Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	736471	2	2	0.3748	NA	NA	NA	6.49700711431984e-09	736471	750051
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	742580	12762774	4512	4104	-0.4737	6.49700711431984e-09	736471	750051	5.46396185764167e-36	12762774	12789063
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12769521	12769521	1	0	NA	5.46396185764167e-36	12762774	12789063	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12789063	12835156	5	5	-2.1027	NA	NA	NA	3.20838862959601e-35	12793354	12835156
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	16704522	1261	1150	-0.5027	3.20838862959601e-35	12793354	12835156	7.92214897402582e-22	16666760	16836160
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17104345	20	18	-1.1703	7.92214897402582e-22	16666760	16836160	7.46948996640199e-23	17080364	17107476
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17107476	25482036	3460	3167	-0.4961	7.46948996640199e-23	17080364	17107476	3.11543413622039e-41	25482036	25539967
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	25538212	25538212	1	0	NA	3.11543413622039e-41	25482036	25539967	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	25539967	25555842	10	8	-1.8394	NA	NA	NA	5.15925218683185e-40	25554672	25555842
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	25557546	29425510	1730	1586	-0.4836	5.15925218683185e-40	25554672	25555842	2.72419865145875e-180	29417518	29429300
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	29428169	30820258	263	230	0.0875	2.72419865145875e-180	29417518	29429300	4.13534583508618e-226	30790716	30834999
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	30824993	37609918	2706	2493	-0.51	4.13534583508618e-226	30790716	30834999	0	37583464	37624217
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	37620460	61884298	9660	8861	0.1007	0	37583464	37624217	1.23279031822604e-70	61884298	61884298
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-2.6343	1.23279031822604e-70	61884298	61884298	2.61796252553679e-80	61890388	61890388
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	72537426	4260	3910	0.0924	2.61796252553679e-80	61890388	61890388	0	72537426	72537426
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.3532	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	84484082	3488	3208	0.0831	0	72579311	72579311	2.19102965201675e-10	84484082	84484082
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.0901	2.19102965201675e-10	84484082	84484082	6.11347078279488e-10	84487429	84487429
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	103904723	6615	6054	0.1	6.11347078279488e-10	84487429	84487429	9.21442923560851e-15	103898005	103907903
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	12	0.6867	9.2144292356085e-15	103898005	103907903	3.45381899878401e-16	103932025	104108153
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	108970626	1102	1017	0.0811	3.45381899878401e-16	103932025	104108153	2.09640694721375e-09	108965343	108975114
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108972385	108990121	8	8	0.6499	2.09640694721375e-09	108965343	108975114	3.90507083775072e-06	108983502	108998839
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108992695	110033018	474	437	0.1283	3.90507083775072e-06	108983502	108998839	3.31105950361919e-14	110023268	110033018
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	1.3999	3.31105950361919e-14	110023268	110033018	7.95594519150456e-16	110041712	110041712
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	113963858	1516	1383	0.0909	7.95594519150456e-16	110041712	110041712	6.38864018229567e-18	113959995	113975576
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113967212	114006063	17	16	0.6968	6.38864018229567e-18	113959995	113975576	3.38785393795128e-18	114002254	114009893
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	114008492	117608564	1315	1196	0.0979	3.38785393795128e-18	114002254	114009893	2.01614404547501e-20	117590783	117647626
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117613356	117767827	47	45	0.48	2.01614404547501e-20	117590783	117647626	2.00263403037537e-25	117759484	117781912
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117769159	145318061	1407	1296	0.0639	2.00263403037537e-25	117759484	117781912	4.11052321501367e-42	145310672	145318061
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145321488	145389760	18	17	-0.7903	4.11052321501367e-42	145310672	145318061	5.57336710079745e-41	145389760	145400036
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145391738	145395027	2	0	NA	5.57336710079745e-41	145389760	145400036	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145400036	146294654	231	210	0.0772	NA	NA	NA	1.05418204650978e-10	146268572	147326097
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147644831	39	35	-0.2557	1.05418204650978e-10	146268572	147326097	2.78559722423655e-16	147490553	148088285
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	149368365	615	557	0.1315	2.78559722423655e-16	147490553	148088285	4.53380130168149e-92	149357496	149382141
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	149370751	149931775	284	260	0.5349	4.53380130168149e-92	149357496	149382141	3.18158557479146e-98	149925506	149939723
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	149933615	150841957	363	332	0.0669	3.18158557479146e-98	149925506	149939723	1.07610040040786e-59	150841957	150841957
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150843192	150843192	1	0	NA	1.07610040040786e-59	150841957	150841957	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-2.9619	NA	NA	NA	2.25655724695297e-84	150846148	150846148
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	2.25655724695297e-84	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	73	0.0489	NA	NA	NA	1.77464616058642e-15	151026228	151026228
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	1.0045	1.77464616058642e-15	151026228	151026228	5.16624792304644e-08	151036435	151038091
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	154760498	1733	1581	0.1287	5.16624792304644e-08	151036435	151038091	1.11628602018509e-35	154753165	154766902
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154762077	154762077	1	0	NA	1.11628602018509e-35	154753165	154766902	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154763555	154908837	71	67	0.5779	NA	NA	NA	8.02086394568008e-55	154901099	154914493
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154910059	167483267	4984	4559	0.0787	8.02086394568008e-55	154901099	154914493	0	167483267	167483267
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167493768	1	0	NA	0	167483267	167483267	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167495719	167507898	7	7	-3.9609	NA	NA	NA	0	167507898	167507898
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	181155736	5381	4946	0.0904	0	167507898	167507898	6.4196614450228e-08	181140145	181166933
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181160892	181160892	1	0	NA	6.4196614450228e-08	181140145	181166933	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181163074	181193815	15	14	0.5084	NA	NA	NA	4.03869631239579e-07	181190845	181211301
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181196877	181196877	1	0	NA	4.03869631239579e-07	181190845	181211301	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181198732	182234159	487	445	0.089	NA	NA	NA	7.23682921730091e-262	182228118	182243570
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	182238350	194978218	3295	3012	0.5187	7.23682921730091e-262	182228118	182243570	0	194978218	194978218
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195062793	8	7	-3.1752	0	194978218	194978218	2.24973077897821e-315	195062793	195062793
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195065867	198650017	1245	1149	0.5275	2.24973077897821e-315	195062793	195062793	2.91245874778052e-219	198639779	198659406
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	198651589	200613454	919	836	0.1481	2.91245874778052e-219	198639779	198659406	1.41898559736157e-10	200587846	200625002
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200787319	33	32	-0.2194	1.41898559736157e-10	200587846	200625002	7.39811420298763e-11	200683992	200807586
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	212790205	4596	4212	0.111	7.39811420298763e-11	200683992	200807586	0	212781237	212796913
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	212793498	214836062	771	718	0.5266	0	212781237	212796913	0	214832214	214841997
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	214838079	220302432	1768	1619	0.0794	0	214832214	214841997	8.69664151318223e-09	220285090	220306382
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	220306382	220357893	13	13	0.5162	8.69664151318223e-09	220285090	220306382	2.25070129214459e-06	220348845	220391897
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	220361230	226437312	2277	2093	0.1175	2.25070129214459e-06	220348845	220391897	5.94021272719137e-169	226426249	226457210
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	226444140	227875096	500	461	0.4928	5.94021272719137e-169	226426249	226457210	4.7715481859013e-11	227872808	227875096
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.5566	4.7715481859013e-11	227872808	227875096	1.43783862838877e-12	227882805	227889619
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	229603452	683	624	0.5291	1.43783862838877e-12	227882805	227889619	0	229596036	229611300
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229605792	247186514	6797	6230	0.0834	0	229596036	229611300	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	7019	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20341	3322129	1242	1144	0.0705	NA	NA	NA	6.54852304248002e-63	3320903	3324769
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3324769	3425083	48	45	-0.6159	6.54852304248002e-63	3320903	3324769	7.11078373994984e-72	3419112	3427435
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3427435	15029550	3192	2940	0.0781	7.11078373994984e-72	3419112	3427435	0	14988301	15067766
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15035785	23886428	2342	2174	0.4997	0	14988301	15067766	0	23872522	23898407
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	23888750	31548946	3430	3173	0.111	0	23872522	23898407	0	31519835	31582559
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	31552160	37789939	2649	2412	0.5105	0	31519835	31582559	3.51803669019964e-17	37779760	37803744
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	25	0.0448	3.51803669019964e-17	37779760	37803744	1.19616748446942e-17	37847519	37866455
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	37858379	1	0	NA	1.19616748446942e-17	37847519	37866455	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	52580357	5797	5302	0.5199	NA	NA	NA	4.16804343049474e-09	52577394	52580357
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52583578	52604016	4	0	NA	4.16804343049474e-09	52577394	52580357	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	1.3838	NA	NA	NA	8.40641700588462e-12	52635695	52639605
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	55315730	948	864	0.4967	8.40641700588462e-12	52635695	52639605	9.07983311921763e-13	55305323	55317203
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55317203	55357504	20	17	0.0489	9.07983311921763e-13	55305323	55317203	5.11563249931295e-12	55355614	55368837
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55359696	55359696	1	0	NA	5.11563249931295e-12	55355614	55368837	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55361065	74953321	6705	6183	0.523	NA	NA	NA	0	74945899	74962194
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	74955697	106244482	7499	6875	0.0825	0	74945899	74962194	9.75505357890528e-21	106244482	106244482
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.6893	9.75505357890528e-21	106244482	106244482	5.89884326564491e-21	106250718	106250718
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	150410398	12200	11209	0.0773	5.89884326564491e-21	106250718	106250718	1.56255413903962e-10	150397460	150415131
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	150411785	150411785	1	0	NA	1.56255413903962e-10	150397460	150415131	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	150413373	150480048	18	18	0.5021	NA	NA	NA	3.04757575252356e-11	150460403	150529618
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	150488808	150493368	2	0	NA	3.04757575252356e-11	150460403	150529618	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	150501110	167551246	5444	5004	0.0906	NA	NA	NA	1.98103242907124e-14	167542144	167577302
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167552328	167622156	26	22	0.5115	1.98103242907124e-14	167542144	167577302	2.01818271008884e-10	167603927	167632147
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167623640	167623640	1	0	NA	2.01818271008884e-10	167603927	167632147	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167625144	167878095	99	94	0.0776	NA	NA	NA	4.31725607848231e-08	167873350	167878095
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167882675	167888640	2	2	-0.9354	4.31725607848231e-08	167873350	167878095	7.75083226214639e-07	167888640	167888640
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	167899155	171030818	1212	1110	0.0788	7.75083226214639e-07	167888640	167888640	1.71819670208086e-18	171023542	171041841
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	171032829	171032829	1	0	NA	1.71819670208086e-18	171023542	171041841	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	171034048	171084343	27	25	0.5492	NA	NA	NA	6.55695821373314e-18	171076390	171091591
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	171085740	174519482	1273	1172	0.0821	6.55695821373314e-18	171076390	171091591	0	174511719	174527774
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	174521927	179767214	2064	1904	0.5086	0	174511719	174527774	6.59400242559422e-10	179764646	179767214
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.4937	6.59400242559422e-10	179764646	179767214	3.28340363918296e-10	179778919	179791155
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	179791128	1	0	NA	3.28340363918296e-10	179778919	179791155	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791155	184702544	1476	1361	0.5154	NA	NA	NA	1.16565752784531e-245	184674128	184728766
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	184713940	187153084	586	546	0.1092	1.16565752784531e-245	184674128	184728766	8.01084925124648e-103	187144920	187164131
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	187155434	187906404	242	223	0.5251	8.01084925124648e-103	187144920	187164131	5.67434674968017e-145	187899698	187918394
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	187909855	198711637	3309	3044	0.1033	5.67434674968017e-145	187899698	187918394	1.58992653148262e-28	198708295	198716611
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198714299	198747736	15	13	-0.6486	1.58992653148262e-28	198708295	198716611	7.22642921395943e-24	198744829	198753727
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198753727	222017616	8507	7815	0.0967	7.22642921395943e-24	198744829	198753727	1.19335328857638e-74	222009612	222025237
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222018867	222018867	1	0	NA	1.19335328857638e-74	222009612	222025237	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222021668	222447764	124	113	0.5416	NA	NA	NA	9.7822301604304e-83	222438679	222464001
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222453878	234015730	4175	3808	0.0779	9.7822301604304e-83	222438679	222464001	5.8508108399958e-11	234002596	234021265
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	234016900	234016900	1	0	NA	5.8508108399958e-11	234002596	234021265	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	234018514	234060540	23	19	0.494	NA	NA	NA	2.34358168980158e-08	234053689	234071432
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	234061850	242493814	3012	2749	0.0908	2.34358168980158e-08	234053689	234071432	3.94141352367859e-09	242450831	242528768
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242495169	242653323	59	57	0.3357	3.94141352367859e-09	242450831	242528768	0.0103924313002638	242596654	242677220
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242655973	242655973	1	0	NA	0.0103924313002638	242596654	242677220	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242656260	242689978	10	10	0.0077	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	28000785	9533	8781	0.0817	NA	NA	NA	8.19784812527253e-33	27976317	28006534
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	28006534	28248982	39	39	0.5763	8.19784812527253e-33	27976317	28006534	2.71013176761147e-30	28242193	28254227
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	28251242	47460892	6646	6113	0.0896	2.71013176761147e-30	28242193	28254227	6.7078742548125e-14	47460892	47460892
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.5614	6.7078742548125e-14	47460892	47460892	2.02673092103733e-10	47466921	47466921
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	50527628	1409	1299	0.141	2.02673092103733e-10	47466921	47466921	5.33580696878868e-20	50516945	50545560
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	50530262	50635102	48	46	0.5562	5.33580696878868e-20	50516945	50545560	1.34993933966860e-35	50626433	50644639
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	50637505	50637505	1	0	NA	1.3499393396686e-35	50626433	50644639	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	50640965	75479859	9198	8437	0.0734	NA	NA	NA	2.18231930515780e-10	75428991	75803353
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76000715	19	18	-0.2837	2.1823193051578e-10	75428991	75803353	1.32642269934927e-08	75858339	76034950
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76006248	89475107	3746	3404	0.0745	1.32642269934927e-08	75858339	76034950	1.12106299700941e-34	89475107	89475107
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89477163	1	0	NA	1.12106299700941e-34	89475107	89475107	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89483712	89500935	12	12	-0.7811	NA	NA	NA	1.70137620646256e-31	89500935	89502757
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	108785945	3978	3642	0.09	1.70137620646256e-31	89500935	89502757	2.68625543990381e-10	108779460	108790524
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	108787621	108814895	12	12	0.598	2.68625543990381e-10	108779460	108790524	4.88904553440785e-10	108806452	108827531
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	108815977	115186944	2118	1925	0.1023	4.88904553440785e-10	108806452	108827531	1.19659516142049e-20	115176447	115204912
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	115202100	115274376	36	34	0.5227	1.19659516142049e-20	115176447	115204912	3.69686323754366e-23	115267514	115282113
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	115276215	125348954	3656	3390	0.0772	3.69686323754366e-23	115267514	115282113	2.05135815760053e-41	125338786	125357103
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	125350721	125514056	83	79	0.4691	2.05135815760053e-41	125338786	125357103	8.60053089551144e-35	125494690	125526539
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	125515353	140540950	5654	5227	0.0929	8.60053089551144e-35	125494690	125526539	1.23909688307007e-06	140539346	140540950
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	140543532	140553106	6	6	-0.5195	1.23909688307007e-06	140539346	140540950	2.07093288245202e-07	140553106	140561012
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	140557156	140557156	1	0	NA	2.07093288245202e-07	140553106	140561012	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	140558438	153574262	3987	3682	0.0903	NA	NA	NA	0	153557531	153579559
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	153576765	158041331	1341	1246	0.5057	0	153557531	153579559	6.50817318187096e-09	158026282	158043077
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	158043077	158064447	13	10	0.9856	6.50817318187096e-09	158026282	158043077	2.2650601403454e-07	158063101	158074964
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	158066286	164005577	1952	1782	0.5099	2.2650601403454e-07	158063101	158074964	5.3719393989238e-98	164005577	164005577
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.8905	5.3719393989238e-98	164005577	164005577	1.21819179537234e-40	164027724	164027724
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	18	1.1532	1.21819179537234e-40	164027724	164027724	3.62572571000893e-25	164105613	164115417
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	189560299	8411	7709	0.5199	3.62572571000893e-25	164105613	164115417	0	189552267	189565969
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	189563041	196835413	2722	2524	0.1013	0	189552267	189565969	9.55885959668937e-23	196820428	196905767
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929805	19	18	-0.4888	9.55885959668937e-23	196820428	196905767	1.60846956423547e-19	196928503	196940125
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196929826	199329592	964	893	0.1155	1.60846956423547e-19	196928503	196940125	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3142	0.1117	NA	NA	NA	8.6725696853247e-138	9815760	9815760
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	-4.0332	8.6725696853247e-138	9815760	9815760	7.78685767060805e-202	9842644	9842644
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	9935799	12	11	0.1307	7.78685767060805e-202	9842644	9842644	1.41916123982188e-19	9935799	9946335
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9941487	18492259	2350	2151	-0.587	1.41916123982188e-19	9935799	9946335	4.40925049917691e-92	18475625	18504206
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	18504206	18880299	67	62	0.0678	4.40925049917691e-92	18475625	18504206	9.7340985342366e-69	18873007	18890866
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	18890866	19369280	90	80	-0.5846	9.7340985342366e-69	18873007	18890866	5.84614067041568e-72	19364876	19381079
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	19381079	19876913	82	78	0.0503	5.84614067041568e-72	19364876	19381079	2.66916077452009e-109	19875740	19883237
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	19878118	19878118	1	0	NA	2.66916077452009e-109	19875740	19883237	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	19879364	48577276	8190	7497	-0.5686	NA	NA	NA	2.28115487015194e-10	48576612	48578998
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48578998	48587136	4	4	0.2951	2.28115487015194e-10	48576612	48578998	8.57891808438869e-11	48582314	48590278
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	48590278	64376590	3158	2889	-0.5872	8.57891808438869e-11	48582314	48590278	5.04351151672125e-37	64376590	64376590
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-2.8531	5.04351151672125e-37	64376590	64376590	6.11640405888037e-36	64390333	64390333
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1002	-0.5771	6.11640405888037e-36	64390333	64390333	2.40592031185888e-140	68905670	68905670
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-2.293	2.40592031185888e-140	68905670	68905670	3.33844679696995e-155	69165814	69165814
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	110728197	13830	12706	-0.5659	3.33844679696995e-155	69165814	69165814	3.63155047919402e-238	110728197	110728197
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	110729198	110813596	34	31	-2.004	3.63155047919402e-238	110728197	110728197	2.51250197110333e-235	110813596	110813596
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	110813645	110815764	2	0	NA	2.51250197110333e-235	110813596	110813596	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	110821159	119650402	2531	2318	-0.5778	NA	NA	NA	2.56737616136044e-08	119633379	119661914
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119652149	119698139	13	11	-0.1192	2.56737616136044e-08	119633379	119661914	6.67012180353825e-08	119684734	119725170
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119700930	149291827	7655	6984	-0.5729	6.67012180353825e-08	119684734	119725170	2.75331597291792e-179	149291827	149293166
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	149293166	149340301	21	19	-2.1579	2.75331597291792e-179	149291827	149293166	9.2443255464434e-176	149338249	149340301
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	149342682	170149216	6318	5830	-0.5658	9.2443255464434e-176	149338249	149340301	0	170145931	170150644
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	170150644	170769477	229	203	0.1239	0	170145931	170150644	1.68410936012409e-307	170764770	170771181
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	170771181	173224400	560	522	-0.5763	1.68410936012409e-307	170764770	170771181	2.90661302896425e-31	173224400	173224400
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.3488	2.90661302896425e-31	173224400	173224400	8.66257950972823e-25	173228860	173228860
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	172	-0.5922	8.66257950972823e-25	173228860	173228860	5.01078172040171e-28	173660684	173660684
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.6832	5.01078172040171e-28	173660684	173660684	1.00734943359456e-31	173666072	173666072
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	4902	-0.5868	1.00734943359456e-31	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	209	0.493	NA	NA	NA	1.09240202403463e-06	729262	737829
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	5	1.3221	1.09240202403463e-06	729262	737829	1.20008171826505e-06	829954	873365
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	1339297	169	161	0.4717	1.20008171826505e-06	829954	873365	2.25645304168324e-05	1325027	1346204
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1342021	1373401	10	9	1.0581	2.25645304168324e-05	1325027	1346204	3.01858887811672e-09	1369982	1382465
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1375592	7780428	1956	1810	0.468	3.01858887811672e-09	1369982	1382465	0	7775634	7790009
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7784257	7784257	1	0	NA	0	7775634	7790009	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7785948	20726879	3871	3548	1.0575	NA	NA	NA	2.6434780650981e-09	20690425	20834425
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20729327	20729327	1	0	NA	2.6434780650981e-09	20690425	20834425	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20731640	20989196	42	41	0.7922	NA	NA	NA	5.97602969218731e-05	20827957	21034083
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20993078	21488938	77	67	1.0637	5.97602969218731e-05	20827957	21034083	2.55375316779626e-09	21480789	21559709
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21490654	21606184	17	16	0.6602	2.55375316779626e-09	21480789	21559709	2.80947293670204e-08	21596630	21616990
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21610433	21703991	26	25	1.1029	2.80947293670204e-08	21596630	21616990	3.43682354574053e-08	21684937	21734693
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21707462	26248491	1137	1049	0.8107	3.43682354574053e-08	21684937	21734693	0	26243241	26264179
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	26264179	34105512	1979	1834	0.087	0	26243241	26264179	1.92477341747197e-10	34083838	34143466
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	34109454	34438184	26	21	0.4643	1.92477341747197e-10	34083838	34143466	1.35368442211961e-10	34347853	34515628
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	34446079	39002554	1604	1479	0.074	1.35368442211961e-10	34347853	34515628	0	38998348	39003673
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	39003673	59016674	4841	4413	-0.58	0	38998348	39003673	8.66103623152212e-244	59016674	59016674
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59017743	59078065	54	52	0.5547	8.66103623152212e-244	59016674	59016674	1.11058945160607e-37	59073424	59090328
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59082698	65625180	2019	1851	0.1001	1.11058945160607e-37	59073424	59090328	0	65623916	65628835
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	65627568	95956664	9057	8322	-0.5638	0	65623916	65628835	0	95950201	95960955
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	95960955	116226613	5298	4878	0.0794	0	95950201	95960955	2.22106924138424e-14	116220400	116226613
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116243256	116308272	8	7	-0.6759	2.22106924138424e-14	116220400	116226613	1.80159361117159e-14	116308272	116326387
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116315191	116315191	1	0	NA	1.80159361117159e-14	116308272	116326387	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116326387	140377016	7727	7098	0.1087	NA	NA	NA	5.08857637659168e-103	140371498	140386594
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140379269	140380716	2	0	NA	5.08857637659168e-103	140371498	140386594	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140384327	140605001	108	103	0.648	NA	NA	NA	2.25240074292181e-103	140600459	140607949
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140606330	176027129	11761	10810	0.1009	2.25240074292181e-103	140600459	140607949	1.73207343483769e-182	176014786	176048959
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176030019	176769170	320	294	0.5365	1.73207343483769e-182	176014786	176048959	3.96123880967277e-21	176757168	176776895
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176772131	176890573	49	42	0.036	3.96123880967277e-21	176757168	176776895	2.51436954625737e-30	176881695	176897231
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176891798	180342860	1257	1160	-0.4917	2.51436954625737e-30	176881695	176897231	7.16885331516882e-39	180342860	180344964
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	8	-1.8454	7.16885331516882e-39	180342860	180344964	1.83865311386128e-34	180358977	180362342
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	97	-0.481	1.83865311386128e-34	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	8075112	3176	2901	0.1034	NA	NA	NA	0	8054283	8098157
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	8078708	18371831	3362	3071	0.5044	0	8054283	8098157	9.46257807363484e-10	18368026	18373481
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.4833	9.46257807363484e-10	18368026	18373481	1.53498002735741e-10	18375068	18380299
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	24659792	1844	1687	0.5043	1.53498002735741e-10	18375068	18380299	9.78278402226791e-21	24651973	24665006
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	24661387	24721967	34	30	0.9374	9.7827840222679e-21	24651973	24665006	1.94470363412888e-14	24713865	24735111
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	24724231	32558677	3258	2982	0.5167	1.94470363412888e-14	24713865	24735111	1.24866215221873e-205	32558677	32564884
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.3812	1.24866215221873e-205	32558677	32564884	1.57912439947486e-194	32595402	32600962
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	44890716	5064	4644	0.5255	1.57912439947486e-194	32595402	32600962	8.5342973490853e-23	44867586	44904596
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	44895994	44895994	1	0	NA	8.5342973490853e-23	44867586	44904596	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	44897903	45017276	50	48	0.0936	NA	NA	NA	3.37990573704768e-29	45008207	45028701
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	45017675	54033505	3187	2939	0.5136	3.37990573704768e-29	45008207	45028701	3.12561585114447e-179	54033505	54037199
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54035000	54042734	4	4	-2.7216	3.12561585114447e-179	54033505	54037199	1.38303219792476e-27	54037199	54042734
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	54156593	52	50	0.5346	1.38303219792476e-27	54037199	54042734	3.12127346384577e-40	54144777	54164991
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54159713	67060622	2719	2509	0.0689	3.12127346384577e-40	54144777	54164991	8.38486891062875e-13	67055837	67060622
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	5	-0.7649	8.38486891062875e-13	67055837	67060622	1.13920142640562e-13	67105238	67109079
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	74283260	2360	2180	0.0924	1.13920142640562e-13	67105238	67109079	3.13200760185225e-165	74279927	74290797
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74284749	74947372	219	208	0.5739	3.13200760185225e-165	74279927	74290797	4.88954748098979e-119	74937524	74954870
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74950701	77032945	706	643	0.1081	4.88954748098979e-119	74937524	74954870	0	77024989	77043072
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77043072	79018959	370	348	-0.5859	0	77024989	77043072	4.50174448962190e-132	79018959	79018959
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-2.3347	4.5017444896219e-132	79018959	79018959	2.51599432184058e-150	79091850	79091850
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6187	-0.5696	2.51599432184058e-150	79091850	79091850	1.92482633071064e-11	103827105	103845083
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.3301	1.92482633071064e-11	103827105	103845083	2.56274420522339e-11	103860573	103873584
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	131325489	9233	8444	-0.5621	2.56274420522339e-11	103860573	103873584	2.56237113303987e-88	131325489	131325489
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	131329238	131331842	3	3	-3.3638	2.56237113303987e-88	131325489	131325489	4.5506991098032e-86	131331842	131331842
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	131335511	158398988	9288	8529	-0.544	4.5506991098032e-86	131331842	131331842	1.6118334503358e-09	158393174	158398988
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	158400897	158413633	8	8	0.049	1.6118334503358e-09	158393174	158398988	2.66369704327665e-10	158413633	158419111
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	158415649	158415649	1	0	NA	2.66369704327665e-10	158413633	158419111	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	158417641	165643653	2573	2348	-0.5782	NA	NA	NA	3.5719411979526e-09	165636035	165643653
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.2608	3.5719411979526e-09	165636035	165643653	8.1323778551791e-09	165650610	165653315
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1674	-0.583	8.1323778551791e-09	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1185629	326	299	0.1206	NA	NA	NA	6.62350440723095e-05	1115483	1187207
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1187207	1224716	14	13	0.4647	6.62350440723095e-05	1115483	1187207	1.99523182436716e-13	1224716	1224716
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1226767	1229427	2	2	1.1207	1.99523182436716e-13	1224716	1224716	3.75378786203477e-05	1229427	1232577
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1232577	3758249	991	910	0.1188	3.75378786203477e-05	1229427	1232577	5.27864607249169e-20	3755178	3760202
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3760202	3784644	12	12	-0.6712	5.27864607249169e-20	3755178	3760202	0.00100601174998971	3777763	3784644
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3786919	3794624	3	3	-0.0495	0.00100601174998971	3777763	3784644	1.31402876141976e-09	3794624	3795777
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3795777	3858031	32	26	-0.605	1.31402876141976e-09	3794624	3795777	8.94999661448124e-40	3858031	3862193
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3859418	3860985	2	0	NA	8.94999661448124e-40	3858031	3862193	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3862193	8270147	1568	1447	0.1154	NA	NA	NA	8.61797969024326e-06	8252006	8274889
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8272901	8310320	14	13	0.5166	8.61797969024326e-06	8252006	8274889	1.18752631824426e-09	8301622	8335580
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8327166	16214008	2462	2252	0.0796	1.18752631824426e-09	8301622	8335580	0	16212121	16217498
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16215842	26093050	3371	3100	-0.5683	0	16212121	16217498	5.58098573977999e-22	26093050	26093050
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26097755	26097755	1	0	NA	5.58098573977999e-22	26093050	26093050	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-2.2993	NA	NA	NA	5.3409333902221e-18	26108369	26108369
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	27679442	678	611	-0.5407	5.3409333902221e-18	26108369	26108369	0	27675199	27683917
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	27682028	27682028	1	0	NA	0	27675199	27683917	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	27683917	28976267	600	557	0.0648	NA	NA	NA	5.82842600544233e-54	28971519	28981217
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	28978094	29141406	75	68	0.5486	5.82842600544233e-54	28971519	28981217	1.64865642530966e-53	29129452	29149313
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29145614	42669489	4995	4610	0.0724	1.64865642530966e-53	29129452	29149313	1.74760594523028e-07	42630912	42688957
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	42676460	42719864	13	13	0.4899	1.74760594523028e-07	42630912	42688957	7.13695688706598e-05	42698438	42773892
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	42724048	47299586	1372	1274	0.1092	7.13695688706598e-05	42698438	42773892	5.60060929499674e-16	47292247	47307033
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	47302689	47355013	25	25	0.595	5.60060929499674e-16	47292247	47307033	1.71910440915176e-19	47348454	47359661
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	47357283	68797540	3915	3559	0.0894	1.71910440915176e-19	47348454	47359661	0	68796321	68798924
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	68798924	69279020	243	228	-0.6051	0	68796321	68798924	0	69275767	69281750
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69281750	107417571	13457	12395	0.0922	0	69275767	69281750	0	107408362	107422439
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	107419960	109017374	706	651	0.534	0	107408362	107422439	4.28381765147906e-08	109015996	109017374
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109019054	109024991	2	2	1.5993	4.28381765147906e-08	109015996	109017374	4.56816727847687e-08	109024991	109030732
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109027435	109027435	1	0	NA	4.56816727847687e-08	109024991	109030732	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109030732	118611324	4382	4016	0.5191	NA	NA	NA	2.18804366565346e-21	118611324	118611324
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.9252	2.18804366565346e-21	118611324	118611324	1.22229812819379e-19	118620875	118620875
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	122669074	1809	1666	0.52	1.22229812819379e-19	118620875	118620875	1.15867666337413e-66	122652117	122685592
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	122673319	123257756	276	254	0.8186	1.15867666337413e-66	122652117	122685592	8.87564671972221e-20	123241882	123291675
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	123259476	123477932	82	75	0.5002	8.87564671972221e-20	123241882	123291675	3.29146707932278e-07	123464144	123483691
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	123481059	123502682	14	12	0.9537	3.29146707932278e-07	123464144	123483691	3.61483405004918e-07	123498194	123513158
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	123504025	125771104	961	886	0.52	3.61483405004918e-07	123498194	123513158	7.89337018163284e-07	125745626	125778451
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125774331	125831554	28	26	0.8087	7.89337018163284e-07	125745626	125778451	8.14410876257645e-274	125831554	125831554
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.2278	8.14410876257645e-274	125831554	125831554	1.19545135005941e-167	125837524	125837524
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125877979	22	20	0.8861	1.19545135005941e-167	125837524	125837524	5.27499155458577e-10	125873396	125890700
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125879757	126276522	176	160	0.4953	5.27499155458577e-10	125873396	125890700	7.75621137843805e-08	126272737	126280816
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126279732	126289299	6	6	1.1058	7.75621137843805e-08	126272737	126280816	4.74536346300867e-06	126283655	126298856
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126290874	127528033	632	588	0.5226	4.74536346300867e-06	126283655	126298856	1.00755210473535e-36	127521254	127545421
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	127529278	127928122	208	191	0.8241	1.00755210473535e-36	127521254	127545421	1.90812928178369e-49	127869886	128103937
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	127974303	138156582	4790	4412	0.5251	1.90812928178369e-49	127869886	128103937	0	138148607	138167880
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138159790	141409512	1527	1421	0.1095	0	138148607	138167880	3.76313195488717e-13	141405145	141414719
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141435643	13	13	0.6831	3.76313195488717e-13	141405145	141414719	5.96938594732807e-09	141431668	141443577
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141438504	1	0	NA	5.96938594732807e-09	141431668	141443577	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	109	0.1186	NA	NA	NA	1.70658501728059e-183	141690753	141690753
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-3.8443	1.70658501728059e-183	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	156222039	5590	5135	0.0892	0	141714168	141714168	9.91539279194212e-161	156209525	156239753
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156228549	156973839	314	290	0.5296	9.91539279194212e-161	156209525	156239753	2.47232432682202e-91	156957508	156985653
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156978436	157783276	407	372	0.0736	2.47232432682202e-91	156957508	156985653	1.48941056003737e-118	157771132	157790946
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	157785600	158821263	441	409	0.5439	1.48941056003737e-118	157771132	157790946	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	151472	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	166493	581533	118	110	-0.5767	NA	NA	NA	1.53649406403588e-14	581533	581533
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.1858	1.53649406403588e-14	581533	581533	7.34067897989123e-16	588865	588865
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7697025	2276	2119	-0.5968	7.34067897989123e-16	588865	588865	2.79970339069196e-09	7327293	7697025
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7709141	7824059	4	4	-1.4625	2.79970339069196e-09	7327293	7697025	2.97323594467758e-11	7824059	8137794
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	10012087	709	649	-0.5542	2.97323594467758e-11	7824059	8137794	9.0416075720674e-12	10012087	10012087
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10013994	10017348	3	2	-1.871	9.0416075720674e-12	10012087	10012087	1.0896227391909e-10	10017348	10017348
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10019015	22989377	4401	4027	-0.5684	1.0896227391909e-10	10017348	10017348	0	22986699	22994030
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	22993104	32680666	3618	3301	0.0901	0	22986699	22994030	3.76057375056952e-12	32673009	32684421
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32682679	32725864	22	21	0.5083	3.76057375056952e-12	32673009	32684421	5.88576644238483e-17	32724326	32729820
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32727390	32797545	39	37	0.0639	5.88576644238483e-17	32724326	32729820	7.61333357304361e-14	32797545	32797545
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	2	-0.9807	7.61333357304361e-14	32797545	32797545	1.43653945892397e-07	32808049	32812909
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	39350798	1878	1726	0.0814	1.43653945892397e-07	32808049	32812909	4.55048815054436e-146	39345557	39350798
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	0.9487	4.55048815054436e-146	39345557	39350798	1.13462320438388e-135	39504332	39508035
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	59444821	4623	4245	0.0907	1.13462320438388e-135	39504332	39508035	2.39809512504247e-51	59396813	59458302
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	59452538	59692201	105	97	0.4949	2.39809512504247e-51	59396813	59458302	1.84851048233427e-63	59685360	59704873
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	59694225	59694225	1	0	NA	1.84851048233427e-63	59685360	59704873	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	59697292	66493155	1890	1732	0.0661	NA	NA	NA	7.29269692834341e-119	66486418	66498881
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	66498881	66734737	59	54	0.8455	7.29269692834341e-119	66486418	66498881	4.10613004194237e-07	66721623	66744638
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	66740020	66782706	21	21	0.4864	4.10613004194237e-07	66721623	66744638	2.55852078476422e-13	66780934	66789327
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	66785225	94195004	7960	7282	0.0694	2.55852078476422e-13	66780934	66789327	0	94167047	94216827
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	94201766	122529659	9224	8447	0.5093	0	94167047	94216827	0	122507197	122563718
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	122536437	125954426	1153	1066	0.0789	0	122507197	122563718	0	125928889	125999030
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	125960129	125960129	1	0	NA	0	125928889	125999030	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	125964073	141274001	4523	4171	0.4751	NA	NA	NA	0	141254840	141300412
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141276873	146264846	1873	1717	0.8012	0	141254840	141300412	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23338535	7999	7334	-0.5708	NA	NA	NA	4.11724162261995e-09	23331804	23338535
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.2631	4.11724162261995e-09	23331804	23338535	6.27496518656529e-11	23365926	23377660
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	32268853	2196	1992	-0.5885	6.27496518656529e-11	23365926	23377660	0	32265596	32271292
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32271292	34305273	777	698	0.1193	0	32265596	32271292	8.5317183315827e-30	34296269	34314141
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34306572	34306572	1	0	NA	8.5317183315827e-30	34296269	34314141	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34308056	34423806	52	48	0.5848	NA	NA	NA	2.15809298181287e-33	34416714	34432070
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34425296	70926188	2043	1887	0.0981	2.15809298181287e-33	34416714	34432070	1.48714897702945e-44	70926188	70926188
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.812	1.48714897702945e-44	70926188	70926188	7.01238012116282e-51	70930528	70930528
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14258	0.0858	7.01238012116282e-51	70930528	70930528	3.18513151068914e-10	116122595	116124007
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116132839	3	3	-0.7899	3.18513151068914e-10	116122595	116124007	4.18113008339274e-13	116132839	116137111
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	130309038	5487	5009	0.1076	4.18113008339274e-13	116132839	116137111	0	130304237	130317456
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130311519	137352394	2807	2558	-0.4924	0	130304237	130317456	1.67565115771492e-33	137352394	137352394
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.9847	1.67565115771492e-33	137352394	137352394	4.10137261552694e-30	137356880	137356880
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	992	-0.4783	4.10137261552694e-30	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	126361	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128878	9070795	3240	2983	0.0891	NA	NA	NA	3.48084861676056e-07	9049117	9074180
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	9074180	9110230	8	6	-0.5195	3.48084861676056e-07	9049117	9074180	1.63120945405464e-06	9105574	9125463
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	9120734	57068319	14081	12977	0.0817	1.63120945405464e-06	9105574	9125463	4.47181421968849e-83	57046175	57080641
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	57074946	58130996	142	132	0.5178	4.47181421968849e-83	57046175	57080641	1.24421111384025e-81	58105624	58160946
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	58136703	69835856	3671	3352	0.093	1.24421111384025e-81	58105624	58160946	8.43173494040575e-12	69834520	69837432
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69837432	69841183	3	3	1.1712	8.43173494040575e-12	69834520	69837432	2.88173871550988e-11	69839583	69841183
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	70366975	255	237	0.1393	2.88173871550988e-11	69839583	69841183	5.38126741782741e-08	70361773	70366975
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70370774	70370774	1	0	NA	5.38126741782741e-08	70361773	70366975	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70372738	70383151	8	7	0.6812	NA	NA	NA	2.15069642167288e-05	70383151	70390613
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70385380	75344648	2028	1863	0.1226	2.15069642167288e-05	70383151	70390613	7.74417829377997e-12	75337859	75350054
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	75346548	75404347	20	18	0.6303	7.74417829377997e-12	75337859	75350054	5.28181857439488e-17	75380313	75412226
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	75409135	77917870	1133	1034	0.0983	5.28181857439488e-17	75380313	75412226	1.22829073146298e-81	77917870	77917870
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77917893	77917893	1	0	NA	1.22829073146298e-81	77917870	77917870	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.3145	NA	NA	NA	7.9369092155217e-78	77928669	77928669
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	77928738	1	0	NA	7.9369092155217e-78	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	98912597	6998	6458	0.0895	NA	NA	NA	4.64625097248017e-58	98902359	98924373
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	98913885	99115791	93	90	0.5326	4.64625097248017e-58	98902359	98924373	1.08654860288338e-53	99104125	99125878
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	99119882	127309739	10290	9385	0.0942	1.08654860288338e-53	99104125	99125878	5.21017712562232e-12	127299012	127315113
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127311751	127373143	25	23	0.5116	5.21017712562232e-12	127299012	127315113	3.33122056446125e-10	127368422	127386880
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127375553	127375553	1	0	NA	3.33122056446125e-10	127368422	127386880	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127377855	127566573	89	83	0.0825	NA	NA	NA	2.01738398067059e-07	127552919	127569849
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127584239	10	10	-0.4634	2.01738398067059e-07	127552919	127569849	6.06510772151673e-08	127581493	127598425
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127590461	133761899	2086	1915	0.0492	6.06510772151673e-08	127581493	127598425	3.85556862593205e-85	133730137	133779614
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	133764941	134122324	159	147	0.4954	3.85556862593205e-85	133730137	133779614	3.08440189481518e-37	134111849	134153178
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134124086	134124086	1	0	NA	3.08440189481518e-37	134111849	134153178	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134126973	135285645	461	425	0.1008	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4113955	1501	1376	0.0808	NA	NA	NA	5.22542523178677e-15	4104273	4116738
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4116424	4370449	39	36	0.5122	5.22542523178677e-15	4104273	4116738	5.862529507618e-22	4362795	4389921
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4371930	18896166	5832	5374	0.0799	5.862529507618e-22	4362795	4389921	2.65096641364191e-07	18890351	18896166
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	5	-0.6055	2.65096641364191e-07	18890351	18896166	2.34380072826111e-07	18917191	18929375
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	18946873	6	6	0.051	2.34380072826111e-07	18917191	18929375	0.00187287082409293	18938056	19003627
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18951913	19050528	14	13	0.641	0.00187287082409293	18938056	19003627	6.64937083859558e-16	19040396	19055313
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	19052559	28539206	2942	2713	0.058	6.64937083859558e-16	19040396	19055313	9.4660545898861e-23	28497173	28549164
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	28543857	28845020	49	43	0.4395	9.4660545898861e-23	28497173	28549164	2.02851494767471e-19	28827876	28885939
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	28853497	45350290	4900	4510	0.077	2.02851494767471e-19	28827876	28885939	0.0094031591213659	45273167	45351539
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	45351539	45361314	5	5	0.433	0.0094031591213659	45273167	45351539	2.22224799568656e-05	45352943	45655985
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	45363495	45363495	1	0	NA	2.22224799568656e-05	45352943	45655985	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	45365112	49659817	1421	1282	0.1349	NA	NA	NA	2.53380083212582e-05	49627359	49685235
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49663240	49701463	10	8	-0.3269	2.53380083212582e-05	49627359	49685235	0.00139455827416328	49683052	49738024
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49710027	55118214	179	161	0.0398	0.00139455827416328	49683052	49738024	3.52605050332373e-12	55090306	55136234
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	38	-0.289	3.52605050332373e-12	55090306	55136234	1.37760063443861e-15	55202450	55230765
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	61425268	2492	2316	0.0879	1.37760063443861e-15	55202450	55230765	3.23082512919656e-09	61413245	61432648
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61427414	61456658	14	14	0.5687	3.23082512919656e-09	61413245	61432648	3.63155713136309e-07	61450062	61474260
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61468000	75125827	5438	4994	0.1209	3.63155713136309e-07	61450062	61474260	0	75112986	75135386
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	75130022	100657740	8135	7457	0.4993	0	75112986	75135386	3.12588735990089e-08	100578568	100662813
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	100662813	100784353	16	16	0.1044	3.12588735990089e-08	100578568	100662813	6.28580697724887e-08	100775038	100817152
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	100790765	112641041	4031	3686	0.5002	6.28580697724887e-08	100775038	100817152	0	112632684	112651301
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	112642610	112642610	1	0	NA	0	112632684	112651301	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	112643849	126843024	5472	5019	0.077	NA	NA	NA	0	126813047	126879574
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	126850142	130551161	1126	1034	0.4956	0	126813047	126879574	0	130543687	130559509
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	130555268	134450318	1634	1494	0.0087	0	130543687	130559509	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9528590	3743	3467	0.5114	NA	NA	NA	3.32896960532134e-140	9528590	9528590
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9531133	9554149	4	4	-3.0487	3.32896960532134e-140	9528590	9528590	3.70385742981686e-60	9554149	9554149
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9626623	12	10	-0.1155	3.70385742981686e-60	9554149	9554149	1.87899185058884e-12	9607363	9628897
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11116883	570	511	0.5226	1.87899185058884e-12	9607363	9628897	1.89892333309897e-99	11116883	11116883
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	-1.9226	1.89892333309897e-99	11116883	11116883	3.35292391764132e-94	11140421	11140421
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	12354529	437	400	0.5241	3.35292391764132e-94	11140421	11140421	1.46658087138143e-11	12344994	12358520
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12355952	12419910	28	23	0.9375	1.46658087138143e-11	12344994	12358520	4.79476195040587e-14	12410048	12433043
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12422129	12423720	2	0	NA	4.79476195040587e-14	12410048	12433043	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12429094	16580697	1715	1568	0.5106	NA	NA	NA	0	16573468	16591349
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	16584102	47726566	9293	8509	0.0921	0	16573468	16591349	7.49627492063877e-13	47723446	47732552
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47728325	47752803	13	13	0.6287	7.49627492063877e-13	47723446	47732552	1.36171656706805e-09	47746896	47764939
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47755024	52312931	2033	1859	0.1226	1.36171656706805e-09	47746896	47764939	1.51090709661754e-07	52299136	52336281
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52333581	52359806	13	13	0.5733	1.51090709661754e-07	52299136	52336281	8.47424942876733e-09	52355557	52368293
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52361615	60366417	2632	2430	0.1087	8.47424942876733e-09	52355557	52368293	7.30298022593109e-28	60325039	60373862
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60371650	60491471	48	44	0.5511	7.30298022593109e-28	60325039	60373862	2.21697946388493e-34	60488994	60501423
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	60493497	92458695	9753	8929	0.0891	2.21697946388493e-34	60488994	60501423	0	92457549	92468241
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	92460223	107409688	5540	5059	-0.5477	0	92457549	92468241	0	107400639	107415327
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	107413760	108509592	501	459	0.1064	0	107400639	107415327	0	108505952	108513906
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	108511868	130943064	8265	7613	-0.5161	0	108505952	108513906	1.16895219442401e-28	130943064	130943064
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.6625	1.16895219442401e-28	130943064	130943064	5.13767518053503e-27	130946248	130946248
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	509	-0.4943	5.13767518053503e-27	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	31818954	5080	4683	0.0691	NA	NA	NA	3.88898416354362e-52	31811501	31824238
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31819088	32028207	95	84	0.508	3.88898416354362e-52	31811501	31824238	2.17767899926389e-54	32023848	32036144
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	32032782	49964838	7044	6465	0.0828	2.17767899926389e-54	32023848	32036144	1.37282451379527e-59	49964838	49964838
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.7831	1.37282451379527e-59	49964838	49964838	7.81327417090766e-62	49971732	49971732
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	97656913	13398	12285	0.079	7.81327417090766e-62	49971732	49971732	0	97652820	97659082
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97657478	114123340	6025	5542	-0.567	0	97652820	97659082	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19400407	20	19	-0.3591	NA	NA	NA	2.37615501733575e-14	19323579	19408583
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19402284	19402284	1	0	NA	2.37615501733575e-14	19323579	19408583	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19403640	21474576	1006	930	0.0967	NA	NA	NA	1.97980350445545e-46	21452603	21498439
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21478228	22035729	276	257	0.3576	1.97980350445545e-46	21452603	21498439	6.13421180603732e-58	22012263	22052799
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22038206	34817076	4516	4160	0.094	6.13421180603732e-58	22012263	22052799	7.29021467315459e-67	34812204	34823581
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34820213	35087101	95	87	0.5708	7.29021467315459e-67	34812204	34823581	1.29652998037993e-68	35080362	35095628
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	35089809	51531503	4691	4302	0.0939	1.29652998037993e-68	35080362	35095628	3.06741852572781e-161	51524203	51536988
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	51532872	52266120	284	256	0.5266	3.06741852572781e-161	51524203	51536988	5.13410740399749e-138	52258185	52271761
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	52267298	55218943	1091	998	0.0999	5.13410740399749e-138	52258185	52271761	3.31275291957095e-16	55213412	55226614
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55220415	55300638	28	27	0.5117	3.31275291957095e-16	55213412	55226614	2.21126712185047e-15	55291912	55312907
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55302130	72006360	6868	6270	0.0899	2.21126712185047e-15	55291912	55312907	1.57908070118618e-77	71999330	72013796
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72007571	72264603	143	128	0.5213	1.57908070118618e-77	71999330	72013796	4.913042995978e-57	72253978	72274783
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72268062	75261869	1455	1334	0.1215	4.913042995978e-57	72253978	72274783	1.40732499972843e-26	75255816	75266316
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75265256	75339353	35	33	0.6428	1.40732499972843e-26	75255816	75266316	5.30844202701548e-34	75337741	75344510
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75341232	75341232	1	0	NA	5.30844202701548e-34	75337741	75344510	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75342614	79988469	2111	1941	0.0767	NA	NA	NA	0	79968125	80012169
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79990851	105597555	9021	8285	0.5015	0	79968125	80012169	3.12116440185825e-257	105597555	105597555
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.2509	3.12116440185825e-257	105597555	105597555	1.47620952128976e-36	105632168	105673157
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105881893	55	49	-0.0585	1.47620952128976e-36	105632168	105673157	5.98421086397463e-22	105856591	105900253
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106218059	124	114	0.5456	5.98421086397463e-22	105856591	105900253	6.94352859948628e-09	106192329	106236795
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106358491	52	50	0.199	6.94352859948628e-09	106192329	106236795	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1939	NA	NA	NA	1.15993952917571e-20	18452491	18692865
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	91	-1.0786	1.15993952917571e-20	18452491	18692865	1.83773318662742e-06	19421704	19805960
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	-0.5662	1.83773318662742e-06	19421704	19805960	4.48095995192194e-07	19845942	19845942
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-1.8005	4.48095995192194e-07	19845942	19845942	1.26508162256483e-10	19882711	19910696
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	40	-0.6793	1.26508162256483e-10	19882711	19910696	7.75173959287058e-55	20065525	20308014
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	22219332	327	301	0.0437	7.75173959287058e-55	20065525	20308014	2.12111851324817e-30	22219332	22219332
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22238807	22250971	2	2	-2.2436	2.12111851324817e-30	22219332	22219332	2.35182653809660e-32	22250971	22250971
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	28943784	1956	1777	0.0759	2.3518265380966e-32	22250971	22250971	2.48983459972785e-07	28923818	28943784
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28958705	28972423	4	4	-0.7234	2.48983459972785e-07	28923818	28943784	7.98054619570778e-08	28972423	28980222
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	28980222	33510562	1719	1588	0.0891	7.98054619570778e-08	28972423	28980222	6.30434761687483e-20	33501708	33522640
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33511620	33591671	38	35	0.5248	6.30434761687483e-20	33501708	33522640	2.35395957788391e-19	33582897	33598933
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33593891	42247612	3572	3289	0.1093	2.35395957788391e-19	33582897	33598933	3.96574113940487e-29	42240906	42257858
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	42249411	42389686	56	54	0.5185	3.96574113940487e-29	42240906	42257858	3.02535301087318e-30	42380070	42396571
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	42391481	75109087	14051	12839	0.1002	3.02535301087318e-30	42380070	42396571	7.26677966635231e-05	75095006	75109087
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75110193	75110193	1	0	NA	7.26677966635231e-05	75095006	75109087	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75111262	75115806	3	3	-0.479	NA	NA	NA	5.6614859763595e-37	75115806	75115806
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.0893	5.6614859763595e-37	75115806	75115806	2.46718964691528e-08	75119713	75119713
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	81447247	2245	2045	0.0893	2.46718964691528e-08	75119713	75119713	9.4324680574908e-29	81441092	81456838
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	81449437	81548771	52	47	0.5378	9.4324680574908e-29	81441092	81456838	7.43027921600944e-29	81539649	81557017
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	81551934	90524106	3619	3317	0.087	7.43027921600944e-29	81539649	81557017	5.01728042675116e-68	90513170	90530292
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	90525355	90881398	140	133	0.5002	5.01728042675116e-68	90513170	90530292	1.68695839344687e-40	90855475	90934524
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	90890088	99632987	3105	2858	0.8186	1.68695839344687e-40	90855475	90934524	9.82496492945038e-33	99632987	99632987
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	3.1049	9.82496492945038e-33	99632987	99632987	3.68212644480196e-26	99635701	99635701
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	245	0.8219	3.68212644480196e-26	99635701	99635701	5.25684838986538e-05	100212174	100282819
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	4	0.0824	5.25684838986538e-05	100212174	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	3511191	1374	1262	0.1186	NA	NA	NA	3.73104632806902e-13	3498415	3518224
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3513201	3564553	25	24	-0.3929	3.73104632806902e-13	3498415	3518224	4.88552603459626e-19	3553661	3571201
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3568499	4208904	278	262	0.1508	4.88552603459626e-19	3553661	3571201	1.99106268264548e-43	4206057	4218953
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4212674	4363703	60	54	-0.4196	1.99106268264548e-43	4206057	4218953	9.45092424619475e-38	4349090	4370319
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4364876	9885280	1950	1814	0.0699	9.45092424619475e-38	4349090	4370319	6.32970157009615e-07	9870834	9890027
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9887520	9911181	12	11	0.5395	6.32970157009615e-07	9870834	9890027	3.64768203869927e-06	9907043	9922194
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9914138	21501073	3566	3256	0.0983	3.64768203869927e-06	9907043	9922194	6.87379741855142e-15	21487008	21507188
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	21504151	1	0	NA	6.87379741855142e-15	21487008	21507188	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21507188	21557247	22	22	0.5725	NA	NA	NA	1.01535932394734e-14	21547651	21567591
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21560802	22561536	264	244	0.1265	1.01535932394734e-14	21547651	21567591	1.52741237599041e-09	22547406	22584012
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22567551	22617217	7	6	-0.5566	1.52741237599041e-09	22547406	22584012	1.72437282211829e-06	22604851	22636249
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	47863176	4180	3844	0.0912	1.72437282211829e-06	22604851	22636249	0	47855823	47867290
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	47865615	76923844	9396	8621	-0.5414	0	47855823	47867290	5.99378378200208e-149	76923844	76931247
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	5.99378378200208e-149	76923844	76931247	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-2.9923	NA	NA	NA	6.64280232566837e-132	76937156	76940218
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4158	-0.5362	6.64280232566837e-132	76937156	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	47546	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	48858	1028979	416	379	0.1757	NA	NA	NA	1.03104238248906e-17	1028979	1028979
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.9363	1.03104238248906e-17	1028979	1028979	2.73086424555096e-16	1030766	1030766
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	4406750	1537	1432	0.1535	2.73086424555096e-16	1030766	1030766	0	4399862	4412532
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4409871	4409871	1	0	NA	0	4399862	4412532	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4411082	26550777	8001	7277	-0.5266	NA	NA	NA	8.75200539368933e-54	26546113	26557409
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26552349	26552349	1	0	NA	8.75200539368933e-54	26546113	26557409	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26554007	26659022	54	50	0.0704	NA	NA	NA	3.62731886403225e-58	26652668	26663307
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26660995	31461588	2025	1856	-0.5406	3.62731886403225e-58	26652668	26663307	2.26219328767242e-09	31443186	31471890
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	16	-0.9777	2.26219328767242e-09	31443186	31471890	2.19534440241509e-10	31489333	31893451
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1657	-0.5007	2.19534440241509e-10	31489333	31893451	4.91102847428586e-91	36673853	36673853
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	5	-2.9887	4.91102847428586e-91	36673853	36673853	1.35109572307725e-93	36684619	36684619
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1836	-0.4791	1.35109572307725e-93	36684619	36684619	7.40324817631438e-46	41566540	41572001
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41647135	36	35	-1.1433	7.40324817631438e-46	41566540	41572001	6.58423697957661e-41	41644148	41652861
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	52440878	3489	3179	-0.5254	6.58423697957661e-41	41644148	41652861	2.62668144138362e-22	52440878	52440878
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-2.0886	2.62668144138362e-22	52440878	52440878	7.4059721364774e-21	52447064	52447064
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	55198853	1228	1116	-0.5211	7.4059721364774e-21	52447064	52447064	0	55195835	55202252
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55202252	56345374	456	422	0.1325	0	55195835	55202252	3.02965965135542e-11	56335546	56362249
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56346577	56346577	1	0	NA	3.02965965135542e-11	56335546	56362249	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56351814	56439989	34	28	0.5176	NA	NA	NA	2.90473847220419e-13	56426695	56447865
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56441497	65875669	3633	3360	0.1094	2.90473847220419e-13	56426695	56447865	0	65854068	65896151
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	65879813	72398013	2327	2150	0.5325	0	65854068	65896151	1.13147678314091e-09	72398013	72398013
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72399562	72401138	2	2	-0.842	1.13147678314091e-09	72398013	72398013	6.3164027671744e-08	72401138	72402560
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72402560	73215537	305	278	0.5323	6.3164027671744e-08	72401138	72402560	1.06965520184552e-22	73162373	73236494
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73216978	73219246	2	0	NA	1.06965520184552e-22	73162373	73236494	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73228160	73640500	170	157	0.8402	NA	NA	NA	3.40950750046385e-08	73634928	73641644
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73641644	73655441	7	6	0.1494	3.40950750046385e-08	73634928	73641644	2.86044082532231e-05	73652226	73671678
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73659773	73659773	1	0	NA	2.86044082532231e-05	73652226	73671678	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73663659	73796830	61	57	0.8331	NA	NA	NA	1.06936140245289e-10	73773525	73837739
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73800895	78636731	1967	1825	0.524	1.06936140245289e-10	73773525	73837739	0.0440530661891884	78620280	78636731
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78637954	78653545	2	2	-0.2402	0.0440530661891884	78620280	78636731	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	158	0.1028	NA	NA	NA	3.9462519299347e-13	500897	500897
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	1.4182	3.9462519299347e-13	500897	500897	5.8959952306848e-12	505456	505456
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	61698601	18784	17207	0.0776	5.8959952306848e-12	505456	505456	1.80287075095411e-27	61691522	61706197
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	61700371	62015136	45	42	0.5132	1.80287075095411e-27	61691522	61706197	2.54834374628576e-29	61993401	62045388
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	62020563	76116026	3958	3632	0.0538	2.54834374628576e-29	61993401	62045388	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	442	0.128	NA	NA	NA	1.42933494790881e-18	1398325	1398325
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.313	1.42933494790881e-18	1398325	1398325	3.27158005196924e-22	1400840	1400840
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	20386500	8721	7976	0.1238	3.27158005196924e-22	1400840	1400840	4.19132050252441e-17	20383210	20399700
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20493401	16	16	-0.5592	4.19132050252441e-17	20383210	20399700	7.5849462567161e-17	20472156	20523643
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	20507235	1	0	NA	7.5849462567161e-17	20472156	20523643	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20510787	63788698	13827	12736	0.0857	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	546	0.0764	NA	NA	NA	2.72897770134090e-99	1506379	1515948
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.2962	2.7289777013409e-99	1506379	1515948	1.13831137533738e-143	1525300	1531162
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	42583567	13673	12561	0.0801	1.13831137533738e-143	1525300	1531162	0	42579005	42587355
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	42584966	45439752	1209	1109	-0.5289	0	42579005	42587355	0	45431011	45446438
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45443007	50532778	1835	1692	0.0952	0	45431011	45446438	0	50523650	50535759
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	50535759	51726915	432	405	0.7993	0	50523650	50535759	1.24077430527899e-100	51711782	51755141
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51728467	62419534	3835	3535	0.4707	1.24077430527899e-100	51711782	51755141	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9882922	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9886732	13882260	56	51	-0.2984	NA	NA	NA	1.30094629685298e-13	13717139	14125179
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	31991323	6193	5688	-0.5704	1.30094629685298e-13	13717139	14125179	4.71121952240678e-43	31988396	31993604
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	31993604	32048751	29	29	0.0577	4.71121952240678e-43	31988396	31993604	6.22372646799283e-32	32041894	32056017
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32051018	36789648	2266	2077	-0.555	6.22372646799283e-32	32041894	32056017	5.1416902153994e-11	36789648	36789648
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	0.8277	5.1416902153994e-11	36789648	36789648	7.65128356212542e-12	36791668	36792708
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46273962	4581	4168	-0.5356	7.65128356212542e-12	36791668	36792708	1.01023216631719e-111	46270186	46281498
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46278360	46278360	1	0	NA	1.01023216631719e-111	46270186	46281498	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46279903	46492023	103	97	0.0988	NA	NA	NA	1.59435679941300e-65	46488122	46495832
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46494437	46922972	209	193	-0.5334	1.594356799413e-65	46488122	46495832	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15448186	3	3	-0.4779	NA	NA	NA	0.00436478207371261	14866086	15466819
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15457366	21571489	2518	2291	0.1171	0.00436478207371261	14866086	15466819	1.13752029530688e-05	21568861	21571489
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.9808	1.13752029530688e-05	21568861	21571489	1.45227119260536e-05	21576859	21580865
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	420	0.0945	1.45227119260536e-05	21576859	21580865	1.38383666680697e-10	22618049	22686731
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22677959	1	0	NA	1.38383666680697e-10	22618049	22686731	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22679305	22720195	19	18	0.601	NA	NA	NA	2.73745298182268e-12	22713972	22736990
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	24834547	1028	943	0.0775	2.73745298182268e-12	22713972	22736990	0	24832402	24837152
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24835820	37618187	6710	6198	-0.5119	0	24832402	24837152	1.20745725299518e-26	37618187	37618187
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37621766	37621766	1	0	NA	1.20745725299518e-26	37618187	37618187	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.639	NA	NA	NA	9.4371463961152e-25	37626069	37626069
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5321	-0.4959	9.4371463961152e-25	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	109064	16	13	-1.1045	NA	NA	NA	1.25657390857120e-09	103089	111851
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	2301365	1383	1269	-0.5172	1.2565739085712e-09	103089	111851	4.65859803507111e-11	2300485	2301365
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.4823	4.65859803507111e-11	2300485	2301365	7.56940670855259e-13	2304398	2306110
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	338	-0.5614	7.56940670855259e-13	2304398	2306110	0.000100881703847244	2662104	2692498
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	25	-0.8585	0.000100881703847244	2662104	2692498	3.78118625523021e-107	2708291	2711273
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	10670204	2781	2564	0.3973	3.78118625523021e-107	2708291	2711273	1.05532934322169e-197	10670204	10670204
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	10671811	10741226	38	34	-1.0645	1.05532934322169e-197	10670204	10670204	9.53758036827266e-257	10741226	10741226
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	10743156	10743156	1	0	NA	9.53758036827266e-257	10741226	10741226	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	10745001	15434591	1942	1768	0.4288	NA	NA	NA	2.84340687053500e-08	15432118	15434591
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	15436303	15441525	5	5	1.1417	2.843406870535e-08	15432118	15434591	1.30720739271636e-07	15441525	15446557
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	15442574	15442574	1	0	NA	1.30720739271636e-07	15441525	15446557	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	15444994	41041809	9446	8657	0.4349	NA	NA	NA	4.47199590963629e-17	41041809	41041809
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	41043086	41043086	1	0	NA	4.47199590963629e-17	41041809	41041809	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	41045471	41046965	2	2	-1.1991	NA	NA	NA	4.04428433119546e-17	41046965	41046965
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	41048259	42648190	550	499	0.4178	4.04428433119546e-17	41046965	41046965	2.67557088221214e-61	42648190	42648190
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	42658614	42677517	3	3	-2.0609	2.67557088221214e-61	42648190	42648190	1.53666462479709e-56	42677517	42677517
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	42684077	118796876	19247	17670	0.4262	1.53666462479709e-56	42677517	42677517	6.7115282081019e-23	118794131	118797928
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118797928	118825582	15	12	1.2265	6.7115282081019e-23	118794131	118797928	3.79972168961192e-24	118823179	118830263
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118830263	131441055	3601	3307	0.4472	3.79972168961192e-24	118823179	118830263	2.12504401037366e-62	131441055	131441055
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	131444332	131444332	1	0	NA	2.12504401037366e-62	131441055	131441055	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	131445505	131457674	8	8	-1.072	NA	NA	NA	6.50677129163667e-60	131457674	131457674
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	131460486	146087729	4452	4104	0.4124	6.50677129163667e-60	131457674	131457674	1.14804205344944e-09	146087729	146087729
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	-0.8096	1.14804205344944e-09	146087729	146087729	1.94063622872116e-07	146095707	146098710
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	153332114	2623	2412	0.4137	1.94063622872116e-07	146095707	146098710	3.16694751192489e-08	153328351	153340901
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153333629	153344718	6	6	-0.3285	3.16694751192489e-08	153328351	153340901	1.56323523953467e-10	153342841	153348763
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153348763	154582414	409	372	0.4567	1.56323523953467e-10	153342841	153348763	5.49398461148375e-315	154578922	154586690
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	179	-0.502	5.49398461148375e-315	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	118	-3.4716	NA	NA	NA	1.00732526970476e-07	3772482	4272867
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.5201	1.00732526970476e-07	3772482	4272867	0.000122551541833161	5422507	6720552
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	161	-3.2654	0.000122551541833161	5422507	6720552	2.37285788022910e-07	7011055	7189475
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7461576	123	113	-2.3837	2.3728578802291e-07	7011055	7189475	5.60034413836693e-07	7349064	7605311
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7723783	82	77	-3.4071	5.60034413836693e-07	7349064	7605311	3.45304019165682e-06	7708716	7726921
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-1.8325	3.45304019165682e-06	7708716	7726921	5.9226398675397e-07	7776265	7806091
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8280065	124	118	-3.2818	5.9226398675397e-07	7776265	7806091	0.00845934303389019	8086207	8463583
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8678888	108	99	-2.7769	0.00845934303389019	8086207	8463583	5.02138814835195e-06	8569769	8761847
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8681965	8681965	1	0	NA	5.02138814835195e-06	8569769	8761847	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	10512616	195	180	-3.429	NA	NA	NA	2.08566922642613e-21	10506718	10537808
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10513747	10513747	1	0	NA	2.08566922642613e-21	10506718	10537808	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	17	-0.9282	NA	NA	NA	4.60468994767574e-23	11698871	12452734
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	8	-4.6918	4.60468994767574e-23	11698871	12452734	4.61739045429548e-10	12536761	12542979
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	13129843	192	175	-2.126	4.61739045429548e-10	12536761	12542979	3.28883501244814e-41	13111594	13150942
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	371	-3.4389	3.28883501244814e-41	13111594	13150942	3.99980756368481e-11	14262916	14386474
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14700040	145	138	-2.6675	3.99980756368481e-11	14262916	14386474	0.000163090861374034	14546195	14765141
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15137457	89	81	-3.3833	0.000163090861374034	14546195	14765141	0.00150345134539491	15025974	15191780
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15139441	15284717	82	76	-2.7201	0.00150345134539491	15025974	15191780	6.91461133659215e-06	15279629	15284717
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15293299	6	5	-5.1092	6.91461133659215e-06	15279629	15284717	0.00232836402827058	15293299	15308025
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15295719	15388044	60	53	-3.6292	0.00232836402827058	15293299	15308025	7.43041110598453e-07	15374939	15413514
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15389388	15389388	1	0	NA	7.43041110598453e-07	15374939	15413514	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15390599	15682936	118	108	-2.7589	NA	NA	NA	2.55653387113301e-06	15603855	15716500
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15911389	37	37	-3.721	2.55653387113301e-06	15603855	15716500	6.24100499363924e-11	15892492	15928904
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15915466	15977755	21	19	-1.9393	6.24100499363924e-11	15892492	15928904	0.000486864037545272	15955821	16017681
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15979526	15979526	1	0	NA	0.000486864037545272	15955821	16017681	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15980898	16377188	139	130	-3.0226	NA	NA	NA	0.206908277757248	16093439	16377188
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16380639	16387273	2	2	-1.1867	0.206908277757248	16093439	16377188	0.000724476412945613	16387273	16413874
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16656177	38	33	-4.1609	0.000724476412945613	16387273	16413874	8.10639489550519e-05	16575926	16745171
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16659030	22177335	909	837	-3.2878	8.10639489550519e-05	16575926	16745171	0.00787681887458006	21882765	22771961
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	85	-3.7606	0.00787681887458006	21882765	22771961	7.34932514545504e-52	22926726	22930737
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26952278	35	32	-0.8792	7.34932514545504e-52	22926726	22930737	8.67196680390376e-14	26950080	26952278
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26957814	26980386	3	3	-3.4457	8.67196680390376e-14	26950080	26952278	1.37643705321315e-61	26980386	26980386
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	26989053	2	2	-0.2972	1.37643705321315e-61	26980386	26980386	9.39623714820866e-15	26989053	26989053
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26990807	26990807	1	0	NA	9.39623714820866e-15	26989053	26989053	NA	NA	NA
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26995399	27003308	4	4	-1.6933	NA	NA	NA	1.54464029427363e-11	27003308	27003308
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.2826	1.54464029427363e-11	27003308	27003308	2.55687565522988e-41	27019256	27019256
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.7045	2.55687565522988e-41	27019256	27019256	3.64583319451763e-16	27039222	27053237
MSK_252152914497_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.8351	3.64583319451763e-16	27039222	27053237	NA	NA	NA
