Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	86800503	32362	31543	5e-04	NA	NA	NA	5.18707406266474e-10	86798583	86800503
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86801675	86806772	5	5	-0.9871	5.18707406266474e-10	86798583	86800503	5.97169338559022e-11	86806772	86811798
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86809511	86809511	1	0	NA	5.97169338559022e-11	86806772	86811798	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86811798	116029725	9468	9229	0.0109	NA	NA	NA	1.18816111619419e-120	116029725	116029725
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-5.0757	1.18816111619419e-120	116029725	116029725	9.530585750417e-123	116033402	116033402
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	143700072	1691	1646	-0.0192	9.530585750417e-123	116033402	116033402	1.589951239493e-21	143651396	143719710
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	144003068	77	72	-0.3869	1.589951239493e-21	143651396	143719710	1.23176746316763e-19	143829340	144109866
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	144093719	1	0	NA	1.23176746316763e-19	143829340	144109866	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	147346399	572	556	-0.0106	NA	NA	NA	2.07407743236333e-08	147203277	147369818
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147352661	147510532	27	27	0.3686	2.07407743236333e-08	147203277	147369818	1.88802440172555e-07	147490553	148125527
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	157133150	4030	3916	0.0089	1.88802440172555e-07	147490553	148125527	3.13406805620001e-74	157133150	157133150
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.0154	3.13406805620001e-74	157133150	157133150	5.66611503029425e-79	157136342	157136342
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11048	-0.0075	5.66611503029425e-79	157136342	157136342	3.31738754476143e-11	185979586	185979586
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.5606	3.31738754476143e-11	185979586	185979586	1.12806051805925e-11	185988138	185988138
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	195009358	1970	1926	0.0345	1.12806051805925e-11	185988138	185988138	6.25689470137378e-07	194972886	195022854
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195097118	11	11	-0.4977	6.25689470137378e-07	194972886	195022854	1.88844497740748e-05	195062793	195109762
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	227875096	12118	11785	-0.0046	1.88844497740748e-05	195062793	195109762	6.06030953073536e-201	227875096	227875096
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-4.6611	6.06030953073536e-201	227875096	227875096	1.48463149090369e-208	227882805	227882805
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	244434655	6412	6225	-7e-04	1.48463149090369e-208	227882805	227882805	1.99497405866517e-21	244432228	244436503
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244436503	244453610	10	10	-0.9573	1.99497405866517e-21	244432228	244436503	3.28944373741769e-18	244451893	244457011
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244455791	247186514	1058	1028	0.017	3.28944373741769e-18	244451893	244457011	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	15941346	4817	4687	-0.0201	NA	NA	NA	2.00251644944268e-12	15938055	15941346
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15942616	15952235	7	7	-0.8839	2.00251644944268e-12	15938055	15941346	7.45385811807646e-12	15952235	15971631
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15954717	15954717	1	0	NA	7.45385811807646e-12	15952235	15971631	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15969580	37787637	8078	7852	-0.0059	NA	NA	NA	1.13269370206233e-26	37781427	37803744
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37789939	37858379	29	29	-0.6454	1.13269370206233e-26	37781427	37803744	6.50352640050534e-27	37847519	37862351
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	41091579	1483	1454	0.0112	6.50352640050534e-27	37847519	37862351	2.95183598948224e-08	41087172	41092989
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-0.8655	2.95183598948224e-08	41087172	41092989	2.88753753874111e-08	41100433	41108548
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	42948369	638	614	0.0022	2.88753753874111e-08	41100433	41108548	2.66934221933574e-08	42945507	42948369
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42951427	42976594	3	3	1.122	2.66934221933574e-08	42945507	42948369	5.15620964498982e-08	42976594	42981601
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42981601	197702605	46385	45147	0.0057	5.15620964498982e-08	42976594	42981601	2.71676141216611e-17	197696663	197702605
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197705422	197726367	11	11	-0.8201	2.71676141216611e-17	197696663	197702605	5.95808838279606e-21	197726367	197727619
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197727619	198301821	250	245	0.0418	5.95808838279606e-21	197726367	197727619	4.88748952236354e-12	198300141	198301821
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198307946	198313546	4	4	-1.0572	4.88748952236354e-12	198300141	198301821	2.56430692457142e-14	198313546	198316089
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	198316089	242689978	16116	15638	-0.0025	2.56430692457142e-14	198313546	198316089	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10504	-0.0053	NA	NA	NA	2.29683448653948e-15	32074432	32074432
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.783	2.29683448653948e-15	32074432	32074432	2.29939152705267e-14	32080848	32080848
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	85844787	18915	18439	-0.0024	2.29939152705267e-14	32080848	32080848	2.29686692063695e-05	85837376	85854368
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85846763	85864354	11	9	-0.5389	2.29686692063695e-05	85837376	85854368	8.2030683867877e-07	85853084	85870099
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85865803	89475107	917	888	0.0349	8.2030683867877e-07	85853084	85870099	2.37791175242174e-23	89473678	89475107
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89499433	12	12	-0.8605	2.37791175242174e-23	89473678	89475107	1.76607551142653e-20	89499433	89500935
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89500935	163992903	22835	22218	0.0029	1.76607551142653e-20	89499433	89500935	9.29278758359556e-232	163992903	163992903
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-5.6945	9.29278758359556e-232	163992903	163992903	1.2927119561167e-49	164005577	164005577
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-0.344	1.2927119561167e-49	164005577	164005577	3.11951685467852e-21	164027724	164027724
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	18	-4.693	3.11951685467852e-21	164027724	164027724	0	164107951	164107951
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196822133	11132	10843	0.0079	0	164107951	164107951	5.12951339715866e-20	196809098	196911055
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	29	-0.5314	5.12951339715866e-20	196809098	196911055	1.4204506657962e-17	196943380	196969782
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	934	0.0139	1.4204506657962e-17	196943380	196969782	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	20976426	6538	6353	-0.0089	NA	NA	NA	2.12832948092321e-09	20972511	20976426
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20978464	20988104	5	5	-0.9306	2.12832948092321e-09	20972511	20976426	7.08307683267086e-10	20988104	20989307
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20989307	104410204	23794	23182	0.0129	7.08307683267086e-10	20988104	20989307	4.55059765557457e-20	104402565	104422011
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	104422011	104466830	8	8	-1.0265	4.55059765557457e-20	104402565	104422011	1.35337146105772e-20	104462218	104470237
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	104470237	173660684	19490	18981	0.0101	1.35337146105772e-20	104462218	104470237	5.3455077637315e-12	173660684	173660684
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.6155	5.3455077637315e-12	173660684	173660684	1.40905628379250e-12	173666072	173666072
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3668	0.0149	1.4090562837925e-12	173666072	173666072	4.00811587532896e-51	186676034	186676034
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.1865	4.00811587532896e-51	186676034	186676034	3.5494545448301e-54	186680176	186680176
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	299	-0.0105	3.5494545448301e-54	186680176	186680176	5.71591384540011e-06	187327270	187330240
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	0.7553	5.71591384540011e-06	187327270	187330240	1.68620694055716e-06	187338465	187346097
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	188079198	298	288	-0.0112	1.68620694055716e-06	187338465	187346097	1.13259163774149e-08	188076938	188079198
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188081084	188085059	3	3	-1.0333	1.13259163774149e-08	188076938	188079198	1.60661924633731e-07	188085059	188089090
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188089090	191153613	938	921	-0.002	1.60661924633731e-07	188085059	188089090	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	218	-0.0354	NA	NA	NA	2.60628393056027e-08	729262	737829
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.8197	2.60628393056027e-08	729262	737829	1.09165616659285e-08	829954	873365
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	150171154	43625	42463	0.0034	1.09165616659285e-08	829954	873365	1.26684477283901e-11	150166447	150185190
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150181399	150202601	8	8	-0.8018	1.26684477283901e-11	150166447	150185190	3.37414883163251e-11	150199780	150207307
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180342860	9785	9530	-0.009	3.37414883163251e-11	150199780	150207307	3.17288735274031e-08	180192214	180348365
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6781	3.17288735274031e-08	180192214	180348365	7.6588390442444e-06	180355807	180365977
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	106	-0.0464	7.6588390442444e-06	180355807	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	18371831	6538	6365	-0.0026	NA	NA	NA	3.61527403624543e-08	18368026	18371831
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.0798	3.61527403624543e-08	18368026	18371831	9.52148521327372e-08	18378787	18380299
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	32548736	5135	5007	0.0081	9.52148521327372e-08	18378787	18380299	2.16189943351498e-121	32548736	32593151
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32650672	20	18	-1.7224	2.16189943351498e-121	32548736	32593151	2.40782848549178e-07	32605300	32650672
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32653710	32713363	26	26	-0.1121	2.40782848549178e-07	32605300	32650672	0.000580487209587289	32703109	32732764
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32756637	18	18	-0.6127	0.000580487209587289	32703109	32732764	3.61966080633063e-16	32736223	32760574
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32758904	103841482	21459	20866	0.0087	3.61966080633063e-16	32736223	32760574	5.34158980502864e-193	103841482	103841482
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.4318	5.34158980502864e-193	103841482	103841482	3.41448416243529e-195	103868154	103868154
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	152087982	16522	16114	0.0104	3.41448416243529e-195	103868154	103868154	2.71338324290716e-09	152085900	152087982
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152091142	152100384	5	4	-0.9994	2.71338324290716e-09	152085900	152087982	1.92444481046772e-08	152100384	152102362
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152102362	170753106	6387	6197	-0.0192	1.92444481046772e-08	152100384	152102362	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	147702365	52455	51047	0.0065	NA	NA	NA	8.7535518706862e-39	147702365	147702365
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.8835	8.7535518706862e-39	147702365	147702365	3.1957583981508e-34	147707161	147707161
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4131	-0.0326	3.1957583981508e-34	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0011	NA	NA	NA	1.07037920497064e-53	581533	581533
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.4719	1.07037920497064e-53	581533	581533	1.89816207207597e-56	588865	588865
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7804	-0.0075	1.89816207207597e-56	588865	588865	2.4344871957452e-10	25120552	25120552
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	2.4344871957452e-10	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.5144	NA	NA	NA	2.03465530313482e-10	25125700	25125700
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	63377340	10732	10422	8e-04	2.03465530313482e-10	25125700	25125700	1.31546356406761e-13	63376172	63377340
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	63379224	63386160	5	5	-1.0849	1.31546356406761e-13	63376172	63377340	1.48701866941844e-15	63386160	63388204
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	63388204	146264846	25667	24992	0.0069	1.48701866941844e-15	63386160	63388204	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	578654	184	182	0.0255	NA	NA	NA	4.39370288277865e-17	577359	578654
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	580722	598488	9	9	-0.8951	4.39370288277865e-17	577359	578654	2.12005868399216e-17	598488	600119
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	600119	70926188	12879	12525	0.0012	2.12005868399216e-17	598488	600119	4.44138285917878e-93	70926188	70926188
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.3183	4.44138285917878e-93	70926188	70926188	1.99770735249310e-86	70930528	70930528
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	130451027	21020	20470	-0.0129	1.9977073524931e-86	70930528	70930528	9.76361670021994e-09	130443672	130452519
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130452519	130464445	7	7	0.7518	9.76361670021994e-09	130443672	130452519	6.92943020999145e-08	130461269	130467487
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130465664	137352394	2738	2663	-0.0156	6.92943020999145e-08	130461269	130467487	1.74916734999298e-29	137352394	137352394
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.6914	1.74916734999298e-29	137352394	137352394	2.11778079496177e-26	137356880	137356880
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	137359947	1	0	NA	2.11778079496177e-26	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137361870	140145683	1102	1065	-0.0241	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23914	-0.0038	NA	NA	NA	8.1791253357552e-68	77917893	77917893
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.8112	8.1791253357552e-68	77917893	77917893	2.69780714873498e-65	77928669	77928669
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	122758447	15695	15265	-0.0055	2.69780714873498e-65	77928669	77928669	1.12713772152544e-07	122751618	122758447
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122760448	122774523	5	5	-0.8688	1.12713772152544e-07	122751618	122758447	5.10204767668385e-07	122774523	122779767
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122777587	135285645	4514	4405	-0.0457	5.10204767668385e-07	122774523	122779767	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	7758275	3015	2932	-0.0137	NA	NA	NA	2.32249905794138e-07	7749512	7771593
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7797993	10	10	-0.6262	2.32249905794138e-07	7749512	7771593	2.02003628287077e-08	7783344	7807253
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	18896166	4347	4232	-0.0028	2.02003628287077e-08	7783344	7807253	4.7836225809552e-07	18888184	18906505
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18932031	8	8	-0.6439	4.7836225809552e-07	18888184	18906505	4.66435866106063e-07	18929375	18940966
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18933855	55123719	9526	9276	-0.0032	4.66435866106063e-07	18929375	18940966	4.34816898955894e-19	55097753	55127355
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55207305	37	37	0.475	4.34816898955894e-19	55097753	55127355	2.44871639764144e-17	55202450	55225136
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	55209626	1	0	NA	2.44871639764144e-17	55202450	55225136	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4524	0.0041	NA	NA	NA	1.29060252834663e-27	66463477	66463477
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.5292	1.29060252834663e-27	66463477	66463477	9.8608292219674e-30	66469412	66469412
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23109	-0.009	9.8608292219674e-30	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3647	-0.0098	NA	NA	NA	5.65324543462146e-31	9523923	9531133
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9582696	10	9	1.235	5.65324543462146e-31	9523923	9531133	1.31550222927450e-28	9563866	9589725
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9589725	11116883	577	555	-0.0072	1.3155022292745e-28	9563866	9589725	3.63311109896787e-15	11112600	11116883
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.0007	3.63311109896787e-15	11112600	11116883	2.57396648082352e-15	11140421	11143592
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	121200074	36848	35924	0.0091	2.57396648082352e-15	11140421	11143592	1.95911364674454e-17	121197807	121200074
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121201230	121215301	7	7	-1.0448	1.95911364674454e-17	121197807	121200074	3.79842080494352e-16	121215301	121217263
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121217263	132289090	3970	3858	-0.0231	3.79842080494352e-16	121215301	121217263	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	35375198	6402	6231	-0.0046	NA	NA	NA	1.28114213141647e-13	35373043	35375198
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	35376634	35385781	6	5	-1.1099	1.28114213141647e-13	35373043	35375198	6.98683326394864e-15	35385781	35387380
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	35387380	37953582	930	909	0.02	6.98683326394864e-15	35385781	35387380	2.31287824804773e-34	37953582	37953582
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.71	2.31287824804773e-34	37953582	37953582	8.06012061247854e-36	37957844	37957844
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	51296396	5468	5316	0.0072	8.06012061247854e-36	37957844	37957844	2.60463110801796e-11	51294959	51296396
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.256	2.60463110801796e-11	51294959	51296396	4.76575790197238e-11	51300398	51301682
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	71375082	4852	4708	0.0244	4.76575790197238e-11	51300398	51301682	8.54522704682244e-26	71375082	71375082
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.3433	8.54522704682244e-26	71375082	71375082	7.78073703490102e-27	71377671	71377671
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4496	0.0172	7.78073703490102e-27	71377671	71377671	2.06100809572766e-08	89657473	89659397
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.365	2.06100809572766e-08	89657473	89659397	2.48057401969308e-08	89662326	89663261
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9123	-0.0081	2.48057401969308e-08	89662326	89663261	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.6905	NA	NA	NA	6.88946580851803e-69	19489920	19538610
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	19497023	1	0	NA	6.88946580851803e-69	19489920	19538610	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19535787	73075500	19361	18887	0.0117	NA	NA	NA	4.65404835676766e-44	73075500	73075500
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	-1.9209	4.65404835676766e-44	73075500	73075500	1.11634548119032e-37	73092112	73092112
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	74152538	524	508	0.0248	1.11634548119032e-37	73092112	73092112	3.59345320336277e-09	74150749	74152538
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74154117	74155334	2	2	-1.4935	3.59345320336277e-09	74150749	74152538	4.35731873685548e-09	74155334	74155334
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74157425	106221696	11882	11567	-0.0122	4.35731873685548e-09	74155334	74155334	9.3756100954763e-09	106209063	106231012
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106280415	22	22	0.427	9.3756100954763e-09	106209063	106231012	0.000204386738297792	106256498	106301621
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106281746	106358491	28	27	0.049	0.000204386738297792	106256498	106301621	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1118	NA	NA	NA	9.11151197122753e-12	18452491	18692865
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19421704	89	88	-1.1145	9.11151197122753e-12	18452491	18692865	2.13951512115134e-07	19412049	19421704
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19424067	19537035	5	5	-2.0876	2.13951512115134e-07	19412049	19421704	2.1266356785807e-17	19537035	19537035
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	57	-0.7332	2.1266356785807e-17	19537035	19537035	4.65588582748801e-63	20060061	20310916
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	32456500	3671	3566	-0.0243	4.65588582748801e-63	20060061	20310916	2.61639987781376e-15	32450056	32520164
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-0.5563	2.61639987781376e-15	32450056	32520164	1.39927581630282e-16	32580871	32675062
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.39927581630282e-16	32580871	32675062	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	74669752	17858	17386	-0.0018	NA	NA	NA	1.89624055992947e-08	74665386	74669752
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74671626	1	0	NA	1.89624055992947e-08	74665386	74669752	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74678353	74680439	3	3	1.1674	NA	NA	NA	6.8486883885522e-08	74680439	74696127
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	163	0.0465	6.8486883885522e-08	74680439	74696127	8.15765072945616e-15	75115806	75115806
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.9149	8.15765072945616e-15	75115806	75115806	9.867815298233e-17	75119713	75119713
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9157	-0.0181	9.867815298233e-17	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34325501	10708	10442	-0.0023	NA	NA	NA	3.99315699472465e-17	34280904	34340574
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34329518	34602318	51	49	0.4073	3.99315699472465e-17	34280904	34340574	2.50258409617150e-18	34574587	34640193
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	68693086	7540	7344	-0.002	2.5025840961715e-18	34574587	34640193	1.56810014524651e-20	68693014	68710277
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.9568	1.56810014524651e-20	68693014	68710277	6.58192044067221e-20	68751390	68838384
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1405	-0.0256	6.58192044067221e-20	68751390	68838384	1.30296162544912e-08	72914152	72918129
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.7676	1.30296162544912e-08	72914152	72918129	9.4870593741867e-09	72964783	73025340
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	733	0.0311	9.4870593741867e-09	72964783	73025340	7.5879379602533e-06	75092501	75093957
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.0348	7.5879379602533e-06	75092501	75093957	5.2912307895315e-08	75100865	75102639
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	595	-0.0248	5.2912307895315e-08	75100865	75102639	9.12131939288109e-17	76923844	76925748
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.9074	9.12131939288109e-17	76923844	76925748	1.14328729237754e-13	76940218	76944661
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4383	-0.0328	1.14328729237754e-13	76940218	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	411	0.0112	NA	NA	NA	4.55897468439173e-09	1028979	1028979
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.4399	4.55897468439173e-09	1028979	1028979	1.85447831146118e-08	1030766	1030766
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	15727076	5883	5728	0.0048	1.85447831146118e-08	1030766	1030766	1.51961192033736e-140	15727076	15727076
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-5.6444	1.51961192033736e-140	15727076	15727076	4.03359981140184e-140	15733964	15733964
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	19438939	1317	1284	-0.0026	4.03359981140184e-140	15733964	15733964	5.89727695114707e-13	19433346	19446176
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19442291	19478144	11	11	-0.7506	5.89727695114707e-13	19433346	19446176	2.2889505458394e-13	19473422	19486672
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19486276	36634734	6224	6056	0.0055	2.2889505458394e-13	19473422	19486672	2.17236466902472e-15	36633313	36634734
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36637908	36644182	5	5	-1.1931	2.17236466902472e-15	36633313	36634734	7.52175841402066e-13	36644182	36644182
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36649076	36672710	9	9	-0.2529	7.52175841402066e-13	36644182	36644182	5.41375980040815e-20	36672710	36672710
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.8954	5.41375980040815e-20	36672710	36672710	1.08122343073536e-11	36684619	36686013
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1981	0.018	1.08122343073536e-11	36684619	36686013	1.44584295447979e-18	41552048	41574775
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	51	-0.3931	1.44584295447979e-18	41552048	41574775	5.82380812966323e-17	41706870	42165272
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	78653545	13674	13313	0.0054	5.82380812966323e-17	41706870	42165272	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22306	-0.0074	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	472	0.0331	NA	NA	NA	2.31036140796577e-17	1398325	1398325
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.1525	2.31036140796577e-17	1398325	1398325	1.88794330177215e-17	1400840	1400840
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	20386500	8721	8492	0.0199	1.88794330177215e-17	1400840	1400840	7.83086487866483e-21	20383210	20386500
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20493401	16	15	-0.8291	7.83086487866483e-21	20383210	20386500	5.06432547897396e-21	20493401	20510787
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	63787171	13827	13449	6e-04	5.06432547897396e-21	20493401	20510787	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	566	-0.0366	NA	NA	NA	5.63550570301563e-77	1506379	1518825
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.3689	5.63550570301563e-77	1506379	1518825	1.54753185093457e-103	1521410	1531162
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	14369261	4421	4291	-0.0048	1.54753185093457e-103	1521410	1531162	1.88654962988523e-16	14368060	14369261
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14372827	14372827	1	0	NA	1.88654962988523e-16	14368060	14369261	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14373978	14388257	8	8	-0.9473	NA	NA	NA	1.97208209771848e-14	14388257	14400025
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14400025	62419534	16554	16112	-0.0209	1.97208209771848e-14	14388257	14400025	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13098	-0.0069	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	37685496	10764	10466	-0.0099	NA	NA	NA	1.64469166831134e-20	37681158	37689058
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.8018	1.64469166831134e-20	37681158	37689058	2.75733632227502e-19	37715370	37721849
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5609	-0.0109	2.75733632227502e-19	37715370	37721849	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	774	-0.0314	NA	NA	NA	3.53020767007521e-11	1427338	1431240
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1868	3.53020767007521e-11	1427338	1431240	1.48027073944522e-11	1432891	1434970
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1751766	260	256	-0.0558	1.48027073944522e-11	1432891	1434970	1.50257980253462e-09	1749777	1751766
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1753446	1755974	4	4	-1.0755	1.50257980253462e-09	1749777	1751766	3.41353125661119e-09	1755974	1760214
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1760214	2708291	738	719	-0.0293	3.41353125661119e-09	1755974	1760214	0	2708113	2711273
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	100989513	27785	27039	0.997	0	2708113	2711273	1.86791414008416e-10	100984904	100989656
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	100989656	101003411	7	7	0.1543	1.86791414008416e-10	100984904	100989656	1.10402593337087e-09	101000912	101017984
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	101005239	154582414	17342	16862	0.9889	1.10402593337087e-09	101000912	101017984	0	154578922	154586690
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.0095	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-4.1239	NA	NA	NA	7.84701315059853e-27	3223585	3772482
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.6321	7.84701315059853e-27	3223585	3772482	2.47706418419489e-16	5531459	6652845
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.7046	2.47706418419489e-16	5531459	6652845	3.24927260977825e-07	7021965	7210018
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7568006	129	125	-2.7517	3.24927260977825e-07	7021965	7210018	0.00268484611197253	7410906	7578636
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7572591	7608619	12	11	-4.6034	0.00268484611197253	7410906	7578636	0.000467865153557066	7605311	7626352
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	18	-2.6444	0.000467865153557066	7605311	7626352	6.50920184644915e-08	7643041	7658121
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.47	6.50920184644915e-08	7643041	7658121	2.07399241857071e-07	7705876	7709619
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7714929	4	4	-2.1189	2.07399241857071e-07	7705876	7709619	1.64481089993674e-14	7714929	7714929
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7716001	7723783	5	5	-4.534	1.64481089993674e-14	7714929	7714929	1.33491229381969e-08	7723783	7729757
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-2.0481	1.33491229381969e-08	7723783	7729757	2.30794427723783e-08	7776265	7799614
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	398	-3.8011	2.30794427723783e-08	7776265	7799614	2.19262669193212e-23	10512616	10515697
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.6516	2.19262669193212e-23	10512616	10515697	9.75711495602172e-09	10631941	11660512
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12541506	18	18	-3.5802	9.75711495602172e-09	10631941	11660512	0.00143156423544745	12514978	12559410
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-2.0875	0.00143156423544745	12514978	12559410	4.75333231038086e-09	12651786	12715696
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-4.0893	4.75333231038086e-09	12651786	12715696	2.65651482184308e-06	12804329	12861657
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13104920	103	99	-2.4555	2.65651482184308e-06	12804329	12861657	0.0268959667549686	13004854	13109337
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.0252	0.0268959667549686	13004854	13109337	6.48461024584124e-08	13128515	13136828
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13272362	49	48	-3.3367	6.48461024584124e-08	13128515	13136828	0.000154613655232176	13167862	13358173
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	14342834	360	337	-4.0658	0.000154613655232176	13167862	13358173	1.21910870130316e-05	14169526	14436374
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	91	-3.4041	1.21910870130316e-05	14169526	14436374	0.000254250361144881	14491287	14547168
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	22	-1.9307	0.000254250361144881	14491287	14547168	1.51519453013866e-06	14555872	14605090
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15299931	204	192	-3.6045	1.51519453013866e-06	14555872	14605090	0.00487541015739308	15176870	15327221
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15408015	69	66	-4.2786	0.00487541015739308	15176870	15327221	2.29146024576724e-06	15388044	15459443
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15409110	1	0	NA	2.29146024576724e-06	15388044	15459443	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15410566	16228031	277	267	-3.3351	NA	NA	NA	1.05152044992765e-09	16124286	16481450
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16229149	16229149	1	0	NA	1.05152044992765e-09	16124286	16481450	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16231057	21036503	698	667	-3.9221	NA	NA	NA	1.38502750623577e-07	21034708	21042490
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.0848	1.38502750623577e-07	21034708	21042490	1.68980464993852e-08	21048365	21059229
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	1.68980464993852e-08	21048365	21059229	NA	NA	NA
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	244	-3.9111	NA	NA	NA	1.01123245630665e-05	22051284	22158616
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0166	1.01123245630665e-05	22051284	22158616	8.96871652657646e-10	22176501	22181855
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	86	-4.2971	8.96871652657646e-10	22176501	22181855	8.47170337571276e-68	22926726	22930737
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-0.9987	8.47170337571276e-68	22926726	22930737	4.73274504121555e-05	26945084	27003308
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.4239	4.73274504121555e-05	26945084	27003308	0.000245698025896689	27006628	27068911
MSK_252152914591_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.7809	0.000245698025896689	27006628	27068911	NA	NA	NA
