Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16643433	5767	5604	-0.0147	NA	NA	NA	2.54120437926475e-06	16604893	16663329
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16646752	16963812	28	27	-0.3465	2.54120437926475e-06	16604893	16663329	7.64782643351373e-08	16799711	17155989
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	21530950	1911	1840	-0.0223	7.64782643351373e-08	16799711	17155989	5.08476748456967e-10	21503933	21561785
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21532455	21685945	30	30	0.3137	5.08476748456967e-10	21503933	21561785	2.31528714829223e-05	21576546	21711832
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21685978	71649745	19715	19176	-0.0058	2.31528714829223e-05	21576546	21711832	7.46059797729078e-08	71640016	71659023
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	71651079	71690520	20	19	0.4681	7.46059797729078e-08	71640016	71659023	1.87985135061161e-06	71682078	71710260
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	71692689	72536231	422	410	0.0427	1.87985135061161e-06	71682078	71710260	3.1930553768031e-12	72533804	72539143
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72579311	15	14	0.7158	3.1930553768031e-12	72533804	72539143	4.39218850678631e-13	72568009	72596993
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150823073	17557	17093	0.0033	4.39218850678631e-13	72568009	72596993	2.87838054412217e-86	150823073	150836484
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.2277	2.87838054412217e-86	150823073	150836484	4.0700579735475e-91	150848509	150851439
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2681	-0.0022	4.0700579735475e-91	150848509	150851439	5.33472129078509e-11	157133150	157133150
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.6638	5.33472129078509e-11	157133150	157133150	4.00336791127343e-10	157136342	157136342
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	215744111	21246	20661	-0.0032	4.00336791127343e-10	157136342	157136342	1.94626655859379e-11	215731606	215747707
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215745459	215789712	25	25	0.4957	1.94626655859379e-11	215731606	215747707	2.15123344102671e-11	215781961	215801464
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215792169	243700961	10238	9947	0.0039	2.15123344102671e-11	215781961	215801464	3.48227821249724e-11	243698335	243707118
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243702540	243702540	1	0	NA	3.48227821249724e-11	243698335	243707118	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243703653	243717078	9	9	-0.8084	NA	NA	NA	5.86414179514551e-11	243711918	243720139
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	243718709	247186514	1391	1365	0.013	5.86414179514551e-11	243711918	243720139	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35821494	12024	11722	-0.0113	NA	NA	NA	2.87802926270373e-16	35821494	35821494
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.6928	2.87802926270373e-16	35821494	35821494	7.86654476904259e-12	35844884	35844884
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	853	-0.0137	7.86654476904259e-12	35844884	35844884	3.11308158681038e-23	37800512	37818455
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.7467	3.11308158681038e-23	37800512	37818455	9.86859061118177e-25	37847519	37859985
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5659	0.0062	9.86859061118177e-25	37847519	37859985	1.91713053234679e-07	52583578	52600588
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8937	1.91713053234679e-07	52583578	52600588	1.96791338221861e-07	52635695	52642716
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	115249749	17393	16898	-0.0064	1.96791338221861e-07	52635695	52642716	7.19614920286345e-08	115247758	115249749
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115251898	115258615	5	5	-0.9298	7.19614920286345e-08	115247758	115249749	1.12994225003573e-17	115258615	115260545
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115260545	242689978	41692	40622	0.0027	1.12994225003573e-17	115258615	115260545	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10489	-0.0142	NA	NA	NA	3.73396821444926e-21	32074432	32074432
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.2753	3.73396821444926e-21	32074432	32074432	7.4371589618669e-20	32080848	32080848
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	133189686	32911	32023	-0.0049	7.4371589618669e-20	32080848	32080848	1.89221935012183e-05	133187633	133189686
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.2692	1.89221935012183e-05	133187633	133189686	1.11338771422062e-05	133194685	133197276
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9524	0.0031	1.11338771422062e-05	133194685	133197276	7.66500045992431e-52	164005577	164005577
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.2986	7.66500045992431e-52	164005577	164005577	8.65656008637763e-18	164027724	164027724
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.6001	8.65656008637763e-18	164027724	164027724	4.25514822316094e-14	164101776	164126256
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	196835413	11132	10789	0.0059	4.25514822316094e-14	164101776	164126256	1.53791570086359e-12	196806091	196907040
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196952514	27	27	-0.4898	1.53791570086359e-12	196806091	196907040	3.45206915001775e-12	196945209	196969782
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196957322	199329592	956	927	0.0198	3.45206915001775e-12	196945209	196969782	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	70207908	18566	18056	-0.0028	NA	NA	NA	1.78936224080603e-49	70207908	70207908
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70216172	70216707	2	2	-3.5144	1.78936224080603e-49	70207908	70207908	1.78806001276783e-48	70216707	70216707
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	191153613	36593	35652	0.0117	1.78806001276783e-48	70216707	70216707	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3881	-0.0345	NA	NA	NA	1.6539261773128e-49	12857302	12857302
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-3.4163	1.6539261773128e-49	12857302	12857302	1.15030736034322e-47	12873052	12873052
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	24340539	3202	3111	0.0036	1.15030736034322e-47	12873052	12873052	6.62146811072776e-08	24334887	24340539
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	24356807	24369784	4	4	-1.0087	6.62146811072776e-08	24334887	24340539	2.06638193985587e-07	24369784	24374270
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	24374270	96641706	20215	19635	0.0069	2.06638193985587e-07	24369784	24374270	1.17324116442863e-07	96591433	96699297
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	96650646	96776333	20	20	0.4679	1.17324116442863e-07	96591433	96699297	2.9341733307149e-08	96747387	96817497
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	96780406	180644810	26348	25574	-0.0059	2.9341733307149e-08	96747387	96817497	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	54	0.0495	NA	NA	NA	2.21741061543915e-07	230588	252939
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	307231	36	33	-0.3367	2.21741061543915e-07	230588	252939	3.54793057909817e-07	292329	331014
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	309211	32548736	11584	11255	0.0019	3.54793057909817e-07	292329	331014	1.01983630703550e-121	32548736	32588005
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	17	-1.8642	1.0198363070355e-121	32548736	32588005	9.95427629999139e-117	32626619	32633691
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	8073	-0.0109	9.9542762999914e-117	32626619	32633691	9.35766493979942e-74	54035000	54035000
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.483	9.35766493979942e-74	54035000	54035000	1.03941785713555e-72	54042734	54042734
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	139643729	25591	24865	0.0131	1.03941785713555e-72	54042734	54042734	1.78127784406116e-69	139643729	139643729
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-3.4062	1.78127784406116e-69	139643729	139643729	4.87690531243025e-69	139648318	139648318
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	170753106	10531	10222	-0.0078	4.87690531243025e-69	139648318	139648318	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	25945672	8744	8469	0.0068	NA	NA	NA	1.01905173000956e-08	25945469	25945672
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25946290	25949466	4	4	-1.0659	1.01905173000956e-08	25945469	25945672	2.37080607277786e-15	25949466	25950020
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	25950020	109217320	26213	25527	0.0048	2.37080607277786e-15	25949466	25950020	6.2574846025295e-101	109217320	109217320
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-4.1221	6.2574846025295e-101	109217320	109217320	4.12200602083658e-98	109233214	109233214
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	125831554	7474	7262	0.0151	4.12200602083658e-98	109233214	109233214	2.55669672610957e-41	125831554	125831554
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-2.677	2.55669672610957e-41	125831554	125831554	4.45259460555441e-41	125837524	125837524
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	158821263	14254	13838	-0.0053	4.45259460555441e-41	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	-0.0494	NA	NA	NA	1.95067164755410e-37	581533	581533
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.9693	1.9506716475541e-37	581533	581533	7.1869584270756e-37	588865	588865
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2207	-0.0133	7.1869584270756e-37	588865	588865	6.70693128000349e-08	6909487	7327293
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	8137794	9	9	-0.6753	6.70693128000349e-08	6909487	7327293	6.71095494877346e-09	7790934	8145219
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8139999	9533226	482	473	0.0231	6.71095494877346e-09	7790934	8145219	2.78532035023067e-06	9531510	9533226
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-0.9886	2.78532035023067e-06	9531510	9533226	4.06696030535093e-05	9538031	9540987
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	16905145	2511	2444	-0.0075	4.06696030535093e-05	9538031	9540987	1.02959969841943e-06	16895128	16913050
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16907218	16924394	8	8	0.6756	1.02959969841943e-06	16895128	16913050	4.14369766217725e-25	16918780	16932367
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16926053	146264846	39160	38016	0.002	4.14369766217725e-25	16918780	16932367	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	4892878	1832	1777	0.0129	NA	NA	NA	3.38595538966399e-18	4881265	4894693
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4894693	4936528	16	15	-0.7631	3.38595538966399e-18	4881265	4894693	4.69101835863892e-17	4933485	4955465
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4947148	39146895	10883	10559	0.0038	4.69101835863892e-17	4933485	4955465	1.53898723295443e-07	39091349	43776365
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	47002187	9	9	0.6803	1.53898723295443e-07	39091349	43776365	3.47205411222387e-09	43599449	67859114
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	70926188	332	321	-0.0279	3.47205411222387e-09	43599449	67859114	3.17595292106781e-28	70926188	70926188
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.4868	3.17595292106781e-28	70926188	70926188	1.76537235220421e-24	70930528	70930528
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9648	-0.0055	1.76537235220421e-24	70930528	70930528	1.14058657066901e-16	100348045	100348045
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.0703	1.14058657066901e-16	100348045	100348045	3.22718088109484e-16	100350814	100350814
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	130451027	11099	10805	-0.0175	3.22718088109484e-16	100350814	100350814	9.20632697466e-07	130439987	130461269
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130452519	130477748	13	12	0.5398	9.20632697466e-07	130439987	130461269	1.00116919308163e-07	130465664	130486114
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130481285	137352394	2732	2658	-0.0291	1.00116919308163e-07	130465664	130486114	8.86424993796258e-14	137352394	137352394
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.8	8.86424993796258e-14	137352394	137352394	1.37523473952280e-12	137356880	137356880
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1065	-0.0379	1.3752347395228e-12	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9441	-0.0011	NA	NA	NA	9.44228276422905e-09	27038538	27038538
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.5044	9.44228276422905e-09	27038538	27038538	4.09379223682758e-09	27041812	27041812
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1522	0.0257	4.09379223682758e-09	27041812	27041812	3.26072329584662e-176	31284926	31284926
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-5.3518	3.26072329584662e-176	31284926	31284926	1.65679706811630e-173	31291525	31291525
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	45480572	3160	3073	-2e-04	1.6567970681163e-173	31291525	31291525	5.32552795406765e-16	45458783	46391653
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45487335	46529536	62	62	-0.3629	5.32552795406765e-16	45458783	46391653	4.16962605899213e-20	46518863	46556477
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46530848	69835856	6626	6440	0.0018	4.16962605899213e-20	46518863	46556477	9.6769884887548e-12	69834520	69837432
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69837432	69841183	3	3	1.3513	9.6769884887548e-12	69834520	69837432	1.63502277207829e-10	69839583	69841183
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	77917893	3446	3354	0.006	1.63502277207829e-10	69839583	69841183	2.00900464071859e-31	77917893	77917893
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.7845	2.00900464071859e-31	77917893	77917893	7.06828285733375e-30	77928669	77928669
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19658	-0.019	7.06828285733375e-30	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	190215	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	192960	5733442	2132	2079	-0.0487	NA	NA	NA	9.54072726046214e-09	5718917	5742476
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5734978	5766615	20	18	-0.5766	9.54072726046214e-09	5718917	5742476	4.31109075757041e-11	5760117	5777496
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	134450318	43150	42006	-0.0112	4.31109075757041e-11	5760117	5777496	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3643	-0.0051	NA	NA	NA	5.34468930781279e-28	9516067	9543817
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	1.1076	5.34468930781279e-28	9516067	9543817	4.33170516970916e-28	9578398	9604633
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	130694393	40760	39618	0.0087	4.33170516970916e-28	9578398	9604633	4.23713422588903e-21	130690343	130694393
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2267	4.23713422588903e-21	130690343	130694393	1.89792155138719e-06	130701040	130718440
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	624	-0.0193	1.89792155138719e-06	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	30730	0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19475864	53	49	-0.2893	NA	NA	NA	8.7310149179038e-08	19448755	19553991
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19478367	69086125	17575	17067	0.0109	8.7310149179038e-08	19448755	19553991	2.30327928308240e-152	69086125	69086125
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-5.0932	2.3032792830824e-152	69086125	69086125	3.51139745969079e-157	69092211	69092211
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	105632168	14023	13623	-0.0185	3.51139745969079e-157	69092211	69092211	1.88548325760605e-25	105622008	105736164
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	48	0.4998	1.88548325760605e-25	105622008	105736164	8.14671604992217e-10	105848335	105856972
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	5	-0.8882	8.14671604992217e-10	105848335	105856972	2.02218974080218e-06	105856972	105881893
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	173	0.0549	2.02218974080218e-06	105856972	105881893	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2435	NA	NA	NA	9.77290462824267e-10	18452491	18692865
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19806497	98	98	-0.8556	9.77290462824267e-10	18452491	18692865	4.86781614438547e-09	19465359	19839695
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19819961	19986234	27	25	-1.3709	4.86781614438547e-09	19465359	19839695	0.00578732984605651	19927496	20009685
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19988304	20308014	27	25	-1.0314	0.00578732984605651	19927496	20009685	6.87608960070608e-52	20088256	20310916
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	41637456	7352	7168	-0.0066	6.87608960070608e-52	20088256	20310916	7.858829436036e-09	41625154	41638388
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41638388	41720966	11	11	0.6499	7.858829436036e-09	41625154	41638388	1.32482324868163e-08	41718512	41817158
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41723580	74669752	14191	13815	-0.0045	1.32482324868163e-08	41718512	41817158	8.75281513797446e-77	74669752	74669752
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	3	-3.6019	8.75281513797446e-77	74669752	74669752	4.71925406685304e-79	74680439	74680439
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	99632987	9333	9076	-0.0196	4.71925406685304e-79	74680439	74680439	4.26727176972405e-08	99630163	99632987
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.4387	4.26727176972405e-08	99630163	99632987	1.91408524920727e-07	99635701	99636724
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	263	0	1.91408524920727e-07	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54348362	13695	13297	-0.0067	NA	NA	NA	1.38436485373736e-11	54340649	54353978
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-0.7413	1.38436485373736e-11	54340649	54353978	4.26112273492705e-11	54368717	54400475
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	57203733	1203	1165	-0.0409	4.26112273492705e-11	54368717	54400475	1.29584344586074e-08	57201427	57203733
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.4032	1.29584344586074e-08	57201427	57203733	1.76526991804055e-07	57206772	57206772
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3315	0.0153	1.76526991804055e-07	57206772	57206772	1.47648932959081e-07	68685696	68710277
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.6428	1.47648932959081e-07	68685696	68710277	8.01562662725067e-07	68751390	68847568
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2130	-2e-04	8.01562662725067e-07	68751390	68847568	1.05465225062777e-53	75093957	75093957
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.0326	1.05465225062777e-53	75093957	75093957	3.60775146477098e-63	75100865	75100865
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	588	-0.0529	3.60775146477098e-63	75100865	75100865	3.11199133681919e-17	76923844	76929598
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	0.8474	3.11199133681919e-17	76923844	76929598	3.84325934828878e-14	76940218	76944661
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88690571	4512	4418	-0.0384	3.84325934828878e-14	76940218	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	411	0.0117	NA	NA	NA	1.42950957552675e-06	1025525	1027248
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	0.9178	1.42950957552675e-06	1025525	1027248	3.40379443538004e-06	1030766	1032051
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1903358	434	415	0.0314	3.40379443538004e-06	1030766	1032051	1.49239524959362e-09	1901302	1906319
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1909874	6	6	0.9337	1.49239524959362e-09	1901302	1906319	4.71454951900817e-10	1906391	1911059
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1910544	31443186	11175	10864	-0.0013	4.71454951900817e-10	1906391	1911059	1.49712763418073e-06	31421370	31471890
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31447686	31503774	22	22	-0.4031	1.49712763418073e-06	31421370	31471890	1.82068582821042e-07	31479804	31906639
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1762	0.0129	1.82068582821042e-07	31479804	31906639	3.85949122514027e-17	36672710	36673853
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.1919	3.85949122514027e-17	36672710	36673853	9.32195367015273e-18	36684619	36686013
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1954	0.0125	9.32195367015273e-18	36684619	36686013	1.94724201139355e-26	41504832	41527705
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41704093	64	63	0.4582	1.94724201139355e-26	41504832	41527705	1.90079993958965e-24	41697532	42147225
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	58435991	5914	5735	0.0149	1.90079993958965e-24	41697532	42147225	1.97185928221438e-06	58427073	58441144
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58439971	1	0	NA	1.97185928221438e-06	58427073	58441144	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58441144	58452260	6	6	0.7746	NA	NA	NA	1.21166918767089e-06	58448749	58459873
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	58454995	1	0	NA	1.21166918767089e-06	58448749	58459873	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58458306	63340660	2064	2004	0.0128	NA	NA	NA	2.10851424041426e-06	63330475	63349378
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	63345067	63367357	12	12	0.5437	2.10851424041426e-06	63330475	63349378	7.7139815237456e-07	63358845	63376847
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	63370162	76214811	4675	4551	-0.0026	7.7139815237456e-07	63358845	63376847	2.40728237996287e-05	76206682	76214811
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	76218706	76227620	5	5	0.7522	2.40728237996287e-05	76206682	76214811	6.68044461548163e-06	76227620	76233933
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	76229547	78653545	1004	976	-0.0355	6.68044461548163e-06	76227620	76233933	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22312	-0.0104	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	481	-0.0188	NA	NA	NA	4.84686835798436e-21	1398325	1398325
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.208	4.84686835798436e-21	1398325	1398325	1.05142364312909e-19	1400840	1400840
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4560	0.0085	1.05142364312909e-19	1400840	1400840	1.69819167973215e-10	11448975	11448975
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.6339	1.69819167973215e-10	11448975	11448975	6.44704862790031e-10	11452390	11452390
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	48211296	10781	10526	0.0073	6.44704862790031e-10	11452390	11452390	1.1426702322285e-11	48122394	48279312
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48276273	48536890	13	12	-0.7096	1.1426702322285e-11	48122394	48279312	6.87724101633624e-13	48531935	48549634
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48548254	59414898	5087	4943	0.0129	6.87724101633624e-13	48531935	48549634	3.10743240208473e-14	59412581	59421197
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.8165	3.10743240208473e-14	59412581	59421197	2.37612912718755e-12	59434159	59440274
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1920	-0.0154	2.37612912718755e-12	59434159	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	570	-0.0378	NA	NA	NA	2.56641024711087e-50	1506379	1516966
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.7118	2.56641024711087e-50	1506379	1516966	9.07735337273814e-53	1525300	1531162
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20384	-0.0193	9.07735337273814e-53	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13055	-0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	16084	-0.0198	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	755	-0.0517	NA	NA	NA	9.34313227723655e-14	1427338	1431240
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.3698	9.34313227723655e-14	1427338	1431240	1.29486879897833e-15	1432891	1432953
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	61	-0.1487	1.29486879897833e-15	1432891	1432953	3.71093492416436e-08	1528179	1528282
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.9295	3.71093492416436e-08	1528179	1528282	5.42103078383611e-06	1530474	1534998
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2708291	935	909	-0.0504	5.42103078383611e-06	1530474	1534998	0	2708113	2711273
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43862	1.0148	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.0315	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.4866	NA	NA	NA	1.15050689710314e-19	3219200	3772482
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8131	1.15050689710314e-19	3219200	3772482	8.32034321390175e-10	5422507	6711090
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.0183	8.32034321390175e-10	5422507	6711090	0.00576326300281396	6998513	7197846
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7249762	48	46	-2.2077	0.00576326300281396	6998513	7197846	0.00176599171188580	7237274	7249762
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7250951	7256919	4	4	-4.8955	0.0017659917118858	7237274	7249762	1.50482579711694e-05	7256919	7259689
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7258171	7495687	76	75	-1.9896	1.50482579711694e-05	7256919	7259689	3.69854681098278e-15	7461576	7590569
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	74	-3.5915	3.69854681098278e-15	7461576	7590569	5.25875937382434e-07	7711759	7729757
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-1.8496	5.25875937382434e-07	7711759	7729757	0.00156824480496958	7755522	7821554
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7855856	28	28	-2.9849	0.00156824480496958	7755522	7821554	8.95461804656006e-05	7847379	7866716
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7859390	7914104	12	11	-1.4807	8.95461804656006e-05	7847379	7866716	3.16751317012076e-07	7911990	7930528
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8280065	84	82	-3.3678	3.16751317012076e-07	7911990	7930528	9.92827865940068e-06	8230756	8292347
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8324291	13	12	-1.7296	9.92827865940068e-06	8230756	8292347	0.000237009165858834	8300654	8341218
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8956787	181	178	-3.1879	0.000237009165858834	8300654	8341218	0.000216298292075795	8852334	8961669
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9133230	29	28	-4.1556	0.000216298292075795	8852334	8961669	3.69193130209226e-05	9119912	10004173
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9135034	9135034	1	0	NA	3.69193130209226e-05	9119912	10004173	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9145335	10513747	81	80	-3.143	NA	NA	NA	3.21009591399202e-15	10511255	10550419
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	3.21009591399202e-15	10511255	10550419	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	19	-0.8867	NA	NA	NA	4.76490056450241e-06	11660512	12514978
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.4253	4.76490056450241e-06	11660512	12514978	2.57692128377618e-05	12532441	12550566
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-1.5454	2.57692128377618e-05	12532441	12550566	3.05674657949358e-09	12651786	12700767
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.2741	3.05674657949358e-09	12651786	12700767	6.80092950457298e-07	12796639	12863434
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12839975	1	0	NA	6.80092950457298e-07	12796639	12863434	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12843307	13128515	111	108	-1.8159	NA	NA	NA	2.7629798775263e-35	13109337	13140274
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14358464	416	402	-3.2862	2.7629798775263e-35	13109337	13140274	1.37798726110618e-08	14321882	14407293
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	87	-2.4882	1.37798726110618e-08	14321882	14407293	8.84207084051778e-06	14496442	14528771
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	8.84207084051778e-06	14496442	14528771	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-0.7308	NA	NA	NA	6.02926178716003e-05	14545228	14549297
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14555872	5	5	-2.9007	6.02926178716003e-05	14545228	14549297	4.5722346146706e-06	14554415	14555872
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14557473	14579298	8	8	-1.0301	4.5722346146706e-06	14554415	14555872	0.0220837016485135	14579298	14689490
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14707011	29	29	-2.5489	0.0220837016485135	14579298	14689490	0.000354660514789558	14687556	14713609
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14708015	14883615	37	34	-3.7228	0.000354660514789558	14687556	14713609	1.53927260075171e-05	14849277	14994704
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15284717	128	127	-2.5904	1.53927260075171e-05	14849277	14994704	7.9092538997633e-06	15251900	15313932
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15432050	96	92	-3.4147	7.9092538997633e-06	15251900	15313932	7.69194762868961e-07	15426319	15432050
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15433122	15447091	7	7	-1.2092	7.69194762868961e-07	15426319	15432050	0.000624200464152176	15447091	15460238
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15915466	120	118	-3.1394	0.000624200464152176	15447091	15460238	0.0653066529340807	15580942	16102267
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	158	-2.6891	0.0653066529340807	15580942	16102267	4.00490587875481e-07	16195788	16680383
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16399608	1	0	NA	4.00490587875481e-07	16195788	16680383	NA	NA	NA
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16404836	21036503	670	654	-3.2773	NA	NA	NA	5.30608881328582e-06	21026715	21042490
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054605	7	7	-0.9583	5.30608881328582e-06	21026715	21042490	2.70865590120144e-06	21048365	21060047
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	253	-3.1968	2.70865590120144e-06	21048365	21060047	4.86449897024043e-05	22044579	22139807
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.4307	4.86449897024043e-05	22044579	22139807	1.11931469984266e-18	22177335	22178964
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22776089	47	46	-3.88	1.11931469984266e-18	22177335	22178964	0.000851621068622963	22393417	22856903
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22780866	25737663	48	48	-3.1223	0.000851621068622963	22393417	22856903	2.15575721882337e-20	22926726	26877235
MSK_252152915754_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	78	-1.1368	2.15575721882337e-20	22926726	26877235	NA	NA	NA
