Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1494648	176	168	0.058	NA	NA	NA	5.12605652581788e-07	1492853	1494648
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1496968	1500465	3	3	1.1105	5.12605652581788e-07	1492853	1494648	1.02963222700889e-06	1500465	1502368
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1502368	32602398	11809	11486	0.0231	1.02963222700889e-06	1500465	1502368	2.12456268801697e-09	32598147	32602398
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32605675	32609196	3	3	-1.2444	2.12456268801697e-09	32598147	32602398	9.82328136326136e-112	32609196	32609196
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32610866	72537426	15903	15485	0.174	9.82328136326136e-112	32609196	32609196	2.30982913368081e-310	72537426	72539143
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.1412	2.30982913368081e-310	72537426	72539143	2.00390314570352e-314	72574479	72579311
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11365	0.1706	2.00390314570352e-314	72574479	72579311	1.66986160558878e-09	109987341	109987341
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-1.4043	1.66986160558878e-09	109987341	109987341	7.90064816981027e-10	109989998	109989998
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	147203277	4572	4445	0.1655	7.90064816981027e-10	109989998	109989998	1.58996084224496e-07	146259710	147346399
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147510532	36	36	0.4932	1.58996084224496e-07	146259710	147346399	9.67794691378099e-06	147446204	148147694
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150823073	1259	1223	0.2095	9.677946913781e-06	147446204	148147694	3.55945236748221e-83	150823073	150836481
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	8	2.4271	3.55945236748221e-83	150823073	150836481	4.11664249369997e-81	150848509	150851439
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	195009358	16060	15633	0.2091	4.11664249369997e-81	150848509	150851439	1.24930078531399e-06	194972886	195009358
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.4598	1.24930078531399e-06	194972886	195009358	1.49668903955169e-50	195062793	195106051
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	246445611	19384	18897	0.1209	1.49668903955169e-50	195062793	195106051	1.21133374883696e-50	246410963	246475624
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246448361	246769018	96	91	0.4643	1.21133374883696e-50	246410963	246475624	2.71869724969790e-28	246755225	246794552
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	27	-0.3912	2.7186972496979e-28	246755225	246794552	2.44827125087066e-21	246858820	246864725
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	97	0.2169	2.44827125087066e-21	246858820	246864725	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34539603	11519	11213	0.246	NA	NA	NA	2.34913557215906e-08	34506496	34554208
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34539740	34591681	22	22	-0.1948	2.34913557215906e-08	34506496	34554208	3.74704860918812e-07	34574224	34613385
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35821494	483	469	0.2456	3.74704860918812e-07	34574224	34613385	3.71589466586479e-07	35818921	35821494
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.6712	3.71589466586479e-07	35818921	35821494	2.43234631472852e-07	35844884	35851593
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	106174179	21871	21255	0.2655	2.43234631472852e-07	35844884	35851593	5.73778884691476e-07	106171700	106174179
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106176211	106177686	2	2	1.6393	5.73778884691476e-07	106171700	106174179	2.38752191049414e-07	106177686	106179390
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106179390	117059138	2795	2726	0.2692	2.38752191049414e-07	106177686	106179390	1.09811128270125e-09	116978013	117092088
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	117064154	117349381	33	33	-0.1169	1.09811128270125e-09	116978013	117092088	2.4799646693666e-09	117296312	117442542
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	117354081	146571330	8347	8128	0.2602	2.4799646693666e-09	117296312	117442542	1.45474322390189e-08	146562545	146571330
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.7789	1.45474322390189e-08	146562545	146571330	5.33178827711579e-28	146592775	146597405
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31892	0.2486	5.33178827711579e-28	146592775	146597405	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32064724	10795	10515	-0.072	NA	NA	NA	3.98633256242994e-20	32064724	32064724
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32074432	32074432	1	0	NA	3.98633256242994e-20	32064724	32064724	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.1808	NA	NA	NA	3.98968024821775e-20	32080848	32080848
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	95016192	20044	19481	-0.0187	3.98968024821775e-20	32080848	32080848	6.68089062502637e-257	90329723	95088845
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95021157	99891210	1341	1318	0.2994	6.68089062502637e-257	90329723	95088845	2.41317480947249e-34	99891210	99891210
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.7549	2.41317480947249e-34	99891210	99891210	3.05570031947383e-38	99897201	99897201
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	117438664	5538	5379	0.307	3.05570031947383e-38	99897201	99897201	9.79297892000497e-318	117435656	117443448
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117440131	118140173	222	220	-0.5437	9.79297892000497e-318	117435656	117443448	1.32026416352089e-07	118113773	118161247
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118147295	118147295	1	0	NA	1.32026416352089e-07	118113773	118161247	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118149025	118253708	28	27	-0.1463	NA	NA	NA	4.38067406621483e-32	118221366	118281786
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118258333	163992903	15514	15104	0.3302	4.38067406621483e-32	118221366	118281786	9.98965747144694e-79	163992903	164012645
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	-2.0093	9.98965747144694e-79	163992903	164012645	0.0203914965333278	164001657	164042397
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-3.906	0.0203914965333278	164001657	164042397	0	164105613	164107951
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	176788911	4214	4104	0.3547	0	164105613	164107951	4.68266302572971e-08	176786490	176788911
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176792705	176794392	2	2	-1.1406	4.68266302572971e-08	176786490	176788911	9.2290272832041e-09	176794392	176796439
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176796439	193785530	5717	5567	0.3495	9.2290272832041e-09	176794392	176796439	2.80323946224441e-26	193785530	193785530
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193794411	4	4	-1.4348	2.80323946224441e-26	193785530	193785530	1.64908748407504e-25	193794411	193794411
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193797190	199329592	2179	2126	0.3523	1.64908748407504e-25	193794411	193794411	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3282	-0.0552	NA	NA	NA	1.50491831199765e-102	9815760	9815760
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.4335	1.50491831199765e-102	9815760	9815760	9.71153792318063e-92	9842644	9842644
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	63808626	13887	13502	-0.0652	9.71153792318063e-92	9842644	9842644	9.20074121010391e-16	63808626	63808626
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63817412	63821962	2	2	-2.0797	9.20074121010391e-16	63808626	63808626	2.36054064034567e-15	63821962	63821962
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63830459	94073863	9609	9344	-0.0656	2.36054064034567e-15	63821962	63821962	2.19714028001367e-100	94073863	94073863
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-5.1156	2.19714028001367e-100	94073863	94073863	6.02131181130447e-101	94078581	94078581
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	173224400	22743	22165	-0.0581	6.02131181130447e-101	94078581	94078581	4.14024996045851e-19	173224400	173224400
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	2.183	4.14024996045851e-19	173224400	173224400	9.34613837182047e-16	173228860	173228860
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	187	-0.0288	9.34613837182047e-16	173228860	173228860	2.32967227270926e-07	173659100	173660684
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.4918	2.32967227270926e-07	173659100	173660684	1.79766606580073e-09	173666072	173666072
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3674	-0.0655	1.79766606580073e-09	173666072	173666072	7.08271310960889e-17	186676034	186676034
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-2.1191	7.08271310960889e-17	186676034	186676034	1.34663526728681e-15	186680176	186680176
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1499	-0.0782	1.34663526728681e-15	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	55354504	14812	14417	0.0592	NA	NA	NA	2.92412315448876e-45	55227271	55354504
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55356995	55360514	3	3	0.5413	2.92412315448876e-45	55227271	55354504	1.54064646754091e-247	55360514	55396758
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55361798	140198797	25262	24586	-0.1069	1.54064646754091e-247	55360514	55396758	1.51116419640488e-246	140187814	140200229
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140200229	140216524	10	10	-0.7588	1.51116419640488e-246	140187814	140200229	2.85820823167178e-18	140215187	140224323
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180194323	13558	13166	-0.0374	2.85820823167178e-18	140215187	140224323	5.48049965972079e-19	180187846	180344964
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180358977	9	8	0.7058	5.48049965972079e-19	180187846	180344964	3.65834948773539e-08	180355807	180364670
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180441070	28	28	-0.0173	3.65834948773539e-08	180355807	180364670	3.64327948380426e-05	180431708	180451904
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180444863	180459673	6	5	-0.7167	3.64327948380426e-05	180431708	180451904	1.02018011863402e-05	180459673	180471920
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180465452	180644810	78	77	0.0305	1.02018011863402e-05	180459673	180471920	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	10562468	3729	3632	-0.0117	NA	NA	NA	7.51161850139928e-47	10553052	10574198
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	10564260	10818752	111	111	-0.4711	7.51161850139928e-47	10553052	10574198	7.20484361905493e-48	10806967	10832227
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	10822728	32558677	7837	7632	-0.006	7.20484361905493e-48	10806967	10832227	9.04368144572989e-80	32558677	32563252
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	-2.379	9.04368144572989e-80	32558677	32563252	5.06465506508578e-81	32595402	32595402
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	42908182	4325	4204	0.0081	5.06465506508578e-81	32595402	32595402	2.36903626096278e-07	42889890	42926264
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	42912107	42961923	27	27	0.3771	2.36903626096278e-07	42889890	42926264	2.26621894914412e-07	42946697	43003213
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	42965633	54035000	3953	3852	-0.0034	2.26621894914412e-07	42946697	43003213	3.23080265081636e-09	54033505	54035000
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.2597	3.23080265081636e-09	54033505	54035000	9.99229243382477e-12	54042734	54045472
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79011979	6430	6240	-0.0427	9.99229243382477e-12	54042734	54045472	9.36827828173183e-25	79008946	79015901
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	15	-0.9625	9.36827828173183e-25	79008946	79015901	5.58364479431984e-25	79085247	79095415
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	88481767	2603	2528	-0.0476	5.58364479431984e-25	79085247	79095415	4.24221823282011e-08	88481767	88481767
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	88484518	88485951	2	2	-1.4999	4.24221823282011e-08	88481767	88481767	4.58788333807327e-08	88485951	88487679
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	88487679	102039635	3667	3562	-0.0555	4.58788333807327e-08	88485951	88487679	3.62436379060209e-11	102039635	102039635
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-1.4311	3.62436379060209e-11	102039635	102039635	5.76275609149713e-11	102044331	102046884
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	470	-0.058	5.76275609149713e-11	102044331	102046884	1.43307152261283e-88	103841482	103841482
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.4066	1.43307152261283e-88	103841482	103841482	8.66188170064311e-90	103868154	103868154
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	162658764	20220	19659	-0.0553	8.66188170064311e-90	103868154	103868154	1.72066037706183e-144	162658764	162665515
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162660868	162660868	1	0	NA	1.72066037706183e-144	162658764	162665515	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162665515	162735906	30	29	-1.6325	NA	NA	NA	5.2751432224512e-147	162734579	162735906
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162737848	170753106	2663	2581	-0.0842	5.2751432224512e-147	162734579	162735906	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26097755	8798	8571	0.1496	NA	NA	NA	2.14027851376649e-11	26097755	26097755
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-1.5256	2.14027851376649e-11	26097755	26097755	2.50240202864707e-11	26108369	26108369
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	29635722	1579	1538	0.1575	2.50240202864707e-11	26108369	26108369	3.14479284036745e-90	29635722	29635722
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29641884	29652543	2	2	-4.4812	3.14479284036745e-90	29635722	29635722	1.87472001317391e-88	29652543	29652543
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29656586	109217320	24580	23934	0.1416	1.87472001317391e-88	29652543	29652543	5.47682628852592e-109	109217320	109217320
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-4.0481	5.47682628852592e-109	109217320	109217320	5.86884529075883e-49	109233214	109233214
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109331768	45	42	0.1282	5.86884529075883e-49	109233214	109233214	3.67919002855857e-12	109320369	109354068
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109332382	109607905	112	105	-0.3719	3.67919002855857e-12	109320369	109354068	2.78953405157864e-56	109594791	109618808
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109609869	142159173	14991	14550	0.1469	2.78953405157864e-56	109594791	109618808	6.26625460615208e-08	142156165	142159173
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142161005	142161005	1	0	NA	6.26625460615208e-08	142156165	142159173	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142167908	3	3	-1.049	NA	NA	NA	4.42087526733056e-08	142167908	142176074
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	158821263	6579	6424	0.1362	4.42087526733056e-08	142167908	142176074	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7955	-0.3243	NA	NA	NA	6.54662359327848e-11	25120552	25120552
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	6.54662359327848e-11	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.3985	NA	NA	NA	1.23825432319628e-10	25125700	25125700
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32800775	3032	2952	-0.3159	1.23825432319628e-10	25125700	25125700	1.75305734698794e-06	32797545	32800775
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-1.6734	1.75305734698794e-06	32797545	32800775	8.13487863635307e-35	32808049	32808049
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	87255865	14624	14223	-0.0693	8.13487863635307e-35	32808049	32808049	6.82157195582445e-32	87244329	87259940
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87281474	8	8	-0.7981	6.82157195582445e-32	87244329	87259940	0	87273542	87288439
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87284732	146264846	18738	18210	0.0248	0	87273542	87288439	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	70926188	13071	12709	-0.0644	NA	NA	NA	5.41491143621316e-07	70923005	70926188
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.3196	5.41491143621316e-07	70923005	70926188	7.33517151725984e-09	70930528	70935055
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23159	-0.0463	7.33517151725984e-09	70930528	70935055	9.7807347015032e-16	137352394	137352394
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.9574	9.7807347015032e-16	137352394	137352394	1.02944030236995e-15	137356880	137356880
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	137359947	1	0	NA	1.02944030236995e-15	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137361870	140145683	1102	1070	0.0075	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	46388078	14459	14062	0.1442	NA	NA	NA	3.67644736943123e-93	45487335	46394835
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46389734	47172534	118	114	0.7735	3.67644736943123e-93	45487335	46394835	3.67148838089744e-97	47165836	47946216
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	56115736	2454	2382	0.1308	3.67148838089744e-97	47165836	47946216	1.05338624022185e-20	56112067	56115736
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56118633	56138767	10	9	1.1775	1.05338624022185e-20	56112067	56115736	4.49744637266927e-19	56138767	56140996
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	56140996	77917893	7551	7341	0.1601	4.49744637266927e-19	56138767	56140996	1.19703439967252e-24	77917893	77917893
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.2835	1.19703439967252e-24	77917893	77917893	1.00152814910002e-22	77928669	77928669
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19647	0.1005	1.00152814910002e-22	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	134450318	45304	44105	-0.0208	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	290	0.3498	NA	NA	NA	1.90594868968189e-24	736988	736988
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-1.2608	1.90594868968189e-24	736988	736988	4.94641724247065e-22	743223	743223
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3346	0.3714	4.94641724247065e-22	743223	743223	1.67499223694193e-70	9523923	9523923
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9550789	4	4	-2.5246	1.67499223694193e-70	9523923	9523923	1.19379061599968e-14	9550789	9550789
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	9599999	9	9	-0.3415	1.19379061599968e-14	9550789	9550789	1.64725159631103e-05	9578398	9626736
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11395862	651	629	0.2508	1.64725159631103e-05	9578398	9626736	6.70808556354174e-44	11395862	11395862
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-1.9346	6.70808556354174e-44	11395862	11395862	3.35982389247964e-48	11435643	11435643
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	33270966	7524	7302	0.2835	3.35982389247964e-48	11435643	11435643	1.00499146348685e-25	33270966	33270966
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-1.4165	1.00499146348685e-25	33270966	33270966	0	33283825	33283825
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	130943064	32671	31804	0.1748	0	33283825	33283825	0	130936199	130943064
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.8307	0	130936199	130943064	1.78302640052934e-12	130946248	130946248
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	534	0.1271	1.78302640052934e-12	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7123	0.0873	NA	NA	NA	2.34681623213077e-40	37953582	37953582
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.1972	2.34681623213077e-40	37953582	37953582	9.77299098063555e-39	37957844	37957844
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	68142120	9394	9142	0.1004	9.77299098063555e-39	37957844	37957844	1.31999150332793e-41	68142120	68142120
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-1.413	1.31999150332793e-41	68142120	68142120	1.95285177969642e-36	68163523	68163523
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	896	0.1039	1.95285177969642e-36	68163523	68163523	7.08409776378632e-08	71373779	71375082
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-1.4138	7.08409776378632e-08	71373779	71375082	5.01633600755285e-09	71377671	71379555
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	71703277	105	101	0.0773	5.01633600755285e-09	71377671	71379555	5.41974099218043e-11	71703277	71703277
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-1.5429	5.41974099218043e-11	71703277	71703277	2.02621750750033e-10	71708737	71708737
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	113097932	13471	13118	0.0973	2.02621750750033e-10	71708737	71708737	1.25378298988318e-08	113097932	113097932
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113099209	113101470	2	2	-1.4063	1.25378298988318e-08	113097932	113097932	3.41201338906429e-09	113101470	113101470
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113103305	114123340	399	386	0.1126	3.41201338906429e-09	113101470	113101470	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18864561	8	8	0.2784	NA	NA	NA	1.03974207434634e-09	18544772	19273289
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	19494416	52	51	-0.726	1.03974207434634e-09	18544772	19273289	4.88171032512379e-46	19484013	19538610
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	106358491	31825	30974	-0.0477	4.88171032512379e-46	19484013	19538610	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18362555	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18427151	19537035	98	97	-0.2064	NA	NA	NA	1.82054876780295e-15	19415360	19822150
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	53	-0.7057	1.82054876780295e-15	19415360	19822150	2.42205625229830e-104	20065525	20310916
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74664249	21553	21010	0.0143	2.4220562522983e-104	20065525	20310916	6.90803019512167e-98	74664249	74678353
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74665386	74680439	6	6	-2.4342	6.90803019512167e-98	74664249	74678353	5.07619557931538e-289	74669752	74680439
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	99630163	9332	9104	0.0116	5.07619557931538e-289	74669752	74680439	9.16417341472031e-291	99627656	99630163
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99632987	99635701	3	3	1.3871	9.16417341472031e-291	99627656	99630163	2.49928711177837e-08	99635701	99636724
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	261	0.1147	2.49928711177837e-08	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33469289	10600	10317	-0.0506	NA	NA	NA	6.93561375702435e-14	33278944	33495501
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33495501	33536526	16	16	-0.5352	6.93561375702435e-14	33278944	33495501	1.93120494029072e-05	33528385	34058222
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	75093957	9907	9657	-0.1076	1.93120494029072e-05	33528385	34058222	6.12355445697883e-44	75093957	75093957
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.7645	6.12355445697883e-44	75093957	75093957	1.86544048324438e-44	75100865	75100865
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5001	-0.1138	1.86544048324438e-44	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15727076	6302	6126	-0.047	NA	NA	NA	5.75562887201086e-100	15727076	15727076
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-4.9912	5.75562887201086e-100	15727076	15727076	4.29830663186512e-107	15733964	15733964
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	24195451	2665	2601	-0.0402	4.29830663186512e-107	15733964	15733964	7.79652409977912e-23	24195451	24195451
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24198397	24201924	5	5	-1.5003	7.79652409977912e-23	24195451	24195451	5.84629173470462e-21	24201924	24201924
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24204545	41515622	6912	6727	-0.0408	5.84629173470462e-21	24201924	24201924	5.18254156574003e-29	41501967	41527705
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41518222	42151941	74	74	0.406	5.18254156574003e-29	41501967	41527705	1.78834431781748e-28	41708551	42165272
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	61394929	7057	6867	-0.0332	1.78834431781748e-28	41708551	42165272	8.37570432261624e-08	61393591	61394929
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	61397603	61397875	2	2	-1.4654	8.37570432261624e-08	61393591	61394929	2.04809796136208e-14	61397875	61397875
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	61402358	78637954	6614	6440	-0.018	2.04809796136208e-14	61397875	61397875	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78653545	78653545	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15761	-0.093	NA	NA	NA	7.08523743274644e-146	53092949	53092949
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.7658	7.08523743274644e-146	53092949	53092949	1.33029128498318e-25	53099601	53099601
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6568	-0.2116	1.33029128498318e-25	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	40352568	12609	12241	-0.0018	NA	NA	NA	0	40350432	40352568
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.2203	0	40350432	40352568	3.34476849526837e-156	40356341	40356341
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	56823430	7262	7070	0.1779	3.34476849526837e-156	40356341	40356341	8.50084603613506e-161	56822197	56823430
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.9722	8.50084603613506e-161	56822197	56823430	2.49162228329823e-93	56840346	56842447
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3092	0.0759	2.49162228329823e-93	56840346	56842447	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	573	0.4119	NA	NA	NA	2.17623760237923e-108	1516966	1518825
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.5929	2.17623760237923e-108	1516966	1518825	3.06867653313079e-104	1528899	1531162
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20431	0.3446	3.06867653313079e-104	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13101	0.1699	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2908	-0.0448	NA	NA	NA	1.52637029618591e-239	22667608	22679305
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	19	-2.5952	1.52637029618591e-239	22667608	22679305	4.69151599541119e-253	22714979	22720195
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	34029969	5778	5621	-0.0563	4.69151599541119e-253	22714979	22720195	2.63904382081292e-14	34019576	34036637
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	34030863	34082126	29	29	0.4353	2.63904382081292e-14	34019576	34036637	1.93595883499147e-13	34071197	34090379
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	34083427	35472378	742	716	-0.0313	1.93595883499147e-13	34071197	34090379	1.90445715487319e-15	35472378	35472378
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.8891	1.90445715487319e-15	35472378	35472378	5.72745206483739e-14	35476942	35476942
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6802	-0.0404	5.72745206483739e-14	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1091	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529	2702699	1787	1743	-0.2005	NA	NA	NA	4.19306738866003e-08	2699364	2702699
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2705374	2708291	5	5	-1.0291	4.19306738866003e-08	2699364	2702699	4.27651437256111e-21	2708291	2708291
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6747678	1255	1226	0.5383	4.27651437256111e-21	2708291	2708291	2.09320260714843e-07	6709430	6753179
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6753179	6834025	11	11	-0.1001	2.09320260714843e-07	6709430	6753179	6.34520288796245e-10	6817735	6866899
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6843577	8432497	515	498	0.5448	6.34520288796245e-10	6817735	6866899	1.74497785134618e-06	8413301	8440931
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8437023	8458058	12	12	0.0409	1.74497785134618e-06	8413301	8440931	3.50956024012767e-20	8452395	8465433
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8459880	76998610	21146	20634	0.628	3.50956024012767e-20	8452395	8465433	4.4123436360792e-20	76998610	76998610
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.6294	4.4123436360792e-20	76998610	76998610	9.0605801457908e-33	77010018	77010018
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	21467	0.6546	9.0605801457908e-33	77010018	77010018	3.41753203781793e-37	154037006	154038318
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154079002	12	11	-0.6781	3.41753203781793e-37	154037006	154038318	3.94371271934119e-26	154079002	154085354
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154599547	123	117	0.5841	3.94371271934119e-26	154079002	154085354	1.54981267418458e-80	154582414	154601295
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154601146	154888224	199	197	-0.1954	1.54981267418458e-80	154582414	154601295	NA	NA	NA
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.1034	NA	NA	NA	4.25329011514434e-16	3034907	3772482
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8005	4.25329011514434e-16	3034907	3772482	7.69085847503055e-11	5531459	6692482
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6970768	130	124	-2.9289	7.69085847503055e-11	5531459	6692482	1.14286279530548e-05	6927923	7022973
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6971636	7304209	122	120	-2.1494	1.14286279530548e-05	6927923	7022973	5.15422260383633e-07	7244216	7401540
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	10501368	567	553	-2.8163	5.15422260383633e-07	7244216	7401540	3.27537352735285e-09	10451527	10515697
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10503821	12452734	26	23	-1.3674	3.27537352735285e-09	10451527	10515697	2.19541919499113e-08	10655750	12502304
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-3.8315	2.19541919499113e-08	10655750	12502304	1.84408571576729e-07	12537944	12550566
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12687167	55	52	-1.8648	1.84408571576729e-07	12537944	12550566	4.29001604085326e-05	12646477	12710000
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12696242	12776542	14	13	-3.3964	4.29001604085326e-05	12646477	12710000	0.000128828963537663	12756268	12843307
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	13129843	121	117	-1.9691	0.000128828963537663	12756268	12843307	8.37317648840717e-15	13101234	13158272
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13649497	208	205	-2.9977	8.37317648840717e-15	13101234	13158272	0.000434239142373932	13587025	13670791
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13705594	10	8	-1.3114	0.000434239142373932	13587025	13670791	1.34290462160411e-05	13701755	13729067
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14352278	193	187	-3.2432	1.34290462160411e-05	13701755	13729067	7.76865932370477e-08	14262916	14407293
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14696387	139	135	-2.4851	7.76865932370477e-08	14262916	14407293	0.00714517756205102	14460135	15107365
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14697315	15915466	397	383	-2.9227	0.00714517756205102	14460135	15107365	0.00265236387655157	15542314	16059723
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16228031	134	132	-2.4627	0.00265236387655157	15542314	16059723	1.00654392357883e-09	16195788	16350833
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16229149	17482749	201	195	-3.3024	1.00654392357883e-09	16195788	16350833	0.00290367532560394	16914237	17858205
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	22192409	779	761	-2.9596	0.00290367532560394	16914237	17858205	0.0225754479275178	21824109	22793907
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22930737	88	82	-3.4018	0.0225754479275178	21824109	22793907	2.85117322085248e-40	22923722	26871442
MSK_252152914659_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	86	-1.1627	2.85117322085248e-40	22923722	26871442	NA	NA	NA
