589790	2638046	1.02564108867480e-08	7896236	7896236
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7898137	7902048	2	2	0.6362	1.0256410886748e-08	7896236	7896236	2.29702923718848e-08	7902048	7903411
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7903411	12262371	1814	1756	-0.5508	2.29702923718848e-08	7902048	7903411	0	12259982	12264981
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	12264981	14255839	730	705	0.1081	0	12259982	12264981	3.53660788393199e-19	14245964	14260444
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	14258894	14316961	30	29	0.5784	3.53660788393199e-19	14245964	14260444	3.42868102157961e-22	14310941	14324502
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	14318800	18659994	1658	1612	0.0944	3.42868102157961e-22	14310941	14324502	6.48993391555951e-85	18653685	18672595
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18671267	18896166	71	66	-0.5354	6.48993391555951e-85	18653685	18672595	2.17966322147805e-09	18892456	18906505
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-1.229	2.17966322147805e-09	18892456	18906505	3.46341861917451e-08	18915465	18932031
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	25027452	1958	1889	-0.586	3.46341861917451e-08	18915465	18932031	0	25025708	25028748
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25028748	49663240	7381	7138	0.1065	0	25025708	25028748	4.85432557788140e-15	49659817	49671267
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49666382	49701463	9	9	-0.6015	4.8543255778814e-15	49659817	49671267	1.51367342698020e-08	49694659	49725462
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49710027	55123719	180	178	-0.0097	1.5136734269802e-08	49694659	49725462	2.98677361399314e-26	55097806	55127355
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	36	0.5247	2.98677361399314e-26	55097806	55127355	8.96716664090789e-25	55205278	55221692
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	57889798	1084	1053	0.0828	8.96716664090789e-25	55205278	55221692	0	57887013	57893837
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57892391	65310933	3037	2938	-0.5269	0	57887013	57893837	1.09007136951025e-191	65308699	65313161
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65312531	65713752	182	176	0.0796	1.09007136951025e-191	65308699	65313161	3.1533956894856e-26	65690532	65740545
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65716096	65991739	117	112	0.4979	3.1533956894856e-26	65690532	65740545	8.74388726647733e-40	65968242	66003527
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65993188	67642663	580	560	0.0823	8.74388726647733e-40	65968242	66003527	4.60363312925842e-12	67642663	67644597
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	67644597	67650521	4	3	1.3521	4.60363312925842e-12	67642663	67644597	1.85287400907839e-15	67648583	67650521
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	67651754	95916633	9818	9482	0.0889	1.85287400907839e-15	67648583	67650521	1.65694506165861e-18	95896516	95946296
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	95925455	96044466	27	27	0.5476	1.65694506165861e-18	95896516	95946296	7.30158233664715e-23	96038612	96058479
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	96051237	99027331	646	633	0.0784	7.30158233664715e-23	96038612	96058479	7.5205629228869e-09	99004343	99035340
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99030209	99074552	21	21	0.4139	7.5205629228869e-09	99004343	99035340	4.00105328072327e-06	99054841	99090359
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	99393929	151	148	0.0965	4.00105328072327e-06	99054841	99090359	1.39744492860353e-159	99392690	99403911
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99403911	100264775	260	255	-0.5868	1.39744492860353e-159	99392690	99403911	0	100262668	100267908
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	100267908	102020044	636	618	0.1086	0	100262668	100267908	0	102016126	102023398
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	102023398	134450318	11797	11396	-0.5666	0	102016126	102023398	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9531133	3744	3616	-0.5719	NA	NA	NA	1.38209004126743e-28	9531133	9531133
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9543817	9554149	3	3	-2.29	1.38209004126743e-28	9531133	9531133	6.35146964352548e-88	9554149	9554149
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	11	0.6323	6.35146964352548e-88	9554149	9554149	1.8552812934659e-58	9610054	9610054
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	554	-0.569	1.8552812934659e-58	9610054	9610054	8.6683598112219e-30	11112600	11116883
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	0.5045	8.6683598112219e-30	11112600	11116883	1.61643721596721e-23	11140421	11143592
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	13049134	789	765	-0.5403	1.61643721596721e-23	11140421	11143592	0	13049134	13049134
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	13050590	29962908	5763	5595	1.5143	0	13049134	13049134	0	29954008	29972073
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29972073	31651726	467	451	0.713	0	29954008	29972073	0.00883230301930086	31600708	31653850
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31653850	31656408	3	3	1.2188	0.00883230301930086	31600708	31653850	4.03821671147397e-12	31656408	31664178
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31664178	31890222	88	86	0.0763	4.03821671147397e-12	31656408	31664178	1.7647351444343e-09	31866123	31890222
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31899792	31949481	8	8	0.6994	1.7647351444343e-09	31866123	31890222	1.52448198948521e-10	31949481	31961505
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31954769	46008305	3687	3552	0.0917	1.52448198948521e-10	31949481	31961505	0	46006582	46020629
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46015519	68283327	8235	7946	-0.5391	0	46006582	46020629	4.30245610289095e-18	68278101	68284949
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	68284949	68303703	11	11	0.1681	4.30245610289095e-18	68278101	68284949	4.08631469812297e-20	68301742	68307206
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	68307206	100624427	10048	9739	-0.5613	4.08631469812297e-20	68301742	68307206	2.11206449947600e-28	100624427	100624427
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100628460	2	2	-2.5828	2.112064499476e-28	100624427	100624427	6.94796212739092e-29	100628460	100628460
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100629832	102373744	575	559	-0.5663	6.94796212739092e-29	100628460	100628460	1.01267105751437e-79	102373744	102373744
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	102375698	102392817	8	8	-2.2499	1.01267105751437e-79	102373744	102373744	3.45087915941426e-73	102392817	102392817
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	102394759	132289090	11141	10775	-0.543	3.45087915941426e-73	102392817	102392817	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18843779	184	178	-0.5816	NA	NA	NA	5.83107709429751e-06	18840134	18848524
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18846451	18857237	5	5	-1.1713	5.83107709429751e-06	18840134	18848524	1.04059302687340e-05	18854263	18861890
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18860433	24572535	1980	1924	-0.5632	1.0405930268734e-05	18854263	18861890	6.46885839898006e-23	24572535	24572535
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24574731	24576634	2	2	-2.4315	6.46885839898006e-23	24572535	24572535	1.65431173706714e-22	24576634	24576634
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24579207	26033662	660	639	-0.6089	1.65431173706714e-22	24576634	24576634	0	26031554	26036916
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	26035308	26035308	1	0	NA	0	26031554	26036916	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	26036916	36969571	4207	4081	0.0747	NA	NA	NA	2.43535502797887e-166	36969571	36969571
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-4.7983	2.43535502797887e-166	36969571	36969571	2.40769188550377e-177	36982877	36982877
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	89659397	15252	14721	0.0825	2.40769188550377e-177	36982877	36982877	1.58322648816804e-14	89659397	89659397
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.5148	1.58322648816804e-14	89659397	89659397	1.47950481115118e-14	89662326	89662326
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	112695067	8749	8468	0.092	1.47950481115118e-14	89662326	89662326	0	112692068	112700472
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	112696802	114123340	600	575	-0.5106	0	112692068	112700472	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19273289	10	8	0.1918	NA	NA	NA	0.000138318019870108	18798641	19323579
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19287128	19494416	50	50	0.6835	0.000138318019870108	18798641	19323579	2.01605921673538e-48	19489920	19538610
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21577976	1015	991	0.1434	2.01605921673538e-48	19489920	19538610	8.60264835550185e-52	21553669	21592140
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21579483	22047168	235	228	0.4228	8.60264835550185e-52	21553669	21592140	9.4610278764155e-43	22040315	22062453
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	22869218	379	364	0.1176	9.4610278764155e-43	22040315	22062453	7.5958395756839e-273	22865321	22874003
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22873969	23770263	377	366	-0.5446	7.5958395756839e-273	22865321	22874003	4.91966587049296e-07	23767888	23770263
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	23771500	23776677	4	4	0.161	4.91966587049296e-07	23767888	23770263	2.20523928585939e-07	23776677	23779930
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	23778822	31187358	2202	2119	-0.5565	2.20523928585939e-07	23776677	23779930	1.58072154197816e-08	31186809	31187358
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	31189082	31191639	3	3	0.2978	1.58072154197816e-08	31186809	31187358	6.59407702524614e-07	31191639	31196070
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	31196070	32235235	414	397	-0.5442	6.59407702524614e-07	31191639	31196070	0	32231088	32236747
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32236747	34674458	1061	1029	0.1	0	32231088	32236747	2.75577978945145e-12	34666996	34674458
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1423	2.75577978945145e-12	34666996	34674458	6.86182027730832e-11	34683810	34685308
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	38940081	1613	1565	0.0982	6.86182027730832e-11	34683810	34685308	4.17890271684446e-16	38927324	38954532
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	38941414	39083643	37	37	0.4618	4.17890271684446e-16	38927324	38954532	2.10997049063834e-14	39029938	39121230
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	39089028	40680589	246	241	0.0876	2.10997049063834e-14	39029938	39121230	3.95252516672997e-322	40680589	40680589
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40726930	7	7	-4.2722	3.95252516672997e-322	40680589	40680589	0	40726930	40726930
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	54805608	4132	3972	0.0945	0	40726930	40726930	1.46805243265447e-11	54799749	54805608
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54807146	54827899	11	11	0.6474	1.46805243265447e-11	54799749	54805608	2.67580965007205e-12	54827899	54834007
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54829138	57978465	1150	1106	0.0944	2.67580965007205e-12	54827899	54834007	1.13557346493621e-10	57976309	57978465
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	57979489	57987201	7	7	-0.5521	1.13557346493621e-10	57976309	57978465	2.22558660410626e-10	57987201	57989873
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	57988829	57988829	1	0	NA	2.22558660410626e-10	57987201	57989873	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	57989873	61751739	1540	1484	0.0965	NA	NA	NA	0	61722527	61775194
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	61761630	61761630	1	0	NA	0	61722527	61775194	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	61770555	66540810	1844	1784	-0.5312	NA	NA	NA	8.7182321839578e-290	66538100	66542160
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	66542160	66872608	196	190	0.1641	8.7182321839578e-290	66538100	66542160	9.97182541332756e-252	66871582	66876853
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	66874823	69086125	1090	1056	-0.5163	9.97182541332756e-252	66871582	66876853	1.58608869396864e-56	69086125	69086125
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-2.9359	1.58608869396864e-56	69086125	69086125	2.22514125187334e-60	69092211	69092211
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	72519034	1519	1473	-0.5558	2.22514125187334e-60	69092211	69092211	0	72516704	72521504
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72521504	75916575	1604	1550	0.133	0	72516704	72521504	9.28024940691908e-256	75909366	75922894
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75918082	77431311	719	683	0.5466	9.28024940691908e-256	75909366	75922894	8.7681312211164e-130	77424450	77436960
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	77433266	78025761	244	238	1.0471	8.7681312211164e-130	77424450	77436960	5.96756172176128e-248	78021946	78028641
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78027619	86051898	2368	2287	0.4922	5.96756172176128e-248	78021946	78028641	0	86026089	86080904
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	86059096	105850033	7617	7361	0.0854	0	86026089	86080904	5.37785802563329e-09	105846004	105856972
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-0.5767	5.37785802563329e-09	105846004	105856972	2.6676175131101e-08	105875924	105898108
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106218059	124	118	0.1069	2.6676175131101e-08	105875924	105898108	1.27012044625318e-10	106209063	106223137
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106219784	1	0	NA	1.27012044625318e-10	106209063	106223137	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106221696	106253648	15	14	-0.4514	NA	NA	NA	1.62459030384442e-09	106249962	106256498
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.0964	1.62459030384442e-09	106249962	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2016	NA	NA	NA	9.7483574899216e-15	18452491	18692865
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	146	-0.7774	9.7483574899216e-15	18452491	18692865	0	20079935	20308014
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	50467340	11094	10712	0.0749	0	20079935	20308014	3.78901592630939e-161	50460386	50471574
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50468994	51044495	277	269	0.5003	3.78901592630939e-161	50460386	50471574	4.9466401060251e-170	51039723	51052404
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	51046592	59192653	3354	3257	0.0701	4.9466401060251e-170	51039723	51052404	5.24421277825828e-10	59184935	59192653
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59194045	59215896	15	13	0.5323	5.24421277825828e-10	59184935	59192653	5.18195916466992e-10	59215896	59221540
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59217840	62193449	1236	1204	0.0599	5.18195916466992e-10	59215896	59221540	0	62191807	62195876
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62194466	66010033	1907	1840	-0.5542	0	62191807	62195876	0	66002812	66017174
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	66013151	73838771	3317	3211	0.0849	0	66002812	66017174	8.17017312716705e-08	73819708	73880421
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73838850	73910498	15	15	0.5104	8.17017312716705e-08	73819708	73880421	5.59120011517171e-08	73902323	73923996
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73911948	74669752	340	331	0.0911	5.59120011517171e-08	73902323	73923996	1.55126287220648e-18	74664249	74669752
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.2952	1.55126287220648e-18	74664249	74669752	1.77724722793871e-15	74680439	74696127
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	162	0.1443	1.77724722793871e-15	74680439	74696127	5.54889338287262e-40	75115806	75115806
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	2.7482	5.54889338287262e-40	75115806	75115806	8.18348340236418e-43	75119713	75119713
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	76529287	546	529	0.1068	8.18348340236418e-43	75119713	75119713	0	76525653	76534992
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	76532734	78090195	617	595	-0.5561	0	76525653	76534992	3.16517756203223e-48	78085475	78105926
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78102398	78198210	46	45	0.0764	3.16517756203223e-48	78085475	78105926	1.06730153987184e-06	78191725	78198210
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78199888	78214991	7	7	0.5737	1.06730153987184e-06	78191725	78198210	6.76402912852438e-06	78214991	78222540
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78216771	78855195	272	263	0.0661	6.76402912852438e-06	78214991	78222540	3.67870033920629e-18	78855195	78855195
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	1.7031	3.67870033920629e-18	78855195	78855195	5.45682804037455e-18	78858227	78858227
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	79367127	274	266	0.0949	5.45682804037455e-18	78858227	78858227	0	79365032	79371203
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	79369999	93231627	5047	4873	-0.5588	0	79365032	79371203	0	93214053	93236051
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	93236051	96527255	966	934	0.0455	0	93214053	93236051	0	96517082	96538425
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	96529972	99632987	1384	1331	0.479	0	96517082	96538425	2.01291856953445e-40	99632987	99632987
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.9485	2.01291856953445e-40	99632987	99632987	3.68402025517881e-37	99635701	99635701
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100282819	270	263	0.462	3.68402025517881e-37	99635701	99635701	0.215750432057086	100083485	100282819
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100287000	100298352	2	2	-0.0329	0.215750432057086	100083485	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33628	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	37560	1997948	783	758	-0.5282	NA	NA	NA	1.88015259740615e-06	1995829	1997948
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1999192	2000527	2	2	0.6614	1.88015259740615e-06	1995829	1997948	1.50882526313439e-09	2000527	2005613
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2005613	14678535	4679	4534	-0.5416	1.50882526313439e-09	2000527	2005613	1.00276720768037e-08	14674185	14678535
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14683004	14687636	2	2	0.5098	1.00276720768037e-08	14674185	14678535	7.09489942020878e-14	14687636	14687636
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15029941	15	15	-0.5437	7.09489942020878e-14	14687636	14687636	2.79630899414855e-19	15029941	15037844
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	21258019	1773	1711	0.0941	2.79630899414855e-19	15029941	15037844	7.64787958026432e-11	21244385	21382540
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21493483	9	9	-0.5291	7.64787958026432e-11	21244385	21382540	1.66590021633547e-12	21492912	21504151
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21501073	22338034	284	277	0.1354	1.66590021633547e-12	21492912	21504151	2.22854145256429e-10	22324719	22561536
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22609825	10	10	-0.4554	2.22854145256429e-10	22324719	22561536	4.15755645656207e-06	22584012	22661197
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22617217	22617217	1	0	NA	4.15755645656207e-06	22584012	22661197	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	22918787	95	89	0.0583	NA	NA	NA	9.56956189210333e-41	22883976	22945896
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22930537	23367479	180	175	0.5343	9.56956189210333e-41	22883976	22945896	1.75551623001789e-97	23358766	23383066
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23369185	29574009	1898	1854	0.0758	1.75551623001789e-97	23358766	23383066	2.48022927868132e-46	29238804	29588359
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	29578273	29959973	120	118	0.4592	2.48022927868132e-46	29238804	29588359	5.97999464935246e-25	29934062	29986758
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	29961347	31862577	720	696	0.1403	5.97999464935246e-25	29934062	29986758	8.278531105032e-16	31835555	32515876
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33647856	47	45	-0.2512	8.278531105032e-16	31835555	32515876	0.00531820559349395	33519338	33868686
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	34059589	9	9	-0.5773	0.00531820559349395	33519338	33868686	2.20646226778747e-12	34056516	34061926
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34061029	34350707	86	86	0.0118	2.20646226778747e-12	34056516	34061926	5.17946650049971e-11	34329518	34414833
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34357366	34552260	35	33	0.3623	5.17946650049971e-11	34329518	34414833	6.95181293284876e-09	34522753	34617260
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34556917	47954066	1021	992	0.0856	6.95181293284876e-09	34522753	34617260	0	47951707	47957325
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	47957325	52300718	1361	1304	-0.5717	0	47951707	47957325	3.11757051967290e-07	52295854	52300718
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	52302943	52310335	4	4	0.1616	3.1175705196729e-07	52295854	52300718	3.45102967528758e-16	52310335	52313082
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	52311777	68177736	4959	4780	-0.5558	3.45102967528758e-16	52310335	52313082	7.71459231127224e-35	68174487	68179093
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68179093	68216231	23	23	0.1295	7.71459231127224e-35	68174487	68179093	1.12321838652887e-22	68213787	68222014
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68217814	69401319	447	439	-0.4653	1.12321838652887e-22	68213787	68222014	4.85261675982047e-82	69393513	69406035
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69402880	69758635	161	155	0.0202	4.85261675982047e-82	69393513	69406035	1.71797366456486e-112	69753919	69763173
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69761372	70654490	389	383	-0.5389	1.71797366456486e-112	69753919	69763173	1.28724574188739e-76	70647078	70665447
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70664807	70899124	77	75	0.0731	1.28724574188739e-76	70647078	70665447	2.47606354859879e-94	70885614	70906513
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70906513	72017300	339	323	-0.5757	2.47606354859879e-94	70885614	70906513	0	72012231	72023508
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72023508	73921010	615	595	0.0891	0	72012231	72023508	0	73917744	73924957
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73922165	76925748	991	954	-0.5728	0	73917744	73924957	1.41723249229566e-25	76925748	76925748
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	6	-1.7617	1.41723249229566e-25	76925748	76925748	3.4119674983897e-27	76940218	76940218
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	81752862	1749	1688	-0.5863	3.4119674983897e-27	76940218	76940218	1.12415939267300e-129	81752862	81752862
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	81755529	81765327	6	6	-3.1324	1.124159392673e-129	81752862	81752862	2.83660902503665e-124	81765327	81765327
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	81768830	84758629	1297	1241	-0.5345	2.83660902503665e-124	81765327	81765327	2.38365040204245e-07	84747636	84758629
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	84761751	84780814	7	7	0.0669	2.38365040204245e-07	84747636	84758629	9.20215111285401e-07	84780814	84790238
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	84783244	88690571	1454	1413	-0.5557	9.20215111285401e-07	84780814	84790238	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	401	0.0967	NA	NA	NA	7.84689664226648e-23	1028979	1028979
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.122	7.84689664226648e-23	1028979	1028979	3.14429930512545e-23	1030766	1030766
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	7522884	2841	2758	0.095	3.14429930512545e-23	1030766	1030766	0	7518927	7530102
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	7524182	10664714	1424	1381	-0.5382	0	7518927	7530102	6.96805249946018e-13	10659920	10675267
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10666972	10692437	15	14	0.0157	6.96805249946018e-13	10659920	10675267	9.14299637330457e-28	10683410	10695815
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10694423	26552349	5260	5068	-0.5619	9.14299637330457e-28	10683410	10695815	1.36840921446467e-32	26550777	26555856
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26554007	26568339	8	8	0.2665	1.36840921446467e-32	26550777	26555856	6.90370612416502e-18	26564122	26570251
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26570251	31461588	2071	2005	-0.5595	6.90370612416502e-18	26564122	26570251	5.5116892222315e-09	31439551	31471890
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	17	-0.9665	5.5116892222315e-09	31439551	31471890	8.79279707792357e-10	31486540	31893451
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32850723	377	362	-0.5664	8.79279707792357e-10	31486540	31893451	1.47895995747916e-11	32850723	32850723
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-1.7926	1.47895995747916e-11	32850723	32850723	1.35362586552313e-09	32854956	32854956
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	32857473	1	0	NA	1.35362586552313e-09	32854956	32854956	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32859443	36673853	1436	1392	-0.5337	NA	NA	NA	1.80255814695153e-152	36673853	36673853
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.6348	1.80255814695153e-152	36673853	36673853	8.15670233517052e-152	36683509	36683509
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41564408	2032	1966	-0.5178	8.15670233517052e-152	36683509	36683509	2.27396204573228e-35	41561017	41568539
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41624013	28	28	-1.1616	2.27396204573228e-35	41561017	41568539	2.440363867124e-26	41617077	41627814
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	43101904	362	348	-0.5608	2.440363867124e-26	41617077	41627814	2.15696611281260e-238	43099302	43105157
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43103776	43765501	375	364	0.113	2.1569661128126e-238	43099302	43105157	5.94189775748148e-221	43758884	43767586
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43767586	44222913	255	241	0.8386	5.94189775748148e-221	43758884	43767586	0	44221640	44225137
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	44225137	52023538	2363	2282	0.0932	0	44221640	44225137	1.72088931785956e-11	52015660	52029462
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52026725	52047301	10	10	0.6857	1.72088931785956e-11	52015660	52029462	6.48170216741696e-13	52042743	52053998
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52049625	52440878	134	128	0.099	6.48170216741696e-13	52042743	52053998	9.57616611628628e-88	52440878	52440878
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-2.6008	9.57616611628628e-88	52440878	52440878	6.00758114506799e-70	52447064	52447064
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	71907136	7440	7205	0.1041	6.00758114506799e-70	52447064	52447064	7.49561850555161e-47	71887680	71925086
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	71910003	72294735	204	197	0.3824	7.49561850555161e-47	71887680	71925086	1.80863392982938e-43	72294735	72294735
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72297674	72299153	2	2	-2.4953	1.80863392982938e-43	72294735	72294735	1.11692607224951e-46	72299153	72299153
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72303321	72878466	228	221	0.4196	1.11692607224951e-46	72299153	72299153	1.30041474528536e-29	72842733	72908090
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72879536	78653545	2322	2250	0.6827	1.30041474528536e-29	72842733	72908090	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	6400620	2172	2102	0.0773	NA	NA	NA	6.37974261269252e-29	6391562	6409080
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	6403336	6617742	58	56	0.4565	6.37974261269252e-29	6391562	6409080	1.53516233460008e-31	6606726	6649923
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	6623014	12471289	2048	1980	0.0601	1.53516233460008e-31	6606726	6649923	1.45184704690712e-25	12461136	12475935
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	12473741	12576269	43	41	0.4774	1.45184704690712e-25	12461136	12475935	1.30545731655246e-21	12571478	12592471
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	12578366	25641682	3393	3281	0.0883	1.30545731655246e-21	12571478	12592471	0	25632795	25673902
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	25657020	53183490	8519	8251	-0.5789	0	25632795	25673902	8.79232175675356e-20	53183490	53183490
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53184691	53185983	2	2	-2.28	8.79232175675356e-20	53183490	53183490	1.67785473424866e-19	53185983	53185983
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53187359	76106692	6725	6505	-0.5941	1.67785473424866e-19	53185983	53185983	2.11740741004279e-23	76106692	76106692
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76110964	76116026	3	3	-2.0981	2.11740741004279e-23	76106692	76106692	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	471	-0.5402	NA	NA	NA	9.43509900481687e-19	1398325	1398325
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5397	9.43509900481687e-19	1398325	1398325	2.29925738299994e-22	1400840	1400840
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	8299177	3218	3105	-0.5256	2.29925738299994e-22	1400840	1400840	2.06109173100359e-64	8299177	8309272
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8302738	8331140	13	11	-2.0238	2.06109173100359e-64	8299177	8309272	3.11323142267272e-73	8319541	8331140
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8332738	12108685	1698	1634	-0.5101	3.11323142267272e-73	8319541	8331140	0	12103867	12116829
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12110431	14372631	979	955	0.0802	0	12103867	12116829	6.3362673273658e-28	14344966	14392318
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14374470	14528264	94	92	0.4487	6.3362673273658e-28	14344966	14392318	5.11981541744264e-33	14513289	14544174
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14530944	43125963	7328	7103	0.0802	5.11981541744264e-33	14513289	14544174	1.37843818369220e-79	43121480	43131720
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43128907	43128907	1	0	NA	1.3784381836922e-79	43121480	43131720	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43130011	43292834	82	82	-0.5198	NA	NA	NA	2.22854933788623e-71	43288887	43297144
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43295767	59421197	7149	6906	0.0536	2.22854933788623e-71	43288887	43297144	3.70537500957874e-15	59414898	59424729
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59422642	59434202	9	8	-0.8033	3.70537500957874e-15	59414898	59424729	2.15971342828561e-14	59433190	59440262
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1922	0.0254	2.15971342828561e-14	59433190	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	566	0.0706	NA	NA	NA	3.19670971102245e-142	1499421	1515948
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1531162	10	9	-2.5408	3.19670971102245e-142	1499421	1515948	3.46542304671189e-200	1525300	1531162
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	8639995	2548	2476	0.1	3.46542304671189e-200	1525300	1531162	5.8046411076229e-205	8630618	8644809
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8642567	9474486	375	359	0.5317	5.8046411076229e-205	8630618	8644809	2.29801308738579e-244	9471155	9481168
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	9477651	15494786	2038	1975	0.0712	2.29801308738579e-244	9471155	9481168	3.84560770480262e-28	15487284	15502549
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15497452	15578444	41	39	0.5173	3.84560770480262e-28	15487284	15502549	4.26780377091908e-27	15571596	15583650
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15580513	26148764	3439	3324	0.0601	4.26780377091908e-27	15571596	15583650	6.57390109798605e-11	26145205	26148764
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26150897	26161111	8	8	-0.5864	6.57390109798605e-11	26145205	26148764	0.176843854335539	26156944	28250082
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	28266113	8	8	-0.34	0.176843854335539	26156944	28250082	0.000118586633562348	26173123	29313069
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	29657275	147	140	0.1178	0.000118586633562348	26173123	29313069	1.08014270289698e-10	29643026	29661282
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29658704	29707265	22	20	0.564	1.08014270289698e-10	29643026	29661282	8.2901624639105e-13	29695578	29722924
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29709312	49532810	7738	7506	0.0981	8.2901624639105e-13	29695578	29722924	1.89749156851586e-08	49522905	49536861
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	49534956	49564242	17	16	0.5266	1.89749156851586e-08	49522905	49536861	4.71248728311973e-11	49560841	49572963
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	49566893	52322559	960	934	0.0818	4.71248728311973e-11	49560841	49572963	1.0893044671426e-18	52312872	52332568
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52332568	52390406	10	10	-0.6423	1.0893044671426e-18	52312872	52332568	1.24190535445466e-14	52382226	52397083
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52397083	60557051	2826	2728	0.0547	1.24190535445466e-14	52382226	52397083	1.24743312719472e-06	60553440	60557051
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60559058	60561656	3	3	-0.8173	1.24743312719472e-06	60553440	60557051	1.11966436061841e-05	60561656	60562422
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60562422	60951827	139	133	0.1071	1.11966436061841e-05	60561656	60562422	1.53935038449416e-05	60941138	60955750
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60953455	60980897	11	11	0.5891	1.53935038449416e-05	60941138	60955750	2.2008783325171e-07	60978131	60989105
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60982373	61799614	365	351	0.0278	2.2008783325171e-07	60978131	60989105	4.96369526209354e-86	61790832	61804818
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	61800375	62151982	183	176	-0.5296	4.96369526209354e-86	61790832	61804818	2.87465402822478e-05	62141985	62156028
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62153980	62168226	8	6	0.0647	2.87465402822478e-05	62141985	62156028	4.07038861194631e-05	62165879	62168226
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62174093	62176540	4	4	-0.6354	4.07038861194631e-05	62165879	62168226	7.08841229717407e-06	62176540	62183838
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62180751	62419534	94	87	0.0451	7.08841229717407e-06	62176540	62183838	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	13882260	56	54	0.0181	NA	NA	NA	0.000948053649481424	13869389	13889359
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	13992109	6	6	-0.5915	0.000948053649481424	13869389	13889359	4.33235107053371e-11	13956118	14088878
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	33525823	6811	6609	0.0803	4.33235107053371e-11	13956118	14088878	1.73512126024056e-11	33501509	33526841
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	33526841	33557650	17	17	0.4876	1.73512126024056e-11	33501509	33526841	2.37046424928840e-08	33550374	33570775
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	33558698	34314834	410	401	0.1071	2.3704642492884e-08	33550374	33570775	0	34312688	34320055
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	34317027	36789648	1244	1211	-0.5869	0	34312688	34320055	6.74487676213929e-15	36789648	36789648
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	0.9244	6.74487676213929e-15	36789648	36789648	1.23142053185064e-14	36791668	36791668
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	40587777	1888	1824	-0.5824	1.23142053185064e-14	36791668	36791668	3.83813592176962e-09	40581405	40587777
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40589815	40608768	12	12	-0.0915	3.83813592176962e-09	40581405	40587777	2.71407191368653e-07	40607531	40618104
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40610100	46922972	2994	2897	-0.5536	2.71407191368653e-07	40607531	40618104	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16902188	663	646	-0.5281	NA	NA	NA	1.27531951181360e-09	16899557	16905458
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16905458	16913254	6	6	0.2463	1.2753195118136e-09	16899557	16905458	6.97062760813378e-10	16911555	16921346
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16918879	22667608	2314	2245	-0.5273	6.97062760813378e-10	16911555	16921346	6.23739969217638e-26	22667608	22667608
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22679305	2	2	-2.6625	6.23739969217638e-26	22667608	22667608	5.96137444667558e-15	22679305	22679305
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22682428	22682428	1	0	NA	5.96137444667558e-15	22679305	22679305	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22686690	22696162	4	4	-0.8476	NA	NA	NA	1.02776537147195e-10	22696162	22701123
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22725305	15	14	-2.3294	1.02776537147195e-10	22696162	22701123	2.88778093425905e-140	22725305	22725305
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	27319790	2534	2429	-0.5515	2.88778093425905e-140	22725305	22725305	1.01362758231685e-12	27318799	27319790
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27321356	27333514	8	7	0.2177	1.01362758231685e-12	27318799	27319790	2.95726426180881e-07	27333514	27342945
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27341996	27387298	24	23	-0.4243	2.95726426180881e-07	27333514	27342945	1.04410972167750e-25	27387298	27387298
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27388887	27388887	1	0	NA	1.0441097216775e-25	27387298	27387298	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27395328	27396032	2	2	1.5405	NA	NA	NA	1.94299786382816e-27	27396032	27396032
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27400339	33857917	3131	3041	-0.5316	1.94299786382816e-27	27396032	27396032	6.21361864397976e-27	33855842	33857917
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	33861494	33891614	16	16	0.1976	6.21361864397976e-27	33855842	33857917	6.37858196107645e-24	33891614	33900475
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	33896241	45982956	6288	6087	-0.5074	6.37858196107645e-24	33891614	33900475	3.78838249024113e-11	45982956	45982956
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45985025	45986561	2	2	-1.8859	3.78838249024113e-11	45982956	45982956	3.79909955271224e-10	45986561	45986561
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45988943	48445579	1042	1012	-0.5605	3.79909955271224e-10	45986561	45986561	4.5364377234045e-09	48443348	48446915
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48446915	48455492	5	5	0.2371	4.5364377234045e-09	48443348	48446915	3.29808943887028e-07	48451678	48465109
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48458933	48458933	1	0	NA	3.29808943887028e-07	48451678	48465109	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48459461	49571068	498	477	-0.5123	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	-0.6588	NA	NA	NA	1.74605667794764e-09	94062	94062
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-2.3068	1.74605667794764e-09	94062	94062	3.36259857960496e-30	104732	104732
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	266212	114	110	-0.6828	3.36259857960496e-30	104732	104732	1.13238974334044e-09	266212	266212
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.9742	1.13238974334044e-09	266212	266212	1.65082591907426e-11	267079	267079
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1521019	719	690	-0.6052	1.65082591907426e-11	267079	267079	3.53038768647541e-07	1518376	1526804
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1522369	1530474	10	9	-1.2035	3.53038768647541e-07	1518376	1526804	1.70445225688344e-06	1528282	1535069
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2374031	620	599	-0.6069	1.70445225688344e-06	1528282	1535069	1.54527662820497e-05	2344220	2391968
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2374133	2422454	58	57	-0.8343	1.54527662820497e-05	2344220	2391968	1.86512525061602e-08	2412897	2435310
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2423726	2672401	230	226	-0.5655	1.86512525061602e-08	2412897	2435310	3.76984203653798e-08	2667362	2686565
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.9233	3.76984203653798e-08	2667362	2686565	2.10760340466857e-168	2708291	2708291
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	38274002	13347	12872	0.4657	2.10760340466857e-168	2708291	2708291	3.74416152157445e-17	38264605	38277288
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	38276233	38317504	21	18	1.0194	3.74416152157445e-17	38264605	38277288	1.86150854813580e-17	38314647	38322370
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	38320413	152784082	31146	30099	0.452	1.8615085481358e-17	38314647	38322370	4.07012724945549e-22	152780136	152786172
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152785084	152823858	19	19	1.0701	4.07012724945549e-22	152780136	152786172	0.0273186792542242	152815265	152837176
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152826786	152841248	8	8	0.6393	0.0273186792542242	152815265	152837176	0.0136782240409665	152830970	152847991
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152842375	152875849	17	17	0.1428	0.0136782240409665	152830970	152847991	0.000296580791145075	152863999	152893547
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152877753	154582414	576	560	0.4676	0.000296580791145075	152863999	152893547	1.22129836614837e-32	154578922	154582414
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154635143	12	12	-0.5605	1.22129836614837e-32	154578922	154582414	0.000128061290071719	154629854	154635143
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154635172	154639094	5	5	-0.0895	0.000128061290071719	154629854	154635143	0.000233171316617618	154639094	154642611
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154641040	154888224	184	171	-0.5971	0.000233171316617618	154639094	154642611	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3223585	122	118	-3.6377	NA	NA	NA	1.41352157443705e-23	3034907	3772482
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.41352157443705e-23	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9653	NA	NA	NA	6.31563128318892e-12	5422507	6688691
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7165588	189	179	-3.3824	6.31563128318892e-12	5422507	6688691	0.000539781550469679	7034323	7205930
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7169915	7248437	33	33	-2.3257	0.000539781550469679	7034323	7205930	0.000121329458423823	7240385	7249762
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7249762	7259689	7	7	-4.6979	0.000121329458423823	7240385	7249762	0.000276993978970982	7258171	7277048
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7461576	67	64	-2.5109	0.000276993978970982	7258171	7277048	7.08861220140133e-08	7368837	7592063
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7722458	81	81	-3.6092	7.08861220140133e-08	7368837	7592063	1.25728330274144e-05	7686527	7774773
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7997485	78	77	-2.6724	1.25728330274144e-05	7686527	7774773	8.28140186219953e-07	7905286	8110976
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	10513747	370	357	-3.4062	8.28140186219953e-07	7905286	8110976	1.07710613751890e-16	10511255	10515697
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.9568	1.0771061375189e-16	10511255	10515697	0.000127924104141565	10631941	12532441
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13109337	200	191	-2.5898	0.000127924104141565	10631941	12532441	0.0176301229916827	13012038	13112411
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13111594	13129843	8	8	-1.1497	0.0176301229916827	13012038	13112411	1.63103594930362e-10	13128515	13137597
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14354682	413	400	-3.5741	1.63103594930362e-10	13128515	13137597	2.01803429215449e-12	14312365	14390028
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14356069	14694578	135	131	-2.789	2.01803429215449e-12	14312365	14390028	5.3508906881637e-10	14561228	14737877
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	15523178	310	297	-3.5652	5.3508906881637e-10	14561228	14737877	5.89339192540457e-05	15517551	15524675
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15531144	5	5	-1.2283	5.89339192540457e-05	15517551	15524675	0.000140939522433764	15528826	15538983
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15532597	15573579	24	24	-3.1341	0.000140939522433764	15528826	15538983	0.00587352213759777	15554463	15573579
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573648	15583573	4	4	-1.583	0.00587352213759777	15554463	15573579	6.40522621863918e-05	15583573	15590299
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	54	-3.7106	6.40522621863918e-05	15583573	15590299	0.00238312643128955	15826121	16033774
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16184484	110	104	-2.9834	0.00238312643128955	15826121	16033774	7.420051098629e-06	16085263	16330184
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16186896	22930737	1092	1054	-3.5631	7.420051098629e-06	16085263	16330184	4.81847932138667e-79	22923722	26871442
MSK_252152915688_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	86	-1.3158	4.81847932138667e-79	22923722	26871442	NA	NA	NA
