Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	17465290	5944	5745	0.0146	NA	NA	NA	2.15562549261641e-17	17461424	17467469
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17467469	17489662	12	12	0.5525	2.15562549261641e-17	17461424	17467469	2.52668223370912e-21	17489541	17497643
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17494392	72525842	21932	21283	0.0099	2.52668223370912e-21	17489541	17497643	3.75416388292653e-19	72520196	72539143
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72579311	20	20	0.3579	3.75416388292653e-19	72520196	72539143	1.43577219657380e-14	72550574	72602597
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110033018	11704	11397	-0.0012	1.4357721965738e-14	72550574	72602597	5.84424334968987e-13	110033018	110033018
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	0.8745	5.84424334968987e-13	110033018	110033018	1.82730955312542e-12	110041712	110058441
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	143659690	3912	3790	-0.0031	1.82730955312542e-12	110041712	110058441	1.31011004726457e-48	143656552	143697723
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	143793179	48	45	-0.4441	1.31011004726457e-48	143656552	143697723	4.10912711081495e-21	143791143	143800457
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143793256	144003068	31	29	-0.0282	4.10912711081495e-21	143791143	143800457	6.06680810382748e-52	143994475	144093719
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	144353701	127	123	0.591	6.06680810382748e-52	143994475	144093719	1.00829696281162e-205	144350349	144356381
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144356381	147306304	438	426	-0.0035	1.00829696281162e-205	144350349	144356381	5.85278062029648e-86	147203277	147308557
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	35	0.6823	5.85278062029648e-86	147203277	147308557	2.66347842995284e-82	147508217	147644831
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	157133150	4030	3899	0.0224	2.66347842995284e-82	147508217	147644831	1.22084807572375e-20	157133150	157133150
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.3694	1.22084807572375e-20	157133150	157133150	1.78788090674398e-20	157136342	157136342
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167493768	4109	4003	-0.0104	1.78788090674398e-20	157136342	157136342	8.87904503354196e-09	167481271	167493768
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167495719	167507882	6	6	-0.5316	8.87904503354196e-09	167481271	167493768	3.76488775248592e-09	167507882	167520743
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167507898	185979586	7210	7004	-0.0054	3.76488775248592e-09	167507882	167520743	3.51887453741952e-16	185979586	185979586
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.1887	3.51887453741952e-16	185979586	185979586	3.12318252237514e-16	185988138	185988138
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200596027	4135	4016	0.0054	3.12318252237514e-16	185988138	185988138	5.3224444709127e-14	200572541	200618814
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200803726	43	43	-0.234	5.3224444709127e-14	200572541	200618814	1.58866720348710e-12	200683992	200818194
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	246751473	17276	16770	-9e-04	1.5886672034871e-12	200683992	200818194	4.17031843024223e-22	246702361	246769018
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246862029	31	31	0.3265	4.17031843024223e-22	246702361	246769018	4.76429192625855e-15	246853406	246878405
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	95	3e-04	4.76429192625855e-15	246853406	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10547	-0.0055	NA	NA	NA	6.47452217108564e-11	33076512	33076512
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.0088	6.47452217108564e-11	33076512	33076512	5.86185331576122e-13	33080437	33080437
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	623	-1e-04	5.86185331576122e-13	33080437	33080437	0	34543992	34543992
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	12	-5.2453	0	34543992	34543992	1.36458381368421e-06	34575366	34580533
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34589997	4	4	-2.7339	1.36458381368421e-06	34575366	34580533	2.28841967541734e-168	34589997	34589997
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6977	-0.0012	2.28841967541734e-168	34589997	34589997	5.58231739514348e-17	52588009	52600588
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.7864	5.58231739514348e-17	52588009	52600588	1.95134401185015e-17	52635695	52635695
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	57251850	1554	1528	0.0011	1.95134401185015e-17	52635695	52635695	7.19478177198454e-25	57251850	57251850
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57263450	57300299	5	5	0.936	7.19478177198454e-25	57251850	57251850	4.9119789277541e-25	57300299	57300299
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57307517	179767214	35986	34896	-0.0045	4.9119789277541e-25	57300299	57300299	9.87767364268457e-11	179764819	179767214
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.8119	9.87767364268457e-11	179764819	179767214	8.36776408111448e-11	179778919	179791128
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242689978	21542	20939	-0.0029	8.36776408111448e-11	179778919	179791128	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10472	-0.0129	NA	NA	NA	2.96382677669834e-39	32074432	32074432
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.8056	2.96382677669834e-39	32074432	32074432	2.48869983855645e-37	32080848	32080848
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1822	0.0044	2.48869983855645e-37	32080848	32080848	1.65963775244061e-22	37951628	37953375
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.8067	1.65963775244061e-22	37951628	37953375	1.32398097863414e-20	37961110	37963014
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3417	-0.0057	1.32398097863414e-20	37961110	37963014	2.09659484819072e-12	47460892	47460892
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.0795	2.09659484819072e-12	47460892	47460892	7.67550075208079e-29	47466921	47466921
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	89747986	14522	14109	-0.0048	7.67550075208079e-29	47466921	47466921	1.71497977430910e-27	89747986	89747986
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89754033	89757490	2	2	-0.9139	1.7149797743091e-27	89747986	89747986	1.14859969658362e-09	89757490	89757490
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89768924	99891210	1439	1403	-0.0025	1.14859969658362e-09	89757490	89757490	4.00699773689124e-50	99891210	99891210
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.1582	4.00699773689124e-50	99891210	99891210	3.10500361298302e-52	99897201	99897201
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11171	-0.0093	3.10500361298302e-52	99897201	99897201	1.64065881349341e-28	133189686	133189686
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.5764	1.64065881349341e-28	133189686	133189686	5.91690163106395e-28	133194685	133194685
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	5.91690163106395e-28	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	150443815	5400	5254	-0.0076	NA	NA	NA	1.08550961595583e-10	150443815	150443815
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150446135	150448380	2	2	-1.0043	1.08550961595583e-10	150443815	150443815	3.20750884083978e-11	150448380	150448380
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150453399	163992903	4374	4265	-0.003	3.20750884083978e-11	150448380	150448380	2.06701084268979e-37	163987457	164001657
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	26	-0.503	2.06701084268979e-37	163987457	164001657	7.1959789018035e-39	164101776	164115417
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	177369007	4366	4230	-0.0039	7.1959789018035e-39	164101776	164115417	3.82893381356748e-09	177354856	177369007
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	177375389	177375389	1	0	NA	3.82893381356748e-09	177354856	177369007	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	177384842	177393195	2	2	-0.8939	NA	NA	NA	1.32269709498081e-11	177393195	177401961
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	177401961	178068018	119	115	0.0101	1.32269709498081e-11	177393195	177401961	1.24754057608176e-19	178068018	178068018
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178084948	178088799	2	2	-1.1809	1.24754057608176e-19	178068018	178068018	6.0788502044394e-16	178088799	178088799
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178098258	194354505	5640	5490	0.0024	6.0788502044394e-16	178088799	178088799	0	194354505	194354505
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194358882	1	0	NA	0	194354505	194354505	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	-5.4401	NA	NA	NA	0	194366950	194366950
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1912	0.0096	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3284	0.0106	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.6862	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5997	-0.0147	0	9842644	9842644	3.74056532534006e-17	34439897	34445002
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.7206	3.74056532534006e-17	34439897	34445002	1.79813713161203e-17	34491115	34506297
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8591	-0.001	1.79813713161203e-17	34491115	34506297	7.67861830702019e-33	68901210	69069651
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69163312	13	13	-0.6659	7.67861830702019e-33	68901210	69069651	3.81385673162247e-33	69153675	69643272
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69165814	69165814	1	0	NA	3.81385673162247e-33	69153675	69643272	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173224400	31193	30333	-0.0045	NA	NA	NA	1.65756036084871e-10	173224400	173224400
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	0.9747	1.65756036084871e-10	173224400	173224400	4.77158050716958e-12	173228860	173228860
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	189	0.0145	4.77158050716958e-12	173228860	173228860	1.69028848050490e-21	173660684	173660684
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.2849	1.6902884805049e-21	173660684	173660684	5.87034751268577e-20	173666072	173666072
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3986	-0.0057	5.87034751268577e-20	173666072	173666072	1.44332266480720e-50	187330240	187330240
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.0779	1.4433226648072e-50	187330240	187330240	2.10225824598307e-45	187333619	187333619
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190425991	1050	1013	-0.0035	2.10225824598307e-45	187333619	187333619	2.80494162568343e-06	190421503	190425991
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190431567	190437365	3	3	-0.6099	2.80494162568343e-06	190421503	190425991	4.47126100433167e-07	190437365	190439544
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190439544	190772330	90	88	-0.0463	4.47126100433167e-07	190437365	190439544	5.210094801015e-10	190749363	190805051
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190924564	54	53	-0.2567	5.210094801015e-10	190749363	190805051	3.59557267721342e-06	190910126	190979524
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191153613	44	42	-0.0129	3.59557267721342e-06	190910126	190979524	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	525008	140	135	-0.0389	NA	NA	NA	1.15726950009798e-06	515610	552354
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	528214	567230	18	17	0.2471	1.15726950009798e-06	515610	552354	8.3839933975715e-08	550674	571442
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	568526	829954	70	64	-0.0818	8.3839933975715e-08	550674	571442	1.61056016515131e-13	829954	829954
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-1.0256	1.61056016515131e-13	829954	829954	1.04406360038898e-11	873365	873365
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3647	-0.0096	1.04406360038898e-11	873365	873365	1.30971797140415e-11	12857302	12857302
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.0023	1.30971797140415e-11	12857302	12857302	5.18219376653695e-12	12873052	12873052
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	68864742	15072	14619	-0.0104	5.18219376653695e-12	12873052	12873052	8.6139430179118e-09	68862665	68864742
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68885350	70405656	4	3	-0.7262	8.6139430179118e-09	68862665	68864742	7.99746378303394e-09	70405656	70693444
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70693444	140200229	21025	20393	-0.0036	7.99746378303394e-09	70405656	70693444	2.88056514642625e-41	140200229	140200229
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.8865	2.88056514642625e-41	140200229	140200229	7.19166608151111e-43	140216524	140216524
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140532277	136	135	0.0482	7.19166608151111e-43	140216524	140216524	2.96414502297653e-13	140532277	140532277
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140533456	140533456	1	0	NA	2.96414502297653e-13	140532277	140532277	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.0174	NA	NA	NA	7.50296654127278e-11	140538666	140538666
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180632269	13539	13177	-0.004	7.50296654127278e-11	140538666	140538666	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	51	-0.0434	NA	NA	NA	1.82117917556604e-31	236535	244363
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	44	-0.4848	1.82117917556604e-31	236535	244363	3.09777402544095e-60	322557	329100
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	26811016	9265	9032	-0.0033	3.09777402544095e-60	322557	329100	5.98903003468738e-21	26811016	26811016
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.9535	5.98903003468738e-21	26811016	26811016	7.61081370295667e-19	26861184	26861184
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32548736	2306	2237	0.0216	7.61081370295667e-19	26861184	26861184	3.1349205621261e-113	32548736	32558677
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	1.6888	3.1349205621261e-113	32548736	32558677	3.47876878169804e-10	32593151	32605300
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	38	0.3509	3.47876878169804e-10	32593151	32605300	9.61822519765906e-05	32700719	32718991
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.2673	9.61822519765906e-05	32700719	32718991	5.70753231794361e-73	32728285	32728487
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	79018959	14694	14249	-4e-04	5.70753231794361e-73	32728285	32728487	6.50391969657947e-13	79011979	79024557
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79079988	11	11	-0.4662	6.50391969657947e-13	79011979	79024557	1.14069237878978e-13	79074911	79091850
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79085247	103841482	6764	6570	-0.0034	1.14069237878978e-13	79074911	79091850	3.89313381829614e-24	103841482	103841482
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0056	3.89313381829614e-24	103841482	103841482	8.64342587628173e-24	103868154	103868154
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10183	-0.0059	8.64342587628173e-24	103868154	103868154	1.3761933867822e-13	134627341	134629897
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134639397	5	5	-0.6974	1.3761933867822e-13	134627341	134629897	2.47939683200181e-13	134639397	134641054
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134641054	155159371	7139	6948	-0.0028	2.47939683200181e-13	134639397	134641054	1.76819639052891e-08	155157679	155159371
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155160734	155163895	3	3	-0.7271	1.76819639052891e-08	155157679	155159371	2.0764088392996e-08	155163895	155165959
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155165959	165643653	3479	3372	-0.0142	2.0764088392996e-08	155163895	155165959	2.58291093036435e-33	165643653	165643653
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1862	2.58291093036435e-33	165643653	165643653	1.43966379661646e-31	165650610	165650610
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1753	-0.021	1.43966379661646e-31	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	12	0.5237	NA	NA	NA	1.3663005601563e-14	160641	178408
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	1038517	248	241	0.0085	1.3663005601563e-14	160641	178408	3.5731594071684e-18	1038517	1038517
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.4065	3.5731594071684e-18	1038517	1038517	4.75176547448336e-20	1047707	1047707
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	7466980	2318	2258	0.0399	4.75176547448336e-20	1047707	1047707	4.20373079730313e-213	7466980	7480834
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	7480834	7562295	40	38	-0.9765	4.20373079730313e-213	7466980	7480834	1.61781096985577e-205	7560314	7562295
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	7569103	71200243	18927	18382	-0.0042	1.61781096985577e-205	7560314	7562295	1.24912696731075e-15	71191256	71205381
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71203792	71219030	11	11	0.3558	1.24912696731075e-15	71191256	71205381	9.0290179527427e-06	71214313	71235560
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71221375	75186980	928	898	0.0448	9.0290179527427e-06	71214313	71235560	5.01972779835917e-12	75180849	75188956
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75188956	75207560	8	8	0.5628	5.01972779835917e-12	75180849	75188956	3.72180889984947e-16	75205238	75212042
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75210882	100166257	8569	8334	0	3.72180889984947e-16	75205238	75212042	1.58999859153453e-13	100164752	100166257
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-0.8056	1.58999859153453e-13	100164752	100166257	7.80334258916283e-17	100174991	100178968
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	125829681	11371	11032	-0.0042	7.80334258916283e-17	100174991	100178968	3.15947929908839e-41	125829681	125829681
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125831554	125831554	1	0	NA	3.15947929908839e-41	125829681	125829681	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.5622	NA	NA	NA	1.41342914705370e-39	125837524	125837524
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3550	-0.0013	1.4134291470537e-39	125837524	125837524	1.55012653427891e-22	133432281	133433384
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7258	1.55012653427891e-22	133432281	133433384	5.56821290933913e-24	133448277	133453811
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3602	0.0069	5.56821290933913e-24	133448277	133453811	7.70827836974124e-13	141408013	141419692
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.4413	7.70827836974124e-13	141408013	141419692	4.62803976795749e-11	141432778	141443577
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141689547	116	115	0.0064	4.62803976795749e-11	141432778	141443577	9.99876558353285e-180	141689547	141689547
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	9.99876558353285e-180	141689547	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-4.1398	NA	NA	NA	1.03017046516362e-254	141714168	141714168
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142152205	167	163	0.0877	1.03017046516362e-254	141714168	141714168	7.47517267437521e-06	142135117	142156165
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142176074	7	7	0.4568	7.47517267437521e-06	142135117	142156165	1.85156292925031e-07	142176074	142188727
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187073	147702365	2338	2276	-0.0073	1.85156292925031e-07	142176074	142188727	4.76905693041757e-17	147702365	147702365
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.3012	4.76905693041757e-17	147702365	147702365	2.96405080843601e-16	147707161	147707161
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4110	-0.009	2.96405080843601e-16	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	-0.021	NA	NA	NA	4.6282967512795e-180	581533	581533
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.8745	4.6282967512795e-180	581533	581533	6.23489669536848e-265	588865	588865
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7818	-0.0048	6.23489669536848e-265	588865	588865	5.11522475283547e-48	25120552	25120552
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.6993	5.11522475283547e-48	25120552	25120552	1.29567346207675e-50	25125700	25125700
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4775	0.0033	1.29567346207675e-50	25125700	25125700	0	39350798	39350798
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	-4.4179	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	137748793	28581	27782	-0.0055	0	39505256	39505256	0	137748793	137748793
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	32	-5.9521	0	137748793	137748793	0	137922591	137922591
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	146264846	2820	2731	-0.0022	0	137922591	137922591	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2135333	760	740	-0.009	NA	NA	NA	1.07375741300620e-17	2135333	2135333
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.2169	1.0737574130062e-17	2135333	2135333	3.87386450024035e-17	2139868	2139868
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	15802255	4696	4559	-0.0061	3.87386450024035e-17	2139868	2139868	7.23141465661542e-16	15802255	15802255
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15813356	3	3	0.947	7.23141465661542e-16	15802255	15802255	1.68304300765851e-15	15813356	15813356
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	70926188	7611	7369	-0.0049	1.68304300765851e-15	15813356	15813356	4.03603296453328e-35	70926188	70926188
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7284	4.03603296453328e-35	70926188	70926188	7.93138262019575e-36	70930528	70930528
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	7.93138262019575e-36	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	86960197	5359	5202	-0.0063	NA	NA	NA	2.17672678785439e-14	86960197	86960197
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	1.1077	2.17672678785439e-14	86960197	86960197	1.06629716913454e-13	86965458	86965458
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	89545309	817	791	-0.0129	1.06629716913454e-13	86965458	86965458	1.10976134398754e-10	89534520	89550122
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89545626	89578197	15	15	0.3545	1.10976134398754e-10	89534520	89550122	4.41926816663119e-10	89566824	89586827
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89580250	100348045	3725	3630	-0.0062	4.41926816663119e-10	89566824	89586827	2.14514267264035e-41	100348045	100348045
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.9832	2.14514267264035e-41	100348045	100348045	2.45932599595699e-44	100350814	100350814
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5383	-0.0061	2.45932599595699e-44	100350814	100350814	4.99854985431005e-10	116124007	116124007
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-0.9604	4.99854985431005e-10	116124007	116124007	4.7622241551115e-09	116130333	116130333
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8048	-6e-04	4.7622241551115e-09	116130333	116130333	8.62939298156873e-40	137352394	137352394
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.9562	8.62939298156873e-40	137352394	137352394	3.49308391933558e-34	137356880	137356880
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1067	0.0085	3.49308391933558e-34	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	26388466	9482	9214	-1e-04	NA	NA	NA	4.34264476626652e-11	26388466	26388466
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26389651	26389651	1	0	NA	4.34264476626652e-11	26388466	26388466	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26390878	26392771	2	2	-0.9992	NA	NA	NA	4.78677310070855e-11	26392771	26392771
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26395501	27038538	244	240	3e-04	4.78677310070855e-11	26392771	26392771	3.62438228451273e-279	27038538	27038538
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.9706	3.62438228451273e-279	27038538	27038538	5.16593467804321e-281	27041812	27041812
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	76977706	14409	14010	-0.0014	5.16593467804321e-281	27041812	27041812	1.78871402651818e-13	76976973	76977706
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76978679	76980809	2	2	-0.7016	1.78871402651818e-13	76976973	76977706	7.63770904493591e-05	76980809	76980984
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76980984	77917893	450	436	-0.0446	7.63770904493591e-05	76980809	76980984	6.13234185487837e-172	77917893	77917893
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.8603	6.13234185487837e-172	77917893	77917893	8.75065389949412e-166	77928669	77928669
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	132797428	19278	18771	-0.0073	8.75065389949412e-166	77928669	77928669	3.22037492689782e-10	132797428	132797428
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.9836	3.22037492689782e-10	132797428	132797428	1.42733441499966e-08	132801463	132801463
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	911	-0.02	1.42733441499966e-08	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1722	-0.0048	NA	NA	NA	2.75010627355585e-09	4920907	4923300
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-0.7368	2.75010627355585e-09	4920907	4923300	7.90672310398831e-09	4932214	4934594
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	343	0.0081	7.90672310398831e-09	4932214	4934594	1.19819655795841e-29	5738494	5741031
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.692	1.19819655795841e-29	5738494	5741031	2.19912579788578e-40	5765438	5766615
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	9549069	1640	1578	0.0028	2.19912579788578e-40	5765438	5766615	4.42260701284348e-13	9546754	9550890
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9550890	9561765	6	5	-0.6902	4.42260701284348e-13	9546754	9550890	2.84806067505306e-12	9559924	9563353
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9563353	18896166	3573	3461	-0.0112	2.84806067505306e-12	9559924	9563353	1.40330091290947e-13	18892456	18896166
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.6614	1.40330091290947e-13	18892456	18896166	2.51793326768161e-14	18917191	18929375
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9248	-0.0031	2.51793326768161e-14	18917191	18929375	4.34190392932890e-49	55112618	55123719
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.4737	4.3419039293289e-49	55112618	55123719	1.00683364869833e-50	55209626	55221692
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4508	0.0174	1.00683364869833e-50	55209626	55221692	1.36368396480326e-11	66463477	66463477
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0719	1.36368396480326e-11	66463477	66463477	2.98981674652198e-12	66469412	66469412
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	66473397	1	0	NA	2.98981674652198e-12	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66474757	88009355	7714	7487	-0.0018	NA	NA	NA	8.29446006135774e-21	88009355	88009355
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88011932	88019525	4	4	-0.9807	8.29446006135774e-21	88009355	88009355	1.70521148794464e-21	88019525	88019525
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88021645	99037126	3141	3063	-0.0147	1.70521148794464e-21	88019525	88019525	4.66216768490152e-08	99025912	99044509
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99038263	99074552	16	16	0.2876	4.66216768490152e-08	99025912	99044509	3.05048635763374e-07	99060172	99086242
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	134450318	12844	12446	-0.0071	3.05048635763374e-07	99060172	99086242	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	292	0.0098	NA	NA	NA	2.14042112922206e-18	736988	736988
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.9261	2.14042112922206e-18	736988	736988	1.38886415960212e-17	743223	743223
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	2109441	620	611	0.0058	1.38886415960212e-17	743223	743223	1.95246911789493e-15	2106791	2109441
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.6545	1.95246911789493e-15	2106791	2109441	4.52202198145003e-15	2127537	2128807
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2739	0.0045	4.52202198145003e-15	2127537	2128807	3.25313297685488e-109	9523923	9528590
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	14	1.2639	3.25313297685488e-109	9523923	9528590	2.37619542174268e-110	9607363	9610054
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	555	-0.014	2.37619542174268e-110	9607363	9610054	0	11116883	11116883
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.7571	0	11116883	11116883	0	11130871	11130871
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	31169263	6821	6623	-0.0037	0	11130871	11130871	7.67142126754073e-24	31132762	31173065
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31171313	31237505	16	16	0.5139	7.67142126754073e-24	31132762	31173065	3.76290806755374e-22	31231952	31245432
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	52858632	6913	6710	0.0117	3.76290806755374e-22	31231952	31245432	1.530082543123e-11	52857015	52858632
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52861748	52864788	3	2	-0.7995	1.530082543123e-11	52857015	52858632	1.01104890948847e-06	52864788	52866047
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52866047	98316278	14391	14001	-4e-04	1.01104890948847e-06	52864788	52866047	8.28705105719893e-09	98314473	98318378
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98329755	5	5	-0.5715	8.28705105719893e-09	98314473	98318378	1.4691440930938e-08	98327582	98330875
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98330875	132289090	12677	12295	0.0075	1.4691440930938e-08	98327582	98330875	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	26814953	3145	3075	-0.0059	NA	NA	NA	1.80520001124933e-11	26812224	26814953
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	26816000	26829384	7	7	0.562	1.80520001124933e-11	26812224	26814953	1.19096518948883e-12	26829384	26835563
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	26832328	36717348	3856	3704	-0.0056	1.19096518948883e-12	26829384	26835563	3.73203630297025e-11	36717348	36717348
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36719486	36729002	2	2	-1.0052	3.73203630297025e-11	36717348	36717348	3.22398019222261e-12	36729002	36729002
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36734427	36969571	29	29	0.042	3.22398019222261e-12	36729002	36729002	4.01379568155049e-10	36969571	36969571
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-2.5144	4.01379568155049e-10	36969571	36969571	1.24799218703657e-49	36982877	36982877
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	287	0.0185	1.24799218703657e-49	36982877	36982877	3.33540269453756e-63	37953582	37953582
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.1375	3.33540269453756e-63	37953582	37953582	1.05909132565632e-53	37957844	37957844
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4735	-0.0011	1.05909132565632e-53	37957844	37957844	6.76901302782592e-22	49964838	49964838
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.3828	6.76901302782592e-22	49964838	49964838	1.13545305589759e-21	49971732	49971732
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	68142120	4513	4386	-0.0054	1.13545305589759e-21	49971732	49971732	7.17983920225006e-08	68132217	68144264
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68161714	9	9	0.393	7.17983920225006e-08	68132217	68144264	8.68444877448893e-08	68160625	68168882
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68163523	100690991	10337	10051	-0.0027	8.68444877448893e-08	68160625	68168882	0	100690991	100690991
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-6.1678	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4435	-0.0176	0	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5588	0.0145	NA	NA	NA	1.29453931289945e-21	34674458	34674458
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1815	1.29453931289945e-21	34674458	34674458	3.53843810432122e-24	34683810	34683810
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	69086125	11875	11547	9e-04	3.53843810432122e-24	34683810	34683810	1.70119048156192e-10	69086125	69086125
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69088190	1	0	NA	1.70119048156192e-10	69086125	69086125	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69090571	69092211	2	2	-0.9706	NA	NA	NA	4.58202804358451e-10	69092211	69092211
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1738	-0.0038	4.58202804358451e-10	69092211	69092211	9.75600850145938e-45	73071404	73071404
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	9.75600850145938e-45	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.1627	NA	NA	NA	4.9294171137876e-43	73092112	73092112
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11854	-2e-04	4.9294171137876e-43	73092112	73092112	4.34963534771088e-16	105594189	105602602
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.5095	4.34963534771088e-16	105594189	105602602	9.63257671447399e-14	105632168	105681007
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	45	-0.109	9.63257671447399e-14	105632168	105681007	6.47287734345998e-27	105848335	105850033
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.9927	6.47287734345998e-27	105848335	105850033	9.59746187957402e-25	105881893	105897061
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106218059	124	120	-0.0249	9.59746187957402e-25	105881893	105897061	5.85861013840186e-08	106209063	106221696
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106255190	17	17	-0.4217	5.85861013840186e-08	106209063	106221696	1.06188731277094e-09	106252126	106260962
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	35	0.019	1.06188731277094e-09	106252126	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	4	0.0037	NA	NA	NA	0.0144641312638312	18427151	19206779
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	93	-0.2862	0.0144641312638312	18427151	19206779	5.90431029394604e-28	19427350	19805960
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20308014	58	57	-0.6704	5.90431029394604e-28	19427350	19805960	1.03703893865987e-132	20088256	20310916
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32456500	3670	3567	-0.0079	1.03703893865987e-132	20088256	20310916	1.54611959338771e-68	32454294	32514939
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	24	-0.7424	1.54611959338771e-68	32454294	32514939	2.83657888357049e-29	32583146	32594200
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	2.83657888357049e-29	32583146	32594200	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	32714483	18	18	0.0529	NA	NA	NA	8.27648294518087e-36	32714483	32714483
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32721469	32762005	8	8	-1.0757	8.27648294518087e-36	32714483	32714483	8.54792478580946e-51	32762005	32762005
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32772265	74115754	17586	17086	0.0032	8.54792478580946e-51	32762005	32762005	2.20440635380166e-18	74115754	74115754
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74127210	74133391	4	4	-0.9275	2.20440635380166e-18	74115754	74115754	1.24368032474983e-16	74133391	74133391
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74137073	74137073	1	0	NA	1.24368032474983e-16	74133391	74133391	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74140287	75115806	415	399	0.0071	NA	NA	NA	3.28893877878691e-17	75115806	75115806
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.3537	3.28893877878691e-17	75115806	75115806	6.06460534824842e-20	75119713	75119713
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	95609756	7443	7221	-0.0041	6.06460534824842e-20	75119713	75119713	6.32760716649677e-21	95606006	95609756
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.8065	6.32760716649677e-21	95606006	95609756	3.4221653877225e-20	95632390	95656272
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1935	-0.017	3.4221653877225e-20	95632390	95656272	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54352394	13696	13320	0.0118	NA	NA	NA	2.65979185891385e-182	54352394	54366535
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54390060	11	11	-1.7938	2.65979185891385e-182	54352394	54366535	0.00314859162917976	54363713	54390060
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54408446	5	5	0.7131	0.00314859162917976	54363713	54390060	3.17552919854981e-13	54402057	54410800
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57203733	1197	1161	0.0076	3.17552919854981e-13	54402057	54410800	5.62499491387131e-96	57203733	57203733
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.9328	5.62499491387131e-96	57203733	57203733	1.71004876409967e-96	57206772	57206772
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5446	0.0147	1.71004876409967e-96	57206772	57206772	8.74297614928951e-64	75093957	75093957
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.9749	8.74297614928951e-64	75093957	75093957	1.80633757402424e-59	75100865	75100865
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4974	-0.0065	1.80633757402424e-59	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11680	0.0196	NA	NA	NA	1.28172393345458e-10	31439551	31467971
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	16	-0.3462	1.28172393345458e-10	31439551	31467971	1.40057746944703e-11	31489333	31891535
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32828797	366	353	0.0199	1.40057746944703e-11	31489333	31891535	1.40974065220395e-45	32828797	32828797
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-2.4151	1.40974065220395e-45	32828797	32828797	1.24145490722699e-55	32832642	32832642
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1402	0.0339	1.24145490722699e-55	32832642	32832642	3.72222916264798e-97	36673853	36673853
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.8009	3.72222916264798e-97	36673853	36673853	2.88983244625461e-90	36684619	36684619
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1960	0.0454	2.88983244625461e-90	36684619	36684619	1.34284620254794e-22	41515622	41526558
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	22	0.5118	1.34284620254794e-22	41515622	41526558	1.80296787710124e-11	41562786	41573295
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41570512	1	0	NA	1.80296787710124e-11	41562786	41573295	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41572001	41624013	25	22	0.0577	NA	NA	NA	1.17923560286160e-05	41617077	41632724
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	41647135	10	10	0.4402	1.1792356028616e-05	41617077	41632724	1.06961307131197e-08	41635536	41697532
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	78653545	13688	13280	0.0174	1.06961307131197e-08	41635536	41697532	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22310	-0.0086	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	42728012	13632	13200	0.0383	NA	NA	NA	2.25275742486159e-07	42716854	42734668
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42730961	42749902	11	11	-0.305	2.25275742486159e-07	42716854	42734668	6.47431504162732e-06	42745561	42761623
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42751168	58208527	6824	6610	0.0363	6.47431504162732e-06	42745561	42761623	6.64528130694153e-33	58206232	58208527
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58212113	1	0	NA	6.64528130694153e-33	58206232	58208527	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58213220	58244012	14	14	0.7202	NA	NA	NA	1.07478406498307e-32	58244012	58247367
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	63788698	2577	2510	0.0255	1.07478406498307e-32	58244012	58247367	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	566	-0.0039	NA	NA	NA	5.45388393887494e-26	1499421	1511632
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.7104	5.45388393887494e-26	1499421	1511632	5.70975019692579e-27	1531162	1544485
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20328	-0.0042	5.70975019692579e-27	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	36789648	8545	8318	-0.0051	NA	NA	NA	1.51562093189008e-09	36789648	36789648
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	-0.9317	1.51562093189008e-09	36789648	36789648	1.59804196692239e-08	36791668	36791668
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4740	-0.0089	1.59804196692239e-08	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22601987	2975	2900	0.0165	NA	NA	NA	4.42336525314478e-15	22586421	22642519
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22603134	22725305	29	29	-0.3125	4.42336525314478e-15	22586421	22642519	2.13043471706823e-15	22715919	22739574
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	37621766	7737	7528	0.014	2.13043471706823e-15	22715919	22739574	2.20789929374062e-43	37621766	37621766
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.0509	2.20789929374062e-43	37621766	37621766	1.71299394267734e-08	37626069	37626069
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37633961	1	0	NA	1.71299394267734e-08	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37637059	37685496	20	20	0.0105	NA	NA	NA	1.05480170058170e-20	37685496	37689058
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.7865	1.0548017005817e-20	37685496	37689058	4.10021468311884e-57	37715370	37715385
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41237593	1826	1764	0.0293	4.10021468311884e-57	37715370	37715385	1.37869517852602e-06	41213175	41248301
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41237731	41279485	9	9	0.4093	1.37869517852602e-06	41213175	41248301	7.24757022971176e-07	41254513	41295673
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	48448446	3439	3345	0.0041	7.24757022971176e-07	41254513	41295673	2.98341977868092e-11	48448446	48448446
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	1.0872	2.98341977868092e-11	48448446	48448446	1.04631832929706e-09	48452959	48452959
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	483	0.0106	1.04631832929706e-09	48452959	48452959	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1182230	689	674	0.0255	NA	NA	NA	4.92349499136272e-12	1177877	1295803
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1182356	1182356	1	0	NA	4.92349499136272e-12	1177877	1295803	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1274736	1311168	13	13	0.4711	NA	NA	NA	4.38362174619021e-12	1303858	1328203
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1322183	1431411	86	84	0.0239	4.38362174619021e-12	1303858	1328203	6.18850087120827e-12	1431411	1431411
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.0086	6.18850087120827e-12	1431411	1431411	1.12500670053797e-10	1432953	1432953
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	586	0.0258	1.12500670053797e-10	1432953	1432953	9.39152811986555e-21	2302065	2302065
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0395	9.39152811986555e-21	2302065	2302065	2.81628052397603e-22	2304398	2304398
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2674962	366	357	0.0052	2.81628052397603e-22	2304398	2304398	3.5714021108594e-05	2667268	2697206
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2676476	2708291	23	23	-0.2161	3.5714021108594e-05	2667268	2697206	1.90960139912128e-111	2708291	2708291
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1748	0.9517	1.90960139912128e-111	2708291	2708291	1.7181166028128e-10	8449254	8463131
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8473482	8	8	0.3605	1.7181166028128e-10	8449254	8463131	2.64795423982413e-12	8459880	8475091
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	19375467	4674	4524	0.9716	2.64795423982413e-12	8459880	8475091	1.17525900361329e-08	19374110	19375467
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19376772	19378637	2	2	-0.0593	1.17525900361329e-08	19374110	19375467	1.12431695884959e-11	19378637	19381726
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19381726	69646994	14736	14270	0.9759	1.12431695884959e-11	19378637	19381726	2.24031579570448e-12	69646994	69646994
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69649160	69650824	2	2	-0.2711	2.24031579570448e-12	69646994	69646994	1.27557507586713e-18	69650824	69650824
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69659613	154582414	23921	23236	0.9694	1.27557507586713e-18	69650824	69650824	0	154582414	154582414
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0177	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-4.2386	NA	NA	NA	4.02461000819364e-24	3780462	4174561
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.1451	4.02461000819364e-24	3780462	4174561	7.18513239322246e-08	5531459	6715636
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6954864	119	116	-3.8511	7.18513239322246e-08	5531459	6715636	0.0331409161605264	6844141	7124918
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6955902	7259689	110	106	-3.2209	0.0331409161605264	6844141	7124918	3.75251278325475e-05	7237274	7266323
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	23	-1.679	3.75251278325475e-05	7237274	7266323	0.000931057216681307	7292494	7344413
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7653082	82	78	-2.9029	0.000931057216681307	7292494	7344413	3.49765122943307e-07	7619927	7659535
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.276	3.49765122943307e-07	7619927	7659535	9.48097799339192e-08	7702787	7729757
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	87	-2.9991	9.48097799339192e-08	7702787	7729757	1.48822379070096e-06	7911990	8114544
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8956787	256	245	-3.7333	1.48822379070096e-06	7911990	8114544	1.47409642928504e-05	8901974	8967247
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9132086	28	28	-4.7683	1.47409642928504e-05	8901974	8967247	0.0110157428470069	9094974	9132086
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9133230	9135034	2	0	NA	0.0110157428470069	9094974	9132086	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9145335	9160624	6	5	-3.4527	NA	NA	NA	0.00298839037493077	9160624	9990889
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10012024	11	10	-2.4107	0.00298839037493077	9160624	9990889	1.11000967412415e-06	10004173	10049346
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10513747	64	64	-3.9522	1.11000967412415e-06	10004173	10049346	1.71154393908061e-36	10512616	10535786
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-1.008	1.71154393908061e-36	10512616	10535786	1.66079141211130e-26	11698871	12452734
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12537944	10	10	-4.8932	1.6607914121113e-26	11698871	12452734	1.88343680181048e-11	12537944	12542979
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	52	-2.0643	1.88343680181048e-11	12537944	12542979	1.92523677058377e-06	12625208	12730281
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12924438	54	52	-3.2896	1.92523677058377e-06	12625208	12730281	8.5781209717847e-05	12888523	12978637
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13129843	82	81	-2.2421	8.5781209717847e-05	12888523	12978637	1.81897149716494e-30	13111594	13138841
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13823928	246	228	-3.9238	1.81897149716494e-30	13111594	13138841	8.27950792526494e-06	13781193	13828384
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.0503	8.27950792526494e-06	13781193	13828384	7.77119882764725e-13	13863616	13868296
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	120	-4.3306	7.77119882764725e-13	13863616	13868296	4.75012811212046e-08	14118164	14122129
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14169526	4	4	-1.7858	4.75012811212046e-08	14118164	14122129	0.00012676750117929	14169526	14214157
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14203911	14342834	27	25	-4.1518	0.00012676750117929	14169526	14214157	7.2509518187768e-08	14331599	14343139
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14380301	19	19	-2.4487	7.2509518187768e-08	14331599	14343139	4.12423957938638e-13	14379418	14380301
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14416385	19	18	-4.2634	4.12423957938638e-13	14379418	14380301	0.000258178862912922	14415559	14440701
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14418116	14508021	58	57	-3.0424	0.000258178862912922	14415559	14440701	3.8011354881134e-06	14494397	14530328
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.8011354881134e-06	14494397	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.6415	NA	NA	NA	8.3592160668564e-05	14566592	14603508
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14700040	23	22	-3.3506	8.3592160668564e-05	14566592	14603508	0.00451334092957557	14598838	14707011
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14883615	43	41	-4.4124	0.00451334092957557	14598838	14707011	1.93522402283765e-06	14849277	15005207
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15284717	128	125	-3.2847	1.93522402283765e-06	14849277	15005207	4.91720584309508e-08	15244992	15299931
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15433122	97	94	-4.194	4.91720584309508e-08	15244992	15299931	2.42479875528366e-12	15431247	15433122
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.5698	2.42479875528366e-12	15431247	15433122	1.00985564376970e-16	15447091	15448670
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15469100	15	15	-4.2783	1.0098556437697e-16	15447091	15448670	0.000194679359312261	15465845	15473709
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15470132	15501930	10	10	-2.9834	0.000194679359312261	15465845	15473709	2.41934282224291e-05	15497443	15514330
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15514330	15523178	6	6	-4.8014	2.41934282224291e-05	15497443	15514330	0.000125503891954781	15523178	15531144
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15558235	23	21	-2.7314	0.000125503891954781	15523178	15531144	0.000920406729373787	15551462	15558235
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15559959	15564959	4	4	-4.8847	0.000920406729373787	15551462	15558235	1.78392516545337e-27	15564959	15564959
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15566377	15566377	1	0	NA	1.78392516545337e-27	15564959	15564959	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15583573	5	5	-1.9709	NA	NA	NA	1.60671029483153e-07	15583573	15587741
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	55	-4.1952	1.60671029483153e-07	15583573	15587741	3.40759160461950e-06	15854496	15996118
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16217583	127	120	-3.2356	3.4075916046195e-06	15854496	15996118	3.15594015214565e-10	16178192	16304538
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	16218742	1	0	NA	3.15594015214565e-10	16178192	16304538	NA	NA	NA
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16219596	17487972	208	199	-4.1448	NA	NA	NA	2.80345735108868e-08	17445037	17496151
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17557953	12	12	-2.1133	2.80345735108868e-08	17445037	17496151	1.74746085674e-07	17544651	17595749
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	21036503	485	460	-4.0522	1.74746085674e-07	17544651	17595749	1.51581924997951e-05	21026715	21036503
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21047798	4	4	-1.1742	1.51581924997951e-05	21026715	21036503	2.63689560006439e-06	21047798	21054519
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21048365	21896293	205	196	-3.8723	2.63689560006439e-06	21047798	21054519	0.000248724792240375	21702495	21914674
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21898297	22014413	36	32	-4.6898	0.000248724792240375	21702495	21914674	9.6632867143141e-06	22002762	22028255
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22015735	22139807	22	21	-3.737	9.6632867143141e-06	22002762	22028255	4.83669887941751e-11	22058759	22139807
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.8361	4.83669887941751e-11	22058759	22139807	1.34288601811486e-15	22177335	22179794
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	83	-4.3366	1.34288601811486e-15	22177335	22179794	4.22999607080032e-64	22926726	25737663
MSK_252152915691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	80	-1.3511	4.22999607080032e-64	22926726	25737663	NA	NA	NA
