Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16239639	5587	5374	0.0227	NA	NA	NA	2.24845373140271e-09	16236840	16239639
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16242789	16260159	6	5	0.9121	2.24845373140271e-09	16236840	16239639	3.76454177494264e-10	16260159	16265269
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16262797	72537426	22301	21514	0.0041	3.76454177494264e-10	16260159	16265269	0	72537426	72539143
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.21	0	72537426	72539143	0	72574479	72579311
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	0	72574479	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	100805099	9372	9041	0.0016	NA	NA	NA	7.54744723264039e-09	100805099	100805099
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100807617	100813230	2	2	-1.2815	7.54744723264039e-09	100805099	100805099	8.50573123624969e-09	100813230	100814767
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100814767	109373255	2031	1954	-0.0011	8.50573123624969e-09	100813230	100814767	1.30005085895330e-83	109373255	109373255
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-3.845	1.3000508589533e-83	109373255	109373255	1.46227076724368e-80	109376249	109376249
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	146294654	4852	4680	-0.0051	1.46227076724368e-80	109376249	109376249	3.27620548662413e-15	146273215	147313991
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	148081741	41	41	-0.3817	3.27620548662413e-15	146273215	147313991	7.88808230924169e-16	147490608	148120872
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150818222	1254	1211	4e-04	7.88808230924169e-16	147490608	148120872	1.33358335009103e-06	150813419	150836481
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150846148	9	6	-0.6468	1.33358335009103e-06	150813419	150836481	8.7984537187173e-06	150836484	150852858
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	8.7984537187173e-06	150836484	150852858	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	77	-0.0223	NA	NA	NA	3.41567226833425e-12	151024118	151026228
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	1.0453	3.41567226833425e-12	151024118	151026228	4.10464861848717e-11	151036435	151038091
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2583	0.0079	4.10464861848717e-11	151036435	151038091	3.49997333207099e-38	157133150	157133150
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.6787	3.49997333207099e-38	157133150	157133150	4.52249442952996e-40	157136342	157136342
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	195009358	13297	12872	-0.0075	4.52249442952996e-40	157136342	157136342	1.18282535852747e-09	194977713	195015837
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195097118	11	10	-0.6151	1.18282535852747e-09	194977713	195015837	1.05893549442400e-09	195065867	195104207
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	200596027	2154	2094	0.0072	1.058935494424e-09	195065867	195104207	5.98321696276918e-11	200580745	200612164
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200676505	30	29	-0.3811	5.98321696276918e-11	200580745	200612164	7.6312880366228e-11	200667381	200696309
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200678532	246751473	17289	16666	-0.0017	7.6312880366228e-11	200667381	200696309	3.19653501425061e-08	246676931	246794552
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246860551	30	30	0.3269	3.19653501425061e-08	246676931	246794552	6.15599786014017e-06	246849755	246911251
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246862029	247186514	99	95	0.0125	6.15599786014017e-06	246849755	246911251	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11104	-3e-04	NA	NA	NA	4.57395421291859e-20	34539740	34552935
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.6307	4.57395421291859e-20	34539740	34552935	1.30435423831917e-19	34582272	34595734
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6972	-0.0073	1.30435423831917e-19	34582272	34595734	5.37636920707564e-173	52600588	52600588
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	5.37636920707564e-173	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-3.8702	NA	NA	NA	5.88965703828478e-171	52635695	52635695
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	52639605	1	0	NA	5.88965703828478e-171	52635695	52635695	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52642716	179767214	37544	36265	-0.0032	NA	NA	NA	1.00757808549884e-07	179764819	179767214
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.0064	1.00757808549884e-07	179764819	179767214	9.74668639445695e-10	179778919	179791128
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	180117780	104	103	-0.0097	9.74668639445695e-10	179778919	179791128	8.6552224277731e-14	180115198	180117780
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.8753	8.6552224277731e-14	180115198	180117780	2.60757366716524e-12	180129680	180131608
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	242689978	21432	20697	8e-04	2.60757366716524e-12	180129680	180131608	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37075	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	43644	32074432	10795	10433	-0.002	NA	NA	NA	6.71499213186098e-69	32074432	32074432
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.4491	6.71499213186098e-69	32074432	32074432	3.79060661977552e-66	32080848	32080848
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32094956	1	0	NA	3.79060661977552e-66	32080848	32080848	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32098215	152993150	39227	37851	-7e-04	NA	NA	NA	2.40720045529734e-27	152991040	152996121
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	152996121	153035523	18	16	-0.793	2.40720045529734e-27	152991040	152996121	3.37693495095577e-28	153032375	153036955
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	153036955	164005577	3447	3337	-0.0025	3.37693495095577e-28	153032375	153036955	1.07074058831447e-69	164005577	164005577
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.2084	1.07074058831447e-69	164005577	164005577	1.49188294457660e-17	164023502	164027724
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	0.5789	1.4918829445766e-17	164023502	164027724	5.40564333685999e-19	164100804	164123806
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	196822133	11131	10743	-0.0046	5.40564333685999e-19	164100804	164123806	8.21811991330946e-16	196807153	196905767
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.5259	8.21811991330946e-16	196807153	196905767	3.77287848327991e-14	196928503	196943380
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	931	-0.0067	3.77287848327991e-14	196928503	196943380	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	173224400	49640	47946	-0.0014	NA	NA	NA	3.97061296824379e-25	173224400	173224400
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	2.1248	3.97061296824379e-25	173224400	173224400	8.45854352786077e-27	173228860	173228860
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	185	0.0115	8.45854352786077e-27	173228860	173228860	1.16212049562170e-79	173660684	173660684
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.637	1.1621204956217e-79	173660684	173660684	5.14726282941305e-81	173666072	173666072
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3966	0.0027	5.14726282941305e-81	173666072	173666072	2.37170454032644e-25	187330240	187330240
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.0711	2.37170454032644e-25	187330240	187330240	2.34451196685736e-24	187333619	187333619
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190710812	1131	1082	-0.0032	2.34451196685736e-24	187333619	187333619	2.6485942195416e-30	190692881	190749363
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	63	-0.4105	2.6485942195416e-30	190692881	190749363	3.23005612406998e-12	190907865	190940021
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191041481	38	35	0.0265	3.23005612406998e-12	190907865	190940021	0.00251683698278545	191021815	191133096
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.4407	0.00251683698278545	191021815	191133096	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	7222660	2173	2079	0.0071	NA	NA	NA	1.20972511934499e-11	7218599	7222660
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7232549	7246064	4	4	-1.0284	1.20972511934499e-11	7218599	7222660	1.32359663011732e-11	7246064	7253683
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7253683	12837736	1795	1730	-0.0124	1.32359663011732e-11	7246064	7253683	3.42817931094349e-12	12835355	12853151
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12840501	12873052	5	5	0.9223	3.42817931094349e-12	12835355	12853151	3.82894131339348e-11	12857302	13263185
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180644810	49789	48052	-0.0023	3.82894131339348e-11	12857302	13263185	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11276	-0.0019	NA	NA	NA	7.65658410920742e-130	32558677	32567462
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.267	7.65658410920742e-130	32558677	32567462	0.000150479345486926	32588005	32628420
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32711957	35	35	-0.3956	0.000150479345486926	32588005	32628420	0.118943219505202	32609525	32732764
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32739800	15	13	-0.7717	0.118943219505202	32609525	32732764	7.1099343863274e-21	32731072	32742767
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	54035000	8253	7971	-4e-04	7.1099343863274e-21	32731072	32742767	3.57320457850150e-167	54035000	54035000
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.4653	3.5732045785015e-167	54035000	54035000	4.65940869449401e-176	54042734	54042734
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4367	-0.001	4.65940869449401e-176	54042734	54042734	2.35992244859746e-63	72919733	72919733
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-2.6904	2.35992244859746e-63	72919733	72919733	2.72337630470656e-61	72924440	72924440
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	170753106	31587	30540	-0.0037	2.72337630470656e-61	72924440	72924440	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	12	0.6235	NA	NA	NA	2.14188540245462e-12	159130	180716
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	26097755	8786	8470	0.0026	2.14188540245462e-12	159130	180716	1.26641804855354e-95	26097755	26097755
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.1176	1.26641804855354e-95	26097755	26097755	4.21209443300004e-94	26108369	26108369
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	109217320	26161	25313	-9e-04	4.21209443300004e-94	26108369	26108369	1.26157666038385e-118	109217320	109217320
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-3.7718	1.26157666038385e-118	109217320	109217320	1.04342552022389e-114	109233214	109233214
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	133433384	11131	10736	-0.001	1.04342552022389e-114	109233214	109233214	4.22284466954414e-311	133433384	133433384
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133444486	6	6	-4.408	4.22284466954414e-311	133433384	133433384	0.0198207582028196	133437464	133444486
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133447868	133448277	2	2	-2.0352	0.0198207582028196	133437464	133444486	6.17479465068103e-24	133448277	133448277
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141422860	3705	3567	4e-04	6.17479465068103e-24	133448277	133448277	6.7289033333997e-09	141417702	141429405
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141425306	141440184	9	9	-0.5972	6.7289033333997e-09	141417702	141429405	9.68428942527071e-07	141434131	141449014
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141687978	114	110	0.0152	9.6842894252707e-07	141434131	141449014	1.06426682694006e-13	141684868	141689547
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141689547	141712786	11	11	0.8003	1.06426682694006e-13	141684868	141689547	8.02640923627267e-18	141711513	141720324
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141714168	141720303	2	0	NA	8.02640923627267e-18	141711513	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158821263	6751	6529	0.0016	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0278	NA	NA	NA	1.74851829912861e-96	581533	581533
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.559	1.74851829912861e-96	581533	581533	1.64969000530025e-119	588865	588865
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7226901	2272	2198	0.002	1.64969000530025e-119	588865	588865	3.02596119335907e-24	7226901	7322035
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7260442	7824059	8	8	-1.04	3.02596119335907e-24	7226901	7322035	8.95807604648483e-23	7729311	8137794
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25022606	5728	5547	-0.0023	8.95807604648483e-23	7729311	8137794	8.43092449295104e-130	25022606	25030003
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-4.0359	8.43092449295104e-130	25022606	25030003	3.46451169410021e-137	25034970	25039370
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4763	-0.0087	3.46451169410021e-137	25034970	25039370	1.03424563027965e-106	39345557	39352361
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	0.823	1.03424563027965e-106	39345557	39352361	5.87032114576272e-89	39504332	39508035
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	426	0.024	5.87032114576272e-89	39504332	39508035	7.71449334284064e-166	40892587	40892587
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.2902	7.71449334284064e-166	40892587	40892587	5.14168634494083e-159	40897469	40897469
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29896	0.0013	5.14168634494083e-159	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5279	-0.0028	NA	NA	NA	2.32809140601618e-08	15801123	15802255
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.2295	2.32809140601618e-08	15801123	15802255	3.63055284488111e-08	15807123	15813954
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	15813356	1	0	NA	3.63055284488111e-08	15807123	15813954	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	39146895	7270	7010	7e-04	NA	NA	NA	4.08650743107606e-08	39130211	39146895
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	1.0011	4.08650743107606e-08	39130211	39146895	0.000601196946787693	43599449	43599449
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	47002187	6	6	0.0512	0.000601196946787693	43599449	43599449	0.00250292468767515	43776365	67859114
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	67927172	12	11	-0.461	0.00250292468767515	43776365	67859114	1.18229033818842e-05	67917803	70212537
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	310	-0.0308	1.18229033818842e-05	67917803	70212537	2.20499889368605e-60	70926188	70926188
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.244	2.20499889368605e-60	70926188	70926188	2.59331639456259e-57	70930528	70930528
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22956	-0.006	2.59331639456259e-57	70930528	70930528	1.37629127697527e-47	137352394	137352394
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.9492	1.37629127697527e-47	137352394	137352394	2.58221923598202e-39	137356880	137356880
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1063	-0.0058	2.58221923598202e-39	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23736	-0.0076	NA	NA	NA	6.6971243068668e-88	77917893	77917893
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-3.2431	6.6971243068668e-88	77917893	77917893	8.96137175639459e-88	77928738	77928738
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	123957735	16163	15619	-2e-04	8.9613717563946e-88	77928738	77928738	1.05417048356688e-08	123956449	123959854
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123969584	5	5	-0.8239	1.05417048356688e-08	123956449	123959854	2.61824424595202e-08	123968017	123971172
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	135285645	4045	3899	-0.004	2.61824424595202e-08	123968017	123971172	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2058	-0.0029	NA	NA	NA	1.79062687167492e-16	5733442	5741031
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5762182	14	14	-0.7084	1.79062687167492e-16	5733442	5741031	6.44615915923609e-19	5760117	5769776
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5763749	5765438	2	0	NA	6.44615915923609e-19	5760117	5769776	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55123719	14753	14225	0.0016	NA	NA	NA	0	55123719	55123719
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	-4.9871	0	55123719	55123719	0	55209626	55209626
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27393	0.0024	0	55209626	55209626	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3621	0.0046	NA	NA	NA	6.70363454077021e-36	9516067	9531133
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.0062	6.70363454077021e-36	9516067	9531133	3.88185163296736e-36	9589725	9604633
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	132289090	41406	39954	0.001	3.88185163296736e-36	9589725	9604633	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	19290979	293	285	0.0047	NA	NA	NA	4.05517791144189e-08	19289252	19292158
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19292158	19300244	4	3	-1.0444	4.05517791144189e-08	19289252	19292158	9.63840001067396e-09	19295454	19300244
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19301284	37953582	7041	6791	-0.0051	9.63840001067396e-09	19295454	19300244	5.33059199361473e-76	37953582	37953582
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.6242	5.33059199361473e-76	37953582	37953582	2.03621962797931e-75	37957844	37957844
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	100690991	19740	19083	-0.0031	2.03621962797931e-75	37957844	37957844	1.41711933160637e-234	100690991	100690991
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-6.3747	1.41711933160637e-234	100690991	100690991	1.9168348645561e-222	100693892	100693892
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4391	-0.0075	1.9168348645561e-222	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19437192	36	34	0.0328	NA	NA	NA	0.00301609165588414	19325098	19442895
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19441654	19469681	14	13	0.4144	0.00301609165588414	19325098	19442895	3.28972386024222e-07	19467512	19489920
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19471494	73075500	19372	18722	1e-04	3.28972386024222e-07	19467512	19489920	8.47780471519346e-57	73075500	73075500
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73082262	73092112	5	5	-2.0211	8.47780471519346e-57	73075500	73075500	9.71391502537625e-55	73092112	73092112
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105597555	12215	11805	0.0026	9.71391502537625e-55	73092112	73092112	1.04537451936510e-282	105597555	105597555
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.088	1.0453745193651e-282	105597555	105597555	5.56600115339957e-171	105632168	105632168
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106218059	179	173	0.0429	5.56600115339957e-171	105632168	105632168	8.78084058440837e-06	106205637	106221696
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	15	-0.3849	8.78084058440837e-06	106205637	106221696	1.31695370580904e-07	106251081	106260962
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	34	0.079	1.31695370580904e-07	106251081	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1085	NA	NA	NA	1.49253772437444e-05	18450562	18810004
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	145	-0.6171	1.49253772437444e-05	18450562	18810004	2.28516735054921e-147	20060061	20310916
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20832	-1e-04	2.28516735054921e-147	20060061	20310916	1.83674263179760e-11	74664249	74669752
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.0678	1.8367426317976e-11	74664249	74669752	4.68077098770463e-12	74680439	74696127
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9292	-5e-04	4.68077098770463e-12	74680439	74696127	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	16145593	5879	5689	0.0015	NA	NA	NA	1.22079747043006e-07	16135431	16149149
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	16149149	16171924	11	11	-0.5324	1.22079747043006e-07	16135431	16149149	2.62694145771868e-08	16171924	16178306
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	16174751	54348362	7805	7528	0.0152	2.62694145771868e-08	16171924	16178306	1.33145711403459e-09	54339225	54362111
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54390060	12	12	-0.5463	1.33145711403459e-09	54339225	54362111	2.19156593968653e-10	54390060	54390060
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54402057	3	3	1.293	2.19156593968653e-10	54390060	54390060	2.71405096723551e-13	54402057	54402057
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	75093957	6813	6592	0.0055	2.71405096723551e-13	54402057	54402057	3.16579126404378e-67	75093957	75093957
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75097331	1	0	NA	3.16579126404378e-67	75093957	75093957	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75099083	75100865	2	2	-3.4686	NA	NA	NA	1.79083449568971e-69	75100865	75100865
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	589	-0.0017	1.79083449568971e-69	75100865	75100865	0	76925748	76925748
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.3209	0	76925748	76925748	0	76940218	76940218
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4385	-9e-04	0	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	7276831	3149	3028	0.0167	NA	NA	NA	4.43829201728093e-11	7276831	7276831
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	7278231	7280101	2	2	-1.4881	4.43829201728093e-11	7276831	7276831	2.30813385657633e-11	7280101	7280101
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	7281801	36673853	10720	10321	0.0096	2.30813385657633e-11	7280101	7280101	3.74973439848503e-18	36672710	36673853
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.0897	3.74973439848503e-18	36672710	36673853	6.09285932108612e-18	36684619	36686013
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1945	0.0208	6.09285932108612e-18	36684619	36686013	2.06287320767114e-14	41514481	41526558
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	0.5371	2.06287320767114e-14	41514481	41526558	1.63537458455504e-14	41561017	41573295
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	78653545	13725	13261	0.0111	1.63537458455504e-14	41561017	41573295	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22171	-0.0057	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	63788698	23058	22244	0.0113	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	561	-0.0061	NA	NA	NA	3.33467900837334e-110	1516966	1521410
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.822	3.33467900837334e-110	1516966	1521410	3.20692439023811e-129	1525300	1531162
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3568	2e-04	3.20692439023811e-129	1525300	1531162	5.41500760007376e-12	12095485	12095485
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4935	5.41500760007376e-12	12095485	12095485	3.61876305567487e-11	12113855	12113855
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16692	6e-04	3.61876305567487e-11	12113855	12113855	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12992	-0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	35472378	9551	9204	0.0133	NA	NA	NA	8.75433633815564e-80	35472378	35472378
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.9787	8.75433633815564e-80	35472378	35472378	2.66795348957968e-78	35476942	35476942
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6740	0.016	2.66795348957968e-78	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.5971	NA	NA	NA	0.000243251348281267	4926	99430
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-2.1459	0.000243251348281267	4926	99430	3.55553617652466e-12	104732	110101
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	134946	22	22	-0.7048	3.55553617652466e-12	104732	110101	5.21078692950542e-25	132689	140897
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	138278	1431411	751	724	-0.0089	5.21078692950542e-25	132689	140897	1.48041735227362e-12	1431411	1431411
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.6136	1.48041735227362e-12	1431411	1431411	3.29585654404864e-12	1432953	1432953
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1435082	2	0	NA	3.29585654404864e-12	1432953	1432953	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1437132	2302065	607	574	-0.0121	NA	NA	NA	2.52840678541295e-12	2301365	2302065
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.1288	2.52840678541295e-12	2301365	2302065	6.41758592241726e-15	2304398	2306110
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	382	-0.0311	6.41758592241726e-15	2304398	2306110	0	2706218	2711273
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	47724053	16528	15958	0.9994	0	2706218	2711273	1.41905936289005e-08	47612327	47739288
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47725263	47748627	10	9	0.6629	1.41905936289005e-08	47612327	47739288	6.78907154830287e-12	47747688	47765476
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47756715	47838184	36	33	1.5211	6.78907154830287e-12	47747688	47765476	8.72623306332544e-20	47827887	47898068
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47840342	76992219	6364	6159	0.9835	8.72623306332544e-20	47827887	47898068	1.30823373728476e-12	76992219	76992219
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76998610	76998610	1	0	NA	1.30823373728476e-12	76992219	76992219	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.7383	NA	NA	NA	1.08672064518791e-12	77010018	77010018
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21436	0.9998	1.08672064518791e-12	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0169	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	119	-4.2829	NA	NA	NA	2.55196586566516e-20	3219200	3733715
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.1149	2.55196586566516e-20	3219200	3733715	5.18701230323681e-10	5593746	6696721
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	168	-3.8125	5.18701230323681e-10	5593746	6696721	3.74197156697065e-07	7007724	7193174
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	121	-2.7827	3.74197156697065e-07	7007724	7193174	0.000135012464913265	7442914	7572591
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	12	-4.7767	0.000135012464913265	7442914	7572591	6.95415333232348e-08	7606496	7608619
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7619927	5	5	-1.8219	6.95415333232348e-08	7606496	7608619	6.96444896657016e-06	7614571	7630477
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7625006	7709619	48	47	-4.2632	6.96444896657016e-06	7614571	7630477	1.88637153698377e-06	7697921	7740117
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8016395	90	86	-3.1134	1.88637153698377e-06	7697921	7740117	1.45107275047321e-08	7926989	8106151
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8036254	8036254	1	0	NA	1.45107275047321e-08	7926989	8106151	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8043008	10513747	365	350	-3.9943	NA	NA	NA	7.38123187433177e-22	10511255	10515697
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.8618	7.38123187433177e-22	10511255	10515697	0.000136855957644645	10631941	12533900
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12999095	154	146	-2.867	0.000136855957644645	10631941	12533900	0.00388725817570665	12926941	13001517
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-1.4518	0.00388725817570665	12926941	13001517	1.38585321335927e-12	13035511	13040293
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13066849	13	12	-3.3116	1.38585321335927e-12	13035511	13040293	0.000168667178286682	13062151	13086552
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13129843	23	23	-1.9285	0.000168667178286682	13062151	13086552	7.72444742768237e-12	13121152	13136828
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13155705	14	14	-4.2363	7.72444742768237e-12	13121152	13136828	0.0106867442506925	13148290	13230706
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13158272	13272362	34	34	-3.0966	0.0106867442506925	13148290	13230706	7.95736261085176e-10	13254095	13286708
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	13279098	1	0	NA	7.95736261085176e-10	13254095	13286708	NA	NA	NA
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13281871	13422642	62	61	-4.4378	NA	NA	NA	2.44684615542936e-08	13411855	13431975
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13424959	13453843	16	16	-2.9381	2.44684615542936e-08	13411855	13431975	4.55042527315931e-05	13440916	13467820
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13454651	14358464	288	274	-4.2361	4.55042527315931e-05	13440916	13467820	1.49609793674773e-10	14328579	14386474
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14524829	91	86	-3.2783	1.49609793674773e-10	14328579	14386474	3.54912118292068e-07	14502379	14526446
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	10	-0.8473	3.54912118292068e-07	14502379	14526446	1.24150889962711e-05	14540351	14555872
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14700040	36	35	-3.0143	1.24150889962711e-05	14540351	14555872	3.30063042703062e-05	14601309	14710266
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14986956	58	57	-4.2504	3.30063042703062e-05	14601309	14710266	0.000159990405247418	14952770	14986956
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14994704	15018205	4	4	-1.7147	0.000159990405247418	14952770	14986956	4.38897728003529e-06	15018205	15025974
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15137457	27	26	-4.1257	4.38897728003529e-06	15018205	15025974	0.00301275324083318	15112995	15182292
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15139441	15299931	92	88	-3.1433	0.00301275324083318	15112995	15182292	1.17535431335358e-13	15284717	15306225
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15408015	69	68	-4.4858	1.17535431335358e-13	15284717	15306225	4.97823816149102e-08	15406461	15409110
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15412637	4	4	-1.8556	4.97823816149102e-08	15406461	15409110	1.28885510548786e-05	15410566	15412637
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15413514	15434486	15	13	-4.1647	1.28885510548786e-05	15410566	15412637	8.44071156644847e-12	15434486	15434486
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15443458	15447091	5	4	-1.3415	8.44071156644847e-12	15434486	15434486	3.98414739428092e-08	15447091	15448670
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	29	-4.272	3.98414739428092e-08	15447091	15448670	5.04903339047872e-12	15521958	15523178
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	11	-1.9293	5.04903339047872e-12	15521958	15523178	4.94955186833627e-13	15546378	15547576
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15566377	15	15	-4.3427	4.94955186833627e-13	15546378	15547576	8.2309802187613e-09	15564959	15566377
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15583573	5	5	-1.8444	8.2309802187613e-09	15564959	15566377	1.33486313570822e-08	15583573	15587741
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	55	-4.4443	1.33486313570822e-08	15583573	15587741	5.74283299466074e-05	15848986	15998663
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16217583	127	121	-3.4665	5.74283299466074e-05	15848986	15998663	1.27251297589539e-06	16166281	16304538
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	17076673	138	131	-4.349	1.27251297589539e-06	16166281	16304538	4.21914463595609e-05	16914237	17117516
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17083649	17167011	16	15	-2.8031	4.21914463595609e-05	16914237	17117516	0.0122825459344516	17101969	17201569
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17170574	17351702	32	30	-3.9079	0.0122825459344516	17101969	17201569	3.72882408206469e-07	17341151	17351702
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17360817	17395271	6	6	-5.8956	3.72882408206469e-07	17341151	17351702	3.35349131234986e-15	17395271	17402227
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17402227	17482749	16	14	-3.6221	3.35349131234986e-15	17395271	17402227	1.47039096200040e-08	17473674	17496151
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17557953	13	13	-2.0409	1.4703909620004e-08	17473674	17496151	2.65792310493709e-09	17548302	17595749
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17566412	21036503	485	465	-4.1525	2.65792310493709e-09	17548302	17595749	7.96055930877734e-09	21035621	21042490
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.1198	7.96055930877734e-09	21035621	21042490	3.04542953056288e-08	21047798	21057446
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	253	-3.9947	3.04542953056288e-08	21047798	21057446	9.6308421517846e-06	22049641	22139807
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.0405	9.6308421517846e-06	22049641	22139807	3.17500100905860e-10	22177335	22179794
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	90	-4.282	3.1750010090586e-10	22177335	22179794	7.44715322071816e-68	22926726	22930737
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0919	7.44715322071816e-68	22926726	22930737	4.11017758161775e-08	26945084	26980386
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27000085	11	11	-3.0454	4.11017758161775e-08	26945084	26980386	5.63557769144067e-05	26984336	27011035
MSK_252152914756_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27003308	57440809	42	40	-1.0458	5.63557769144067e-05	26984336	27011035	NA	NA	NA
