Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	756927	6	6	-0.1446	NA	NA	NA	0.000114422593687728	750051	791419
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	766170	893629	30	29	0.5372	0.000114422593687728	750051	791419	2.64833904949569e-22	880808	903494
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	896990	72537426	27858	27225	-9e-04	2.64833904949569e-22	880808	903494	0	72537426	72537426
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.5241	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	103904723	10105	9890	-0.0037	0	72579311	72579311	2.06452324980618e-14	103899771	103909053
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103956767	14	14	0.5794	2.06452324980618e-14	103899771	103909053	2.00849249141718e-14	103927825	104108153
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103962495	103962495	1	0	NA	2.00849249141718e-14	103927825	104108153	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	108533257	1008	990	-0.0142	NA	NA	NA	4.11329454155977e-89	108533257	108533257
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-3.3116	4.11329454155977e-89	108533257	108533257	1.06685038397622e-94	108538662	108538662
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	146297175	5130	5008	4e-04	1.06685038397622e-94	108538662	108538662	1.74452673358158e-11	146268572	147326097
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	148081769	41	40	0.3217	1.74452673358158e-11	146268572	147326097	7.32977100398466e-11	147490553	148128113
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148084402	150819879	1254	1215	9e-04	7.32977100398466e-11	147490553	148128113	3.34065807082008e-144	150819879	150819879
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	9	2.422	3.34065807082008e-144	150819879	150819879	5.6946403545665e-133	150851439	150851439
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	153451902	1178	1159	0.0017	5.6946403545665e-133	150851439	150851439	1.58729051459848e-15	153446387	153454056
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153454056	153464029	9	9	-0.8249	1.58729051459848e-15	153446387	153454056	7.7251974395255e-18	153463690	153467519
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153467519	157133150	1574	1538	-0.0053	7.7251974395255e-18	153463690	153467519	1.94307311836812e-90	157133150	157133150
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.8536	1.94307311836812e-90	157133150	157133150	3.13111188646808e-88	157136342	157136342
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	224441808	24138	23591	-0.0028	3.13111188646808e-88	157136342	157136342	5.02503835408666e-11	224439448	224441808
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	224444252	224450127	4	4	-0.9998	5.02503835408666e-11	224439448	224441808	3.7215893836131e-11	224450127	224451351
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	224451351	246755225	8641	8461	-0.0041	3.7215893836131e-11	224450127	224451351	3.31056729563437e-12	246691241	246805521
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246755298	246878405	33	33	0.2903	3.31056729563437e-12	246691241	246805521	9.28653690657542e-08	246863179	246921317
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246882156	246882156	1	0	NA	9.28653690657542e-08	246863179	246921317	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902260	247186514	93	88	-0.0392	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11258	-0.0098	NA	NA	NA	1.19336778010444e-19	34539603	34552935
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	-0.6113	1.19336778010444e-19	34539603	34552935	3.76464695981231e-21	34583814	34597294
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	66357387	11753	11480	-2e-04	3.76464695981231e-21	34583814	34597294	7.7615932254847e-190	66357387	66357387
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-5.5484	7.7615932254847e-190	66357387	66357387	4.71044835685887e-182	66360747	66360747
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	146571330	21778	21297	-0.0053	4.71044835685887e-182	66360747	66360747	0	146571330	146571330
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-6.3821	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242501239	32682	31955	-0.0012	0	146592775	146592775	2.40608663438034e-119	242496751	242505261
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242682950	65	62	-0.795	2.40608663438034e-119	242496751	242505261	0.0127416237416448	242655973	242682950
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242686945	242689978	2	2	0.0094	0.0127416237416448	242655973	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	46769081	15925	15525	-0.0023	NA	NA	NA	5.09813231668202e-17	46767765	46769081
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	7	-0.9246	5.09813231668202e-17	46767765	46769081	2.66185894197408e-17	46825048	46829442
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	46827727	1	0	NA	2.66185894197408e-17	46825048	46829442	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46829442	133189686	27775	27118	-0.0012	NA	NA	NA	2.34506941052625e-12	133189686	133189686
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4742	2.34506941052625e-12	133189686	133189686	1.12493329187627e-12	133194685	133194685
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.12493329187627e-12	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9543	0.0024	NA	NA	NA	9.12350175963607e-42	164005577	164005577
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	2.6236	9.12350175963607e-42	164005577	164005577	6.65678219899824e-21	164012645	164012645
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	164107951	23	22	0.5574	6.65678219899824e-21	164012645	164012645	3.22775950243474e-20	164101776	164115417
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	193785530	9933	9724	0.0025	3.22775950243474e-20	164101776	164115417	6.71651170609724e-17	193784209	193785530
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193794411	4	4	-1.1898	6.71651170609724e-17	193784209	193785530	3.26149496731472e-16	193794411	193797190
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193797190	199329592	2179	2124	0.0061	3.26149496731472e-16	193794411	193797190	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3324	-0.0174	NA	NA	NA	4.20269728086887e-248	9815760	9815760
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.7938	4.20269728086887e-248	9815760	9815760	2.57544844478256e-283	9842644	9842644
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	6028	-0.0154	2.57544844478256e-283	9842644	9842644	6.39681945648153e-09	34433787	34445002
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.732	6.39681945648153e-09	34433787	34445002	1.62214307600514e-09	34491115	34509895
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	119334954	25175	24613	-3e-04	1.62214307600514e-09	34491115	34509895	3.5279281568431e-141	119334954	119345371
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-3.8196	3.5279281568431e-141	119334954	119345371	7.04926573966739e-140	119346804	119348829
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	184788480	18120	17712	-2e-04	7.04926573966739e-140	119346804	119348829	7.02766787149116e-235	184782721	184792255
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	184790669	185325563	209	203	0.6033	7.02766787149116e-235	184782721	184792255	7.14899928188263e-137	185320588	185329008
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185327097	186384128	395	388	0.0187	7.14899928188263e-137	185320588	185329008	3.1746323653574e-67	186377910	186388346
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186386377	186532602	70	69	0.6308	3.1746323653574e-67	186377910	186388346	9.63895981416537e-73	186526397	186538269
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186536009	187330240	376	367	1e-04	9.63895981416537e-73	186526397	186538269	2.45545195274578e-40	187330240	187330240
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.8169	2.45545195274578e-40	187330240	187330240	1.40177519774261e-47	187333619	187333619
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1217	-0.0071	1.40177519774261e-47	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	17735652	5519	5414	-0.0156	NA	NA	NA	9.95130222209186e-09	17735652	17735652
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17739874	17739874	1	0	NA	9.95130222209186e-09	17735652	17735652	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17743589	17752042	2	2	-1.2714	NA	NA	NA	1.23685687131579e-09	17752042	17757185
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17757185	64242671	11964	11699	-0.0033	1.23685687131579e-09	17752042	17757185	4.29538523458614e-61	64236876	64242671
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	64244461	64287534	18	18	-1.0344	4.29538523458614e-61	64236876	64242671	1.36127348123912e-61	64287534	64289427
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	64289427	98116606	10122	9915	-9e-04	1.36127348123912e-61	64287534	64289427	1.23256474611749e-13	98113816	98116606
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98118881	98126117	4	4	-1.0534	1.23256474611749e-13	98113816	98116606	1.68364129988059e-12	98126117	98127741
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	98127741	180644810	26136	25567	1e-04	1.68364129988059e-12	98126117	98127741	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	0.0367	NA	NA	NA	6.73670806828576e-09	183349	202063
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	232366	12	12	0.5459	6.73670806828576e-09	183349	202063	3.29060174393202e-10	230588	237952
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	234115	27958005	9702	9506	-0.0075	3.29060174393202e-10	230588	237952	3.64844323297333e-14	27952903	27958005
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	27961781	27977063	9	9	0.7384	3.64844323297333e-14	27952903	27958005	2.98290583520696e-13	27977063	27980822
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	27978471	32558677	1914	1874	-0.027	2.98290583520696e-13	27977063	27980822	1.97469871701771e-111	32558677	32558677
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32593151	6	6	-2.726	1.97469871701771e-111	32558677	32558677	2.10281495680701e-06	32588005	32593151
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32609525	5	5	-0.8931	2.10281495680701e-06	32588005	32593151	8.16925129372862e-11	32605300	32613538
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32613538	54035000	8301	8103	2e-04	8.16925129372862e-11	32605300	32613538	1.13037361227688e-14	54035000	54035000
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.3324	1.13037361227688e-14	54035000	54035000	9.13075777175996e-17	54042734	54042734
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6294	0.0018	9.13075777175996e-17	54042734	54042734	1.33339400757266e-09	79005118	79028813
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.4924	1.33339400757266e-09	79005118	79028813	7.69072321549133e-09	79079988	79119694
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	170753106	29680	29015	-0.0026	7.69072321549133e-09	79079988	79119694	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	18244187	6139	5996	0.0049	NA	NA	NA	1.29837344998932e-12	18236631	18244187
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18248366	18260638	3	3	-1.2093	1.29837344998932e-12	18236631	18244187	4.00820591019105e-12	18260638	18266003
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	18266003	52276932	11869	11635	-0.0066	4.00820591019105e-12	18260638	18266003	7.8790450868195e-11	52276932	52279938
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52279938	52287180	3	3	1.1355	7.8790450868195e-11	52276932	52279938	2.16178021348299e-10	52284751	52287180
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52289210	71894353	3773	3681	0.0017	2.16178021348299e-10	52284751	52287180	4.88316172461294e-38	71894353	71894353
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.5936	4.88316172461294e-38	71894353	71894353	5.98147418245477e-41	71912065	71912065
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	118611324	17476	17094	6e-04	5.98147418245477e-41	71912065	71912065	2.35129796627426e-14	118611324	118611324
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	1.5649	2.35129796627426e-14	118611324	118611324	9.3134157247679e-16	118619693	118619693
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118620875	1	0	NA	9.3134157247679e-16	118619693	118619693	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3095	-0.0016	NA	NA	NA	3.29495600790946e-133	125831554	125831554
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.6668	3.29495600790946e-133	125831554	125831554	2.68470902436068e-116	125837524	125837524
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	134856657	4317	4219	-0.003	2.68470902436068e-116	125837524	125837524	5.27334067525957e-11	134850868	134856657
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134858375	134867303	5	5	-0.8968	5.27334067525957e-11	134850868	134856657	5.57166827884003e-12	134867303	134870292
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134870292	141410894	3040	2973	-0.0016	5.57166827884003e-12	134867303	134870292	1.41950263088182e-10	141406414	141419692
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	-0.5267	1.41950263088182e-10	141406414	141419692	1.13606860278657e-07	141431668	141446728
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	115	-0.028	1.13606860278657e-07	141431668	141446728	2.83663819332772e-12	141689547	141690753
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141709835	7	7	0.7673	2.83663819332772e-12	141689547	141690753	5.45493649386376e-11	141709835	141711513
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141711513	158821263	6755	6598	-0.0057	5.45493649386376e-11	141709835	141711513	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7997	-0.0116	NA	NA	NA	4.47203209114275e-10	25119007	25120552
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	4.47203209114275e-10	25119007	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.3796	NA	NA	NA	1.22349074623255e-10	25125700	25125700
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	137748793	33552	32798	-0.0093	1.22349074623255e-10	25125700	25125700	3.65683716778198e-79	137737806	137757481
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	32	-0.9082	3.65683716778198e-79	137737806	137757481	2.52301654824486e-63	137915829	137931707
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	146264846	2820	2755	-0.0081	2.52301654824486e-63	137915829	137931707	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12781	-0.0061	NA	NA	NA	3.71722369566351e-43	70926188	70926188
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.6805	3.71722369566351e-43	70926188	70926188	3.11074468150576e-40	70930528	70930528
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23240	-4e-04	3.11074468150576e-40	70930528	70930528	5.74012424226732e-15	137352394	137352394
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.6649	5.74012424226732e-15	137352394	137352394	2.49754765842343e-13	137356880	137356880
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1073	0.0145	2.49754765842343e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9528	-0.007	NA	NA	NA	5.46251336864345e-14	27038538	27038538
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.5913	5.46251336864345e-14	27038538	27038538	2.44029571509e-14	27041812	27041812
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45476905	4721	4606	1e-04	2.44029571509e-14	27041812	27041812	2.85060086458253e-27	45463553	46388078
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45478103	46568496	77	76	0.3559	2.85060086458253e-27	45463553	46388078	1.13742291338112e-27	46545343	47058901
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	77917893	10063	9855	3e-04	1.13742291338112e-27	46545343	47058901	1.04990246990850e-55	77917893	77917893
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.5112	1.0499024699085e-55	77917893	77917893	1.32651556880338e-52	77928738	77928738
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135284109	20212	19771	-0.0057	1.32651556880338e-52	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2088	0.0081	NA	NA	NA	1.59402632793181e-25	5734978	5741031
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.8075	1.59402632793181e-25	5734978	5741031	7.11195326549818e-25	5765438	5766615
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	7762277	863	839	-0.0203	7.11195326549818e-25	5765438	5766615	8.9983824337072e-19	7758275	7762277
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7771593	7783344	7	7	-1.0213	8.9983824337072e-19	7758275	7762277	3.59035545387622e-21	7783344	7783492
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7783492	55118214	13882	13573	0.0013	3.59035545387622e-21	7783344	7783492	6.99549545944062e-35	55097806	55124730
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.5515	6.99549545944062e-35	55097806	55124730	1.03105186702659e-33	55205278	55221692
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	107284914	18285	17886	5e-04	1.03105186702659e-33	55205278	55221692	2.2853665022213e-132	107284914	107284914
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-4.7798	2.2853665022213e-132	107284914	107284914	7.6740472546932e-134	107292148	107292148
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9851	-0.0103	7.6740472546932e-134	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3676	-0.0029	NA	NA	NA	5.77295073468662e-61	9523923	9543817
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	16	1.1757	5.77295073468662e-61	9523923	9543817	6.28318521789817e-59	9599999	9610054
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	553	-0.0027	6.28318521789817e-59	9599999	9610054	8.25259401332791e-17	11112600	11116883
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	0.962	8.2525940133279e-17	11112600	11116883	1.84059054329905e-16	11130871	11140421
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	19358397	2833	2773	-0.009	1.84059054329905e-16	11130871	11140421	1.71288969265385e-55	19352226	19361660
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19359838	19469446	56	55	0.5765	1.71288969265385e-55	19352226	19361660	1.14447931355545e-56	19466506	19476466
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	19471947	31132762	3931	3846	-3e-04	1.14447931355545e-56	19466506	19476466	6.17586385728078e-16	31084265	31177645
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	17	0.5562	6.17586385728078e-16	31084265	31177645	1.78235865193974e-14	31225941	31246624
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	132289090	33989	33247	0.0026	1.78235865193974e-14	31225941	31246624	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7189	-0.0058	NA	NA	NA	9.62675097637949e-50	37953582	37953582
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.908	9.6267509763795e-50	37953582	37953582	2.43324887157415e-53	37957844	37957844
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	100690991	19740	19327	-0.0014	2.43324887157415e-53	37957844	37957844	2.96966094696014e-220	100690991	100690991
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.8766	2.96966094696014e-220	100690991	100690991	6.70361367841345e-206	100693892	100693892
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4450	-0.0083	6.70361367841345e-206	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	0.3253	NA	NA	NA	2.32363153125914e-17	19471494	19549728
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73071404	19360	18915	0.002	2.32363153125914e-17	19471494	19549728	5.99833888861003e-48	73071404	73075500
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	5.99833888861003e-48	73071404	73075500	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.6276	NA	NA	NA	9.16904531374076e-45	73092018	73092112
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105606424	12217	11938	4e-04	9.16904531374076e-45	73092018	73092112	1.18385406555462e-08	105595302	105606424
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105607572	105632168	10	10	-0.5726	1.18385406555462e-08	105595302	105606424	0.0792534576350713	105630089	105848335
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105948347	72	69	-0.1945	0.0792534576350713	105630089	105848335	5.74159983741509e-06	105917286	105951399
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105985422	11	11	-0.8609	5.74159983741509e-06	105917286	105951399	0.000662115121428354	105973615	105989160
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105985458	106002179	6	6	-0.3473	0.000662115121428354	105973615	105989160	0.143128521468233	105989160	106093506
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	141	0.0143	0.143128521468233	105989160	106093506	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	41361216	7334	7149	-0.0054	NA	NA	NA	2.24872375039295e-06	41353561	41361216
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41364093	41365537	2	2	-0.7686	2.24872375039295e-06	41353561	41361216	0	41365537	41365537
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41367184	41371504	2	2	-1.5144	0	41365537	41365537	5.72757068989604e-13	41371504	41371504
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41374117	75115806	14547	14216	0.004	5.72757068989604e-13	41371504	41371504	9.88410056351343e-19	75115806	75115806
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.8047	9.88410056351343e-19	75115806	75115806	3.69974398240893e-18	75119713	75119713
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9230	-0.0011	3.69974398240893e-18	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10347	3e-04	NA	NA	NA	4.72740333231629e-52	31854794	32379126
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	46	0.6454	4.72740333231629e-52	31854794	32379126	4.52276837409346e-39	33647856	33842125
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	33830585	1	0	NA	4.52276837409346e-39	33647856	33842125	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	34317157	87	85	0.0057	NA	NA	NA	1.50983422226004e-16	34292521	34339543
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34596655	51	50	0.4423	1.50983422226004e-16	34292521	34339543	2.91951277223669e-28	34574587	34621068
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34602318	68712507	7543	7366	0.0035	2.91951277223669e-28	34574587	34621068	1.03687852402813e-13	68693086	68734100
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68732367	68753209	8	8	-0.7682	1.03687852402813e-13	68693086	68734100	8.76057734839343e-16	68751390	68838384
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	70154957	583	574	0.0456	8.76057734839343e-16	68751390	68838384	9.85601980038799e-06	70146666	70158911
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70157131	70166877	5	5	-0.5824	9.856019800388e-06	70146666	70158911	6.16216249018139e-05	70162042	70175377
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70168399	72918129	865	850	0.0054	6.16216249018139e-05	70162042	70175377	2.00519980437148e-11	72917554	72941901
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.7378	2.00519980437148e-11	72917554	72941901	1.65693242139565e-10	72956298	73025340
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	740	-6e-04	1.65693242139565e-10	72956298	73025340	1.68152707092337e-89	75093957	75093957
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.2129	1.68152707092337e-89	75093957	75093957	3.579135120935e-85	75100865	75100865
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5005	-0.0143	3.579135120935e-85	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31461588	12038	11757	0.0094	NA	NA	NA	2.55469850269548e-08	31439551	31468896
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31499568	17	17	-0.4335	2.55469850269548e-08	31439551	31468896	4.01344778163157e-09	31492553	31895551
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32707677	294	290	0.0269	4.01344778163157e-09	31492553	31895551	1.00966480746431e-07	32705315	32707677
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32709516	32711048	2	2	-1.1941	1.00966480746431e-07	32705315	32707677	1.03688161109007e-12	32711048	32711048
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32711885	32828797	70	69	0.0226	1.03688161109007e-12	32711048	32711048	1.07262847194095e-10	32828797	32828797
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	1.1083	1.07262847194095e-10	32828797	32828797	1.27443752196958e-05	32832642	32833765
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	41514481	3462	3379	0.0228	1.27443752196958e-05	32832642	32833765	4.22984797087188e-19	41506317	41514481
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41515622	41515622	1	0	NA	4.22984797087188e-19	41506317	41514481	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41518222	41566540	23	23	0.5952	NA	NA	NA	1.35110565987779e-21	41566540	41572001
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	78653545	13725	13399	0.0045	1.35110565987779e-21	41566540	41572001	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22480	-0.005	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56823430	19873	19411	0.0036	NA	NA	NA	2.53410046722989e-13	56819531	56823430
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.8271	2.53410046722989e-13	56819531	56823430	1.21371639019761e-12	56837593	56844304
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1158	-0.0222	1.21371639019761e-12	56837593	56844304	2.12799320301334e-12	59412581	59422642
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440262	11	11	-0.7042	2.12799320301334e-12	59412581	59422642	4.09764382596702e-13	59434159	59441741
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63788698	1993	1939	-0.0073	4.09764382596702e-13	59434159	59441741	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	578	0.0027	NA	NA	NA	1.08491159664160e-17	1506379	1516966
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1532433	9	9	0.8493	1.0849115966416e-17	1506379	1516966	1.47718757213418e-17	1528899	1544485
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20510	-0.0034	1.47718757213418e-17	1528899	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13140	-3e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2929	0.006	NA	NA	NA	4.02634997249745e-08	22603134	22696162
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	19	-0.4215	4.02634997249745e-08	22603134	22696162	1.34138025736940e-09	22708012	22738466
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	23326964	297	291	0.0326	1.3413802573694e-09	22708012	22738466	4.59108561470224e-36	23321969	23410438
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23410438	23438657	16	15	-0.9246	4.59108561470224e-36	23321969	23410438	5.51219673593717e-34	23437264	23440399
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23440399	35472378	6236	6099	0.0031	5.51219673593717e-34	23437264	23440399	1.31496271845670e-13	35472378	35472378
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.6273	1.3149627184567e-13	35472378	35472378	3.60645060160623e-13	35476942	35476942
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	45423570	5138	5000	0.0095	3.60645060160623e-13	35476942	35476942	1.47151061469405e-06	45406938	45428468
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45424689	45460464	22	22	0.3652	1.47151061469405e-06	45406938	45428468	2.08122305111006e-07	45453176	45473006
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45461388	49571068	1843	1795	-0.0107	2.08122305111006e-07	45453176	45473006	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2390126	1494	1468	0.0389	NA	NA	NA	7.94835836131763e-176	2385228	2392931
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2391772	2687984	281	276	0.5333	7.94835836131763e-176	2385228	2392931	3.07650399158802e-32	2687501	2692523
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2692498	2708291	18	18	-0.2778	3.07650399158802e-32	2687501	2692523	6.10418090773854e-62	2708291	2711273
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	44043	0.875	6.10418090773854e-62	2708291	2711273	0	154578922	154582414
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0031	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-3.7581	NA	NA	NA	7.57616203296576e-19	3034907	3772482
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-1.1647	7.57616203296576e-19	3034907	3772482	2.6926577956268e-14	5422507	6688691
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6970768	130	122	-3.7091	2.6926577956268e-14	5422507	6688691	5.07261837303299e-09	6939451	7016002
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6971636	7495687	173	170	-2.7363	5.07261837303299e-09	6939451	7016002	0.000359901666421202	7442914	7568006
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7606496	12	11	-4.47	0.000359901666421202	7442914	7568006	9.99167689264488e-15	7606496	7612732
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7645258	14	14	-2.0583	9.99167689264488e-15	7606496	7612732	1.66299067887689e-05	7632577	7664085
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	10515697	497	481	-3.5439	1.66299067887689e-05	7632577	7664085	1.50332315592065e-21	10512616	10515697
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.3328	1.50332315592065e-21	10512616	10515697	5.39667698506183e-06	10631941	11673476
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-2.3798	5.39667698506183e-06	10631941	11673476	0.000854842241235248	11660512	12511461
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.4196	0.000854842241235248	11660512	12511461	3.59401421847819e-09	12537944	12546917
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-1.9803	3.59401421847819e-09	12537944	12546917	0.0500236408924794	12579534	12682301
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12700767	3	3	-3.8918	0.0500236408924794	12579534	12682301	6.01394047315898e-30	12700767	12700767
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12710000	12715696	2	2	-3.1295	6.01394047315898e-30	12700767	12700767	4.88144667797906e-05	12715696	12715696
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12721434	12741404	5	5	-5.0074	4.88144667797906e-05	12715696	12715696	8.60557007915842e-06	12741404	12741404
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12745259	12772155	4	4	-3.3164	8.60557007915842e-06	12741404	12741404	0.487284356457193	12764220	13078432
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12776542	12776542	1	0	NA	0.487284356457193	12764220	13078432	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13104920	111	109	-2.3867	NA	NA	NA	0.0309901213978976	13001517	13111594
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.2293	0.0309901213978976	13001517	13111594	6.45253416437164e-15	13128515	13129843
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13153117	12	12	-4.2464	6.45253416437164e-15	13128515	13129843	0.000367860641164698	13148290	13165652
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13261173	32	32	-2.6858	0.000367860641164698	13148290	13165652	1.06437570301162e-08	13238502	13286708
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	14358464	371	358	-3.8852	1.06437570301162e-08	13238502	13286708	1.99435042899414e-06	14339170	14361732
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14382361	14	13	-2.3243	1.99435042899414e-06	14339170	14361732	6.88452253956814e-10	14380301	14382361
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14383746	14388689	5	5	-4.9408	6.88452253956814e-10	14380301	14382361	0.000501609056799078	14388689	14407293
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14390028	14508021	70	70	-3.0441	0.000501609056799078	14388689	14407293	9.72383999749646e-07	14496442	14538156
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	9.72383999749646e-07	14496442	14538156	NA	NA	NA
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.7128	NA	NA	NA	0.000129163263560794	14566592	14587291
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.9664	0.000129163263560794	14566592	14587291	2.37155168786789e-06	14596156	14598838
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-0.8059	2.37155168786789e-06	14596156	14598838	2.45584101510561e-10	14644293	14644293
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14696387	10	10	-3.0467	2.45584101510561e-10	14644293	14644293	0.478561711250975	14691724	15146521
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14697315	15206674	131	128	-3.6774	0.478561711250975	14691724	15146521	2.59018997495423e-05	15181501	15223545
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15251900	19	19	-2.2216	2.59018997495423e-05	15181501	15223545	0.00847781573760186	15222741	15261976
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15252823	15284717	24	23	-3.2441	0.00847781573760186	15222741	15261976	9.26235356102629e-07	15283393	15284717
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15290554	4	4	-5.7028	9.26235356102629e-07	15283393	15284717	2.86571049146178e-07	15290554	15293299
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15291532	15317370	19	19	-3.6735	2.86571049146178e-07	15290554	15293299	3.72155174349755e-05	15311814	15319560
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15318374	15339564	13	13	-4.7334	3.72155174349755e-05	15311814	15319560	0.000356460140452945	15334366	15348526
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15340715	15367176	17	17	-3.5872	0.000356460140452945	15334366	15348526	0.000194411898082521	15355928	15371826
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15370244	15390599	15	15	-4.7183	0.000194411898082521	15355928	15371826	0.000180201679592827	15389388	15409110
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15396500	15687088	118	116	-3.3127	0.000180201679592827	15389388	15409110	0.00831969652956473	15532597	15750379
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15915466	37	36	-4.0777	0.00831969652956473	15532597	15750379	5.83331081275666e-08	15892492	15951430
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16071977	60	56	-2.6615	5.83331081275666e-08	15892492	15951430	2.89192923571623e-10	16037646	16091622
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16072965	19610243	479	471	-3.7533	2.89192923571623e-10	16037646	16091622	5.6553736805826e-05	19606814	19610243
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	0.058	5.6553736805826e-05	19606814	19610243	1.32770547062378e-05	19613864	19614809
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	542	-3.6791	1.32770547062378e-05	19613864	19614809	1.78291072955231e-07	22055660	22139807
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.6521	1.78291072955231e-07	22055660	22139807	2.50525879711147e-28	22177335	22177335
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22308420	30	30	-4.6069	2.50525879711147e-28	22177335	22177335	0.000150959496395437	22249988	22768795
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	22930737	63	60	-3.6674	0.000150959496395437	22249988	22768795	4.76571683492593e-37	22924754	26870361
MSK_252152914533_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	83	-1.2317	4.76571683492593e-37	22924754	26870361	NA	NA	NA
