Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	38928079	14382	13962	-0.0882	NA	NA	NA	0	38924128	38931283
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	38931283	42658754	1614	1562	1.3931	0	38924128	38931283	4.54221569695772e-46	42625709	42689883
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42660478	43703367	406	398	1.7516	4.54221569695772e-46	42625709	42689883	0	43701292	43713521
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43713521	44857696	517	501	0.514	0	43701292	43713521	5.17700827174124e-258	44849300	44861590
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	44859565	47298380	967	944	-0.2527	5.17700827174124e-258	44849300	44861590	1.42709673088346e-205	47296318	47305368
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	47305368	47522758	80	80	1.1511	1.42709673088346e-205	47296318	47305368	1.16489420475397e-86	47519332	47525808
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	47524018	50064806	1013	986	0.2	1.16489420475397e-86	47519332	47525808	0	50048862	50089567
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	50066170	61884298	4652	4540	-0.3379	0	50048862	50089567	1.86898801047801e-123	61884298	61884298
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-5.7411	1.86898801047801e-123	61884298	61884298	3.51308210100519e-141	61890388	61890388
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	72537426	4260	4129	-0.3032	3.51308210100519e-141	61890388	61890388	2.69066550717983e-283	72537426	72537426
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.0359	2.69066550717983e-283	72537426	72537426	5.79733986417474e-286	72579311	72579311
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	5.79733986417474e-286	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	117524390	14517	14109	-0.3052	NA	NA	NA	2.26298690552272e-48	117518306	117529302
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117526407	117733183	68	67	0.375	2.26298690552272e-48	117518306	117529302	8.43755304845121e-13	117712417	117759484
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117737094	120968980	981	960	-0.0075	8.43755304845121e-13	117712417	117759484	6.4115548484476e-168	120936550	120989987
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120971710	150823073	1990	1925	0.421	6.4115548484476e-168	120936550	120989987	6.81646193683137e-76	150823073	150823073
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.8751	6.81646193683137e-76	150823073	150823073	6.65691448987819e-77	150851439	150851439
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2692	0.4171	6.65691448987819e-77	150851439	150851439	3.05771496743287e-63	157133150	157133150
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.2945	3.05771496743287e-63	157133150	157133150	1.78883209079975e-67	157136342	157136342
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	192715640	12818	12441	0.3624	1.78883209079975e-67	157136342	157136342	1.31480174667417e-15	192715640	192715640
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-1.9196	1.31480174667417e-15	192715640	192715640	0	192719540	192719540
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	246794552	19966	19418	0.0824	0	192719540	192719540	0	246769018	246805521
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246862029	26	26	-1.071	0	246769018	246805521	2.29784630263388e-27	246860551	246864725
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	93	-0.0549	2.29784630263388e-27	246860551	246864725	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	1619159	596	580	-0.0293	NA	NA	NA	5.102957209597e-06	1617254	1619159
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1621283	1622579	2	2	-1.6347	5.102957209597e-06	1617254	1619159	1.62967112818747e-07	1622579	1624267
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1624267	8045619	1799	1744	0.0191	1.62967112818747e-07	1622579	1624267	5.45574672161762e-07	8042298	8045619
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8048423	8053654	3	3	-1.2865	5.45574672161762e-07	8042298	8045619	1.75655339385432e-07	8053654	8058417
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	8058417	24452394	4682	4545	0.0786	1.75655339385432e-07	8053654	8058417	1.01035701398476e-11	24448885	24452394
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24462631	4	4	-1.3821	1.01035701398476e-11	24448885	24452394	3.30359463354229e-12	24462631	24467164
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24467164	37800512	5821	5672	0.0855	3.30359463354229e-12	24462631	24467164	5.2161218320077e-17	37787637	37812045
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	24	-0.618	5.2161218320077e-17	37787637	37812045	2.04118154779835e-18	37848754	37862351
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	66038336	10290	10024	0.089	2.04118154779835e-18	37848754	37862351	2.9178218855073e-11	66032733	66041319
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66063033	6	5	-1.1358	2.9178218855073e-11	66032733	66041319	0	66063033	66065935
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66065935	146571330	21847	21262	0.2108	0	66063033	66065935	0	146571330	146571330
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.5021	0	146571330	146571330	7.78268517934381e-206	146592775	146592775
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	180595984	11548	11193	0.0892	7.78268517934381e-206	146592775	146592775	1.42695962700525e-07	180595387	180595984
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180597948	180600415	2	2	-1.4988	1.42695962700525e-07	180595387	180595984	4.23585537242245e-07	180600415	180608268
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180608268	242689978	21199	20563	0.0845	4.23585537242245e-07	180600415	180608268	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	85089201	29341	28499	-0.3192	NA	NA	NA	1.60452791655483e-15	85086622	85089201
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85093209	85094355	2	2	-1.9241	1.60452791655483e-15	85086622	85089201	7.34048821351467e-09	85094355	85094355
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	85097943	95016192	1499	1457	-0.3143	7.34048821351467e-09	85094355	85094355	0	90346768	95074272
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95021157	163992903	22646	22051	0.0904	0	90346768	95074272	6.36387327738383e-116	163992903	163992903
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-4.8711	6.36387327738383e-116	163992903	163992903	4.03874320801121e-18	164005577	164005577
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-1.7246	4.03874320801121e-18	164005577	164005577	5.5912360360719e-14	164027724	164036648
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-4.8874	5.5912360360719e-14	164027724	164036648	0	164107951	164107951
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192874342	9640	9375	0.0981	0	164107951	164107951	1.43927321068465e-73	192837799	192948785
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192881154	193730921	270	262	-0.3302	1.43927321068465e-73	192837799	192948785	1.3045594472821e-69	193713564	193762878
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193733404	193733404	1	0	NA	1.3045594472821e-69	193713564	193762878	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193735204	199329592	2205	2151	0.1063	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	47239721	13616	13237	-0.319	NA	NA	NA	0	47228328	47257802
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	47243971	57335514	2407	2330	0.1979	0	47228328	47257802	1.67982319586024e-322	57329109	57344037
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57337792	60657767	588	570	0.9016	1.67982319586024e-322	57329109	57344037	0	60649030	60666262
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	60666262	92288271	9754	9478	-0.3008	0	60649030	60666262	8.29368437220542e-25	92288271	92288271
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92295210	92299709	3	3	-2.57	8.29368437220542e-25	92288271	92288271	6.76589317793468e-26	92299709	92299709
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92306592	94019076	503	486	-0.3075	6.76589317793468e-26	92299709	92299709	3.99310154062975e-11	93984764	94028106
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94020231	94156438	59	59	-0.6551	3.99310154062975e-11	93984764	94028106	1.78451463627266e-12	94146387	94181585
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94158490	107275274	4222	4095	-0.2942	1.78451463627266e-12	94146387	94181585	2.60705817777024e-96	107275274	107275274
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-4.0659	2.60705817777024e-96	107275274	107275274	6.163183920501e-97	107281410	107281410
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	138387955	7821	7633	-0.2983	6.163183920501e-97	107281410	107281410	5.93482505082566e-18	138387955	138387955
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138400817	138409231	2	2	-2.6222	5.93482505082566e-18	138387955	138387955	4.95319449332222e-49	138409231	138409231
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138417188	151968782	4370	4231	0.0798	4.95319449332222e-49	138409231	138409231	1.47968978771161e-89	151957672	151983174
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151968963	151968963	1	0	NA	1.47968978771161e-89	151957672	151983174	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151970913	152384729	168	165	0.6833	NA	NA	NA	4.27491362611407e-265	152380522	152386078
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152386078	173224400	6122	5953	-0.3057	4.27491362611407e-265	152380522	152386078	2.69803140038974e-18	173224400	173224400
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.6731	2.69803140038974e-18	173224400	173224400	5.13708867227353e-17	173228860	173228860
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	186676034	3968	3805	-0.3046	5.13708867227353e-17	173228860	173228860	2.54005707944354e-17	186676034	186676034
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-2.6928	2.54005707944354e-17	186676034	186676034	8.97498628539668e-17	186680176	186680176
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	190780239	1453	1422	-0.3462	8.97498628539668e-17	186680176	186680176	3.63717724765755e-10	190717801	190816187
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190784435	190927969	53	50	0.0292	3.63717724765755e-10	190717801	190816187	0.000147438191595421	190887201	190971283
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190930709	191153613	43	42	-0.3423	0.000147438191595421	190887201	190971283	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	11953407	3808	3705	-0.3228	NA	NA	NA	1.83628767024412e-11	11951629	11953407
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	11955118	11959228	4	3	-1.7405	1.83628767024412e-11	11951629	11953407	5.52787937805156e-09	11959228	11960604
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	11960604	155405839	41671	40483	-0.2901	5.52787937805156e-09	11959228	11960604	4.59330065491933e-144	155405839	155405839
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-4.5539	4.59330065491933e-144	155405839	155405839	2.03837049564484e-126	155421443	155421443
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180346557	8160	7948	-0.2999	2.03837049564484e-126	155421443	155421443	2.65558949701503e-38	180346557	180346557
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180357210	5	5	-2.6566	2.65558949701503e-38	180346557	180346557	9.93870333494208e-20	180357210	180358977
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180358977	180644810	113	108	-0.3385	9.93870333494208e-20	180357210	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	17482872	6126	5965	0.2767	NA	NA	NA	3.25710334774371e-93	17482872	17482872
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-4.7668	3.25710334774371e-93	17482872	17482872	1.10583299061967e-69	17488010	17488010
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	32548736	5548	5396	0.0695	1.10583299061967e-69	17488010	17488010	7.12332173418812e-124	32548736	32564884
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32650672	20	20	-1.9935	7.12332173418812e-124	32548736	32564884	2.49091787409927e-12	32628420	32653710
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32653710	32713363	26	25	-0.2151	2.49091787409927e-12	32628420	32653710	0.00249030880295979	32700719	32738443
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32756637	18	18	-0.9665	0.00249030880295979	32700719	32738443	1.88845402528106e-25	32736223	32760574
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32758904	40973601	3471	3378	0.0868	1.88845402528106e-25	32736223	32760574	0	40935904	41000499
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	40975971	50502268	3420	3303	-0.3129	0	40935904	41000499	0	50489783	50511509
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	50507299	54499608	1539	1492	0.6274	0	50489783	50511509	1.23885338566468e-46	54456968	54527221
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54505597	55056621	149	145	1.1221	1.23885338566468e-46	54456968	54527221	3.17460818001996e-252	55045088	55069706
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55069706	87269582	8282	8076	0.1017	3.17460818001996e-252	55045088	55069706	9.54342428715958e-12	87218813	87325567
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	87278165	87530517	46	45	-0.3034	9.54342428715958e-12	87218813	87325567	3.08803753224592e-10	87505620	87558407
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	87532451	139643729	16936	16433	0.0858	3.08803753224592e-10	87505620	87558407	1.53762409481795e-104	139643729	139643729
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-4.5565	1.53762409481795e-104	139643729	139643729	4.48333646018113e-107	139648318	139648318
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	152278699	4231	4089	0.0821	4.48333646018113e-107	139648318	139648318	3.75212977934395e-15	152255548	152306430
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152282439	152389620	48	48	-0.3647	3.75212977934395e-15	152255548	152306430	2.11076195141076e-13	152374646	152420210
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152397183	152397183	1	0	NA	2.11076195141076e-13	152374646	152420210	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152397583	162374643	3417	3312	0.0749	NA	NA	NA	9.2330532640768e-49	162357325	162387683
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162376498	162783200	192	186	-0.3512	9.2330532640768e-49	162357325	162387683	5.92896680867031e-32	162762350	162816034
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162785426	170753106	2642	2561	0.0173	5.92896680867031e-32	162762350	162816034	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	8652065	3102	3022	-0.8064	NA	NA	NA	9.48733126601694e-286	8650600	8653991
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8653991	9588883	188	181	0.4117	9.48733126601694e-286	8650600	8653991	0	9586462	9594628
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	9594628	15668715	1973	1909	-0.8447	0	9586462	9594628	7.84724386024689e-17	15665559	15668715
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	15671263	15684669	8	8	0.3509	7.84724386024689e-17	15665559	15668715	3.04230486124074e-15	15684669	15686685
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	15686685	16104075	105	101	-0.8568	3.04230486124074e-15	15684669	15686685	4.49068396157855e-10	16102720	16104075
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16106227	16112274	3	3	0.7092	4.49068396157855e-10	16102720	16104075	3.18186185538816e-13	16112274	16112274
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16118497	16208935	44	43	-0.8333	3.18186185538816e-13	16112274	16112274	9.40881565186386e-10	16207035	16208935
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16210326	16217498	5	5	0.2466	9.40881565186386e-10	16207035	16208935	5.29537574717038e-08	16217498	16222137
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16220573	17209189	405	399	-0.8077	5.29537574717038e-08	16217498	16222137	2.47937465043532e-09	17206576	17209189
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	17211367	17213408	2	0	NA	2.47937465043532e-09	17206576	17209189	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	17215245	17220643	4	4	0.4568	NA	NA	NA	2.66530017079374e-08	17220643	17229328
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	17227536	20012023	839	810	-0.8277	2.66530017079374e-08	17220643	17229328	5.34191363764241e-08	20000596	20019511
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20013712	20037023	9	8	0.0778	5.34191363764241e-08	20000596	20019511	5.25792194250553e-11	20019511	20044840
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20039564	20039564	1	0	NA	5.25792194250553e-11	20019511	20044840	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20044840	20545716	172	168	-0.8514	NA	NA	NA	7.61711351242936e-08	20527622	20567604
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20550407	20582900	10	10	-0.1702	7.61711351242936e-08	20527622	20567604	2.65211113800839e-06	20567604	20591555
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	20585698	26097755	1928	1886	-0.8553	2.65211113800839e-06	20567604	20591555	2.87951032498261e-37	26097755	26097755
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.4508	2.87951032498261e-37	26097755	26097755	2.41835545675436e-19	26108369	26108369
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	26193254	30	30	-0.7065	2.41835545675436e-19	26108369	26108369	1.70159153872492e-05	26185172	26193254
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26195451	26201608	4	4	0.7071	1.70159153872492e-05	26185172	26193254	1.26240875713045e-13	26201608	26202727
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26202727	44240761	6901	6716	-0.8653	1.26240875713045e-13	26201608	26202727	2.85226982126572e-06	44237630	44240761
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	44243373	44245874	2	2	-2.4133	2.85226982126572e-06	44237630	44240761	2.60455954800294e-06	44245874	44247666
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	44247666	47203030	769	745	-0.8184	2.60455954800294e-06	44245874	44247666	1.48202717418068e-169	47176745	47243059
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	47208253	53013085	1614	1575	-0.3122	1.48202717418068e-169	47176745	47243059	2.80697464804678e-220	52962059	53051170
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	53027437	57616272	1013	979	-0.8393	2.80697464804678e-220	52962059	53051170	3.4007834286724e-111	57566117	62103610
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	57625302	64523575	429	415	-0.3165	3.4007834286724e-111	57566117	62103610	2.20367806865193e-07	64516764	64523575
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.8665	2.20367806865193e-07	64516764	64523575	4.54855655833049e-07	64532949	64534167
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	67149422	537	519	-0.2815	4.54855655833049e-07	64532949	64534167	7.18244788897336e-25	67146750	67149422
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	67153716	67189668	15	14	0.8355	7.18244788897336e-25	67146750	67149422	3.53703808558639e-27	67189668	67191688
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	67191688	72448311	1730	1688	-0.3124	3.53703808558639e-27	67189668	67191688	6.85220161720282e-07	72444884	72450333
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	72450333	72470529	4	4	-1.4177	6.85220161720282e-07	72444884	72450333	6.7366335314191e-19	72470529	72478226
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	72476546	109217320	13111	12725	-0.265	6.7366335314191e-19	72470529	72478226	1.85012244862776e-97	109217320	109217320
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-4.8875	1.85012244862776e-97	109217320	109217320	1.57259389953381e-07	109233214	109233214
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.929	1.57259389953381e-07	109233214	109233214	3.09840574073895e-08	109240210	109240210
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	118611324	4299	4167	-0.2891	3.09840574073895e-08	109240210	109240210	2.94433818774775e-56	118611324	118611324
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-3.6868	2.94433818774775e-56	118611324	118611324	5.9569741666159e-52	118620875	118620875
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6608	-0.2952	5.9569741666159e-52	118620875	118620875	5.81021036576827e-07	133426938	133436265
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.4853	5.81021036576827e-07	133426938	133436265	8.95163952162896e-07	133447868	133456873
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3720	-0.2937	8.95163952162896e-07	133447868	133456873	6.28999330628561e-274	141690753	141690753
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-4.5765	6.28999330628561e-274	141690753	141690753	8.9531010477223e-259	141714168	141714168
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	144399712	976	945	-0.3134	8.9531010477223e-259	141714168	141714168	1.06469149698228e-47	144399712	144399712
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144403133	144404463	2	2	-4.3189	1.06469149698228e-47	144399712	144399712	7.06648259370421e-42	144404463	144404463
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144411778	158821263	5774	5614	-0.3202	7.06648259370421e-42	144404463	144404463	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	15987191	5207	5075	-0.3673	NA	NA	NA	1.66726666794906e-33	15965761	15993734
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15990019	16067927	32	31	-1.2502	1.66726666794906e-33	15965761	15993734	1.94145608475518e-37	16062628	16070933
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16069607	32797545	5954	5764	-0.322	1.94145608475518e-37	16062628	16070933	2.53854103296825e-14	32797545	32797545
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32808049	3	2	-2.6077	2.53854103296825e-14	32797545	32797545	1.88000468243770e-19	32808049	32808049
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	34268041	373	359	-0.3132	1.8800046824377e-19	32808049	32808049	1.99514334500062e-76	34241584	34299546
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	34270304	39350798	1505	1451	0.1053	1.99514334500062e-76	34241584	34299546	3.42191927295634e-27	39333887	39363050
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	-0.4688	3.42191927295634e-27	39333887	39363050	3.50105780569991e-52	39499752	39509423
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	432	0.3561	3.50105780569991e-52	39499752	39509423	7.94317781809164e-89	40892587	40892587
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.9931	7.94317781809164e-89	40892587	40892587	2.50522206205223e-72	40897469	40897469
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	42850384	707	693	0.3537	2.50522206205223e-72	40897469	40897469	1.32960653635015e-68	42836103	42864354
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	42858096	43647063	198	193	-0.2246	1.32960653635015e-68	42836103	42864354	6.89107553353524e-91	43478243	47066831
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	47058319	51316810	880	856	0.4123	6.89107553353524e-91	43478243	47066831	1.07868822415281e-306	51309802	51321193
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51318333	55470703	1249	1202	-0.2162	1.07868822415281e-306	51309802	51321193	1.97871822128399e-08	55418566	55481820
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	55475715	55537579	30	28	-0.6575	1.97871822128399e-08	55418566	55481820	1.39788727722713e-237	55535394	55555404
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	55539065	87255865	9180	8916	-0.1344	1.39788727722713e-237	55535394	55555404	2.47179404129206e-228	87255865	87255865
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-2.7891	2.47179404129206e-228	87255865	87255865	1.17127833336631e-36	87262662	87262662
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	18222	0.0822	1.17127833336631e-36	87262662	87262662	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	35327804	11390	11057	-0.2583	NA	NA	NA	0	35319989	35340705
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	35330959	68483889	1364	1327	0.2962	0	35319989	35340705	4.23722171083702e-123	67915082	70212537
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70174301	70926188	318	313	-0.3088	4.23722171083702e-123	67915082	70212537	5.08292275779176e-17	70926188	70926188
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.6706	5.08292275779176e-17	70926188	70926188	2.44173905288024e-16	70930528	70930528
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	90881252	6584	6391	-0.3158	2.44173905288024e-16	70930528	70930528	8.84505944546333e-23	90866022	90890800
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	90883656	91109303	72	70	-0.7859	8.84505944546333e-23	90866022	90890800	3.54757078749542e-11	91089189	91122641
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	91109646	91211055	54	52	-0.2737	3.54757078749542e-11	91089189	91122641	8.45212064746088e-17	91196809	91229087
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	91212835	91215235	2	0	NA	8.45212064746088e-17	91196809	91229087	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	91216553	111075963	6605	6428	-0.7631	NA	NA	NA	0	111061977	111095833
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	111077196	140145683	11553	11204	-0.2891	0	111061977	111095833	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23884	0.0725	NA	NA	NA	1.91712237370799e-41	77917893	77917893
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.0017	1.91712237370799e-41	77917893	77917893	7.0946958185112e-39	77928738	77928738
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19646	0.0655	7.0946958185112e-39	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	7049236	2703	2620	0.3897	NA	NA	NA	4.00646606512633e-05	7016307	7053326
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7052026	7065425	6	6	-0.2911	4.00646606512633e-05	7016307	7053326	6.03215994724201e-06	7057170	7070745
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7066567	7259197	85	83	0.4447	6.03215994724201e-06	7057170	7070745	2.45594560671698e-16	7248198	7287673
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7261965	48561884	13762	13364	0.071	2.45594560671698e-16	7248198	7287673	1.24784981732308e-10	48561884	48561884
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48564809	48568515	2	2	1.7768	1.24784981732308e-10	48561884	48561884	3.27865515880971e-10	48568515	48568515
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48583374	55118214	347	336	-0.0239	3.27865515880971e-10	48568515	48568515	1.21473484493147e-43	55112618	55127355
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.9121	1.21473484493147e-43	55112618	55127355	7.67702663948885e-50	55205278	55221692
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	55217189	1	0	NA	7.67702663948885e-50	55205278	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	85040960	11363	11039	0.0759	NA	NA	NA	3.53067436600613e-08	84993427	85061610
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85042748	85133397	45	40	0.4277	3.53067436600613e-08	84993427	85061610	1.940566386198e-07	85109527	85160880
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85134587	104248215	5839	5663	0.0818	1.940566386198e-07	85109527	85160880	8.42492997450007e-23	104218986	104257524
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	104250920	104370100	48	48	-0.4569	8.42492997450007e-23	104218986	104257524	8.02541158599391e-18	104357357	104382977
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	104372233	134450318	11064	10769	0.0562	8.0254115859939e-18	104357357	104382977	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	79019	9	9	0.1734	NA	NA	NA	0.114057210343535	64510	190636
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80193	221726	72	69	-0.1901	0.114057210343535	64510	190636	1.89742630807777e-10	199040	258511
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	222982	736988	215	209	0.1792	1.89742630807777e-10	199040	258511	1.53527692094004e-13	734832	736988
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-1.3266	1.53527692094004e-13	734832	736988	1.58575952730868e-13	743223	745410
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	2205903	666	651	0.1785	1.58575952730868e-13	743223	745410	2.03906008672049e-10	2202764	2205903
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2208275	2210774	2	2	-1.6972	2.03906008672049e-10	2202764	2205903	1.04613416010966e-08	2210774	2212919
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2212919	5013170	1153	1112	0.1047	1.04613416010966e-08	2210774	2212919	2.92239215979985e-08	5011102	5013170
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5017445	5018733	2	2	-1.653	2.92239215979985e-08	5011102	5013170	1.2026952183086e-07	5018733	5019940
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	5019940	9523923	1619	1577	0.1015	1.2026952183086e-07	5018733	5019940	6.99196528729061e-24	9516067	9550789
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	1.4135	6.99196528729061e-24	9516067	9550789	8.21633014563978e-30	9563866	9589725
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	31132762	7402	7189	0.0834	8.21633014563978e-30	9563866	9589725	1.00000077564161e-05	31058854	31177645
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	16	0.5872	1.00000077564161e-05	31058854	31177645	5.38233630629047e-05	31225941	31262482
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	31890222	274	267	0.122	5.38233630629047e-05	31225941	31262482	1.57441674628276e-07	31866123	31899792
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31899792	31949481	8	8	0.9123	1.57441674628276e-07	31866123	31899792	8.50788317142104e-07	31940796	31967558
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31954769	69138621	12219	11886	0.1237	8.50788317142104e-07	31940796	31967558	1.93886642168105e-15	69138621	69138621
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-2.1873	1.93886642168105e-15	69138621	69138621	1.66963109613535e-14	69164231	69164231
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	131682352	21225	20594	0.0959	1.66963109613535e-14	69164231	69164231	2.47240108189635e-08	131673312	131685349
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131683955	131694050	6	6	-0.7595	2.47240108189635e-08	131673312	131685349	2.31593550162145e-06	131689734	131697163
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	131695178	132289090	255	250	0.1345	2.31593550162145e-06	131689734	131697163	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11864	-0.3278	NA	NA	NA	1.10329896029259e-37	49964838	49964838
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.8829	1.10329896029259e-37	49964838	49964838	6.61306313752103e-41	49971732	49971732
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	100690991	14859	14467	-0.3295	6.61306313752103e-41	49971732	49971732	7.20748672171977e-09	100689280	100690991
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.0416	7.20748672171977e-09	100689280	100690991	3.53667861682250e-07	100693892	100695073
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4429	-0.3777	3.5366786168225e-07	100693892	100695073	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18864561	8	8	0.0378	NA	NA	NA	0.000238872129206276	18537177	19297767
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19271102	19549728	60	57	-0.5084	0.000238872129206276	18537177	19297767	1.87904198258918e-29	19540294	19557687
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19551043	33015478	5020	4866	0.0825	1.87904198258918e-29	19540294	19557687	2.52597545109386e-57	33000633	33020210
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	33017869	33269654	148	142	-0.4401	2.52597545109386e-57	33000633	33020210	7.86897140339425e-62	33262146	33280967
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	33271511	68327581	12033	11689	0.0916	7.86897140339425e-62	33262146	33280967	1.30447421922470e-25	68325628	68327581
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	68329278	68330471	2	2	-1.5761	1.3044742192247e-25	68325628	68327581	1.16879911305355e-07	68330471	68331511
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	68331511	73082262	2152	2085	0.0564	1.16879911305355e-07	68330471	68331511	1.46716765815820e-29	73082262	73082262
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73083141	73104540	6	6	-1.7653	1.4671676581582e-29	73082262	73082262	1.73534695584038e-29	73104540	73104540
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73106558	85351640	4550	4421	0.0736	1.73534695584038e-29	73104540	73104540	3.11779779582212e-11	85337106	85356918
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85356918	85381909	7	7	-0.9913	3.11779779582212e-11	85337106	85356918	1.56472410422491e-09	85376240	85398952
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85390548	105856972	7718	7499	0.0637	1.56472410422491e-09	85376240	85398952	1.08296768092470e-25	105856972	105856972
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	5	-1.9425	1.0829676809247e-25	105856972	105856972	8.79972821570473e-25	105881893	105881893
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	171	-0.0578	8.79972821570473e-25	105881893	105881893	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19537035	99	95	0.0823	NA	NA	NA	8.39148176316631e-10	19430207	19537035
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19835471	8	7	-0.9627	8.39148176316631e-10	19430207	19537035	1.83861048118583e-104	19835471	19835471
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-5.2606	1.83861048118583e-104	19835471	19835471	7.44127899287947e-36	19844217	19844217
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20308014	48	46	-1.0125	7.44127899287947e-36	19844217	19844217	8.48484169882884e-34	20045859	20321772
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	74669752	21554	20905	-0.3039	8.48484169882884e-34	20045859	20321772	4.14583275187513e-85	74669752	74671626
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-4.1083	4.14583275187513e-85	74669752	74671626	8.80855191772457e-79	74680338	74680439
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	98643259	8885	8624	-0.3272	8.80855191772457e-79	74680338	74680439	1.60891427398675e-06	98640852	98643259
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98650526	98652572	3	3	-1.6386	1.60891427398675e-06	98640852	98643259	8.5330363561242e-06	98652572	98656507
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98654390	100298352	719	691	-0.3418	8.5330363561242e-06	98652572	98656507	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19977	0.0862	NA	NA	NA	0	75089974	75093957
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.2757	0	75089974	75093957	9.226778982045e-15	75100865	75102639
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4986	-0.2247	9.226778982045e-15	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13471	-0.2855	NA	NA	NA	1.18145259217593e-84	36673853	36673853
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-3.5622	1.18145259217593e-84	36673853	36673853	9.65353871463191e-82	36684619	36684619
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	42246695	2129	2042	-0.2446	9.6535387146319e-82	36684619	36684619	2.36321130282265e-09	42242838	42246695
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42248925	42250113	2	2	-2.2317	2.36321130282265e-09	42242838	42246695	5.76319259754187e-12	42250113	42252988
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42252988	78653545	13626	13225	-0.277	5.76319259754187e-12	42250113	42252988	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	13376680	4660	4522	0.0452	NA	NA	NA	0	13375485	13380160
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13378507	42906862	8182	7964	0.9626	0	13375485	13380160	4.63885660430846e-41	42870155	42927711
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	42908783	43645411	234	230	0.6087	4.63885660430846e-41	42870155	42927711	3.11797647731028e-227	43642128	43649565
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	43648038	45252448	616	593	-0.3422	3.11797647731028e-227	43642128	43649565	1.03963384469442e-215	45242489	45259224
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45253337	76088538	9262	9008	-0.8666	1.03963384469442e-215	45242489	45259224	0.000624104535894863	76052238	76097841
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76090738	76116026	10	10	-0.3545	0.000624104535894863	76052238	76097841	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20384757	9214	8939	-0.248	NA	NA	NA	0	20383210	20386500
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20386500	22351693	497	479	1.1121	0	20383210	20386500	6.43742680791022e-45	22351664	22361859
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22361859	22447295	26	23	-0.1595	6.43742680791022e-45	22351664	22361859	8.07573017239754e-09	22445621	22447295
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22448647	22457558	4	4	1.2325	8.07573017239754e-09	22445621	22447295	1.54008564145738e-13	22457558	22459183
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22459183	23693052	316	307	-0.2711	1.54008564145738e-13	22457558	22459183	3.03402322994371e-05	23687868	23693052
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23694329	23702404	3	3	0.8253	3.03402322994371e-05	23687868	23693052	2.00501202406542e-07	23702404	23705888
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23703047	50835935	6998	6801	-0.2977	2.00501202406542e-07	23702404	23705888	4.00442808561598e-14	50833941	50835935
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	50836664	50854558	10	10	0.8049	4.00442808561598e-14	50833941	50835935	1.03449322668393e-63	50854558	50859544
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	50855766	63788698	5991	5822	-0.1653	1.03449322668393e-63	50854558	50859544	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	46743040	15825	15358	0.3396	NA	NA	NA	0	46717999	46761252
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	46744657	54755467	2693	2611	0.7647	0	46717999	46761252	0	54742646	54771239
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	54758512	56896329	798	770	1.4913	0	54742646	54771239	2.86283307837793e-07	56892695	56896329
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56898026	56903818	4	4	0.2086	2.86283307837793e-07	56892695	56896329	6.69977868485766e-08	56903818	56909352
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56905479	57973095	418	406	1.219	6.69977868485766e-08	56903818	56909352	5.10125366551626e-72	57953995	57995860
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57975656	60875902	1139	1111	0.7617	5.10125366551626e-72	57953995	57995860	3.98227104309804e-09	60873171	60875902
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60877807	60877807	1	0	NA	3.98227104309804e-09	60873171	60875902	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60879310	60882976	2	2	-1.2978	NA	NA	NA	7.83768256324647e-08	60882976	60885178
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60885178	61854621	431	420	0.8018	7.83768256324647e-08	60882976	60885178	7.89933704726483e-174	61849939	61858865
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	61856830	62419534	268	256	-0.2701	7.89933704726483e-174	61849939	61858865	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	14312687	72	67	-0.2254	NA	NA	NA	2.95064883901061e-168	14296189	14319178
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14319178	22394223	2920	2852	-1.6648	2.95064883901061e-168	14296189	14319178	0	22389265	22401554
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22395180	31449053	2964	2889	-0.844	0	22389265	22401554	0	31439676	31459989
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	31450810	46922972	7485	7246	-0.3325	0	31439676	31459989	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18088300	1112	1080	-0.7634	NA	NA	NA	9.56880681456755e-08	18087057	18088300
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18092255	18095689	3	3	-2.2481	9.56880681456755e-08	18087057	18088300	4.97711702692071e-09	18095689	18096763
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18096763	22667608	1867	1794	-0.7564	4.97711702692071e-09	18095689	18096763	9.8863179698223e-176	22667608	22679305
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-3.6222	9.8863179698223e-176	22667608	22679305	3.15018543723599e-200	22718614	22725305
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49567768	13551	13154	-0.7915	3.15018543723599e-200	22718614	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1596607	910	885	0.0866	NA	NA	NA	1.47585692124989e-13	1596453	1596607
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1597614	1599826	5	5	-1.652	1.47585692124989e-13	1596453	1596607	2.01211087205751e-14	1599826	1601345
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1600296	1600296	1	0	NA	2.01211087205751e-14	1599826	1601345	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1601345	2708113	876	849	0.0789	NA	NA	NA	4.13483136573933e-184	2697588	2726260
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	2708291	1	0	NA	4.13483136573933e-184	2697588	2726260	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	17692048	5734	5569	0.545	NA	NA	NA	3.31461857516416e-31	17620323	17692048
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	17694009	17697584	3	3	-0.167	3.31461857516416e-31	17620323	17692048	6.49588969426501e-42	17697584	17697584
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	17698993	17701960	3	3	-1.0295	6.49588969426501e-42	17697584	17697584	1.37459261576671e-08	17701960	17705739
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	17705739	58087292	13455	13062	0.5715	1.37459261576671e-08	17701960	17705739	0	57975115	61974430
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	58095846	58095846	1	0	NA	0	57975115	61974430	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	58314675	128454177	17231	16756	0.0691	NA	NA	NA	1.18517780213609e-47	128440811	128471612
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	128456059	128782290	143	142	0.5898	1.18517780213609e-47	128440811	128471612	2.65135386921471e-48	128761869	128797705
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	128785396	154582414	8564	8321	0.0434	2.65135386921471e-48	128761869	128797705	4.64868749819091e-145	154570177	154601295
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154882108	194	189	-0.7766	4.64868749819091e-145	154570177	154601295	1.40115583783487e-05	154879208	154885364
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154882362	154888224	7	7	0.184	1.40115583783487e-05	154879208	154885364	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	119	-4.083	NA	NA	NA	5.07783100545694e-15	3034907	3223585
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	4425391	10	9	-0.9102	5.07783100545694e-15	3034907	3223585	1.11959618255165e-07	4425391	4425391
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4431527	4431527	1	0	NA	1.11959618255165e-07	4425391	4425391	NA	NA	NA
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	5593746	6	5	-2.5718	NA	NA	NA	0.0713052714058518	5531459	6855813
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	168	-3.9201	0.0713052714058518	5531459	6855813	0.000173638484075021	6995017	7250951
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	128	-3.2267	0.000173638484075021	6995017	7250951	2.57332804771583e-06	7362895	7606496
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7708716	65	62	-4.3022	2.57332804771583e-06	7362895	7606496	0.0139265273791506	7655293	7860364
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7709619	8324291	165	156	-3.7257	0.0139265273791506	7655293	7860364	4.15017474493291e-05	8149413	8539855
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10515697	293	287	-4.2604	4.15017474493291e-05	8149413	8539855	0.00250297900258176	10504879	10515697
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10550419	3	3	-1.7741	0.00250297900258176	10504879	10515697	7.31132761233769e-06	10537808	10550419
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10595079	10631941	8	8	-7e-04	7.31132761233769e-06	10537808	10550419	1.55071132108321e-06	10631941	10646662
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	11660512	5	5	-1.6117	1.55071132108321e-06	10631941	10646662	0.136400980974641	11249952	12741404
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11673476	13128515	203	194	-3.0975	0.136400980974641	11249952	12741404	5.97076840074078e-17	13054694	13153117
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14342834	409	398	-4.0103	5.97076840074078e-17	13054694	13153117	0.0134978767593513	14073254	14456240
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	94	-3.5631	0.0134978767593513	14073254	14456240	0.000209784866426928	14488060	14547168
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-2.4033	0.000209784866426928	14488060	14547168	7.19834300527286e-11	14557473	14598838
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	22930737	1619	1568	-4.0077	7.19834300527286e-11	14557473	14598838	4.38303163130068e-48	22926726	23283689
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0339	4.38303163130068e-48	22926726	23283689	0.00304780827908801	26929225	27068911
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27193424	45	43	-2.1277	0.00304780827908801	26929225	27068911	0.000593985129349116	27113201	27193424
MSK_252152914748_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	57411732	57440809	8	8	-0.022	0.000593985129349116	27113201	27193424	NA	NA	NA
