Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72525842	27888	27398	0.0084	NA	NA	NA	4.14650615322086e-24	72523186	72534975
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72539143	7	7	-0.4846	4.14650615322086e-24	72523186	72534975	8.4123326196947e-10	72536231	72539143
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72571158	11	11	0.4801	8.4123326196947e-10	72536231	72539143	1.95923176083858e-15	72559751	72574479
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72574479	92012759	6102	5993	-0.0076	1.95923176083858e-15	72559751	72574479	9.26700070083324e-23	92012759	92012759
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92013987	92020793	4	4	-0.9814	9.26700070083324e-23	92012759	92012759	9.58823040536604e-23	92020793	92020793
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92022217	109373255	5302	5215	-0.0077	9.58823040536604e-23	92020793	92020793	8.36391291084503e-10	109369942	109373255
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.9274	8.36391291084503e-10	109369942	109373255	3.50971486140984e-10	109376249	109376249
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110015739	294	285	0.0188	3.50971486140984e-10	109376249	109376249	0.058525791648308	109933650	110015739
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110023268	110033018	2	2	0.3809	0.058525791648308	109933650	110015739	2.0902180171095e-25	110033018	110033018
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	0.8011	2.0902180171095e-25	110033018	110033018	2.76838968708406e-11	110041712	110041712
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	116029725	2221	2172	0.0058	2.76838968708406e-11	110041712	110041712	1.67696959356795e-09	116029725	116029725
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	0.903	1.67696959356795e-09	116029725	116029725	2.94625948972783e-10	116033402	116033402
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	147311437	2335	2296	-0.0057	2.94625948972783e-10	116033402	116033402	7.44705062659431e-19	146297175	147352661
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147313991	147847659	35	34	-0.3062	7.44705062659431e-19	146297175	147352661	1.01931943099412e-21	147471665	148088285
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150819879	1256	1238	0.0155	1.01931943099412e-21	147471665	148088285	0	150819879	150819879
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	3.0009	0	150819879	150819879	8.07198530344229e-155	150851439	150851439
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	0.0162	8.07198530344229e-155	150851439	150851439	5.52039896988308e-07	151022179	151028700
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7578	5.52039896988308e-07	151022179	151028700	7.96814107486178e-13	151033188	151036435
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	167483267	6789	6683	0.0034	7.96814107486178e-13	151033188	151036435	9.40660406235481e-14	167481271	167493768
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5549	9.40660406235481e-14	167481271	167493768	1.22032367291424e-14	167507882	167520743
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	173060997	2177	2147	-0.0142	1.22032367291424e-14	167507882	167520743	8.17441657490468e-10	173059045	173060997
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-0.7794	8.17441657490468e-10	173059045	173060997	5.65366517467094e-10	173067337	173068576
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	185979586	5029	4947	-0.0078	5.65366517467094e-10	173067337	173068576	7.4116381449493e-34	185979586	185979586
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.7262	7.4116381449493e-34	185979586	185979586	8.01391868213267e-36	185988138	185988138
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200602881	4138	4075	8e-04	8.01391868213267e-36	185988138	185988138	1.01663440556826e-14	200594055	200618814
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200668993	23	23	-0.3276	1.01663440556826e-14	200594055	200618814	3.73155936891947e-14	200654700	200673525
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	227875096	9938	9780	-6e-04	3.73155936891947e-14	200654700	200673525	2.02645923037868e-13	227872808	227875096
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.7638	2.02645923037868e-13	227872808	227875096	1.59961502051882e-13	227882805	227889619
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246755298	7354	7232	-0.0022	1.59961502051882e-13	227882805	227889619	4.0052249035724e-28	246751473	246811355
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246769018	246864725	30	30	0.3514	4.0052249035724e-28	246751473	246811355	1.00901252442518e-17	246857496	246882156
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246875016	247186514	96	96	-0.0127	1.00901252442518e-17	246857496	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	17074335	5088	4999	-0.0061	NA	NA	NA	4.27077623210806e-28	17074335	17074335
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17082016	17082016	1	0	NA	4.27077623210806e-28	17074335	17074335	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17087488	17102047	4	4	-1.111	NA	NA	NA	1.46696168802022e-28	17102047	17102047
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17105804	34539740	6427	6313	0.0011	1.46696168802022e-28	17102047	17102047	2.16417573404631e-44	34539603	34543992
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34542224	34542224	1	0	NA	2.16417573404631e-44	34539603	34543992	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34543992	34582272	17	17	-0.6694	NA	NA	NA	1.79910407338814e-45	34580533	34583814
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	37789939	1366	1350	-0.003	1.79910407338814e-45	34580533	34583814	2.62770980722238e-12	37773896	37810001
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.2833	2.62770980722238e-12	37773896	37810001	8.2572785053909e-13	37846240	37866455
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5685	0.0026	8.2572785053909e-13	37846240	37866455	0	52600588	52600588
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	0	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-4.967	NA	NA	NA	0	52635695	52635695
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25874	-0.0027	0	52635695	52635695	0	146571330	146571330
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-6.282	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242501239	32682	32104	-0.0063	0	146592775	146592775	2.08344686064124e-17	242483535	242521765
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242682950	65	64	0.2115	2.08344686064124e-17	242483535	242521765	0.00634225562978813	242656260	242682950
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242686945	242689978	2	2	-0.2088	0.00634225562978813	242656260	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10600	-0.0118	NA	NA	NA	1.41594325646371e-21	32074432	32074432
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.3445	1.41594325646371e-21	32074432	32074432	1.78552468804825e-20	32080848	32080848
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5329	-3e-04	1.78552468804825e-20	32080848	32080848	1.47752927882366e-15	47460892	47460892
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.1775	1.47752927882366e-15	47460892	47460892	3.15071885045873e-15	47466921	47466921
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	53001678	2442	2393	0.0256	3.15071885045873e-15	47466921	47466921	1.07400711722283e-36	53001678	53001678
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-1.0941	1.07400711722283e-36	53001678	53001678	2.09766538662692e-35	53011885	53011885
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	143391483	28582	28052	-0.0064	2.09766538662692e-35	53011885	53011885	1.90683147331099e-106	143389308	143400306
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143400172	143573178	59	57	0.548	1.90683147331099e-106	143389308	143400306	7.23677075234974e-33	143570148	143577210
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143577210	143638605	30	30	-0.0402	7.23677075234974e-33	143570148	143577210	1.35009817059715e-11	143635550	143646392
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143646392	143663566	8	8	0.5868	1.35009817059715e-11	143635550	143646392	7.4514991240958e-17	143661394	143665472
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143665472	164005577	6145	6035	-0.0067	7.4514991240958e-17	143661394	143665472	1.14669144885029e-137	164005577	164005577
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.1244	1.14669144885029e-137	164005577	164005577	7.18390231075799e-13	164012645	164027724
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5568	7.18390231075799e-13	164012645	164027724	1.79929866855651e-36	164105613	164112873
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	199329592	12116	11927	-0.002	1.79929866855651e-36	164105613	164112873	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	9815760	3392	3344	0.0173	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.0004	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	40921056	8360	8218	-0.0081	0	9842644	9842644	5.90682247575502e-19	40921056	40921056
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	40922497	40926332	3	3	-1.0352	5.90682247575502e-19	40921056	40921056	3.2673196763434e-18	40926332	40926332
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	40928576	70150576	6804	6675	-0.0111	3.2673196763434e-18	40926332	40926332	2.97835296671691e-25	70150576	70150576
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70294312	5	5	-0.9405	2.97835296671691e-25	70150576	70150576	2.67277482492317e-25	70294312	70294312
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	87193253	5798	5699	-0.0086	2.67277482492317e-25	70294312	70294312	1.90056077505972e-07	87191469	87193253
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87196350	87198840	2	2	-0.8307	1.90056077505972e-07	87191469	87193253	1.28602688212767e-07	87198840	87201443
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87201443	103995556	5837	5736	-0.0132	1.28602688212767e-07	87198840	87201443	1.78023956981838e-08	103994390	103995556
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	103998599	104002632	2	2	-0.8723	1.78023956981838e-08	103994390	103995556	1.43315681213675e-08	104002632	104005047
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	104005047	107275274	944	924	-0.004	1.43315681213675e-08	104002632	104005047	5.53567770116897e-12	107275274	107275274
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.7182	5.53567770116897e-12	107275274	107275274	3.40196097334275e-12	107281410	107283257
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	173660684	18679	18340	-0.012	3.40196097334275e-12	107281410	107283257	1.19218114533492e-162	173660684	173660684
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.6662	1.19218114533492e-162	173660684	173660684	1.45866766554837e-161	173666072	173666072
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3708	-0.0089	1.45866766554837e-161	173666072	173666072	1.11240539501360e-31	186676034	186676034
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	1.6371	1.1124053950136e-31	186676034	186676034	1.42379953673801e-28	186680176	186680176
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190425991	1358	1342	-0.0108	1.42379953673801e-28	186680176	186680176	2.39424070487171e-07	190424374	190425991
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190431567	190437365	3	3	-0.6938	2.39424070487171e-07	190424374	190425991	9.2472234673011e-08	190437365	190439544
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190439544	191153613	188	183	-0.0388	9.2472234673011e-08	190437365	190439544	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	222	0.0222	NA	NA	NA	1.47397426027383e-11	829954	829954
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-0.9692	1.47397426027383e-11	829954	829954	2.68901576096713e-10	873365	873365
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	104452261	28768	28249	-0.008	2.68901576096713e-10	873365	873365	6.56851824468341e-64	104452261	104452261
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104461541	104528444	12	10	-1.0391	6.56851824468341e-64	104452261	104452261	3.18503047946971e-67	104528444	104528444
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104533570	140533456	11214	11014	-0.0024	3.18503047946971e-67	104528444	104528444	8.11180981547515e-15	140533456	140533456
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.1115	8.11180981547515e-15	140533456	140533456	4.50524594852144e-14	140538666	140538666
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180194323	13419	13182	-0.0028	4.50524594852144e-14	140538666	140538666	1.95155609416570e-11	180194323	180194323
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180346557	3	2	-1.0091	1.9515560941657e-11	180194323	180194323	1.71503308925512e-19	180346557	180346557
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-5.1312	1.71503308925512e-19	180346557	180346557	0	180358977	180358977
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	110	0.0544	0	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	236535	53	52	-0.0124	NA	NA	NA	1.37132197959914e-33	232366	237952
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	46	-0.4502	1.37132197959914e-33	232366	237952	2.62868464302109e-55	323898	329100
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32558677	11576	11364	-0.0026	2.62868464302109e-55	323898	329100	0	32558677	32563252
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	7	-3.019	0	32558677	32563252	4.19703585500375e-30	32595402	32600962
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	36	0.0041	4.19703585500375e-30	32595402	32600962	4.5934124593722e-21	32713363	32713363
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.3733	4.5934124593722e-21	32713363	32713363	1.17858470782168e-88	32728487	32728487
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8103	0.0053	1.17858470782168e-88	32728487	32728487	2.83568347427641e-47	54035000	54035000
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	2	-2.0146	2.83568347427641e-47	54035000	54035000	7.73699324853463e-47	54042734	54042734
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6312	-0.0065	7.73699324853463e-47	54042734	54042734	3.88531602618848e-20	79011979	79028813
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79085247	12	12	-0.5441	3.88531602618848e-20	79011979	79028813	2.24450705545032e-21	79074911	79091850
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79091850	103542517	6709	6601	-0.0043	2.24450705545032e-21	79074911	79091850	3.01279860990295e-38	103540789	103549323
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103544862	103635707	23	23	0.5146	3.01279860990295e-38	103540789	103549323	3.24129732683596e-37	103627777	103639727
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103639727	134629897	10515	10351	-0.0095	3.24129732683596e-37	103627777	103639727	2.58367311982678e-10	134627341	134629897
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	2.58367311982678e-10	134627341	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.7911	NA	NA	NA	1.64745882772798e-10	134635779	134639397
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	151546355	5797	5720	-0.0104	1.64745882772798e-10	134635779	134639397	1.51250153412244e-12	151546355	151546355
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151549525	151552684	3	3	-0.8595	1.51250153412244e-12	151546355	151546355	1.55399679602990e-12	151552684	151554478
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151554478	162502077	3859	3799	-0.0118	1.5539967960299e-12	151552684	151554478	9.08271482929074e-10	162502077	162502077
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-0.9338	9.08271482929074e-10	162502077	162502077	8.25497934056342e-10	162505819	162508430
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	946	-0.0193	8.25497934056342e-10	162505819	162508430	0	165643653	165643653
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-5.6102	0	165643653	165643653	0	165649379	165649379
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	0	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	167120986	649	638	-0.0199	NA	NA	NA	1.00478892374076e-10	167120986	167120986
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	167121009	167128528	2	2	0.9238	1.00478892374076e-10	167120986	167120986	1.71182385154944e-09	167128528	167128528
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	167128828	170753106	1153	1133	-0.0049	1.71182385154944e-09	167128528	167128528	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	40	0.0609	NA	NA	NA	4.17960925331367e-31	244720	244720
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-1.0964	4.17960925331367e-31	244720	244720	2.71465134845048e-35	254342	254342
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	34933965	12398	12189	-0.0026	2.71465134845048e-35	254342	254342	2.58727227809375e-13	34933965	34933965
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34934610	34936476	2	2	-1.0737	2.58727227809375e-13	34933965	34933965	3.97942157103906e-12	34936476	34936476
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34937508	38258332	1155	1135	-0.009	3.97942157103906e-12	34936476	34936476	2.76912324971376e-31	38251281	38269153
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38349033	45	45	-0.3716	2.76912324971376e-31	38251281	38269153	6.02223056574795e-36	38343026	38375502
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38360187	93162991	14803	14583	-0.001	6.02223056574795e-36	38343026	38375502	1.23232590189633e-08	93162991	93162991
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.889	1.23232590189633e-08	93162991	93162991	1.45516049550701e-09	93168978	93168978
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2565	0.0015	1.45516049550701e-09	93168978	93168978	6.18192593620818e-18	100164752	100164752
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.8475	6.18192593620818e-18	100164752	100164752	7.90061355502328e-16	100174991	100178968
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	124767910	10920	10703	-0.0072	7.90061355502328e-16	100174991	100178968	8.44698158276485e-15	124765944	124767910
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	124770083	124773660	3	3	-0.9468	8.44698158276485e-15	124765944	124767910	4.66742893533821e-15	124773660	124773660
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	124775736	133433384	4106	4017	-0.0037	4.66742893533821e-15	124773660	124773660	2.49353962957265e-26	133433384	133433384
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7541	2.49353962957265e-26	133433384	133433384	1.26797132581137e-27	133448277	133448277
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133872990	209	204	-0.0037	1.26797132581137e-27	133448277	133448277	1.06085825514361e-48	133872990	133872990
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133875152	133911760	11	11	-0.8867	1.06085825514361e-48	133872990	133872990	5.70842456413444e-54	133911760	133911760
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133913921	141406414	3477	3423	0.007	5.70842456413444e-54	133911760	133911760	5.75526806896584e-14	141400646	141409512
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141408013	141432778	13	13	-0.4073	5.75526806896584e-14	141400646	141409512	3.13386919008390e-10	141429405	141440184
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141434131	143503317	789	776	-0.0338	3.1338691900839e-10	141429405	141440184	1.08132488144159e-11	143503317	143503317
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143583309	2	2	0.9831	1.08132488144159e-11	143503317	143503317	2.08032604902739e-10	143583309	143583309
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143584350	143584350	1	0	NA	2.08032604902739e-10	143583309	143583309	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	147702365	1850	1817	-0.0132	NA	NA	NA	5.01443125043311e-32	147702365	147702365
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7661	5.01443125043311e-32	147702365	147702365	1.86781639456573e-35	147707161	147707161
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	155990503	2997	2949	0.012	1.86781639456573e-35	147707161	147707161	1.08726377646912e-13	155988048	155990503
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	155994634	156003945	3	3	-0.8906	1.08726377646912e-13	155988048	155990503	2.57715845084822e-12	156003945	156003945
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156006993	158821263	1238	1221	0.0156	2.57715845084822e-12	156003945	156003945	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	0.0334	NA	NA	NA	3.84247559677073e-159	581533	581533
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.871	3.84247559677073e-159	581533	581533	1.04737924951833e-172	588865	588865
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7156900	2271	2233	-0.0077	1.04737924951833e-172	588865	588865	3.10888640992938e-38	7156900	7156900
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	8	-0.9268	3.10888640992938e-38	7156900	7156900	6.96100899515148e-39	7824059	7824059
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5659	-0.0023	6.96100899515148e-39	7824059	7824059	4.18581590877894e-60	25120552	25120552
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.8653	4.18581590877894e-60	25120552	25120552	2.62586120461035e-62	25125700	25125700
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35766	-0.0059	2.62586120461035e-62	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23338535	7999	7866	-0.0108	NA	NA	NA	3.93043124846032e-14	23331804	23338535
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.7654	3.93043124846032e-14	23331804	23338535	2.61970653669858e-13	23365926	23377660
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4969	0.0029	2.61970653669858e-13	23365926	23377660	5.24412191915742e-26	70926188	70926188
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.4934	5.24412191915742e-26	70926188	70926188	1.16778855680382e-26	70930528	70930528
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	129219834	20431	20066	-0.0042	1.16778855680382e-26	70930528	70930528	2.21447865545184e-10	129218343	129219834
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129221786	129224728	3	3	-0.7866	2.21447865545184e-10	129218343	129219834	5.42119916710266e-11	129224728	129226241
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	137352394	3331	3260	0.0218	5.42119916710266e-11	129224728	129226241	3.37258195674050e-33	137352394	137352394
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.7153	3.3725819567405e-33	137352394	137352394	1.81546889540005e-31	137356880	137356880
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1087	0.023	1.81546889540005e-31	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45489823	14457	14196	-0.0028	NA	NA	NA	6.49855411906611e-27	45474003	46396163
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47021415	74	70	0.253	6.49855411906611e-27	45474003	46396163	3.77574293063751e-08	46545343	47064707
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47040444	47938346	47	45	0.4742	3.77574293063751e-08	46545343	47064707	5.69883640053974e-63	47172534	47943524
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47943524	52872222	1342	1320	-0.0098	5.69883640053974e-63	47172534	47943524	1.55711611323547e-39	52872222	52872222
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	52873705	52881683	6	6	-1.0492	1.55711611323547e-39	52872222	52872222	1.28215080481015e-39	52881683	52881683
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	52887550	100676022	16431	16158	-0.0037	1.28215080481015e-39	52881683	52881683	4.91004769538443e-15	100672415	100676022
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.8057	4.91004769538443e-15	100672415	100676022	1.91708526533986e-14	100686787	100693036
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	135285645	12447	12214	-0.0012	1.91708526533986e-14	100686787	100693036	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1744	0.0167	NA	NA	NA	1.49978167311331e-17	4920907	4923300
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.7981	1.49978167311331e-17	4920907	4923300	2.02391966864089e-17	4932214	4934594
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	354	-4e-04	2.02391966864089e-17	4932214	4934594	2.1595722246577e-42	5738494	5741031
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7226	2.1595722246577e-42	5738494	5741031	2.08725669066538e-44	5765438	5766615
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	10180233	1908	1858	0.0041	2.08725669066538e-44	5765438	5766615	2.12454383786383e-11	10180233	10180233
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10185604	10187640	2	2	-1.0195	2.12454383786383e-11	10180233	10180233	7.42980317290419e-12	10187640	10187640
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10189286	18896166	3309	3245	-0.0036	7.42980317290419e-12	10187640	10187640	6.04502127593737e-16	18892456	18896166
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.6796	6.04502127593737e-16	18892456	18896166	4.90262537639696e-16	18917191	18929375
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55129329	9531	9361	-0.0065	4.90262537639696e-16	18917191	18929375	4.52748638351516e-37	55124730	55134486
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55131703	55209626	35	35	0.413	4.52748638351516e-37	55124730	55134486	4.29310448458218e-34	55203706	55219985
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4560	0.0142	4.29310448458218e-34	55203706	55219985	1.17335659379398e-10	66463477	66463477
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9068	1.17335659379398e-10	66463477	66463477	7.04009819739722e-09	66469412	66469412
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81177333	5234	5137	0.0085	7.04009819739722e-09	66469412	66469412	1.72176483539227e-11	81177333	81177333
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-1.0058	1.72176483539227e-11	81177333	81177333	1.62348565424676e-11	81192409	81192409
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	85565280	1711	1685	-0.0062	1.62348565424676e-11	81192409	81192409	1.95488207935169e-19	85565280	85565280
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85567562	85576174	3	3	-1.0595	1.95488207935169e-19	85565280	85565280	2.74107948321252e-19	85576174	85576174
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85580062	134450318	16770	16491	-0.0097	2.74107948321252e-19	85576174	85576174	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2109441	920	904	-0.0065	NA	NA	NA	7.79339694785631e-17	2106791	2109441
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.682	7.79339694785631e-17	2106791	2109441	1.33847262342654e-19	2127537	2128807
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	7897538	2324	2288	0.0041	1.33847262342654e-19	2127537	2128807	9.50009668683742e-07	7868220	7917603
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7899058	7975671	30	28	0.2107	9.50009668683742e-07	7868220	7917603	2.98561287580216e-06	7961626	8013470
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7977034	9523923	461	446	0.0107	2.98561287580216e-06	7961626	8013470	2.08178435347626e-40	9523923	9543817
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	0.8461	2.08178435347626e-40	9523923	9543817	1.04839088780013e-41	9573313	9589725
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	11104973	572	555	-0.0104	1.04839088780013e-41	9573313	9589725	2.36406314377633e-09	11104085	11104973
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	3	-0.7551	2.36406314377633e-09	11104085	11104973	0.000305882514181535	11116883	11128557
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-3.4973	0.000305882514181535	11116883	11128557	0	11140421	11140421
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	129612492	39776	39073	-1e-04	0	11140421	11140421	4.54211363415596e-08	129611181	129612492
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129613999	129616048	2	2	-0.8591	4.54211363415596e-08	129611181	129612492	2.55167066462725e-07	129616048	129617826
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129617826	130943064	495	487	-0.0046	2.55167066462725e-07	129616048	129617826	3.40996952433049e-07	130936199	130943064
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	0.8429	3.40996952433049e-07	130936199	130943064	8.92030409258801e-08	130946248	130946248
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	538	0.016	8.92030409258801e-08	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7226	-0.008	NA	NA	NA	4.11188788147907e-90	37953582	37953582
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.7364	4.11188788147907e-90	37953582	37953582	3.65924094379882e-92	37957844	37957844
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	97327189	18141	17836	-0.0096	3.65924094379882e-92	37957844	37957844	3.99078327142361e-11	97327189	97327189
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-0.9953	3.99078327142361e-11	97327189	97327189	8.75115719828603e-12	97330568	97330568
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	100690991	1597	1557	0.002	8.75115719828603e-12	97330568	97330568	0	100690991	100690991
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-6.495	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4471	-0.007	0	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	21558492	1068	1043	-7e-04	NA	NA	NA	1.03101704991155e-87	21551504	21569676
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21559744	22031369	232	226	-0.2861	1.03101704991155e-87	21551504	21569676	9.7859382612176e-109	22019726	22041571
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22032374	40680589	6349	6238	-0.0022	9.7859382612176e-109	22019726	22041571	5.94974796767019e-18	40676611	40680589
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40726930	7	7	0.6532	5.94974796767019e-18	40676611	40680589	5.70253816161783e-17	40726930	40741934
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	105597555	23986	23541	0.0011	5.70253816161783e-17	40726930	40741934	0	105597555	105597555
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.3772	0	105597555	105597555	1.05904098157025e-102	105632168	105632168
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	49	-0.0348	1.05904098157025e-102	105632168	105632168	1.59825514089853e-12	105856591	105856972
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-1.0377	1.59825514089853e-12	105856591	105856972	6.29749152742297e-15	105875924	105881677
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	175	0.0619	6.29749152742297e-15	105875924	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0334	NA	NA	NA	1.79720016886829e-05	18450562	18741716
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	147	-0.5203	1.79720016886829e-05	18450562	18741716	2.63584057671698e-219	20065525	20308014
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32456500	3671	3608	5e-04	2.63584057671698e-219	20065525	20308014	4.35757593867077e-61	32454294	32514939
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	24	-0.6662	4.35757593867077e-61	32454294	32514939	1.48312545579780e-63	32583146	32664506
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.4831254557978e-63	32583146	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	41638388	3657	3589	0.001	NA	NA	NA	1.23643361487222e-08	41637456	41638388
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41682925	3	3	0.6825	1.23643361487222e-08	41637456	41638388	8.82513715845658e-08	41682925	41682937
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41682937	52517110	4487	4422	-0.0035	8.82513715845658e-08	41682925	41682937	1.332005704082e-08	52511733	52517110
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-0.884	1.332005704082e-08	52511733	52517110	5.76297272175131e-09	52533227	52533227
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	67296930	6587	6458	0.0025	5.76297272175131e-09	52533227	52533227	1.83730093314882e-10	67295527	67296930
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67298848	67307573	3	3	0.7808	1.83730093314882e-10	67295527	67296930	1.32682932871806e-10	67307573	67310476
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67310476	74669752	3119	3052	0.0124	1.32682932871806e-10	67307573	67310476	2.00520667210043e-18	74669752	74669752
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	3	1.0148	2.00520667210043e-18	74669752	74669752	2.79572114087767e-15	74680439	74680439
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	169	0.0227	2.79572114087767e-15	74680439	74680439	2.23359815177598e-18	75115806	75115806
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.3401	2.23359815177598e-18	75115806	75115806	9.82740250833658e-19	75119713	75119713
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	75445222	140	140	-0.0032	9.82740250833658e-19	75119713	75119713	9.61851120848832e-16	75445222	75445222
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75451853	75459179	3	3	-1.0338	9.61851120848832e-16	75445222	75445222	2.75937877771780e-19	75459179	75459179
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75462120	78855195	1345	1326	0.003	2.7593787777178e-19	75459179	75459179	1.11511196338697e-09	78855195	78855195
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	0.9102	1.11511196338697e-09	78855195	78855195	2.58390931700100e-09	78858227	78858227
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	98232932	7031	6906	-0.0021	2.583909317001e-09	78858227	78858227	3.99604621604767e-13	98232932	98232932
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-0.878	3.99604621604767e-13	98232932	98232932	1.42692001873255e-15	98239454	98239454
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	900	0.0013	1.42692001873255e-15	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	20174	0.0085	NA	NA	NA	3.75258340498192e-10	75093957	75093957
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75099083	2	2	0.9595	3.75258340498192e-10	75093957	75093957	1.92579973080505e-11	75099083	75099083
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75100865	76925748	611	596	-0.0082	1.92579973080505e-11	75099083	75099083	0	76925748	76925748
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.5183	0	76925748	76925748	0	76940218	76940218
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4424	0.0037	0	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	411	0.0347	NA	NA	NA	3.31808943504678e-10	1028979	1028979
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.0112	3.31808943504678e-10	1028979	1028979	3.98657384051953e-11	1030766	1030766
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31457889	11618	11394	0.0167	3.98657384051953e-11	1030766	1030766	5.96462058831692e-24	31447686	31462463
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.4618	5.96462058831692e-24	31447686	31462463	7.20364532728727e-25	31492553	31503774
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1787	0.0226	7.20364532728727e-25	31492553	31503774	0	36673853	36673853
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	-3.5754	0	36673853	36673853	1.86022867182018e-187	36684619	36684619
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36785286	47	46	0.0069	1.86022867182018e-187	36684619	36684619	3.12535526465275e-11	36782082	36785286
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36787465	36792511	4	4	0.6183	3.12535526465275e-11	36782082	36785286	5.77574021585442e-08	36792511	36793796
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36793796	41519702	1960	1928	0.0266	5.77574021585442e-08	36792511	36793796	3.07373557621732e-106	41518222	41521544
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41708551	66	64	0.5575	3.07373557621732e-106	41518222	41521544	3.46894390071321e-115	41706870	42142363
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	3.46894390071321e-115	41706870	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	57217753	5514	5416	0.0099	NA	NA	NA	2.32304872088107e-11	57216624	57221543
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	57221543	57226188	4	4	-0.6933	2.32304872088107e-11	57216624	57221543	2.30807600893083e-11	57225755	57230522
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	57230522	78653545	8161	8016	0.0135	2.30807600893083e-11	57225755	57230522	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15920	-0.0082	NA	NA	NA	4.88424361718457e-24	53092949	53092949
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.4318	4.88424361718457e-24	53092949	53092949	1.24392801888475e-23	53099601	53099601
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6643	-0.0052	1.24392801888475e-23	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	216	0.0653	NA	NA	NA	6.69283405023836e-07	790492	790526
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	0.8897	6.69283405023836e-07	790492	790526	1.23884809858160e-07	794978	798817
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	3353960	1199	1170	0.0334	1.2388480985816e-07	794978	798817	1.00754147148085e-12	3353960	3353960
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	1.1267	1.00754147148085e-12	3353960	3353960	2.3663058524811e-14	3356334	3356334
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	11448975	3750	3676	0.0338	2.3663058524811e-14	3356334	3356334	7.80127922000719e-08	11448975	11448975
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	0.8537	7.80127922000719e-08	11448975	11448975	1.77931649679131e-07	11452390	11453579
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	41532062	7974	7861	0.0217	1.77931649679131e-07	11452390	11453579	1.34454182742725e-08	41530835	41532062
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-0.8657	1.34454182742725e-08	41530835	41532062	6.26971890856805e-09	41538649	41542955
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	56823430	6723	6611	0.0294	6.26971890856805e-09	41538649	41542955	0	56823430	56823430
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	7	-5.4725	0	56823430	56823430	0	56840346	56840346
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59246409	1085	1070	0.0196	0	56840346	56840346	2.53685764002545e-09	59244965	59246409
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.7028	2.53685764002545e-09	59244965	59246409	6.03274484853473e-10	59251831	59255421
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414898	86	85	0.056	6.03274484853473e-10	59251831	59255421	4.57685751919321e-25	59414645	59414898
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440262	11	11	-0.6082	4.57685751919321e-25	59414645	59414898	2.96563688667829e-12	59440262	59441741
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	59491509	21	21	-0.1074	2.96563688667829e-12	59440262	59441741	9.45683411959715e-09	59491509	59491509
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-0.9044	9.45683411959715e-09	59491509	59491509	2.13993423624188e-10	59497049	59497049
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1934	0.0143	2.13993423624188e-10	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	0.0038	NA	NA	NA	2.60030438683585e-171	1506379	1506379
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.6404	2.60030438683585e-171	1506379	1506379	1.73243685500384e-164	1532433	1532433
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	18624714	6172	6058	-0.0085	1.73243685500384e-164	1532433	1532433	1.8369812985167e-20	18624714	18624714
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	18626711	18635854	4	4	-0.9405	1.8369812985167e-20	18624714	18624714	8.30217792141101e-22	18635854	18635854
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	18638309	21671310	1104	1091	-0.0125	8.30217792141101e-22	18635854	18635854	6.79890712073574e-17	21671310	21671310
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21682736	21686107	3	3	-0.9599	6.79890712073574e-17	21671310	21671310	3.46809314155055e-16	21686107	21686107
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	21688130	62419534	13700	13502	0.0063	3.46809314155055e-16	21686107	21686107	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	18978210	1932	1897	-0.002	NA	NA	NA	3.35691721727858e-11	18974047	18978210
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18982113	18993605	4	4	0.7036	3.35691721727858e-11	18974047	18978210	6.55429683370025e-11	18993605	18996912
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18996912	46922972	11505	11288	-0.0025	6.55429683370025e-11	18993605	18996912	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	20136668	1833	1797	0.0252	NA	NA	NA	7.54639436729284e-13	20136668	20136668
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20138950	20141979	2	2	-1.0812	7.54639436729284e-13	20136668	20136668	5.97595563984946e-14	20141979	20141979
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20247200	22644243	1146	1126	0.026	5.97595563984946e-14	20141979	20141979	3.20323146448211e-15	22618049	22679305
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22667608	22715919	19	19	-0.3527	3.20323146448211e-15	22618049	22679305	2.47136811890624e-14	22712211	22721042
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22718614	25319178	1331	1308	0.0151	2.47136811890624e-14	22712211	22721042	3.52062869057045e-06	25318098	25320843
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	25320843	25323641	3	3	-0.5989	3.52062869057045e-06	25318098	25320843	1.37168263660629e-06	25322763	25325335
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	25325335	26544534	776	759	0.0161	1.37168263660629e-06	25322763	25325335	4.06507086700228e-11	26544534	26544534
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	26547440	26548861	2	2	-0.9495	4.06507086700228e-11	26544534	26544534	4.39534064340566e-10	26548861	26548861
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	26550204	49571068	11444	11220	0.0179	4.39534064340566e-10	26548861	26548861	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.011	NA	NA	NA	0.0005679245547205	4926	99430
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	106242	8	8	0.4369	0.0005679245547205	4926	99430	1.58707996287348e-06	103089	110101
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	159609	39	39	0.0439	1.58707996287348e-06	103089	110101	7.3453492670772e-10	158967	159609
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	159991	159991	1	0	NA	7.3453492670772e-10	158967	159609	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	162802	163792	3	3	-0.6664	NA	NA	NA	4.61759571093884e-09	163792	164913
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	164913	2672401	1709	1676	0.0274	4.61759571093884e-09	163792	164913	2.39276721853335e-14	2669225	2686115
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.2704	2.39276721853335e-14	2669225	2686115	4.00398820886881e-182	2708291	2708291
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	150453214	43576	42790	0.9401	4.00398820886881e-182	2708291	2708291	6.81546981530715e-24	150451758	150453214
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	150458397	150459075	2	2	-0.0298	6.81546981530715e-24	150451758	150453214	1.09539008205323e-06	150459075	150464030
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	150464030	152655026	883	871	0.9174	1.09539008205323e-06	150459075	150464030	1.80879900181233e-08	152655026	152655026
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.1429	1.80879900181233e-08	152655026	152655026	3.12749381206733e-07	152657445	152669192
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154582414	671	656	0.906	3.12749381206733e-07	152657445	152669192	0	154578922	154582414
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	200	0.0262	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	117	-4.7211	NA	NA	NA	4.71228556217936e-37	3223585	3773948
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.1813	4.71228556217936e-37	3223585	3773948	6.54605025812229e-16	5422507	6688691
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	171	-4.2494	6.54605025812229e-16	5422507	6688691	2.89532947730400e-10	7029972	7189475
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7401540	113	109	-2.9987	2.895329477304e-10	7029972	7189475	4.50125662114133e-06	7320755	7481187
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7410906	7723783	90	85	-4.1411	4.50125662114133e-06	7320755	7481187	1.13731371883578e-06	7712882	7726921
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	13	-2.1319	1.13731371883578e-06	7712882	7726921	9.11934855310301e-09	7781968	7789562
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-3.9667	9.11934855310301e-09	7781968	7789562	5.35866835060438e-05	7895945	7905286
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.2799	5.35866835060438e-05	7895945	7905286	1.54174463236550e-05	7914104	7919636
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	364	-4.3486	1.5417446323655e-05	7914104	7919636	8.63128008293397e-41	10512616	10535786
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-1.109	8.63128008293397e-41	10512616	10535786	4.02822844487994e-21	11673476	12452734
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.938	4.02822844487994e-21	11673476	12452734	9.32943481176135e-08	12541506	12550566
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-2.3948	9.32943481176135e-08	12541506	12550566	2.51836467821337e-08	12651786	12696242
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12796639	18	16	-4.707	2.51836467821337e-08	12651786	12696242	7.25694153863592e-07	12745259	12809152
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12804329	12899653	28	25	-3.1882	7.25694153863592e-07	12745259	12809152	2.89470968519433e-06	12887023	12901857
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12901857	12924438	8	8	-4.7526	2.89470968519433e-06	12887023	12901857	0.000232159803738005	12924438	12958620
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13129843	82	78	-2.5184	0.000232159803738005	12924438	12958620	8.83475233130654e-07	13101234	13148290
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13256555	42	38	-4.0034	8.83475233130654e-07	13101234	13148290	0.000223121449941041	13169265	13261173
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13361267	41	36	-5.0163	0.000223121449941041	13169265	13261173	3.7467982190052e-05	13358970	13361267
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13363320	13375346	3	3	-3.3821	3.7467982190052e-05	13358970	13361267	5.17743259728297e-07	13375346	13377991
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13377991	13402284	16	13	-5.1789	5.17743259728297e-07	13375346	13377991	7.96754525316405e-06	13397939	13414670
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13405447	13405447	1	0	NA	7.96754525316405e-06	13397939	13414670	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13407320	13453843	24	23	-4.0354	NA	NA	NA	0.000450839577889485	13437661	13475214
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13454651	13566041	63	60	-4.8078	0.000450839577889485	13437661	13475214	8.83883563036227e-07	13551853	13573345
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13566905	13705594	28	24	-3.7793	8.83883563036227e-07	13551853	13573345	1.21764126646704e-08	13691261	13760710
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14122129	159	150	-4.8661	1.21764126646704e-08	13691261	13760710	6.05954013616205e-09	14122036	14122129
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.9452	6.05954013616205e-09	14122036	14122129	1.00652010961842e-07	14143748	14169526
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14358464	35	34	-4.8952	1.00652010961842e-07	14143748	14169526	2.46485461163043e-05	14343139	14386474
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	84	-3.7331	2.46485461163043e-05	14343139	14386474	3.69259645786311e-10	14502379	14508021
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.69259645786311e-10	14502379	14508021	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	11	-1.0893	NA	NA	NA	3.70306584069765e-06	14545228	14555872
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14697315	34	33	-3.2429	3.70306584069765e-06	14545228	14555872	2.12511326461701e-16	14691724	14698076
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	14883615	45	41	-5.1564	2.12511326461701e-16	14691724	14698076	1.21755956031606e-09	14868114	14952770
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15207522	86	81	-3.9756	1.21755956031606e-09	14868114	14952770	2.52628245512149e-05	15204346	15207522
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15208612	15221212	4	3	-0.9116	2.52628245512149e-05	15204346	15207522	0.000329497257313617	15221212	15227049
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15222741	15284717	38	34	-3.4888	0.000329497257313617	15221212	15227049	2.30319877549728e-12	15276098	15290554
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	75	-4.8565	2.30319877549728e-12	15276098	15290554	1.14374793169466e-08	15399621	15444246
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15409110	1	0	NA	1.14374793169466e-08	15399621	15444246	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15410566	15630463	97	93	-3.7361	NA	NA	NA	5.19714334648899e-06	15558235	15658114
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15915466	46	45	-4.8926	5.19714334648899e-06	15558235	15658114	5.70623330878152e-14	15902561	15947948
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15920478	1	0	NA	5.70623330878152e-14	15902561	15947948	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16071977	59	54	-3.0773	NA	NA	NA	5.95578679582839e-06	16018437	16090556
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16072965	16371504	99	95	-4.1062	5.95578679582839e-06	16018437	16090556	0.000294020830893749	16354465	16371504
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16377188	16387273	3	3	-1.4426	0.000294020830893749	16354465	16371504	6.89418532360774e-05	16387273	16413874
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	19610243	377	358	-4.5658	6.89418532360774e-05	16387273	16413874	2.34660641492339e-06	19608039	19610243
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.2345	2.34660641492339e-06	19608039	19610243	3.48830006535213e-08	19613864	19614809
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036411	291	270	-4.6152	3.48830006535213e-08	19613864	19614809	2.593623245141e-08	21034708	21036411
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21047798	5	5	-1.813	2.593623245141e-08	21034708	21036411	1.70674361788449e-09	21047798	21048365
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21048365	21497583	142	133	-4.516	1.70674361788449e-09	21047798	21048365	2.52622033406542e-05	21477616	21497583
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21534077	3	3	-1.9124	2.52622033406542e-05	21477616	21497583	2.75281794008458e-06	21534077	21569358
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21559551	22139807	118	110	-4.536	2.75281794008458e-06	21534077	21569358	4.73243744957898e-12	22052726	22139807
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.4048	4.73243744957898e-12	22052726	22139807	1.33030001210869e-22	22177335	22178964
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22866553	70	62	-5.0298	1.33030001210869e-22	22177335	22178964	6.87284197309697e-05	22856903	22866553
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22868395	22876519	4	3	-3.0052	6.87284197309697e-05	22856903	22866553	3.15809949221959e-05	22876519	22880349
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22877495	22877495	1	0	NA	3.15809949221959e-05	22876519	22880349	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22930737	18	14	-4.9867	NA	NA	NA	6.69577947455843e-72	22930737	22930737
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-1.1938	6.69577947455843e-72	22930737	22930737	0.0429851631002588	26933862	27006628
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27019256	17	15	-2.1158	0.0429851631002588	26933862	27006628	0.0349381696005302	26984336	27019256
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27032300	3	3	-4.6521	0.0349381696005302	26984336	27019256	2.13622246395603e-48	27032300	27032300
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27039222	27039222	1	0	NA	2.13622246395603e-48	27032300	27032300	NA	NA	NA
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	15	-0.5677	NA	NA	NA	3.17359433344874e-08	27137064	27163598
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-2.857	3.17359433344874e-08	27137064	27163598	3.71969339005436e-10	27172283	27176933
MSK_252152915653_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.2091	3.71969339005436e-10	27172283	27176933	NA	NA	NA
