Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12592	0.0187	NA	NA	NA	3.1068706799186e-14	34859068	34869589
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.918	3.1068706799186e-14	34859068	34869589	6.86565202473245e-15	34883375	34884849
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	54860193	8125	7937	0.0057	6.86565202473245e-15	34883375	34884849	5.13690624845171e-06	54857788	54860193
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54862228	54864879	2	2	-0.851	5.13690624845171e-06	54857788	54860193	5.57494826286677e-09	54864879	54866506
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54866506	72537426	6869	6695	-0.0118	5.57494826286677e-09	54864879	54866506	0	72537426	72537426
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.8051	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	92012759	6100	5943	-0.0078	0	72579311	72579311	2.28114601055842e-18	92012759	92012759
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92013987	92020793	4	4	-1.0065	2.28114601055842e-18	92012759	92012759	8.7664869766147e-20	92020793	92020793
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92022217	104892344	4155	4049	0.0012	8.7664869766147e-20	92020793	92020793	6.85109679314218e-39	104892344	104892344
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104912040	104973892	7	7	-1.0587	6.85109679314218e-39	104892344	104892344	1.71812468221470e-35	104973892	104973892
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104983508	150819879	7290	7119	-0.0019	1.7181246822147e-35	104973892	104973892	5.85374038152808e-225	150819879	150819879
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	11	2.1184	5.85374038152808e-225	150819879	150819879	2.81787469010845e-219	150852858	150852858
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2699	0.0076	2.81787469010845e-219	150852858	150852858	6.46629914449492e-24	157133150	157133150
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6309	6.46629914449492e-24	157133150	157133150	5.10980188056305e-25	157136342	157136342
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167481271	4107	4012	-0.0133	5.10980188056305e-25	157136342	157136342	2.86393421424340e-11	167477428	167481271
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167483267	167507898	9	9	0.5016	2.8639342142434e-11	167477428	167481271	1.02717961663735e-10	167507898	167523140
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	194978218	9180	8927	-0.0091	1.02717961663735e-10	167507898	167523140	4.48261492220572e-22	194977713	194978218
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195062793	8	8	0.7561	4.48261492220572e-22	194977713	194978218	5.06317049946699e-21	195062793	195091758
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195065867	195065867	1	0	NA	5.06317049946699e-21	195062793	195091758	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	246794552	19481	18970	-0.0021	NA	NA	NA	1.90301761225750e-44	246769018	246805521
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246862029	26	24	-0.6321	1.9030176122575e-44	246769018	246805521	2.26688833458194e-33	246860551	246863179
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	93	0.033	2.26688833458194e-33	246860551	246863179	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	12791777	4103	4003	-0.0215	NA	NA	NA	1.73437946670707e-06	12790186	12791777
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	12794350	12796449	2	2	-0.8799	1.73437946670707e-06	12790186	12791777	7.48911265417753e-07	12796449	12797806
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	12797806	16887060	948	926	-0.0367	7.48911265417753e-07	12796449	12797806	6.73187882152575e-13	16884629	16887060
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	16889294	16900413	6	6	0.6241	6.73187882152575e-13	16884629	16887060	2.62511734335876e-13	16900413	16901626
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	16901626	20231737	817	798	-0.022	2.62511734335876e-13	16900413	16901626	2.52303584837560e-16	20231737	20231737
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.2555	2.5230358483756e-16	20231737	20231737	7.30467016616232e-14	20236210	20236210
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	33076512	4998	4889	0.0021	7.30467016616232e-14	20236210	20236210	8.22518673646655e-10	33076512	33076512
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.0693	8.22518673646655e-10	33076512	33076512	1.33567647261534e-11	33080437	33080437
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34542224	643	628	-0.0088	1.33567647261534e-11	33080437	33080437	5.54819502638047e-12	34524344	34561038
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34543992	34589997	19	19	0.3579	5.54819502638047e-12	34524344	34561038	3.70818954087858e-10	34571897	34602813
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35377646	305	301	-0.0075	3.70818954087858e-10	34571897	34602813	7.01064184337285e-15	35375407	35377646
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35380378	35384737	4	4	-0.9124	7.01064184337285e-15	35375407	35377646	3.7962959694319e-15	35384737	35386734
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35386734	52600588	6883	6693	-0.0034	3.7962959694319e-15	35384737	35386734	3.776115728211e-08	52588009	52600588
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	3.776115728211e-08	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.6749	NA	NA	NA	5.30433722283544e-08	52635695	52639605
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	89093646	11552	11237	-0.001	5.30433722283544e-08	52635695	52639605	2.52417492933396e-37	89051451	89222963
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89208480	89730278	47	47	-0.4135	2.52417492933396e-37	89051451	89222963	3.37597813955164e-12	89706973	89743142
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89742890	89902365	20	19	-0.9527	3.37597813955164e-12	89706973	89743142	2.93544674906631e-80	89902365	89902365
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	179767214	25926	25307	-0.0053	2.93544674906631e-80	89902365	89902365	7.8579772383456e-10	179767214	179767214
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.8631	7.8579772383456e-10	179767214	179767214	3.47149252672399e-10	179778919	179791128
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	227949124	15995	15601	-0.0024	3.47149252672399e-10	179778919	179791128	5.1511832854938e-34	227949124	227949124
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227964962	7	7	1.0053	5.1511832854938e-34	227949124	227949124	1.73442281487095e-29	227964962	227964962
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227967126	242490167	5468	5361	-0.0038	1.73442281487095e-29	227964962	227964962	9.75865250083689e-16	242477420	242505261
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242492286	242596873	45	44	0.2941	9.7586525008369e-16	242477420	242505261	2.76395325870487e-05	242584505	242632434
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242601501	242689978	27	26	8e-04	2.76395325870487e-05	242584505	242632434	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	8797012	2988	2916	-0.0102	NA	NA	NA	2.21927560367537e-10	8791808	8801504
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8800797	8835272	9	9	0.4757	2.21927560367537e-10	8791808	8801504	1.99181349747491e-09	8825809	8843670
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	8838332	32074432	7799	7590	-0.0085	1.99181349747491e-09	8825809	8843670	1.38789101560618e-18	32074432	32074432
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.4088	1.38789101560618e-18	32074432	32074432	1.39654319721353e-17	32080848	32080848
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5298	-7e-04	1.39654319721353e-17	32080848	32080848	1.29355241519284e-06	47460805	47460892
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	0.8874	1.29355241519284e-06	47460805	47460892	9.8384029259504e-06	47466921	47469018
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	47817133	150	145	0.0544	9.8384029259504e-06	47466921	47469018	2.73445940842455e-05	47797610	47832551
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47820355	47840356	11	11	0.4118	2.73445940842455e-05	47797610	47832551	1.54904836333141e-06	47833545	47846222
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47841094	53001678	2281	2226	0.0352	1.54904836333141e-06	47833545	47846222	8.37007128607485e-15	52999601	53001678
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.787	8.37007128607485e-15	52999601	53001678	1.25536378774003e-13	53011885	53014254
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	164023502	34828	33971	-0.0078	1.25536378774003e-13	53011885	53014254	9.63031968076205e-18	164005577	164036648
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164027724	164105613	20	19	-0.4601	9.63031968076205e-18	164005577	164036648	2.43277812429079e-18	164093750	164115417
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164107951	166512920	587	574	-0.0054	2.43277812429079e-18	164093750	164115417	6.40936880169623e-30	166512920	166512920
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166528663	166559166	6	6	-1.0206	6.40936880169623e-30	166512920	166512920	2.90604292196195e-29	166559166	166559166
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	166566095	190844369	8321	8117	0.0038	2.90604292196195e-29	166559166	166559166	0	190844369	190844369
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190847899	190850562	3	3	-5.8742	0	190844369	190844369	0	190850562	190850562
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190854164	190854164	1	0	NA	0	190850562	190850562	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190856394	192546280	631	615	0.0098	NA	NA	NA	2.52261759273849e-14	192544305	192546280
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.8764	2.52261759273849e-14	192544305	192546280	6.5216632471004e-15	192552734	192552734
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	196835413	1581	1538	-0.0038	6.5216632471004e-15	192552734	192552734	2.54446386399156e-82	196822133	196904349
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	20	-0.9155	2.54446386399156e-82	196822133	196904349	3.59257796453629e-79	196929805	196929826
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	941	0.0356	3.59257796453629e-79	196929805	196929826	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	65688	11	11	0.5973	NA	NA	NA	4.96857687047291e-16	61552	71148
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	71148	9815760	3382	3282	-0.0115	4.96857687047291e-16	61552	71148	0	9815760	9815760
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.9668	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14664	-0.0091	0	9842644	9842644	0	68905670	68905670
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-4.0434	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	88752705	6585	6416	-0.0066	0	69165814	69165814	3.54517398287641e-12	88752705	88752705
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-1.1446	3.54517398287641e-12	88752705	88752705	5.65389322811666e-12	88756721	88756721
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	191153613	30127	29413	-0.0039	5.65389322811666e-12	88756721	88756721	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3878	-0.0281	NA	NA	NA	1.60745166340357e-12	12857302	12857302
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.1923	1.60745166340357e-12	12857302	12857302	1.26823264537541e-12	12873052	12873052
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180344964	49670	48460	-0.004	1.26823264537541e-12	12873052	12873052	1.88036816830269e-10	180194323	180344964
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180346557	180358977	7	7	0.5832	1.88036816830269e-10	180194323	180344964	4.80002914356087e-08	180358977	180365950
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	110	-0.0025	4.80002914356087e-08	180358977	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	37	0.0472	NA	NA	NA	3.02923172364583e-07	183349	202063
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	232366	12	12	0.4892	3.02923172364583e-07	183349	202063	2.67041361649878e-13	230588	237952
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	234115	26811016	9314	9093	-0.0056	2.67041361649878e-13	230588	237952	3.56923767442228e-09	26801068	26811016
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26853170	2	2	-1.0233	3.56923767442228e-09	26801068	26811016	1.21554297506013e-08	26853170	26855591
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26855591	32558677	2309	2256	0.0018	1.21554297506013e-08	26853170	26855591	6.6313840738954e-215	32558677	32558677
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32588005	4	3	-4.0502	6.6313840738954e-215	32558677	32558677	9.62000946915371e-36	32588005	32588005
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32590568	1	0	NA	9.62000946915371e-36	32588005	32588005	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32600962	4	4	-1.3554	NA	NA	NA	2.03708918270967e-06	32600962	32613538
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	35	0.1076	2.03708918270967e-06	32600962	32613538	9.08331291940247e-05	32703109	32718991
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.0472	9.08331291940247e-05	32703109	32718991	3.20081562940858e-06	32728285	32728487
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32738443	5	5	-0.1959	3.20081562940858e-06	32728285	32728487	0.000944926787030242	32734957	32739800
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32739800	32758904	6	6	0.5906	0.000944926787030242	32734957	32739800	1.81398344076885e-07	32745693	32762061
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32760574	35862502	1335	1304	0.0315	1.81398344076885e-07	32745693	32762061	1.17933422370866e-10	35856922	35862502
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35875112	7	7	0.6435	1.17933422370866e-10	35856922	35862502	1.17446655303220e-12	35875112	35880489
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35878656	54035000	6906	6731	-0.0018	1.1744665530322e-12	35875112	35880489	8.69683623396052e-182	54035000	54035000
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.6454	8.69683623396052e-182	54035000	54035000	1.11405238755882e-207	54042734	54042734
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67078860	2773	2705	-0.0023	1.11405238755882e-207	54042734	54042734	7.87146536295507e-15	67078860	67078860
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67086412	67105238	4	4	-0.8613	7.87146536295507e-15	67078860	67078860	2.05476257450698e-14	67105238	67109079
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	74762234	2535	2470	-0.0039	2.05476257450698e-14	67105238	67109079	1.16268842882788e-46	74762234	74762234
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74766480	74773321	5	5	1.3585	1.16268842882788e-46	74762234	74762234	1.44658944197457e-46	74773321	74773321
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	79018959	1115	1089	-0.0025	1.44658944197457e-46	74773321	74773321	1.88794621228337e-17	79011979	79024557
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.5245	1.88794621228337e-17	79011979	79024557	1.99500084076943e-16	79085247	79101978
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6585	-0.0052	1.99500084076943e-16	79085247	79101978	1.00712818944666e-249	103841482	103841482
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.6018	1.00712818944666e-249	103841482	103841482	2.41076622859455e-250	103868154	103868154
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20597	-0.0032	2.41076622859455e-250	103868154	103868154	2.93356977013965e-10	165642393	165643653
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.754	2.93356977013965e-10	165642393	165643653	2.22440399860338e-10	165650610	165653315
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1754	-0.024	2.22440399860338e-10	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	71205381	21549	21004	-0.0035	NA	NA	NA	1.66567737658731e-13	71200243	71206540
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71206540	71231199	14	14	0.4652	1.66567737658731e-13	71200243	71206540	4.49191964026187e-19	71226769	71241031
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71235560	100164752	9499	9273	0.0078	4.49191964026187e-19	71226769	71241031	6.76190631683733e-214	100164752	100164752
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-3.3466	6.76190631683733e-214	100164752	100164752	8.29308297120733e-217	100174991	100174991
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	125831554	11372	11090	-0.0063	8.29308297120733e-217	100174991	100174991	1.74215679590281e-23	125831554	125831554
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.2795	1.74215679590281e-23	125831554	125831554	2.91887547455877e-22	125837524	125837524
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	7170	-0.0014	2.91887547455877e-22	125837524	125837524	3.37310664726237e-15	141406414	141414719
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.495	3.37310664726237e-15	141406414	141414719	9.59526261899865e-16	141435643	141443577
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	115	-0.0069	9.59526261899865e-16	141435643	141443577	2.62918360957075e-279	141690753	141698634
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-4.0743	2.62918360957075e-279	141690753	141698634	0	141712786	141714168
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	0	141712786	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2456	-0.0115	NA	NA	NA	1.28265080693795e-32	147702365	147702365
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.9905	1.28265080693795e-32	147702365	147702365	2.56145553074332e-30	147707161	147707161
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4131	-0.0126	2.56145553074332e-30	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0196	NA	NA	NA	7.13449961475512e-10	581533	581533
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.2051	7.13449961475512e-10	581533	581533	1.54115592283658e-12	588865	588865
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2219	-0.0298	1.54115592283658e-12	588865	588865	4.43718390134601e-21	7156900	7322035
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	8137794	9	9	-0.7412	4.43718390134601e-21	7156900	7322035	3.01374274367156e-21	7790934	8139999
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8139999	25022606	5727	5592	-0.0126	3.01374274367156e-21	7790934	8139999	1.28742053158284e-06	25013753	25022606
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25047250	4	4	-0.64	1.28742053158284e-06	25013753	25022606	0.00148510888282458	25047250	25073050
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25057567	25120552	26	26	-0.0787	0.00148510888282458	25047250	25073050	9.65759607726957e-17	25120552	25120552
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	9.65759607726957e-17	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.6905	NA	NA	NA	4.7275550217548e-27	25125700	25125700
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4787	-0.0092	4.7275550217548e-27	25125700	25125700	6.06984390098916e-175	39345557	39350798
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.7833	6.06984390098916e-175	39345557	39350798	4.53103753883544e-172	39504332	39508035
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2131	-0.0035	4.53103753883544e-172	39504332	39508035	3.21186544096978e-09	51189068	51191560
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.7119	3.21186544096978e-09	51189068	51191560	3.58472392368451e-09	51200291	51204788
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	3.58472392368451e-09	51200291	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	87255865	10503	10215	-0.0065	NA	NA	NA	8.55296096712773e-15	87255865	87255865
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-1.0264	8.55296096712773e-15	87255865	87255865	2.79199561881894e-15	87262662	87262662
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	18276	-0.0079	2.79199561881894e-15	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7636	-0.0097	NA	NA	NA	1.16724314166007e-40	22477358	22477358
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-2.0894	1.16724314166007e-40	22477358	22477358	7.80692626567543e-40	22492603	22492603
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	39146895	4892	4766	-0.0062	7.80692626567543e-40	22492603	22492603	4.8306487942783e-08	39091349	39146895
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43776365	6	6	0.5453	4.8306487942783e-08	39091349	39146895	7.18856422650644e-08	43776365	45359327
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	44199401	70926188	335	330	-0.0027	7.18856422650644e-08	43776365	45359327	2.84061427311948e-129	70926188	70926188
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.7579	2.84061427311948e-129	70926188	70926188	1.14024591909371e-134	70930528	70930528
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	15093	-0.0051	1.14024591909371e-134	70930528	70930528	8.2719276293911e-11	116122595	116124007
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116132839	3	3	-0.9031	8.2719276293911e-11	116122595	116124007	1.94947297792466e-10	116132839	116137111
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	128654320	4687	4555	-0.0114	1.94947297792466e-10	116132839	116137111	9.93576203762116e-11	128644965	128657974
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128656749	128687602	15	15	0.3599	9.93576203762116e-11	128644965	128657974	2.08216562093701e-08	128684270	128709553
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128689234	140145683	4697	4570	0.0225	2.08216562093701e-08	128684270	128709553	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4583	-0.0107	NA	NA	NA	3.92798993299262e-10	13553503	13553503
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.1133	3.92798993299262e-10	13553503	13553503	3.23777219716726e-11	13556315	13556315
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4915	0	3.23777219716726e-11	13556315	13556315	6.90105008972981e-19	27038538	27038538
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.43	6.90105008972981e-19	27038538	27038538	1.12504231365495e-18	27041812	27041812
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1527	0.0124	1.12504231365495e-18	27041812	27041812	5.87695202923618e-13	31284756	31284926
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.9563	5.87695202923618e-13	31284756	31284926	3.67884536005361e-12	31291525	31291525
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	69658582	9768	9548	-0.0077	3.67884536005361e-12	31291525	31291525	0.00511839473355461	69649717	69658582
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69661546	69667989	3	3	-0.5187	0.00511839473355461	69649717	69658582	0.000124050566009754	69667989	69671909
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69669165	70949263	609	597	0.0504	0.000124050566009754	69667989	69671909	0.000270620233060465	70941924	70949263
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70955025	2	2	-0.6068	0.000270620233060465	70941924	70949263	0	70955025	70955025
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70960102	70960187	2	2	-0.9049	0	70955025	70955025	1.15775110705812e-15	70960187	70964344
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	132797428	22193	21692	-0.0076	1.15775110705812e-15	70960187	70964344	3.26578720123878e-16	132797428	132797428
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	1.1202	3.26578720123878e-16	132797428	132797428	1.50331759516474e-08	132801463	132801463
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	921	-0.0043	1.50331759516474e-08	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1727	0.0085	NA	NA	NA	1.57488245819971e-13	4920907	4923300
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.8802	1.57488245819971e-13	4920907	4923300	2.11495899330399e-14	4932214	4937118
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	4934594	1	0	NA	2.11495899330399e-14	4932214	4937118	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4937118	5741031	360	344	-0.0311	NA	NA	NA	3.00392156418616e-32	5738494	5741031
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7662	3.00392156418616e-32	5738494	5741031	1.38642932863676e-39	5765438	5766615
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	14389	-0.0085	1.38642932863676e-39	5765438	5766615	6.79207631829581e-22	55097753	55129329
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55221692	42	40	0.3397	6.79207631829581e-22	55097753	55129329	1.19493221061668e-20	55205278	55231935
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55223056	122040341	23649	23074	-0.0037	1.19493221061668e-20	55205278	55231935	4.532359927138e-143	122036088	122043303
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	122041564	122194298	85	82	0.617	4.532359927138e-143	122036088	122043303	4.14304906465094e-158	122193013	122197455
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	122197455	134450318	4623	4518	-0.029	4.14304906465094e-158	122193013	122197455	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3659	-0.0055	NA	NA	NA	3.20380519001606e-152	9523923	9523923
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-2.6373	3.20380519001606e-152	9523923	9523923	7.39912770567491e-17	9550789	9554149
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9607363	10	9	-0.6304	7.39912770567491e-17	9550789	9554149	1.16227355936319e-15	9604633	9610054
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11104973	568	551	-0.0128	1.16227355936319e-15	9604633	9610054	8.55700679454662e-10	11104085	11109483
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	-0.7425	8.55700679454662e-10	11104085	11109483	4.99381459598417e-07	11116883	11116883
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-3.4465	4.99381459598417e-07	11116883	11116883	5.31410305969528e-126	11140421	11140421
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	68	-0.0324	5.31410305969528e-126	11140421	11140421	2.0333360745564e-34	11395862	11395862
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-1.2764	2.0333360745564e-34	11395862	11395862	5.00338082895207e-39	11435643	11435643
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	41303729	9251	9013	-0.0043	5.00338082895207e-39	11435643	11435643	3.81465028633744e-09	41303729	41303729
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	2	-1.0061	3.81465028633744e-09	41303729	41303729	1.41044215821547e-09	41312478	41312478
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	46992235	1817	1776	-0.003	1.41044215821547e-09	41312478	41312478	1.37933044582860e-31	46992235	46992235
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.8251	1.3793304458286e-31	46992235	46992235	7.53459185354176e-30	46996769	46996769
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	130694393	29030	28355	0.0045	7.53459185354176e-30	46996769	46996769	4.27920483146215e-36	130694393	130694393
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	-2.0001	4.27920483146215e-36	130694393	130694393	2.48543812618707e-32	130701040	130701040
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	628	0.0175	2.48543812618707e-32	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7157	-0.0029	NA	NA	NA	1.27211204884242e-93	37953582	37953582
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.1382	1.27211204884242e-93	37953582	37953582	4.09395193928764e-94	37957844	37957844
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49958475	4878	4754	-0.0038	4.09395193928764e-94	37957844	37957844	3.29445059842772e-137	49958475	49958475
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	3.29445059842772e-137	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.7928	NA	NA	NA	5.98987427185632e-147	49971732	49971732
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	89659397	10072	9840	-0.006	5.98987427185632e-147	49971732	49971732	6.55727679794072e-28	89659397	89659397
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.6794	6.55727679794072e-28	89659397	89659397	1.01342155887749e-25	89662326	89662326
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9138	-0.0128	1.01342155887749e-25	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19295733	12	11	-0.3031	NA	NA	NA	2.10607161466797e-06	19271102	19323579
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19297767	19490630	46	44	-0.7406	2.10607161466797e-06	19271102	19323579	1.23660953815522e-91	19490630	19492531
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19492531	20034343	265	261	0.0104	1.23660953815522e-91	19490630	19492531	1.05373876400316e-06	20027368	20035793
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20035793	20048143	7	7	0.4893	1.05373876400316e-06	20027368	20035793	3.59479181553836e-10	20046996	20052836
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20049907	34674458	5420	5286	0.0057	3.59479181553836e-10	20046996	20052836	2.30735736086474e-16	34674458	34674458
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1273	2.30735736086474e-16	34674458	34674458	1.65723248248426e-17	34683810	34683810
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	73071404	13667	13316	0.0034	1.65723248248426e-17	34683810	34683810	9.19943758239292e-117	73071404	73071404
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	9.19943758239292e-117	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-2.0124	NA	NA	NA	1.24673578346743e-86	73092112	73092112
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73307681	94	93	0.0221	1.24673578346743e-86	73092112	73092112	3.72517602712188e-08	73306411	73307681
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73309616	73315317	4	4	-0.6875	3.72517602712188e-08	73306411	73307681	2.5833180491924e-09	73315317	73317195
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	105597555	12117	11815	-0.002	2.5833180491924e-09	73315317	73317195	6.76484477204107e-11	105590641	105602602
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105681007	14	14	-0.4341	6.76484477204107e-11	105590641	105602602	6.91348502249244e-08	105673157	105736164
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105850033	46	42	-0.0397	6.91348502249244e-08	105673157	105736164	2.4263760554291e-14	105848335	105856972
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881677	6	6	-0.9014	2.4263760554291e-14	105848335	105856972	3.49072669065315e-14	105875924	105881893
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881893	106235367	133	129	-0.029	3.49072669065315e-14	105875924	105881893	9.12821595253345e-07	106223137	106242757
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106236795	106255190	9	9	-0.5446	9.12821595253345e-07	106223137	106242757	6.67232184621133e-13	106251081	106255190
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	35	0.1199	6.67232184621133e-13	106251081	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19109124	31	31	-0.0454	NA	NA	NA	1.51114529826928e-05	18867285	19174556
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	19845942	79	77	0.195	1.51114529826928e-05	18867285	19174556	2.11801426394106e-20	19845942	19845942
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-1.1274	2.11801426394106e-20	19845942	19845942	1.77943019961389e-16	19882711	19882711
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	98232932	30295	29536	-0.0023	1.77943019961389e-16	19882711	19882711	1.70860495417539e-11	98228743	98232932
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-0.9539	1.70860495417539e-11	98228743	98232932	3.54829123456478e-11	98239454	98243586
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99234354	445	433	-0.031	3.54829123456478e-11	98239454	98243586	4.06946799096448e-05	99228966	99236636
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99236636	99244444	5	5	-0.5225	4.06946799096448e-05	99228966	99236636	3.61800353556253e-06	99242967	99250493
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99246240	99632987	187	180	-0.0342	3.61800353556253e-06	99242967	99250493	2.65784943409048e-12	99632987	99632987
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.0402	2.65784943409048e-12	99632987	99632987	6.58506538423154e-09	99635701	99636724
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	263	-0.0201	6.58506538423154e-09	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10313	0.009	NA	NA	NA	6.33974709389099e-14	31842335	32513457
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33348511	21	21	0.4119	6.33974709389099e-14	31842335	32513457	0.00110043008831350	32543017	33505210
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33370459	33647856	25	25	0.6268	0.0011004300883135	32543017	33505210	3.92363890408641e-47	33559207	33830585
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	54898052	3228	3149	-0.012	3.92363890408641e-47	33559207	33830585	2.72692477757587e-07	54895788	54898052
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54899690	54903259	3	3	-0.7582	2.72692477757587e-07	54895788	54898052	8.76151381869436e-08	54903259	54904592
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54904592	57203733	1059	1032	0.0208	8.76151381869436e-08	54903259	54904592	1.50302307985428e-24	57203733	57203733
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.6864	1.50302307985428e-24	57203733	57203733	1.13375497383546e-24	57206772	57206772
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	87165574	10085	9839	-5e-04	1.13375497383546e-24	57206772	57206772	2.22565224532962e-14	87165574	87165574
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87167051	87169085	2	2	-1.0372	2.22565224532962e-14	87165574	87165574	2.624059697294e-08	87169085	87169085
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87170962	88690571	659	640	0.0389	2.624059697294e-08	87169085	87169085	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	407	0.0355	NA	NA	NA	5.27536857287722e-09	1028979	1028979
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.1931	5.27536857287722e-09	1028979	1028979	4.00226087595333e-10	1030766	1030766
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1903358	434	423	0.0487	4.00226087595333e-10	1030766	1030766	1.13826941630772e-06	1901302	1903358
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	0.7126	1.13826941630772e-06	1901302	1903358	7.42545044686179e-08	1906391	1909371
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	32828797	11564	11265	0.0134	7.42545044686179e-08	1906391	1909371	6.00561035310894e-221	32828797	32828797
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.0009	6.00561035310894e-221	32828797	32828797	4.31854912041528e-209	32832642	32832642
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1419	0.035	4.31854912041528e-209	32832642	32832642	1.99423885063057e-295	36673853	36673853
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.8591	1.99423885063057e-295	36673853	36673853	1.05633889773645e-300	36683509	36683509
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41566540	2033	1982	0.0411	1.05633889773645e-300	36683509	36683509	1.76778058939218e-31	41558893	41570512
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41700762	41	41	-0.3971	1.76778058939218e-31	41558893	41570512	1.04363644994815e-32	41652861	41706870
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41702238	63867536	8112	7895	0.0197	1.04363644994815e-32	41652861	41706870	0.000480100410219223	63853338	63872699
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	63870095	63885083	7	7	-0.3591	0.000480100410219223	63853338	63872699	0.00121959710890491	63878588	63905239
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	63887408	68326225	1298	1256	-0.0233	0.00121959710890491	63878588	63905239	0	68326225	68326225
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68331629	3	3	-5.5958	0	68326225	68326225	0	68331629	68331629
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	78653545	4264	4155	0.0361	0	68331629	68331629	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22396	-0.0117	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	475	0.0591	NA	NA	NA	3.58044996122095e-15	1398325	1398325
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.549	3.58044996122095e-15	1398325	1398325	3.39842816694479e-15	1400840	1400840
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	6325993	2337	2278	0.0485	3.39842816694479e-15	1400840	1400840	2.34533049647811e-06	6320033	6329388
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	6328061	6338786	7	7	0.5789	2.34533049647811e-06	6320033	6329388	3.34130997980947e-07	6336462	6344339
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	6340588	11448975	2334	2259	0.0333	3.34130997980947e-07	6336462	6344339	4.21096638379868e-08	11448975	11448975
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.111	4.21096638379868e-08	11448975	11448975	8.78137126633703e-09	11452390	11452390
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	56823430	14699	14302	0.0208	8.78137126633703e-09	11452390	11452390	1.07338380954591e-18	56822197	56823430
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.7563	1.07338380954591e-18	56822197	56823430	5.23357992505978e-18	56840346	56842447
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58298893	626	610	-0.0197	5.23357992505978e-18	56840346	56842447	2.41322858438457e-17	58297157	58298893
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58300698	58321026	11	10	0.6252	2.41322858438457e-17	58297157	58298893	1.47098042181768e-14	58321026	58324486
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58322574	59246409	448	440	0.0076	1.47098042181768e-14	58321026	58324486	2.60295373646591e-06	59244965	59246409
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.7444	2.60295373646591e-06	59244965	59246409	5.79004584704692e-08	59251831	59253728
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414898	86	85	0.0855	5.79004584704692e-08	59251831	59253728	1.59293096298664e-18	59414645	59422642
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.66	1.59293096298664e-18	59414645	59422642	3.89426975088420e-18	59433190	59440262
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1930	0.0148	3.8942697508842e-18	59433190	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	572	-0.0172	NA	NA	NA	2.58089991826253e-24	1499421	1511632
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	0.7587	2.58089991826253e-24	1499421	1511632	5.10707336055729e-23	1528899	1544485
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	1532433	1	0	NA	5.10707336055729e-23	1528899	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20446	-0.007	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13109	-0.0034	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2927	0.0112	NA	NA	NA	1.05856632375057e-14	22618049	22679305
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	0.4586	1.05856632375057e-14	22618049	22679305	2.95674007707718e-17	22720195	22738466
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6385	0.0047	2.95674007707718e-17	22720195	22738466	4.29855136353104e-91	35472378	35472378
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.2375	4.29855136353104e-91	35472378	35472378	6.20132595672198e-83	35476942	35476942
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	48448446	6501	6353	0.016	6.20132595672198e-83	35476942	35476942	2.37302760716729e-21	48444553	48459461
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48466679	7	7	-0.4604	2.37302760716729e-21	48444553	48459461	1.16183264328336e-09	48452959	48477052
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48468207	49571068	495	476	0.036	1.16183264328336e-09	48452959	48477052	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	763	0.0471	NA	NA	NA	3.86273609450559e-10	1427338	1431240
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.7726	3.86273609450559e-10	1427338	1431240	2.72804522793453e-09	1432891	1434970
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1894973	349	344	0.0125	2.72804522793453e-09	1432891	1434970	3.17292609833544e-08	1892736	1894973
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1898078	2	2	-1.0172	3.17292609833544e-08	1892736	1894973	5.64787126272976e-09	1898078	1901223
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1901223	2671030	623	608	0.0465	5.64787126272976e-09	1898078	1901223	3.51992713460096e-10	2667268	2686115
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672401	2708291	28	27	-0.2701	3.51992713460096e-10	2667268	2686115	4.95122259173179e-112	2708291	2711273
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8449254	1789	1752	0.8648	4.95122259173179e-112	2708291	2711273	1.89373928790199e-07	8437023	8459880
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8450789	8475091	11	10	0.483	1.89373928790199e-07	8437023	8459880	4.02142039195192e-07	8459880	8481902
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8477126	17683695	3932	3848	0.9146	4.02142039195192e-07	8459880	8481902	4.80039327824899e-10	17678918	17687952
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	17687952	17709203	12	12	0.4525	4.80039327824899e-10	17678918	17687952	3.6959706081514e-13	17708929	17719872
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	17715497	154582414	39390	38409	0.9088	3.6959706081514e-13	17708929	17719872	0	154578922	154586690
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	0.0279	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2875705	77	72	-3.9024	NA	NA	NA	0.000203961806630068	2853217	2878705
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2876787	2900650	16	15	-5.031	0.000203961806630068	2853217	2878705	0.000239629380083274	2898453	2922934
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2901890	4174561	36	35	-3.8704	0.000239629380083274	2898453	2922934	1.70030305264139e-09	3777766	4421500
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	6652845	13	13	-1.746	1.70030305264139e-09	3777766	4421500	1.95700942352225e-06	5422507	6728131
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6688691	7259689	227	220	-3.6984	1.95700942352225e-06	5422507	6728131	2.61516485878742e-10	7249762	7264547
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	22	-1.7798	2.61516485878742e-10	7249762	7264547	1.77727086574324e-16	7296153	7311131
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	10515697	574	557	-3.8324	1.77727086574324e-16	7296153	7311131	6.50929777230433e-25	10512616	10515697
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10646662	13	12	-0.4928	6.50929777230433e-25	10512616	10515697	7.76887453299761e-07	10646662	12452734
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10655750	12682301	71	70	-2.9093	7.76887453299761e-07	10646662	12452734	0.000657616384313584	12618263	12687167
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	14	-4.6049	0.000657616384313584	12618263	12687167	0.000173377231693934	12772155	12852769
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	12994193	64	61	-3.0328	0.000173377231693934	12772155	12852769	0.00031223898190788	12960717	12996552
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12996552	13040293	21	20	-1.7456	0.00031223898190788	12960717	12996552	1.79130533409813e-06	13035511	13059372
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13104920	26	24	-3.0613	1.79130533409813e-06	13035511	13059372	8.23477665075284e-06	13089124	13109337
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13129843	10	10	-1.4238	8.23477665075284e-06	13089124	13109337	7.2889986992972e-06	13128515	13146483
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13264329	46	46	-3.3792	7.2889986992972e-06	13128515	13146483	0.0172627392244504	13150942	13375346
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13271228	13649497	162	159	-3.9625	0.0172627392244504	13150942	13375346	0.000267748529357304	13597813	13649497
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13699223	7	5	-2.068	0.000267748529357304	13597813	13649497	7.96255266036211e-06	13699223	13705594
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14342834	193	183	-4.0894	7.96255266036211e-06	13699223	13705594	2.59450191908815e-06	14203911	14390028
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	94	-3.4716	2.59450191908815e-06	14203911	14390028	2.78915602138238e-09	14506319	14530134
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	11	-1.4469	2.78915602138238e-09	14506319	14530134	3.70670990823555e-09	14545228	14553021
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	15189646	155	152	-3.7996	3.70670990823555e-09	14545228	14553021	0.000460700495106176	15152354	15205160
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15191780	15241527	21	20	-2.5916	0.000460700495106176	15152354	15205160	2.00949164961730e-06	15221212	15252823
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15433122	128	123	-3.9282	2.0094916496173e-06	15221212	15252823	4.18413004939247e-07	15429742	15433122
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.614	4.18413004939247e-07	15429742	15433122	2.67800961167458e-05	15447091	15453525
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15915466	120	115	-3.8691	2.67800961167458e-05	15447091	15453525	0.000993280519748663	15695261	15986595
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16088722	70	68	-3.1604	0.000993280519748663	15695261	15986595	4.8023722154666e-09	16062175	16154076
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16090556	22056953	1028	993	-3.9945	4.8023722154666e-09	16062175	16154076	1.91226616241771e-07	22044579	22058759
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22058759	22177335	11	10	-2.0833	1.91226616241771e-07	22044579	22058759	7.5092704059338e-14	22176501	22181855
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	84	-4.386	7.5092704059338e-14	22176501	22181855	3.68359813018644e-83	22926726	22930737
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.1409	3.68359813018644e-83	22926726	22930737	4.04647268585775e-05	26945084	27003308
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.4109	4.04647268585775e-05	26945084	27003308	6.24482190849678e-08	27007874	27064654
MSK_252152914553_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	32	-0.6461	6.24482190849678e-08	27007874	27064654	NA	NA	NA
