Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	54860193	21023	20492	0.0093	NA	NA	NA	1.21025173442958e-11	54860193	54860193
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54866506	3	3	-1.086	1.21025173442958e-11	54860193	54860193	2.80056002213545e-12	54866506	54876067
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72537426	6868	6682	-0.0074	2.80056002213545e-12	54866506	54876067	0	72537426	72537426
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	-4.2654	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	85745222	4044	3941	2e-04	0	72579311	72579311	2.30014785846957e-08	85735211	85745222
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85753561	85776171	13	13	-0.4209	2.30014785846957e-08	85735211	85745222	1.00815454621258e-07	85776171	85787136
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85778723	108533257	7071	6906	0.0049	1.00815454621258e-07	85776171	85787136	2.26792379443315e-243	108533257	108535814
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-4.864	2.26792379443315e-243	108533257	108535814	6.21570790411741e-169	108537259	108538662
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110033018	573	556	0.0271	6.21570790411741e-169	108537259	108538662	4.43584756687356e-07	110023268	110033018
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.0611	4.43584756687356e-07	110023268	110033018	1.13344673873633e-07	110039388	110041712
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	143702972	3916	3831	-0.0115	1.13344673873633e-07	110039388	110041712	2.42859541546708e-13	143637892	143718575
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143706304	143820820	61	59	-0.2686	2.42859541546708e-13	143637892	143718575	1.03050262579944e-12	143808283	143893163
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143822873	144322074	133	132	0.0358	1.03050262579944e-12	143808283	143893163	1.67417166530612e-118	144320529	144337287
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144337287	144544352	60	60	-0.8745	1.67417166530612e-118	144320529	144337287	5.31006862069002e-141	144542687	144970789
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144970789	146297175	385	379	-0.0162	5.31006862069002e-141	144542687	144970789	3.13816480864434e-19	146283719	147313991
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	148081741	40	38	-0.4093	3.13816480864434e-19	146283719	147313991	5.29539874717509e-24	147508217	148088434
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	151026228	1344	1300	0.0224	5.29539874717509e-24	147508217	148088434	0	151026228	151026228
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.8891	0	151026228	151026228	0	151036435	151036435
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2609	0.0187	0	151036435	151036435	2.59789301018335e-121	157133150	157133150
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.2052	2.59789301018335e-121	157133150	157133150	3.91867055231886e-130	157136342	157136342
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11067	-0.0034	3.91867055231886e-130	157136342	157136342	1.6499769475413e-126	185979586	185979586
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-4.1473	1.6499769475413e-126	185979586	185979586	1.14884628917538e-130	185988138	185988138
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1924	0.0201	1.14884628917538e-130	185988138	185988138	6.21620988896991e-10	194972886	195015837
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195097118	12	12	-0.4632	6.21620988896991e-10	194972886	195015837	9.4435747292851e-09	195062793	195106051
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	196570662	569	556	0.0124	9.4435747292851e-09	195062793	195106051	2.82346472703037e-05	196569486	196570662
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	3	-0.7197	2.82346472703037e-05	196569486	196570662	9.69822796668226e-17	196576204	196580475
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	247186514	19030	18555	4e-04	9.69822796668226e-17	196576204	196580475	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20231737	5876	5738	-0.0218	NA	NA	NA	6.5510093396424e-14	20231737	20231737
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.386	6.5510093396424e-14	20231737	20231737	1.09520503924927e-12	20236210	20236210
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	34543992	5644	5490	-5e-04	1.09520503924927e-12	20236210	20236210	4.06008106598275e-21	34539740	34552935
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.5916	4.06008106598275e-21	34539740	34552935	6.58999532699909e-22	34582272	34595734
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37789939	1364	1324	-0.006	6.58999532699909e-22	34582272	34595734	2.30324905189702e-09	37775420	37812045
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37858379	28	28	-0.3187	2.30324905189702e-09	37775420	37812045	6.13838667671896e-11	37843380	37874432
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	39541647	785	766	0.0147	6.13838667671896e-11	37843380	37874432	5.13333814637709e-08	39536812	39541647
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39546042	39548509	2	2	1.0641	5.13333814637709e-08	39536812	39541647	8.9082241297428e-08	39548509	39550075
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39550075	52600588	5013	4897	0.007	8.9082241297428e-08	39548509	39550075	1.03409626909612e-10	52588009	52600588
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.03409626909612e-10	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8759	NA	NA	NA	1.68639742605370e-10	52635695	52639605
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25688	-8e-04	1.6863974260537e-10	52635695	52639605	0	146571330	146571330
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.9219	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242505261	32683	31870	0.0012	0	146592775	146592775	2.68727334830695e-12	242478404	242528768
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242506262	242677011	61	59	0.2493	2.68727334830695e-12	242478404	242528768	0.0693457014410304	242595315	242682950
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677069	242689978	5	5	-0.0806	0.0693457014410304	242595315	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10547	-0.0054	NA	NA	NA	4.10031100013511e-34	32074432	32074432
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.14	4.10031100013511e-34	32074432	32074432	2.10391567765874e-32	32080848	32080848
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1837	0.0064	2.10391567765874e-32	32080848	32080848	2.41445191482659e-19	37951628	37953375
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.9531	2.41445191482659e-19	37951628	37953375	6.45429171483711e-19	37961110	37963014
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	133189686	31022	30319	-0.0015	6.45429171483711e-19	37961110	37963014	2.31626783520602e-19	133189686	133189686
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6646	2.31626783520602e-19	133189686	133189686	9.01485038036546e-20	133194685	133194685
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9541	0.0026	9.01485038036546e-20	133194685	133194685	1.87241142260427e-103	164005577	164005577
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.3727	1.87241142260427e-103	164005577	164005577	5.41361416163036e-89	164027724	164027724
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164105613	19	19	-0.4251	5.41361416163036e-89	164027724	164027724	1.07790768318612e-10	164093750	164123806
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164107951	166512920	587	559	0.0097	1.07790768318612e-10	164093750	164123806	1.5995095939565e-12	166502853	166512920
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166528663	166559166	6	5	-0.8955	1.5995095939565e-12	166502853	166512920	2.25409876818816e-14	166559166	166566095
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166566095	191219222	8530	8345	0.0029	2.25409876818816e-14	166559166	166566095	2.07468343081275e-238	191219222	191219222
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-5.6483	2.07468343081275e-238	191219222	191219222	1.09586787004699e-221	191222891	191222891
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	199329592	2992	2941	-0.0058	1.09586787004699e-221	191222891	191222891	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	18016	-0.0045	NA	NA	NA	5.54436494007386e-19	68899247	69075140
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.6246	5.54436494007386e-19	68899247	69075140	8.20873487157459e-20	69153675	69656183
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173224400	31193	30466	0.0051	8.20873487157459e-20	69153675	69656183	2.38847358270229e-24	173224400	173224400
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.8431	2.38847358270229e-24	173224400	173224400	2.11228964935811e-22	173228860	173228860
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	190	0.0369	2.11228964935811e-22	173228860	173228860	1.50331744905526e-11	173660684	173660684
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.334	1.50331744905526e-11	173660684	173660684	3.71936865384590e-13	173666072	173666072
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3674	0.0025	3.7193686538459e-13	173666072	173666072	3.60096656619745e-61	186676034	186676034
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.8238	3.60096656619745e-61	186676034	186676034	1.72736013286059e-58	186680176	186680176
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1518	-0.0128	1.72736013286059e-58	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12837736	3972	3868	-0.0266	NA	NA	NA	4.29099050012012e-10	12823441	13269140
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12840501	13319637	13	13	0.4415	4.29099050012012e-10	12823441	13269140	3.46397932903467e-09	12866038	13345654
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13325291	45890934	9130	8923	-0.0065	3.46397932903467e-09	12866038	13345654	2.48314731669425e-13	45878978	45890934
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45894590	45916407	6	6	-0.7905	2.48314731669425e-13	45878978	45890934	5.50494614953594e-13	45916407	45924620
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45924620	140533456	27103	26459	0.0023	5.50494614953594e-13	45916407	45924620	1.98462526809775e-08	140532277	140533456
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140541178	3	3	-0.9186	1.98462526809775e-08	140532277	140533456	2.10451831313184e-08	140541178	140542704
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140542704	180342860	13419	13122	-0.0042	2.10451831313184e-08	140541178	140542704	7.1849288057709e-11	180192214	180344964
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6265	7.1849288057709e-11	180192214	180344964	1.02577221075765e-12	180357210	180362342
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	110	-0.017	1.02577221075765e-12	180357210	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	236535	54	52	-0.0327	NA	NA	NA	6.83802326957522e-29	232366	240119
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	47	-0.5625	6.83802326957522e-29	232366	240119	5.0994988648854e-57	322557	329100
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32558677	11576	11302	0.0052	5.0994988648854e-57	322557	329100	5.16830732062926e-33	32558677	32558677
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	1.1275	5.16830732062926e-33	32558677	32558677	6.57501120916829e-14	32595402	32597877
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	37	0.1033	6.57501120916829e-14	32595402	32597877	0.00189218626230648	32700719	32721872
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	0.6411	0.00189218626230648	32700719	32721872	1.17475599360437e-09	32721872	32732764
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8073	0.0028	1.17475599360437e-09	32721872	32732764	1.67533059540925e-25	54035000	54035000
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.5527	1.67533059540925e-25	54035000	54035000	7.65247750623563e-26	54042734	54042734
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6291	0.0031	7.65247750623563e-26	54042734	54042734	2.63712102162572e-10	79008946	79028813
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.4821	2.63712102162572e-10	79008946	79028813	3.48077443405042e-10	79079988	79112799
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	132154299	16306	15897	0.0037	3.48077443405042e-10	79079988	79112799	1.09223005792877e-11	132154299	132154299
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-1.2958	1.09223005792877e-11	132154299	132154299	1.24829546237308e-11	132159522	132159522
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	170753106	13372	13057	-0.0037	1.24829546237308e-11	132159522	132159522	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	249	-0.0061	NA	NA	NA	4.85174143864949e-08	1033418	1036135
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.1772	4.85174143864949e-08	1033418	1036135	1.61156740541772e-09	1038517	1038517
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	43590850	15227	14885	4e-04	1.61156740541772e-09	1038517	1038517	4.55238920512834e-09	43589344	43590850
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43592620	43597673	3	3	-0.9402	4.55238920512834e-09	43589344	43590850	1.40126011367483e-08	43597673	43601254
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43601254	64523575	4072	3975	-0.0071	1.40126011367483e-08	43597673	43601254	1.19533279232570e-10	64523575	64523575
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.2718	1.1953327923257e-10	64523575	64523575	8.58987780293415e-11	64532949	64532949
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	133433384	26531	25909	0.0089	8.58987780293415e-11	64532949	64532949	1.44181036090062e-17	133432281	133433384
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8125	1.44181036090062e-17	133432281	133433384	4.93494929453817e-19	133448277	133453811
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141405145	3696	3591	0.007	4.93494929453817e-19	133448277	133453811	2.76562840549956e-07	141387458	141417702
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141406414	141443577	20	20	-0.3163	2.76562840549956e-07	141387458	141417702	1.00783198589182e-06	141432778	141462167
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141446728	142156165	292	287	0.035	1.00783198589182e-06	141432778	141462167	2.05444128844557e-15	142156165	142156165
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142166710	3	3	-1.3366	2.05444128844557e-15	142156165	142156165	9.5987538540114e-11	142166710	142166710
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-3.7463	9.5987538540114e-11	142166710	142166710	4.5158360735827e-98	142167908	142167908
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	147702365	2339	2277	-0.0022	4.5158360735827e-98	142167908	142167908	9.12678334468099e-66	147702365	147702365
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.0735	9.126783344681e-66	147702365	147702365	1.01636744467433e-61	147707161	147707161
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158620919	4216	4103	-0.022	1.01636744467433e-61	147707161	147707161	1.34908692608602e-08	158604095	158744659
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158733294	158821263	22	21	0.3408	1.34908692608602e-08	158604095	158744659	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	27386549	9133	8928	-0.0145	NA	NA	NA	3.24650507483356e-43	27384641	27386549
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27388404	27419819	15	15	-0.9164	3.24650507483356e-43	27384641	27386549	4.9863300818924e-47	27419819	27422112
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27422112	31810293	1564	1533	0.0042	4.9863300818924e-47	27419819	27422112	1.77769093203193e-06	31805305	31810293
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31811829	31815721	3	3	-0.7803	1.77769093203193e-06	31805305	31810293	1.45883480993439e-06	31815721	31817573
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31817573	39350798	2359	2305	0.0044	1.45883480993439e-06	31815721	31817573	0	39350798	39352361
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	-4.4989	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30684	-1e-04	0	39504332	39505256	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2419	-0.0049	NA	NA	NA	8.21340399114053e-11	6681606	6685358
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-0.9953	8.21340399114053e-11	6681606	6685358	2.94225709408174e-10	6698290	6701392
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	38745124	10250	10010	-0.0011	2.94225709408174e-10	6698290	6701392	1.49445707781210e-10	38738205	39048058
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	38758232	38758232	1	0	NA	1.4944570778121e-10	38738205	39048058	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39048058	39130211	5	5	-0.7586	NA	NA	NA	0.00158647515268135	39088753	43599449
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	70221479	31	31	-0.3209	0.00158647515268135	39088753	43599449	2.69261031195751e-11	70205801	70235853
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70223138	70223138	1	0	NA	2.69261031195751e-11	70205801	70235853	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70225166	70926188	310	305	-0.0157	NA	NA	NA	3.13545289380706e-39	70926188	70926188
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.0965	3.13545289380706e-39	70926188	70926188	5.51031096642858e-32	70930528	70930528
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9688	-0.0056	5.51031096642858e-32	70930528	70930528	1.48428714159126e-29	100348045	100348045
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.033	1.48428714159126e-29	100348045	100348045	2.00628595318762e-29	100350814	100350814
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5428	-0.011	2.00628595318762e-29	100350814	100350814	3.09551468126213e-09	116122595	116124007
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116132839	3	3	-0.9531	3.09551468126213e-09	116122595	116124007	2.37303770023536e-08	116132839	116137111
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	137352394	8294	8106	-0.0035	2.37303770023536e-08	116132839	116137111	8.75492712553646e-21	137352394	137352394
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.7884	8.75492712553646e-21	137352394	137352394	1.47619752933029e-22	137356880	137356880
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	138250679	355	341	0.0024	1.47619752933029e-22	137356880	137356880	1.41534968407969e-08	138246907	138250679
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138252639	138253816	2	2	-1.1107	1.41534968407969e-08	138246907	138250679	2.78168713299094e-06	138253816	138256535
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138255962	138255962	1	0	NA	2.78168713299094e-06	138253816	138256535	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138256535	140145683	745	731	-0.0211	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4576	-0.0116	NA	NA	NA	1.16922543036464e-12	13553503	13553503
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.3534	1.16922543036464e-12	13553503	13553503	2.25618537404062e-13	13556315	13556315
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4937	-3e-04	2.25618537404062e-13	13556315	13556315	9.45089191952973e-156	27038538	27038538
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.5196	9.45089191952973e-156	27038538	27038538	3.10128819614782e-148	27041812	27041812
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46396163	4733	4621	-0.0016	3.10128819614782e-148	27041812	27041812	1.65586000940104e-15	45478162	46414875
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46399272	46558272	63	62	-0.2708	1.65586000940104e-15	45478162	46414875	4.99222620137246e-15	46529536	47064707
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46561216	69835856	6616	6446	-0.0071	4.99222620137246e-15	46529536	47064707	2.81424028861081e-10	69834520	69837432
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69837432	69841183	3	3	0.9897	2.81424028861081e-10	69834520	69837432	8.75897039632535e-10	69839583	69843195
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	70949263	529	515	0.0134	8.75897039632535e-10	69839583	69843195	4.42337795759133e-08	70947915	70949263
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.7474	4.42337795759133e-08	70947915	70949263	6.8365844646169e-14	70960187	70966034
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	135285645	23129	22577	-0.0097	6.8365844646169e-14	70960187	70966034	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2086	-0.0071	NA	NA	NA	1.14125602484157e-20	5734978	5742476
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6836	1.14125602484157e-20	5734978	5742476	6.41028718055157e-24	5763749	5769776
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18896166	5219	5092	-0.0075	6.41028718055157e-24	5763749	5769776	2.51036520674676e-37	18896166	18896166
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-1.3352	2.51036520674676e-37	18896166	18896166	4.83725264944528e-38	18917191	18917191
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	46096588	8173	7987	-0.0122	4.83725264944528e-38	18917191	18917191	2.06760515356323e-08	46095353	46096588
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46099212	46103800	4	4	0.7734	2.06760515356323e-08	46095353	46096588	6.13001959123983e-08	46103800	46106795
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46105220	55123719	1351	1314	0.011	6.13001959123983e-08	46103800	46106795	8.75208102276102e-29	55112618	55127355
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55207305	37	37	0.4829	8.75208102276102e-29	55112618	55127355	2.50388340724321e-30	55203706	55219985
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	92655841	13556	13225	7e-04	2.50388340724321e-30	55203706	55219985	1.31305523718897e-13	92655841	92655841
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92662312	92669239	3	3	-1.1499	1.31305523718897e-13	92655841	92655841	1.08114287252099e-10	92669239	92669239
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92685617	93000699	130	127	0.0179	1.08114287252099e-10	92669239	92669239	1.15521168760762e-08	93000699	93000699
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93003167	93005517	2	2	-1.2876	1.15521168760762e-08	93000699	93000699	1.29451317976893e-11	93005517	93005517
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93008346	107284914	4595	4491	-0.001	1.29451317976893e-11	93005517	93005517	1.39506114161815e-213	107284914	107284914
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-5.3791	1.39506114161815e-213	107284914	107284914	1.32789503906912e-218	107292148	107292148
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134105421	9973	9733	-0.0134	1.32789503906912e-218	107292148	107292148	3.2426262638704e-20	134105421	134105421
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134109095	134111832	2	2	-1.6738	3.2426262638704e-20	134105421	134105421	2.79211245127597e-21	134111832	134111832
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134113671	134349586	72	67	-0.0533	2.79211245127597e-21	134111832	134111832	1.11359148409712e-07	134316289	134372904
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134353931	134450318	26	26	0.2361	1.11359148409712e-07	134316289	134372904	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3641	-0.0028	NA	NA	NA	1.01558074201579e-29	9516067	9543817
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9528590	1	0	NA	1.01558074201579e-29	9516067	9543817	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9531133	9599999	12	11	0.8897	NA	NA	NA	2.46689677974763e-27	9578398	9604633
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11116883	574	560	-0.0049	2.46689677974763e-27	9578398	9604633	8.08020685004682e-290	11116883	11116883
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.9253	8.08020685004682e-290	11116883	11116883	0	11130871	11130871
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	46992235	11148	10915	0.0064	0	11130871	11130871	4.48083196825548e-110	46992235	46992235
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-3.9124	4.48083196825548e-110	46992235	46992235	1.29491401872529e-111	46996769	46996769
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	80662066	11856	11574	0.0128	1.29491401872529e-111	46996769	46996769	4.9365179520408e-08	80662066	80662066
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.0856	4.9365179520408e-08	80662066	80662066	3.45985148869697e-17	80666751	80668695
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	130694393	17172	16741	0.0015	3.45985148869697e-17	80666751	80668695	1.20989207235918e-16	130694393	130694393
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.1026	1.20989207235918e-16	130694393	130694393	1.25217745176561e-07	130701040	130718440
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	633	0.008	1.25217745176561e-07	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11940	0	NA	NA	NA	3.30332938535228e-68	49964838	49964838
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.0505	3.30332938535228e-68	49964838	49964838	1.12692163497633e-67	49971732	49971732
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	89659397	10072	9837	9e-04	1.12692163497633e-67	49971732	49971732	4.50579235189967e-36	89659397	89659397
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.244	4.50579235189967e-36	89659397	89659397	4.10140246223161e-36	89662326	89662326
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4671	-0.0041	4.10140246223161e-36	89662326	89662326	1.49461966142189e-53	100690991	100690991
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.7422	1.49461966142189e-53	100690991	100690991	3.50694896345364e-51	100693892	100693892
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4442	-0.0169	3.50694896345364e-51	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19475864	53	50	-0.2498	NA	NA	NA	1.06134791240601e-11	19453177	19542388
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19478367	34674458	5697	5549	0.013	1.06134791240601e-11	19453177	19542388	3.75910055830588e-17	34666996	34674458
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.2948	3.75910055830588e-17	34666996	34674458	1.00321338519245e-17	34683810	34683810
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	74152538	14198	13839	0.0017	1.00321338519245e-17	34683810	34683810	5.73712738598825e-08	74152538	74152538
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74154117	74155334	2	2	-1.0882	5.73712738598825e-08	74152538	74152538	1.25276417395610e-07	74155334	74157425
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74157425	105607572	11692	11419	-0.0081	1.2527641739561e-07	74155334	74157425	2.0702006816331e-12	105602602	105609466
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105681007	11	11	0.569	2.0702006816331e-12	105602602	105609466	4.72243672501298e-08	105681007	105724133
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105848335	45	44	-0.0786	4.72243672501298e-08	105681007	105724133	1.97616725701665e-17	105846004	105872360
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105850033	105850033	1	0	NA	1.97616725701665e-17	105846004	105872360	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-1.5017	NA	NA	NA	1.01228962303367e-24	105881893	105881893
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	172	-0.0275	1.01228962303367e-24	105881893	105881893	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2043	NA	NA	NA	1.19969842339685e-19	18452491	18452491
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-0.7609	1.19969842339685e-19	18452491	18452491	1.57018384756888e-16	18835660	18837737
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	0.0815	1.57018384756888e-16	18835660	18837737	1.08002559430811e-20	18848213	18848213
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	18867285	6	6	-0.929	1.08002559430811e-20	18848213	18848213	0.000177371156963276	18857376	19371539
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18874259	20088256	131	128	-0.6291	0.000177371156963276	18857376	19371539	1.03522034435093e-160	20065525	20316992
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	20308014	1	0	NA	1.03522034435093e-160	20065525	20316992	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32514939	3671	3582	-0.0205	NA	NA	NA	7.03980450213936e-44	32456500	32517839
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32594200	24	23	-0.7653	7.03980450213936e-44	32456500	32517839	2.17940083146666e-46	32583146	32661846
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	100298352	27470	26865	-0.004	2.17940083146666e-46	32583146	32661846	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	21382540	7256	7072	-1e-04	NA	NA	NA	6.12289078136984e-08	21240874	21482409
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21477973	21508397	12	11	0.4719	6.12289078136984e-08	21240874	21482409	2.55382938772587e-07	21493483	21515797
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21510738	22541389	281	276	0.031	2.55382938772587e-07	21493483	21515797	9.2334126818152e-06	22338034	22541389
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22547406	22561536	3	3	0.768	9.2334126818152e-06	22338034	22541389	4.33150843477502e-08	22561536	22584012
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22567551	34329518	3157	3082	0.0147	4.33150843477502e-08	22561536	22584012	1.62883209515049e-25	34302966	34340574
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34602318	50	48	0.4165	1.62883209515049e-25	34302966	34340574	8.50647866649044e-31	34584793	34623136
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	57203733	4150	4061	-0.0117	8.50647866649044e-31	34584793	34623136	4.70481004739175e-08	57203733	57203733
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.0834	4.70481004739175e-08	57203733	57203733	1.45900011491246e-08	57206772	57208375
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3306	0.0177	1.45900011491246e-08	57206772	57208375	3.14546943816038e-10	68687301	68710277
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.5122	3.14546943816038e-10	68687301	68710277	2.37190711984095e-08	68751390	68849229
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2144	-0.0099	2.37190711984095e-08	68751390	68849229	1.11119442857496e-129	75093957	75093957
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.5194	1.11119442857496e-129	75093957	75093957	2.13615086599716e-127	75100865	75100865
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	590	-0.0418	2.13615086599716e-127	75100865	75100865	0	76925748	76929598
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.91	0	76925748	76929598	0	76938723	76940218
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4409	-0.0204	0	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	0.0321	NA	NA	NA	1.00728580985045e-15	1028979	1028979
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5569	1.00728580985045e-15	1028979	1028979	3.46945964189672e-15	1030766	1030766
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	425	0.0482	3.46945964189672e-15	1030766	1030766	4.55913883759262e-17	1904451	1904451
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.3594	4.55913883759262e-17	1904451	1904451	3.35856261992916e-18	1906391	1906391
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31471890	11186	10908	0.0101	3.35856261992916e-18	1906391	1906391	3.71329724681708e-07	31457889	31474518
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31473186	31503774	13	13	-0.4089	3.71329724681708e-07	31457889	31474518	1.07727670929517e-07	31493990	31905266
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1761	0.0199	1.07727670929517e-07	31493990	31905266	1.54019389204964e-223	36673853	36673853
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-3.3133	1.54019389204964e-223	36673853	36673853	2.53252596356524e-233	36684619	36684619
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1986	0.0258	2.53252596356524e-233	36684619	36684619	5.37009663600609e-23	41555295	41573295
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	44	0.4167	5.37009663600609e-23	41555295	41573295	5.10545226109956e-24	41702238	42148637
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13374	0.0135	5.10545226109956e-24	41702238	42148637	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15816	-0.0108	NA	NA	NA	1.18705288055666e-12	53092949	53092949
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.3474	1.18705288055666e-12	53092949	53092949	6.59437126386438e-12	53099601	53099601
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6614	-0.0142	6.59437126386438e-12	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790492	218	211	0.025	NA	NA	NA	2.3755411776766e-06	786616	790492
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	790526	794978	3	3	0.9697	2.3755411776766e-06	786616	790492	5.57913029514716e-08	794978	798817
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	260	0.0546	5.57913029514716e-08	794978	798817	3.63591507886499e-19	1398325	1398325
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.7659	3.63591507886499e-19	1398325	1398325	1.70672612685377e-16	1400840	1400840
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1012	0.0285	1.70672612685377e-16	1400840	1400840	2.09557209543359e-07	3588389	3591120
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.152	2.09557209543359e-07	3588389	3591120	8.62729397343129e-09	3593646	3596968
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	11448975	3634	3545	0.0507	8.62729397343129e-09	3593646	3596968	6.53227151241426e-15	11448975	11448975
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.5993	6.53227151241426e-15	11448975	11448975	4.23217021736532e-16	11452390	11452390
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	56825794	14700	14357	0.0277	4.23217021736532e-16	11452390	11452390	1.14289039776499e-08	56822197	56828073
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.6014	1.14289039776499e-08	56822197	56828073	2.54610422493794e-08	56837593	56844304
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59410642	1170	1141	0.0297	2.54610422493794e-08	56837593	56844304	1.61415776446633e-10	59402188	59411618
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59411618	59440262	15	13	0.549	1.61415776446633e-10	59402188	59411618	2.06238950237738e-11	59434159	59442709
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63788698	1993	1936	0.0152	2.06238950237738e-11	59434159	59442709	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	572	-0.0129	NA	NA	NA	7.45869227040496e-200	1516966	1521410
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-3.4534	7.45869227040496e-200	1516966	1521410	1.39634035606241e-256	1525300	1531162
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3603	0.0025	1.39634035606241e-256	1525300	1531162	7.11526795071392e-09	12089020	12095485
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12127349	3	3	0.9195	7.11526795071392e-09	12089020	12095485	2.70189092414477e-08	12127349	12139235
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12139235	62419534	17290	16866	-0.0131	2.70189092414477e-08	12127349	12139235	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13114	-0.0068	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2918	0.0048	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-3.7499	0	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6391	-0.005	0	22720195	22725305	3.74193344954904e-13	35472378	35472378
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.3821	3.74193344954904e-13	35472378	35472378	8.69220259265157e-12	35476942	35476942
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1154	0.0327	8.69220259265157e-12	35476942	35476942	1.04727460862814e-33	37621766	37621766
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.3011	1.04727460862814e-33	37621766	37621766	9.83540974552335e-06	37626069	37626069
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37681158	19	19	0.0476	9.83540974552335e-06	37626069	37626069	2.22284770636192e-11	37675709	37681158
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37683516	37685496	2	0	NA	2.22284770636192e-11	37675709	37681158	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.7752	NA	NA	NA	1.06474303164119e-29	37715385	37718669
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5627	-4e-04	1.06474303164119e-29	37715385	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1182356	690	680	0.0115	NA	NA	NA	3.20572713764899e-12	1179171	1297192
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1274736	1307285	12	12	-0.602	3.20572713764899e-12	1179171	1297192	1.20504688263952e-14	1303815	1322183
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1311168	1427392	85	84	0.0672	1.20504688263952e-14	1303815	1322183	9.74715446714247e-22	1427392	1431240
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.3413	9.74715446714247e-22	1427392	1431240	2.99793088392194e-20	1432891	1432953
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	971	-0.0099	2.99793088392194e-20	1432891	1432953	0	2708113	2711273
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43996	0.9982	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	0.0495	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	125	-4.3971	NA	NA	NA	4.73211568212096e-14	3777766	4272867
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5672441	12	11	-1.8484	4.73211568212096e-14	3777766	4272867	5.21744660324286e-06	5422507	6730882
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7054924	174	168	-3.9894	5.21744660324286e-06	5422507	6730882	0.00855714293586615	6983447	7210986
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7259689	54	53	-3.2123	0.00855714293586615	6983447	7210986	0.0398750458564567	7210018	7289497
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	22	-2.0566	0.0398750458564567	7210018	7289497	0.000440868657075487	7284775	7333934
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7653082	82	81	-3.4658	0.000440868657075487	7284775	7333934	7.52478299209358e-05	7608619	7659535
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	34	-4.5795	7.52478299209358e-05	7608619	7659535	5.23692566856001e-19	7707621	7712882
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	25	-2.6467	5.23692566856001e-19	7707621	7712882	8.12309338452385e-07	7755522	7798534
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7859390	29	29	-4.0033	8.12309338452385e-07	7755522	7798534	4.55593861097723e-07	7852359	7865557
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	11	-2.3469	4.55593861097723e-07	7852359	7865557	8.93934296375595e-13	7911990	7914104
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7936024	6	6	-4.8115	8.93934296375595e-13	7911990	7914104	0.00294004110242515	7928317	7951683
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7938700	7985612	9	9	-3.6384	0.00294004110242515	7928317	7951683	0.0012831333973225	7985459	7992095
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992095	7996758	3	3	-1.9247	0.0012831333973225	7985459	7992095	0.000422372295773296	7996758	8016395
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10515697	372	352	-4.2541	0.000422372295773296	7996758	8016395	2.86001274723950e-47	10513747	10515697
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.3994	2.8600127472395e-47	10513747	10515697	0.0194764747722647	10631941	10655750
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11673476	5	4	-1.9649	0.0194764747722647	10631941	10655750	0.000173098870831933	10655750	11698871
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	13	-4.4962	0.000173098870831933	10655750	11698871	1.47583639741657e-05	12537944	12557151
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-2.407	1.47583639741657e-05	12537944	12557151	2.86077895780488e-07	12638022	12700767
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.3614	2.86077895780488e-07	12638022	12700767	0.000660791175865018	12764220	12859309
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12926941	33	32	-3.1906	0.000660791175865018	12764220	12859309	0.0258169558411886	12887023	13045641
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	76	-2.3874	0.0258169558411886	12887023	13045641	0.000282541589387878	13078432	13153117
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	45	-3.3853	0.000282541589387878	13078432	13153117	1.38930826512677e-11	13232295	13296819
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14122129	332	317	-4.3591	1.38930826512677e-11	13232295	13296819	8.48034601295416e-06	14118164	14122129
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.8454	8.48034601295416e-06	14118164	14122129	3.97834831438657e-10	14143748	14169526
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	27	-4.6374	3.97834831438657e-10	14143748	14169526	0.000456760847980298	14335755	14374313
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14407293	31	30	-3.5105	0.000456760847980298	14335755	14374313	0.00068121234096006	14388689	14407293
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14413754	5	4	-0.9955	0.00068121234096006	14388689	14407293	1.83989070991042e-05	14413754	14419087
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14415559	14508021	60	55	-3.5609	1.83989070991042e-05	14413754	14419087	1.86616631125021e-05	14500052	14553021
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.86616631125021e-05	14500052	14553021	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14644293	35	34	-2.1912	NA	NA	NA	1.55051634888417e-15	14596156	14684159
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14883615	56	55	-4.3866	1.55051634888417e-15	14596156	14684159	0.00437843812566754	14771401	15139441
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15303557	140	134	-3.6954	0.00437843812566754	14771401	15139441	2.19840000730075e-06	15261976	15315201
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15304956	15408015	67	65	-4.5901	2.19840000730075e-06	15261976	15315201	0.0820982709010803	15381088	15431247
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15409110	1	0	NA	0.0820982709010803	15381088	15431247	NA	NA	NA
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15410566	15433122	17	17	-3.8563	NA	NA	NA	0.00391669068593848	15425463	15433122
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.763	0.00391669068593848	15425463	15433122	1.16981708938182e-13	15447091	15448670
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	31	-4.2868	1.16981708938182e-13	15447091	15448670	3.38378807965685e-18	15521958	15524675
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15541293	10	10	-1.7533	3.38378807965685e-18	15521958	15524675	0.00273213023240497	15538983	15552815
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15542314	15583573	23	23	-3.4644	0.00273213023240497	15538983	15552815	0.00439321583969503	15551462	15642822
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15920478	57	56	-4.453	0.00439321583969503	15551462	15642822	3.50910638005768e-07	15854496	15980898
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16199764	118	109	-3.4106	3.50910638005768e-07	15854496	15980898	3.47792744812046e-14	16176562	16231057
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16200557	21036503	714	691	-4.2721	3.47792744812046e-14	16176562	16231057	1.39567276152714e-07	21034708	21043581
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.7948	1.39567276152714e-07	21034708	21043581	1.93924573519769e-08	21043581	21057446
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22157319	262	247	-4.2818	1.93924573519769e-08	21043581	21057446	1.7007404965503e-09	22058759	22157319
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	7	-1.8833	1.7007404965503e-09	22058759	22157319	5.31534074732733e-19	22177335	22178964
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	88	-4.4668	5.31534074732733e-19	22177335	22178964	3.07905241052477e-93	22926726	23283689
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.1772	3.07905241052477e-93	22926726	23283689	3.61836603164462e-08	26943701	26950080
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.8222	3.61836603164462e-08	26943701	26950080	0.000748899882823177	26965406	26998633
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	11	-1.6243	0.000748899882823177	26965406	26998633	0.000265799342886356	27007874	27019256
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.9347	0.000265799342886356	27007874	27019256	1.81245418770306e-11	27039222	27063070
MSK_252152915153_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.6389	1.81245418770306e-11	27039222	27063070	NA	NA	NA
