Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	12762774	4514	4379	0.0094	NA	NA	NA	9.14322548930423e-13	12761998	12769521
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12835156	6	6	-0.6757	9.14322548930423e-13	12761998	12769521	2.21622157133576e-12	12831942	12839991
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	16713074	1262	1222	-2e-04	2.21622157133576e-12	12831942	12839991	2.28173840035129e-23	16704522	16814050
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16799711	16926444	11	11	-0.6834	2.28173840035129e-23	16704522	16814050	1.40301181634215e-25	16921319	16961001
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	61884298	17838	17300	0.0042	1.40301181634215e-25	16921319	16961001	0	61884298	61884298
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-5.1806	0	61884298	61884298	0	61890388	61890388
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	72537426	4260	4151	-0.0025	0	61890388	61890388	0	72537426	72537426
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-4.0997	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	84484082	3488	3387	-0.0011	0	72579311	72579311	6.15186502231047e-19	84484082	84484082
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.2706	6.15186502231047e-19	84484082	84484082	5.61666567453474e-18	84487429	84487429
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	103904723	6615	6428	1e-04	5.61666567453474e-18	84487429	84487429	5.46535068813227e-29	103901454	103906464
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	15	0.5857	5.46535068813227e-29	103901454	103906464	2.72455777599523e-28	103956767	104012520
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110033018	1584	1548	-0.0026	2.72455777599523e-28	103956767	104012520	2.90578602530240e-39	110033018	110033018
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	1.5369	2.9057860253024e-39	110033018	110033018	1.15103045019885e-37	110041712	110041712
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	142723311	3890	3764	-0.0031	1.15103045019885e-37	110041712	110041712	0.0570613748025899	120301662	142727791
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	142725580	143623909	6	6	0.1832	0.0570613748025899	120301662	142727791	8.32628891709932e-05	143623909	143633624
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143631328	143659690	16	15	0.4288	8.32628891709932e-05	143623909	143633624	1.26327919382786e-13	143658181	143702972
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	145310672	388	376	0.0312	1.26327919382786e-13	143658181	143702972	4.71690311126248e-73	145304486	145315481
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145315481	145391738	21	19	-0.8861	4.71690311126248e-73	145304486	145315481	8.11938916359747e-71	145387367	145391738
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145395027	147306304	235	232	0.0109	8.11938916359747e-71	145387367	145391738	9.40545910569222e-12	146283719	147369818
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	148084402	40	39	-0.2719	9.40545910569222e-12	146283719	147369818	1.89749217897445e-15	147467273	148123789
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148088285	150823073	1254	1216	0.0067	1.89749217897445e-15	147467273	148123789	1.91165588019282e-14	150819879	150836481
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150839754	3	3	-0.9378	1.91165588019282e-14	150819879	150836481	0.0013166652208048	150839754	150841957
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	3	-2.5574	0.0013166652208048	150839754	150841957	9.37924397372297e-48	150846148	150846148
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	9.37924397372297e-48	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	79	-0.0511	NA	NA	NA	1.48531602093208e-08	151026228	151028700
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.7564	1.48531602093208e-08	151026228	151028700	2.66367620954435e-10	151033188	151038091
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	153344100	1030	1005	0.0067	2.66367620954435e-10	151033188	151038091	3.1446853260699e-16	153344100	153344100
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153346670	153353029	4	4	-0.9252	3.1446853260699e-16	153344100	153344100	1.13028187486273e-18	153353029	153353029
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153355636	154671137	650	626	0.0191	1.13028187486273e-18	153353029	153353029	1.41734898730106e-09	154671137	154671137
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154672405	154673614	2	2	0.987	1.41734898730106e-09	154671137	154671137	7.13381791692101e-10	154673614	154673614
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154674900	167483267	5103	4957	-0.0038	7.133817916921e-10	154673614	154673614	0	167483267	167483267
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.1476	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7010	-0.0046	0	167507898	167507898	2.18510403778680e-14	185979586	185979586
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.1579	2.1851040377868e-14	185979586	185979586	2.47642270673172e-17	185988138	185988138
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1455	0.0045	2.47642270673172e-17	185988138	185988138	4.34530016492903e-11	192715640	192715640
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-0.9289	4.34530016492903e-11	192715640	192715640	8.51340421797754e-09	192719540	192723635
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	194978218	476	467	-1e-04	8.51340421797754e-09	192719540	192723635	0	194978218	194978218
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-4.2729	0	194978218	194978218	0	195065867	195065867
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200594055	2156	2094	0.0069	0	195065867	195065867	1.33854640258977e-16	200582647	200612164
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200596027	200787319	40	39	-0.286	1.33854640258977e-16	200582647	200612164	2.93395778695512e-16	200683992	200806319
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	227875096	9925	9632	-0.0019	2.93395778695512e-16	200683992	200806319	4.00635792168394e-09	227872808	227875096
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-0.78	4.00635792168394e-09	227872808	227875096	8.75061605610597e-10	227882805	227889619
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246702361	7347	7153	-0.0011	8.75061605610597e-10	227882805	227889619	1.95056295048981e-23	246676931	246751473
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246713340	246902260	41	41	0.2825	1.95056295048981e-23	246676931	246751473	2.72138093692764e-13	246864725	246912838
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902470	247186514	92	86	0.0052	2.72138093692764e-13	246864725	246912838	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10566	-0.0022	NA	NA	NA	1.65229765737611e-10	33076512	33076512
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.0075	1.65229765737611e-10	33076512	33076512	2.33015303745338e-12	33080437	33080437
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34551222	645	623	-0.0045	2.33015303745338e-12	33080437	33080437	3.78003011475149e-07	34527334	34556434
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34580533	14	13	0.3024	3.78003011475149e-07	34527334	34556434	1.13802150531649e-06	34574224	34599239
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34582272	35821494	487	472	-0.0024	1.13802150531649e-06	34574224	34599239	1.68212880227459e-17	35821494	35821494
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.2256	1.68212880227459e-17	35821494	35821494	1.34901442031219e-18	35844884	35844884
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	1.34901442031219e-18	35844884	35844884	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	37789939	877	851	-0.0073	NA	NA	NA	1.09545411368865e-12	37776576	37813211
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37858379	28	28	-0.2877	1.09545411368865e-12	37776576	37813211	2.06012367220064e-12	37846240	37872988
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	52600588	5800	5612	2e-04	2.06012367220064e-12	37846240	37872988	4.99315682108593e-12	52588009	52600588
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	4.99315682108593e-12	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.748	NA	NA	NA	5.26885072949192e-12	52635695	52639605
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	106244482	15173	14720	0	5.26885072949192e-12	52635695	52639605	4.63658966358791e-10	106240400	106244482
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106256521	4	4	-0.6893	4.63658966358791e-10	106240400	106244482	6.92770626797762e-10	106256521	106261767
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106261767	146571330	11160	10825	-4e-04	6.92770626797762e-10	106256521	106261767	5.92164102215666e-12	146562545	146571330
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.7531	5.92164102215666e-12	146562545	146571330	2.56294100303074e-12	146592775	146597405
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	167878095	6625	6434	-0.0024	2.56294100303074e-12	146592775	146597405	3.91964117658481e-11	167878095	167878095
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167882675	167888640	2	2	-1.0142	3.91964117658481e-11	167878095	167878095	3.68985730867186e-10	167888640	167888640
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167899155	179767214	4577	4440	-0.0074	3.68985730867186e-10	167888640	167888640	2.13260511432164e-13	179767214	179767214
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.9306	2.13260511432164e-13	179767214	179767214	1.47585461844117e-13	179778919	179778919
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242505261	21476	20895	-0.0013	1.47585461844117e-13	179778919	179778919	2.7482410761448e-11	242477420	242532246
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242506262	242689978	66	64	0.1843	2.7482410761448e-11	242477420	242532246	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15756	-0.0014	NA	NA	NA	8.23722578474173e-10	47460892	47460892
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	0.9746	8.23722578474173e-10	47460892	47460892	7.71847126447923e-10	47466921	47466921
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	89475107	14421	13987	-0.003	7.71847126447923e-10	47466921	47466921	3.48716307404455e-67	89475107	89475107
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.9723	3.48716307404455e-67	89475107	89475107	1.72349643907319e-67	89500935	89500935
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	133189686	13055	12671	-0.0048	1.72349643907319e-67	89500935	89500935	1.10333647372049e-16	133189686	133189686
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.2423	1.10333647372049e-16	133189686	133189686	1.21146942101561e-16	133194685	133194685
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.21146942101561e-16	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9521	-0.0049	NA	NA	NA	2.27998126117709e-89	164005577	164005577
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.0058	2.27998126117709e-89	164005577	164005577	7.20551307196745e-23	164019640	164027724
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5253	7.20551307196745e-23	164019640	164027724	4.06149312194778e-31	164105613	164115417
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196835413	11133	10792	-0.0043	4.06149312194778e-31	164105613	164115417	8.87918698797546e-20	196810503	196905767
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929805	19	19	-0.4404	8.87918698797546e-20	196810503	196905767	1.72308430750522e-18	196927528	196942158
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929826	196929826	1	0	NA	1.72308430750522e-18	196927528	196942158	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	939	0.0101	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	0.4908	NA	NA	NA	4.13101922994577e-10	58159	65688
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	9815760	3384	3293	0.0046	4.13101922994577e-10	58159	65688	0	9815760	9815760
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.8383	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	6007	-0.0036	0	9842644	9842644	8.27182653773222e-20	34439897	34445002
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.7607	8.27182653773222e-20	34439897	34445002	1.68653984476861e-19	34491115	34506297
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8593	-0.0022	1.68653984476861e-19	34491115	34506297	5.44186893134374e-36	68901210	69069651
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.672	5.44186893134374e-36	68901210	69069651	1.31055603952779e-35	69163312	69643272
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	107271000	12703	12341	-0.0025	1.31055603952779e-35	69163312	69643272	4.290750408317e-10	107267028	107274138
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107274138	107281410	6	6	0.5562	4.290750408317e-10	107267028	107274138	2.10571835542117e-10	107279749	107284892
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	175860235	19424	18902	-0.0058	2.10571835542117e-10	107279749	107284892	1.50471202873336e-10	175860235	175860235
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.9737	1.50471202873336e-10	175860235	175860235	1.18640452722664e-10	175863396	175863396
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	186676034	3028	2944	-0.0034	1.18640452722664e-10	175863396	175863396	9.98292111552518e-21	186676034	186676034
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-1.3497	9.98292111552518e-21	186676034	186676034	8.63182163965876e-20	186680176	186680176
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1509	-0.0067	8.63182163965876e-20	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	216	-0.0138	NA	NA	NA	4.85941892772585e-22	737829	737829
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.8357	4.85941892772585e-22	737829	737829	2.01814227591822e-23	829954	829954
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	116226613	32185	31284	-0.0045	2.01814227591822e-23	829954	829954	2.60142606209541e-50	116226613	116226613
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116243256	116308272	8	8	-1.0596	2.60142606209541e-50	116226613	116226613	7.46396997034223e-48	116308272	116308272
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116315191	180644810	21345	20698	-7e-04	7.46396997034223e-48	116308272	116308272	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11372	-0.0012	NA	NA	NA	2.73737009493435e-280	32558677	32558677
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32593151	6	5	-3.1393	2.73737009493435e-280	32558677	32558677	1.26450705063523e-06	32588005	32593151
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32600962	3	3	-1.1945	1.26450705063523e-06	32588005	32593151	2.67940280405763e-08	32600962	32605300
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32709263	34	34	-0.0221	2.67940280405763e-08	32600962	32605300	0.00286343250950110	32683958	32721872
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32711957	32728487	10	10	0.4167	0.0028634325095011	32683958	32721872	1.29398207367869e-08	32720656	32734957
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8024	3e-04	1.29398207367869e-08	32720656	32734957	2.35065569148607e-169	54035000	54035000
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.2426	2.35065569148607e-169	54035000	54035000	8.82506219778224e-185	54042734	54042734
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2694	0.0049	8.82506219778224e-185	54042734	54042734	3.98581856720298e-20	67055837	67068673
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.7652	3.98581856720298e-20	67055837	67068673	4.69639159895666e-19	67101355	67109079
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	79018959	3655	3535	0.0019	4.69639159895666e-19	67101355	67109079	1.06353422142993e-17	79011979	79024557
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.5002	1.06353422142993e-17	79011979	79024557	4.8127990635134e-18	79085247	79101978
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	131325489	15999	15584	-0.001	4.8127990635134e-18	79085247	79101978	4.15599977501578e-22	131325489	131325489
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	131329238	131331842	3	3	-1.1465	4.15599977501578e-22	131325489	131325489	3.44031119437530e-21	131331842	131331842
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	131335511	170753106	13678	13293	-0.0055	3.4403111943753e-21	131331842	131331842	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	12	0.6117	NA	NA	NA	1.68680068187055e-23	160641	176344
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	109967918	35255	34278	3e-04	1.68680068187055e-23	160641	176344	2.23130230691044e-07	109966116	109967918
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109976628	3	3	0.7179	2.23130230691044e-07	109966116	109967918	9.61486426633566e-09	109976628	109980654
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109980654	118611324	3995	3880	-0.0094	9.61486426633566e-09	109976628	109980654	1.67369568546667e-27	118611324	118611324
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.2532	1.67369568546667e-27	118611324	118611324	2.52688529135552e-25	118620875	118620875
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3059	-0.0082	2.52688529135552e-25	118620875	118620875	6.95282221870927e-214	125831554	125831554
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.6318	6.95282221870927e-214	125831554	125831554	2.00695414921366e-244	125837524	125837524
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	126271393	195	191	-0.0139	2.00695414921366e-244	125837524	125837524	2.27252912812149e-18	126269543	126272737
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126272737	126289299	9	9	0.5792	2.27252912812149e-18	126269543	126272737	1.74072918643359e-15	126287022	126290874
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126290874	141410894	7158	6946	-0.0016	1.74072918643359e-15	126287022	126290874	1.54473180614292e-19	141409512	141413352
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.5387	1.54473180614292e-19	141409512	141413352	9.24177024639143e-20	141435643	141440184
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	113	0.0252	9.24177024639143e-20	141435643	141440184	0	141690753	141690753
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-4.2512	0	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2426	-0.0034	0	141714168	141714168	2.40605950603954e-66	147702365	147702365
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.5398	2.40605950603954e-66	147702365	147702365	2.22626063697648e-62	147707161	147707161
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4106	-0.0089	2.22626063697648e-62	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.0119	NA	NA	NA	3.06525081084378e-21	581533	581533
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.5175	3.06525081084378e-21	581533	581533	3.33663246921056e-24	588865	588865
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12589	-0.0035	3.33663246921056e-24	588865	588865	1.02785849844308e-191	39350798	39352361
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.7778	1.02785849844308e-191	39350798	39352361	2.19454883940718e-198	39504332	39508035
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	145330767	31132	30243	-0.0026	2.19454883940718e-198	39504332	39508035	4.57294081304102e-09	145330767	145330767
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145333207	145334573	2	2	-0.9457	4.57294081304102e-09	145330767	145330767	1.26689755909648e-08	145334573	145334573
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145336073	146264846	299	291	0.0176	1.26689755909648e-08	145334573	145334573	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	23338535	7998	7751	-0.003	NA	NA	NA	1.00013360122560e-12	23331804	23338535
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.7564	1.0001336012256e-12	23331804	23338535	8.8475222496131e-12	23365926	23377660
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4913	0.0023	8.8475222496131e-12	23365926	23377660	5.11268845736259e-64	70926188	70926188
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.4361	5.11268845736259e-64	70926188	70926188	7.15427608229721e-63	70930528	70930528
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23087	-0.0045	7.15427608229721e-63	70930528	70930528	1.16869064875000e-15	137352394	137352394
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.24	1.16869064875e-15	137352394	137352394	4.74027516670453e-12	137356880	137356880
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1068	-0.0077	4.74027516670453e-12	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23945	-0.003	NA	NA	NA	1.01831498842004e-155	77917893	77917893
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.0702	1.01831498842004e-155	77917893	77917893	3.16362747114583e-149	77928738	77928738
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19638	-0.0035	3.16362747114583e-149	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1713	-0.0025	NA	NA	NA	3.00949158926612e-13	4920907	4923300
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.7867	3.00949158926612e-13	4920907	4923300	4.02865458442757e-16	4932214	4934594
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	18896166	5595	5417	-0.0025	4.02865458442757e-16	4932214	4934594	1.78079518047303e-07	18890351	18896166
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.5	1.78079518047303e-07	18890351	18896166	5.01904180423773e-08	18917191	18932031
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	49671267	9341	9060	0.0026	5.01904180423773e-08	18917191	18932031	6.61300530420482e-27	49666382	49685235
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49710027	8	8	-0.772	6.61300530420482e-27	49666382	49685235	6.02705418758232e-23	49699428	49721954
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55118214	178	175	-0.0157	6.02705418758232e-23	49699428	49721954	1.66922814677543e-40	55112618	55124730
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.5057	1.66922814677543e-40	55112618	55124730	7.6330082801293e-53	55207305	55221692
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	99030209	15495	15080	-0.0013	7.6330082801293e-53	55207305	55221692	1.45563315770163e-09	99016880	99037126
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99031550	99072015	19	19	0.3164	1.45563315770163e-09	99016880	99037126	3.79760691448223e-10	99054841	99081056
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99074552	134450318	12845	12480	-0.0032	3.79760691448223e-10	99054841	99081056	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3628	1e-04	NA	NA	NA	3.96518868759763e-46	9523923	9523923
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9531133	2	2	-2.1346	3.96518868759763e-46	9523923	9523923	0.000308173355760994	9531133	9531133
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9543817	9626623	15	10	-0.4241	0.000308173355760994	9531133	9531133	1.51684786161819e-08	9607363	9631798
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11104973	566	537	-0.0094	1.51684786161819e-08	9607363	9631798	0.000125416204382366	11098025	11104973
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	-0.4955	0.000125416204382366	11098025	11104973	7.98741758002362e-05	11116883	11125311
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	-3.5181	7.98741758002362e-05	11116883	11125311	0	11140421	11140421
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	78668041	22216	21564	0.0013	0	11140421	11140421	2.88280976349977e-11	78663063	78679297
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78675711	78686371	6	6	-0.6013	2.88280976349977e-11	78663063	78679297	7.2834291020209e-11	78676440	78688893
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	132289090	18603	18097	-9e-04	7.2834291020209e-11	78676440	78688893	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11849	-0.0061	NA	NA	NA	1.72742809148235e-165	49964838	49964838
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.8655	1.72742809148235e-165	49964838	49964838	3.24668154631362e-170	49971732	49971732
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	63118944	3279	3188	-1e-04	3.24668154631362e-170	49971732	49971732	8.5160176354727e-15	63118944	63118944
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-1.1624	8.5160176354727e-15	63118944	63118944	1.95009229565292e-17	63130828	63130828
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	68142120	1232	1196	0.0038	1.95009229565292e-17	63130828	63130828	1.93630645032621e-08	68130387	68142120
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	10	0.372	1.93630645032621e-08	68130387	68142120	7.01856710036617e-08	68163523	68171943
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	89659397	5549	5382	0.0016	7.01856710036617e-08	68163523	68171943	2.35637420342108e-282	89659397	89659397
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.7648	2.35637420342108e-282	89659397	89659397	2.85967549975032e-256	89662326	89662326
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9074	-0.0065	2.85967549975032e-256	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40676611	7648	7422	0.006	NA	NA	NA	6.17182999003697e-09	40663660	40680589
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.4721	6.17182999003697e-09	40663660	40680589	1.53860239129684e-09	40722360	40746865
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	69086125	9972	9633	-8e-04	1.53860239129684e-09	40722360	40746865	1.09027421591170e-11	69084841	69086125
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-0.85	1.0902742159117e-11	69084841	69086125	2.06543702758515e-10	69092211	69093444
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	105597555	14011	13623	-0.001	2.06543702758515e-10	69092211	69093444	0	105597555	105597555
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.4943	0	105597555	105597555	9.17723304345073e-40	105632168	105632168
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105881893	55	54	-0.9711	9.17723304345073e-40	105632168	105632168	3.25158059058685e-88	105875924	105881893
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106218059	124	123	0.0025	3.25158059058685e-88	105875924	105881893	2.32357275138434e-08	106207549	106238148
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106269543	21	21	-0.3415	2.32357275138434e-08	106207549	106238148	0.000116150716463157	106238148	106280415
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106269748	106358491	31	29	0.0205	0.000116150716463157	106238148	106280415	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	5	-0.0563	NA	NA	NA	8.80479683475389e-09	18452491	18692865
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	18884436	23	22	-0.7606	8.80479683475389e-09	18452491	18692865	0.000680921480686899	18854068	19174556
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18886649	18886649	1	0	NA	0.000680921480686899	18854068	19174556	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	19537035	69	69	-1.0011	NA	NA	NA	1.12015533763566e-05	19421704	19805960
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	-0.5807	1.12015533763566e-05	19421704	19805960	1.23248980664258e-17	19845942	19845942
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-2.0236	1.23248980664258e-17	19845942	19845942	1.62607075471603e-23	19882711	19882711
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	42	-0.5318	1.62607075471603e-23	19882711	19882711	2.32508520140958e-61	20065525	20310916
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	43010528	7948	7714	-0.0027	2.32508520140958e-61	20065525	20310916	2.82300500093093e-09	43009351	43014929
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43014929	43019499	3	3	-0.7934	2.82300500093093e-09	43009351	43014929	3.39054114904749e-09	43015037	43024361
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43024361	100298352	23215	22560	-0.0042	3.39054114904749e-09	43015037	43024361	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19964	0.0033	NA	NA	NA	6.90067227687865e-15	75093957	75093957
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.025	6.90067227687865e-15	75093957	75093957	8.37080662569065e-18	75100865	75100865
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	585	-0.0074	8.37080662569065e-18	75100865	75100865	0	76923844	76923844
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	0	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.0879	NA	NA	NA	0	76940218	76940218
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4388	-0.0061	0	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	409	0.0188	NA	NA	NA	1.41621830323936e-26	1028979	1028979
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5449	1.41621830323936e-26	1028979	1028979	3.35974844595093e-23	1030766	1030766
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31457889	11618	11278	0.0083	3.35974844595093e-23	1030766	1030766	1.54318152748231e-09	31437168	31468896
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.3278	1.54318152748231e-09	31437168	31468896	6.61455058583414e-09	31486540	31895551
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32828797	366	360	-0.0117	6.61455058583414e-09	31486540	31895551	3.00491448752029e-09	32828797	32828797
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.9214	3.00491448752029e-09	32828797	32828797	6.88898658774456e-08	32832642	32832642
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1404	0.0111	6.88898658774456e-08	32832642	32832642	0	36673853	36673853
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-3.5738	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1975	0.0157	0	36684619	36684619	2.66712851988096e-39	41564408	41570512
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41624013	26	26	-0.5313	2.66712851988096e-39	41564408	41570512	3.65043328964291e-06	41621474	41624013
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	41631495	4	4	-0.0784	3.65043328964291e-06	41621474	41624013	0.000224914958532686	41629407	41631495
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41632724	41648545	7	6	-0.4735	0.000224914958532686	41629407	41631495	2.77820179068413e-06	41648545	41700762
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	78653545	13687	13274	0.0079	2.77820179068413e-06	41648545	41700762	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15731	-0.0036	NA	NA	NA	7.46523049191835e-36	53092949	53092949
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.7724	7.46523049191835e-36	53092949	53092949	1.42170122452617e-33	53099601	53099601
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6561	-0.005	1.42170122452617e-33	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	208	0.0318	NA	NA	NA	3.72701686645522e-10	790492	790526
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.149	3.72701686645522e-10	790492	790526	7.1488607905018e-12	794978	794978
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	263	0.0309	7.1488607905018e-12	794978	794978	4.96914542366789e-11	1398325	1398325
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.1067	4.96914542366789e-11	1398325	1398325	4.74542784164879e-10	1400840	1400840
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4515	0.0174	4.74542784164879e-10	1400840	1400840	3.72373946136131e-20	11448975	11448975
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.539	3.72373946136131e-20	11448975	11448975	4.88801866230625e-23	11452390	11452390
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	20386500	4041	3937	0.0122	4.88801866230625e-23	11452390	11452390	1.84601728603136e-48	20384757	20399700
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20493401	16	16	-0.7676	1.84601728603136e-48	20384757	20399700	5.9597863349857e-48	20474417	20507235
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	58208527	11236	10907	0.0095	5.9597863349857e-48	20474417	20507235	2.600821567406e-11	58203159	58212113
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	14	0.4225	2.600821567406e-11	58203159	58212113	6.1089155290494e-10	58239871	58254174
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59491509	605	590	0.0123	6.1089155290494e-10	58239871	58254174	6.44644847571595e-10	59488537	59491509
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-1.0665	6.44644847571595e-10	59488537	59491509	1.03547150208919e-10	59497049	59500575
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63787171	1969	1900	-0.002	1.03547150208919e-10	59497049	59500575	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	566	-0.0143	NA	NA	NA	3.56428122596495e-233	1506379	1506379
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.878	3.56428122596495e-233	1506379	1506379	0	1531162	1531162
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	41183830	13109	12748	-0.0061	0	1531162	1531162	3.30661713069482e-13	41182194	41183830
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41185996	41190291	3	3	-0.9397	3.30661713069482e-13	41182194	41183830	8.81297752128981e-13	41190291	41192706
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41192706	62419534	7872	7623	-0.0013	8.81297752128981e-13	41190291	41192706	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	14951516	352	340	-0.0016	NA	NA	NA	4.46373539492902e-07	14947995	14951516
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14953152	14960081	5	4	0.6474	4.46373539492902e-07	14947995	14951516	4.27218715073473e-08	14960081	14961357
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14961357	46922972	13084	12721	-0.0015	4.27218715073473e-08	14960081	14961357	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	21571489	2520	2447	0.0064	NA	NA	NA	2.41897148218961e-13	21571489	21571489
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.0162	2.41897148218961e-13	21571489	21571489	2.77511518890484e-12	21576859	21576859
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	443	-0.0043	2.77511518890484e-12	21576859	21576859	1.52756066915684e-12	22643742	22682428
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	16	0.4495	1.52756066915684e-12	22643742	22682428	2.21806212451544e-14	22708012	22735036
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	49571068	13554	13150	0.0065	2.21806212451544e-14	22708012	22735036	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2302065	1400	1364	0.0114	NA	NA	NA	7.94845740060003e-13	2302065	2302065
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9018	7.94845740060003e-13	2302065	2302065	8.75375472235732e-15	2304398	2306110
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2674962	366	355	0.0222	8.75375472235732e-15	2304398	2306110	7.23563034812427e-08	2672477	2674962
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2676476	2695630	9	9	-0.4083	7.23563034812427e-08	2672477	2674962	0.0122877885850566	2692523	2702666
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695951	2708291	14	14	-0.0935	0.0122877885850566	2692523	2702666	9.4199975427547e-49	2708291	2711273
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1735	0.8937	9.4199975427547e-49	2708291	2711273	2.00617066376596e-09	8449254	8456422
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	6	0.253	2.00617066376596e-09	8449254	8456422	1.31257564060629e-11	8465433	8477126
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	1.31257564060629e-11	8465433	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	41043086	12416	12051	0.9256	NA	NA	NA	3.21165250152591e-10	41041809	41043086
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	41045471	41046965	2	2	-0.1719	3.21165250152591e-10	41041809	41043086	4.06179386939968e-09	41046965	41048259
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	41048259	92268730	11214	10889	0.9168	4.06179386939968e-09	41046965	41048259	2.88543163877703e-09	92263775	92268730
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	92289605	92294987	2	2	-0.18	2.88543163877703e-09	92263775	92268730	2.00130940380273e-11	92294987	92303812
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	92303812	154582414	19701	19152	0.9181	2.00130940380273e-11	92294987	92303812	0	154578922	154582414
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0024	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	10	-4.7518	NA	NA	NA	0.0771847669743426	2716461	2856959
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2875705	67	65	-3.921	0.0771847669743426	2716461	2856959	1.84126305407852e-07	2861090	2882209
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2876787	4174561	52	48	-4.8331	1.84126305407852e-07	2861090	2882209	7.08275121431776e-31	3780462	4174561
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.5912	7.08275121431776e-31	3780462	4174561	1.48307847930291e-06	4948824	6715636
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7266323	233	224	-3.7196	1.48307847930291e-06	4948824	6715636	5.95447976030449e-07	7249762	7278425
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7267235	7304209	19	19	-2.0028	5.95447976030449e-07	7249762	7278425	1.06176518181529e-06	7289497	7330779
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7865557	175	166	-3.6744	1.06176518181529e-06	7289497	7330779	0.00114374266816198	7833760	7893056
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7866716	7914104	9	9	-1.9589	0.00114374266816198	7833760	7893056	0.000168170965649968	7905553	7926989
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8010446	22	22	-3.5973	0.000168170965649968	7905553	7926989	0.000399023604616191	7942730	8048263
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8178487	36	35	-4.4213	0.000399023604616191	7942730	8048263	3.55570082747418e-07	8167434	8219845
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8689019	139	135	-3.5207	3.55570082747418e-07	8167434	8219845	0.000316406179768891	8589035	8754519
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8690572	8943871	77	73	-4.119	0.000316406179768891	8589035	8754519	0.000395324549292725	8928870	8943871
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8949553	8956787	4	4	-1.9366	0.000395324549292725	8928870	8943871	1.11616251277912e-08	8956787	8958121
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9157232	35	33	-4.3363	1.11616251277912e-08	8956787	8958121	2.44548857653829e-05	9133230	9208277
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9160624	10025706	14	11	-3.0521	2.44548857653829e-05	9133230	9208277	9.36069144924305e-07	9999384	10049346
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10030654	10513747	62	62	-4.252	9.36069144924305e-07	9999384	10049346	4.63832091884193e-88	10513747	10515697
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	18	-0.6817	4.63832091884193e-88	10513747	10515697	2.45131415643949e-40	11673476	11698871
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.4799	2.45131415643949e-40	11673476	11698871	8.41343331085657e-05	12541506	12570314
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-2.5102	8.41343331085657e-05	12541506	12570314	0.00036510996406142	12611624	12741404
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12872417	37	35	-3.7781	0.00036510996406142	12611624	12741404	0.00959559711603786	12833424	12876008
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12875039	12901857	10	10	-2.4516	0.00959559711603786	12833424	12876008	2.76183068204040e-09	12898852	12901857
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12905395	12924438	7	7	-4.1774	2.7618306820404e-09	12898852	12901857	0.000269652643299989	12924438	12960717
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13129843	82	77	-2.4431	0.000269652643299989	12924438	12960717	6.62262754202173e-07	13106723	13150942
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13262997	45	44	-3.5305	6.62262754202173e-07	13106723	13150942	7.51099074243267e-07	13213249	13286708
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13445263	79	76	-4.4225	7.51099074243267e-07	13213249	13286708	6.10759392536089e-09	13441949	13445263
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13448037	13453843	3	3	-1.78	6.10759392536089e-09	13441949	13445263	5.88616683557848e-05	13453843	13457504
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13454651	13603478	77	75	-4.3437	5.88616683557848e-05	13453843	13457504	3.04342959139371e-05	13573345	13606316
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13606316	13705594	14	12	-2.9882	3.04342959139371e-05	13573345	13606316	2.21562977668934e-07	13701755	13751402
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14122129	159	148	-4.3746	2.21562977668934e-07	13701755	13751402	1.31997196463322e-06	14118164	14122129
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.7931	1.31997196463322e-06	14118164	14122129	7.06271279835394e-05	14143748	14214157
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14169526	1	0	NA	7.06271279835394e-05	14143748	14214157	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14203911	14358464	34	33	-4.2368	NA	NA	NA	0.024917793906705	14325320	14455003
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	87	-3.5277	0.024917793906705	14325320	14455003	7.75487437301174e-06	14492454	14549297
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	7.75487437301174e-06	14492454	14549297	NA	NA	NA
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14644293	35	33	-2.256	NA	NA	NA	2.14315574010562e-13	14596156	14685149
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14875973	55	52	-4.2362	2.14315574010562e-13	14596156	14685149	0.00386010095107663	14729413	15122414
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14883615	15286805	130	123	-3.6323	0.00386010095107663	14729413	15122414	0.000940860391714538	15201695	15352989
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15287893	15523178	133	128	-4.1573	0.000940860391714538	15201695	15352989	0.00182494101957678	15448670	15558235
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15687088	52	50	-3.4503	0.00182494101957678	15448670	15558235	6.49312680363978e-07	15617621	15707307
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15915466	37	36	-4.6773	6.49312680363978e-07	15617621	15707307	3.8986226140679e-07	15892492	15953710
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	152	-3.6185	3.8986226140679e-07	15892492	15953710	6.87912673966113e-07	16290147	16462452
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16679419	49	49	-4.566	6.87912673966113e-07	16290147	16462452	5.94117175650726e-06	16669423	16679419
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	16716541	10	10	-2.9381	5.94117175650726e-06	16669423	16679419	4.60830127940862e-09	16710218	16727813
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16719600	17076673	44	43	-4.29	4.60830127940862e-09	16710218	16727813	7.67891883605705e-15	17073540	17076673
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17083649	17101969	5	5	-2.0889	7.67891883605705e-15	17073540	17076673	2.55969925786975e-09	17101969	17113261
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17107617	17496151	68	65	-4.4797	2.55969925786975e-09	17101969	17113261	6.09769473089861e-10	17482749	17503455
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17503455	17557953	10	10	-2.6424	6.09769473089861e-10	17482749	17503455	0.000239903997274894	17544651	17623295
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	17751277	34	34	-4.281	0.000239903997274894	17544651	17623295	0.000554181131468816	17705768	17751277
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17767311	17792907	10	10	-2.7389	0.000554181131468816	17705768	17751277	1.78523121539688e-06	17792907	17795392
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17795392	17805953	7	7	-4.1914	1.78523121539688e-06	17792907	17795392	5.14784215839406e-07	17805953	17817586
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17814505	17841801	15	14	-2.6111	5.14784215839406e-07	17805953	17817586	4.42783397667540e-12	17833945	17850226
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17843372	19610243	125	122	-4.3923	4.4278339766754e-12	17833945	17850226	8.43582953755198e-09	19608039	19610243
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.4916	8.43582953755198e-09	19608039	19610243	2.47702342337455e-07	19613864	19614809
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	20367138	214	206	-4.2009	2.47702342337455e-07	19613864	19614809	0.000151696095689391	20362457	20367138
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20384639	20393111	4	4	-2.1202	0.000151696095689391	20362457	20367138	5.50367108340026e-05	20393111	20448276
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20400879	21041164	75	72	-4.2938	5.50367108340026e-05	20393111	20448276	4.01596841055666e-05	21025500	21043581
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21042490	21060047	9	9	-2.7712	4.01596841055666e-05	21025500	21043581	1.68831567735823e-05	21057446	21074401
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21061132	22139807	257	249	-4.2338	1.68831567735823e-05	21057446	21074401	1.50293297442066e-08	22052726	22139807
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.436	1.50293297442066e-08	22052726	22139807	1.56075732986016e-15	22177335	22178964
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22770920	44	44	-4.5094	1.56075732986016e-15	22177335	22178964	2.90207746336294e-05	22371003	22782417
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22771961	22877495	31	29	-3.7641	2.90207746336294e-05	22371003	22782417	3.47592866174018e-06	22869711	22904627
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22930737	18	16	-4.6884	3.47592866174018e-06	22869711	22904627	1.22561471937678e-66	22930737	22930737
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.1298	1.22561471937678e-66	22930737	22930737	4.9951458883361e-05	26941769	27003308
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.4038	4.9951458883361e-05	26941769	27003308	0.000142259084430240	27003308	27069765
MSK_252152914492_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.757	0.00014225908443024	27003308	27069765	NA	NA	NA
