Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	15158665	5074	4963	0.0176	NA	NA	NA	0.000206216425397309	15157302	15158665
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15160803	15162189	2	2	-0.9296	0.000206216425397309	15157302	15158665	1.94217644374307e-08	15162189	15162189
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15163929	15185776	10	10	0.0763	1.94217644374307e-08	15162189	15162189	0.000141618521325964	15179335	15190946
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15187606	15220793	18	17	-0.3005	0.000141618521325964	15179335	15190946	3.926489518842e-08	15214788	15233356
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15222363	16704522	677	669	0.0523	3.926489518842e-08	15214788	15233356	3.76236971125487e-09	16657837	16838573
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17127039	26	26	-0.297	3.76236971125487e-09	16657837	16838573	8.34626756932409e-07	17094475	17177212
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	21547884	1908	1861	0.011	8.34626756932409e-07	17094475	17177212	5.36333360464551e-09	21530950	21598210
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21551096	21693171	25	24	0.3175	5.36333360464551e-09	21530950	21598210	2.76620685255630e-07	21578725	21722995
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21694754	36361655	5795	5664	0.0361	2.7662068525563e-07	21578725	21722995	1.14173927022571e-08	36361655	36361655
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36362761	36364509	2	2	1.2652	1.14173927022571e-08	36361655	36361655	1.37777938532899e-09	36364509	36366824
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36366824	54860193	7486	7332	0.014	1.37777938532899e-09	36364509	36366824	1.03452909059284e-08	54857788	54860193
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54866506	3	3	-0.963	1.03452909059284e-08	54857788	54860193	6.02417573310339e-12	54866506	54876067
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72537426	6868	6746	-0.0076	6.02417573310339e-12	54866506	54876067	0	72537426	72537426
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.8475	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110014625	11701	11455	0.0014	0	72579311	72579311	4.00159349893932e-13	110011494	110015739
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.7572	4.00159349893932e-13	110011494	110015739	3.60170973925479e-11	110039388	110058441
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	143700072	3914	3826	-0.0138	3.60170973925479e-11	110039388	110058441	9.72928604421324e-30	143645940	143715443
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	144003068	77	76	-0.3191	9.72928604421324e-30	143645940	143715443	4.69417953335335e-30	143928815	144108338
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	150839754	1862	1821	0.0302	4.69417953335335e-30	143928815	144108338	8.96970655562562e-21	150839754	150839754
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	-1.0931	8.96970655562562e-21	150839754	150839754	9.0580026322392e-20	150851439	150851439
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2703	0.0249	9.0580026322392e-20	150851439	150851439	1.07015964155768e-17	157133150	157133150
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6541	1.07015964155768e-17	157133150	157133150	4.6479769265252e-19	157136342	157136342
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167479184	4106	4017	-0.0233	4.6479769265252e-19	157136342	157136342	3.26010919678171e-05	167471001	167493768
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167507898	10	9	-0.439	3.26010919678171e-05	167471001	167493768	9.47574719176497e-06	167506259	167529221
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	180559633	5127	5023	-0.0098	9.47574719176497e-06	167506259	167529221	2.86240864234276e-05	180548110	180562709
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	180561090	180574008	9	9	0.4027	2.86240864234276e-05	180548110	180562709	3.22499623541778e-05	180570420	180589094
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	180575361	195009358	4045	3939	0.0141	3.22499623541778e-05	180570420	180589094	8.62511182651315e-09	194977713	195011344
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.5105	8.62511182651315e-09	194977713	195011344	2.95822492332604e-08	195062793	195095156
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	199870566	1779	1732	0.0028	2.95822492332604e-08	195062793	195095156	1.63443012198990e-08	199860493	199877385
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199873365	199895578	12	11	0.4478	1.6344301219899e-08	199860493	199877385	4.88948209820545e-06	199889296	199904085
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199896669	200598243	367	363	0.0217	4.88948209820545e-06	199889296	199904085	1.01453345810612e-07	200567550	200625002
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200803726	42	41	-0.2381	1.01453345810612e-07	200567550	200625002	3.13249550422122e-07	200676505	200834176
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	215747707	5744	5607	-0.0073	3.13249550422122e-07	200676505	200834176	4.53045147854454e-16	215745459	215747707
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215749658	215779190	16	16	0.5296	4.53045147854454e-16	215745459	215747707	3.36772943588307e-16	215779190	215785488
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	215780335	246794552	11521	11265	-0.0024	3.36772943588307e-16	215779190	215785488	1.08618766332350e-11	246750352	246812425
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246805521	1	0	NA	1.0861876633235e-11	246750352	246812425	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246806669	246862029	25	25	0.3624	NA	NA	NA	3.12325736820126e-07	246855902	246912838
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	98	0.0346	3.12325736820126e-07	246855902	246912838	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34542224	11521	11262	-0.0127	NA	NA	NA	2.5691865556792e-27	34516600	34551222
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34543992	34580533	16	15	0.3656	2.5691865556792e-27	34516600	34551222	1.07823709509514e-08	34575366	34595734
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	37810001	1372	1345	-0.0166	1.07823709509514e-08	34575366	34595734	2.13890412924994e-50	37803744	37815049
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	21	-0.7917	2.13890412924994e-50	37803744	37815049	1.54839099329574e-52	37848754	37855837
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5678	0.0126	1.54839099329574e-52	37848754	37855837	1.74583873669240e-12	52588009	52600588
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.7458387366924e-12	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.9236	NA	NA	NA	1.61982953056247e-12	52635695	52639605
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	232206536	55126	53887	-0.0019	1.61982953056247e-12	52635695	52639605	1.06563882316910e-07	232185200	232214963
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232208233	232259924	22	22	0.3165	1.0656388231691e-07	232185200	232214963	4.39094971080221e-08	232255496	232273228
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232261380	242514593	3879	3800	-0.0281	4.39094971080221e-08	232255496	232273228	1.37252891957779e-06	242490167	242530542
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242516492	242572731	23	23	0.2835	1.37252891957779e-06	242490167	242530542	0.0284762378425027	242528768	242628911
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242575809	242689978	40	39	0.0786	0.0284762378425027	242528768	242628911	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	7666445	2648	2589	-0.0202	NA	NA	NA	1.14825131019136e-216	7658730	7669414
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7667591	8426755	197	194	0.4969	1.14825131019136e-216	7658730	7669414	1.25253703831220e-186	8424717	8435902
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8431712	37953375	9836	9640	-0.0082	1.2525370383122e-186	8424717	8435902	5.78031241991969e-13	37951628	37953375
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7793	5.78031241991969e-13	37951628	37953375	6.62077729316446e-12	37961110	37963014
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3463	-0.0117	6.62077729316446e-12	37961110	37963014	3.07322583570203e-184	47460892	47460892
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-5.1225	3.07322583570203e-184	47460892	47460892	2.40987433468309e-197	47466921	47466921
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	99891210	15963	15607	-0.0056	2.40987433468309e-197	47466921	47466921	8.62742439596908e-140	99891210	99891210
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-4.3153	8.62742439596908e-140	99891210	99891210	6.56768448568869e-145	99897201	99897201
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11274	-0.012	6.56768448568869e-145	99897201	99897201	1.84176927132009e-20	133189686	133189686
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6311	1.84176927132009e-20	133189686	133189686	1.21034819041521e-20	133194685	133194685
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9576	-0.0042	1.21034819041521e-20	133194685	133194685	3.65465296279923e-10	163966032	164023502
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	25	-0.3348	3.65465296279923e-10	163966032	164023502	3.39746921197231e-11	164086905	164131402
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9890	0.0073	3.39746921197231e-11	164086905	164131402	0	194354505	194354505
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.9606	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196928503	1015	991	-0.0238	0	194366950	194366950	7.00429902871872e-07	196920748	196940125
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929805	196958467	11	11	-0.4546	7.00429902871872e-07	196920748	196940125	1.61692175633324e-07	196950095	196969782
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	199329592	954	942	0.0238	1.61692175633324e-07	196950095	196969782	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3316	0.0033	NA	NA	NA	6.89601550653109e-282	9815760	9815760
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.7946	6.89601550653109e-282	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	70150576	15167	14803	-0.0043	0	9842644	9842644	1.76219632013339e-13	70130975	70150576
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.9257	1.76219632013339e-13	70130975	70150576	6.06624333888762e-14	70216707	70216707
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	107275274	12584	12293	0.0027	6.06624333888762e-14	70216707	70216707	2.5451617679877e-08	107274138	107275274
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.7327	2.5451617679877e-08	107274138	107275274	3.79951155331135e-08	107281410	107283257
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	186676034	22454	21971	7e-04	3.79951155331135e-08	107281410	107283257	1.04967604239991e-87	186676034	186676034
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.2365	1.04967604239991e-87	186676034	186676034	5.13953344761966e-85	186680176	186680176
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190710812	1439	1413	-0.0181	5.13953344761966e-85	186680176	186680176	3.26513676882304e-28	190692881	190735382
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190913517	62	62	-0.3635	3.26513676882304e-28	190692881	190735382	1.08689138065097e-09	190891595	190936155
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190915643	191153613	48	46	-0.0641	1.08689138065097e-09	190891595	190936155	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3897	-0.0377	NA	NA	NA	3.41925317691099e-175	12857302	12857302
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.9641	3.41925317691099e-175	12857302	12857302	9.28717054777712e-194	12873052	12873052
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180342860	49669	48566	-0.0032	9.28717054777712e-194	12873052	12873052	3.38479883309511e-12	180192214	180342860
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6455	3.38479883309511e-12	180192214	180342860	1.39713942063059e-07	180358977	180365977
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	110	0.0295	1.39713942063059e-07	180358977	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10357	4e-04	NA	NA	NA	2.07719985203401e-15	29937319	29972382
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30021908	16	16	-0.5069	2.07719985203401e-15	29937319	29972382	5.57656081850333e-14	30005338	30026699
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30025480	32548736	1073	1051	0.0466	5.57656081850333e-14	30005338	30026699	1.15967200142452e-46	32548736	32634977
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32668835	27	26	-0.9577	1.15967200142452e-46	32548736	32634977	0.0310236955112528	32563252	32668835
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32672983	32711957	18	18	-0.0552	0.0310236955112528	32563252	32668835	4.16189094299345e-11	32709263	32716255
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	9	-0.9435	4.16189094299345e-11	32709263	32716255	2.88651496475187e-23	32723722	32731072
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862270	1345	1316	0.0189	2.88651496475187e-23	32723722	32731072	1.31829115675103e-07	35853209	35862270
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35862502	35873335	7	7	0.6526	1.31829115675103e-07	35853209	35862270	2.51273707508080e-10	35873335	35878656
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	40471613	1968	1920	0.0039	2.5127370750808e-10	35873335	35878656	9.18747166687956e-10	40471613	40471613
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40474346	40476041	2	2	-1.1747	9.18747166687956e-10	40471613	40471613	3.90747016081953e-09	40476041	40477327
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40477327	43834129	1370	1340	0.0166	3.90747016081953e-09	40476041	40477327	6.56445711438749e-07	43811939	43854527
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43835967	43883462	21	19	-0.3252	6.56445711438749e-07	43811939	43854527	5.50217742781257e-07	43860712	43919463
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43888286	54035000	3546	3466	-0.0171	5.50217742781257e-07	43860712	43919463	5.00433062633108e-36	54035000	54035000
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.682	5.00433062633108e-36	54035000	54035000	1.05440824114381e-36	54042734	54042734
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	65767409	2398	2348	-0.0145	1.05440824114381e-36	54042734	54042734	3.63891234436675e-33	65767409	65767409
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-2.0277	3.63891234436675e-33	65767409	65767409	1.06501483988106e-34	65771532	65771532
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	79018959	4032	3971	0.0103	1.06501483988106e-34	65771532	65771532	6.7251557702331e-09	79005118	79032059
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.4206	6.7251557702331e-09	79005118	79032059	2.90067656834563e-09	79079988	79112799
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6593	-0.0037	2.90067656834563e-09	79079988	79112799	4.81463178390363e-202	103841482	103841482
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.4575	4.81463178390363e-202	103841482	103841482	1.34074965366457e-195	103868154	103868154
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20664	-0.001	1.34074965366457e-195	103868154	103868154	4.04421014710948e-22	165643653	165643653
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1817	4.04421014710948e-22	165643653	165643653	1.37658033805646e-20	165650610	165650610
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1776	-0.056	1.37658033805646e-20	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5294	0.0143	NA	NA	NA	1.20659681052187e-149	16135701	16135701
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.6196	1.20659681052187e-149	16135701	16135701	3.38613638188243e-164	16140018	16140018
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	64523575	14172	13903	-0.0139	3.38613638188243e-164	16140018	16140018	1.53535236118854e-12	64523575	64523575
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.3239	1.53535236118854e-12	64523575	64523575	1.01635268353547e-12	64532949	64532949
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	117703503	19302	18901	0.0149	1.01635268353547e-12	64532949	64532949	1.18267753339490e-167	117702178	117706710
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	117706710	117825006	52	52	-0.9109	1.1826775333949e-167	117702178	117706710	8.30110369794782e-156	117823083	117827838
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	117827838	118611324	347	334	-0.0129	8.30110369794782e-156	117823083	117827838	4.46900919972068e-268	118611324	118611324
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.5559	4.46900919972068e-268	118611324	118611324	1.68568395858063e-244	118620875	118620875
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6678	0.0023	1.68568395858063e-244	118620875	118620875	7.4398447461435e-312	133433384	133433384
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.1639	7.4398447461435e-312	133433384	133433384	6.69955741812046e-234	133448277	133448277
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133860107	206	201	-0.0396	6.69955741812046e-234	133448277	133448277	4.17624478172793e-06	133839461	133878889
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133864684	133945978	26	25	-0.3056	4.17624478172793e-06	133839461	133878889	4.05428613501851e-09	133929341	133961601
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133947618	141410894	3468	3409	0.0088	4.05428613501851e-09	133929341	133961601	2.20553189981464e-09	141402937	141417702
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.45	2.20553189981464e-09	141402937	141417702	1.82932385490468e-07	141432778	141449014
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	116	0.0089	1.82932385490468e-07	141432778	141449014	6.8415595686702e-18	141689547	141690753
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.7643	6.8415595686702e-18	141689547	141690753	5.62324876289413e-20	141714168	141720303
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6611	-0.0196	5.62324876289413e-20	141714168	141720303	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7974	-0.0153	NA	NA	NA	9.70833969160478e-31	25120552	25120552
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.7058	9.70833969160478e-31	25120552	25120552	7.50827066895792e-33	25125700	25125700
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4816	7e-04	7.50827066895792e-33	25125700	25125700	0	39350798	39350798
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	-4.3537	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30804	-0.0044	0	39505256	39505256	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23308627	7995	7835	-0.0097	NA	NA	NA	1.74309863062664e-09	23297220	23338535
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23316739	23365926	8	8	0.5365	1.74309863062664e-09	23297220	23338535	5.08297490099486e-08	23338535	23405562
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4962	0.0026	5.08297490099486e-08	23338535	23405562	1.35308189854391e-105	70926188	70926188
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.733	1.35308189854391e-105	70926188	70926188	1.52339116027419e-113	70930528	70930528
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	86960197	5360	5250	-0.0015	1.52339116027419e-113	70930528	70930528	2.05783240574289e-15	86960197	86960197
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	1.3988	2.05783240574289e-15	86960197	86960197	2.15362367425769e-14	86965458	86965458
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	112062107	8410	8213	-0.0206	2.15362367425769e-14	86965458	86965458	7.04575074254076e-27	112062107	112062107
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-1.9432	7.04575074254076e-27	112062107	112062107	6.28269289956293e-27	112069192	112069192
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	116124007	1694	1669	0.0102	6.28269289956293e-27	112069192	112069192	3.13180549465931e-09	116124007	116124007
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1415	3.13180549465931e-09	116124007	116124007	9.63811279538724e-08	116130333	116130333
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8130	0.0024	9.63811279538724e-08	116130333	116130333	8.72101417394454e-15	137352394	137352394
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5646	8.72101417394454e-15	137352394	137352394	1.43467765487167e-10	137356880	137356880
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140058573	1069	1047	-0.0046	1.43467765487167e-10	137356880	137356880	3.85783061251174e-12	140040037	140064967
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140061642	140116609	22	22	0.5048	3.85783061251174e-12	140040037	140064967	1.19127516742497e-08	140110429	140119700
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140119700	140145683	12	12	-0.0605	1.19127516742497e-08	140110429	140119700	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	26389651	9483	9274	-0.003	NA	NA	NA	3.7209852938211e-13	26389651	26389651
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26390878	26392771	2	2	-1.009	3.7209852938211e-13	26389651	26389651	2.81816396472515e-08	26392771	26392771
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26395501	27038538	244	239	0.0059	2.81816396472515e-08	26392771	26392771	7.28769919052977e-19	27038538	27038538
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.5174	7.28769919052977e-19	27038538	27038538	8.80901675251084e-17	27041812	27041812
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14532	-3e-04	8.80901675251084e-17	27041812	27041812	4.84135546386365e-87	77917893	77917893
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.3921	4.84135546386365e-87	77917893	77917893	5.13405661340754e-80	77928669	77928669
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19770	-0.0139	5.13405661340754e-80	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18896166	7372	7209	-0.0102	NA	NA	NA	2.31038490583758e-10	18890351	18896166
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.7549	2.31038490583758e-10	18890351	18896166	5.97503003493864e-12	18917191	18929375
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9321	-0.008	5.97503003493864e-12	18917191	18929375	1.36988742807199e-32	55097806	55123719
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55207305	38	36	0.4869	1.36988742807199e-32	55097806	55123719	4.30709753244758e-24	55203706	55221692
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	66463477	4639	4551	0.0209	4.30709753244758e-24	55203706	55221692	4.09904641412645e-55	66463477	66463477
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.942	4.09904641412645e-55	66463477	66463477	1.69936778546509e-56	66469412	66469412
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81177333	5234	5130	0.0072	1.69936778546509e-56	66469412	66469412	2.16236297598845e-10	81177333	81177333
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-1.1997	2.16236297598845e-10	81177333	81177333	1.63023833523236e-11	81192409	81192409
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	99187169	5690	5571	-0.0125	1.63023833523236e-11	81192409	81192409	3.82962993032936e-06	99182892	99187169
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99189492	99192490	3	3	0.7108	3.82962993032936e-06	99182892	99187169	7.77865185581611e-06	99192490	99195647
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99193626	113976883	5121	5009	-0.0097	7.77865185581611e-06	99192490	99195647	1.97705564114774e-09	113972484	113979934
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	113996548	5	5	-0.7099	1.97705564114774e-09	113972484	113979934	2.30148882204299e-13	113992975	114016954
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113999831	134450318	7665	7512	-0.016	2.30148882204299e-13	113992975	114016954	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3659	0.0049	NA	NA	NA	9.64718140206e-36	9516067	9531133
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	0.9693	9.64718140206e-36	9516067	9531133	1.79716655448874e-45	9582696	9599999
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11104973	570	559	0.0011	1.79716655448874e-45	9582696	9599999	6.51217060021403e-06	11099711	11104973
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	-0.5893	6.51217060021403e-06	11099711	11104973	1.79022427222703e-07	11116883	11123452
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.9428	1.79022427222703e-07	11116883	11123452	0	11130871	11130871
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	128877382	39465	38601	0.0107	0	11130871	11130871	1.28918964905359e-14	128869663	128878823
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128878823	128887216	6	5	0.6287	1.28918964905359e-14	128869663	128878823	9.88616628411635e-06	128885243	128892254
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128888941	132088471	1277	1243	-0.0266	9.88616628411635e-06	128885243	128892254	4.84354278909663e-12	132083110	132091704
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132091704	132116038	10	10	0.6353	4.84354278909663e-12	132083110	132091704	7.35911896167771e-13	132112614	132123349
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132118942	132289090	68	67	-0.0034	7.35911896167771e-13	132112614	132123349	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7164	-0.0055	NA	NA	NA	3.70974367930189e-67	37953582	37953582
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9576	3.70974367930189e-67	37953582	37953582	1.40236098467626e-70	37957844	37957844
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	51675209	5655	5537	-0.0018	1.40236098467626e-70	37957844	37957844	1.10749345524377e-08	51671093	51675209
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51783311	51791812	4	4	0.7554	1.10749345524377e-08	51671093	51675209	6.70928105626044e-09	51791812	51793481
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51793481	71375082	4664	4548	0.0095	6.70928105626044e-09	51791812	51793481	3.12917825689057e-177	71375082	71375082
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.5497	3.12917825689057e-177	71375082	71375082	2.27094836779677e-179	71377671	71377671
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	75105505	1248	1228	0.0034	2.27094836779677e-179	71377671	71377671	3.7502989179346e-08	75101906	75105505
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	75107257	75108573	2	2	1	3.7502989179346e-08	75101906	75105505	3.2200155588614e-08	75108573	75109797
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	75109797	89659397	3378	3303	0.0113	3.2200155588614e-08	75108573	75109797	2.67851649116559e-34	89659397	89659397
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.979	2.67851649116559e-34	89659397	89659397	1.57794932886202e-28	89662326	89662326
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9151	-0.021	1.57794932886202e-28	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.6762	NA	NA	NA	1.21817020445778e-100	19490630	19497023
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	105428694	31544	30855	0.0018	1.21817020445778e-100	19490630	19497023	1.81749725852235e-07	105425440	105428694
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105432521	105461607	4	4	-0.7502	1.81749725852235e-07	105425440	105428694	0.000117071393438800	105460029	105470332
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105466912	105597555	34	30	-0.0903	0.0001170713934388	105460029	105470332	2.69344039500659e-76	105597555	105597555
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.7001	2.69344039500659e-76	105597555	105597555	3.14272875978696e-61	105632168	105632168
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105848335	47	44	-0.8496	3.14272875978696e-61	105632168	105632168	1.62820292350424e-61	105846004	105850033
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105850033	106358491	184	179	-0.0812	1.62820292350424e-61	105846004	105850033	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0941	NA	NA	NA	1.69121936292235e-08	18452491	18749895
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18692865	1	0	NA	1.69121936292235e-08	18452491	18749895	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20088256	150	146	-0.6969	NA	NA	NA	6.3135649501171e-148	20065525	20308014
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	21881379	318	310	-0.011	6.3135649501171e-148	20065525	20308014	1.99302079782254e-08	21876892	21881379
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21949888	21949888	1	0	NA	1.99302079782254e-08	21876892	21881379	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21957989	21982746	3	3	-0.9464	NA	NA	NA	3.70541527446452e-09	21982746	21996787
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21996787	35172697	4286	4194	-0.0217	3.70541527446452e-09	21982746	21996787	1.27933487284358e-06	35168823	35172697
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35174207	35182617	5	5	0.5754	1.27933487284358e-06	35168823	35172697	2.32265503950981e-08	35182617	35186438
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35183604	41637456	2740	2681	0.0133	2.32265503950981e-08	35182617	35186438	7.87825612135231e-10	41625173	41638388
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41638388	41682937	5	5	0.6242	7.87825612135231e-10	41625173	41638388	1.95295979035344e-06	41682925	41706959
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	69260389	11773	11519	0.002	1.95295979035344e-06	41682925	41706959	1.31251626064773e-07	69248176	69260389
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69262017	69264503	2	2	-1.0586	1.31251626064773e-07	69248176	69260389	6.2758659612076e-07	69264503	69266172
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69266172	74669752	2422	2372	0.0212	6.2758659612076e-07	69264503	69266172	9.40780384636745e-145	74669752	74671626
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.422	9.40780384636745e-145	74669752	74671626	4.83925605759792e-168	74680338	74680439
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9386	-0.0151	4.83925605759792e-168	74680338	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	22561536	7552	7371	0.0107	NA	NA	NA	1.13481283180224e-08	22547406	22561536
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22567551	22617217	7	7	-0.6401	1.13481283180224e-08	22547406	22561536	2.27721305080567e-09	22617217	22636249
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	75093957	12964	12692	0.0099	2.27721305080567e-09	22617217	22636249	5.80614069237855e-44	75093957	75093957
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.1003	5.80614069237855e-44	75093957	75093957	1.72322416428054e-48	75100865	75100865
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	82554683	2739	2681	-0.0282	1.72322416428054e-48	75100865	75100865	3.11408434455788e-07	82553120	82554683
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	82554993	82560354	2	2	1.0097	3.11408434455788e-07	82553120	82554683	5.31107126174877e-05	82560354	82563981
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	82562248	88690571	2390	2334	-0.0094	5.31107126174877e-05	82560354	82563981	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	405	0.0304	NA	NA	NA	3.4926901062946e-15	1027248	1027248
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1027736	1	0	NA	3.4926901062946e-15	1027248	1027248	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1028979	1030766	3	3	1.3689	NA	NA	NA	1.68722045879195e-16	1030766	1030766
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	13152	0.0282	1.68722045879195e-16	1030766	1030766	2.78893065710085e-16	36672710	36673853
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.97	2.78893065710085e-16	36672710	36673853	1.26585116080342e-14	36684619	36686013
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1980	0.0511	1.26585116080342e-14	36684619	36686013	4.14633703161694e-19	41553226	41572001
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41708551	45	45	0.4356	4.14633703161694e-19	41553226	41572001	8.36192537593686e-24	41702238	42151941
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	8.36192537593686e-24	41702238	42151941	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13349	0.0255	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	11756580	4011	3924	-0.0095	NA	NA	NA	2.99925058551950e-17	11756580	11756580
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11757823	11760498	3	3	-1.2285	2.9992505855195e-17	11756580	11756580	2.67672720841652e-17	11760498	11760498
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11763220	45339112	9727	9519	-0.0111	2.67672720841652e-17	11760498	11760498	3.33902324293003e-09	45328370	45346544
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45340382	45372526	18	17	0.3687	3.33902324293003e-09	45328370	45346544	8.30359855196365e-10	45364279	45383849
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45374875	72643289	7992	7817	-0.0194	8.30359855196365e-10	45364279	45383849	7.52788515534957e-05	72595427	72657882
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	72646305	72703605	23	23	0.2227	7.52788515534957e-05	72595427	72657882	7.52990880704874e-06	72692845	72729449
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	72706651	76116026	1190	1167	-0.0645	7.52990880704874e-06	72692845	72729449	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	480	0.0723	NA	NA	NA	4.74993281468192e-06	1395246	1398325
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3675	4.74993281468192e-06	1395246	1398325	2.00215463588347e-35	1400840	1405308
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	40352568	12115	11863	0.0516	2.00215463588347e-35	1400840	1405308	1.25524372269085e-35	40350432	40352568
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.1102	1.25524372269085e-35	40350432	40352568	2.70446781209943e-07	40356341	40359145
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	63788698	10448	10239	0.0545	2.70446781209943e-07	40356341	40359145	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	568	-0.0239	NA	NA	NA	2.66527215762150e-210	1511632	1515948
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	8	-3.3471	2.6652721576215e-210	1511632	1515948	3.69784987182117e-302	1528899	1531162
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	48696441	16074	15721	-0.0059	3.69784987182117e-302	1528899	1531162	1.53059770768181e-13	48674855	48717040
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48699647	48777730	37	36	0.2599	1.53059770768181e-13	48674855	48717040	2.21089274480667e-07	48755061	48808508
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48780058	52080395	1135	1109	0.0086	2.21089274480667e-07	48755061	48808508	2.59235090976292e-14	52078884	52080395
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.9026	2.59235090976292e-14	52078884	52080395	1.95048661342977e-10	52090393	52092989
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3630	-0.0332	1.95048661342977e-10	52090393	52092989	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13144	-0.0097	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22354945	2848	2777	0.0114	NA	NA	NA	6.9180862147042e-14	22354945	22354945
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22356179	22357051	2	2	-1.5893	6.9180862147042e-14	22354945	22354945	4.12122552116368e-14	22357051	22357051
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22358386	22667608	132	129	0.0576	4.12122552116368e-14	22357051	22357051	1.72682843823221e-06	22599899	22686731
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-0.3108	1.72682843823221e-06	22599899	22686731	4.96278243057411e-06	22708012	22751788
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	23991961	602	587	0.0019	4.96278243057411e-06	22708012	22751788	9.4849973851085e-45	23962623	24005497
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23994618	24241592	90	87	0.4305	9.4849973851085e-45	23962623	24005497	6.94671678049682e-43	24228256	24256981
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24249014	49571068	12860	12542	0.0133	6.94671678049682e-43	24228256	24256981	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	767373	511	495	-0.0102	NA	NA	NA	0.00111602182631292	723776	772351
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	767408	800669	24	23	-0.2846	0.00111602182631292	723776	772351	4.59348568852846e-07	796371	811977
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800956	1427392	252	244	0.0644	4.59348568852846e-07	796371	811977	1.22844099299148e-18	1427392	1431240
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.2938	1.22844099299148e-18	1427392	1431240	4.60732901679573e-13	1431411	1432953
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	62	-0.0474	4.60732901679573e-13	1431411	1432953	4.25634891697439e-06	1526804	1528282
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.8094	4.25634891697439e-06	1526804	1528282	1.72045753970297e-06	1530474	1533546
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2301365	541	528	0.0177	1.72045753970297e-06	1530474	1533546	7.07106485822515e-13	2300485	2301365
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	1.0518	7.07106485822515e-13	2300485	2301365	2.85992444079338e-16	2304398	2306110
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	383	-0.0376	2.85992444079338e-16	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	23624350	7995	7822	0.9883	0	2708113	2711273	2.62235131961407e-11	23617575	23624350
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	23625456	23625456	1	0	NA	2.62235131961407e-11	23617575	23624350	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	23627230	23633836	4	4	0.2764	NA	NA	NA	4.09672464608758e-09	23633836	23637684
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	23634931	63362704	11453	11197	1.004	4.09672464608758e-09	23633836	23637684	1.00258208218090e-09	63361143	63362704
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	63364917	63366019	2	2	-0.1883	1.0025820821809e-09	63361143	63362704	4.99580736586982e-08	63366019	63368676
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	63368676	69646994	1756	1722	0.9753	4.99580736586982e-08	63366019	63368676	3.71972777092003e-07	69645040	69646994
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69649160	69650824	2	2	-0.1266	3.71972777092003e-07	69645040	69646994	3.71039014188459e-07	69650824	69659613
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69659613	76998610	1726	1692	0.9954	3.71039014188459e-07	69650824	69659613	2.83610895457987e-25	76998610	76998610
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.0568	2.83610895457987e-25	76998610	76998610	1.41571455554424e-28	77010018	77010018
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	111776974	8814	8618	0.9912	1.41571455554424e-28	77010018	77010018	2.82962211706862e-08	111775547	111778323
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111778323	111780974	3	3	0.1068	2.82962211706862e-08	111775547	111778323	1.67460260356067e-16	111779952	111782110
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111782110	154582414	13376	13059	0.991	1.67460260356067e-16	111779952	111782110	0	154578922	154582414
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	-0.025	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-4.1899	NA	NA	NA	1.38880407923836e-32	3223585	3733715
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4431527	10	9	0.242	1.38880407923836e-32	3223585	3733715	8.2859603739618e-18	4431527	4846477
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7054924	181	178	-3.8894	8.2859603739618e-18	4431527	4846477	1.00364602703913e-06	7005620	7214259
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	153	-3.0064	1.00364602703913e-06	7005620	7214259	1.46727808634763e-06	7614417	7656915
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	33	-4.4694	1.46727808634763e-06	7614417	7656915	1.59541360505104e-10	7708716	7709619
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7712882	2	2	-0.9742	1.59541360505104e-10	7708716	7709619	0.119845623630403	7712882	7847379
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7713973	7897073	61	58	-3.0941	0.119845623630403	7712882	7847379	0.00659088250520601	7848999	7897073
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905286	7914104	4	4	-1.0455	0.00659088250520601	7848999	7897073	2.25742230437981e-23	7914104	7914104
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7938700	7	7	-4.9453	2.25742230437981e-23	7914104	7914104	0.000191604947845287	7936024	7964586
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7942730	7997485	12	12	-2.9801	0.000191604947845287	7936024	7964586	1.37972613974010e-06	7985527	8005148
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8178487	39	36	-4.3813	1.3797261397401e-06	7985527	8005148	9.78403532212303e-07	8168499	8182880
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8199414	7	7	-2.9118	9.78403532212303e-07	8168499	8182880	1.60665585106947e-05	8186463	8208164
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8201959	8292347	21	20	-4.3318	1.60665585106947e-05	8186463	8208164	5.22572718307669e-15	8289709	8292347
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8293425	8324291	11	11	-2.5579	5.22572718307669e-15	8289709	8292347	0.000233706491551746	8324291	8366302
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10513747	292	279	-3.9807	0.000233706491551746	8324291	8366302	8.90948154348577e-29	10512616	10513747
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.6839	8.90948154348577e-29	10512616	10513747	0.00984633270252237	10631941	11698871
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12502304	8	8	-2.4433	0.00984633270252237	10631941	11698871	0.00070308710847494	11249952	12511461
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12511461	12541506	10	10	-4.8994	0.00070308710847494	11249952	12511461	4.25810995079294e-15	12541506	12541506
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12554612	5	5	-1.4676	4.25810995079294e-15	12541506	12541506	6.29775382604319e-06	12554612	12554612
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12556034	12570314	6	5	-3.9068	6.29775382604319e-06	12554612	12554612	3.71653131434039e-07	12570314	12571053
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12571053	12590969	13	13	-1.5008	3.71653131434039e-07	12570314	12571053	1.13273666839657e-09	12588578	12593244
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12611624	11	11	-3.8193	1.13273666839657e-09	12588578	12593244	5.18938430000599e-06	12607539	12618263
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	18	-1.8495	5.18938430000599e-06	12607539	12618263	8.27919228509442e-12	12658135	12687167
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12804329	19	19	-4.202	8.27919228509442e-12	12658135	12687167	5.76522608229382e-08	12786515	12820920
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	12863434	14	14	-2.4861	5.76522608229382e-08	12786515	12820920	1.27547148735197e-10	12861657	12863434
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12865349	12872417	4	4	-5.1385	1.27547148735197e-10	12861657	12863434	2.97648965557428e-05	12872417	12876008
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12875039	12924438	17	17	-3.1135	2.97648965557428e-05	12872417	12876008	0.00420857354965042	12909643	12975651
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13048283	49	48	-2.0337	0.00420857354965042	12909643	12975651	0.00128756307141922	13024023	13076862
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13104920	23	22	-3.3346	0.00128756307141922	13024023	13076862	3.01102560516736e-06	13089124	13104920
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-0.983	3.01102560516736e-06	13089124	13104920	9.41417920071098e-34	13128515	13128515
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-4.4264	9.41417920071098e-34	13128515	13128515	0.0338838598442797	13148290	13221044
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13256555	30	29	-3.2558	0.0338838598442797	13148290	13221044	8.71686623150895e-05	13176983	13313420
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14358464	373	358	-4.1506	8.71686623150895e-05	13176983	13313420	9.79442859449972e-12	14328579	14391767
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	87	-3.2711	9.79442859449972e-12	14328579	14391767	0.00263767223505628	14487022	14563486
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	0.00263767223505628	14487022	14563486	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14644293	35	33	-2.1643	NA	NA	NA	2.50983287610666e-16	14579298	14684159
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15139441	103	99	-4.1341	2.50983287610666e-16	14579298	14684159	1.95231917953867e-06	15103953	15176870
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15284717	81	80	-3.2574	1.95231917953867e-06	15103953	15176870	2.13134111771739e-10	15265021	15291532
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	79	-4.3605	2.13134111771739e-10	15265021	15291532	7.52083298842631e-05	15398652	15477260
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15409110	1	0	NA	7.52083298842631e-05	15398652	15477260	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15410566	15630463	97	95	-3.498	NA	NA	NA	0.000210000971249002	15550511	15655003
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15915466	46	46	-4.5331	0.000210000971249002	15550511	15655003	1.78842237267483e-08	15898644	15965605
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15920478	1	0	NA	1.78842237267483e-08	15898644	15965605	NA	NA	NA
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	16182565	107	106	-3.1988	NA	NA	NA	9.39423531021561e-13	16156464	16198927
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	17496151	230	224	-4.2011	9.39423531021561e-13	16156464	16198927	4.23633156788504e-09	17487972	17496151
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17503455	17517470	4	4	-1.009	4.23633156788504e-09	17487972	17496151	5.21980805942195e-06	17517470	17533546
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17521483	22139807	758	727	-4.0212	5.21980805942195e-06	17517470	17533546	5.07304522609187e-05	22049641	22158616
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.1703	5.07304522609187e-05	22049641	22158616	8.35341562990111e-10	22175425	22179794
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	91	-4.3126	8.35341562990111e-10	22175425	22179794	1.56262815925927e-58	22926726	26870361
MSK_252152915686_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	82	-1.411	1.56262815925927e-58	22926726	26870361	NA	NA	NA
