Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	150818222	45463	44420	0.0018	NA	NA	NA	2.47770017859471e-08	150811736	150823073
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150851439	12	8	-0.6454	2.47770017859471e-08	150811736	150823073	5.26677586068942e-09	150846148	150857070
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2703	0.0108	5.26677586068942e-09	150846148	150857070	1.00980016401215e-15	157133150	157133150
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.7215	1.00980016401215e-15	157133150	157133150	1.15933303743449e-16	157136342	157136342
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200596027	15462	15123	-0.0012	1.15933303743449e-16	157136342	157136342	1.81461255247323e-08	200576669	200618814
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200672373	28	28	-0.3373	1.81461255247323e-08	200576669	200618814	1.78401485757726e-08	200649025	200696309
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200673525	247186514	17420	17033	2e-04	1.78401485757726e-08	200649025	200696309	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11232	-0.0033	NA	NA	NA	7.15287403259155e-23	34539740	34551222
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.665	7.15287403259155e-23	34539740	34551222	3.55143446060206e-21	34583814	34597294
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	41091579	2875	2813	-0.0119	3.55143446060206e-21	34583814	34597294	3.96663398091411e-08	41087172	41091579
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41092989	1	0	NA	3.96663398091411e-08	41087172	41091579	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41094296	41101640	4	4	-0.8844	NA	NA	NA	3.73673540088419e-08	41101640	41105253
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	212890878	52715	51423	4e-04	3.73673540088419e-08	41101640	41105253	7.93329769311628e-11	212889077	212890878
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-1.0021	7.93329769311628e-11	212889077	212890878	7.84854470335198e-11	212898875	212900857
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10445	-0.0034	7.84854470335198e-11	212898875	212900857	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11383299	4087	3988	-0.0033	NA	NA	NA	6.04312090145868e-14	11383299	11383299
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.2392	6.04312090145868e-14	11383299	11383299	8.56811925019404e-13	11389624	11389624
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	32074432	6706	6560	-0.0089	8.56811925019404e-13	11389624	11389624	1.73761955090297e-41	32074432	32074432
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-2.6764	1.73761955090297e-41	32074432	32074432	1.00383377654132e-40	32080848	32080848
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	99882435	21384	20870	0	1.00383377654132e-40	32080848	32080848	2.66119031908911e-150	99882435	99882435
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99891210	99891210	1	0	NA	2.66119031908911e-150	99882435	99882435	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.102	NA	NA	NA	1.53835543713422e-152	99897201	99897201
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	20787	-5e-04	1.53835543713422e-152	99897201	99897201	8.97709813466913e-13	163977334	164027724
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164105613	27	26	-0.4231	8.97709813466913e-13	163977334	164027724	2.10116122487127e-13	164081541	164121847
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164107951	194354505	10131	9887	0.0011	2.10116122487127e-13	164081541	164121847	0	194354505	194354505
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.0053	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	194368145	1	0	NA	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	199329592	1979	1935	0.0032	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3312	-0.0012	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.6654	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	69069651	15037	14670	-0.0039	0	9842644	9842644	1.48528932365093e-16	68901210	69088563
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69075140	69165814	13	13	-0.6688	1.48528932365093e-16	68901210	69088563	1.80613002380906e-16	69144974	69656183
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	30656	0.0028	1.80613002380906e-16	69144974	69656183	6.57571901176465e-10	173660684	173660684
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.3564	6.57571901176465e-10	173660684	173660684	1.85245413137166e-10	173666072	173666072
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3683	0.01	1.85245413137166e-10	173666072	173666072	1.71584934071439e-45	186676034	186676034
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.7596	1.71584934071439e-45	186676034	186676034	7.1185388581262e-47	186680176	186680176
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	302	-0.0082	7.1185388581262e-47	186680176	186680176	8.13655246166882e-170	187330240	187330240
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-5.2669	8.13655246166882e-170	187330240	187330240	3.06922912012034e-171	187333619	187333619
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1208	-0.0016	3.06922912012034e-171	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3905	-0.0056	NA	NA	NA	2.67387988630543e-114	12857302	12857302
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.2122	2.67387988630543e-114	12857302	12857302	9.28565777469696e-106	12873052	12873052
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	150155049	39870	38974	-0.0023	9.28565777469696e-106	12873052	12873052	1.38775373905202e-09	150148732	150171154
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150156233	150204134	15	14	-0.5053	1.38775373905202e-09	150148732	150171154	1.78542083225102e-10	150185190	150212516
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150207307	155416484	1623	1592	0.0015	1.78542083225102e-10	150185190	150212516	3.32815667047913e-10	155416484	155416484
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	155421443	3	2	1.3126	3.32815667047913e-10	155416484	155416484	3.5555402874637e-09	155421443	155421443
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180342860	8158	7940	-0.0021	3.5555402874637e-09	155421443	155421443	4.96322631252622e-08	180192214	180346557
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6161	4.96322631252622e-08	180192214	180346557	6.20375866343992e-08	180355807	180365950
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	106	-0.0121	6.20375866343992e-08	180355807	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11389	0.0036	NA	NA	NA	4.29400620653099e-20	32548736	32558677
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	0.9922	4.29400620653099e-20	32548736	32558677	4.50560404086304e-11	32590568	32600962
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	38	0.0664	4.50560404086304e-11	32590568	32600962	0.00262133063862523	32700719	32723366
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.5547	0.00262133063862523	32700719	32723366	1.28736540775583e-05	32721872	32736223
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862502	1346	1317	-0.0031	1.28736540775583e-05	32721872	32736223	6.38439699254619e-06	35846772	35870753
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35889353	13	13	-0.4514	6.38439699254619e-06	35846772	35870753	2.67214590904267e-07	35880489	35902630
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35891023	54035000	6900	6735	-0.0039	2.67214590904267e-07	35880489	35902630	4.67437187878168e-121	54035000	54035000
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.6405	4.67437187878168e-121	54035000	54035000	5.77219084597459e-123	54042734	54042734
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79008946	6429	6278	0.002	5.77219084597459e-123	54042734	54042734	7.92399909487132e-11	78987158	79018959
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79011979	79091850	16	16	0.4836	7.92399909487132e-11	78987158	79018959	1.38840844641781e-10	79074911	79119694
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6606	0.0037	1.38840844641781e-10	79074911	79119694	7.8328335917659e-12	103827105	103841482
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0142	7.8328335917659e-12	103827105	103841482	2.51447529089709e-11	103868154	103873584
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22366	3e-04	2.51447529089709e-11	103868154	103873584	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	109967918	35267	34492	0.0035	NA	NA	NA	3.2076226249245e-48	109967918	109967918
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-2.8954	3.2076226249245e-48	109967918	109967918	3.63882524888821e-47	109974402	109974402
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	6987	-0.0035	3.63882524888821e-47	109974402	109974402	3.26256117419978e-110	125831554	125831554
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.5764	3.26256117419978e-110	125831554	125831554	2.94881244174847e-111	125837524	125837524
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3557	-0.0056	2.94881244174847e-111	125837524	125837524	5.35716475882766e-15	133432281	133433384
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8116	5.35716475882766e-15	133432281	133433384	8.18316900855237e-15	133448277	133453811
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141422860	3705	3619	0.0072	8.18316900855237e-15	133448277	133453811	4.7949046396559e-12	141417702	141429405
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141425306	141440184	9	9	-0.6811	4.7949046396559e-12	141417702	141429405	1.14564218157165e-10	141434131	141443577
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	143503317	785	765	0.0178	1.14564218157165e-10	141434131	141443577	1.20781484089133e-07	143500499	143503317
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.0051	1.20781484089133e-07	143500499	143503317	6.07154191235403e-07	143584350	143705425
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	144399712	314	306	-0.0038	6.07154191235403e-07	143584350	143705425	2.6913501158618e-20	144399712	144399712
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144403133	144404463	2	2	-2.2287	2.6913501158618e-20	144399712	144399712	3.44478717167834e-25	144404463	144404463
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144411778	147702365	1534	1510	0.0079	3.44478717167834e-25	144404463	144404463	3.42244932174134e-19	147702365	147702365
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.9311	3.42244932174134e-19	147702365	147702365	4.52927912252475e-20	147707161	147707161
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4146	-0.0094	4.52927912252475e-20	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7958	-0.0037	NA	NA	NA	1.02328783318271e-39	25120552	25120552
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.02328783318271e-39	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.6315	NA	NA	NA	4.65695563746787e-40	25125700	25125700
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35567	0.001	4.65695563746787e-40	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	70926188	13071	12742	0	NA	NA	NA	4.82521499040738e-22	70926188	70926188
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.9177	4.82521499040738e-22	70926188	70926188	6.94670872471356e-21	70930528	70930528
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23239	-0.0068	6.94670872471356e-21	70930528	70930528	4.80009065722473e-12	137352394	137352394
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.4778	4.80009065722473e-12	137352394	137352394	2.44163207945307e-10	137356880	137356880
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1078	-0.0109	2.44163207945307e-10	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	49060463	14676	14318	-0.0021	NA	NA	NA	0	48277415	49067228
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	49062902	50719624	680	667	0.5157	0	48277415	49067228	5.02564244826488e-35	50712022	51158614
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	50721556	51306200	48	48	4e-04	5.02564244826488e-35	50712022	51158614	1.92339101792301e-32	51264492	51462955
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	51334026	52085018	192	189	0.515	1.92339101792301e-32	51264492	51462955	1.27310616944716e-145	52078690	52223475
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	52173693	69835856	5547	5410	0.0017	1.27310616944716e-145	52078690	52223475	6.5662787101862e-10	69835856	69835856
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69837432	69841183	3	2	1.3202	6.5662787101862e-10	69835856	69835856	1.75014052978292e-09	69841183	69841183
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	77917893	3446	3360	-0.0076	1.75014052978292e-09	69841183	69841183	1.48430175471309e-63	77917893	77917893
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.7502	1.48430175471309e-63	77917893	77917893	1.88581089995662e-64	77928738	77928738
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135124875	20168	19716	-0.0068	1.88581089995662e-64	77928738	77928738	2.85176744643374e-29	135117546	135135745
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135126486	135227463	35	35	0.5392	2.85176744643374e-29	135117546	135135745	5.15880594391801e-05	135204397	135227463
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135229796	135285645	10	9	0.0329	5.15880594391801e-05	135204397	135227463	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1738	-0.0157	NA	NA	NA	2.41710888186687e-269	4923300	4923300
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.5589	2.41710888186687e-269	4923300	4923300	2.56583694947743e-243	4932214	4932214
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	349	0.0248	2.56583694947743e-243	4932214	4932214	5.19432738456565e-15	5734978	5742476
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.642	5.19432738456565e-15	5734978	5742476	4.78775486950840e-17	5763749	5769776
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55123719	14753	14384	-0.0041	4.7877548695084e-17	5763749	5769776	8.93124440170245e-22	55097806	55129329
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	0.4469	8.93124440170245e-22	55097806	55129329	1.91704947259494e-21	55203706	55223056
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27710	-0.0017	1.91704947259494e-21	55203706	55223056	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	9523923	3741	3646	-0.0024	NA	NA	NA	1.38514721912974e-144	9523923	9523923
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9550789	4	4	-3.552	1.38514721912974e-144	9523923	9523923	3.64829526027574e-147	9550789	9550789
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9554149	132289090	41415	40440	0.0031	3.64829526027574e-147	9550789	9550789	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6854	-0.0055	NA	NA	NA	1.66007841225832e-158	36969571	36969571
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-5.1922	1.66007841225832e-158	36969571	36969571	1.07620317751379e-163	36982877	36982877
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	49964838	5178	5053	0.0026	1.07620317751379e-163	36982877	36982877	2.45354453187796e-16	49964838	49964838
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.6724	2.45354453187796e-16	49964838	49964838	1.07007996128197e-15	49971732	49971732
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	89659397	10072	9830	0.0028	1.07007996128197e-15	49971732	49971732	3.74971314682333e-08	89657473	89659397
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.2331	3.74971314682333e-08	89657473	89659397	1.99426429102199e-08	89662326	89663261
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100689280	4784	4669	-0.0016	1.99426429102199e-08	89662326	89663261	9.05670571476826e-228	100689280	100689280
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100690991	100690991	1	0	NA	9.05670571476826e-228	100689280	100689280	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-6.2015	NA	NA	NA	1.44427921539047e-219	100693892	100693892
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4442	-0.0091	1.44427921539047e-219	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19442895	38	35	0.0392	NA	NA	NA	0.000362064674505821	19414714	19457688
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19446048	19535787	24	23	0.3637	0.000362064674505821	19414714	19457688	2.12824631679478e-07	19489920	19553991
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19538610	34674458	5688	5557	0.0131	2.12824631679478e-07	19489920	19553991	9.50753766538443e-12	34674458	34674458
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.4877	9.50753766538443e-12	34674458	34674458	9.6083385187038e-12	34679959	34679959
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	106358491	26133	25567	-0.0027	9.6083385187038e-12	34679959	34679959	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.3825	NA	NA	NA	2.71758849157502e-09	18452491	18692865
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19421704	89	87	-0.4746	2.71758849157502e-09	18452491	18692865	1.81471255008268e-06	19371539	19839695
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19424067	20088256	62	57	-0.7465	1.81471255008268e-06	19371539	19839695	2.24573664016624e-88	20079935	20310916
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	100298352	31166	30425	-0.0039	2.24573664016624e-88	20079935	20310916	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54352394	13696	13374	1e-04	NA	NA	NA	3.18603935123943e-08	54339225	54365385
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54390060	11	11	-0.5437	3.18603935123943e-08	54339225	54365385	4.17165279791699e-10	54390060	54390060
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54402057	3	3	1.3434	4.17165279791699e-10	54390060	54390060	1.86821903283438e-15	54402057	54402057
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	57203733	1199	1173	-0.012	1.86821903283438e-15	54402057	54402057	1.07989538987544e-87	57203733	57203733
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.9018	1.07989538987544e-87	57203733	57203733	7.70266312158433e-90	57206772	57206772
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5482	0.0048	7.70266312158433e-90	57206772	57206772	3.4211998890065e-11	75092501	75093957
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1585	3.4211998890065e-11	75092501	75093957	1.05508793519152e-11	75100865	75102639
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	597	-0.0109	1.05508793519152e-11	75100865	75102639	0	76923844	76929598
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	0	76923844	76929598	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.4265	NA	NA	NA	0	76938723	76940218
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4420	-0.012	0	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13529	0.0053	NA	NA	NA	1.33151239743496e-61	36673853	36673853
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.9123	1.33151239743496e-61	36673853	36673853	4.18328654225212e-62	36684619	36684619
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1963	0.0185	4.18328654225212e-62	36684619	36684619	5.4475718125931e-16	41514481	41522429
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	22	0.5286	5.4475718125931e-16	41514481	41522429	1.07273751280977e-15	41564408	41573295
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	78653545	13724	13389	0.01	1.07273751280977e-15	41564408	41573295	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22419	-0.0058	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22497	0.0095	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1511632	587	570	-0.0243	NA	NA	NA	6.343890262993e-121	1511632	1521410
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1531162	8	8	-2.7898	6.343890262993e-121	1511632	1521410	9.08993652606744e-176	1521410	1531162
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20498	-0.0075	9.08993652606744e-176	1521410	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13151	-0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22686731	2987	2913	0.0105	NA	NA	NA	1.09465851300996e-12	22682428	22701123
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696038	22720195	15	14	0.6048	1.09465851300996e-12	22682428	22701123	5.87123716800324e-13	22714979	22725305
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	49571068	13554	13245	0.003	5.87123716800324e-13	22714979	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	27	0.0848	NA	NA	NA	9.31012226962243e-08	124528	127779
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	132689	6	6	-0.7874	9.31012226962243e-08	124528	127779	2.23826442347654e-09	129544	133501
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132721	1427392	752	735	-0.0173	2.23826442347654e-09	129544	133501	1.44115340686572e-09	1427338	1431240
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.9675	1.44115340686572e-09	1427338	1431240	2.25093520657677e-09	1432891	1434970
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	593	-0.018	2.25093520657677e-09	1432891	1434970	5.2935189460974e-10	2301365	2302065
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9547	5.2935189460974e-10	2301365	2302065	1.51538884555163e-11	2304398	2306110
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	379	-0.0506	1.51538884555163e-11	2304398	2306110	0	2708291	2711273
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6773792	1259	1228	0.9775	0	2708291	2711273	4.7476394670005e-111	6747678	6809238
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6783819	7424490	223	218	1.5105	4.7476394670005e-111	6747678	6809238	7.53292828572937e-142	7396100	7443896
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	7431286	76998610	21457	20929	0.989	7.53292828572937e-142	7396100	7443896	1.80325762851812e-38	76998610	76998610
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.8312	1.80325762851812e-38	76998610	76998610	4.82384154012634e-57	77010018	77010018
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	77390104	19	19	0.9865	4.82384154012634e-57	77010018	77010018	1.12091763834699e-191	77390104	77390104
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77408943	77410052	2	2	-4.5633	1.12091763834699e-191	77390104	77390104	6.9223373359615e-152	77410052	77410052
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77412083	126468154	13086	12794	0.9959	6.9223373359615e-152	77410052	77410052	7.31557666806728e-26	126461489	126491940
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	126476808	126476808	1	0	NA	7.31557666806728e-26	126461489	126491940	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	126491940	126584745	14	13	0.0842	NA	NA	NA	3.82564084261692e-26	126576443	126591857
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	126591857	134075886	2804	2739	0.9929	3.82564084261692e-26	126576443	126591857	1.06451728913092e-06	134054368	134076134
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134076134	134153778	13	13	1.4646	1.06451728913092e-06	134054368	134076134	1.76713184843373e-08	134145919	134159435
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134155222	134575130	141	139	0.9326	1.76713184843373e-08	134145919	134159435	6.83217905083418e-16	134568939	134584985
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134584985	134627936	14	14	1.6604	6.83217905083418e-16	134568939	134584985	4.19553099044843e-14	134620437	134635957
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134635130	154582414	6099	5954	0.9835	4.19553099044843e-14	134620437	134635957	0	154578922	154586690
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.001	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-4.2883	NA	NA	NA	4.34126078224492e-26	2973379	3733715
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	15	-1.1057	4.34126078224492e-26	2973379	3733715	1.36054813232965e-10	5531459	6696721
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7259689	229	225	-3.8322	1.36054813232965e-10	5531459	6696721	1.36794044157884e-06	7242656	7271632
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	22	-2.0045	1.36794044157884e-06	7242656	7271632	2.15365650625363e-09	7295562	7320048
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7709619	117	113	-3.9593	2.15365650625363e-09	7295562	7320048	0.00558858499802233	7630477	7828009
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7996758	85	83	-3.2648	0.00558858499802233	7630477	7828009	7.34576501726378e-09	7893056	8093653
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10513747	371	352	-4.1476	7.34576501726378e-09	7893056	8093653	7.5454238199844e-29	10512616	10515697
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.7303	7.5454238199844e-29	10512616	10515697	0.000224162372264510	10622062	12527445
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	69	-2.8444	0.00022416237226451	10622062	12527445	0.00318331039544306	12591908	12710000
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.2489	0.00318331039544306	12591908	12710000	0.00946510057875294	12792780	12911576
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12999095	59	57	-3.1165	0.00946510057875294	12792780	12911576	0.00108184238640834	12958620	13007725
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13045641	20	20	-1.7531	0.00108184238640834	12958620	13007725	7.67709058564988e-06	13035511	13058512
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13048283	13104920	24	21	-3.1339	7.67709058564988e-06	13035511	13058512	6.36309738637645e-06	13089124	13106723
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.3425	6.36309738637645e-06	13089124	13106723	1.09703816160612e-07	13128515	13137597
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13272362	49	48	-3.5883	1.09703816160612e-07	13128515	13137597	0.000191002720205148	13202163	13314244
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	13422642	63	62	-4.4356	0.000191002720205148	13202163	13314244	7.312719434075e-06	13413004	13427571
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13424959	13437661	8	8	-2.8056	7.312719434075e-06	13413004	13427571	0.000434083138510742	13434942	13454651
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13438904	13603478	85	85	-4.3132	0.000434083138510742	13434942	13454651	2.72520752449051e-06	13587025	13603478
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13606316	13606316	1	0	NA	2.72520752449051e-06	13587025	13603478	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13699223	10	8	-2.4811	NA	NA	NA	1.22238522631173e-09	13699223	13705594
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14122129	162	154	-4.4924	1.22238522631173e-09	13699223	13705594	8.11687524387767e-07	14118164	14122129
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.7203	8.11687524387767e-07	14118164	14122129	4.27161149410932e-08	14143748	14169526
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	26	-4.6024	4.27161149410932e-08	14143748	14169526	0.0024486574578378	14326935	14404979
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	94	-3.5987	0.0024486574578378	14326935	14404979	1.11991339436188e-08	14502379	14530328
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14561228	19	19	-1.6392	1.11991339436188e-08	14502379	14530328	1.68689545578191e-11	14555872	14579298
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14563486	16218742	550	536	-3.7975	1.68689545578191e-11	14555872	14579298	1.33524918618251e-07	16037646	16571246
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16219596	21036503	705	676	-4.2004	1.33524918618251e-07	16037646	16571246	8.3571492658805e-07	21035621	21043581
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.695	8.3571492658805e-07	21035621	21043581	6.16706087348417e-08	21047798	21059229
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	6.16706087348417e-08	21047798	21059229	NA	NA	NA
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22139807	260	251	-4.2745	NA	NA	NA	1.09967367118929e-08	22051284	22139807
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.1231	1.09967367118929e-08	22051284	22139807	9.24211701745827e-12	22177335	22179794
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	88	-4.2286	9.24211701745827e-12	22177335	22179794	1.56444441955555e-66	22926726	26870361
MSK_252152914755_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	80	-1.3553	1.56444441955555e-66	22926726	26870361	NA	NA	NA
