Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12380	-0.0029	NA	NA	NA	2.33327734831023e-304	34869589	34869589
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-4.0748	2.33327734831023e-304	34869589	34869589	1.77357616734069e-290	34883375	34883375
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14449	-0.0043	1.77357616734069e-290	34883375	34883375	1.73134580702776e-16	72534975	72540240
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.5249	1.73134580702776e-16	72534975	72540240	5.59920044524012e-16	72568009	72596993
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6730	0.0037	5.59920044524012e-16	72568009	72596993	4.81807934520363e-13	94060783	94060783
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-1.2461	4.81807934520363e-13	94060783	94060783	4.06445090189121e-13	94062928	94062928
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	103932025	3126	3003	0.0078	4.06445090189121e-13	94062928	94062928	3.47038260304687e-55	103932025	103932025
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	103962495	2	2	-2.5373	3.47038260304687e-55	103932025	103932025	1.22767156192822e-51	103962495	103962495
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110014625	1581	1526	4e-04	1.22767156192822e-51	103962495	103962495	0.00284113378812138	110008873	110014625
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110023268	2	2	-0.6353	0.00284113378812138	110008873	110014625	7.93335374689351e-19	110023268	110023268
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.923	7.93335374689351e-19	110023268	110023268	1.79515633697072e-10	110039388	110058441
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110041712	1	0	NA	1.79515633697072e-10	110039388	110058441	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147306304	4556	4382	-0.0166	NA	NA	NA	4.79058302093974e-305	147306304	147315217
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	33	-1.545	4.79058302093974e-305	147306304	147315217	1.08601365630164e-239	147490553	147510532
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	147644831	1	0	NA	1.08601365630164e-239	147490553	147510532	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150839754	1261	1220	0.0156	NA	NA	NA	4.11394734970119e-51	150839754	150839754
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	4.11394734970119e-51	150839754	150839754	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-2.3984	NA	NA	NA	1.76251313758423e-48	150846148	150846148
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.76251313758423e-48	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	162599438	4836	4664	-0.0121	NA	NA	NA	1.41722066091827e-22	162599438	162599438
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	162601802	162611836	5	5	-1.05	1.41722066091827e-22	162599438	162599438	3.39706860234962e-23	162611836	162611836
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	162613526	185979586	9249	8884	-0.003	3.39706860234962e-23	162611836	162611836	1.07030479412571e-09	185979586	185979586
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.0895	1.07030479412571e-09	185979586	185979586	4.06005940373877e-09	185988138	185988138
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1890	0.0234	4.06005940373877e-09	185988138	185988138	3.3590390072373e-12	194972886	195014129
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.5564	3.3590390072373e-12	194972886	195014129	4.79728005783662e-12	195046932	195097118
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	195091758	1	0	NA	4.79728005783662e-12	195046932	195097118	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195095156	200598243	2157	2072	0.005	NA	NA	NA	1.05818666894946e-07	200565895	200625002
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200600795	1	0	NA	1.05818666894946e-07	200565895	200625002	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200602881	200787319	37	37	-0.2198	NA	NA	NA	9.97761161903362e-16	200672373	200824803
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16740	-0.0042	9.97761161903362e-16	200672373	200824803	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34558824	11527	11125	-0.0087	NA	NA	NA	4.90751453339491e-24	34556434	34561038
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34561038	34583814	12	12	-0.6863	4.90751453339491e-24	34556434	34561038	1.71615495185251e-23	34582272	34589997
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34589997	37810001	1370	1311	0.0039	1.71615495185251e-23	34582272	34589997	1.81622317017972e-56	37803744	37813211
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	-0.8097	1.81622317017972e-56	37803744	37813211	1.19972407772762e-61	37852371	37859985
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	37858379	1	0	NA	1.19972407772762e-61	37852371	37859985	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	76781406	13933	13365	8e-04	NA	NA	NA	6.53668535789507e-16	76777680	76781406
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76789219	76802732	4	4	-0.9576	6.53668535789507e-16	76777680	76781406	4.28035741469810e-15	76802732	76810154
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76810154	175089544	27579	26517	-0.0011	4.2803574146981e-15	76802732	76810154	7.72916635709817e-16	175085925	175089544
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175091554	175104030	6	6	-0.8	7.72916635709817e-16	175085925	175089544	1.40624761474713e-16	175104030	175107823
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175107823	208057199	10938	10506	0.0081	1.40624761474713e-16	175104030	175107823	1.93415259302538e-72	208057199	208057199
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208061390	208066245	2	2	-2.9012	1.93415259302538e-72	208057199	208057199	8.28601793197294e-71	208066245	208066245
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	208071101	242501239	12366	11913	-0.0055	8.28601793197294e-71	208066245	208066245	1.00072222024015e-137	242496751	242505261
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242689978	67	64	-0.713	1.00072222024015e-137	242496751	242505261	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11381714	4086	3915	-0.0096	NA	NA	NA	1.37037420008855e-17	11381714	11381714
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11383299	11383299	1	0	NA	1.37037420008855e-17	11381714	11381714	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.1595	NA	NA	NA	1.44401576925926e-16	11389624	11389624
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	32074432	6706	6462	-0.0059	1.44401576925926e-16	11389624	11389624	1.38088040204022e-38	32074432	32074432
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.127	1.38088040204022e-38	32074432	32074432	1.70721007353535e-39	32080848	32080848
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5200	-0.007	1.70721007353535e-39	32080848	32080848	1.17575185151829e-09	47460892	47460892
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.0727	1.17575185151829e-09	47460892	47460892	4.88499657108598e-09	47466921	47466921
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	164027724	37276	35860	-0.0026	4.88499657108598e-09	47466921	47466921	1.91971627708376e-27	164009321	164036648
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5683	1.91971627708376e-27	164009321	164036648	2.68998168451046e-26	164101776	164115417
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	176559755	4109	3936	0.0074	2.68998168451046e-26	164101776	164115417	2.41547401151218e-34	176559755	176559755
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176563796	176566161	2	2	-2.0337	2.41547401151218e-34	176559755	176559755	6.23773545145723e-36	176566161	176566161
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176568986	199329592	8005	7701	0.002	6.23773545145723e-36	176566161	176566161	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3256	-0.0142	NA	NA	NA	3.79922379899399e-215	9815760	9815760
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9832823	3	3	-3.9119	3.79922379899399e-215	9815760	9815760	8.47559530548749e-194	9832823	9832823
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9842644	9842644	1	0	NA	8.47559530548749e-194	9832823	9832823	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5950	-0.0073	NA	NA	NA	1.0955750355647e-11	34433787	34445002
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.7029	1.0955750355647e-11	34433787	34445002	2.869935751893e-12	34491115	34506297
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	100240716	19394	18682	0.0083	2.869935751893e-12	34491115	34506297	2.35623335324983e-92	100230932	100244817
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100244817	100351083	29	28	-0.8694	2.35623335324983e-92	100230932	100244817	3.73637400769877e-93	100348780	100353659
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100353659	173660684	20842	20057	0.0102	3.73637400769877e-93	100348780	100353659	8.26007949217506e-11	173660684	173660684
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.1701	8.26007949217506e-11	173660684	173660684	9.04863261041944e-12	173666072	173666072
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3925	0.0047	9.04863261041944e-12	173666072	173666072	2.97878493228918e-124	187330240	187330240
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.6955	2.97878493228918e-124	187330240	187330240	2.62354180582914e-118	187333619	187333619
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	187335827	1	0	NA	2.62354180582914e-118	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187338465	191153613	1240	1190	-0.0089	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	140469291	40195	38642	9e-04	NA	NA	NA	5.37066804527752e-08	140461319	140477335
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140469778	140482598	5	4	0.4464	5.37066804527752e-08	140461319	140477335	7.86936969223507e-06	140477335	140487596
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140484137	180187846	13442	12918	-0.0087	7.86936969223507e-06	140477335	140487596	3.70108554123153e-08	180177334	180194323
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180189516	180365950	15	15	-0.3708	3.70108554123153e-08	180177334	180194323	5.34616422252037e-06	180358977	180398319
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180365977	180644810	109	105	-0.0399	5.34616422252037e-06	180358977	180398319	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	3344943	1332	1268	-0.0125	NA	NA	NA	7.58605026701471e-124	3340693	3351073
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3346740	3346740	1	0	NA	7.58605026701471e-124	3340693	3351073	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3349394	3641859	105	100	0.5329	NA	NA	NA	5.3851780640214e-130	3635907	3648492
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3645905	31385778	9744	9379	6e-04	5.3851780640214e-130	3635907	3648492	0	31385778	31387708
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-3.9758	0	31385778	31387708	9.77633621100794e-247	31395330	31418006
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	473	0.0134	9.77633621100794e-247	31395330	31418006	2.06732262141917e-35	32548736	32548736
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	1.0392	2.06732262141917e-35	32548736	32548736	7.8505694267957e-08	32595402	32609525
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32745036	54	54	0.2692	7.8505694267957e-08	32595402	32609525	1.08480707462534e-16	32709263	32771725
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745693	67055837	11024	10625	-0.0024	1.08480707462534e-16	32709263	32771725	0	67055837	67078860
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67060622	67060622	1	0	NA	0	67055837	67078860	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-4.1264	NA	NA	NA	0	67093216	67105238
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	79024557	3656	3533	0.0136	0	67093216	67105238	5.71534882330954e-09	79008946	79032059
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79028813	79105311	15	14	-0.3789	5.71534882330954e-09	79008946	79032059	2.14717726385174e-08	79095415	79146664
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79112799	170753106	29677	28595	0.0016	2.14717726385174e-08	79095415	79146664	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	118611324	39265	37812	0.0031	NA	NA	NA	2.83066831227522e-16	118611324	118611324
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.1497	2.83066831227522e-16	118611324	118611324	5.70921472931106e-14	118620875	118620875
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	120089714	604	582	0.0147	5.70921472931106e-14	118620875	118620875	1.51834526400113e-11	120087494	120089714
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120092153	120101979	6	6	-0.72	1.51834526400113e-11	120087494	120089714	1.95027925286080e-13	120101979	120104344
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120104344	133433384	6217	5984	-5e-04	1.9502792528608e-13	120101979	120104344	1.17514265289970e-12	133426996	133433384
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133453811	9	9	0.5705	1.1751426528997e-12	133426996	133433384	2.9144723383799e-11	133453811	133456873
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133455682	147702365	6351	6123	0.0063	2.9144723383799e-11	133453811	133456873	8.8517835383515e-11	147702365	147702365
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.1662	8.8517835383515e-11	147702365	147702365	3.20281466159509e-10	147707161	147707161
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4064	-0.0235	3.20281466159509e-10	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	112	0.0064	NA	NA	NA	2.08093749086854e-17	581533	581533
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.7368	2.08093749086854e-17	581533	581533	1.41936543809866e-21	588865	588865
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	599	-0.0298	1.41936543809866e-21	588865	588865	3.28267935460234e-07	2229727	2234351
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.7116	3.28267935460234e-07	2229727	2234351	4.69779033956974e-09	2251011	2257255
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	10330645	2526	2436	0.0017	4.69779033956974e-09	2251011	2257255	6.14184319750462e-09	10330645	10330645
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10332803	10332839	2	2	-1.0007	6.14184319750462e-09	10330645	10330645	4.94427499195073e-08	10332839	10332839
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339001	10339001	1	0	NA	4.94427499195073e-08	10332839	10332839	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339780	25120552	4889	4701	-0.0103	NA	NA	NA	1.63935193503121e-43	25120552	25120552
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.8195	1.63935193503121e-43	25120552	25120552	3.39197798756421e-44	25125700	25125700
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4685	-0.0037	3.39197798756421e-44	25125700	25125700	1.19497641014239e-191	39350798	39352361
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8662	1.19497641014239e-191	39350798	39352361	2.57610870516689e-185	39504332	39505256
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	87255865	12687	12212	0.0065	2.57610870516689e-185	39504332	39505256	8.65300938026116e-09	87249754	87255865
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-0.8414	8.65300938026116e-09	87249754	87255865	8.20231075177098e-17	87262662	87265435
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	18012	-0.0039	8.20231075177098e-17	87262662	87265435	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5269	0.0066	NA	NA	NA	3.6481729044253e-13	15802255	15802255
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.2503	3.6481729044253e-13	15802255	15802255	3.31691142904153e-13	15807123	15807123
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2280	-0.0092	3.31691142904153e-13	15807123	15807123	5.64647342695859e-08	22473542	22477358
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.9802	5.64647342695859e-08	22473542	22477358	9.71397162476319e-08	22492603	22499541
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	157	0.0163	9.7139716247632e-08	22492603	22499541	3.01167883205133e-09	23338535	23343915
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.8875	3.01167883205133e-09	23338535	23343915	5.57810645620175e-10	23365926	23377660
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39146895	4728	4541	8e-04	5.57810645620175e-10	23365926	23377660	8.88267654370835e-07	39130211	43445839
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	0.741	8.88267654370835e-07	39130211	43445839	1.59783600484916e-07	43530076	43626920
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	70926188	338	320	-0.0108	1.59783600484916e-07	43530076	43626920	2.0315383269515e-33	70926188	70926188
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8792	2.0315383269515e-33	70926188	70926188	2.68057568895234e-31	70930528	70930528
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	76393854	2034	1953	0.0038	2.68057568895234e-31	70930528	70930528	3.31731293096605e-06	76391614	76393854
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76396284	76398571	2	2	-0.8563	3.31731293096605e-06	76391614	76393854	1.43264779449285e-05	76398571	76401134
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76401134	116124007	13432	12954	-0.0085	1.43264779449285e-05	76398571	76401134	2.94563209761481e-10	116124007	116124007
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1252	2.94563209761481e-10	116124007	116124007	4.43671455567149e-10	116130333	116130333
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	134542664	7250	6991	-0.0114	4.43671455567149e-10	116130333	116130333	4.84822730126083e-10	134542664	134542664
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134544331	134545846	2	2	1.1005	4.84822730126083e-10	134542664	134542664	1.41994551692919e-05	134545846	134551488
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134548747	134612031	27	25	0.0316	1.41994551692919e-05	134545846	134551488	6.40887688285576e-06	134609758	134612031
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134613502	134616971	3	3	-0.8722	6.40887688285576e-06	134609758	134612031	1.77889699424016e-10	134616971	134619449
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134619449	137352394	1013	974	-0.0118	1.77889699424016e-10	134616971	134619449	4.31485099225508e-62	137352394	137352394
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.5078	4.31485099225508e-62	137352394	137352394	5.19515490748328e-51	137356880	137356880
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1063	-0.0048	5.19515490748328e-51	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9376	-0.0045	NA	NA	NA	1.19649489769082e-16	27038538	27038538
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.376	1.19649489769082e-16	27038538	27038538	1.49897508320890e-17	27041812	27041812
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1502	0.0127	1.4989750832089e-17	27041812	27041812	1.88359939401991e-10	31284926	31284926
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31289799	2	2	-1.0485	1.88359939401991e-10	31284926	31284926	7.87769498566839e-09	31289799	31289799
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31291525	46384985	3164	3030	-0.0019	7.87769498566839e-09	31289799	31289799	1.72977581137530e-102	45489823	46388078
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	46568496	71	66	-0.6105	1.7297758113753e-102	45489823	46388078	9.5832828985481e-106	46561216	47021415
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	100676022	17828	17156	-0.003	9.5832828985481e-106	46561216	47021415	3.22721903299169e-115	100676022	100676022
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-2.9738	3.22721903299169e-115	100676022	100676022	2.4398136812145e-115	100686753	100686753
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	114100979	4627	4458	-0.0065	2.4398136812145e-115	100686753	100686753	5.05607560288345e-50	114100979	114100979
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.4047	5.05607560288345e-50	114100979	114100979	7.0003865205636e-50	114106460	114106460
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135285645	7819	7527	-0.0208	7.0003865205636e-50	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2054	-0.0184	NA	NA	NA	1.02762002950213e-11	5738494	5738494
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5742476	2	2	-1.2957	1.02762002950213e-11	5738494	5738494	5.3478786751122e-25	5742476	5742476
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5744034	5765438	14	14	-5.1189	5.3478786751122e-25	5742476	5742476	0	5765438	5765438
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14223	-0.0054	0	5765438	5765438	2.14035893122871e-42	55112618	55123719
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	0.5103	2.14035893122871e-42	55112618	55123719	2.16196821702981e-44	55207305	55219985
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4461	0.0037	2.16196821702981e-44	55207305	55219985	2.30564323095715e-10	66463477	66463477
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0903	2.30564323095715e-10	66463477	66463477	1.17722098406916e-11	66469412	66469412
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22836	-0.0101	1.17722098406916e-11	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	289	0.0204	NA	NA	NA	7.61382058295776e-13	734832	736988
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.7996	7.61382058295776e-13	734832	736988	1.67769269747851e-09	743223	745410
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3307	-0.0138	1.67769269747851e-09	743223	745410	4.79817306103051e-57	9523923	9531133
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.0335	4.79817306103051e-57	9523923	9531133	3.07082925779013e-58	9589725	9599999
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	80662066	23586	22675	0.0087	3.07082925779013e-58	9589725	9599999	7.39868927594873e-12	80662066	80662066
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.2045	7.39868927594873e-12	80662066	80662066	5.74992438953545e-12	80666751	80666751
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130694393	17172	16573	-0.003	5.74992438953545e-12	80666751	80666751	2.50793426167456e-10	130690343	130694393
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.9019	2.50793426167456e-10	130690343	130694393	8.53500604859258e-07	130701040	130718440
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	614	-0.014	8.53500604859258e-07	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	56650373	14025	13510	0.0017	NA	NA	NA	1.06748719821371e-33	56646284	56657371
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	-0.7268	1.06748719821371e-33	56646284	56657371	1.03281375812006e-33	56681665	56686863
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68146755	2696	2589	0.006	1.03281375812006e-33	56681665	56686863	8.36462057795216e-07	68138912	68155925
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68147831	68163523	8	7	0.5018	8.36462057795216e-07	68138912	68155925	6.02031075842333e-07	68160625	68169957
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	100690991	10336	9959	0.0052	6.02031075842333e-07	68160625	68169957	5.53214330098493e-303	100690991	100690991
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.83	5.53214330098493e-303	100690991	100690991	2.56289687361004e-301	100693892	100693892
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4372	-0.0187	2.56289687361004e-301	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	6	-0.0379	NA	NA	NA	2.66781871714768e-07	18798641	19273289
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	50	-0.674	2.66781871714768e-07	18798641	19273289	5.96837836954192e-97	19490630	19497023
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34666996	5689	5490	0.0085	5.96837836954192e-97	19490630	19497023	5.77439650969015e-22	34666996	34666996
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34674458	34674458	1	0	NA	5.77439650969015e-22	34666996	34666996	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.3432	NA	NA	NA	8.31020989755906e-23	34683810	34683810
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	73071404	13667	13139	0.002	8.31020989755906e-23	34683810	34683810	6.8075183595667e-44	73071404	73071404
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	6.8075183595667e-44	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.3077	NA	NA	NA	8.05302749280002e-46	73092112	73092112
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105595302	12214	11734	-0.0138	8.05302749280002e-46	73092112	73092112	1.46105222440180e-11	105590641	105602602
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105632168	13	13	-0.4756	1.4610522244018e-11	105590641	105602602	3.02095252770203e-07	105625010	105736025
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105945006	70	68	-0.0214	3.02095252770203e-07	105625010	105736025	1.19180345577236e-12	105921895	105948347
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	15	-0.6016	1.19180345577236e-12	105921895	105948347	8.24272630320502e-20	105998412	106015449
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	138	0.046	8.24272630320502e-20	105998412	106015449	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18848213	19	19	-0.0631	NA	NA	NA	0.00341795831422075	18835660	18874259
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	18886649	11	10	-0.3799	0.00341795831422075	18835660	18874259	1.02022643065834e-05	18867285	19123327
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	19465359	68	61	-0.0297	1.02022643065834e-05	18867285	19123327	3.40564415364921e-71	19430207	19537035
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	53	-0.7402	3.40564415364921e-71	19430207	19537035	1.00917008272455e-122	20079935	20308014
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20772	-0.0059	1.00917008272455e-122	20079935	20308014	4.24706580770285e-210	74669752	74671626
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.5033	4.24706580770285e-210	74669752	74671626	1.80865837553165e-131	74680338	74680439
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	165	0.0221	1.80865837553165e-131	74680338	74680439	3.67014950343748e-17	75115806	75115806
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.4555	3.67014950343748e-17	75115806	75115806	1.33429775324401e-17	75119713	75119713
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	95609756	7443	7141	-0.0138	1.33429775324401e-17	75119713	75119713	7.45757666692265e-13	95606006	95609756
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.7291	7.45757666692265e-13	95606006	95609756	8.89506524851032e-13	95632390	95656272
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1916	-0.02	8.89506524851032e-13	95632390	95656272	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14340	-0.0118	NA	NA	NA	7.09798105961223e-12	57203733	57203733
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1683	7.09798105961223e-12	57203733	57203733	1.83044431176437e-11	57206772	57206772
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5416	5e-04	1.83044431176437e-11	57206772	57206772	8.04488793447609e-79	75093957	75093957
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.9903	8.0448879344761e-79	75093957	75093957	2.04138893063987e-79	75100865	75100865
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4934	-0.0209	2.04138893063987e-79	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	403	0.0042	NA	NA	NA	3.52314328967762e-24	1028979	1028979
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7151	3.52314328967762e-24	1028979	1028979	9.90331057855898e-26	1030766	1030766
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	25367590	9097	8770	0.0011	9.90331057855898e-26	1030766	1030766	2.30303794945949e-11	25359330	25367590
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25371853	25377349	3	3	-0.9444	2.30303794945949e-11	25359330	25367590	5.55409155849184e-11	25377349	25378651
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25378651	31461588	2519	2428	-0.008	5.55409155849184e-11	25377349	25378651	9.9154314892749e-17	31451114	31468896
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	14	0.5259	9.9154314892749e-17	31451114	31468896	3.64555622989025e-16	31479804	31889566
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1744	0.0059	3.64555622989025e-16	31479804	31889566	3.29003739237730e-23	36673853	36673853
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.9485	3.2900373923773e-23	36673853	36673853	5.94206257193378e-24	36684619	36684619
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1952	0.0165	5.94206257193378e-24	36684619	36684619	5.35588302091978e-41	41562786	41574775
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	43	-0.4444	5.35588302091978e-41	41562786	41574775	9.97477242227506e-40	41702238	42147225
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	58435991	5911	5681	0.0093	9.97477242227506e-40	41702238	42147225	7.71358689741793e-07	58427073	58441144
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58458306	9	9	0.4334	7.71358689741793e-07	58427073	58441144	7.66428849356614e-07	58454995	58471774
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58459873	78653545	7759	7471	-6e-04	7.66428849356614e-07	58454995	58471774	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15620	-0.0051	NA	NA	NA	1.98559512968845e-18	53092949	53092949
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.4577	1.98559512968845e-18	53092949	53092949	3.03660041124930e-17	53099601	53099601
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6498	-0.0133	3.0366004112493e-17	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	9134840	4062	3909	0.0178	NA	NA	NA	5.58465432223781e-09	9131737	9134840
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9138936	9144715	4	4	-0.7313	5.58465432223781e-09	9131737	9134840	1.58298783696388e-09	9144715	9145735
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9145735	19694025	4961	4783	0.0092	1.58298783696388e-09	9144715	9145735	8.77618990725842e-215	19694025	19694025
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-3.9226	8.77618990725842e-215	19694025	19694025	1.21344966916855e-192	19700620	19700620
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	35206301	1797	1738	0.0317	1.21344966916855e-192	19700620	19700620	2.24555650273846e-10	35199384	35206301
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35212865	35213053	3	3	-0.6827	2.24555650273846e-10	35199384	35206301	2.82856966116559e-09	35213053	35220895
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35219777	59414898	10225	9775	-3e-04	2.82856966116559e-09	35213053	35220895	3.61212639223905e-16	59414645	59414898
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	-0.6427	3.61212639223905e-16	59414645	59414898	7.60910990065157e-16	59434202	59440262
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1934	-0.005	7.60910990065157e-16	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	565	-0.0329	NA	NA	NA	1.68955191225858e-160	1506379	1515948
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.4487	1.68955191225858e-160	1506379	1515948	1.76864284432543e-231	1525300	1531162
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	31552312	9456	9132	-0.0122	1.76864284432543e-231	1525300	1531162	3.04389220146372e-16	31550652	31552312
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	31555067	31560953	5	5	-0.8842	3.04389220146372e-16	31550652	31552312	1.35494211659371e-19	31560953	31560953
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	31566875	32103418	239	227	0.0311	1.35494211659371e-19	31560953	31560953	1.11722810392054e-07	32092613	32108160
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	32105194	32134329	17	17	-0.2895	1.11722810392054e-07	32092613	32108160	6.55387133592148e-05	32126774	32159244
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	32135924	62419534	11267	10860	-0.0174	6.55387133592148e-05	32126774	32159244	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	41106927	10746	10345	0.0022	NA	NA	NA	2.15611211511424e-14	41105959	41106927
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	41108222	41113173	4	4	-0.9345	2.15611211511424e-14	41105959	41106927	1.98372600221677e-14	41113173	41114609
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	41114609	46922972	2691	2592	-0.0131	1.98372600221677e-14	41113173	41114609	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22677959	2984	2891	-0.0071	NA	NA	NA	5.89251193467649e-14	22643742	22696162
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22679305	1	0	NA	5.89251193467649e-14	22643742	22696162	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22682428	22725305	20	18	0.4226	NA	NA	NA	2.17425896744854e-15	22718614	22738466
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6320	-0.0172	2.17425896744854e-15	22718614	22738466	3.37722403506475e-144	35472378	35472378
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.9734	3.37722403506475e-144	35472378	35472378	2.65042125274016e-146	35476942	35476942
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36074159	339	329	-0.0222	2.65042125274016e-146	35476942	35476942	2.93111201555515e-12	36072484	36074159
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36075796	36079268	3	3	-0.9603	2.93111201555515e-12	36072484	36074159	3.11425106861401e-12	36079268	36079268
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36080448	37685496	869	836	0.0112	3.11425106861401e-12	36079268	36079268	2.67763794134331e-47	37683516	37685496
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-0.839	2.67763794134331e-47	37683516	37685496	1.89519393521603e-48	37715385	37718669
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	40017002	1202	1155	0.0079	1.89519393521603e-48	37715385	37718669	1.07432281370825e-08	40017002	40017002
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40025517	40025517	1	0	NA	1.07432281370825e-08	40017002	40017002	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40027630	40028911	2	2	1.0064	NA	NA	NA	2.21132256501015e-08	40028911	40028911
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40030431	49571068	4571	4411	-0.0147	2.21132256501015e-08	40028911	40028911	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	28	-0.0402	NA	NA	NA	1.94280291142128e-06	122211	127113
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.6648	1.94280291142128e-06	122211	127113	1.94244842186449e-06	129544	132689
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	210518	35	35	-0.0849	1.94244842186449e-06	129544	132689	6.82398099580857e-14	207641	216366
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	211285	369273	134	130	0.3606	6.82398099580857e-14	207641	216366	9.80875937428458e-70	358850	377967
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	369425	369425	1	0	NA	9.80875937428458e-70	358850	377967	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	375857	1427392	583	561	-0.0316	NA	NA	NA	1.07258879302332e-11	1427392	1431240
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.7862	1.07258879302332e-11	1427392	1431240	8.37382727455559e-10	1432891	1434970
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	582	-0.0458	8.37382727455559e-10	1432891	1434970	3.31741965374839e-17	2302065	2302065
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9233	3.31741965374839e-17	2302065	2302065	4.62191487448599e-17	2304398	2304398
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2306110	1	0	NA	4.62191487448599e-17	2304398	2304398	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2307282	2708291	388	374	-0.0633	NA	NA	NA	0	2708291	2711273
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	32529976	11449	11029	0.9929	0	2708291	2711273	1.98824793197662e-18	32527969	32529976
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32530785	32535255	2	2	-0.071	1.98824793197662e-18	32527969	32529976	6.84359427786779e-13	32535255	32537055
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32537055	74365882	11160	10731	0.973	6.84359427786779e-13	32535255	32537055	1.04149626087753e-28	74353191	74410307
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	74380482	74603666	50	48	1.4273	1.04149626087753e-28	74353191	74410307	2.50605170172709e-28	74586268	74614591
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	74603910	154582414	22473	21598	0.9877	2.50605170172709e-28	74586268	74614591	0	154578922	154582414
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0238	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3777766	127	121	-3.8762	NA	NA	NA	1.83441827188717e-14	3772482	4272867
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3780462	5593746	13	13	-1.4411	1.83441827188717e-14	3772482	4272867	4.50697120675575e-07	4846477	6711090
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	164	-3.4143	4.50697120675575e-07	4846477	6711090	1.21295737223593e-05	7016814	7247504
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	119	-2.5978	1.21295737223593e-05	7016814	7247504	0.00089036369976539	7418921	7495687
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7606496	12	10	-4.5621	0.00089036369976539	7418921	7495687	4.06820721217674e-13	7606496	7608619
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	19	-2.3639	4.06820721217674e-13	7606496	7608619	0.000126201082343702	7643041	7663037
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7677056	15	14	-3.6387	0.000126201082343702	7643041	7663037	0.00915017304505464	7660965	7688250
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7677946	7709619	20	20	-4.4681	0.00915017304505464	7660965	7688250	1.58315982484961e-13	7708716	7714929
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	26	-2.3163	1.58315982484961e-13	7708716	7714929	0.00364549954727333	7734410	7827650
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-3.3068	0.00364549954727333	7734410	7827650	0.000714040841270695	7870400	7905286
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.0328	0.000714040841270695	7870400	7905286	0.00098233650527688	7914104	7928317
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8956787	278	259	-3.5529	0.00098233650527688	7914104	7928317	1.26218735424638e-05	8863981	8963617
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	34	-4.4948	1.26218735424638e-05	8863981	8963617	4.73498961184034e-05	9133230	10051663
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10501368	69	65	-3.5552	4.73498961184034e-05	9133230	10051663	0.0936343316926729	9171109	10511255
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10503821	10515697	7	6	-2.9084	0.0936343316926729	9171109	10511255	1.34171154642629e-28	10515697	10515697
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	11	-0.3435	1.34171154642629e-28	10515697	10515697	0.000416628316380623	10645500	11673476
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-1.9697	0.000416628316380623	10645500	11673476	0.000134544734523339	11660512	12514978
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12502304	1	0	NA	0.000134544734523339	11660512	12514978	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12511461	12541506	10	9	-4.4884	NA	NA	NA	1.08950650157079e-08	12537944	12546917
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12601014	29	27	-1.7246	1.08950650157079e-08	12537944	12546917	0.000289339659874392	12588578	12601014
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12602617	12611624	6	6	-3.8618	0.000289339659874392	12588578	12601014	2.5537756898464e-18	12611624	12611624
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12625208	6	6	-0.8551	2.5537756898464e-18	12611624	12611624	0.0426204066630771	12615455	12651786
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12627138	12682301	13	13	-1.9637	0.0426204066630771	12615455	12651786	7.19648105354843e-05	12668435	12730281
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-3.7099	7.19648105354843e-05	12668435	12730281	1.73838626955880e-05	12792780	12869489
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	101	-2.2257	1.7383862695588e-05	12792780	12869489	0.000123714622535700	13100625	13136828
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-3.8663	0.0001237146225357	13100625	13136828	1.53001594175723e-05	13147329	13159901
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13262997	33	33	-2.5796	1.53001594175723e-05	13147329	13159901	1.22945685178286e-14	13254711	13285595
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14342834	363	347	-3.9481	1.22945685178286e-14	13254711	13285595	3.29949424671390e-14	14321882	14376942
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	93	-3.0251	3.2994942467139e-14	14321882	14376942	2.75465525760083e-10	14500820	14526446
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.75465525760083e-10	14500820	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	22	-1.2612	NA	NA	NA	0.00015939950967822	14569287	14644293
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14703568	26	25	-2.8278	0.00015939950967822	14569287	14644293	4.30925825922286e-05	14644293	14708015
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14705129	14875973	39	35	-4.1879	4.30925825922286e-05	14644293	14708015	0.000234297157262940	14823549	15067468
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	14883615	1	0	NA	0.00023429715726294	14823549	15067468	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15273305	118	112	-3.1852	NA	NA	NA	0.000434667293082209	15205160	15280555
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15274383	15334366	44	41	-4.0777	0.000434667293082209	15205160	15280555	8.8880667138663e-06	15327001	15334366
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15335578	15348526	8	8	-2.5578	8.8880667138663e-06	15327001	15334366	0.00094441808035257	15348526	15376350
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15350821	15433122	55	49	-3.8613	0.00094441808035257	15348526	15376350	1.10990042550980e-07	15431247	15433122
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.6627	1.1099004255098e-07	15431247	15433122	1.53770414077121e-06	15447091	15452656
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	31	-3.8615	1.53770414077121e-06	15447091	15452656	8.0540604848699e-08	15517551	15531144
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15558235	23	23	-2.2083	8.0540604848699e-08	15517551	15531144	0.000114802385041420	15552815	15558235
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15559959	15566377	5	5	-4.4345	0.00011480238504142	15552815	15558235	9.32849616054777e-21	15566377	15566377
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15583573	5	5	-1.3354	9.32849616054777e-21	15566377	15566377	1.79927810815235e-05	15583573	15595870
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	53	-3.7324	1.79927810815235e-05	15583573	15595870	0.000123648181843094	15829553	15985027
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	98	-2.7946	0.000123648181843094	15829553	15985027	3.57581153679493e-15	16143653	16201830
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	22139807	996	936	-3.7495	3.57581153679493e-15	16143653	16201830	1.02576574047579e-06	22051284	22139807
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.7592	1.02576574047579e-06	22051284	22139807	2.31092997075288e-38	22177335	22179794
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22178964	1	0	NA	2.31092997075288e-38	22177335	22179794	NA	NA	NA
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22268552	28	28	-4.657	NA	NA	NA	3.04800202542784e-06	22252795	22395796
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22877495	46	41	-3.5893	3.04800202542784e-06	22252795	22395796	0.0276466560454609	22780866	22908342
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22930737	18	17	-4.3991	0.0276466560454609	22780866	22908342	4.67738488735874e-25	22926726	25737663
MSK_252152915752_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	78	-1.1619	4.67738488735874e-25	22926726	25737663	NA	NA	NA
