Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	146294654	44168	42137	0.0018	NA	NA	NA	1.49028188888972e-12	146248754	147357754
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	148081741	41	38	-0.3402	1.49028188888972e-12	146248754	147357754	2.16169094025526e-07	147441409	148141512
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150819879	1255	1190	-0.0024	2.16169094025526e-07	147441409	148141512	5.97940927828685e-163	150819879	150819879
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	3.0123	5.97940927828685e-163	150819879	150819879	5.69914165546519e-171	150851439	150851439
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2646	0.0028	5.69914165546519e-171	150851439	150851439	9.09953157878907e-53	157133150	157133150
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.7116	9.09953157878907e-53	157133150	157133150	7.06363287131607e-56	157136342	157136342
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200596027	15462	14727	9e-04	7.06363287131607e-56	157136342	157136342	1.20156742337167e-10	200576669	200629099
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200804838	44	44	-0.3558	1.20156742337167e-10	200576669	200629099	4.5342438634591e-10	200678532	200818194
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	227872808	9919	9511	-0.0044	4.5342438634591e-10	200678532	200818194	3.17609870025797e-72	227872808	227872808
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227875096	227875096	1	0	NA	3.17609870025797e-72	227872808	227872808	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-3.4922	NA	NA	NA	1.02656345960173e-71	227882805	227882805
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	247186514	7480	7163	-0.0015	1.02656345960173e-71	227882805	227882805	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	146571330	45074	43085	-0.0041	NA	NA	NA	2.44984924110179e-240	146571330	146571330
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.4161	2.44984924110179e-240	146571330	146571330	2.10399349115753e-249	146592775	146592775
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2106	0.0016	2.10399349115753e-249	146592775	146592775	3.20886322579986e-99	154601442	154601442
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-4.7871	3.20886322579986e-99	154601442	154601442	8.09369181943381e-93	154606943	154606943
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242689978	30544	29238	0.0017	8.09369181943381e-93	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10311	-0.0015	NA	NA	NA	2.98563783180368e-12	32074432	32074432
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.7662	2.98563783180368e-12	32074432	32074432	1.76095714989825e-11	32080848	32080848
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	164027724	42698	40835	0.0011	1.76095714989825e-11	32080848	32080848	5.68139594985981e-08	163992903	164048489
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.4644	5.68139594985981e-08	163992903	164048489	2.05158096615148e-08	164101776	164142230
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9651	0.0041	2.05158096615148e-08	164101776	164142230	8.27184532682436e-204	194354505	194354505
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.0666	8.27184532682436e-204	194354505	194354505	5.45924683076797e-189	194366950	194366950
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1883	-0.0114	5.45924683076797e-189	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3251	-0.0027	NA	NA	NA	2.5930729567895e-200	9815760	9815760
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.1759	2.5930729567895e-200	9815760	9815760	4.74966872731682e-222	9842644	9842644
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14331	0.0013	4.74966872731682e-222	9842644	9842644	1.99295458813207e-08	68896316	69088563
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.5622	1.99295458813207e-08	68896316	69088563	2.70357639631331e-08	69144974	69687545
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	29979	0.0057	2.70357639631331e-08	69144974	69687545	8.67758100746535e-44	173660684	173660684
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.2886	8.67758100746535e-44	173660684	173660684	1.00504246000268e-45	173666072	173666072
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191041481	5317	5072	0.003	1.00504246000268e-45	173666072	173666072	3.81435349386631e-08	190987363	191133096
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.4208	3.81435349386631e-08	190987363	191133096	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	140203440	40080	38348	-8e-04	NA	NA	NA	7.18273286694002e-11	140201609	140203440
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	6	-0.976	7.18273286694002e-11	140201609	140203440	1.09795899306381e-10	140216524	140224323
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	140219465	1	0	NA	1.09795899306381e-10	140216524	140224323	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140221835	150181399	3766	3598	-0.0091	NA	NA	NA	4.79014249097355e-08	150166447	150185190
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.7923	4.79014249097355e-08	150166447	150185190	4.13090011949019e-08	150199780	150207307
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9480	-0.0014	4.13090011949019e-08	150199780	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11215	-0.0048	NA	NA	NA	7.32952331485853e-182	32558677	32567462
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	16	-2.3824	7.32952331485853e-182	32558677	32567462	1.1632978563061e-170	32626619	32633691
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	7918	2e-04	1.1632978563061e-170	32626619	32633691	3.96595876150248e-95	54035000	54035000
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0545	3.96595876150248e-95	54035000	54035000	1.46904259264850e-106	54042734	54042734
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79011979	6430	6142	0.0126	1.4690425926485e-106	54042734	54042734	7.5833556977425e-09	78987158	79024557
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	14	0.5739	7.5833556977425e-09	78987158	79024557	1.27345601006128e-08	79074911	79127731
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	165643653	27872	26682	2e-04	1.27345601006128e-08	79074911	79127731	1.97075295022018e-176	165643653	165643653
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.6172	1.97075295022018e-176	165643653	165643653	9.57191348157014e-161	165650610	165650610
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	168075043	898	861	-0.0255	9.57191348157014e-161	165650610	165650610	1.18146837531071e-45	168065659	168087918
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168076928	168351821	108	106	0.4758	1.18146837531071e-45	168065659	168087918	5.44428562695621e-44	168327844	168369063
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168355498	170753106	798	766	-0.0235	5.44428562695621e-44	168327844	168369063	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	118611324	39264	37517	0.0018	NA	NA	NA	3.01980258592083e-08	118609124	118611324
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.247	3.01980258592083e-08	118609124	118611324	2.14729098466993e-08	118620875	118622742
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3010	0.0133	2.14729098466993e-08	118620875	118622742	8.30209763824435e-67	125831554	125831554
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.3746	8.30209763824435e-67	125831554	125831554	1.25933765438126e-64	125837524	125837524
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3492	0.0015	1.25933765438126e-64	125837524	125837524	1.34445477171984e-07	133419940	133433384
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7325	1.34445477171984e-07	133419940	133433384	3.59153450749514e-08	133448277	133456873
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3674	-0.0039	3.59153450749514e-08	133448277	133456873	1.66775469153228e-13	141687978	141698634
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8332	1.66775469153228e-13	141687978	141698634	1.60706032385764e-11	141712786	141723354
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.60706032385764e-11	141712786	141723354	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	144546976	1040	994	-0.0073	NA	NA	NA	3.69082795962637e-61	144546976	144546976
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144548093	144551256	2	2	-4.2511	3.69082795962637e-61	144546976	144546976	7.09262681808344e-72	144551256	144551256
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144554448	147702365	1469	1404	0.0109	7.09262681808344e-72	144551256	144551256	8.2523525310628e-38	147702365	147702365
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.0941	8.2523525310628e-38	147702365	147702365	4.34098915672947e-35	147707161	147707161
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4053	-0.015	4.34098915672947e-35	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39350798	13074	12493	-0.0062	NA	NA	NA	1.36844130871905e-86	39341524	39352361
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.8764	1.36844130871905e-86	39341524	39352361	1.14961916504194e-71	39500219	39509423
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	423	0.0261	1.14961916504194e-71	39500219	39509423	3.08241771885209e-106	40892587	40892587
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.9564	3.08241771885209e-106	40892587	40892587	8.4160797308071e-101	40897469	40897469
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	87255865	12244	11731	0.0069	8.4160797308071e-101	40897469	40897469	3.09259024673532e-08	87249754	87255865
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-1.2001	3.09259024673532e-08	87249754	87255865	5.89202285488805e-08	87262662	87265435
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	17925	0.0022	5.89202285488805e-08	87262662	87265435	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	15802255	5457	5225	0.0043	NA	NA	NA	2.31343927217797e-70	15802255	15802255
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-4.0477	2.31343927217797e-70	15802255	15802255	6.37019347570216e-67	15807123	15807123
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2429	5e-04	6.37019347570216e-67	15807123	15807123	1.48348082803408e-129	23343915	23343915
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.5863	1.48348082803408e-129	23343915	23343915	4.29876577634327e-129	23365926	23365926
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70916897	5067	4830	0.0026	4.29876577634327e-129	23365926	23365926	1.30663330267356e-18	70916897	70916897
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70923005	70926188	2	0	NA	1.30663330267356e-18	70916897	70916897	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.1692	NA	NA	NA	1.37856173089584e-17	70930528	70930528
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23776	-0.0111	1.37856173089584e-17	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9302	-0.0064	NA	NA	NA	3.1318609470218e-18	27038538	27038538
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.1305	3.1318609470218e-18	27038538	27038538	2.43481602175692e-17	27041812	27041812
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14212	-0.001	2.43481602175692e-17	27041812	27041812	6.62923780851759e-37	77917893	77917893
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.0701	6.62923780851759e-37	77917893	77917893	1.91184185223490e-36	77928669	77928669
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19270	-0.0057	1.9118418522349e-36	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1703	-0.0344	NA	NA	NA	8.69984831214731e-134	4923300	4923300
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-3.9732	8.69984831214731e-134	4923300	4923300	1.23552453217934e-157	4932214	4932214
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14422	9e-04	1.23552453217934e-157	4932214	4932214	0	55118214	55118214
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-4.199	0	55118214	55118214	0	55209626	55209626
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	107284914	18285	17506	-0.0015	0	55209626	55209626	4.59993441430812e-69	107284914	107284914
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-4.2258	4.59993441430812e-69	107284914	107284914	1.19319272460385e-74	107292148	107292148
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	113976883	2403	2299	-0.0034	1.19319272460385e-74	107292148	107292148	1.86759332905301e-07	113970268	113976883
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	114016954	7	6	-0.7974	1.86759332905301e-07	113970268	113976883	3.05368728493695e-07	114016954	114027925
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	114022843	134450318	7663	7325	-0.012	3.05368728493695e-07	114016954	114027925	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	285	0.0184	NA	NA	NA	9.74037645499476e-09	734832	736988
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.987	9.74037645499476e-09	734832	736988	1.09292638209165e-06	743223	747365
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3294	-0.0093	1.09292638209165e-06	743223	747365	7.22448255486807e-32	9456107	9531133
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	1.1903	7.22448255486807e-32	9456107	9531133	2.11081564684961e-31	9589725	9604633
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11116883	574	549	-0.0213	2.11081564684961e-31	9589725	9604633	4.77675487476583e-81	11116883	11116883
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	-3.0966	4.77675487476583e-81	11116883	11116883	4.17444494939268e-96	11128557	11128557
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11130871	1	0	NA	4.17444494939268e-96	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132287226	40825	38996	0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7042	-0.0083	NA	NA	NA	1.48706274382151e-56	37953582	37953582
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.7229	1.48706274382151e-56	37953582	37953582	1.61057972253763e-57	37957844	37957844
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4664	-0.001	1.61057972253763e-57	37957844	37957844	2.5388103948856e-33	49964838	49964838
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.8491	2.5388103948856e-33	49964838	49964838	2.22521969029306e-32	49971732	49971732
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	114123340	19423	18572	0.0024	2.22521969029306e-32	49971732	49971732	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5508	0.0204	NA	NA	NA	2.03520616250471e-10	34666996	34674458
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.6725	2.03520616250471e-10	34666996	34674458	3.54721702724222e-10	34679959	34679959
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	105597555	25890	24742	-0.0037	3.54721702724222e-10	34679959	34679959	8.02193587361269e-199	105597555	105602602
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.9113	8.02193587361269e-199	105597555	105602602	6.09676403391391e-51	105630089	105632168
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	50	0.0251	6.09676403391391e-51	105630089	105632168	7.83937556596005e-06	105850033	105874293
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	5	-0.9557	7.83937556596005e-06	105850033	105874293	2.42964304096846e-06	105875924	105900253
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	166	0.01	2.42964304096846e-06	105875924	105900253	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0995	NA	NA	NA	1.64901261614631e-05	18427151	18452491
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-0.6781	1.64901261614631e-05	18427151	18452491	0.0368838299402600	18826924	19371539
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	19537035	84	83	-0.3556	0.03688382994026	18826924	19371539	2.24289178735232e-08	19391934	19839695
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19800789	1	0	NA	2.24289178735232e-08	19391934	19839695	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	20316992	59	57	-0.7351	NA	NA	NA	4.47631479852173e-57	20308014	20339495
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	32454294	3667	3491	-0.009	4.47631479852173e-57	20308014	20339495	2.84408110080164e-13	32447707	32517839
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32456500	32594200	26	26	-0.5385	2.84408110080164e-13	32447707	32517839	1.60956380158648e-13	32580871	32676783
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	1.60956380158648e-13	32580871	32676783	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	74669752	17858	17025	-0.003	NA	NA	NA	1.40565074932460e-10	74664249	74669752
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.2139	1.4056507493246e-10	74664249	74669752	3.4928951763065e-11	74680439	74696127
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9158	-0.0129	3.4928951763065e-11	74680439	74696127	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	68693086	18299	17462	3e-04	NA	NA	NA	2.09020963409338e-14	68687301	68693086
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.9416	2.09020963409338e-14	68687301	68693086	3.28902877914774e-14	68753209	68842364
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2123	-0.0092	3.28902877914774e-14	68753209	68842364	4.79648731298876e-46	75093957	75093957
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.883	4.79648731298876e-46	75093957	75093957	9.3433720720716e-50	75100865	75100865
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	592	-0.0137	9.3433720720716e-50	75100865	75100865	4.21397500179971e-12	76922411	76931247
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8625	4.21397500179971e-12	76922411	76931247	1.52198231444214e-10	76937156	76944661
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4320	-0.0149	1.52198231444214e-10	76937156	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13264	0.0042	NA	NA	NA	1.67695550637388e-111	36673853	36673853
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.4263	1.67695550637388e-111	36673853	36673853	4.06816520041243e-113	36683509	36683509
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41566540	2033	1938	0.0167	4.06816520041243e-113	36683509	36683509	1.03306440432145e-18	41553226	41574775
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	50	-0.436	1.03306440432145e-18	41553226	41574775	5.75183496952696e-18	41706870	42165272
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	74880525	12205	11627	0.0084	5.75183496952696e-18	41706870	42165272	2.30773022927196e-09	74872990	74884216
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74882413	74904114	13	12	0.6746	2.30773022927196e-09	74872990	74884216	5.75557589743346e-09	74900777	74914393
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78653545	1456	1379	-0.0195	5.75557589743346e-09	74900777	74914393	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21973	-0.0043	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	463	0.0055	NA	NA	NA	5.90529795956292e-09	1398325	1398325
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.6923	5.90529795956292e-09	1398325	1398325	3.77911794751870e-09	1400840	1405308
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	59414898	20561	19609	0.0052	3.7791179475187e-09	1400840	1405308	1.91888043566584e-14	59412581	59414898
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	-0.9774	1.91888043566584e-14	59412581	59414898	2.29518577966924e-14	59434202	59440262
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1906	-0.0121	2.29518577966924e-14	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	562	-0.0173	NA	NA	NA	2.77132494936801e-60	1499421	1511632
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1506379	1	0	NA	2.77132494936801e-60	1499421	1511632	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1523000	6	6	-2.3815	NA	NA	NA	8.8572181071713e-70	1518825	1523000
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1525300	1525300	1	0	NA	8.8572181071713e-70	1518825	1523000	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	12095485	3693	3546	0.0033	NA	NA	NA	4.89747564621751e-08	12089020	12095485
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4343	4.89747564621751e-08	12089020	12095485	3.94675315557540e-07	12113855	12127349
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16515	-0.0144	3.9467531555754e-07	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12871	-0.0029	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	9076	0.0031	NA	NA	NA	2.99034573631484e-50	35472378	35472378
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.7481	2.99034573631484e-50	35472378	35472378	4.47059304087279e-48	35476942	35476942
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6662	-0.0025	4.47059304087279e-48	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	755	-0.072	NA	NA	NA	7.42332898841694e-09	1427338	1431240
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.2134	7.42332898841694e-09	1427338	1431240	2.17772159842709e-09	1432891	1434970
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2672401	975	937	-0.0603	2.17772159842709e-09	1432891	1434970	0.000453586046196391	2666344	2674962
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2693493	12	12	-0.5081	0.000453586046196391	2666344	2674962	0.0121593594280248	2686565	2702699
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	15	-0.0594	0.0121593594280248	2686565	2702699	1.41595402261986e-28	2708113	2711273
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	29444024	10013	9573	1.0109	1.41595402261986e-28	2708113	2711273	9.3540983188181e-54	29436712	29448854
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29445494	29556570	57	54	0.2396	9.3540983188181e-54	29436712	29448854	2.38132994147711e-56	29549572	29560892
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29559145	47727864	6461	6171	1.0185	2.38132994147711e-56	29549572	29560892	8.9526356738872e-43	47725263	47735786
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47734767	47845497	46	44	0.2675	8.9526356738872e-43	47725263	47735786	7.33918021005994e-39	47840342	47906417
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	47898068	154582414	28557	27286	1.005	7.33918021005994e-39	47840342	47906417	3.13709281664350e-301	154578922	154599547
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	186	0.014	3.1370928166435e-301	154578922	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-3.7123	NA	NA	NA	8.91451268645698e-19	3034907	3772482
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	8.91451268645698e-19	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8182	NA	NA	NA	2.53614607944224e-12	5531459	6696721
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7057026	176	165	-3.4488	2.53614607944224e-12	5531459	6696721	1.62867081132861e-07	7016814	7204505
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7461576	120	119	-2.4229	1.62867081132861e-07	7016814	7204505	2.11641198510867e-06	7347578	7600570
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7723783	82	81	-3.5656	2.11641198510867e-06	7347578	7600570	1.86544652065464e-06	7708716	7726921
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-1.7003	1.86544652065464e-06	7708716	7726921	7.44679097315661e-08	7781968	7806091
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	406	-3.4822	7.44679097315661e-08	7781968	7806091	1.94175607681236e-15	10506718	10595079
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-1.091	1.94175607681236e-15	10506718	10595079	6.39031144796666e-10	11660512	12452734
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-4.5081	6.39031144796666e-10	11660512	12452734	5.0747787550149e-06	12536761	12546917
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	55	-1.9991	5.0747787550149e-06	12536761	12546917	0.000893591264315447	12625208	12700767
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	9	-4.0399	0.000893591264315447	12625208	12700767	0.00262622396285086	12715696	12820920
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12905395	39	38	-2.4653	0.00262622396285086	12715696	12820920	0.0168228722791174	12871057	12919413
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12926941	8	8	-3.9148	0.0168228722791174	12871057	12919413	0.000159001357157362	12924438	12959689
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13147329	87	83	-1.9964	0.000159001357157362	12924438	12959689	3.69572496356451e-35	13129843	13153117
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13148290	14352278	404	386	-3.6286	3.69572496356451e-35	13129843	13153117	0.00078796748002454	14096437	14423860
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	88	-3.0857	0.00078796748002454	14096437	14423860	5.17583068983118e-05	14489801	14539230
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.17583068983118e-05	14489801	14539230	NA	NA	NA
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	22	-1.7122	NA	NA	NA	4.9063732819768e-06	14557473	14684159
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	16387273	580	562	-3.2334	4.9063732819768e-06	14557473	14684159	8.07788772148605e-07	16260833	16430865
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16679419	49	49	-4.3149	8.07788772148605e-07	16260833	16430865	0.000262268144590714	16656177	16766920
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	17487972	125	119	-3.5189	0.000262268144590714	16656177	16766920	2.10982311706978e-05	17467755	17487972
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17492482	17517470	6	5	-1.0064	2.10982311706978e-05	17467755	17487972	5.33907656984046e-06	17517470	17530333
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17521483	21036503	491	467	-3.6333	5.33907656984046e-06	17517470	17530333	3.36853774351326e-08	21035621	21042490
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-0.8336	3.36853774351326e-08	21035621	21042490	1.87300963591854e-07	21047798	21059229
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22930737	363	352	-3.5885	1.87300963591854e-07	21047798	21059229	1.98607429345476e-35	22923722	22930737
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-0.9775	1.98607429345476e-35	22923722	22930737	4.56991803205700e-06	26945084	26995399
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.5332	4.569918032057e-06	26945084	26995399	1.33721723454025e-05	27003308	27067889
MSK_252152914757_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.8129	1.33721723454025e-05	27003308	27067889	NA	NA	NA
