Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	9242021	3009	2946	0.0113	NA	NA	NA	7.79593291335765e-42	9237111	9246530
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9244452	9325536	39	39	0.5565	7.79593291335765e-42	9237111	9246530	1.48799829237291e-47	9322177	9328245
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9326760	12762774	1466	1444	0.0325	1.48799829237291e-47	9322177	9328245	1.39181044381531e-16	12761998	12789063
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12839991	7	7	-0.6976	1.39181044381531e-16	12761998	12789063	5.80856177663395e-15	12831942	13101056
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13101056	16704522	1260	1235	0.0071	5.80856177663395e-15	12831942	13101056	1.33532434913139e-26	16698906	16814050
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17094475	18	18	-0.5769	1.33532434913139e-26	16698906	16814050	5.40222779478088e-26	17086698	17102601
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	24391166	3035	2981	0.0136	5.40222779478088e-26	17086698	17102601	3.79302722054333e-05	24389046	24391166
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-0.8016	3.79302722054333e-05	24389046	24391166	1.86031898909424e-21	24395691	24397212
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	72537426	19058	18678	0.01	1.86031898909424e-21	24395691	24397212	1.93700651253480e-21	72536231	72539143
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	13	0.5817	1.9370065125348e-21	72536231	72539143	5.18848887225723e-23	72571158	72579311
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	110014625	11702	11483	0.0025	5.18848887225723e-23	72571158	72579311	1.81687075802497e-14	110011494	110014625
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.6795	1.81687075802497e-14	110011494	110014625	6.30186345798817e-13	110041712	110058441
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	146297175	4554	4472	-0.0071	6.30186345798817e-13	110041712	110058441	1.14074809386154e-24	146283719	147313991
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	148084402	42	41	-0.3607	1.14074809386154e-24	146283719	147313991	1.29261825799770e-32	147644831	148115321
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148088285	150839754	1257	1228	0.0424	1.2926182579977e-32	147644831	148115321	1.58984480186804e-37	150839754	150844444
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150843192	2	0	NA	1.58984480186804e-37	150839754	150844444	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150851439	5	4	-1.3617	NA	NA	NA	1.35927462726345e-33	150848509	150851439
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2708	0.0209	1.35927462726345e-33	150848509	150851439	2.70152655767944e-35	157133150	157133150
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.0011	2.70152655767944e-35	157133150	157133150	6.64357177549892e-40	157136342	157136342
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167479184	4106	4028	-0.0144	6.64357177549892e-40	157136342	157136342	1.30863548340910e-10	167475635	167483267
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167507898	10	10	-0.4772	1.3086354834091e-10	167475635	167483267	8.27863895772423e-12	167506259	167523140
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	194978218	9180	8997	-1e-04	8.27863895772423e-12	167506259	167523140	4.4319258958881e-16	194977713	195009358
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	7	-0.6603	4.4319258958881e-16	194977713	195009358	1.27952078749491e-15	195046932	195091758
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200598243	2158	2113	0.0061	1.27952078749491e-15	195046932	195091758	7.63124267794918e-11	200585836	200616638
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200668993	25	24	-0.2974	7.63124267794918e-11	200585836	200616638	1.08640667594161e-09	200652799	200679934
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	215744111	5758	5631	-0.004	1.08640667594161e-09	200652799	200679934	1.56514850507382e-09	215731606	215746540
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215745459	215779190	19	19	0.3227	1.56514850507382e-09	215731606	215746540	1.31346936887853e-09	215775900	215788435
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215780335	227875096	4161	4085	7e-04	1.31346936887853e-09	215775900	215788435	1.6642011137732e-14	227872808	227875096
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8523	1.6642011137732e-14	227872808	227875096	1.43901022191063e-14	227882805	227882805
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246751473	7351	7214	-0.0034	1.43901022191063e-14	227882805	227882805	1.69958400554549e-18	246702361	246769018
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246862029	31	31	0.3393	1.69958400554549e-18	246702361	246769018	4.07048932861542e-08	246852126	246911251
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	97	0.0548	4.07048932861542e-08	246852126	246911251	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	24452394	7082	6965	-0.0244	NA	NA	NA	4.58204117716673e-14	24452394	24452394
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24462631	4	4	-0.8546	4.58204117716673e-14	24452394	24452394	6.1394265255138e-14	24462631	24467164
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24467164	33617141	4046	3959	0.0108	6.1394265255138e-14	24462631	24467164	9.17886606310673e-31	33617141	33617141
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-1.8005	9.17886606310673e-31	33617141	33617141	3.22969236113398e-30	33621111	33621111
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	34178510	231	228	0.02	3.22969236113398e-30	33621111	33621111	6.01915518157333e-07	34178510	34178510
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34179832	34182915	2	2	0.7834	6.01915518157333e-07	34178510	34178510	7.4576466392284e-08	34182915	34182915
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34186232	34543992	155	151	-0.0158	7.4576466392284e-08	34182915	34182915	1.03193515278687e-34	34542224	34551222
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.5895	1.03193515278687e-34	34542224	34551222	7.20470329425414e-33	34583814	34591681
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	146571330	33534	32909	-0.002	7.20470329425414e-33	34583814	34591681	0	146571330	146571330
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.6572	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2158	2e-04	0	146592775	146592775	2.73949933869508e-09	154599133	154601442
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.9153	2.73949933869508e-09	154599133	154601442	1.70193354537983e-08	154606943	154606943
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	179104863	8714	8520	-1e-04	1.70193354537983e-08	154606943	154606943	0.372231885866361	178966961	179104863
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179108533	179115582	4	4	-0.2656	0.372231885866361	178966961	179104863	9.73900268859609e-15	179115582	179115582
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179117769	179123085	3	3	-0.6187	9.73900268859609e-15	179115582	179115582	2.45061140581548e-10	179123085	179124459
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179124459	242689978	21823	21432	-4e-04	2.45061140581548e-10	179123085	179124459	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15908	-0.0076	NA	NA	NA	2.18894781632561e-274	47460892	47460892
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-5.1136	2.18894781632561e-274	47460892	47460892	9.79185296806535e-279	47466921	47466921
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	89475107	14421	14125	-0.0057	9.79185296806535e-279	47466921	47466921	7.7702663009678e-53	89475107	89475107
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89502757	14	14	-0.8519	7.7702663009678e-53	89475107	89475107	8.58871899741609e-54	89502757	89502757
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89504141	164005577	22836	22359	-0.0049	8.58871899741609e-54	89502757	89502757	6.51339322837041e-173	164005577	164005577
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.5223	6.51339322837041e-173	164005577	164005577	4.19207382600939e-58	164027724	164027724
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.4992	4.19207382600939e-58	164027724	164027724	5.42354306571357e-29	164105613	164121847
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	174730888	3353	3272	0.0026	5.42354306571357e-29	164105613	164121847	1.90165999424139e-22	174721900	174734126
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174732977	174772331	20	19	0.4635	1.90165999424139e-22	174721900	174734126	2.48847643181087e-21	174767241	174781735
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174775059	194354505	6756	6617	0.0018	2.48847643181087e-21	174767241	174781735	0	194354505	194354505
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-5.0737	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	195686118	524	517	-0.031	0	194366950	194366950	5.14017731645139e-07	195671849	195691534
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	195687498	195717807	14	13	0.2889	5.14017731645139e-07	195671849	195691534	5.18225155545306e-05	195710809	195759607
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	195720742	196835413	459	452	7e-04	5.18225155545306e-05	195710809	195759607	1.63036586068689e-15	196807153	196911055
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196964180	31	31	0.333	1.63036586068689e-15	196807153	196911055	2.85866851049929e-14	196950095	196972067
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196966631	199329592	952	933	0.0217	2.85866851049929e-14	196950095	196972067	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9375	-0.0052	NA	NA	NA	6.03353861436819e-13	34439897	34445002
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.675	6.03353861436819e-13	34439897	34445002	1.34618497540050e-14	34491115	34506297
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	173660684	40265	39512	-9e-04	1.3461849754005e-14	34491115	34506297	8.08302531207403e-22	173660684	173660684
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.41	8.08302531207403e-22	173660684	173660684	3.24814446764277e-24	173666072	173666072
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	728	-0.0029	3.24814446764277e-24	173666072	173666072	2.07715436966778e-13	175860235	175860235
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	1.0596	2.07715436966778e-13	175860235	175860235	2.83250971588441e-12	175863396	175863396
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3267	0.0031	2.83250971588441e-12	175863396	175863396	3.8235735351672e-70	187330240	187330240
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.5416	3.8235735351672e-70	187330240	187330240	1.88861214149007e-58	187333619	187333619
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190710812	1131	1107	-0.013	1.88861214149007e-58	187333619	187333619	6.01739644253832e-28	190695751	190735382
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190899545	58	56	-0.3284	6.01739644253832e-28	190695751	190735382	1.15243138566478e-11	190888913	190917729
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190907760	191153613	52	51	-0.0147	1.15243138566478e-11	190888913	190917729	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	3639056	1118	1100	-0.0304	NA	NA	NA	4.00433351363685e-07	3631579	3644058
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	3642087	3657734	9	9	0.4299	4.00433351363685e-07	3631579	3644058	4.56703713033113e-09	3654213	3664247
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	3659969	59521690	15076	14792	-0.0107	4.56703713033113e-09	3654213	3664247	2.67866384987379e-14	59521690	59521690
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59525396	59531344	3	3	-0.9539	2.67866384987379e-14	59521690	59521690	2.32332455022899e-14	59531344	59531344
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59535295	155405839	29277	28727	-8e-04	2.32332455022899e-14	59531344	59531344	1.592827780449e-08	155394793	155418745
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155427589	6	6	-0.5321	1.592827780449e-08	155394793	155418745	3.94432278760233e-08	155418745	155432745
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427637	172345157	5485	5384	-0.009	3.94432278760233e-08	155418745	155432745	1.36169076286523e-08	172345157	172345157
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172348216	172349917	2	2	-0.9378	1.36169076286523e-08	172345157	172345157	6.51023907937255e-08	172349917	172349917
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172351264	180194323	2669	2622	0.0217	6.51023907937255e-08	172349917	172349917	1.69116328266864e-07	180192214	180194323
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180346557	3	2	-0.9141	1.69116328266864e-07	180192214	180194323	1.28542701420689e-15	180346557	180346557
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-5.2341	1.28542701420689e-15	180346557	180346557	0	180358977	180358977
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180632269	111	108	3e-04	0	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	236535	54	51	-0.0222	NA	NA	NA	9.5947576126074e-06	211079	252939
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	309211	39	39	-0.2357	9.5947576126074e-06	211079	252939	2.75828687399583e-11	299520	327962
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	311748	31385778	11089	10875	0.0035	2.75828687399583e-11	299520	327962	1.22325405322136e-23	31385778	31387708
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.8636	1.22325405322136e-23	31385778	31387708	1.01744567149300e-22	31395330	31418006
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	477	0.0518	1.017445671493e-22	31395330	31418006	2.19377060855707e-89	32548736	32588005
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32650672	20	18	-1.2608	2.19377060855707e-89	32548736	32588005	2.10660346210444e-08	32613538	32653710
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32653710	32713363	26	26	-0.1062	2.10660346210444e-08	32613538	32653710	3.31728349001031e-06	32709263	32723722
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	14	-0.8722	3.31728349001031e-06	32709263	32723722	4.27409082680725e-53	32731072	32739800
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	67060622	11027	10809	-0.0021	4.27409082680725e-53	32731072	32739800	1.17111361069837e-15	67055837	67078860
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.7326	1.17111361069837e-15	67055837	67078860	5.53524907278801e-18	67093216	67105238
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	79018959	3655	3599	0.01	5.53524907278801e-18	67093216	67105238	1.01976688366650e-12	79008946	79024557
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.4157	1.0197668836665e-12	79008946	79024557	1.42575695158799e-11	79085247	79105311
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	27338	-0.0024	1.42575695158799e-11	79085247	79105311	0	165643653	165643653
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-5.2522	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1767	-0.0391	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	40	0.019	NA	NA	NA	5.89577344460258e-16	244720	246786
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-0.9621	5.89577344460258e-16	244720	246786	1.73721823484916e-21	251565	254342
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	16135701	5343	5246	0.0068	1.73721823484916e-21	251565	254342	5.18481617642809e-207	16135701	16135701
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.6746	5.18481617642809e-207	16135701	16135701	3.07089218061345e-230	16140018	16140018
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	64523575	14172	13935	-0.0087	3.07089218061345e-230	16140018	16140018	1.17361496674569e-07	64516764	64523575
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-0.9022	1.17361496674569e-07	64516764	64523575	8.19937413883494e-09	64532949	64534167
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	66125189	368	361	0.0266	8.19937413883494e-09	64532949	64534167	1.68759160774859e-05	66114937	66125189
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	66125305	66143507	3	3	0.5482	1.68759160774859e-05	66114937	66125189	0.000334391828029798	66143507	66149575
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	66145759	70879718	1455	1425	0.0072	0.000334391828029798	66143507	66149575	2.13081496570158e-24	70872356	70879718
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	70882362	70905078	15	15	0.5698	2.13081496570158e-24	70872356	70879718	2.67068216881653e-25	70905078	70910323
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	70907026	93162991	7043	6893	0.007	2.67068216881653e-25	70905078	70910323	1.60791202313887e-20	93162991	93162991
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.9756	1.60791202313887e-20	93162991	93162991	8.70788875943161e-16	93168978	93172507
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100166257	2613	2564	0.0205	8.70788875943161e-16	93168978	93172507	4.67577442275729e-14	100164752	100170227
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-0.6625	4.67577442275729e-14	100164752	100170227	1.17462551463171e-11	100171204	100178968
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109216032	3894	3820	0.0176	1.17462551463171e-11	100171204	100178968	9.76302133568024e-13	109212149	109216032
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109244233	7	7	0.537	9.76302133568024e-13	109212149	109216032	3.662323115045e-12	109244233	109247295
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	109967918	300	291	-0.019	3.662323115045e-12	109244233	109247295	2.41235652101944e-08	109966116	109967918
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	0.8421	2.41235652101944e-08	109966116	109967918	9.62240830029337e-08	109974402	109976628
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3922	-0.0068	9.62240830029337e-08	109974402	109976628	1.85668176514707e-27	118611324	118611324
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.266	1.85668176514707e-27	118611324	118611324	1.7876531595585e-27	118620875	118620875
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3107	7e-04	1.7876531595585e-27	118620875	118620875	4.57856327992003e-32	125831554	125831554
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3671	4.57856327992003e-32	125831554	125831554	2.11606089281493e-27	125837524	125837524
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3583	0.0052	2.11606089281493e-27	125837524	125837524	9.3775349241006e-24	133432281	133433384
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7824	9.3775349241006e-24	133432281	133433384	2.90237529637414e-26	133448277	133453811
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133864684	207	204	-0.0259	2.90237529637414e-26	133448277	133453811	7.60287779787547e-07	133854126	133872990
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133869068	133911760	13	13	-0.3619	7.60287779787547e-07	133854126	133872990	1.67068307245813e-08	133908027	133920655
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133913921	141422860	3485	3413	0.0033	1.67068307245813e-08	133908027	133920655	7.81443653156748e-15	141419692	141422860
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141425306	141440184	9	9	-0.5686	7.81443653156748e-15	141419692	141422860	5.97891099819916e-14	141440184	141443577
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	147702365	2638	2605	-0.0101	5.97891099819916e-14	141440184	141443577	7.54190689190212e-21	147702365	147702365
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.4538	7.54190689190212e-21	147702365	147702365	8.6296206279862e-17	147707161	147707161
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4166	-0.0182	8.6296206279862e-17	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.0017	NA	NA	NA	9.11321715671883e-27	581533	581533
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.3989	9.11321715671883e-27	581533	581533	5.00472519700555e-55	588865	588865
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2229	-0.0356	5.00472519700555e-55	588865	588865	1.19986777856766e-10	6909487	7260442
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-0.5512	1.19986777856766e-10	6909487	7260442	5.13680766736225e-11	7790934	8139999
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5633	-0.0013	5.13680766736225e-11	7790934	8139999	1.74911744901725e-252	25022606	25030003
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-4.2438	1.74911744901725e-252	25022606	25030003	5.99485806464682e-277	25034970	25039370
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4851	0	5.99485806464682e-277	25034970	25039370	0	39350798	39352361
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-4.4977	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	434	0.0054	0	39504332	39505256	0	40892587	40892587
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.3361	0	40892587	40892587	1.36154829855620e-306	40897469	40897469
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30392	-0.0033	1.3615482985562e-306	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5353	-0.0113	NA	NA	NA	1.16772593997706e-11	15802255	15802255
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.0187	1.16772593997706e-11	15802255	15802255	1.08204474660365e-10	15807123	15807123
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	39146895	7271	7121	-0.0026	1.08204474660365e-10	15807123	15807123	4.38444243645122e-11	39048058	43626920
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	67927172	21	20	-0.3316	4.38444243645122e-11	39048058	43626920	3.89514403746431e-11	67911945	70207320
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	314	-0.0152	3.89514403746431e-11	67911945	70207320	4.45021945880662e-251	70926188	70926188
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.5156	4.45021945880662e-251	70926188	70926188	8.85197264085123e-204	70930528	70930528
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23303	-0.0035	8.85197264085123e-204	70930528	70930528	6.4571772914477e-67	137352394	137352394
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.5939	6.4571772914477e-67	137352394	137352394	1.15829950175033e-41	137356880	137356880
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1079	-0.0133	1.15829950175033e-41	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4602	-0.0106	NA	NA	NA	1.34490650699155e-10	13553503	13553503
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.0609	1.34490650699155e-10	13553503	13553503	9.30129249633817e-12	13556315	13556315
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	31284926	6608	6490	0.0037	9.30129249633817e-12	13556315	13556315	5.39216558921684e-12	31284756	31284926
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.8737	5.39216558921684e-12	31284756	31284926	6.38852845443648e-11	31291525	31293140
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917893	13297	13049	-0.0033	6.38852845443648e-11	31291525	31293140	9.2232667799996e-166	77917893	77917893
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-4.0227	9.2232667799996e-166	77917893	77917893	4.8546221839151e-166	77928669	77928669
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	124328915	16335	16020	-0.0026	4.8546221839151e-166	77928669	77928669	1.41769663269870e-11	124328915	124328915
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.8978	1.4176966326987e-11	124328915	124328915	1.48536994151281e-10	124340356	124368725
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	132797428	2940	2895	-0.0408	1.48536994151281e-10	124340356	124368725	1.55965875099821e-06	132787561	132797428
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.796	1.55965875099821e-06	132787561	132797428	0.000111240420121436	132801463	132806049
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	917	-0.0381	0.000111240420121436	132801463	132806049	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	748973	213	207	-0.0025	NA	NA	NA	3.62111717862787e-06	709841	775898
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	751601	835705	32	31	0.2628	3.62111717862787e-06	709841	775898	2.15778979672603e-10	815523	855506
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	837643	55118214	16660	16336	-0.007	2.15778979672603e-10	815523	855506	1.61618720009109e-27	55097753	55131703
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	40	-0.3845	1.61618720009109e-27	55097753	55131703	5.0810134044208e-29	55202450	55223056
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	65000428	3995	3930	0.015	5.0810134044208e-29	55202450	55223056	2.12310472230392e-10	64979515	65023590
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65003889	65067194	27	27	0.2837	2.12310472230392e-10	64979515	65023590	1.81363859805781e-10	65048052	65085512
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65069108	81551675	5937	5827	0.0033	1.81363859805781e-10	65048052	65085512	3.15315909104423e-09	81544262	81551675
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81554664	81557345	2	2	0.7972	3.15315909104423e-09	81544262	81551675	6.87894793361087e-08	81557345	81561626
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81561626	85565280	1625	1597	-0.0089	6.87894793361087e-08	81557345	81561626	6.68821770539082e-13	85565280	85565280
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85567562	85576174	3	3	-0.8426	6.68821770539082e-13	85565280	85565280	3.8468127520989e-11	85576174	85588411
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85580062	85580062	1	0	NA	3.8468127520989e-11	85576174	85588411	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85588411	106733851	6447	6318	-0.0063	NA	NA	NA	3.91523075348173e-08	106730906	106733851
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.6187	3.91523075348173e-08	106730906	106733851	4.32368891918201e-08	106747920	106756347
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	107758842	439	426	0.0296	4.32368891918201e-08	106747920	106756347	7.6823215320008e-28	107758842	107758842
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107761839	107770499	6	6	0.9084	7.6823215320008e-28	107758842	107758842	1.77197754643950e-29	107770499	107770499
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107774489	111660503	1327	1303	-0.0046	1.7719775464395e-29	107770499	107770499	9.27052193387535e-07	111658872	111660503
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	111662150	111665473	2	2	0.7709	9.27052193387535e-07	111658872	111660503	1.28988877137119e-06	111665473	111667613
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	111667613	113976883	874	860	-0.0225	1.28988877137119e-06	111665473	111667613	5.08374413016578e-10	113970622	113979934
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	114016954	7	7	-0.5415	5.08374413016578e-10	113970622	113979934	1.14622080265506e-09	113999831	114027925
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	114022843	131427991	6424	6306	-0.0025	1.14622080265506e-09	113999831	114027925	1.40195429983601e-08	131426009	131427991
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131429532	131434659	4	4	0.6716	1.40195429983601e-08	131426009	131427991	1.4337287214902e-09	131434659	131436397
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131436397	134450318	1235	1211	-0.046	1.4337287214902e-09	131434659	131436397	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3675	0.007	NA	NA	NA	1.07299670819993e-30	9523923	9589725
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9604633	14	10	-0.825	1.07299670819993e-30	9523923	9589725	6.81712742984383e-29	9543817	9604633
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	11116883	573	553	-0.0245	6.81712742984383e-29	9543817	9604633	0	11116883	11116883
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.9877	0	11116883	11116883	0	11130871	11130871
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	19358397	2833	2771	0.001	0	11130871	11130871	5.22209978895269e-265	19358397	19358397
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19359838	19469446	56	55	0.9609	5.22209978895269e-265	19358397	19358397	2.6589028470559e-257	19469446	19469446
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19471947	132289090	37937	37188	0.0061	2.6589028470559e-257	19469446	19469446	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	31428172	4884	4806	-0.0061	NA	NA	NA	5.46553098949406e-16	31428172	31428172
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-1.3155	5.46553098949406e-16	31428172	31428172	6.77384037760596e-19	31436314	31436314
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	37953582	2452	2404	-0.0065	6.77384037760596e-19	31436314	31436314	4.51882704972085e-92	37953582	37953582
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.8445	4.51882704972085e-92	37953582	37953582	2.15455997386323e-89	37957844	37957844
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	102480849	20577	20209	-0.0015	2.15455997386323e-89	37957844	37957844	6.12457007103261e-09	102471294	102488607
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	102483043	102503934	10	10	0.4188	6.12457007103261e-09	102471294	102488607	5.76683169683921e-09	102497969	102508615
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	102505254	114123340	3717	3652	-0.0273	5.76683169683921e-09	102497969	102508615	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.387	NA	NA	NA	0.00269791044103126	18527871	19297767
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	-0.687	0.00269791044103126	18527871	19297767	5.52967405894651e-138	19492531	19497023
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5577	0.0081	5.52967405894651e-138	19492531	19497023	2.76443405486242e-20	34674458	34674458
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1402	2.76443405486242e-20	34674458	34674458	5.59754140153302e-21	34683810	34683810
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	73061942	13666	13408	0.0012	5.59754140153302e-21	34683810	34683810	3.28286369929148e-11	73058103	73071404
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	0.555	3.28286369929148e-11	73058103	73071404	9.03791111988975e-12	73092112	73104540
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	90318343	6148	6047	-0.004	9.03791111988975e-12	73092112	73104540	5.07532285080234e-13	90318343	90319509
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90319509	90323329	3	3	-0.9479	5.07532285080234e-13	90318343	90319509	3.65708751669664e-11	90321398	90323329
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90324694	105597555	6064	5958	-0.0024	3.65708751669664e-11	90321398	90323329	0	105597555	105597555
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.7303	0	105597555	105597555	0	105632168	105632168
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106355517	230	226	-0.0396	0	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106358491	106358491	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1522	NA	NA	NA	4.60985723124933e-10	18452491	18741716
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	150	-0.6456	4.60985723124933e-10	18452491	18741716	1.19435606878734e-280	20065525	20308014
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	35172697	4608	4529	-0.0179	1.19435606878734e-280	20065525	20308014	6.72707647638898e-07	35166093	35172697
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35174207	35179651	4	4	0.5266	6.72707647638898e-07	35166093	35172697	5.25753483793772e-05	35179651	35184814
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35182617	41638388	2742	2691	0.0088	5.25753483793772e-05	35179651	35184814	1.55461581522957e-25	41638388	41638388
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41682937	4	4	1.1361	1.55461581522957e-25	41638388	41638388	4.28494838191033e-25	41682937	41682937
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	74794160	14242	13975	0.003	4.28494838191033e-25	41682937	41682937	1.46137751584307e-12	74794160	74794160
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74799100	74799239	2	2	-1.148	1.46137751584307e-12	74794160	74794160	3.48898002793373e-09	74799239	74804475
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74804475	75115806	127	125	-0.0088	3.48898002793373e-09	74799239	74804475	3.5763295268352e-14	75115806	75115806
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.4001	3.5763295268352e-14	75115806	75115806	2.58983780502496e-18	75119713	75119713
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	79733803	1870	1842	0.001	2.58983780502496e-18	75119713	75119713	7.57521966543535e-08	79723206	79744695
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	79744695	79784014	6	6	0.5391	7.57521966543535e-08	79723206	79744695	1.62576354701903e-08	79776336	79797536
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	79789706	100298352	7559	7415	-0.0089	1.62576354701903e-08	79776336	79797536	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	8696925	3287	3226	-0.0049	NA	NA	NA	7.93483157897778e-07	8656236	8719019
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8698913	8736922	17	17	0.2344	7.93483157897778e-07	8656236	8719019	4.03477701373725e-09	8715608	8763219
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8740351	34325501	7404	7270	0.0116	4.03477701373725e-09	8715608	8763219	2.05966645685584e-31	34306513	34339543
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34329518	34602318	51	50	0.3831	2.05966645685584e-31	34306513	34339543	1.88349082208875e-34	34584793	34623136
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	68693086	7540	7388	0.0039	1.88349082208875e-34	34584793	34623136	1.65472499525057e-33	68693086	68693086
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.8308	1.65472499525057e-33	68693086	68693086	2.21065031193412e-32	68753209	68838384
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1431	-0.0122	2.21065031193412e-32	68753209	68838384	1.30457023446745e-14	72915477	72918129
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.6735	1.30457023446745e-14	72915477	72918129	2.14975293172070e-17	72964783	73022578
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	738	0.0278	2.1497529317207e-17	72964783	73022578	2.87687090918065e-105	75093957	75093957
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.1565	2.87687090918065e-105	75093957	75093957	3.501831358015e-95	75100865	75100865
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	83395356	3122	3059	-0.0176	3.501831358015e-95	75100865	75100865	1.54843029247902e-07	83391036	83395356
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83397725	83404088	5	5	0.5565	1.54843029247902e-07	83391036	83395356	2.31385431999842e-05	83404088	83410257
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83405485	88690571	2004	1971	-0.0135	2.31385431999842e-05	83404088	83410257	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	406	0.0319	NA	NA	NA	0.00368347147073767	1024219	1027248
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1028979	2	2	0.7095	0.00368347147073767	1024219	1027248	0	1028979	1028979
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.0796	0	1028979	1028979	1.37101444791623e-09	1030766	1030766
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31457889	11618	11382	0.0195	1.37101444791623e-09	1030766	1030766	2.36373908797188e-12	31441419	31470227
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.3682	2.36373908797188e-12	31441419	31470227	4.38008482527785e-14	31489333	31893451
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1780	0.0352	4.38008482527785e-14	31489333	31893451	1.479629526942e-24	36673853	36673853
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.9674	1.479629526942e-24	36673853	36673853	5.48881649148715e-23	36684619	36684619
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41564408	2031	1990	0.0411	5.48881649148715e-23	36684619	36684619	5.96079023315627e-35	41558893	41572001
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	42151941	52	51	-0.3557	5.96079023315627e-35	41558893	41572001	1.68572526542689e-31	41710400	42161364
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13416	0.0179	1.68572526542689e-31	41710400	42161364	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15906	-0.0088	NA	NA	NA	3.88138456482405e-22	53092949	53092949
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.428	3.88138456482405e-22	53092949	53092949	9.18168051866486e-22	53099601	53099601
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6629	-0.0183	9.18168051866486e-22	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19694025	9027	8851	0.0535	NA	NA	NA	3.23583947538821e-06	19692626	19694025
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-0.759	3.23583947538821e-06	19692626	19694025	1.04726098522214e-08	19699485	19702214
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	45751259	5985	5863	0.0156	1.04726098522214e-08	19699485	19702214	4.67809277673405e-10	45727452	45767966
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45752634	45808580	33	32	0.2782	4.67809277673405e-10	45727452	45767966	4.28221198665679e-05	45787853	45849735
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45810217	55769042	4307	4211	0.0544	4.28221198665679e-05	45787853	45849735	1.07824250128873e-32	55769042	55769042
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-2.1291	1.07824250128873e-32	55769042	55769042	1.07211097988514e-33	55772729	55772729
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56823430	516	506	0.0353	1.07211097988514e-33	55772729	55772729	1.35315822298258e-11	56819531	56823430
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.5517	1.35315822298258e-11	56819531	56823430	2.07581048932452e-10	56840346	56844304
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1150	0.0276	2.07581048932452e-10	56840346	56844304	2.67152356153497e-08	59390167	59434202
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59504796	38	38	-0.2147	2.67152356153497e-08	59390167	59434202	1.60590752541781e-08	59485704	59526597
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59505797	63788698	1966	1925	0.0226	1.60590752541781e-08	59485704	59526597	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	575	-0.008	NA	NA	NA	1.95377514079729e-213	1511632	1516966
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	7	-3.2622	1.95377514079729e-213	1511632	1516966	0	1525300	1531162
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3604	-0.0025	0	1525300	1531162	1.87759279817057e-08	12089020	12095485
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	0.8274	1.87759279817057e-08	12089020	12095485	3.01930816830444e-12	12113855	12127349
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16961	-0.0062	3.01930816830444e-12	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13201	-0.0101	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	19190231	1526	1501	0.011	NA	NA	NA	0.000173851973955727	19185817	19190231
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	19191393	19193294	3	3	0.6698	0.000173851973955727	19185817	19190231	8.99057484723499e-05	19193294	19198706
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	19195379	22667608	1454	1420	0.016	8.99057484723499e-05	19193294	19198706	0	22667608	22677959
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22706166	12	12	-3.0051	0	22667608	22677959	1.37074370222106e-05	22701123	22706166
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22708012	22718614	7	7	-5.0533	1.37074370222106e-05	22701123	22706166	1.08635888306923e-07	22718614	22720195
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22720195	22725305	3	3	-2.8458	1.08635888306923e-07	22718614	22720195	1.40135689044169e-107	22725305	22725305
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	28262123	3028	2959	-0.001	1.40135689044169e-107	22725305	22725305	2.23001288897426e-08	28214765	28283746
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28263094	28360419	52	52	0.1959	2.23001288897426e-08	28214765	28283746	9.0366574844255e-08	28342857	28390946
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28361757	35472378	3467	3411	0.0075	9.0366574844255e-08	28342857	28390946	3.49196494994144e-28	35472378	35472378
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.7816	3.49196494994144e-28	35472378	35472378	4.69657840326406e-23	35476942	35476942
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1191	0.0379	4.69657840326406e-23	35476942	35476942	2.76167192363603e-44	37683516	37685496
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.8333	2.76167192363603e-44	37683516	37685496	1.18572927039893e-44	37715385	37718669
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5665	0.0048	1.18572927039893e-44	37715385	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	765191	510	502	-0.0357	NA	NA	NA	3.94875946255434e-06	711968	771824
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	767373	800669	25	25	-0.2389	3.94875946255434e-06	711968	771824	2.00553235892801e-06	793712	818021
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800956	1427392	252	250	0.0329	2.00553235892801e-06	793712	818021	9.35181210467857e-21	1427392	1431240
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1923	9.35181210467857e-21	1427392	1431240	4.75628091547977e-15	1431411	1432953
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	62	-0.0729	4.75628091547977e-15	1431411	1432953	1.03253266733821e-06	1526617	1528282
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.7259	1.03253266733821e-06	1526617	1528282	5.42043961724084e-08	1530474	1533361
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2374031	620	607	0.0119	5.42043961724084e-08	1530474	1533361	3.73976841567897e-10	2364343	2382584
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2374133	2418980	53	52	-0.2256	3.73976841567897e-10	2364343	2382584	2.71758374236103e-10	2411621	2426938
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2638587	195	192	0.0082	2.71758374236103e-10	2411621	2426938	2.70965798556591e-07	2637964	2638587
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2640484	2	2	0.8982	2.70965798556591e-07	2637964	2638587	4.20479118680683e-10	2640484	2640484
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642054	2673365	40	40	-0.0364	4.20479118680683e-10	2640484	2640484	1.39091679047967e-06	2671030	2674962
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2693493	10	10	-0.4008	1.39091679047967e-06	2671030	2674962	0.0160689494641558	2692498	2702666
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	15	-0.0902	0.0160689494641558	2692498	2702666	7.29563360129577e-73	2708291	2708291
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22499	0.9892	7.29563360129577e-73	2708291	2708291	1.62925273791989e-64	76998610	76998610
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.7714	1.62925273791989e-64	76998610	76998610	8.31040448698195e-67	77010018	77010018
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	153329988	21777	21349	0.9854	8.31040448698195e-67	77010018	77010018	2.03782498588722e-14	153328351	153335752
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153344718	7	7	0.2767	2.03782498588722e-14	153328351	153335752	6.5609091684117e-13	153340901	153348763
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153348763	154582414	409	399	0.9667	6.5609091684117e-13	153340901	153348763	0	154578922	154586690
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	0.0062	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	119	-4.4537	NA	NA	NA	7.29868122213567e-39	3223585	3733715
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.5892	7.29868122213567e-39	3223585	3733715	3.27354002502191e-21	5531459	6652845
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7070931	177	169	-4.0048	3.27354002502191e-21	5531459	6652845	6.64562979219684e-08	7024303	7219774
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7073916	7495687	126	121	-2.965	6.64562979219684e-08	7024303	7219774	0.00637301872684923	7389797	7572591
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7606496	12	12	-4.6342	0.00637301872684923	7389797	7572591	0.0026808667322271	7603458	7630477
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	19	-2.9096	0.0026808667322271	7603458	7630477	2.45701631500824e-08	7632577	7656915
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7712882	37	36	-4.7693	2.45701631500824e-08	7632577	7656915	1.00470068475287e-11	7708716	7723783
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7713973	7997485	84	81	-3.1714	1.00470068475287e-11	7708716	7723783	5.79612495984092e-11	7964586	8005148
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8178487	39	36	-4.7248	5.79612495984092e-11	7964586	8005148	2.17663570949874e-11	8174858	8178487
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8195174	6	6	-2.4083	2.17663570949874e-11	8174858	8178487	0.00504939180020716	8195174	8230756
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	8199414	1	0	NA	0.00504939180020716	8195174	8230756	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8201959	8690572	133	130	-3.8454	NA	NA	NA	0.000188681683022711	8641679	8696392
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	8725431	18	18	-4.8818	0.000188681683022711	8641679	8696392	0.000942868620068634	8717366	8760589
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8730690	8943871	58	53	-3.9406	0.000942868620068634	8717366	8760589	8.50237655257138e-05	8935134	8943871
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8949553	8949553	1	0	NA	8.50237655257138e-05	8935134	8943871	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.54	NA	NA	NA	2.24974032613608e-11	8956787	8958121
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9132086	28	28	-4.996	2.24974032613608e-11	8956787	8958121	2.40019169707211e-09	9119912	9153682
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9133230	9135034	2	0	NA	2.40019169707211e-09	9119912	9153682	NA	NA	NA
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9145335	10055462	26	24	-3.5206	NA	NA	NA	0.00158067580857121	10014777	10373935
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10056943	10513747	55	55	-4.4584	0.00158067580857121	10014777	10373935	3.7147430209962e-38	10512616	10513747
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.643	3.7147430209962e-38	10512616	10513747	1.78922998730874e-08	10645500	11673476
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12537944	17	17	-3.9138	1.78922998730874e-08	10645500	11673476	0.00314897493214258	11698871	12559410
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12541506	12682301	55	53	-2.3327	0.00314897493214258	11698871	12559410	2.15664849566248e-06	12649357	12700767
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	15	-4.3445	2.15664849566248e-06	12649357	12700767	0.000260030756587116	12725675	12796639
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	12905395	33	33	-3.0858	0.000260030756587116	12725675	12796639	0.00424273409612641	12888523	12922667
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12926941	8	8	-4.2585	0.00424273409612641	12888523	12922667	0.00373270774893201	12922667	12973132
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13104920	70	68	-2.5037	0.00373270774893201	12922667	12973132	0.329774564332682	12942170	13114169
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.4479	0.329774564332682	12942170	13114169	5.0526200383773e-09	13119344	13133803
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13158272	16	15	-4.3201	5.0526200383773e-09	13119344	13133803	0.0158453485209592	13149825	13167862
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13159901	13213249	14	14	-2.9052	0.0158453485209592	13149825	13167862	1.51043444485615e-05	13169265	13238502
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13215006	14352278	382	372	-4.2668	1.51043444485615e-05	13169265	13238502	1.16533375736361e-12	14328579	14383746
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508894	94	93	-3.3752	1.16533375736361e-12	14328579	14383746	4.52701896589623e-07	14500820	14536962
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	23	-1.7882	4.52701896589623e-07	14500820	14536962	1.54018373995882e-17	14561228	14587291
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	15915466	418	403	-4.1078	1.54018373995882e-17	14561228	14587291	1.30590904831303e-08	15780423	15996118
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16200557	120	118	-3.2875	1.30590904831303e-08	15780423	15996118	2.30345359255489e-13	16173830	16228031
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16201830	17496151	218	210	-4.3557	2.30345359255489e-13	16173830	16228031	3.1320619022604e-07	17473674	17507174
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17503455	17557953	10	9	-2.1984	3.1320619022604e-07	17473674	17507174	2.08906460126445e-06	17533546	17598928
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	25737663	856	829	-4.2305	2.08906460126445e-06	17533546	17598928	7.33527295184888e-104	23283689	26872527
MSK_252152915685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	81	-1.41	7.33527295184888e-104	23283689	26872527	NA	NA	NA
