Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12762774	4514	4312	0.0185	NA	NA	NA	6.04995749427241e-148	12762774	12762774
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12831942	5	5	-3.809	6.04995749427241e-148	12762774	12762774	1.65423329657969e-162	12831942	12831942
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12835156	12835156	1	0	NA	1.65423329657969e-162	12831942	12831942	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	72537426	23374	22284	0.0028	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	-4.3846	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110033018	11704	11172	0.0034	0	72579311	72579311	3.9034604943719e-08	110023268	110033018
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.3636	3.9034604943719e-08	110023268	110033018	2.39635685611497e-08	110039388	110041712
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	142719230	3889	3700	-0.0101	2.39635685611497e-08	110039388	110041712	1.50460011095184e-34	121015302	143238284
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	142721264	144093719	104	102	-0.3969	1.50460011095184e-34	121015302	143238284	1.93270745385735e-27	143923947	144109866
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	146297175	562	533	-0.0239	1.93270745385735e-27	143923947	144109866	1.97956931468336e-15	146274661	147313991
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147847659	39	37	-0.465	1.97956931468336e-15	146274661	147313991	5.93843607440749e-18	147497268	148115321
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	148081741	1	0	NA	5.93843607440749e-18	147497268	148115321	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	200596027	19491	18593	-0.0013	NA	NA	NA	1.28369925022836e-09	200572541	200620756
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200803726	43	38	-0.3431	1.28369925022836e-09	200572541	200620756	1.37059313085769e-09	200678532	200816497
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	246755298	17279	16493	-0.0028	1.37059313085769e-09	200678532	200816497	9.317960757846e-14	246702361	246805521
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246769018	246882156	33	33	-0.4345	9.317960757846e-14	246702361	246805521	2.35090706967892e-14	246875016	246911251
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902260	247186514	93	89	0.0221	2.35090706967892e-14	246875016	246911251	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35821494	12024	11456	-0.0045	NA	NA	NA	1.30026925453092e-11	35821494	35821494
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.6204	1.30026925453092e-11	35821494	35821494	5.96773660399718e-12	35844884	35844884
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	5.96773660399718e-12	35844884	35844884	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	89876334	18324	17461	-0.0026	NA	NA	NA	6.83866663456904e-09	89871269	89879264
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89877995	91155301	14	14	-0.5382	6.83866663456904e-09	89871269	89879264	1.34504691789210e-08	91148554	91270311
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91158269	238217378	45774	43566	-0.0019	1.3450469178921e-08	91148554	91270311	6.04274444163325e-10	238214027	238217378
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238219154	238219154	1	0	NA	6.04274444163325e-10	238214027	238217378	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238220470	238223192	3	3	-1.2372	NA	NA	NA	4.1312541427019e-08	238223192	238224411
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238224411	242689978	1684	1612	-0.0057	4.1312541427019e-08	238223192	238224411	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164005577	53491	50966	-0.0036	NA	NA	NA	7.4029512431881e-78	164005577	164005577
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.5705	7.4029512431881e-78	164005577	164005577	2.49878836977387e-33	164027724	164027724
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	0.5286	2.49878836977387e-33	164027724	164027724	9.4743886477008e-13	164101776	164123806
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	196820428	11130	10604	-0.0027	9.4743886477008e-13	164101776	164123806	1.21737236866543e-46	196810503	196904349
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196822133	1	0	NA	1.21737236866543e-46	196810503	196904349	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196957322	29	26	-0.8767	NA	NA	NA	1.14725438372331e-39	196950095	196958467
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199329592	955	914	-0.009	1.14725438372331e-39	196950095	196958467	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	132135793	38029	36247	0.0014	NA	NA	NA	4.37304551300325e-30	132102054	132168747
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	132144090	132571968	64	59	0.4707	4.37304551300325e-30	132102054	132168747	1.38654205370177e-31	132553941	132608051
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	132583288	186676034	15517	14781	-0.0013	1.38654205370177e-31	132553941	132608051	1.49402339602296e-46	186676034	186676034
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.0932	1.49402339602296e-46	186676034	186676034	1.60720686192472e-45	186680176	186680176
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190710812	1439	1391	-0.0099	1.60720686192472e-45	186680176	186680176	1.20802022225633e-19	190674430	190754887
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190924564	66	63	-0.3834	1.20802022225633e-19	190674430	190754887	1.55293766749732e-08	190899523	190950585
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191035341	35	35	0.008	1.55293766749732e-08	190899523	190950585	0.0733875592221241	191004049	191133609
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191037553	191037553	1	0	NA	0.0733875592221241	191004049	191133609	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191041481	191153613	8	8	-0.363	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	97060205	27471	26212	-0.0032	NA	NA	NA	3.73898299890589e-12	97055188	97077666
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97126918	8	8	-0.8215	3.73898299890589e-12	97055188	97077666	5.4972079409701e-12	97114071	97135634
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97135634	180342860	26167	24947	-0.002	5.4972079409701e-12	97114071	97135634	2.23233539155765e-07	180189516	180346557
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	0.7018	2.23233539155765e-07	180189516	180346557	1.32504200438198e-10	180352261	180362342
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	101	-0.0725	1.32504200438198e-10	180352261	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	240119	56	51	-0.0826	NA	NA	NA	7.92878423087673e-18	232366	246974
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	327962	46	43	-0.6378	7.92878423087673e-18	232366	246974	1.48166043823184e-41	323898	331014
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	32558677	11575	11064	0.0021	1.48166043823184e-41	323898	331014	1.63636374111169e-129	32558677	32564884
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-2.6129	1.63636374111169e-129	32558677	32564884	2.23019685757726e-128	32593151	32600962
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	103841482	21513	20512	-0.0018	2.23019685757726e-128	32593151	32600962	9.24156557808816e-223	103841482	103841482
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.8442	9.24156557808816e-223	103841482	103841482	5.7783644500135e-234	103868154	103868154
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	110498221	2256	2146	0.0015	5.7783644500135e-234	103868154	103868154	2.70125720382061e-14	110495371	110498221
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110503513	110520229	7	7	-0.9164	2.70125720382061e-14	110495371	110498221	3.31897068314613e-13	110520229	110524191
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110521603	110521603	1	0	NA	3.31897068314613e-13	110520229	110524191	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110524191	165643653	18842	17990	-0.0055	NA	NA	NA	5.89676266621059e-238	165643653	165643653
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-5.7397	5.89676266621059e-238	165643653	165643653	8.3089026775564e-224	165649379	165649379
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	8.3089026775564e-224	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1732	-0.0151	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26097755	8798	8363	0.0027	NA	NA	NA	3.69053936985284e-73	26097755	26097755
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.0288	3.69053936985284e-73	26097755	26097755	1.42414648025493e-75	26108369	26108369
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	141690753	41133	39210	3e-04	1.42414648025493e-75	26108369	26108369	0	141690753	141690753
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-4.2453	0	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	154682315	5026	4769	-0.0035	0	141714168	141714168	6.42343135012525e-13	154677653	154687743
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154684956	154715016	13	13	-0.6933	6.42343135012525e-13	154677653	154687743	7.98249144702746e-12	154707958	154722992
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154717463	158821263	1713	1632	-0.0137	7.98249144702746e-12	154707958	154722992	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	16252838	5286	5029	-0.0023	NA	NA	NA	2.44730269914543e-11	16240739	16269186
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16261499	16309306	10	9	-0.7682	2.44730269914543e-11	16240739	16269186	1.54517622123759e-11	16294663	16373516
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16315130	25120552	2863	2737	6e-04	1.54517622123759e-11	16294663	16373516	2.19695790246774e-55	25120552	25120552
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	2.8611	2.19695790246774e-55	25120552	25120552	4.04180986114642e-59	25125700	25125700
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4667	-0.0064	4.04180986114642e-59	25125700	25125700	4.81878419224582e-107	39345557	39352361
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8816	4.81878419224582e-107	39345557	39352361	1.73393046678336e-103	39504332	39508035
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	29915	2e-04	1.73393046678336e-103	39504332	39508035	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6685358	2471	2344	0.0039	NA	NA	NA	2.35923145505943e-07	6681606	6685358
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-1.0119	2.35923145505943e-07	6681606	6685358	4.97485188688049e-07	6698290	6704941
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	6701392	1	0	NA	4.97485188688049e-07	6698290	6704941	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6704941	15802255	2983	2838	-0.0042	NA	NA	NA	4.0098203960912e-124	15802255	15802255
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-5.006	4.0098203960912e-124	15802255	15802255	4.0029720696954e-121	15807123	15807123
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	15813356	1	0	NA	4.0029720696954e-121	15807123	15807123	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	22477358	2376	2265	0.0014	NA	NA	NA	2.60768644667335e-32	22477358	22477358
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-2.6287	2.60768644667335e-32	22477358	22477358	2.99802455098690e-32	22492603	22492603
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	4973	0.0033	2.9980245509869e-32	22492603	22492603	3.29312586003804e-17	70926188	70926188
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.9311	3.29312586003804e-17	70926188	70926188	2.26075623264873e-16	70930528	70930528
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22613	-0.0052	2.26075623264873e-16	70930528	70930528	1.31167057049769e-32	137352394	137352394
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.6757	1.31167057049769e-32	137352394	137352394	5.66250530566349e-25	137356880	137356880
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1040	-0.0048	5.66250530566349e-25	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	67742738	20252	19301	-0.0082	NA	NA	NA	3.80444868356603e-27	67738803	67745379
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67745379	67784457	18	18	-0.8133	3.80444868356603e-27	67738803	67745379	5.66590900873708e-26	67782096	67789338
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67787935	77917893	4322	4112	-0.004	5.66590900873708e-26	67782096	67789338	7.11942424149341e-20	77917893	77917893
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.1349	7.11942424149341e-20	77917893	77917893	1.25319851216472e-19	77928669	77928669
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19311	-0.0048	1.25319851216472e-19	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1698	0.007	NA	NA	NA	1.33212376932808e-243	4923300	4923300
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-5.7124	1.33212376932808e-243	4923300	4923300	6.15108890699159e-300	4932214	4932214
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14389	-4e-04	6.15108890699159e-300	4932214	4932214	2.60423814948689e-25	55097753	55127355
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55123719	1	0	NA	2.60423814948689e-25	55097753	55127355	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	37	0.5522	NA	NA	NA	1.97022360356034e-25	55205278	55223056
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134443483	28359	27032	0.0015	1.97022360356034e-25	55205278	55223056	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134450318	134450318	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3564	0.0045	NA	NA	NA	1.40616286971151e-38	9516067	9531133
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	12	1.2177	1.40616286971151e-38	9516067	9531133	4.69354306285727e-41	9582696	9590351
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	46992235	11729	11182	-6e-04	4.69354306285727e-41	9582696	9590351	6.0243411353918e-12	46992235	46992235
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.6437	6.0243411353918e-12	46992235	46992235	1.16844259977755e-11	46996769	46996769
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	100624427	17950	17124	0.0027	1.16844259977755e-11	46996769	46996769	4.34329725744194e-102	100624427	100624427
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-3.852	4.34329725744194e-102	100624427	100624427	7.49604037614542e-103	100629832	100629832
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	132289090	11723	11179	0.0033	7.49604037614542e-103	100629832	100629832	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18194544	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18348833	71375082	17662	16822	-0.0013	NA	NA	NA	4.68193187479459e-96	71375082	71375082
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.5399	4.68193187479459e-96	71375082	71375082	1.29391800436859e-96	71377671	71377671
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13320	-0.0035	1.29391800436859e-96	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	36	-0.3624	NA	NA	NA	5.62627377941274e-11	19415745	19457688
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	34674458	5713	5453	0.0098	5.62627377941274e-11	19415745	19457688	7.28339307538171e-11	34674458	34674458
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.5751	7.28339307538171e-11	34674458	34674458	1.02099049527329e-10	34679959	34679959
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	105597555	25890	24684	-0.0059	1.02099049527329e-10	34679959	34679959	5.53255871456963e-286	105597555	105597555
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.2143	5.53255871456963e-286	105597555	105597555	5.72059346330135e-90	105632168	105632168
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105948347	72	71	-0.0534	5.72059346330135e-90	105632168	105632168	5.20209132059353e-115	105948347	105951399
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	13	-4.5557	5.20209132059353e-115	105948347	105951399	1.14003894434610e-191	105985458	105989160
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	140	0.0224	1.1400389443461e-191	105985458	105989160	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18450562	4	4	0.2507	NA	NA	NA	0.000351282883280056	18432558	18749895
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18452491	20308014	153	150	-0.4462	0.000351282883280056	18432558	18749895	2.82188088647872e-65	20053008	20335887
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	74669752	21554	20508	-0.0041	2.82188088647872e-65	20053008	20335887	5.48124916929169e-16	74665386	74669752
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.3581	5.48124916929169e-16	74665386	74669752	1.85203322244032e-16	74680439	74696127
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9135	-0.0047	1.85203322244032e-16	74680439	74696127	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5214	0.0023	NA	NA	NA	4.88320203229306e-10	14678535	14876356
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.5959	4.88320203229306e-10	14678535	14876356	3.97354449609944e-10	15029941	15039224
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	34329518	5227	4971	0.0059	3.97354449609944e-10	15029941	15039224	1.45364299949894e-19	34285301	34350707
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34602318	50	49	0.4486	1.45364299949894e-19	34285301	34350707	1.67177455206550e-22	34578641	34630537
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	75093957	9764	9318	-0.0045	1.6717745520655e-22	34578641	34630537	6.11343758591241e-66	75093957	75093957
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.0993	6.11343758591241e-66	75093957	75093957	3.35193868344063e-61	75100865	75100865
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4921	-0.0045	3.35193868344063e-61	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	396	0.0273	NA	NA	NA	3.5005580454278e-11	1026339	1027736
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.2214	3.5005580454278e-11	1026339	1027736	1.10828523158999e-11	1030715	1031233
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	8147124	3123	2989	0.0138	1.10828523158999e-11	1030715	1031233	1.50454230828113e-08	8144634	8147124
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.4851	1.50454230828113e-08	8144634	8147124	4.31914337915583e-09	8149084	8154339
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	36673853	10327	9839	0.0045	4.31914337915583e-09	8149084	8154339	3.9855606985469e-14	36672710	36673853
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.0561	3.9855606985469e-14	36672710	36673853	3.07012063604429e-14	36684619	36686013
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1939	0.0166	3.07012063604429e-14	36684619	36686013	1.09361362864426e-12	41512318	41526558
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	20	0.5569	1.09361362864426e-12	41512318	41526558	1.9895214044707e-12	41558893	41574775
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	78000100	13435	12802	0.0083	1.9895214044707e-12	41558893	41574775	5.09249116863342e-09	78000100	78000100
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78002158	78006585	3	2	1.5021	5.09249116863342e-09	78000100	78000100	2.68013344893174e-09	78006585	78006585
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78009084	78009084	1	0	NA	2.68013344893174e-09	78006585	78006585	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78011084	78653545	287	266	-0.0101	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15424	-0.006	NA	NA	NA	9.08309779209895e-10	53090140	53110731
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53116053	9	7	-0.7955	9.08309779209895e-10	53090140	53110731	9.63611145403516e-10	53099601	53118362
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53118362	75247123	6430	6109	-0.0123	9.63611145403516e-10	53099601	53118362	1.07835481054626e-07	75235682	75269342
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75252781	75282954	14	13	0.5024	1.07835481054626e-07	75235682	75269342	2.08337206416320e-07	75271360	75291671
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75284189	76116026	312	298	-0.0403	2.0833720641632e-07	75271360	75291671	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	467	0.0254	NA	NA	NA	5.73567821476571e-12	1398325	1398325
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9621	5.73567821476571e-12	1398325	1398325	3.5951585645465e-13	1400840	1400840
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	9146708	3574	3398	0.0314	3.5951585645465e-13	1400840	1400840	6.11612761612415e-11	9146708	9146708
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9147742	9150878	2	2	1.7977	6.11612761612415e-11	9146708	9146708	2.00666194446709e-12	9150878	9150878
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9152145	58208527	16397	15660	0.0158	2.00666194446709e-12	9150878	9150878	1.63539943442941e-09	58198955	58208527
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	14	0.611	1.63539943442941e-09	58198955	58208527	2.13590424819381e-10	58244012	58259101
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59414898	573	545	0.0059	2.13590424819381e-10	58244012	58259101	1.11523258952745e-14	59412581	59414898
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.8383	1.11523258952745e-14	59412581	59414898	2.73152945835567e-14	59434202	59440274
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63787171	1993	1915	0.0015	2.73152945835567e-14	59434202	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	554	-0.0154	NA	NA	NA	2.57545682795861e-97	1511632	1516966
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	7	-2.7836	2.57545682795861e-97	1511632	1516966	1.04688527595627e-120	1528899	1531162
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19984	-0.0022	1.04688527595627e-120	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46920225	13440	12766	-0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46922972	46922972	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2859	0.0107	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	20	-3.6155	0	22667608	22679305	0	22718614	22721042
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	49571068	13553	12928	0.0071	0	22718614	22721042	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1431411	789	760	-0.0193	NA	NA	NA	3.22321325828427e-14	1431411	1431411
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-2.0777	3.22321325828427e-14	1431411	1431411	3.43541382018249e-17	1432953	1432953
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2301365	608	578	-0.0223	3.43541382018249e-17	1432953	1432953	2.89627781177997e-11	2300485	2301365
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	1.043	2.89627781177997e-11	2300485	2301365	2.02621721194644e-09	2304398	2307282
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2372138	72	68	0.0694	2.02621721194644e-09	2304398	2307282	3.89513788406495e-12	2367351	2375499
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2373235	2417595	53	51	-0.3423	3.89513788406495e-12	2367351	2375499	3.45811367440518e-09	2410643	2430156
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2418497	2418497	1	0	NA	3.45811367440518e-09	2410643	2430156	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2418980	2638587	196	192	-0.033	NA	NA	NA	4.7989031811375e-08	2637964	2638587
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2640484	2	2	1.2914	4.7989031811375e-08	2637964	2638587	9.75274392309594e-10	2640484	2640484
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642054	2642054	1	0	NA	9.75274392309594e-10	2640484	2640484	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2642145	2708291	64	62	-0.0975	NA	NA	NA	2.06750465370316e-130	2708291	2711273
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6455262	1199	1142	1.039	2.06750465370316e-130	2708291	2711273	7.5250735927031e-159	6445142	6473275
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6459644	8093113	496	476	1.5609	7.5250735927031e-159	6445142	6473275	3.21192737021095e-239	8080231	8119579
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8108521	132058651	36233	34524	1.0608	3.21192737021095e-239	8080231	8119579	5.17707263691833e-13	132050408	132081048
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132060329	132060329	1	0	NA	5.17707263691833e-13	132050408	132081048	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132064246	132112847	16	16	1.7153	NA	NA	NA	3.90979114356267e-13	132106216	132120342
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132115275	154582414	7189	6807	1.0527	3.90979114356267e-13	132106216	132120342	0	154578922	154599547
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154586690	1	0	NA	0	154578922	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154599547	154888224	200	188	-0.03	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2769294	24	23	-4.3848	NA	NA	NA	0.000372751421393549	2746781	2771455
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2771455	2784560	11	10	-2.475	0.000372751421393549	2746781	2771455	1.49199099208555e-10	2783745	2792940
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3223585	88	83	-4.6066	1.49199099208555e-10	2783745	2792940	1.48754861730233e-28	3034907	3772482
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	15	-1.4293	1.48754861730233e-28	3034907	3772482	9.69394028259842e-08	4948824	6711090
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	165	-3.8437	9.69394028259842e-08	4948824	6711090	4.9421638160587e-05	7005620	7219774
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	118	-2.9356	4.9421638160587e-05	7005620	7219774	0.175658529690737	7204505	7648873
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7653082	31	29	-3.5274	0.175658529690737	7204505	7648873	0.082236684305399	7581867	7666216
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	33	-4.5329	0.082236684305399	7581867	7666216	1.05136462415599e-06	7701303	7734410
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8016395	90	81	-3.1439	1.05136462415599e-06	7701303	7734410	2.91493521512007e-13	7985612	8057124
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8036254	8036254	1	0	NA	2.91493521512007e-13	7985612	8057124	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	8280065	60	55	-4.6939	NA	NA	NA	1.77592478716357e-19	8259766	8280065
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8324328	14	14	-2.3018	1.77592478716357e-19	8259766	8280065	1.11507208154679e-06	8324291	8341218
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8327467	10513747	291	266	-4.1024	1.11507208154679e-06	8324291	8341218	3.46477566349638e-18	10506718	10550419
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-1.4665	3.46477566349638e-18	10506718	10550419	2.84459254032761e-11	11249952	12502304
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.8859	2.84459254032761e-11	11249952	12502304	1.68452404101408e-07	12537944	12554612
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-2.24	1.68452404101408e-07	12537944	12554612	2.50092313048116e-05	12625208	12715696
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	19	-4.0467	2.50092313048116e-05	12625208	12715696	3.10563845253987e-05	12796639	12875039
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	105	-2.2917	3.10563845253987e-05	12796639	12875039	2.87578548239033e-06	13100625	13133803
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13165652	21	19	-4.1915	2.87578548239033e-06	13100625	13133803	0.0502223816734225	13148290	13240240
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13166582	13262997	25	24	-3.2051	0.0502223816734225	13148290	13240240	1.71951959090528e-06	13236901	13286708
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13566041	145	134	-4.3211	1.71951959090528e-06	13236901	13286708	0.000188076994659492	13541808	13603478
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13566905	13705594	28	22	-3.3787	0.000188076994659492	13541808	13603478	6.9227728432615e-05	13606316	13717328
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	25	-4.5629	6.9227728432615e-05	13606316	13717328	2.42623629547317e-07	13787559	13823928
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13869106	11	10	-3.4405	2.42623629547317e-07	13787559	13823928	0.000526045967048352	13869106	13891301
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13870089	14122129	120	115	-4.6018	0.000526045967048352	13869106	13891301	5.76697303122794e-07	14122036	14122129
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.8268	5.76697303122794e-07	14122036	14122129	5.77742772826184e-05	14143748	14214157
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	27	-4.5366	5.77742772826184e-05	14143748	14214157	0.000461656968575083	14330251	14382361
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	91	-3.3291	0.000461656968575083	14330251	14382361	5.39332322261641e-09	14498784	14528771
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	25	-1.4018	5.39332322261641e-09	14498784	14528771	8.9281546234969e-15	14566592	14596156
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	391	-3.7361	8.9281546234969e-15	14566592	14596156	4.86599096554067e-06	15774136	15967120
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	47	-2.5983	4.86599096554067e-06	15774136	15967120	0.00241858833230193	15990153	16087502
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16215750	77	72	-3.5704	0.00241858833230193	15990153	16087502	0.00225444419295806	16124286	16593391
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16217583	16217583	1	0	NA	0.00225444419295806	16124286	16593391	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	21036503	706	660	-4.1749	NA	NA	NA	3.46002867769081e-07	21034708	21041164
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.3357	3.46002867769081e-07	21034708	21041164	6.81460021023451e-07	21048365	21060047
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	6.81460021023451e-07	21048365	21060047	NA	NA	NA
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	241	-4.1174	NA	NA	NA	0.000343342660221956	22040373	22158616
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.3283	0.000343342660221956	22040373	22158616	4.15412843796188e-08	22175425	22181855
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	85	-4.3255	4.15412843796188e-08	22175425	22181855	1.04863846212482e-62	23283689	26870361
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-1.0929	1.04863846212482e-62	23283689	26870361	2.66504268086058e-05	26941769	26998633
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.7531	2.66504268086058e-05	26941769	26998633	0.000204223421481304	27003308	27069765
MSK_252152915832_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	29	-1.0009	0.000204223421481304	27003308	27069765	NA	NA	NA
